FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4242, 904 aa 1>>>pF1KE4242 904 - 904 aa - 904 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2072+/-0.00127; mu= 16.1298+/- 0.075 mean_var=84.1007+/-16.633, 0's: 0 Z-trim(101.5): 80 B-trim: 49 in 2/48 Lambda= 0.139854 statistics sampled from 6461 (6541) to 6461 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.552), E-opt: 0.2 (0.201), width: 16 Scan time: 3.600 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS43508.1 ECT2L gene_id:345930|Hs108|chr6 ( 904) 6033 1228.3 0 CCDS6068.1 FBXO16 gene_id:157574|Hs108|chr8 ( 292) 551 122.0 1.7e-27 CCDS59099.1 FBXO16 gene_id:157574|Hs108|chr8 ( 280) 456 102.8 9.4e-22 CCDS3220.1 ECT2 gene_id:1894|Hs108|chr3 ( 883) 387 89.1 3.9e-17 CCDS58860.1 ECT2 gene_id:1894|Hs108|chr3 ( 914) 387 89.1 4.1e-17 CCDS45320.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15 (1257) 339 79.5 4.4e-14 CCDS10309.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15 (1273) 339 79.5 4.5e-14 CCDS4052.1 RASGRF2 gene_id:5924|Hs108|chr5 (1237) 311 73.8 2.2e-12 CCDS13807.1 BCR gene_id:613|Hs108|chr22 (1227) 304 72.4 5.8e-12 CCDS13806.1 BCR gene_id:613|Hs108|chr22 (1271) 304 72.4 6e-12 CCDS30617.1 ARHGEF10L gene_id:55160|Hs108|chr1 (1240) 291 69.8 3.6e-11 CCDS182.1 ARHGEF10L gene_id:55160|Hs108|chr1 (1279) 291 69.8 3.7e-11 >>CCDS43508.1 ECT2L gene_id:345930|Hs108|chr6 (904 aa) initn: 6033 init1: 6033 opt: 6033 Z-score: 6577.5 bits: 1228.3 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6033; 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CCDS60 MMAFAPPKNTDGPKMQTKMSTWTPLNHQLLNDRVFEERRALLGKWFDKWTDSQRRRILTG 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 IFLRCTKSQLRFVQDWFSERMQVAKVDFSTVLPRFISLYIFSFLSPKDLCAAAQVSWPWK .. ::. :: .: ..:.. . .::.: ::: .::::::::.:..:: ::: : :: CCDS60 LLERCSLSQQKFCCRKLQEKIPAEALDFTTKLPRVLSLYIFSFLDPRSLCRCAQVCWHWK 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 FLTEQDCLWMPKCVKFGWFLPYTPTDNEYGAWKRHYIACVSHLDWLTPRE--------AA :.: : ::: ::..:.:.. ..:: : : ::.::: :..: :. : CCDS60 NLAELDQLWMLKCLRFNWYINFSPTPFEQGIWKKHYIQMVKELHITKPKTPPKDGFVIAD 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 ATYGTLNEPKTEDEELLERQREKCLRKRIWEKIALRKKELFKVRPPWVSGTCCSSVLKPR . : : :. .. : . . :::. .. :. ::: : CCDS60 VQLVTSNSPEEKQSPLSAFRSSSSLRKK--------NNSGEKALPPWRSSDKHPTDIIRF 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 CQPRLSQTVRERVGLHEALEKQLVLTSLETLPKRSNISGSHSYPLLSKKNWHGVHKNDDR CCDS60 NYLDNRDPMETVQQGRRKRNQMTPDFSRQSHDKKNKLQDRTRLRKAQSMMSRRNPFPLCP 240 250 260 270 280 290 >>CCDS59099.1 FBXO16 gene_id:157574|Hs108|chr8 (280 aa) initn: 