Result of FASTA (ccds) for pFN21AE3100
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE3100, 2035 aa
  1>>>pF1KE3100 2035 - 2035 aa - 2035 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.9212+/-0.00115; mu= -11.6498+/- 0.069
 mean_var=369.2195+/-77.109, 0's: 0 Z-trim(111.7): 65  B-trim: 0 in 0/53
 Lambda= 0.066747
 statistics sampled from 12528 (12580) to 12528 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.684), E-opt: 0.2 (0.386), width:  16
 Scan time:  5.460

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS44020.1 HCFC1 gene_id:3054|Hs108|chrX          (2035) 13220 1288.9       0
CCDS9097.1 HCFC2 gene_id:29915|Hs108|chr12         ( 792) 2005 208.7 7.8e-53
CCDS76369.1 MUC5AC gene_id:4586|Hs108|chr11        (5654)  640 77.7 1.6e-12


>>CCDS44020.1 HCFC1 gene_id:3054|Hs108|chrX               (2035 aa)
 initn: 13220 init1: 13220 opt: 13220  Z-score: 6892.3  bits: 1288.9 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 13220; 100.0% identity (100.0% similar) in 2035 aa overlap (1-2035:1-2035)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MASAVSPANLPAVLLQPRWKRVVGWSGPVPRPRHGHRAVAIKELIVVFGGGNEGIVDELH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MASAVSPANLPAVLLQPRWKRVVGWSGPVPRPRHGHRAVAIKELIVVFGGGNEGIVDELH
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE3 VYNTATNQWFIPAVRGDIPPGCAAYGFVCDGTRLLVFGGMVEYGKYSNDLYELQASRWEW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VYNTATNQWFIPAVRGDIPPGCAAYGFVCDGTRLLVFGGMVEYGKYSNDLYELQASRWEW
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE3 KRLKAKTPKNGPPPCPRLGHSFSLVGNKCYLFGGLANDSEDPKNNIPRYLNDLYILELRP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KRLKAKTPKNGPPPCPRLGHSFSLVGNKCYLFGGLANDSEDPKNNIPRYLNDLYILELRP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE3 GSGVVAWDIPITYGVLPPPRESHTAVVYTEKDNKKSKLVIYGGMSGCRLGDLWTLDIDTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GSGVVAWDIPITYGVLPPPRESHTAVVYTEKDNKKSKLVIYGGMSGCRLGDLWTLDIDTL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE3 TWNKPSLSGVAPLPRSLHSATTIGNKMYVFGGWVPLVMDDVKVATHEKEWKCTNTLACLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TWNKPSLSGVAPLPRSLHSATTIGNKMYVFGGWVPLVMDDVKVATHEKEWKCTNTLACLN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE3 LDTMAWETILMDTLEDNIPRARAGHCAVAINTRLYIWSGRDGYRKAWNNQVCCKDLWYLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LDTMAWETILMDTLEDNIPRARAGHCAVAINTRLYIWSGRDGYRKAWNNQVCCKDLWYLE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE3 TEKPPPPARVQLVRANTNSLEVSWGAVATADSYLLQLQKYDIPATAATATSPTPNPVPSV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TEKPPPPARVQLVRANTNSLEVSWGAVATADSYLLQLQKYDIPATAATATSPTPNPVPSV
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE3 PANPPKSPAPAAAAPAVQPLTQVGITLLPQAAPAPPTTTTIQVLPTVPGSSISVPTAART
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PANPPKSPAPAAAAPAVQPLTQVGITLLPQAAPAPPTTTTIQVLPTVPGSSISVPTAART
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE3 QGVPAVLKVTGPQATTGTPLVTMRPASQAGKAPVTVTSLPAGVRMVVPTQSAQGTVIGSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QGVPAVLKVTGPQATTGTPLVTMRPASQAGKAPVTVTSLPAGVRMVVPTQSAQGTVIGSS
