FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3293, 765 aa 1>>>pF1KE3293 765 - 765 aa - 765 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.6853+/-0.00238; mu= -17.8679+/- 0.133 mean_var=638.3211+/-143.952, 0's: 0 Z-trim(105.1): 498 B-trim: 487 in 1/48 Lambda= 0.050764 statistics sampled from 7727 (8221) to 7727 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.6), E-opt: 0.2 (0.253), width: 16 Scan time: 2.470 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS44734.1 ANKK1 gene_id:255239|Hs108|chr11 ( 765) 5123 392.3 1.5e-108 CCDS13675.1 RIPK4 gene_id:54101|Hs108|chr21 ( 784) 920 84.5 7.1e-16 CCDS55712.1 ANK3 gene_id:288|Hs108|chr10 (1861) 811 77.0 3.1e-13 CCDS55711.1 ANK3 gene_id:288|Hs108|chr10 (1868) 811 77.0 3.1e-13 CCDS7258.1 ANK3 gene_id:288|Hs108|chr10 (4377) 811 77.4 5.4e-13 CCDS6121.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1880) 796 75.9 6.8e-13 CCDS6119.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1881) 796 75.9 6.8e-13 CCDS47849.1 ANK1 gene_id:286|Hs108|chr8 (1897) 796 75.9 6.8e-13 CCDS54796.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (1863) 785 75.1 1.2e-12 CCDS43261.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (1872) 785 75.1 1.2e-12 CCDS3702.1 ANK2 gene_id:287|Hs108|chr4 (3957) 785 75.5 1.9e-12 >>CCDS44734.1 ANKK1 gene_id:255239|Hs108|chr11 (765 aa) initn: 5123 init1: 5123 opt: 5123 Z-score: 2062.2 bits: 392.3 E(32554): 1.5e-108 Smith-Waterman score: 5123; 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