484 init1: 440 opt: 456 Z-score: 504.0 bits: 102.8 E(32554): 9.4e-22 Smith-Waterman score: 480; 37.9% identity (61.7% similar) in 214 aa overlap (5-210:16-209) 10 20 30 40 pF1KE4 MESFHTRFSAWTPFSNKSLNRQLFQERVALISHWFDLWTNKQRQEFLFA .:..:.::: ::.::...: :: ::..::...: . CCDS59 MMAFAPPKNTDGPKMQTKMSTWTP-----LNHQLLNDR-------FDKWTDSQRRRILTG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 pF1KE4 IFLRCTKSQLRFVQDWFSERMQVAKVDFSTVLPRFISLYIFSFLSPKDLCAAAQVSWPWK .. ::. :: .: ..:.. . .::.: ::: .::::::::.:..:: ::: : :: CCDS59 LLERCSLSQQKFCCRKLQEKIPAEALDFTTKLPRVLSLYIFSFLDPRSLCRCAQVCWHWK 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 FLTEQDCLWMPKCVKFGWFLPYTPTDNEYGAWKRHYIACVSHLDWLTPRE--------AA :.: : ::: ::..:.:.. ..:: : : ::.::: :..: :. : CCDS59 NLAELDQLWMLKCLRFNWYINFSPTPFEQGIWKKHYIQMVKELHITKPKTPPKDGFVIAD 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 ATYGTLNEPKTEDEELLERQREKCLRKRIWEKIALRKKELFKVRPPWVSGTCCSSVLKPR . : : :. .. : . . :::. .. :. ::: : CCDS59 VQLVTSNSPEEKQSPLSAFRSSSSLRKK--------NNSGEKALPPWRSSDKHPTDIIRF 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 CQPRLSQTVRERVGLHEALEKQLVLTSLETLPKRSNISGSHSYPLLSKKNWHGVHKNDDR CCDS59 NYLDNRDPMETVQQGRRKRNQMTPDFSRQSHDKKNKLQDRTRLRKAQSMMSRRNPFPLCP 230 240 250 260 270 280 >>CCDS3220.1 ECT2 gene_id:1894|Hs108|chr3 (883 aa) initn: 390 init1: 187 opt: 387 Z-score: 421.0 bits: 89.1 E(32554): 3.9e-17 Smith-Waterman score: 387; 27.6% identity (58.6% similar) in 362 aa overlap (561-904:418-766) 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 VEDNSWDTKSRLSKNDLNFEALINLERILQKDSAEKRARVVRELLQSERKYVQILEIVRD :.:: : .:..:: :.: .::.:: . . CCDS32 ISNTPESSINYGDTPKSCTKSSKSSTPVPSKQSA--RWQVAKELYQTESNYVNILATIIQ 390 400 410 420 430 440 600 610 620 630 640 650 pF1KE4 VYVAPLKAALSSNRAILSAANIQIIFCDILQILSLNRQFLDNLRDRLQEWGPAHCVGEIV .. .::. . . ::. .:. :: .: .:.... .. :.:.: . .: .. .:.: CCDS32 LFQVPLEEEGQRGGPILAPEEIKTIFGSIPDIFDVHTKIKDDLEDLIVNWDESKSIGDIF 450 460 470 480 490 500 660 670 680 690 700 pF1KE4 TKFGSQL-NTYTNFFNNYPVILKTIEKCREMIPAFRTFLKRHDKTIVTKMLSLPELLLYP :....: .:: : : . . .:: ::... : :..::: .. :: :::. : CCDS32 LKYSKDLVKTYPPFVNFFEMSKETIIKCEKQKPRFHAFLKINQAKPECGRQSLVELLIRP 510 520 530 540 550 560 710 720 730 740 750 760 pF1KE4 SRRFEEYLNLLYAVRLHTPAEHVDRGDLTTAIDQIKKYKGYIDQMKQNITMKDHLSDIQR .:. :: .. :: :. :.. : :: ..:. .:.. :.. . .. :. CCDS32 VQRLPSVALLLNDLKKHTADENPDKSTLEKAIGSLKEVMTHINEDKRKTEAQKQIFDVVY 570 580 590 600 610 620 770 780 790 800 810 820 pF1KE4 IIWGCPT-LSEVNRYLI-RVQDVAQ-LHCCDEEISFSLRLYEHIHDLSLFLFNDALLVSS . :::. : .: :. ::. .. : ::. :.. .:::::: : .. CCDS32 EVDGCPANLLSSHRSLVQRVETISLGEHPCDRG--------EQV---TLFLFNDCLEIAR 