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE3 PQMSGMAALAAAAAATQKIPPSSAPTVLSVPAGTTIVKTMAVTPGTTTLPATVKVASSPV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PQMSGMAALAAAAAATQKIPPSSAPTVLSVPAGTTIVKTMAVTPGTTTLPATVKVASSPV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE3 MVSNPATRMLKTAAAQVGTSVSSATNTSTRPIITVHKSGTVTVAQQAQVVTTVVGGVTKT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MVSNPATRMLKTAAAQVGTSVSSATNTSTRPIITVHKSGTVTVAQQAQVVTTVVGGVTKT
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE3 ITLVKSPISVPGGSALISNLGKVMSVVQTKPVQTSAVTGQASTGPVTQIIQTKGPLPAGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ITLVKSPISVPGGSALISNLGKVMSVVQTKPVQTSAVTGQASTGPVTQIIQTKGPLPAGT
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE3 ILKLVTSADGKPTTIITTTQASGAGTKPTILGISSVSPSTTKPGTTTIIKTIPMSAIITQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ILKLVTSADGKPTTIITTTQASGAGTKPTILGISSVSPSTTKPGTTTIIKTIPMSAIITQ
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE3 AGATGVTSSPGIKSPITIITTKVMTSGTGAPAKIITAVPKIATGHGQQGVTQVVLKGAPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AGATGVTSSPGIKSPITIITTKVMTSGTGAPAKIITAVPKIATGHGQQGVTQVVLKGAPG
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE3 QPGTILRTVPMGGVRLVTPVTVSAVKPAVTTLVVKGTTGVTTLGTVTGTVSTSLAGAGGH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QPGTILRTVPMGGVRLVTPVTVSAVKPAVTTLVVKGTTGVTTLGTVTGTVSTSLAGAGGH
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE3 STSASLATPITTLGTIATLSSQVINPTAITVSAAQTTLTAAGGLTTPTITMQPVSQPTQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 STSASLATPITTLGTIATLSSQVINPTAITVSAAQTTLTAAGGLTTPTITMQPVSQPTQV
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE3 TLITAPSGVEAQPVHDLPVSILASPTTEQPTATVTIADSGQGDVQPGTVTLVCSNPPCET
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TLITAPSGVEAQPVHDLPVSILASPTTEQPTATVTIADSGQGDVQPGTVTLVCSNPPCET
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE3 HETGTTNTATTTVVANLGGHPQPTQVQFVCDRQEAAASLVTSTVGQQNGSVVRVCSNPPC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 HETGTTNTATTTVVANLGGHPQPTQVQFVCDRQEAAASLVTSTVGQQNGSVVRVCSNPPC
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE3 ETHETGTTNTATTATSNMAGQHGCSNPPCETHETGTTNTATTAMSSVGANHQRDARRACA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ETHETGTTNTATTATSNMAGQHGCSNPPCETHETGTTNTATTAMSSVGANHQRDARRACA
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE3 AGTPAVIRISVATGALEAAQGSKSQCQTRQTSATSTTMTVMATGAPCSAGPLLGPSMARE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AGTPAVIRISVATGALEAAQGSKSQCQTRQTSATSTTMTVMATGAPCSAGPLLGPSMARE
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE3 PGGRSPAFVQLAPLSSKVRLSSPSIKDLPAGRHSHAVSTAAMTRSSVGAGEPRMAPVCES
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PGGRSPAFVQLAPLSSKVRLSSPSIKDLPAGRHSHAVSTAAMTRSSVGAGEPRMAPVCES
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE3 LQGGSPSTTVTVTALEALLCPSATVTQVCSNPPCETHETGTTNTATTSNAGSAQRVCSNP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LQGGSPSTTVTVTALEALLCPSATVTQVCSNPPCETHETGTTNTATTSNAGSAQRVCSNP
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

