FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3420, 483 aa 1>>>pF1KE3420 483 - 483 aa - 483 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9731+/-0.00103; mu= 12.6214+/- 0.064 mean_var=365.7669+/-75.756, 0's: 0 Z-trim(108.0): 2019 B-trim: 69 in 1/49 Lambda= 0.067061 statistics sampled from 13838 (16102) to 13838 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.468), E-opt: 0.2 (0.189), width: 16 Scan time: 6.490 The best scores are: opt bits E(85289) NP_056936 (OMIM: 194624) zinc finger protein 117 [ ( 483) 3398 344.4 4.1e-94 NP_001243102 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 ( 531) 2472 254.9 4e-67 NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 is ( 595) 2472 255.0 4.2e-67 NP_001243100 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 ( 625) 2430 251.0 7.2e-66 XP_011526565 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 640) 2430 251.0 7.3e-66 XP_011526566 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 536) 2428 250.7 7.7e-66 XP_016882723 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 518) 2423 250.2 1.1e-65 NP_001269288 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 852) 2410 249.3 3.2e-65 XP_011526007 (OMIM: 603980) PREDICTED: zinc finger ( 531) 2392 247.2 8.6e-65 NP_001092096 (OMIM: 603980) zinc finger protein 98 ( 572) 2392 247.2 8.9e-65 XP_016867773 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 2379 246.2 2.5e-64 XP_016867772 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 2379 246.2 2.5e-64 NP_057304 (OMIM: 603989) zinc finger protein 107 i ( 783) 2379 246.2 2.5e-64 XP_016867775 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 2379 246.2 2.5e-64 XP_016867774 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 2379 246.2 2.5e-64 NP_001013768 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 783) 2379 246.2 2.5e-64 NP_001269289 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 820) 2367 245.1 5.6e-64 NP_112495 (OMIM: 603975) zinc finger protein 93 [H ( 620) 2302 238.6 3.8e-62 NP_001243583 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 2272 235.8 3.1e-61 NP_001243580 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 2272 235.8 3.1e-61 XP_011526559 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2272 235.9 3.2e-61 NP_001243578 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2272 235.9 3.2e-61 XP_016882703 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2272 235.9 3.2e-61 NP_001243579 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2272 235.9 3.2e-61 XP_016882702 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2272 235.9 3.2e-61 XP_016882704 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2272 235.9 3.2e-61 XP_016882705 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2272 235.9 3.2e-61 XP_016882698 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2272 235.9 3.2e-61 XP_016882697 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2272 235.9 3.2e-61 XP_016882699 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2272 235.9 3.2e-61 XP_016882701 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2272 235.9 3.2e-61 XP_016882700 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2272 235.9 3.2e-61 NP_001243577 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2272 235.9 3.2e-61 XP_011526561 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2272 235.9 3.2e-61 XP_016882696 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2272 235.9 3.2e-61 NP_003414 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 is ( 809) 2272 235.9 3.3e-61 NP_001243582 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 818) 2272 235.9 3.3e-61 NP_001303925 (OMIM: 606957) zinc finger protein 25 ( 