FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5749, 673 aa 1>>>pF1KE5749 673 - 673 aa - 673 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.4463+/-0.000359; mu= 3.3474+/- 0.023 mean_var=283.2351+/-59.797, 0's: 0 Z-trim(122.3): 19 B-trim: 492 in 1/57 Lambda= 0.076208 statistics sampled from 40166 (40185) to 40166 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.763), E-opt: 0.2 (0.471), width: 16 Scan time: 10.880 The best scores are: opt bits E(85289) NP_004851 (OMIM: 605339) fragile X mental retardat ( 673) 4489 507.1 8.5e-143 XP_005247870 (OMIM: 600819) PREDICTED: fragile X m ( 677) 2719 312.5 3.3e-84 XP_005247871 (OMIM: 600819) PREDICTED: fragile X m ( 650) 2518 290.4 1.4e-77 XP_005247873 (OMIM: 600819) PREDICTED: fragile X m ( 568) 2511 289.6 2.2e-77 XP_006713838 (OMIM: 600819) PREDICTED: fragile X m ( 592) 2218 257.4 1.1e-67 XP_016862787 (OMIM: 600819) PREDICTED: fragile X m ( 565) 2017 235.3 4.9e-61 XP_016862789 (OMIM: 600819) PREDICTED: fragile X m ( 483) 2010 234.4 7.4e-61 NP_001013456 (OMIM: 600819) fragile X mental retar ( 539) 2010 234.5 8.1e-61 NP_005078 (OMIM: 600819) fragile X mental retardat ( 621) 2010 234.5 8.9e-61 XP_005247872 (OMIM: 600819) PREDICTED: fragile X m ( 648) 2010 234.6 9.2e-61 NP_001172010 (OMIM: 300623,300624,309550,311360) s ( 516) 1604 189.8 2.1e-47 NP_001172004 (OMIM: 300623,300624,309550,311360) s ( 537) 1604 189.8 2.2e-47 NP_001172011 (OMIM: 300623,300624,309550,311360) s ( 586) 1604 189.9 2.3e-47 NP_001172005 (OMIM: 300623,300624,309550,311360) s ( 611) 1604 189.9 2.4e-47 NP_002015 (OMIM: 300623,300624,309550,311360) syna ( 632) 1604 189.9 2.5e-47 XP_016862790 (OMIM: 600819) PREDICTED: fragile X m ( 454) 1509 179.3 2.7e-44 NP_001013457 (OMIM: 600819) fragile X mental retar ( 536) 1509 179.4 3.1e-44 XP_016862788 (OMIM: 600819) PREDICTED: fragile X m ( 563) 1509 179.4 3.2e-44 >>NP_004851 (OMIM: 605339) fragile X mental retardation (673 aa) initn: 4489 init1: 4489 opt: 4489 Z-score: 2684.7 bits: 507.1 E(85289): 8.5e-143 Smith-Waterman score: 4489; 100.0% identity (100.0% similar) in 673 aa overlap (1-673:1-673) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MGGLASGGDVEPGLPVEVRGSNGAFYKGFVKDVHEDSVTIFFENNWQSERQIPFGDVRLP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_004 MGGLASGGDVEPGLPVEVRGSNGAFYKGFVKDVHEDSVTIFFENNWQSERQIPFGDVRLP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 PPADYNKEITEGDEVEVYSRANEQEPCGWWLARVRMMKGDFYVIEYAACDATYNEIVTLE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_004 PPADYNKEITEGDEVEVYSRANEQEPCGWWLARVRMMKGDFYVIEYAACDATYNEIVTLE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 RLRPVNPNPLATKGSFFKVTMAVPEDLREACSNENVHKEFKKALGANCIFLNITNSELFI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_004 RLRPVNPNPLATKGSFFKVTMAVPEDLREACSNENVHKEFKKALGANCIFLNITNSELFI 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 LSTTEAPVKRASLLGDMHFRSLRTKLLLMSRNEEATKHLETSKQLAAAFQEEFTVREDLM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_004 LSTTEAPVKRASLLGDMHFRSLRTKLLLMSRNEEATKHLETSKQLAAAFQEEFTVREDLM 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 GLAIGTHGANIQQARKVPGVTAIELGEETCTFRIYGETPEACRQARSYLEFSEDSVQVPR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_004 GLAIGTHGANIQQARKVPGVTAIELGEETCTFRIYGETPEACRQARSYLEFSEDSVQVPR 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 NLVGKVIGKNGKVIQEIVDKSGVVRVRVEGDNDKKNPREEGMVPFIFVGTRENISNAQAL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_004 NLVGKVIGKNGKVIQEIVDKSGVVRVRVEGDNDKKNPREEGMVPFIFVGTRENISNAQAL 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 LEYHLSYLQEVEQLRLERLQIDEQLRQIGLGFRPPGSGRGSGGSDKAGYSTDESSSSSLH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_004 LEYHLSYLQEVEQLRLERLQIDEQLRQIGLGFRPPGSGRGSGGSDKAGYSTDESSSSSLH 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE5 