FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2318, 1980 aa 1>>>pF1KE2318 1980 - 1980 aa - 1980 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1965+/-0.00123; mu= 16.2145+/- 0.074 mean_var=130.4180+/-26.975, 0's: 0 Z-trim(105.1): 117 B-trim: 462 in 1/50 Lambda= 0.112307 statistics sampled from 8129 (8246) to 8129 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.585), E-opt: 0.2 (0.253), width: 16 Scan time: 5.450 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS44891.1 SCN8A gene_id:6334|Hs108|chr12 (1980) 13129 2140.5 0 CCDS81692.1 SCN8A gene_id:6334|Hs108|chr12 (1980) 13123 2139.5 0 CCDS53794.1 SCN8A gene_id:6334|Hs108|chr12 (1939) 8480 1387.2 0 CCDS54414.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2 (1981) 8391 1372.8 0 CCDS33316.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2 (1998) 8359 1367.6 0 CCDS33313.1 SCN2A gene_id:6326|Hs108|chr2 (2005) 8357 1367.3 0 CCDS33314.1 SCN2A 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CCDS53 QKPIPRPLNKIQGIVFDFVTQQAFDIVIMMLICLNMVTMMVETDTQSKQMENILYWINLV 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1570 1580 1590 1600 1610 1620 pF1KE2 FVIFFTCECVLKMFALRHYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLADIIEKYFVSPTLFRVIR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 FVIFFTCECVLKMFALRHYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLADIIEKYFVSPTLFRVIR 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1630 1640 1650 1660 1670 1680 pF1KE2 LARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIFSIFGMSNFAYVKHEA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 LARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIFSIFGMSNFAYVKHEA 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1690 1700 1710 1720 1730 1740 pF1KE2 GIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLLPILNRPPDCSLDKEHPGSGFKGDCGNPS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS53 GIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLLPILNRPPDCSLDKEHPGSGFKGDCGNPS 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1750 1760 1770 1780 1790 1800 pF1KE2 VGIFFFVSYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVATEESADPLSEDDFETFYEIWEKFDPDAT 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.::.::::.:::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 GFCLEDFTFLRDPWNWLDFTVITFAYVTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTI 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 pF1KE2 VGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCVVWP--------------- :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :: CCDS54 VGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCIQWPPTNASLEEHSIEKNI 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 -INFNESYLENGTKGFDWEEYINNKTNFYTVPGMLEPLLCGNSSDAGQCPEGYQCMKAGR .:.: . ... . :::. ::... : . :.:. ::::::::::::::::.:.:::: CCDS54 TVNYNGTLINETVFEFDWKSYIQDSRYHYFLEGFLDALLCGNSSDAGQCPEGYMCVKAGR 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 NPNYGYTSFDTFSWAFLALFRLMTQDYWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFVGSFYLVN :::::::::::::::::.::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:::::.: CCDS54 NPNYGYTSFDTFSWAFLSLFRLMTQDFWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFLGSFYLIN 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 LILAVVAMAYEEQNQATLEEAEQKEAEFKAMLEQLKKQQEEAQAAAMATSAGTVSEDAIE ::::::::::::::::::::::::::::. :.:::::::: :: :: ::. :: . 