             1330      1340      1350      1360      1370      1380
pF1KE3 PCETHETGTTHTATTATSNGGTGQPEGGQQPPAGRPCETHQTTSTGTTMSVSVGALLPDA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PCETHETGTTHTATTATSNGGTGQPEGGQQPPAGRPCETHQTTSTGTTMSVSVGALLPDA
             1330      1340      1350      1360      1370      1380

             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE3 TSSHRTVESGLEVAAAPSVTPQAGTALLAPFPTQRVCSNPPCETHETGTTHTATTVTSNM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TSSHRTVESGLEVAAAPSVTPQAGTALLAPFPTQRVCSNPPCETHETGTTHTATTVTSNM
             1390      1400      1410      1420      1430      1440

             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KE3 SSNQDPPPAASDQGEVESTQGDSVNITSSSAITTTVSSTLTRAVTTVTQSTPVPGPSVPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SSNQDPPPAASDQGEVESTQGDSVNITSSSAITTTVSSTLTRAVTTVTQSTPVPGPSVPP
             1450      1460      1470      1480      1490      1500

             1510      1520      1530      1540      1550      1560
pF1KE3 PEELQVSPGPRQQLPPRQLLQSASTALMGESAEVLSASQTPELPAAVDLSSTGEPSSGQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PEELQVSPGPRQQLPPRQLLQSASTALMGESAEVLSASQTPELPAAVDLSSTGEPSSGQE
             1510      1520      1530      1540      1550      1560

             1570      1580      1590      1600      1610      1620
pF1KE3 SAGSAVVATVVVQPPPPTQSEVDQLSLPQELMAEAQAGTTTLMVTGLTPEELAVTAAAEA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SAGSAVVATVVVQPPPPTQSEVDQLSLPQELMAEAQAGTTTLMVTGLTPEELAVTAAAEA
             1570      1580      1590      1600      1610      1620

             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KE3 AAQAAATEEAQALAIQAVLQAAQQAVMGTGEPMDTSEAAATVTQAELGHLSAEGQEGQAT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AAQAAATEEAQALAIQAVLQAAQQAVMGTGEPMDTSEAAATVTQAELGHLSAEGQEGQAT
             1630      1640      1650      1660      1670      1680

             1690      1700      1710      1720      1730      1740
pF1KE3 TIPIVLTQQELAALVQQQQLQEAQAQQQHHHLPTEALAPADSLNDPAIESNCLNELAGTV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TIPIVLTQQELAALVQQQQLQEAQAQQQHHHLPTEALAPADSLNDPAIESNCLNELAGTV
             1690      1700      1710      1720      1730      1740

             1750      1760      1770      1780      1790      1800
pF1KE3 PSTVALLPSTATESLAPSNTFVAPQPVVVASPAKLQAAATLTEVANGIESLGVKPDLPPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PSTVALLPSTATESLAPSNTFVAPQPVVVASPAKLQAAATLTEVANGIESLGVKPDLPPP
             1750      1760      1770      1780      1790      1800

             1810      1820      1830      1840      1850      1860
pF1KE3 PSKAPMKKENQWFDVGVIKGTNVMVTHYFLPPDDAVPSDDDLGTVPDYNQLKKQELQPGT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PSKAPMKKENQWFDVGVIKGTNVMVTHYFLPPDDAVPSDDDLGTVPDYNQLKKQELQPGT
             1810      1820      1830      1840      1850      1860

             1870      1880      1890      1900      1910      1920
pF1KE3 AYKFRVAGINACGRGPFSEISAFKTCLPGFPGAPCAIKISKSPDGAHLTWEPPSVTSGKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AYKFRVAGINACGRGPFSEISAFKTCLPGFPGAPCAIKISKSPDGAHLTWEPPSVTSGKI
             1870      1880      1890      1900      1910      1920

             1930      1940      1950      1960      1970      1980
pF1KE3 IEYSVYLAIQSSQAGGELKSSTPAQLAFMRVYCGPSPSCLVQSSSLSNAHIDYTTKPAII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 IEYSVYLAIQSSQAGGELKSSTPAQLAFMRVYCGPSPSCLVQSSSLSNAHIDYTTKPAII
             1930      1940      1950      1960      1970      1980

             1990      2000      2010      2020      2030     
pF1KE3 FRIAARNEKGYGPATQVRWLQETSKDSSGTKPANKRPMSSPEMKSAPKKSKADGQ
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FRIAARNEKGYGPATQVRWLQETSKDSSGTKPANKRPMSSPEMKSAPKKSKADGQ
             1990      2000      2010      2020      2030     

>>CCDS9097.1 HCFC2 gene_id:29915|Hs108|chr12              (792 aa)
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               10        20        30        40        50        60
pF1KE3 MASAVSPANLPAVLLQPRWKRVVGWSGPVPRPRHGHRAVAIKELIVVFGGGNEGIVDELH
                         :.:: ...::::: :::::::::.::...::::::::.::::
CCDS90           MAAPSLLNWRRVSSFTGPVPRARHGHRAVAIRELMIIFGGGNEGIADELH
                         10        20        30        40        50