ATRTYGGSYGGRGRGRRTGGPAYGPSSDVSTASETESEKREEPNRAGPGDRDPPTRGEES :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_004 ATRTYGGSYGGRGRGRRTGGPAYGPSSDVSTASETESEKREEPNRAGPGDRDPPTRGEES 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE5 RRRPTGGRGRGPPPAPRPTSRYNSSSISSVLKDPDSNPYSLLDTSEPEPPVDSEPGEPPP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_004 RRRPTGGRGRGPPPAPRPTSRYNSSSISSVLKDPDSNPYSLLDTSEPEPPVDSEPGEPPP 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE5 ASARRRRSRRRRTDEDRTVMDGGLESDGPNMTENGLEDESRPQRRNRSRRRRNRGNRTDG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_004 ASARRRRSRRRRTDEDRTVMDGGLESDGPNMTENGLEDESRPQRRNRSRRRRNRGNRTDG 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE5 SISGDRQPVTVADYISRAESQSRQRPPLERTKPSEDSLSGQKGDSVSKLPKGPSENGELS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_004 SISGDRQPVTVADYISRAESQSRQRPPLERTKPSEDSLSGQKGDSVSKLPKGPSENGELS 610 620 630 640 650 660 670 pF1KE5 APLELGSMVNGVS ::::::::::::: NP_004 APLELGSMVNGVS 670 >>XP_005247870 (OMIM: 600819) PREDICTED: fragile X menta (677 aa) initn: 2514 init1: 2020 opt: 2719 Z-score: 1632.9 bits: 312.5 E(85289): 3.3e-84 Smith-Waterman score: 2754; 64.5% identity (81.9% similar) in 691 aa overlap (14-673:4-677) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MGGLASGGDVEPGLPVEVRGSNGAFYKGFVKDVHEDSVTIFFENNWQSERQIPFGDVRLP : ::::::::::::::.:::::::.:. :::::: :::.::..:::: XP_005 MAELTVEVRGSNGAFYKGFIKDVHEDSLTVVFENNWQPERQVPFNEVRLP 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 PPADYNKEITEGDEVEVYSRANEQEPCGWWLARVRMMKGDFYVIEYAACDATYNEIVTLE :: : .:::.::::::::::::.:::::::::.::::::.::::::::::::::::::.: XP_005 PPPDIKKEISEGDEVEVYSRANDQEPCGWWLAKVRMMKGEFYVIEYAACDATYNEIVTFE 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 RLRPVNPNPLATKGSFFKVTMAVPEDLREACSNENVHKEFKKALGANCIFLNITNSELFI :::::: : . :..::: :. :::::::::.:::.::.::::.:: :: . ...:.: XP_005 RLRPVNQNKTVKKNTFFKCTVDVPEDLREACANENAHKDFKKAVGACRIFYHPETTQLMI 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 LSTTEAPVKRASLLGDMHFRSLRTKLLLMSRNEEATKHLETSKQLAAAFQEEFTVREDLM ::..:: :::...:.:::.::.::::.::::::::::::: .:::::::.:::.:::::: XP_005 LSASEATVKRVNILSDMHLRSIRTKLMLMSRNEEATKHLECTKQLAAAFHEEFVVREDLM 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 GLAIGTHGANIQQARKVPGVTAIELGEETCTFRIYGETPEACRQARSYLEFSEDSVQVPR ::::::::.:::::::::::::::: :.: :::::::. .: ..::..::: :: .:::: XP_005 GLAIGTHGSNIQQARKVPGVTAIELDEDTGTFRIYGESADAVKKARGFLEFVEDFIQVPR 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 NLVGKVIGKNGKVIQEIVDKSGVVRVRVEGDNDKKNPREEGMVPFIFVGTRENISNAQAL :::::::::::::::::::::::::::.::::..: :::.:::::.::::.:.:.:.:.: XP_005 NLVGKVIGKNGKVIQEIVDKSGVVRVRIEGDNENKLPREDGMVPFVFVGTKESIGNVQVL 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 LEYHLSYLQEVEQLRLERLQIDEQLRQIGLGFRPPGSGRGSGGSDKAGYSTDESSSSSLH ::::..::.::::::.:::::::::::::.:::: .: :: . ::.::::. ::.. XP_005 LEYHIAYLKEVEQLRMERLQIDEQLRQIGMGFRP-SSTRGP--EKEKGYATDESTVSSVQ 360 370 380 390 400 430 440 450 460 470 pF1KE5 ATRTYGGSYGGRGRGRRTGGP----AYGPSSDVSTASETESEKREEPNR---AGPGDRDP ..: ::.::::::: :: .:: .:..:. ::::::...: . :: ::: XP_005 GSR----SYSGRGRGRR--GPNYTSGYGTNSELSNPSETESERKDELSDWSLAGEDDRDS 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KE5 PTRGEESRRRPTGGRGRGPPPA-PRPTSRYNSSSISSVLKDPDSNPYSLLDTSEPEPPVD . ..::::: :::::. . : : ..:::::::::::::::::::..: . .: XP_005 -RHQRDSRRRP-GGRGRSVSGGRGRGGPRGGKSSISSVLKDPDSNPYSLLDNTESDQTAD 470 480 490 500 510 540 550 560 570 580 590 pF1KE5 SEPGEPPPASARRRRSRRRRTDEDRTVMDGGLESDGPNMTENGLED-ESRPQRRNRSRRR .. .: .. ::::::::::::: ..::: ::: ...::::.: :..:::::::::: XP_005 TDASESHHSTNRRRRSRRRRTDEDAVLMDGMTESDTASVNENGLDDSEKKPQRRNRSRRR 520 530 540 550 560 570 600 610 620 630 pF1KE5 RNRGNRTDGSISGDRQPVTVADYISRAESQSRQR--P--PLERTK------------PSE : ::. . ::::::::::::::::::::: : : ..: ::: XP_005 RFRGQ------AEDRQPVTVADYISRAESQSRQRNLPRETLAKNKKEMAKDVIEEHGPSE 