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CCDS54 LRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALLGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFY 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1360 1370 1380 1390 1400 1410 pF1KE2 YCFNETSEIRFEIEDVNNKTECEKLMEGNNTEIRWKNVKINFDNVGAGYLALLQVATFKG .:.: :. ::.::::::.:.: ::.: :.: ::::::.:::::: :::.::::::::: CCDS54 HCINTTTGDRFDIEDVNNHTDCLKLIERNETA-RWKNVKVNFDNVGFGYLSLLQVATFKG 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1420 1430 1440 1450 1460 1470 pF1KE2 WMDIMYAAVDSRKPDEQPKYEDNIYMYIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKF ::::::::::::. . :::::...:::.:::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 WMDIMYAAVDSRNVELQPKYEESLYMYLYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKF 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1480 1490 1500 1510 1520 1530 pF1KE2 GGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPLNKIQGIVFDFVTQQAFDIVIMMLICL ::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.::.::::::.:.::: ::.:::: CCDS54 GGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPGNKFQGMVFDFVTRQVFDISIMILICL 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1540 1550 1560 1570 1580 1590 pF1KE2 NMVTMMVETDTQSKQMENILYWINLVFVIFFTCECVLKMFALRHYYFTIGWNIFDFVVVI :::::::::: ::. . .:: :::::...:: :::::...::::::::::::::::::: CCDS54 NMVTMMVETDDQSEYVTTILSRINLVFIVLFTGECVLKLISLRHYYFTIGWNIFDFVVVI 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1600 1610 1620 1630 1640 1650 pF1KE2 LSIVGMFLADIIEKYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNI :::::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 LSIVGMFLAELIEKYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNI 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1660 1670 1680 1690 1700 1710 pF1KE2 GLLLFLVMFIFSIFGMSNFAYVKHEAGIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLLPI ::::::::::..:::::::::::.:.::::::::::::::::::::::::::::::: :: CCDS54 GLLLFLVMFIYAIFGMSNFAYVKREVGIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLAPI 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1720 1730 1740 1750 1760 1770 pF1KE2 LN-RPPDCSLDKEHPGSGFKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVAT :: .::::. .: .:::. :::::::::::::::::::::::.:::::::.::::::::: CCDS54 LNSKPPDCDPNKVNPGSSVKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFLVVVNMYIAVILENFSVAT 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1780 1790 1800 1810 1820 1830 pF1KE2 EESADPLSEDDFETFYEIWEKFDPDATQFIEYCKLADFADALEHPLRVPKPNTIELIAMD ::::.:::::::: :::.:::::::::::.:. ::..:: ::: :: .:.:: ..::::: CCDS54 EESAEPLSEDDFEMFYEVWEKFDPDATQFMEFEKLSQFAAALEPPLNLPQPNKLQLIAMD 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1840 1850 1860 1870 1880 1890 pF1KE2 LPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGDSGELDILRQQMEERFVASNPSKVSYEPITTTLRRK ::::::::::::::::::::::::.:::.: :: ::::::.:::::::::.::::::.:: CCDS54 LPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGESGEMDALRIQMEERFMASNPSKVSYQPITTTLKRK 1830 1840 1850 1860 1870 1880 1900 1910 1920 1930 pF1KE2 QEEVSAVVLQRAYRGHLARRGFICKKTTSNKLE-NGGTH-----------------REKK :::::::..::::: :: .: . : :: . .::.. :: CCDS54 QEEVSAVIIQRAYRRHLLKRTVKQASFTYNKNKIKGGANLLIKEDMIIDRINENSITEKT 1890 1900 1910 1920 1930 1940 1940 1950 1960 1970 1980 pF1KE2 ESTPSTASLP-SYDSVTKPEKEKQQRAEEGRRERAKRQKEVRESKC . : :::. : ::: :::: ::.. .::. :.:: CCDS54 DLTMSTAACPPSYDRVTKPIVEKHE--QEGKDEKAKGK 1950 1960 1970 1980 >>CCDS33316.