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pF1KE3 VYNTATNQWFIPAVRGDIPPGCAAYGFVCDGTRLLVFGGMVEYGKYSNDLYELQASRWEW
       ::::::::::.:::::::::::::.::::::::.::::::::::.:::.::::::::: :
CCDS90 VYNTATNQWFLPAVRGDIPPGCAAHGFVCDGTRILVFGGMVEYGRYSNELYELQASRWLW
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pF1KE3 KRLKAKTPKNGPPPCPRLGHSFSLVGNKCYLFGGLANDSEDPKNNIPRYLNDLYILELRP
       :..: . : .: :::::::::::: ::::::::::::.::: .::.::::::.: :::. 
CCDS90 KKVKPHPPPSGLPPCPRLGHSFSLYGNKCYLFGGLANESEDSNNNVPRYLNDFYELELQH
              120       130       140       150       160       170

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pF1KE3 GSGVVAWDIPITYGVLPPPRESHTAVVYTEKDNKKSKLVIYGGMSGCRLGDLWTLDIDTL
       :::::.:.::.: ::.: ::::::::.: .::. . :. ..::: : :: ::: ::..:.
CCDS90 GSGVVGWSIPVTKGVVPSPRESHTAVIYCKKDSGSPKMYVFGGMCGARLDDLWQLDLETM
              180       190       200       210       220       230

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pF1KE3 TWNKPSLSGVAPLPRSLHSATTIGNKMYVFGGWVPLVMDDVKVATHEKEWKCTNTLACLN
       .:.::  .:..:::::::.:..::::::.::::::   ...... :. ::.::.... ::
CCDS90 SWSKPETKGTVPLPRSLHTASVIGNKMYIFGGWVPHKGENTETSPHDCEWRCTSSFSYLN
              240       250       260       270       280       290

              310          320       330       340       350       
pF1KE3 LDTMAWETILMDTLEDNI---PRARAGHCAVAINTRLYIWSGRDGYRKAWNNQVCCKDLW
       :::  : :.. :. ::.    :: :::::::::.::::.:::::::.:: :.::::::::
CCDS90 LDTTEWTTLVSDSQEDKKNSRPRPRAGHCAVAIGTRLYFWSGRDGYKKALNSQVCCKDLW
              300       310       320       330       340       350

       360       370       380       390       400       410       
pF1KE3 YLETEKPPPPARVQLVRANTNSLEVSWGAVATADSYLLQLQKYDIPATAATATSPTPNPV
       ::.::::: :..:::..:.:::..:.:  :.:...:::::.  :.:  ::.. :      
CCDS90 YLDTEKPPAPSQVQLIKATTNSFHVKWDEVSTVEGYLLQLST-DLPYQAASSDS------
              360       370       380       390        400         

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pF1KE3 PSVPANPPKSPAPAAAAPAVQPLTQVGITLLPQAAPAPPTTTTIQVLPTVPGSSISVPTA
                : ::   .  ..:  : . ...:..     ..:  .   :   :  . :  
CCDS90 ---------SAAPNMQGVRMDPHRQGSNNIVPNSINDTINSTKTEQPATKETSMKNKPDF
                    410       420       430       440       450    

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pF1KE3 ARTQGVPAVL--KVTGPQATTGTPLVTM--RPASQAGKAPVTVTSLPAGVRMVVPTQSAQ
              :.:  ....  .. .. .: :  .  .   .: : : :    :: :.:  :..
CCDS90 KALTDSNAILYPSLASNASNHNSHVVDMLRKNEGPHTSANVGVLSSCLDVRTVIPETSVS
          460       470       480       490       500       510    

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pF1KE3 GTVIGSSPQMSGMAALAAAAAATQKIPPSSAPTVLSVPAGTTIVKTMAVTPGTTTLPATV
       .::  :: :         . .. : :   :. :      . ..::      . ::. .  
CCDS90 STV--SSTQ---------TMVTQQTIKTESSST------NGAVVKD---ETSLTTFSTKS
            520                530             540          550    

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pF1KE3 KVASSPVMVSNPATRMLKTAAAQVGTSVSSATNTSTRPIITVHKSGTVTVAQQAQVVTTV
       .:  . ..   :::.. .. .  ..:  :. : ..  :. :: :.:     :  .:    
CCDS90 EVDETYAL---PATKISRVETHATATPFSKETPSN--PVATV-KAGE---RQWCDV----
          560          570       580         590           600     