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 pF1KE5 DSLSGQ---KGDSVSKLPKGPSE---NGELSAPLELGSMVNGVS ...: .::..::: . :.: : . ....:::: XP_005 KAINGPTSASGDDISKLQRTPGEEKINTLKEENTQEAAVLNGVS 640 650 660 670 >>XP_005247871 (OMIM: 600819) PREDICTED: fragile X menta (650 aa) initn: 2491 init1: 2020 opt: 2518 Z-score: 1513.7 bits: 290.4 E(85289): 1.4e-77 Smith-Waterman score: 2576; 61.9% identity (78.6% similar) in 690 aa overlap (14-673:4-650) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MGGLASGGDVEPGLPVEVRGSNGAFYKGFVKDVHEDSVTIFFENNWQSERQIPFGDVRLP : ::::::::::::::.:::::::.:. :::::: :::.::..:::: XP_005 MAELTVEVRGSNGAFYKGFIKDVHEDSLTVVFENNWQPERQVPFNEVRLP 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 PPADYNKEITEGDEVEVYSRANEQEPCGWWLARVRMMKGDFYVIEYAACDATYNEIVTLE :: : .:::.::::::::::::.:::::::::.::::::.::::::::::::::::::.: XP_005 PPPDIKKEISEGDEVEVYSRANDQEPCGWWLAKVRMMKGEFYVIEYAACDATYNEIVTFE 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 RLRPVNPNPLATKGSFFKVTMAVPEDLREACSNENVHKEFKKALGANCIFLNITNSELFI :::::: : . :..::: :. :::::::::.:::.::.::::.:: :: . ...:.: XP_005 RLRPVNQNKTVKKNTFFKCTVDVPEDLREACANENAHKDFKKAVGACRIFYHPETTQLMI 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 LSTTEAPVKRASLLGDMHFRSLRTKLLLMSRNEEATKHLETSKQLAAAFQEEFTVREDLM ::..:: :::...:.:::.::.::::.::::::::::::: .:::::::.:::.:::::: XP_005 LSASEATVKRVNILSDMHLRSIRTKLMLMSRNEEATKHLECTKQLAAAFHEEFVVREDLM 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 GLAIGTHGANIQQARKVPGVTAIELGEETCTFRIYGETPEACRQARSYLEFSEDSVQVPR ::::::::.:::::::::::::::: :.: :::::::. .: ..::..::: :: .:::: XP_005 GLAIGTHGSNIQQARKVPGVTAIELDEDTGTFRIYGESADAVKKARGFLEFVEDFIQVPR 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 NLVGKVIGKNGKVIQEIVDKSGVVRVRVEGDNDKKNPREEGMVPFIFVGTRENISNAQAL :::::::::::::::::::::::::::.::::..: :::.:::::.::::.:.:.:.:.: XP_005 NLVGKVIGKNGKVIQEIVDKSGVVRVRIEGDNENKLPREDGMVPFVFVGTKESIGNVQVL 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 LEYHLSYLQEVEQLRLERLQIDEQLRQIGLGFRPPGSGRGSGGSDKAGYSTDESSSSSLH ::::..::.::::::.:::::::::::::.:::: .: :: . ::.::::. ::.. XP_005 LEYHIAYLKEVEQLRMERLQIDEQLRQIGMGFRP-SSTRGP--EKEKGYATDESTVSSVQ 360 370 380 390 400 430 440 450 460 470 pF1KE5 ATRTYGGSYGGRGRGRRTGGP----AYGPSSDVSTASETESEKREEPNR---AGPGDRDP ..: ::.::::::: :: .:: .:..:. ::::::...: . :: ::: XP_005 GSR----SYSGRGRGRR--GPNYTSGYGTNSELSNPSETESERKDELSDWSLAGEDDRDS 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KE5 PTRGEESRRRPTGGRGRGPPPA-PRPTSRYNSSSISSVLKDPDSNPYSLLDTSEPEPPVD . ..::::: :::::. . : : ..:::::::::::::::::::..: . .: XP_005 -RHQRDSRRRP-GGRGRSVSGGRGRGGPRGGKSSISSVLKDPDSNPYSLLDNTESDQTAD 470 480 490 500 510 540 550 560 570 580 590 pF1KE5 SEPGEPPPASARRRRSRRRRTDEDRTVMDGGLESDGPNMTENGLEDESRPQRRNRSRRRR .. .: .. ::::::::::::: ..::: ::: ...:::: XP_005 TDASESHHSTNRRRRSRRRRTDEDAVLMDGMTESDTASVNENGL---------------- 520 530 540 550 560 600 610 620 630 pF1KE5 NRGNRTDGSISGDRQPVTVADYISRAESQSRQR--P--PLERTK------------PSED ::::::::::::::::: : : ..: ::: XP_005 ----------------VTVADYISRAESQSRQRNLPRETLAKNKKEMAKDVIEEHGPSEK 570 580 590 600 640 650 660 670 pF1KE5 SLSGQ---KGDSVSKLPKGPSE---NGELSAPLELGSMVNGVS ...: .::..::: . :.: : . ....:::: XP_005 AINGPTSASGDDISKLQRTPGEEKINTLKEENTQEAAVLNGVS 610 620 630 640 650 >>XP_005247873 (OMIM: 600819) PREDICTED: fragile X menta (568 aa) initn: 2403 init1: 2020 opt: 2511 Z-score: 1510.3 bits: 289.6 E(85289): 2.2e-77 Smith-Waterman score: 2516; 68.5% identity (86.0% similar) in 571 aa overlap (14-576:4-563) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MGGLASGGDVEPGLPVEVRGSNGAFYKGFVKDVHEDSVTIFFENNWQSERQIPFGDVRLP : ::::::::::::::.:::::::.:. :::::: :::.::..:::: XP_005 MAELTVEVRGSNGAFYKGFIKDVHEDSLTVVFENNWQPERQVPFNEVRLP 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 PPADYNKEITEGDEVEVYSRANEQEPCGWWLARVRMMKGDFYVIEYAACDATYNEIVTLE :: : .:::.::::::::::::.:::::::::.::::::.::::::::::::::::::.: XP_005 PPPDIKKEISEGDEVEVYSRANDQEPCGWWLAKVRMMKGEFYVIEYAACDATYNEIVTFE 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 RLRPVNPNPLATKGSFFKVTMAVPEDLREACSNENVHKEFKKALGANCIFLNITNSELFI :::::: : . :..::: :. :::::::::.:::.::.::::.:: :: . ...:.: XP_005 RLRPVNQNKTVKKNTFFKCTVDVPEDLREACANENAHKDFKKAVGACRIFYHPETTQLMI 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 LSTTEAPVKRASLLGDMHFRSLRTKLLLMSRNEEATKHLETSKQLAAAFQEEFTVREDLM ::..:: :::...:.:::.::.::::.::::::::::::: .:::::::.:::.:::::: XP_005 LSASEATVKRVNILSDMHLRSIRTKLMLMSRNEEATKHLECTKQLAAAFHEEFVVREDLM 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 GLAIGTHGANIQQARKVPGVTAIELGEETCTFRIYGETPEACRQARSYLEFSEDSVQVPR ::::::::.:::::::::::::::: :.: :::::::. .: ..::..::: :: .:::: XP_005 GLAIGTHGSNIQQARKVPGVTAIELDEDTGTFRIYGESADAVKKARGFLEFVEDFIQVPR 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 NLVGKVIGKNGKVIQEIVDKSGVVRVRVEGDNDKKNPREEGMVPFIFVGTRENISNAQAL :::::::::::::::::::::::::::.::::..: :::.:::::.::::.:.:.:.:.: XP_005 NLVGKVIGKNGKVIQEIVDKSGVVRVRIEGDNENKLPREDGMVPFVFVGTKESIGNVQVL 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 LEYHLSYLQEVEQLRLERLQIDEQLRQIGLGFRPPGSGRGSGGSDKAGYSTDESSSSSLH ::::..::.::::::.:::::::::::::.:::: .: :: . ::.::::. ::.. XP_005 LEYHIAYLKEVEQLRMERLQIDEQLRQIGMGFRP-SSTRGP--EKEKGYATDESTVSSVQ 360 370 380 390 400 430 440 450 460 470 pF1KE5 ATRTYGGSYGGRGRGRRTGGP----AYGPSSDVSTASETESEKREEPNR---AGPGDRDP ..: ::.::::::: :: .:: .:..:. ::::::...: . :: ::: XP_005 GSR----SYSGRGRGRR--GPNYTSGYGTNSELSNPSETESERKDELSDWSLAGEDDRDS 410 420 430 440 450 460 480 490 500 510 520 530 pF1KE5 PTRGEESRRRPTGGRGRGPPPA-PRPTSRYNSSSISSVLKDPDSNPYSLLDTSEPEPPVD . ..::::: :::::. . : : ..:::::::::::::::::::..: . .: XP_005 -RHQRDSRRRP-GGRGRSVSGGRGRGGPRGGKSSISSVLKDPDSNPYSLLDNTESDQTAD 470 480 490 500 510 540 550 560 570 580 590 pF1KE5 SEPGEPPPASARRRRSRRRRTDEDRTVMDGGLESDGPNMTENGLEDESRPQRRNRSRRRR .. .: .. ::::::::::::: ..::: ::: ...:::: XP_005 TDASESHHSTNRRRRSRRRRTDEDAVLMDGMTESDTASVNENGLGKRCD 520 530 540 550 560 600 610 620 630 640 650 pF1KE5 NRGNRTDGSISGDRQPVTVADYISRAESQSRQRPPLERTKPSEDSLSGQKGDSVSKLPKG >>XP_006713838 (OMIM: 600819) PREDICTED: fragile X menta (592 aa) initn: 2013 init1: 1519 opt: 2218 Z-score: 1336.0 bits: 257.4 E(85289): 1.1e-67 Smith-Waterman score: 2253; 62.2% identity (80.3% similar) in 609 aa overlap (96-673:1-592) 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 NKEITEGDEVEVYSRANEQEPCGWWLARVRMMKGDFYVIEYAACDATYNEIVTLERLRPV ::::.::::::::::::::::::.:::::: XP_006 MMKGEFYVIEYAACDATYNEIVTFERLRPV 10 20 30 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 NPNPLATKGSFFKVTMAVPEDLREACSNENVHKEFKKALGANCIFLNITNSELFILSTTE : : . :..::: :. :::::::::.:::.::.::::.:: :: . ...:.:::..: XP_006 NQNKTVKKNTFFKCTVDVPEDLREACANENAHKDFKKAVGACRIFYHPETTQLMILSASE 40 50 60 70 80 90 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 APVKRASLLGDMHFRSLRTKLLLMSRNEEATKHLETSKQLAAAFQEEFTVREDLMGLAIG : :::...:.:::.::.::::.::::::::::::: .:::::::.:::.::::::::::: XP_006 ATVKRVNILSDMHLRSIRTKLMLMSRNEEATKHLECTKQLAAAFHEEFVVREDLMGLAIG 100 110 120 130 140 150 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 THGANIQQARKVPGVTAIELGEETCTFRIYGETPEACRQARSYLEFSEDSVQVPRNLVGK :::.:::::::::::::::: :.: :::::::. .: ..::..::: :: .::::::::: XP_006 THGSNIQQARKVPGVTAIELDEDTGTFRIYGESADAVKKARGFLEFVEDFIQVPRNLVGK 160 170 180 190 200 210 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 VIGKNGKVIQEIVDKSGVVRVRVEGDNDKKNPREEGMVPFIFVGTRENISNAQALLEYHL ::::::::::::::::::::::.::::..: :::.:::::.::::.:.:.:.:.:::::. XP_006 VIGKNGKVIQEIVDKSGVVRVRIEGDNENKLPREDGMVPFVFVGTKESIGNVQVLLEYHI 220 230 240 250 260 270 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 SYLQEVEQLRLERLQIDEQLRQIGLGFRPPGSGRGSGGSDKAGYSTDESSSSSLHATRTY .::.::::::.:::::::::::::.:::: .: :: . ::.::::. ::....: XP_006 AYLKEVEQLRMERLQIDEQLRQIGMGFRP-SSTRGP--EKEKGYATDESTVSSVQGSR-- 