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2 (1998 aa) initn: 6736 init1: 2289 opt: 8359 Z-score: 7318.2 bits: 1367.6 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 9891; 75.9% identity (88.2% similar) in 2019 aa overlap (1-1970:1-1996) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MAARLLAPPGPDSFKPFTPESLANIERRIAESKLKKPPKADGSHREDDEDSKPKPNSDLE : .:.:::::::. :: :::: ::::::: : :.: : : ..::... :::::::: CCDS33 MEQTVLVPPGPDSFNFFTRESLAAIERRIAEEKAKNP-KPD---KKDDDENGPKPNSDLE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 AGKSLPFIYGDIPQGLVAVPLEDFDPYYLTQKTFVVLNRGKTLFRFSATPALYILSPFNL :::.::::::::: .:. ::::.::::...:::.:::.::..:::::: :::::.::: CCDS33 AGKNLPFIYGDIPPEMVSEPLEDLDPYYINKKTFIVLNKGKAIFRFSATSALYILTPFNP 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 IRRIAIKILIHSVFSMIIMCTILTNCVFMTFSNPPDWSKNVEYTFTGIYTFESLVKIIAR .:.::::::.::.:::.:::::::::::::.::::::.::::::::::::::::.::::: CCDS33 LRKIAIKILVHSLFSMLIMCTILTNCVFMTMSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKIIAR 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 GFCIDGFTFLRDPWNWLDFSVIMMAYITEFVNLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTI :::.. :::::::::::::.:: .::.::::.:::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 GFCLEDFTFLRDPWNWLDFTVITFAYVTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTI 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 pF1KE2 VGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCVVWP--------------- :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :: CCDS33 VGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCIQWPPTNASLEEHSIEKNI 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 -INFNESYLENGTKGFDWEEYINNKTNFYTVPGMLEPLLCGNSSDAGQCPEGYQCMKAGR .:.: . ... . :::. ::... : . :.:. ::::::::::::::::.:.:::: CCDS33 TVNYNGTLINETVFEFDWKSYIQDSRYHYFLEGFLDALLCGNSSDAGQCPEGYMCVKAGR 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 NPNYGYTSFDTFSWAFLALFRLMTQDYWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFVGSFYLVN :::::::::::::::::.::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:::::.: CCDS33 NPNYGYTSFDTFSWAFLSLFRLMTQDFWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFLGSFYLIN 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 LILAVVAMAYEEQNQATLEEAEQKEAEFKAMLEQLKKQQEEAQAAAMATSAGTVSEDAIE ::::::::::::::::::::::::::::. :.:::::::: :: :: ::. :: . 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CCDS33 NDFADDEHSTFEDNESRRDSLFVPRRHGERRNS-----NLSQTSRSSRMLAVFPANGKMH 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 pF1KE2 STVDCNGVVSLIGGPGSHIG--GRLLPEATT-EVEIKKKGPGSLLVSMDQLASYGRKDRI :::::::::::.:::. . :.::::.:: :.:..:. .:. :::: : . ....: CCDS33 STVDCNGVVSLVGGPSVPTSPVGQLLPEGTTTETEMRKRRSSSFHVSMDFLEDPSQRQRA 650 660 670 680 690 700 700 710 720 730 740 750 pF1KE2 NSIMSVVTNTLVEELEESQRKCPPCWYKFANTFLIWECHPYWIKLKEIVNLIVMDPFVDL :: :..::: :::::::..:::::::::.: ::::.: :::.:.:..:::.:::::::: CCDS33 MSIASILTNT-VEELEESRQKCPPCWYKFSNIFLIWDCSPYWLKVKHVVNLVVMDPFVDL 710 720 730 740 750 760 760 770 780 790 800 810 pF1KE2 AITICIVLNTLFMAMEHHPMTPQFEHVLAVGNLVFTGIFTAEMFLKLIAMDPYYYFQEGW :::::::::::::::::.::: .:..::.:::::::::::::::::.::::::::::::: CCDS33 AITICIVLNTLFMAMEHYPMTDHFNNVLTVGNLVFTGIFTAEMFLKIIAMDPYYYFQEGW 770 780 790 800 810 820 820 830 840 850 860 870 pF1KE2 NIFDGFIVSLSLMELSLADVEGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGN ::::::::.:::.::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 NIFDGFIVTLSLVELGLANVEGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGN 830 840 850 860 870 880 880 890 900 910 920 930 pF1KE2 LTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKSYKECVCKINQDCELPRWHMHDFFHSFLIVFRVLCGEW :::::::::::::::::::::::::.::::: .::.::::::.::::::::::::::::: CCDS33 LTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKSYKDCVCKIASDCQLPRWHMNDFFHSFLIVFRVLCGEW 890 900 910 920 930 940 940 950 960 970 980 990 pF1KE2 IETMWDCMEVAGQAMCLIVFMMVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLAATDDDGEMNNL ::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::: CCDS33 IETMWDCMEVAGQAMCLTVFMMVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLAATDDDNEMNNL 950 960 970 980 990 1000 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KE2 QISVIRIKKGVAWTKLKVHAFMQAHF--KQCEADEVKPLDELYEKKANCIANHTGADIHR ::.: :..::::..: :.. :.: : :: ::.::::.: .:: .:..::: :.: . CCDS33 QIAVDRMHKGVAYVKRKIYEFIQQSFIRKQKILDEIKPLDDLNNKKDSCMSNHT-AEIGK 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KE2 NGDFQKNGNGTTSGIG--SSVEKYIIDE-DHMSFINNPNLTVRVPIAVGESDFENLNTED . :. :. :::::::: :::::::::: :.:::::::.::: ::::::::::::::::: CCDS33 DLDYLKDVNGTTSGIGTGSSVEKYIIDESDYMSFINNPSLTVTVPIAVGESDFENLNTED 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KE2 VSSESDPEGSKDKLDDTSSS-EGSTIDIKPEVEEVPVEQPEEYLDPDACFTEGCVQRFKC ::::: : ::.::...::: ::::.:: ::: :: .::: :.:.::::::::::::: CCDS33 FSSESDLEESKEKLNESSSSSEGSTVDIGAPVEEQPVVEPEETLEPEACFTEGCVQRFKC 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1180 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KE2 CQVNIEEGLGKSWWILRKTCFLIVEHNWFETFIIFMILLSSGALAFEDIYIEQRKTIRTI ::.:.::: ::.:: ::.::: :::::::::::.:::::::::::::::::.:::::.:. CCDS33 CQINVEEGRGKQWWNLRRTCFRIVEHNWFETFIVFMILLSSGALAFEDIYIDQRKTIKTM 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1240 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KE2 LEYADKVFTYIFILEMLLKWTAYGFVKFFTNAWCWLDFLIVAVSLVSLIANALGYSELGA ::::::::::::::::::::.:::. .::::::::::::: :::::: ::::::::::: CCDS33 LEYADKVFTYIFILEMLLKWVAYGYQTYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLTANALGYSELGA 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1300 1310 1320 1330 1340 1350 pF1KE2 IKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAG :::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 IKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALLGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAG 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1360 1370 1380 1390 1400 1410 pF1KE2 KYHYCFNETSEIRFEIEDVNNKTECEKLMEGNNTEIRWKNVKINFDNVGAGYLALLQVAT :...:.: :. ::.::::::.:.: ::.: :.: ::::::.:::::: :::.:::::: CCDS33 KFYHCINTTTGDRFDIEDVNNHTDCLKLIERNETA-RWKNVKVNFDNVGFGYLSLLQVAT 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 pF1KE2 FKGWMDIMYAAVDSRKPDEQPKYEDNIYMYIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQK :::::::::::::::. . :::::...:::.::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 FKGWMDIMYAAVDSRNVELQPKYEESLYMYLYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQK 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1530 pF1KE2 KKFGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPLNKIQGIVFDFVTQQAFDIVIMML :::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.::.::::::.:.::: ::.: CCDS33 KKFGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPGNKFQGMVFDFVTRQVFDISIMIL 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 pF1KE2 ICLNMVTMMVETDTQSKQMENILYWINLVFVIFFTCECVLKMFALRHYYFTIGWNIFDFV ::::::::::::: ::. . .:: :::::...:: :::::...:::::::::::::::: CCDS33 ICLNMVTMMVETDDQSEYVTTILSRINLVFIVLFTGECVLKLISLRHYYFTIGWNIFDFV 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1650 pF1KE2 VVILSIVGMFLADIIEKYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPAL ::::::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 VVILSIVGMFLAELIEKYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPAL 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1710 pF1KE2 FNIGLLLFLVMFIFSIFGMSNFAYVKHEAGIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLL :::::::::::::..:::::::::::.:.::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 FNIGLLLFLVMFIYAIFGMSNFAYVKREVGIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLL 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1770 pF1KE2 LPILN-RPPDCSLDKEHPGSGFKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFLIVVNMYIAIILENFS :::: .::::. .: .:::. :::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::: CCDS33 APILNSKPPDCDPNKVNPGSSVKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFLVVVNMYIAVILENFS 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1830 pF1KE2 VATEESADPLSEDDFETFYEIWEKFDPDATQFIEYCKLADFADALEHPLRVPKPNTIELI :::::::.:::::::: :::.:::::::::::.:. ::..:: ::: :: .:.:: ..:: CCDS33 VATEESAEPLSEDDFEMFYEVWEKFDPDATQFMEFEKLSQFAAALEPPLNLPQPNKLQLI 1780 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1870 1880 1890 pF1KE2 AMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGDSGELDILRQQMEERFVASNPSKVSYEPITTTL :::::::::::::::::::::::::::.:::.: :: ::::::.:::::::::.:::::: CCDS33 AMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGESGEMDALRIQMEERFMASNPSKVSYQPITTTL 1840 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1930 pF1KE2 RRKQEEVSAVVLQRAYRGHLARRGFICKKTTSNKLE-NGGTH-----------------R .:::::::::..::::: :: .: . : :: . .::.. CCDS33 KRKQEEVSAVIIQRAYRRHLLKRTVKQASFTYNKNKIKGGANLLIKEDMIIDRINENSIT 1900 1910 1920 1930 1940 1950 1940 1950 1960 1970 1980 pF1KE2 EKKESTPSTASLP-SYDSVTKPEKEKQQRAEEGRRERAKRQKEVRESKC :: . : :::. : ::: :::: ::.. .::. :.:: CCDS33 EKTDLTMSTAACPPSYDRVTKPIVEKHE--QEGKDEKAKGK 1960 1970 1980 1990 >>CCDS33313.1 SCN2A gene_id:6326|Hs108|chr2 (2005 aa) initn: 7054 init1: 2189 opt: 8357 Z-score: 7316.4 bits: 1367.3 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 9962; 75.9% identity (88.1% similar) in 2027 aa overlap (1-1979:1-2004) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MAARLLAPPGPDSFKPFTPESLANIERRIAESKLKKPPKADGSHREDDEDSKPKPNSDLE :: .:.:::::::. :: :::: ::.:::: : :.: . ....:... :::::::: CCDS33 MAQSVLVPPGPDSFRFFTRESLAAIEQRIAEEKAKRPKQE---RKDEDDENGPKPNSDLE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 AGKSLPFIYGDIPQGLVAVPLEDFDPYYLTQKTFVVLNRGKTLFRFSATPALYILSPFNL ::::::::::::: .:.:::::.::::...:::.:::.::.. :::::::::::.::: CCDS33 AGKSLPFIYGDIPPEMVSVPLEDLDPYYINKKTFIVLNKGKAISRFSATPALYILTPFNP 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 IRRIAIKILIHSVFSMIIMCTILTNCVFMTFSNPPDWSKNVEYTFTGIYTFESLVKIIAR ::..:::::.::.:.:.:::::::::::::.::::::.::::::::::::::::.::.:: CCDS33 IRKLAIKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMTMSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKILAR 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 GFCIDGFTFLRDPWNWLDFSVIMMAYITEFVNLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTI :::.. :::::::::::::.:: .::.::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 GFCLEDFTFLRDPWNWLDFTVITFAYVTEFVNLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTI 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 pF1KE2 VGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCVVWP-------IN----FN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :: :: :: CCDS33 VGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCLQWPPDNSSFEINITSFFN 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 ESYLENGT------KGFDWEEYINNKTNFYTVPGMLEPLLCGNSSDAGQCPEGYQCMKAG .: ::: . :.:.:::..:..:: . :. . :::::::::::::::: :.::: CCDS33 NSLDGNGTTFNRTVSIFNWDEYIEDKSHFYFLEGQNDALLCGNSSDAGQCPEGYICVKAG 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 RNPNYGYTSFDTFSWAFLALFRLMTQDYWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFVGSFYLV ::::::::::::::::::.::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:::::. CCDS33 RNPNYGYTSFDTFSWAFLSLFRLMTQDFWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFLGSFYLI 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 NLILAVVAMAYEEQNQATLEEAEQKEAEFKAMLEQLKKQQEEAQAAAMATSAGTVSEDAI :::::::::::::::::::::::::::::. :::::::::::::::: :.:: .. 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CCDS33 KKKFGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPANKFQGMVFDFVTRQVFDISIMI 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 pF1KE2 LICLNMVTMMVETDTQSKQMENILYWINLVFVIFFTCECVLKMFALRHYYFTIGWNIFDF :::::::::::::: :.: : .: :::::...:: : :::. .::::::::::::::: CCDS33 LICLNMVTMMVETDDQGKYMTLVLSRINLVFIVLFTGEFVLKLVSLRHYYFTIGWNIFDF 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1650 pF1KE2 VVVILSIVGMFLADIIEKYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPA :::::::::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 VVVILSIVGMFLAEMIEKYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPA 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1710 pF1KE2 LFNIGLLLFLVMFIFSIFGMSNFAYVKHEAGIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGL ::::::::::::::..:::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 LFNIGLLLFLVMFIYAIFGMSNFAYVKKEAGIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGL 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1760 pF1KE2 LLPILNR-PPDCSLDKEHPGSGFKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFLIVVNMYIAIILENF : :::: ::::. : ::::. :::::::::::::::::::::::.:::::::.::::: CCDS33 LAPILNSAPPDCDPDTIHPGSSVKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFLVVVNMYIAVILENF 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1770 1780 1790 1800 1810 1820 pF1KE2 SVATEESADPLSEDDFETFYEIWEKFDPDATQFIEYCKLADFADALEHPLRVPKPNTIEL ::::::::.:::::::: :::.:::::::::::::. ::.::: ::. :: . ::: ..: CCDS33 SVATEESAEPLSEDDFEMFYEVWEKFDPDATQFIEFSKLSDFAAALDPPLLIAKPNKVQL 1780 1790 1800 1810 1820 1830 1830 1840 1850 1860 1870 1880 pF1KE2 IAMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGDSGELDILRQQMEERFVASNPSKVSYEPITTT ::::::::::::::::::::::::::::.:::.: :: :::.::.::::::::::::::: CCDS33 IAMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGESGEMDALRIQMEDRFMASNPSKVSYEPITTT 1840 1850 1860 1870 1880 1890 1890 1900 1910 1920 1930 pF1KE2 LRRKQEEVSAVVLQRAYRGHLARRGFICKKTTSNKLE------------------NGGTH :.::::::::...:: .: .: .. . ... :: ::.. CCDS33 LKRKQEEVSAAIIQRNFRCYLLKQRLKNISSNYNKEAIKGRIDLPIKQDMIIDKLNGNST 1900 1910 1920 1930 1940 1950 1940 1950 1960 1970 1980 pF1KE2 REKKESTPSTASLPSYDSVTKPEKEKQQRAEEGRRERAKRQKEVRESKC :: ... ::.: :::::::::.::: :. . :. .. :::::.. CCDS33 PEKTDGSSSTTSPPSYDSVTKPDKEK---FEKDKPEKESKGKEVRENQK 1960 1970 1980 1990 2000 >>CCDS54413.