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pF1KE3 VGGVTKTIT-LVKSPISVPGGSALISNLGKV----MSVVQTKPV--------QTSAVTGQ
         :. :. : ::..   .: :.  ::..:..    .:... . .        ...:..: 
CCDS90 --GIFKNNTALVSQFYLLPKGKQSISKVGNADVPDYSLLKKQDLVPGTGYRFRVAAING-
               610       620       630       640       650         

              710           720       730       740       750      
pF1KE3 ASTGPVTQIIQTKGPLP----AGTILKLVTSADGKPTTIITTTQASGAGTKPTILGISSV
        . :: ..: . :  .:    : . ...  ...:   .    :. ::             
CCDS90 CGIGPFSKISEFKTCIPGFPGAPSAVRISKNVEGIHLSWEPPTSPSGNILEYSAYLAIRT
      660       670       680       690       700       710        

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pF1KE3 SPSTTKPGTTTIIKTIPMSAIITQAGATGVTSSPGIKSPITIITTKVMTSGTGAPAKIIT
                                                                   
CCDS90 AQIQDNPSQLVFMRIYCGLKTSCIVTAGQLANAHIDYTSRPAIVFRISAKNEKGYGPATQ
      720       730       740       750       760       770        

>>CCDS76369.1 MUC5AC gene_id:4586|Hs108|chr11             (5654 aa)
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            380       390       400       410       420        430 
pF1KE3 VRANTNSLEVSWGAVATADSYLLQLQKYDIPATAATATSPTPNPVPSVPA-NPPKSPAPA
                                     ::..... . ::.:::.. . . : .   .
CCDS76 STTYAHTTSTTSAPTARTTSAPTTRTTSASPASTTSGPGNTPSPVPTTSTISAPTTSITS
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pF1KE3 AAAPAVQPLTQVGITLLPQAAPAPPTTTTIQVLPTVPGSSISVPT----AARTQGVPAVL
       : . ..      . :  : ..:.:  ::.:   ::.  :. :.::    .:::... .. 
CCDS76 APTTSTTSAPTSSTTSGPGTTPSPVPTTSITSAPTT--STTSAPTTSTTSARTSSTTSAT
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pF1KE3 ---KVTGPQATTGTPLVTMRPASQAGKAPVTVTSLPAGVRMVVPTQSAQGTVIGSSPQMS
          ...::. :: .:. :   .: .. . ...:: :.     .::.:.      :::: :
CCDS76 TTSRISGPE-TTPSPVPT---TSTTSATTTSTTSAPTTSTTSAPTSSTT-----SSPQTS
         2390       2400         2410      2420           2430     

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pF1KE3 GMAALAAAAAATQKIPPSSAPTVLSVPAGTTIVKTMAVTPGTTTLPATVKVASSPVMVSN
         .: ......     :: .::. .. : ::  .: ..  ..::  ::....:.:  .  
CCDS76 TTSAPTTSTTSGPGTTPSPVPTTSTTSAPTT--RTTSAPKSSTTSAATTSTTSGPETTPR
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pF1KE3 PATRMLKTAAAQVGTSVSSATNTSTRPIITVHKSGTVTVAQQAQVVTTVVGGVTKTITLV
       :.    .:... . ...:. :...:    :   ::. :. . . ...:. . .:.: .  
CCDS76 PVPTT-STTSSPTTSTTSAPTTSTTSASTTSTTSGAGTTPSPVPTTSTTSAPTTSTTSAP
           2500      2510      2520      2530      2540      2550  

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pF1KE3 KSPISVPGGSALISNLGKVMSVVQTKPVQTSAVTGQASTGPVTQIIQTKGPLPAGTILKL
        :  .    ..  :. : . : : :  . ::: : ....:: :    : . .:. .: . 
CCDS76 ISSTTSATTTSTTSGPGTTPSPVPTTST-TSAPTTSTTSGPGT----TPSAVPTTSITSA
           2560      2570      2580       2590          2600       

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pF1KE3 -VTSADGKP----TTIITTTQASGAGTKPT-ILGISSVSPSTTK----PGTT------TI
        .::... :    :.  ::.. ::  : :. .   :..: :::.    ::::      : 
CCDS76 PTTSTNSAPISSTTSATTTSRISGPETTPSPVPTASTTSASTTSTTSGPGTTPSPVPTTS
      2610      2620      2630      2640      2650      2660       