280 290 300 310 320 430 440 450 460 470 pF1KE5 GGSYGGRGRGRRTGGP----AYGPSSDVSTASETESEKREEPNR---AGPGDRDPPTRGE ::.::::::: :: .:: .:..:. ::::::...: . :: ::: . . XP_006 --SYSGRGRGRR--GPNYTSGYGTNSELSNPSETESERKDELSDWSLAGEDDRDS-RHQR 330 340 350 360 370 380 480 490 500 510 520 530 pF1KE5 ESRRRPTGGRGRGPPPA-PRPTSRYNSSSISSVLKDPDSNPYSLLDTSEPEPPVDSEPGE .::::: :::::. . : : ..:::::::::::::::::::..: . .:.. .: XP_006 DSRRRP-GGRGRSVSGGRGRGGPRGGKSSISSVLKDPDSNPYSLLDNTESDQTADTDASE 390 400 410 420 430 540 550 560 570 580 590 pF1KE5 PPPASARRRRSRRRRTDEDRTVMDGGLESDGPNMTENGLED-ESRPQRRNRSRRRRNRGN .. ::::::::::::: ..::: ::: ...::::.: :..::::::::::: ::. XP_006 SHHSTNRRRRSRRRRTDEDAVLMDGMTESDTASVNENGLDDSEKKPQRRNRSRRRRFRGQ 440 450 460 470 480 490 600 610 620 630 640 pF1KE5 RTDGSISGDRQPVTVADYISRAESQSRQR--P--PLERTK------------PSEDSLSG . ::::::::::::::::::::: : : ..: ::: ...: XP_006 ------AEDRQPVTVADYISRAESQSRQRNLPRETLAKNKKEMAKDVIEEHGPSEKAING 500 510 520 530 540 550 650 660 670 pF1KE5 Q---KGDSVSKLPKGPSE---NGELSAPLELGSMVNGVS .::..::: . :.: : . ....:::: XP_006 PTSASGDDISKLQRTPGEEKINTLKEENTQEAAVLNGVS 560 570 580 590 >>XP_016862787 (OMIM: 600819) PREDICTED: fragile X menta (565 aa) initn: 1990 init1: 1519 opt: 2017 Z-score: 1216.8 bits: 235.3 E(85289): 4.9e-61 Smith-Waterman score: 2075; 59.2% identity (76.5% similar) in 608 aa overlap (96-673:1-565) 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 NKEITEGDEVEVYSRANEQEPCGWWLARVRMMKGDFYVIEYAACDATYNEIVTLERLRPV ::::.::::::::::::::::::.:::::: XP_016 MMKGEFYVIEYAACDATYNEIVTFERLRPV 10 20 30 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 NPNPLATKGSFFKVTMAVPEDLREACSNENVHKEFKKALGANCIFLNITNSELFILSTTE : : . :..::: :. :::::::::.:::.::.::::.:: :: . ...:.:::..: XP_016 NQNKTVKKNTFFKCTVDVPEDLREACANENAHKDFKKAVGACRIFYHPETTQLMILSASE 40 50 60 70 80 90 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 APVKRASLLGDMHFRSLRTKLLLMSRNEEATKHLETSKQLAAAFQEEFTVREDLMGLAIG : :::...:.:::.::.::::.::::::::::::: .:::::::.:::.::::::::::: XP_016 ATVKRVNILSDMHLRSIRTKLMLMSRNEEATKHLECTKQLAAAFHEEFVVREDLMGLAIG 100 110 120 130 140 150 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 THGANIQQARKVPGVTAIELGEETCTFRIYGETPEACRQARSYLEFSEDSVQVPRNLVGK :::.:::::::::::::::: :.: :::::::. .: ..::..::: :: .::::::::: XP_016 THGSNIQQARKVPGVTAIELDEDTGTFRIYGESADAVKKARGFLEFVEDFIQVPRNLVGK 160 170 180 190 200 210 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 VIGKNGKVIQEIVDKSGVVRVRVEGDNDKKNPREEGMVPFIFVGTRENISNAQALLEYHL ::::::::::::::::::::::.::::..: :::.:::::.::::.:.:.:.:.:::::. XP_016 VIGKNGKVIQEIVDKSGVVRVRIEGDNENKLPREDGMVPFVFVGTKESIGNVQVLLEYHI 220 230 240 250 260 270 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 SYLQEVEQLRLERLQIDEQLRQIGLGFRPPGSGRGSGGSDKAGYSTDESSSSSLHATRTY .::.::::::.:::::::::::::.:::: .: :: . ::.::::. ::....: XP_016 AYLKEVEQLRMERLQIDEQLRQIGMGFRP-SSTRGP--EKEKGYATDESTVSSVQGSR-- 280 290 300 310 320 430 440 450 460 470 pF1KE5 GGSYGGRGRGRRTGGP----AYGPSSDVSTASETESEKREEPNR---AGPGDRDPPTRGE ::.::::::: :: .:: .:..:. ::::::...: . :: ::: . . XP_016 --SYSGRGRGRR--GPNYTSGYGTNSELSNPSETESERKDELSDWSLAGEDDRDS-RHQR 330 340 350 360 370 380 480 490 500 510 520 530 pF1KE5 ESRRRPTGGRGRGPPPA-PRPTSRYNSSSISSVLKDPDSNPYSLLDTSEPEPPVDSEPGE .::::: :::::. . : : ..:::::::::::::::::::..: . .:.. .: XP_016 DSRRRP-GGRGRSVSGGRGRGGPRGGKSSISSVLKDPDSNPYSLLDNTESDQTADTDASE 390 400 410 420 430 540 550 560 570 580 590 pF1KE5 PPPASARRRRSRRRRTDEDRTVMDGGLESDGPNMTENGLEDESRPQRRNRSRRRRNRGNR .. ::::::::::::: ..::: ::: ...:::: XP_016 SHHSTNRRRRSRRRRTDEDAVLMDGMTESDTASVNENGL--------------------- 440 450 460 470 600 610 620 630 640 pF1KE5 TDGSISGDRQPVTVADYISRAESQSRQR--P--PLERTK------------PSEDSLSGQ ::::::::::::::::: : : ..: ::: ...: XP_016 -----------VTVADYISRAESQSRQRNLPRETLAKNKKEMAKDVIEEHGPSEKAINGP 480 490 500 510 520 650 660 670 pF1KE5 ---KGDSVSKLPKGPSE---NGELSAPLELGSMVNGVS .::..::: . :.: : . ....:::: XP_016 TSASGDDISKLQRTPGEEKINTLKEENTQEAAVLNGVS 530 540 550 560 >>XP_016862789 (OMIM: 600819) PREDICTED: fragile X menta (483 aa) initn: 1902 init1: 1519 opt: 2010 Z-score: 1213.5 bits: 234.4 E(85289): 7.4e-61 Smith-Waterman score: 2015; 66.3% identity (84.7% similar) in 489 aa overlap (96-576:1-478) 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 NKEITEGDEVEVYSRANEQEPCGWWLARVRMMKGDFYVIEYAACDATYNEIVTLERLRPV ::::.::::::::::::::::::.:::::: XP_016 MMKGEFYVIEYAACDATYNEIVTFERLRPV 10 20 30 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 NPNPLATKGSFFKVTMAVPEDLREACSNENVHKEFKKALGANCIFLNITNSELFILSTTE : : . :..::: :. :::::::::.:::.::.::::.:: :: . ...:.:::..: XP_016 NQNKTVKKNTFFKCTVDVPEDLREACANENAHKDFKKAVGACRIFYHPETTQLMILSASE 40 50 60 70 80 90 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 APVKRASLLGDMHFRSLRTKLLLMSRNEEATKHLETSKQLAAAFQEEFTVREDLMGLAIG : :::...:.:::.::.::::.::::::::::::: .:::::::.:::.::::::::::: XP_016 ATVKRVNILSDMHLRSIRTKLMLMSRNEEATKHLECTKQLAAAFHEEFVVREDLMGLAIG 100 110 120 130 140 150 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 THGANIQQARKVPGVTAIELGEETCTFRIYGETPEACRQARSYLEFSEDSVQVPRNLVGK :::.:::::::::::::::: :.: :::::::. .: ..::..::: :: .::::::::: XP_016 THGSNIQQARKVPGVTAIELDEDTGTFRIYGESADAVKKARGFLEFVEDFIQVPRNLVGK 160 170 180 190 200 210 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 VIGKNGKVIQEIVDKSGVVRVRVEGDNDKKNPREEGMVPFIFVGTRENISNAQALLEYHL ::::::::::::::::::::::.::::..: :::.:::::.::::.:.:.:.:.:::::. XP_016 VIGKNGKVIQEIVDKSGVVRVRIEGDNENKLPREDGMVPFVFVGTKESIGNVQVLLEYHI 220 230 240 250 260 270 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 SYLQEVEQLRLERLQIDEQLRQIGLGFRPPGSGRGSGGSDKAGYSTDESSSSSLHATRTY .::.::::::.:::::::::::::.:::: .: :: . ::.::::. ::....: XP_016 AYLKEVEQLRMERLQIDEQLRQIGMGFRP-SSTRGP--EKEKGYATDESTVSSVQGSR-- 280 290 300 310 320 430 440 450 460 470 pF1KE5 GGSYGGRGRGRRTGGP----AYGPSSDVSTASETESEKREEPNR---AGPGDRDPPTRGE ::.::::::: :: .:: .:..:. ::::::...: . :: ::: . . XP_016 --SYSGRGRGRR--GPNYTSGYGTNSELSNPSETESERKDELSDWSLAGEDDRDS-RHQR 330 340 350 360 370 380 480 490 500 510 520 530 pF1KE5 ESRRRPTGGRGRGPPPA-PRPTSRYNSSSISSVLKDPDSNPYSLLDTSEPEPPVDSEPGE .::::: :::::. . : : ..:::::::::::::::::::..: . .:.. .: XP_016 DSRRRP-GGRGRSVSGGRGRGGPRGGKSSISSVLKDPDSNPYSLLDNTESDQTADTDASE 390 400 410 420 430 540 550 560 570 580 590 pF1KE5 PPPASARRRRSRRRRTDEDRTVMDGGLESDGPNMTENGLEDESRPQRRNRSRRRRNRGNR .. ::::::::::::: ..::: ::: ...:::: XP_016 SHHSTNRRRRSRRRRTDEDAVLMDGMTESDTASVNENGLGKRCD 440 450 460 470 480 600 610 620 630 640 650 pF1KE5 TDGSISGDRQPVTVADYISRAESQSRQRPPLERTKPSEDSLSGQKGDSVSKLPKGPSENG >>NP_001013456 (OMIM: 600819) fragile X mental retardati (539 aa) initn: 2289 init1: 1985 opt: 2010 Z-score: 1212.9 bits: 234.5 E(85289): 8.1e-61 Smith-Waterman score: 2364; 65.8% identity (82.0% similar) in 571 aa overlap (14-576:4-534) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MGGLASGGDVEPGLPVEVRGSNGAFYKGFVKDVHEDSVTIFFENNWQSERQIPFGDVRLP : ::::::::::::::.:::::::.:. :::::: :::.::..:::: NP_001 MAELTVEVRGSNGAFYKGFIKDVHEDSLTVVFENNWQPERQVPFNEVRLP 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 PPADYNKEITEGDEVEVYSRANEQEPCGWWLARVRMMKGDFYVIEYAACDATYNEIVTLE :: : .:::.::::::::::::.:::::::::.::::::.::::::::::::::::::.: NP_001 PPPDIKKEISEGDEVEVYSRANDQEPCGWWLAKVRMMKGEFYVIEYAACDATYNEIVTFE 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 RLRPVNPNPLATKGSFFKVTMAVPEDLREACSNENVHKEFKKALGANCIFLNITNSELFI :::::: : . :..::: :. :::::::::.:::.::.::::.:: :: . ...:.: NP_001 RLRPVNQNKTVKKNTFFKCTVDVPEDLREACANENAHKDFKKAVGACRIFYHPETTQLMI 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 LSTTEAPVKRASLLGDMHFRSLRTKLLLMSRNEEATKHLETSKQLAAAFQEEFTVREDLM ::..:: :::...:.:::.::.::::.::::::::::::: .:::::::.:::.:::::: NP_001 LSASEATVKRVNILSDMHLRSIRTKLMLMSRNEEATKHLECTKQLAAAFHEEFVVREDLM 