FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2531, 701 aa 1>>>pF1KE2531 701 - 701 aa - 701 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9123+/-0.00108; mu= 16.1202+/- 0.065 mean_var=72.9621+/-14.201, 0's: 0 Z-trim(103.2): 59 B-trim: 5 in 1/48 Lambda= 0.150150 statistics sampled from 7229 (7279) to 7229 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.583), E-opt: 0.2 (0.224), width: 16 Scan time: 2.750 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS45846.1 MEP1B gene_id:4225|Hs108|chr18 ( 701) 4808 1051.5 0 CCDS77173.1 MEP1B gene_id:4225|Hs108|chr18 ( 700) 4789 1047.4 0 CCDS4918.1 MEP1A gene_id:4224|Hs108|chr6 ( 746) 1789 397.6 3.6e-110 CCDS33249.1 ASTL gene_id:431705|Hs108|chr2 ( 431) 460 109.6 1e-23 CCDS7449.1 TLL2 gene_id:7093|Hs108|chr10 (1015) 444 106.3 2.4e-22 CCDS56342.1 TLL1 gene_id:7092|Hs108|chr4 ( 392) 434 103.9 4.6e-22 CCDS34856.1 BMP1 gene_id:649|Hs108|chr8 ( 730) 434 104.0 8e-22 CCDS6026.1 BMP1 gene_id:649|Hs108|chr8 ( 986) 434 104.1 1e-21 CCDS3811.1 TLL1 gene_id:7092|Hs108|chr4 (1013) 434 104.1 1.1e-21 CCDS47417.1 MDGA1 gene_id:266727|Hs108|chr6 ( 955) 285 71.8 5.3e-12 >>CCDS45846.1 MEP1B gene_id:4225|Hs108|chr18 (701 aa) initn: 4808 init1: 4808 opt: 4808 Z-score: 5626.3 bits: 1051.5 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 4808; 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CCDS49 LLQKS--RNGLRDPNTRWTFPIPYILADNLGLNAKGAILYAFEMFRLKSCVDFKPYEGES 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 NYISVFKGSGCWSSVGNRRVGKQELSIGANCDRIATVQHEFLHALGFWHEQSRSDRDDYV .:: . .:::: ::...:: :..::: .: : ..::.::::::.:::::.:::::: CCDS49 SYIIFQQFDGCWSEVGDQHVG-QNISIGQGCAYKAIIEHEILHALGFYHEQSRTDRDDYV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 RIMWDRILSGREHNFNTYSDDISDSLNVPYDYTSVMHYSKTAF-QNGTEPTIVTRISDFE : ::.:::: .:::.::.:.. .::.:::: :.:::. .: .:.. :::...: .:. CCDS49 NIWWDQILSGYQHNFDTYDDSLITDLNTPYDYESLMHYQPFSFNKNASVPTITAKIPEFN 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 DVIGQRMDFSDSDLLKLNQLYNCSSSLSFMDSCSFELENVCGMIQSSGDNADWQRVSQVP ..::::.::: :: .::..:::... ...: :.:: :.:::::.. :..:: . ... CCDS49 SIIGQRLDFSAIDLERLNRMYNCTTTHTLLDHCTFEKANICGMIQGTRDDTDWAHQDSAQ 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 RGPESDHSNMGQCQGSGFFMHFDSSSVNVGATAVLESRTLYPKRGFQCLQFYLYNSGSES : : ::. .::: :.:.::.:..:: .. .:.:::: ::::: :::::. .:: : CCDS49 AG-EVDHTLLGQCTGAGYFMQFSTSSGSAEEAALLESRILYPKRKQQCLQFFYKMTGSPS 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 DQLNIYIREYSADNVDGN---LTLVEEIKEIPTGSWQLYHVTLKVTKKFRVVFEGRKGSG :.: ...:. :. :: :. :. .. .:.. ::.:: .::: .:.: ::. CCDS49 DRLVVWVRR---DDSTGNVRKLVKVQTFQGDDDHNWKIAHVVLKEEQKFRYLFQGTKGDP 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 A-SLGGLSIDDINLSETRCPHHIWHIRNFTQFI--GSPNGTLYSPPFYSSKGYAFQIYLN : ::. .:::.:.:: :: .: .:::.: . : . : :: ::.:.::.: . : CCDS49 QNSTGGIYLDDITLTETPCPTGVWTVRNFSQVLENTSKGDKLQSPRFYNSEGYGFGVTLY 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 LAHVTNAG---IYFHLISGANDDQLQWPCPWQQATMTLLDQNPDIRQRMSNQRSITTDPF ..: . ::. :: :: :.:: .:. .:.:::.::.:.:::.. .::. CCDS49 PNSRESSGYLRLAFHVCSGENDAILEWPVENRQVIITILDQEPDVRNRMSSSMVFTTSKS 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 MTTD--NGNYFWDRPSKVGTVALFSNGTQFRRGGGYGTSAFITHERLKSRDFIKGDDVYI :. : . .:::::.::: . . . :. : :.::.:. :: :.:.:.::. : CCDS49 HTSPAINDTVIWDRPSRVGT---YHTDCNCFRSIDLGWSGFISHQMLKRRSFLKNDDLII 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE2 LLTVEDISHLNSTQI-----QLTPA---------------------------------PS .. :::.::..:.. .:.: :: CCDS49 FVDFEDITHLSQTEVPTKGKRLSPQGLILQGQEQQVSEEGSGKAMLEEALPVSLSQGQPS 590 600 610 620 630 640 610 620 630 640 pF1KE2 VQ--------------------DLCSKTTCKNDGVCTVRDGKAECRCQSGEDWWYMGERC : : :. . :.:::.:. : : ::: ::. ..: :::: CCDS49 RQKRSVENTGPLEDHNWPQYFRDPCDPNPCQNDGICVNVKGMASCRCISGHAFFYTGERC 650 660 670 680 690 700 650 660 670 680 690 700 pF1KE2 EKRGSTRDTIVIAVSSTVAVFALMLIITLVSVYCTRKKYRERMSSNRPNLTPQNQHAF . ... .....:..:. : . : CCDS49 QAVQVHGSVLGMVIGGTAGVIFLTFSIIAILSQRPRK 710 720 730 740 >>CCDS33249.1 ASTL gene_id:431705|Hs108|chr2 (431 aa) initn: 457 init1: 186 opt: 460 Z-score: 539.3 bits: 109.6 E(32554): 1e-23 Smith-Waterman score: 497; 37.4% identity (64.2% similar) in 254 aa overlap (20-258:41-284) 10 20 30 40 pF1KE2 MDLWNLSWFLFLDALLVISGLATPENFDVDGGMDQDIFDINEGLGLD-- :: :::. ...: :.:: ::.:: :. CCDS33 VLGLLSLPGVILGAPLASSCAGACGTSFPDGL-TPEGTQASG--DKDIPAINQGLILEET 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 pF1KE2 -----LFEGDIRLDRAQIRNSIIGEKYRWPH------TIPYVLEDSLEMNAKGVILNAFE :.:::: : . . . . .:: .:..: .. . .. :::.:. CCDS33 PESSFLIEGDI--IRPSPFRLLSATSNKWPMGGSGVVEVPFLLSSKYDEPSRQVILEALA 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 RYRLKTCIDFKPWAGETNYISVFKGSGCWSSVGNRRVGKQELSIGANCDRIAT--VQHEF ... .::: : . . ..::.. ::.:::: : : : .:.. .: . . : ::. CCDS33 EFERSTCIRFVTYQDQRDFISIIPMYGCFSSVG-RSGGMQVVSLAPTCLQKGRGIVLHEL 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 LHALGFWHEQSRSDRDDYVRIMWDRILSGREHNFNTYSDDISDSLNVPYDYTSVMHYSKT .:.::::::..:.::: :.:. :..:: : : :: . :... .::::.:::::.. CCDS33 