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pF1KE3 IKTIPMSAII-------TQAGATGVTSSPGIKSPITIITTKVMTSGTGAPAKIITAVPKI
         ..: ..         :.:..:..::.::  .:  . :    :: :.::.   :..:  
CCDS76 TISVPTTSTTSASTTSTTSASTTSTTSGPGT-TPSPVPT----TSTTSAPTTSTTSAPTT
      2670      2680      2690       2700          2710      2720  

              830       840       850       860       870       880
pF1KE3 AT-GHGQQGVTQVVLKGAPGQPGTILRTVPMGGVRLVTPVTVSAVKPAVTTLVVKGTTGV
       .: .    ..:...  .. . :     ..:       :  :.::   ..:. .. .::..
CCDS76 STISAPTTSTTSATTTSTTSAPTPRRTSAP-------TTSTISASTTSTTSATTTSTTSA
           2730      2740      2750             2760      2770     

               890       900       910       920       930         
pF1KE3 TTLGTVTG-TVSTSLAGAGGHSTSASLATPITTLGTIATLSSQVINPTAITVSAAQTTLT
       :: .:... :.::.:.      :... .: ::.  : : .:: . .: . :.::  :. :
CCDS76 TTTSTISAPTTSTTLS-----PTTSTTSTTITST-TSAPISSTTSTPQTSTTSAPTTSTT
        2780      2790           2800       2810      2820         

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pF1KE3 AAGGLTT-PTITMQPVSQPTQVTLITAPSGVEAQPVHDLPVSILASPTTEQPTATVTIAD
       .. : :. :. : . .: ::  :  .::.                . ::  ::...: . 
CCDS76 SGPGTTSSPVPTTSTTSAPTTSTT-SAPT----------------TRTTSVPTSSTTSTA
    2830      2840      2850                       2860      2870  

     1000      1010      1020      1030      1040      1050        
pF1KE3 SGQGDVQPGTVTLVCSNPPCETHETGTTNTATTTVVANLGGHPQPTQVQFVCDRQEAAAS
       . .    :::     .  :  :  : .. :. :: . . .    ::        . ....
CCDS76 TTSTTSGPGT-----TPSPVPTTSTTSAPTTRTTSAPTTSTTSAPTTSTTSAPTSSTTSA
           2880           2890      2900      2910      2920       

     1060      1070      1080      1090      1100         1110     
pF1KE3 LVTSTVGQQNGSVVRVCSNPPCETHETGTTNTATTATSNMAGQHGCSNP---PCETHETG
        .:::..  . :.. : .. :  .  :.: .. ::.:.. .     :.:   :  .  :.
CCDS76 TTTSTISVPTTSTTSVPGTTPSPVPTTSTISVPTTSTTSASTTSTTSGPGTTPSPVPTTS
      2930      2940      2950      2960      2970      2980       

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pF1KE3 TTNTATTAMSSVGANHQRDARRACAAGTPAV-IRISVATGALEAAQGSKSQCQTRQTSAT
       ::.. ::. .:. ..   .:  . . ..:..   .. .:..  :   : ..  : .:...
CCDS76 TTSAPTTSTTSAPTTSTISAPTTSTPSAPTTSTTLAPTTSTTSAPTTSTTSTPTSSTTSS
      2990      3000      3010      3020      3030      3040       

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pF1KE3 STTMTVMATGAPCSAGPLLGPSMAREPGGRSPAFVQLAPLSSKVRLSSPSIKDLPAGRHS
         : :. :. .  ..::   :: .   .  :   .. .  ..   .:.:. .   :   :
CCDS76 PQTSTTSASTTSITSGPGTTPSPVPTTSTTSAPTTSTTSAATTSTISAPTTSTTSAPTTS
      3050      3060      3070      3080      3090      3100       

         1240      1250      1260      1270      1280        1290  
pF1KE3 HAVSTAAMTRSSVGAGEPRMAPVCESLQGGSPSTTVTVTALEALLC--PSATVTQVCSNP
        . ...:   :..:.  :   :.  .    :: :: :..:  :     :..: . : .. 
CCDS76 TTSASTASKTSGLGT-TPSPIPTTSTT---SPPTTSTTSASTASKTSGPGTTPSPVPTTS
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          . .:.::...:::.. .     .. :  .  :.:. .. :.::. . ..   .:  :
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       . : :. . : .    ..  : :    :  . .  ..:: ..   :  .:         :
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       ..     : ..        :: :     :   : ..:. .    :     ..:.  :  :
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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