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2 (2009 aa) initn: 6725 init1: 2289 opt: 7696 Z-score: 6737.6 bits: 1260.2 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 9869; 75.5% identity (87.7% similar) in 2030 aa overlap (1-1970:1-2007) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MAARLLAPPGPDSFKPFTPESLANIERRIAESKLKKPPKADGSHREDDEDSKPKPNSDLE : .:.:::::::. :: :::: ::::::: : :.: : : ..::... :::::::: CCDS54 MEQTVLVPPGPDSFNFFTRESLAAIERRIAEEKAKNP-KPD---KKDDDENGPKPNSDLE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 AGKSLPFIYGDIPQGLVAVPLEDFDPYYLTQKTFVVLNRGKTLFRFSATPALYILSPFNL :::.::::::::: .:. ::::.::::...:::.:::.::..:::::: :::::.::: CCDS54 AGKNLPFIYGDIPPEMVSEPLEDLDPYYINKKTFIVLNKGKAIFRFSATSALYILTPFNP 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 IRRIAIKILIHSVFSMIIMCTILTNCVFMTFSNPPDWSKNVEYTFTGIYTFESLVKIIAR .:.::::::.::.:::.:::::::::::::.::::::.::::::::::::::::.::::: CCDS54 LRKIAIKILVHSLFSMLIMCTILTNCVFMTMSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKIIAR 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 GFCIDGFTFLRDPWNWLDFSVIMMAYITEFVNLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTI :::.. :::::::::::::.:: .::.::::.:::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 GFCLEDFTFLRDPWNWLDFTVITFAYVTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTI 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 pF1KE2 VGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCVVWP--------------- :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :: CCDS54 VGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCIQWPPTNASLEEHSIEKNI 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 -INFNESYLENGTKGFDWEEYINNKTNFYTVPGMLEPLLCGNSSDAGQCPEGYQCMKAGR .:.: . ... . :::. ::... : . :.:. ::::::::::::::::.:.:::: CCDS54 TVNYNGTLINETVFEFDWKSYIQDSRYHYFLEGFLDALLCGNSSDAGQCPEGYMCVKAGR 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 NPNYGYTSFDTFSWAFLALFRLMTQDYWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFVGSFYLVN :::::::::::::::::.::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:::::.: CCDS54 NPNYGYTSFDTFSWAFLSLFRLMTQDFWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFLGSFYLIN 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 LILAVVAMAYEEQNQATLEEAEQKEAEFKAMLEQLKKQQEEAQAAAMATSAGTVSEDAIE ::::::::::::::::::::::::::::. :.:::::::: :: :: ::. :: . 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CCDS54 KVSYQPITTTLKRKQEEVSAVIIQRAYRRHLLKRTVKQASFTYNKNKIKGGANLLIKEDM 1900 1910 1920 1930 1940 1950 1940 1950 1960 1970 1980 pF1KE2 ----------REKKESTPSTASLP-SYDSVTKPEKEKQQRAEEGRRERAKRQKEVRESKC :: . : :::. : ::: :::: ::.. .::. :.:: CCDS54 IIDRINENSITEKTDLTMSTAACPPSYDRVTKPIVEKHE--QEGKDEKAKGK 1960 1970 1980 1990 2000 >>CCDS46441.1 SCN9A gene_id:6335|Hs108|chr2 (1977 aa) initn: 6555 init1: 2043 opt: 7652 Z-score: 6699.2 bits: 1253.0 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 9181; 70.9% identity (85.9% similar) in 2005 aa overlap (5-1979:3-1976) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MAARLLAPPGPDSFKPFTPESLANIERRIAESKLKKPPKADGSHREDDEDSKPKPNSDLE .: ::::.:: :: .::: ::.:::: : :.: . ...::.. :::.:::: CCDS46 MAMLPPPGPQSFVHFTKQSLALIEQRIAERKSKEPKE----EKKDDDEEAPKPSSDLE 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 AGKSLPFIYGDIPQGLVAVPLEDFDPYYLTQKTFVVLNRGKTLFRFSATPALYILSPFNL :::.::::::::: :.:. ::::.:::: .:::.:::.:::.:::.::::::.::::. 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