MHVLGFWHEHTRADRDRYIRVNWNEILPGFEINFIKSQ---SSNMLTPYDYSSVMHYGRL 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 AFQNGTEPTIVTRISDFEDVIGQRMDFSDSDLLKLNQLYNCSSSLSFMDSCSFELENVCG ::. :::. . :::: ..: ::. .. .::.:: : CCDS33 AFSRRGLPTITPLWAPSVH-IGQRWNLSASDITRVLKLYGCSPSGPRPRGRGSHAHSTGR 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 MIQSSGDNADWQRVSQVPRGPESDHSNMGQCQGSGFFMHFDSSSVNVGATAVLESRTLYP CCDS33 SPAPASLSLQRLLEALSAESRSPDPSGSSAGGQPVPAGPGESPHGWESPALKKLSAEASA 310 320 330 340 350 360 >>CCDS7449.1 TLL2 gene_id:7093|Hs108|chr10 (1015 aa) initn: 390 init1: 308 opt: 444 Z-score: 514.7 bits: 106.3 E(32554): 2.4e-22 Smith-Waterman score: 444; 30.5% identity (61.0% similar) in 269 aa overlap (22-280:105-366) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MDLWNLSWFLFLDALLVISGLATPENFDVDGGMDQDIFDINEGLGLDLFEG ..:.. .: : . : :. : : CCDS74 FHIDKARDWTKQTVGATGHSTGGLEEQASESSPDTTAMDTGTKEAGKDGRENTTLLHSPG 80 90 100 110 120 130 60 70 80 90 100 pF1KE2 DI----RLDRAQIRNSIIGEKYR-WPH-TIPYVLEDSLEMNAKGVILNAFERYRLKTCID . . ..: . .. : :: .::::. .. . .... .:..... .::. CCDS74 TLHAAAKTFSPRVRRATTSRTERIWPGGVIPYVIGGNFTGSQRAIFKQAMRHWEKHTCVT 140 150 160 170 180 190 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 FKPWAGETNYISV-FKGSGCWSSVGNRRVGKQELSIGANCDRIATVQHEFLHALGFWHEQ : . : ..: .. :: : :: : : : .::: :::... : ::. :..:::::. CCDS74 FIERTDEESFIVFSYRTCGCCSYVGRRGGGPQAISIGKNCDKFGIVAHELGHVVGFWHEH 200 210 220 230 240 250 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 SRSDRDDYVRIMWDRILSGREHNFNTYSDDISDSLNVPYDYTSVMHYSKTAFQNGTE-PT .: :::..: :. . : :.:.:: . .::. ::. :.:::....:. :. : CCDS74 TRPDRDQHVTIIRENIQPGQEYNFLKMEAGEVSSLGETYDFDSIMHYARNTFSRGVFLDT 260 270 280 290 300 310 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 IVTRISD--FEDVIGQRMDFSDSDLLKLNQLYNCSSSLSFMDSCSFELENVCGMIQSSGD :. : .: . .::::. .:..:. . .::.: .:. :... : ... : CCDS74 ILPRQDDNGVRPTIGQRVRLSQGDIAQARKLYKCP-------ACGETLQDTTGNFSAPGF 320 330 340 350 360 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 NADWQRVSQVPRGPESDHSNMGQCQGSGFFMHFDSSSVNVGATAVLESRTLYPKRGFQCL CCDS74 PNGYPSYSHCVWRISVTPGEKIVLNFTSMDLFKSRLCWYDYVEVRDGYWRKAPLLGRFCG 370 380 390 400 410 420 >>CCDS56342.1 TLL1 gene_id:7092|Hs108|chr4 (392 aa) initn: 488 init1: 311 opt: 434 Z-score: 509.6 bits: 103.9 E(32554): 4.6e-22 Smith-Waterman score: 434; 34.4% identity (63.7% similar) in 215 aa overlap (71-280:157-364) 50 60 70 80 90 pF1KE2 NEGLGLDLFEGDIRLDRAQIRNSIIGEKYRWPH-TIPYVLEDSLEMNAKGVILNAFERYR :: .::::. .. . .... .:..... 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