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 GLAIGTHGANIQQARKVPGVTAIELGEETCTFRIYGETPEACRQARSYLEFSEDSVQVPR ::::::::.:::::::::::::::: :.: :::::::. .: ..::..::: :: .:::: NP_001 GLAIGTHGSNIQQARKVPGVTAIELDEDTGTFRIYGESADAVKKARGFLEFVEDFIQVPR 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 NLVGKVIGKNGKVIQEIVDKSGVVRVRVEGDNDKKNPREEGMVPFIFVGTRENISNAQAL :::::::::::::::::::::::::::.::::..: :::.:::::.::::.:.:.:.:.: NP_001 NLVGKVIGKNGKVIQEIVDKSGVVRVRIEGDNENKLPREDGMVPFVFVGTKESIGNVQVL 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 LEYHLSYLQEVEQLRLERLQIDEQLRQIGLGFRPPGSGRGSGGSDKAGYSTDESSSSSLH ::::..::.::::::.::::::::::::: NP_001 LEYHIAYLKEVEQLRMERLQIDEQLRQIG------------------------------- 360 370 430 440 450 460 470 pF1KE5 ATRTYGGSYGGRGRGRRTGGP----AYGPSSDVSTASETESEKREEPNR---AGPGDRDP .: ::.::::::: :: .:: .:..:. ::::::...: . :: ::: NP_001 -SR----SYSGRGRGRR--GPNYTSGYGTNSELSNPSETESERKDELSDWSLAGEDDRDS 380 390 400 410 420 430 480 490 500 510 520 530 pF1KE5 PTRGEESRRRPTGGRGRGPPPA-PRPTSRYNSSSISSVLKDPDSNPYSLLDTSEPEPPVD . ..::::: :::::. . : : ..:::::::::::::::::::..: . .: NP_001 -RHQRDSRRRP-GGRGRSVSGGRGRGGPRGGKSSISSVLKDPDSNPYSLLDNTESDQTAD 440 450 460 470 480 490 540 550 560 570 580 590 pF1KE5 SEPGEPPPASARRRRSRRRRTDEDRTVMDGGLESDGPNMTENGLEDESRPQRRNRSRRRR .. .: .. ::::::::::::: ..::: ::: ...:::: NP_001 TDASESHHSTNRRRRSRRRRTDEDAVLMDGMTESDTASVNENGLGKRCD 500 510 520 530 600 610 620 630 640 650 pF1KE5 NRGNRTDGSISGDRQPVTVADYISRAESQSRQRPPLERTKPSEDSLSGQKGDSVSKLPKG >>NP_005078 (OMIM: 600819) fragile X mental retardation (621 aa) initn: 2377 init1: 1985 opt: 2010 Z-score: 1212.1 bits: 234.5 E(85289): 8.9e-61 Smith-Waterman score: 2424; 59.7% identity (75.2% similar) in 690 aa overlap (14-673:4-621) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MGGLASGGDVEPGLPVEVRGSNGAFYKGFVKDVHEDSVTIFFENNWQSERQIPFGDVRLP : ::::::::::::::.:::::::.:. :::::: :::.::..:::: NP_005 MAELTVEVRGSNGAFYKGFIKDVHEDSLTVVFENNWQPERQVPFNEVRLP 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 PPADYNKEITEGDEVEVYSRANEQEPCGWWLARVRMMKGDFYVIEYAACDATYNEIVTLE :: : .:::.::::::::::::.:::::::::.::::::.::::::::::::::::::.: NP_005 PPPDIKKEISEGDEVEVYSRANDQEPCGWWLAKVRMMKGEFYVIEYAACDATYNEIVTFE 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 RLRPVNPNPLATKGSFFKVTMAVPEDLREACSNENVHKEFKKALGANCIFLNITNSELFI :::::: : . :..::: :. :::::::::.:::.::.::::.:: :: . ...:.: NP_005 RLRPVNQNKTVKKNTFFKCTVDVPEDLREACANENAHKDFKKAVGACRIFYHPETTQLMI 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 LSTTEAPVKRASLLGDMHFRSLRTKLLLMSRNEEATKHLETSKQLAAAFQEEFTVREDLM ::..:: :::...:.:::.::.::::.::::::::::::: .:::::::.:::.:::::: NP_005 LSASEATVKRVNILSDMHLRSIRTKLMLMSRNEEATKHLECTKQLAAAFHEEFVVREDLM 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 GLAIGTHGANIQQARKVPGVTAIELGEETCTFRIYGETPEACRQARSYLEFSEDSVQVPR ::::::::.:::::::::::::::: :.: :::::::. .: ..::..::: :: .:::: NP_005 GLAIGTHGSNIQQARKVPGVTAIELDEDTGTFRIYGESADAVKKARGFLEFVEDFIQVPR 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 NLVGKVIGKNGKVIQEIVDKSGVVRVRVEGDNDKKNPREEGMVPFIFVGTRENISNAQAL :::::::::::::::::::::::::::.::::..: :::.:::::.::::.:.:.:.:.: NP_005 NLVGKVIGKNGKVIQEIVDKSGVVRVRIEGDNENKLPREDGMVPFVFVGTKESIGNVQVL 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 LEYHLSYLQEVEQLRLERLQIDEQLRQIGLGFRPPGSGRGSGGSDKAGYSTDESSSSSLH ::::..::.::::::.::::::::::::: NP_005 LEYHIAYLKEVEQLRMERLQIDEQLRQIG------------------------------- 360 370 430 440 450 460 470 pF1KE5 ATRTYGGSYGGRGRGRRTGGP----AYGPSSDVSTASETESEKREEPNR---AGPGDRDP .: ::.::::::: :: .:: .:..:. ::::::...: . :: ::: NP_005 -SR----SYSGRGRGRR--GPNYTSGYGTNSELSNPSETESERKDELSDWSLAGEDDRDS 380 390 400 410 420 430 480 490 500 510 520 530 pF1KE5 PTRGEESRRRPTGGRGRGPPPA-PRPTSRYNSSSISSVLKDPDSNPYSLLDTSEPEPPVD . ..::::: :::::. . : : ..:::::::::::::::::::..: . .: NP_005 -RHQRDSRRRP-GGRGRSVSGGRGRGGPRGGKSSISSVLKDPDSNPYSLLDNTESDQTAD 440 