531) 2260 234.4 6e-61 NP_258429 (OMIM: 606957) zinc finger protein 257 i ( 563) 2260 234.4 6.2e-61 NP_001265593 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 586) 2257 234.2 7.7e-61 XP_016883008 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 586) 2257 234.2 7.7e-61 XP_016883007 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 586) 2257 234.2 7.7e-61 XP_016883003 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2257 234.2 7.9e-61 NP_001265590 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 618) 2257 234.2 7.9e-61 XP_011526745 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2257 234.2 7.9e-61 XP_016883005 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2257 234.2 7.9e-61 NP_001265591 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 618) 2257 234.2 7.9e-61 XP_011526746 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2257 234.2 7.9e-61 NP_001265606 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 618) 2257 234.2 7.9e-61 XP_016883004 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2257 234.2 7.9e-61 >>NP_056936 (OMIM: 194624) zinc finger protein 117 [Homo (483 aa) initn: 3398 init1: 3398 opt: 3398 Z-score: 1810.6 bits: 344.4 E(85289): 4.1e-94 Smith-Waterman score: 3398; 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72.8% identity (87.3% similar) in 482 aa overlap (1-481:1-482) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MKRHE-MVAKHLVMFYYFAQHLWPEQNIRDSFQKVTLRRYRKCGYENLQLRKGCKSVVEC ::::: :::: :: .::: :::::::.::::::::.:: :: .::: :::::.:. :: NP_001 MKRHEIMVAKPTVMCSHFAQDLWPEQNIKDSFQKVTLKRYGKCRHENLPLRKGCESMDEC 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 KQHKGDYSGLNQCLKTTLSKIFQCNKYVEVFHKISNSNRHKMRHTENKHFKCKECRKTFC :.::: .:::::: .: ::::::.:::.: ::.::::::..:::..: ::: .: :.: NP_001 KMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKVAHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCTKCGKSFG 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 MLSHLTQHKRIQTRVNFYKCEAYGRAFNWSSTLNKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFNQTSH :.: ::.:.::.::::::::: :.::::::::.::::::::::::::.::::::::.:. NP_001 MISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSN 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 LIRHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQSSTLTTHNIIHTGEIPYKCEKCVRAFNQASKLTEH ::.::.::: :::::::::::.::. ::::::.:::::: ::::..: .:::..: :: : NP_001 LIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTH 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 KLIHTGEKRYECEECGKAFNRSSKLTEHKYIHTGEKLYKCEECGKAFNQSSTLTTHKRIH . :::::: :.::::::::..::.:: :: :::::: :::..::::::::. ::::. :: NP_001 RKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIH 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 SGEKPYKCEECGKAFKQFSNLTDHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQLSNLTRHKVIHTGEK .::::::::.:::::..::.:: :: ::::::::::.::::::.. :.::.::.:::::: NP_001 TGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEK 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 PYKCGECGKAFNQSSALNTHKIIHTGENPHKCRESGKVFHLSSKLSTCKKIHTGEKLYKC :::: :: ::::::: :. :: :::::.:..:.. ::.:. ::.:. :: :: :: ::: NP_001 PYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKC 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 EECGKAFNRSSTLIGHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLTTHKIIHTEEKQYKCDECG :::::.:. ::: :: ::::::::::::::::::::: :: :: ::: :: : :.::: NP_001 EECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECG 430 440 450 460 470 480 480 pF1KE3 KAST :: NP_001 KAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI 490 500 510 520 530 >>NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 isofor (595 aa) initn: 2448 init1: 2448 