FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6731, 1386 aa 1>>>pF1KE6731 1386 - 1386 aa - 1386 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.9188+/-0.000503; mu= -21.0369+/- 0.031 mean_var=708.0598+/-144.927, 0's: 0 Z-trim(123.6): 420 B-trim: 0 in 0/60 Lambda= 0.048199 statistics sampled from 43119 (43588) to 43119 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.771), E-opt: 0.2 (0.511), width: 16 Scan time: 18.390 The best scores are: opt bits E(85289) NP_071765 (OMIM: 607313,608630) roundabout homolog (1386) 9556 681.1 1.5e-194 XP_016873611 (OMIM: 607313,608630) PREDICTED: roun (1364) 9234 658.7 8.1e-188 XP_016862478 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1534) 3437 255.7 2e-66 XP_011532283 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1597) 3437 255.7 2e-66 XP_016862483 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1445) 3430 255.2 2.6e-66 XP_011532286 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XP_016 NKNSSKPQKNNGSTWANVPLPPPPVQPLPGTELE--HYAVEQQENGYDSDSWCPPLPVQT 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KE6 HLTE------PSSSGGCLVTPSRRETPSPTPSYGQQSTATLTPSPPDPPQPPTDMPHLHQ .: . .. . : : . ::. :.:::::::::::: . :: . :: . 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