450 460 470 480 490 540 550 560 570 580 590 pF1KE5 SEPGEPPPASARRRRSRRRRTDEDRTVMDGGLESDGPNMTENGLEDESRPQRRNRSRRRR .. .: .. ::::::::::::: ..::: ::: ...:::: NP_005 TDASESHHSTNRRRRSRRRRTDEDAVLMDGMTESDTASVNENGL---------------- 500 510 520 530 600 610 620 630 pF1KE5 NRGNRTDGSISGDRQPVTVADYISRAESQSRQR--P--PLERTK------------PSED ::::::::::::::::: : : ..: ::: NP_005 ----------------VTVADYISRAESQSRQRNLPRETLAKNKKEMAKDVIEEHGPSEK 540 550 560 570 640 650 660 670 pF1KE5 SLSGQ---KGDSVSKLPKGPSE---NGELSAPLELGSMVNGVS ...: .::..::: . :.: : . ....:::: NP_005 AINGPTSASGDDISKLQRTPGEEKINTLKEENTQEAAVLNGVS 580 590 600 610 620 >>XP_005247872 (OMIM: 600819) PREDICTED: fragile X menta (648 aa) initn: 2400 init1: 1985 opt: 2010 Z-score: 1211.9 bits: 234.6 E(85289): 9.2e-61 Smith-Waterman score: 2602; 62.4% identity (78.6% similar) in 691 aa overlap (14-673:4-648) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MGGLASGGDVEPGLPVEVRGSNGAFYKGFVKDVHEDSVTIFFENNWQSERQIPFGDVRLP : ::::::::::::::.:::::::.:. :::::: :::.::..:::: XP_005 MAELTVEVRGSNGAFYKGFIKDVHEDSLTVVFENNWQPERQVPFNEVRLP 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 PPADYNKEITEGDEVEVYSRANEQEPCGWWLARVRMMKGDFYVIEYAACDATYNEIVTLE :: : .:::.::::::::::::.:::::::::.::::::.::::::::::::::::::.: XP_005 PPPDIKKEISEGDEVEVYSRANDQEPCGWWLAKVRMMKGEFYVIEYAACDATYNEIVTFE 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 RLRPVNPNPLATKGSFFKVTMAVPEDLREACSNENVHKEFKKALGANCIFLNITNSELFI :::::: : . :..::: :. :::::::::.:::.::.::::.:: :: . ...:.: XP_005 RLRPVNQNKTVKKNTFFKCTVDVPEDLREACANENAHKDFKKAVGACRIFYHPETTQLMI 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 LSTTEAPVKRASLLGDMHFRSLRTKLLLMSRNEEATKHLETSKQLAAAFQEEFTVREDLM ::..:: :::...:.:::.::.::::.::::::::::::: .:::::::.:::.:::::: XP_005 LSASEATVKRVNILSDMHLRSIRTKLMLMSRNEEATKHLECTKQLAAAFHEEFVVREDLM 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 GLAIGTHGANIQQARKVPGVTAIELGEETCTFRIYGETPEACRQARSYLEFSEDSVQVPR ::::::::.:::::::::::::::: :.: :::::::. .: ..::..::: :: .:::: XP_005 GLAIGTHGSNIQQARKVPGVTAIELDEDTGTFRIYGESADAVKKARGFLEFVEDFIQVPR 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KE5 NLVGKVIGKNGKVIQEIVDKSGVVRVRVEGDNDKKNPREEGMVPFIFVGTRENISNAQAL :::::::::::::::::::::::::::.::::..: :::.:::::.::::.:.:.:.:.: XP_005 NLVGKVIGKNGKVIQEIVDKSGVVRVRIEGDNENKLPREDGMVPFVFVGTKESIGNVQVL 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KE5 LEYHLSYLQEVEQLRLERLQIDEQLRQIGLGFRPPGSGRGSGGSDKAGYSTDESSSSSLH ::::..::.::::::.::::::::::::: XP_005 LEYHIAYLKEVEQLRMERLQIDEQLRQIG------------------------------- 360 370 430 440 450 460 470 pF1KE5 ATRTYGGSYGGRGRGRRTGGP----AYGPSSDVSTASETESEKREEPNR---AGPGDRDP .: ::.::::::: :: .:: .:..:. ::::::...: . :: ::: XP_005 -SR----SYSGRGRGRR--GPNYTSGYGTNSELSNPSETESERKDELSDWSLAGEDDRDS 380 390 400 410 420 430 480 490 500 510 520 530 pF1KE5 PTRGEESRRRPTGGRGRGPPPA-PRPTSRYNSSSISSVLKDPDSNPYSLLDTSEPEPPVD . ..::::: :::::. . : : ..:::::::::::::::::::..: . .: XP_005 -RHQRDSRRRP-GGRGRSVSGGRGRGGPRGGKSSISSVLKDPDSNPYSLLDNTESDQTAD 440 450 460 470 480 490 540 550 560 570 580 590 pF1KE5 SEPGEPPPASARRRRSRRRRTDEDRTVMDGGLESDGPNMTENGLED-ESRPQRRNRSRRR .. .: .. ::::::::::::: ..::: ::: ...::::.: :..:::::::::: XP_005 TDASESHHSTNRRRRSRRRRTDEDAVLMDGMTESDTASVNENGLDDSEKKPQRRNRSRRR 500 510 520 530 540 550 600 610 620 630 pF1KE5 RNRGNRTDGSISGDRQPVTVADYISRAESQSRQR--P--PLERTK------------PSE : ::. . ::::::::::::::::::::: : : ..: ::: XP_005 RFRGQ------AEDRQPVTVADYISRAESQSRQRNLPRETLAKNKKEMAKDVIEEHGPSE 560 570 580 590 600 640 650 660 670 pF1KE5 DSLSGQ---KGDSVSKLPKGPSE---NGELSAPLELGSMVNGVS ...: .::..::: . :.: : . ....:::: XP_005 KAINGPTSASGDDISKLQRTPGEEKINTLKEENTQEAAVLNGVS 610 620 630 640 673 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 05:00:31 2016 done: Tue Nov 8 05:00:33 2016 Total Scan time: 10.880 Total Display time: 0.130 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]