opt: 2472 Z-score: 1325.7 bits: 255.0 E(85289): 4.2e-67 Smith-Waterman score: 2472; 72.8% identity (87.3% similar) in 482 aa overlap (1-481:65-546) 10 20 pF1KE3 MKRHE-MVAKHLVMFYYFAQHLWPEQNIRD ::::: :::: :: .::: :::::::.: NP_003 ENYRNLVFLGITVSKPDLITCLEQGKEAWSMKRHEIMVAKPTVMCSHFAQDLWPEQNIKD 40 50 60 70 80 90 30 40 50 60 70 80 pF1KE3 SFQKVTLRRYRKCGYENLQLRKGCKSVVECKQHKGDYSGLNQCLKTTLSKIFQCNKYVEV :::::::.:: :: .::: :::::.:. :::.::: .:::::: .: ::::::.:::.: NP_003 SFQKVTLKRYGKCRHENLPLRKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKV 100 110 120 130 140 150 90 100 110 120 130 140 pF1KE3 FHKISNSNRHKMRHTENKHFKCKECRKTFCMLSHLTQHKRIQTRVNFYKCEAYGRAFNWS ::.::::::..:::..: ::: .: :.: :.: ::.:.::.::::::::: :.::::: NP_003 AHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCTKCGKSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWS 160 170 180 190 200 210 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 STLNKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFNQTSHLIRHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQSSTLT :::.::::::::::::::.::::::::.:.::.::.::: :::::::::::.::. :::: NP_003 STLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTLT 220 230 240 250 260 270 210 220 230 240 250 260 pF1KE3 THNIIHTGEIPYKCEKCVRAFNQASKLTEHKLIHTGEKRYECEECGKAFNRSSKLTEHKY ::.:::::: ::::..: .:::..: :: :. :::::: :.::::::::..::.:: :: NP_003 THKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKI 280 290 300 310 320 330 270 280 290 300 310 320 pF1KE3 IHTGEKLYKCEECGKAFNQSSTLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQFSNLTDHKKIHTG :::::: :::..::::::::. ::::. ::.::::::::.:::::..::.:: :: :::: NP_003 IHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTG 340 350 360 370 380 390 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 EKPYKCEECGKAFNQLSNLTRHKVIHTGEKPYKCGECGKAFNQSSALNTHKIIHTGENPH ::::::.::::::.. :.::.::.:::::::::: :: ::::::: :. :: :::::.:. NP_003 EKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPY 400 410 420 430 440 450 390 400 410 420 430 440 pF1KE3 KCRESGKVFHLSSKLSTCKKIHTGEKLYKCEECGKAFNRSSTLIGHKRIHTGEKPYKCEE .:.. ::.:. ::.:. :: :: :: ::::::::.:. ::: :: :::::::::::: NP_003 ECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEE 460 470 480 490 500 510 450 460 470 480 pF1KE3 CGKAFNQSSTLTTHKIIHTEEKQYKCDECGKAST ::::::::: :: :: ::: :: : :.::::: NP_003 CGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKA 520 530 540 550 560 570 NP_003 FKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI 580 590 >>NP_001243100 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 iso (625 aa) initn: 2427 init1: 2427 opt: 2430 Z-score: 1303.5 bits: 251.0 E(85289): 7.2e-66 Smith-Waterman score: 2430; 71.6% identity (86.8% similar) in 479 aa overlap (3-481:98-576) 10 20 30 pF1KE3 MKRHEMVAKHLVMFYYFAQHLWPEQNIRDSFQ : . :. .: .::: :::::::.:::: NP_001 HEIMVAKPTGCLSKRMSYELLRKVYILMLLRSVLYASVRIMCSHFAQDLWPEQNIKDSFQ 70 80 90 100 110 120 40 50 60 70 80 90 pF1KE3 KVTLRRYRKCGYENLQLRKGCKSVVECKQHKGDYSGLNQCLKTTLSKIFQCNKYVEVFHK ::::.:: :: .::: :::::.:. :::.::: .:::::: .: ::::::.:::.: :: NP_001 KVTLKRYGKCRHENLPLRKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKVAHK 130 140 150 160 170 180 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 ISNSNRHKMRHTENKHFKCKECRKTFCMLSHLTQHKRIQTRVNFYKCEAYGRAFNWSSTL .::::::..:::..: ::: .: :.: :.: ::.:.::.::::::::: :.:::::::: NP_001 FSNSNRHEIRHTKKKPFKCTKCGKSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTL 190 200 210 220 230 240 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 NKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFNQTSHLIRHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQSSTLTTHN .::::::::::::::.::::::::.:.::.::.::: :::::::::::.::. ::::::. NP_001 TKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTLTTHK 250 260 270 280 290 300 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 IIHTGEIPYKCEKCVRAFNQASKLTEHKLIHTGEKRYECEECGKAFNRSSKLTEHKYIHT :::::: ::::..: .:::..: :: :. :::::: :.::::::::..::.:: :: ::: NP_001 IIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHT 310 320 330 340 350 360 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 GEKLYKCEECGKAFNQSSTLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQFSNLTDHKKIHTGEKP ::: :::..::::::::. ::::. ::.::::::::.:::::..::.:: :: ::::::: NP_001 GEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKP 370 380 390 400 410 420 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 YKCEECGKAFNQLSNLTRHKVIHTGEKPYKCGECGKAFNQSSALNTHKIIHTGENPHKCR :::.::::::.. :.::.::.:::::::::: :: ::::::: :. :: :::::.:..:. NP_001 YKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECE 430 440 450 460 470 480 400 410 420 430 440 450 pF1KE3 ESGKVFHLSSKLSTCKKIHTGEKLYKCEECGKAFNRSSTLIGHKRIHTGEKPYKCEECGK . ::.:. ::.:. :: :: :: ::::::::.:. ::: :: ::::::::::::::: NP_001 KCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGK 490 500 510 520 530 540 460 470 480 pF1KE3 AFNQSSTLTTHKIIHTEEKQYKCDECGKAST :::::: :: :: ::: :: : :.::::: NP_001 AFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKW 550 560 570 580 590 600 >>XP_011526565 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger pro (640 aa) initn: 2427 init1: 2427 opt: 2430 Z-score: 1303.4 bits: 251.0 E(85289): 7.3e-66 Smith-Waterman score: 2430; 71.6% identity (86.8% similar) in 479 aa overlap (3-481:113-591) 10 20 30 pF1KE3 MKRHEMVAKHLVMFYYFAQHLWPEQNIRDSFQ : . :. .: .::: :::::::.:::: XP_011 QADLQLLVSSCLSKRMSYELLRKVYILMLLRSVLYASVRIMCSHFAQDLWPEQNIKDSFQ 90 100 110 120 130 140 40 50 60 70 80 90 pF1KE3 KVTLRRYRKCGYENLQLRKGCKSVVECKQHKGDYSGLNQCLKTTLSKIFQCNKYVEVFHK ::::.:: :: .::: :::::.:. :::.::: .:::::: .: ::::::.:::.: :: XP_011 KVTLKRYGKCRHENLPLRKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKVAHK 150 160 170 180 190 200 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 ISNSNRHKMRHTENKHFKCKECRKTFCMLSHLTQHKRIQTRVNFYKCEAYGRAFNWSSTL .::::::..:::..: ::: .: :.: :.: ::.:.::.::::::::: :.:::::::: XP_011 FSNSNRHEIRHTKKKPFKCTKCGKSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTL 210 220 230 240 250 260 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 NKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFNQTSHLIRHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQSSTLTTHN .::::::::::::::.::::::::.:.::.::.::: :::::::::::.::. ::::::. XP_011 TKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTLTTHK 270 280 290 300 310 320 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 IIHTGEIPYKCEKCVRAFNQASKLTEHKLIHTGEKRYECEECGKAFNRSSKLTEHKYIHT :::::: ::::..: .:::..: :: :. :::::: :.::::::::..::.:: :: ::: XP_011 IIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHT 330 340 350 360 370 380 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 GEKLYKCEECGKAFNQSSTLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQFSNLTDHKKIHTGEKP ::: :::..::::::::. ::::. ::.::::::::.:::::..::.:: :: ::::::: XP_011 GEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKP 390 400 410 420 430 440 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 YKCEECGKAFNQLSNLTRHKVIHTGEKPYKCGECGKAFNQSSALNTHKIIHTGENPHKCR :::.::::::.. :.::.::.:::::::::: :: ::::::: :. :: :::::.:..:. XP_011 YKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECE 450 460 470 480 490 500 400 410 420 430 440 450 pF1KE3 ESGKVFHLSSKLSTCKKIHTGEKLYKCEECGKAFNRSSTLIGHKRIHTGEKPYKCEECGK . ::.:. ::.:. :: :: :: ::::::::.:. ::: :: ::::::::::::::: XP_011 KCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGK 510 520 530 540 550 560 460 470 480 pF1KE3 AFNQSSTLTTHKIIHTEEKQYKCDECGKAST :::::: :: :: ::: :: : :.::::: XP_011 AFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKW 570 580 590 600 610 620 >>XP_011526566 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger pro (536 aa) initn: 2428 init1: 2428 opt: 2428 Z-score: 1303.0 bits: 250.7 E(85289): 7.7e-66 Smith-Waterman score: 2428; 72.8% identity (87.7% similar) in 470 aa overlap (12-481:18-487) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MKRHEMVAKHLVMFYYFAQHLWPEQNIRDSFQKVTLRRYRKCGYENLQLRKGCK :: .::: :::::::.::::::::.:: :: .::: :::::. XP_011 MSLSAQPSSSFYKPVSEVMCSHFAQDLWPEQNIKDSFQKVTLKRYGKCRHENLPLRKGCE 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 SVVECKQHKGDYSGLNQCLKTTLSKIFQCNKYVEVFHKISNSNRHKMRHTENKHFKCKEC :. :::.::: .:::::: .: ::::::.:::.: ::.::::::..:::..: ::: .: XP_011 SMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKVAHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCTKC 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 RKTFCMLSHLTQHKRIQTRVNFYKCEAYGRAFNWSSTLNKHKRIHTGEKPYKCKECGKAF :.: :.: ::.:.::.::::::::: :.::::::::.::::::::::::::.:::::: XP_011 GKSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAF 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 NQTSHLIRHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQSSTLTTHNIIHTGEIPYKCEKCVRAFNQAS ::.:.::.::.::: :::::::::::.::. ::::::.:::::: ::::..: .:::..: XP_011 NQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSS 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 KLTEHKLIHTGEKRYECEECGKAFNRSSKLTEHKYIHTGEKLYKCEECGKAFNQSSTLTT :: :. :::::: :.::::::::..::.:: :: :::::: :::..::::::::. ::: XP_011 TLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTT 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 HKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQFSNLTDHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQLSNLTRHKVI :. ::.::::::::.:::::..::.:: :: ::::::::::.::::::.. :.::.::.: XP_011 HEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKII 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 HTGEKPYKCGECGKAFNQSSALNTHKIIHTGENPHKCRESGKVFHLSSKLSTCKKIHTGE ::::::::: :: ::::::: :. :: :::::.:..:.. ::.:. ::.:. :: :: : XP_011 HTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEE 370 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 KLYKCEECGKAFNRSSTLIGHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLTTHKIIHTEEKQYK : ::::::::.:. ::: :: ::::::::::::::::::::: :: :: ::: :: : XP_011 KPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYT 430 440 450 460 470 480 480 pF1KE3 CDECGKAST :.::::: XP_011 CEECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI 490 500 510 520 530 >>XP_016882723 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger pro (518 aa) initn: 2423 init1: 2423 opt: 2423 Z-score: 1300.5 bits: 250.2 E(85289): 1.1e-65 Smith-Waterman score: 2423; 72.7% identity (87.6% similar) in 469 aa overlap (13-481:1-469) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MKRHEMVAKHLVMFYYFAQHLWPEQNIRDSFQKVTLRRYRKCGYENLQLRKGCKSVVECK : .::: :::::::.::::::::.:: :: .::: :::::.:. ::: XP_016 MCSHFAQDLWPEQNIKDSFQKVTLKRYGKCRHENLPLRKGCESMDECK 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 QHKGDYSGLNQCLKTTLSKIFQCNKYVEVFHKISNSNRHKMRHTENKHFKCKECRKTFCM .::: .:::::: .: ::::::.:::.: ::.::::::..:::..: ::: .: :.: : XP_016 MHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKVAHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCTKCGKSFGM 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 LSHLTQHKRIQTRVNFYKCEAYGRAFNWSSTLNKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFNQTSHL .: ::.:.::.::::::::: :.::::::::.::::::::::::::.::::::::.:.: XP_016 ISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNL 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 IRHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQSSTLTTHNIIHTGEIPYKCEKCVRAFNQASKLTEHK :.::.::: :::::::::::.::. ::::::.:::::: ::::..: .:::..: :: :. XP_016 IKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHR 170 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 LIHTGEKRYECEECGKAFNRSSKLTEHKYIHTGEKLYKCEECGKAFNQSSTLTTHKRIHS :::::: :.::::::::..::.:: :: :::::: :::..::::::::. ::::. ::. XP_016 KIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHT 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 GEKPYKCEECGKAFKQFSNLTDHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNQLSNLTRHKVIHTGEKP ::::::::.:::::..::.:: :: ::::::::::.::::::.. :.::.::.::::::: XP_016 GEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEKP 290 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 YKCGECGKAFNQSSALNTHKIIHTGENPHKCRESGKVFHLSSKLSTCKKIHTGEKLYKCE ::: :: ::::::: :. :: :::::.:..:.. ::.:. ::.:. :: :: :: :::: XP_016 YKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKCE 350 360 370 380 390 400 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 ECGKAFNRSSTLIGHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSTLTTHKIIHTEEKQYKCDECGK ::::.:. ::: :: ::::::::::::::::::::: :: :: ::: :: : :.:::: XP_016 ECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECGK 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 AST : XP_016 AFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI 470 480 490 500 510 >>NP_001269288 (OMIM: 603989) zinc finger protein 107 is (852 aa) initn: 2410 init1: 2410 opt: 2410 Z-score: 1291.9 bits: 249.3 E(85289): 3.2e-65 Smith-Waterman score: 2410; 71.5% identity (86.3% similar) in 481 aa overlap (1-481:65-545) 10 20 30 pF1KE3 MKRHEMVAKHLVMFYYFAQHLWPEQNIRDS .:::::::: :: ..::: :::::::.:: NP_001 ENYRNLVFLGIAVSKPYLITCLEQKKEPWNIKRHEMVAKPPVMSFHFAQDLWPEQNIKDS 40 50 60 70 80 90 40 50 60 70 80 90 pF1KE3 FQKVTLRRYRKCGYENLQLRKGCKSVVECKQHKGDYSGLNQCLKTTLSKIFQCNKYVEVF ::::::::: :: ::::::::::: : :: ::: .. .:::: .: ::::::::::.:: NP_001 FQKVTLRRYGKCEYENLQLRKGCKHVDECTGHKGGHNTVNQCLTATPSKIFQCNKYVKVF 100 110 120 130 140 150 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 HKISNSNRHKMRHTENKHFKCKECRKTFCMLSHLTQHKRIQTRVNFYKCEAYGRAFNWSS :.:::::.: ::: ::::::::: :.::.::.::::.::.:::: :::: :.:::: : NP_001 DKFSNSNRYKRRHTGNKHFKCKECSKSFCVLSQLTQHRRIHTRVNSYKCEECGKAFNWFS 160 170 180 190 200 210 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 TLNKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFNQTSHLIRHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQSSTLTT ::.::::::::::::::.::::::::.:.: ::: ::::::: :::::::::.:.: :: NP_001 TLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSQLTRHKIIHTEEKPNKCEECGKAFKQASHLTI 220 230 240 250 260 270 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 HNIIHTGEIPYKCEKCVRAFNQASKLTEHKLIHTGEKRYECEECGKAFNRSSKLTEHKYI :.:::::: ::: :.: ..:.:.:.:: .:..::::. :.:.::::::: :.::.:: : NP_001 HKIIHTGEKPYKYEECGKVFSQSSHLTTQKILHTGENLYKCKECGKAFNLFSNLTNHKRI 280 290 300 310 320 330 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 HTGEKLYKCEECGKAFNQSSTLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQFSNLTDHKKIHTGE :.::: :::.:::.::: ::.:. ...::.: : ::::: :::.. .:: :::: : NP_001 HAGEKPYKCKECGRAFNISSNLNKQEKIHTGGKLNKCEECDKAFNRSLKLTAHKKILMEE 340 350 360 370 380 390 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 KPYKCEECGKAFNQLSNLTRHKVIHTGEKPYKCGECGKAFNQSSALNTHKIIHTGENPHK ::::::::::.:::.:.:::::.:::::::::: :::::::::: :. :: :::.:. .: NP_001 KPYKCEECGKVFNQFSTLTRHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNQSSNLTEHKKIHTAEKSYK 400 410 420 430 440 450 400 410 420 430 440 450 pF1KE3 CRESGKVFHLSSKLSTCKKIHTGEKLYKCEECGKAFNRSSTLIGHKRIHTGEKPYKCEEC :.: ::.:. :.: . .::..::: :::::::::::::::: ::.::::::::::::: NP_001 CEECGKAFNQHSNLINHRKIYSGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTRHKKIHTGEKPYKCEEC 460 470 480 490 500 510 460 470 480 pF1KE3 GKAFNQSSTLTTHKIIHTEEKQYKCDECGKAST .::.:::.:: :: ::: :: :::.::::: NP_001 DRAFSQSSNLTEHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNRFSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAF 520 530 540 550 560 570 NP_001 NQSYQLTRHKIVHTKEKLNKCEEFGKAFKQSSHRTIHKIIHTGEKPYKCEEHGKVFNQSS 580 590 600 610 620 630 >-- initn: 3970 init1: 1428 opt: 1431 Z-score: 780.0 bits: 154.6 E(85289): 1e-36 Smith-Waterman score: 1431; 69.4% identity (84.7% similar) in 307 aa overlap (174-480:546-851) 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 RAFNWSSTLNKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFNQTSHLIRHKRIHTEEKPYKCEECGKAFN ::. : : .:::::: :::::::::::::: NP_001 RAFSQSSNLTEHKKIHTGEKPYKCEECGKAFNRFSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFN 520 530 540 550 560 570 210 220 230 240 250 260 pF1KE3 QSSTLTTHNIIHTGEIPYKCEKCVRAFNQASKLTEHKLIHTGEKRYECEECGKAFNRSSK :: :: :.:.:: : :::. .::.:.:. : ::.:::::: :.::: ::.::.::. NP_001 QSYQLTRHKIVHTKEKLNKCEEFGKAFKQSSHRTIHKIIHTGEKPYKCEEHGKVFNQSSN 580 590 600 610 620 630 270 280 290 300 310 320 pF1KE3 LTEHKYIHTGEKLYKCEECGKAFNQSSTLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQFSNLTDH :: .: :::::.::: :: ::::: :..:.:: :..::::.::::::::...::::: : NP_001 LTTQKIIHTGENLYKFEEHGKAFNLFSNITNHKIIYTGEKPHKCEECGKAYNRFSNLTIH 640 650 660 670 680 690 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 KKIHTGEKPYKCEECGKAFNQLSNLTRHKVIHTGEKPYKCGECGKAFNQSSALNTHKIIH :.::::::::.: ::::::: :.:.:::.:::::::::: ::::::: ::.:..:: :: NP_001 KRIHTGEKPYQCAECGKAFNCSSTLNRHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNLSSTLTAHKKIH 700 710 720 730 740 750 390 400 410 420 430 440 pF1KE3 TGENPHKCRESGKVFHLSSKLSTCKKIHTGEKLYKCEECGKAFNRSSTLIGHKRIHTGEK :::.:.::.: ::.:. ::.:.: :::::.:: ::::::::.::. :.: :: :::::: NP_001 TGEKPYKCEECGKAFNQSSNLTTHKKIHTSEKPYKCEECGKSFNQFSSLNIHKIIHTGEK 760 770 780 790 800 810 450 460 470 480 pF1KE3 PYKCEECGKAFNQSSTLTTHKIIHTEEKQYKCDECGKAST :::: . :.::: ::.::::: ::: :: ::: : :: NP_001 PYKCGDYGRAFNLSSNLTTHKKIHTGEKPYKC-EYGKT 820 830 840 850 >>XP_011526007 (OMIM: 603980) PREDICTED: zinc finger pro (531 aa) initn: 2391 init1: 2391 opt: 2392 Z-score: 1284.2 bits: 247.2 E(85289): 8.6e-65 Smith-Waterman score: 2392; 71.3% identity (85.7% similar) in 481 aa overlap (1-481:33-513) 10 20 30 pF1KE3 MKRHEMVAKHLVMFYYFAQHLWPEQNIRDS .::::::.. :.. :::: :::.:. .. XP_011 ENYRNLVFVGIAASKPDLITCLEQGKEPWNVKRHEMVTEPPVVYSYFAQDLWPKQGKKNY 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KE3 FQKVTLRRYRKCGYENLQLRKGCKSVVECKQHKGDYSGLNQCLKTTLSKIFQCNKYVEVF :::: :: :.::: ::::::: :::. ::: :: :.:::::: :: .:::: .:::.:: XP_011 FQKVILRTYKKCGRENLQLRKYCKSMDECKVHKECYNGLNQCLTTTQNKIFQYDKYVKVF 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 HKISNSNRHKMRHTENKHFKCKECRKTFCMLSHLTQHKRIQTRVNFYKCEAYGRAFNWSS ::.:::::::. :: .: ::::::.:.:::::::.:::::.. . :::. :.:.: .: XP_011 HKFSNSNRHKIGHTGKKSFKCKECEKSFCMLSHLAQHKRIHSGEKPYKCKECGKAYNEAS 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 TLNKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFNQTSHLIRHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQSSTLTT .:. :::::::.:::::.:::::::. ::: :: ::: .:::::::::::::::..::: XP_011 NLSTHKRIHTGKKPYKCEECGKAFNRLSHLTTHKIIHTGKKPYKCEECGKAFNQSANLTT 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 HNIIHTGEIPYKCEKCVRAFNQASKLTEHKLIHTGEKRYECEECGKAFNRSSKLTEHKYI :. ::::: :::::.: :::.:.: :: ::.::.::: :.::::::::..:: :: :: : XP_011 HKRIHTGEKPYKCEECGRAFSQSSTLTAHKIIHAGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTTHKII 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 HTGEKLYKCEECGKAFNQSSTLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQFSNLTDHKKIHTGE :::::.::::::::::.. : ::::::::::::::::::::::::: :.:: ::.::.:: XP_011 HTGEKFYKCEECGKAFSRLSHLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTTHKRIHAGE 310 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 KPYKCEECGKAFNQLSNLTRHKVIHTGEKPYKCGECGKAFNQSSALNTHKIIHTGENPHK : :::: :.:::...:.:: :: :::::::::: ::::::: :: :.:::::::::.:.: XP_011 KFYKCEVCSKAFSRFSHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNLSSQLTTHKIIHTGEKPYK 370 380 390 400 410 420 400 410 420 430 440 450 pF1KE3 CRESGKVFHLSSKLSTCKKIHTGEKLYKCEECGKAFNRSSTLIGHKRIHTGEKPYKCEEC :.: ::.:. :: :: : :::::: :::::::::::.:: : :: ::::::::::::: XP_011 CEECGKAFNQSSTLSKHKVIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSHLTTHKMIHTGEKPYKCEEC 430 440 450 460 470 480 460 470 480 pF1KE3 GKAFNQSSTLTTHKIIHTEEKQYKCDECGKAST :::::.:: :. ::.::: :: :: . :..: XP_011 GKAFNNSSILNRHKMIHTGEKLYKPESCNNACDNIAKISKYKRNCAGEK 490 500 510 520 530 >>NP_001092096 (OMIM: 603980) zinc finger protein 98 [Ho (572 aa) initn: 2391 init1: 2391 opt: 2392 Z-score: 1284.0 bits: 247.2 E(85289): 8.9e-65 Smith-Waterman score: 2392; 71.3% identity (85.7% similar) in 481 aa overlap (1-481:74-554) 10 20 30 pF1KE3 MKRHEMVAKHLVMFYYFAQHLWPEQNIRDS .::::::.. :.. :::: :::.:. .. NP_001 ENYRNLVFVGIAASKPDLITCLEQGKEPWNVKRHEMVTEPPVVYSYFAQDLWPKQGKKNY 50 60 70 80 90 100 40 50 60 70 80 90 pF1KE3 FQKVTLRRYRKCGYENLQLRKGCKSVVECKQHKGDYSGLNQCLKTTLSKIFQCNKYVEVF :::: :: :.::: ::::::: :::. ::: :: :.:::::: :: .:::: .:::.:: NP_001 FQKVILRTYKKCGRENLQLRKYCKSMDECKVHKECYNGLNQCLTTTQNKIFQYDKYVKVF 110 120 130 140 150 160 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 HKISNSNRHKMRHTENKHFKCKECRKTFCMLSHLTQHKRIQTRVNFYKCEAYGRAFNWSS ::.:::::::. :: .: ::::::.:.:::::::.:::::.. . :::. :.:.: .: NP_001 HKFSNSNRHKIGHTGKKSFKCKECEKSFCMLSHLAQHKRIHSGEKPYKCKECGKAYNEAS 170 180 190 200 210 220 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 TLNKHKRIHTGEKPYKCKECGKAFNQTSHLIRHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQSSTLTT .:. :::::::.:::::.:::::::. ::: :: ::: .:::::::::::::::..::: NP_001 NLSTHKRIHTGKKPYKCEECGKAFNRLSHLTTHKIIHTGKKPYKCEECGKAFNQSANLTT 230 240 250 260 270 280 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 HNIIHTGEIPYKCEKCVRAFNQASKLTEHKLIHTGEKRYECEECGKAFNRSSKLTEHKYI :. ::::: :::::.: :::.:.: :: ::.::.::: :.::::::::..:: :: :: : NP_001 HKRIHTGEKPYKCEECGRAFSQSSTLTAHKIIHAGEKPYKCEECGKAFSQSSTLTTHKII 290 300 310 320 330 340 280 290 300 310 320 330 pF1KE3 HTGEKLYKCEECGKAFNQSSTLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQFSNLTDHKKIHTGE :::::.::::::::::.. : ::::::::::::::::::::::::: :.:: ::.::.:: NP_001 HTGEKFYKCEECGKAFSRLSHLTTHKRIHSGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTTHKRIHAGE 350 360 370 380 390 400 340 350 360 370 380 390 pF1KE3 KPYKCEECGKAFNQLSNLTRHKVIHTGEKPYKCGECGKAFNQSSALNTHKIIHTGENPHK : :::: :.:::...:.:: :: :::::::::: ::::::: :: :.:::::::::.:.: NP_001 KFYKCEVCSKAFSRFSHLTTHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNLSSQLTTHKIIHTGEKPYK 410 420 430 440 450 460 400 410 420 430 440 450 pF1KE3 CRESGKVFHLSSKLSTCKKIHTGEKLYKCEECGKAFNRSSTLIGHKRIHTGEKPYKCEEC :.: ::.:. :: :: : :::::: :::::::::::.:: : :: ::::::::::::: NP_001 CEECGKAFNQSSTLSKHKVIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSHLTTHKMIHTGEKPYKCEEC 470 480 490 500 510 520 460 470 480 pF1KE3 GKAFNQSSTLTTHKIIHTEEKQYKCDECGKAST :::::.:: :. ::.::: :: :: . :..: NP_001 GKAFNNSSILNRHKMIHTGEKLYKPESCNNACDNIAKISKYKRNCAGEK 530 540 550 560 570 483 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Mon Nov 7 18:23:50 2016 done: Mon Nov 7 18:23:51 2016 Total Scan time: 6.490 Total Display time: 0.090 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]