630 640 650 660 670 830 840 850 860 870 pF1KE4 R-----GTSHTPFERTSK-TTYQFIASVALHRLL-IENIPDSKYVKNAFIL--QGP--KY . :: ..: .: .. . : . : .. . .: ... .::: : . : . CCDS32 KRHKVIGTFRSPHGQTRPPASLKHIHLMPLSQIKKVLDIRETEDCHNAFALLVRPPTEQA 680 690 700 710 720 730 880 890 900 pF1KE4 KWICATEIEDD---KFLWLSVLRNAIKSSMEK . . . .. .: : ::..: . ... : CCDS32 NVLLSFQMTSDELPKENWLKMLCRHVANTICKADAENLIYTADPESFEVNTKDMDSTLSR 740 750 760 770 780 790 CCDS32 ASRAIKKTSKKVTRAFSFSKTPKRALRRALMTSHGSVEGRSPSSNDKHVMSRLSSTSSLA 800 810 820 830 840 850 >>CCDS58860.1 ECT2 gene_id:1894|Hs108|chr3 (914 aa) initn: 390 init1: 187 opt: 387 Z-score: 420.8 bits: 89.1 E(32554): 4.1e-17 Smith-Waterman score: 387; 27.6% identity (58.6% similar) in 362 aa overlap (561-904:449-797) 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 VEDNSWDTKSRLSKNDLNFEALINLERILQKDSAEKRARVVRELLQSERKYVQILEIVRD :.:: : .:..:: :.: .::.:: . . CCDS58 ISNTPESSINYGDTPKSCTKSSKSSTPVPSKQSA--RWQVAKELYQTESNYVNILATIIQ 420 430 440 450 460 470 600 610 620 630 640 650 pF1KE4 VYVAPLKAALSSNRAILSAANIQIIFCDILQILSLNRQFLDNLRDRLQEWGPAHCVGEIV .. .::. . . ::. .:. :: .: .:.... .. :.:.: . .: .. .:.: CCDS58 LFQVPLEEEGQRGGPILAPEEIKTIFGSIPDIFDVHTKIKDDLEDLIVNWDESKSIGDIF 480 490 500 510 520 530 660 670 680 690 700 pF1KE4 TKFGSQL-NTYTNFFNNYPVILKTIEKCREMIPAFRTFLKRHDKTIVTKMLSLPELLLYP :....: .:: : : . . .:: ::... : :..::: .. :: :::. : CCDS58 LKYSKDLVKTYPPFVNFFEMSKETIIKCEKQKPRFHAFLKINQAKPECGRQSLVELLIRP 540 550 560 570 580 590 710 720 730 740 750 760 pF1KE4 SRRFEEYLNLLYAVRLHTPAEHVDRGDLTTAIDQIKKYKGYIDQMKQNITMKDHLSDIQR .:. :: .. :: :. :.. : :: ..:. .:.. :.. . .. :. CCDS58 VQRLPSVALLLNDLKKHTADENPDKSTLEKAIGSLKEVMTHINEDKRKTEAQKQIFDVVY 600 610 620 630 640 650 770 780 790 800 810 820 pF1KE4 IIWGCPT-LSEVNRYLI-RVQDVAQ-LHCCDEEISFSLRLYEHIHDLSLFLFNDALLVSS . :::. : .: :. ::. .. : ::. :.. .:::::: : .. CCDS58 EVDGCPANLLSSHRSLVQRVETISLGEHPCDRG--------EQV---TLFLFNDCLEIAR 660 670 680 690 700 830 840 850 860 870 pF1KE4 R-----GTSHTPFERTSK-TTYQFIASVALHRLL-IENIPDSKYVKNAFIL--QGP--KY . :: ..: .: .. . : . : .. . .: ... .::: : . : . CCDS58 KRHKVIGTFRSPHGQTRPPASLKHIHLMPLSQIKKVLDIRETEDCHNAFALLVRPPTEQA 710 720 730 740 750 760 880 890 900 pF1KE4 KWICATEIEDD---KFLWLSVLRNAIKSSMEK . . . .. .: : ::..: . ... : CCDS58 NVLLSFQMTSDELPKENWLKMLCRHVANTICKADAENLIYTADPESFEVNTKDMDSTLSR 770 780 790 800 810 820 CCDS58 ASRAIKKTSKKVTRAFSFSKTPKRALRRALMTSHGSVEGRSPSSNDKHVMSRLSSTSSLA 830 840 850 860 870 880 >>CCDS45320.1 RASGRF1 gene_id:5923|Hs108|chr15 (1257 aa) initn: 199 init1: 119 opt: 339 Z-score: 366.3 bits: 79.5 E(32554): 4.4e-14 Smith-Waterman score: 342; 24.3% identity (59.3% similar) in 371 aa overlap (466-829:151-506) 440 450 460 470 480 490 pF1KE4 LGSQWGKAPSSIYFCESKLQTWSSFTDFLEETLKTVRKQLYPFFKELQKSISGRMIGQFM :: ::: ::: ... . : :. .. CCDS45 VAAIAHASYRTLATEHEALMQKYLHLLQIVETEKTVAKQLRQQIEDGEIEIE-RLKAE-- 130 140 150 160 170 500 510 520 530 540 550 pF1KE4 FDTMGMTNILNNQDTAQALADGLMELSKEDSERNVVEDNSWDTKSRLSKNDLNFEALI-N .:..:.... :. . . :::. . .. . .. : . .....: . CCDS45 -----ITSLLKDNERIQSTQT--VAPNDEDSDIKKIKKVQSFLRGWLCRR--KWKTIIQD 180 190 200 210 220 560 570 580 590 600 610 pF1KE4 LERILQKDSAEKRARVVRELLQSERKYVQILEIVRDVYVAPLKAALSSNRAILSAANIQI : . :: .:: .:: .:..: .::: :.:. . .. ::. : ::.. .. ... CCDS45 YIRSPHADSMRKRNQVVFSMLEAEAEYVQQLHILVNNFLRPLRMAASSKKPPITHDDVSS 230 240 250 260 270 280 620 630 640 650 660 670 pF1KE4 IFCDILQILSLNRQFLDNLRDRLQEWGPAHCVGEIVTKFGSQLNTYTNFFNNYPVILKTI :: . :. :.. : ..:. :.. : :. .... . .:: : .: :. :. . CCDS45 IFLNSETIMFLHQIFYQGLKARISSW-PTLVLADLFDILLPMLNIYQEFVRNHQYSLQIL 290 300 310 320 330 340 680 690 700 710 720 730 pF1KE4 EKCREMIPAFRTFLKRHDKTIVTKMLSLPELLLYPSRRFEEYLNLLYAVRLHTPAEHVDR .:.. : .::... . .: .: :: .. .:. :. . ::: :::.: CCDS45 AHCKQN-RDFDKLLKHYEAKPDCEERTLETFLTYPMFQIPRYILTLHELLAHTPHEHVER 350 360 370 380 390 400 740 750 760 770 780 790 pF1KE4 GDLTTAIDQIKKYKGYI-DQMKQNITMKDHLSDIQRIIWGCPTLSEVNRYLIRVQDVAQL ..: : ..... . . :..... ... .:. . :: :: : .... ..: .. :. CCDS45 NSLDYAKSKLEELSRIMHDEVSETENIRKNLAIERMIIEGCEILLDTSQTFVRQGSLIQV 410 420 430 440 450 460 800 810 820 830 840 pF1KE4 HCCDE-EISF----SLRLYEHIHDLSLFLFNDALLVSSRGTSHTPFERTSKTTYQFIASV .. .:. :: : .. . . :::. :.. .::. 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CCDS10 -----ITSLLKDNERIQSTQT--VAPNDEDSDIKKIKKVQSFLRGWLCRR--KWKTIIQD 180 190 200 210 220 560 570 580 590 600 610 pF1KE4 LERILQKDSAEKRARVVRELLQSERKYVQILEIVRDVYVAPLKAALSSNRAILSAANIQI : . :: .:: .:: .:..: .::: :.:. . .. ::. : ::.. .. ... CCDS10 YIRSPHADSMRKRNQVVFSMLEAEAEYVQQLHILVNNFLRPLRMAASSKKPPITHDDVSS 230 240 250 260 270 280 620 630 640 650 660 670 pF1KE4 IFCDILQILSLNRQFLDNLRDRLQEWGPAHCVGEIVTKFGSQLNTYTNFFNNYPVILKTI :: . :. :.. : ..:. :.. : :. .... . .:: : .: :. :. . CCDS10 IFLNSETIMFLHQIFYQGLKARISSW-PTLVLADLFDILLPMLNIYQEFVRNHQYSLQIL 290 300 310 320 330 340 680 690 700 710 720 730 pF1KE4 EKCREMIPAFRTFLKRHDKTIVTKMLSLPELLLYPSRRFEEYLNLLYAVRLHTPAEHVDR .:.. : .::... . .: .: :: .. .:. :. . ::: :::.: CCDS10 AHCKQN-RDFDKLLKHYEAKPDCEERTLETFLTYPMFQIPRYILTLHELLAHTPHEHVER 350 360 370 380 390 400 740 750 760 770 780 790 pF1KE4 GDLTTAIDQIKKYKGYI-DQMKQNITMKDHLSDIQRIIWGCPTLSEVNRYLIRVQDVAQL ..: : ..... . . :..... ... .:. . :: :: : .... ..: .. :. CCDS10 NSLDYAKSKLEELSRIMHDEVSETENIRKNLAIERMIIEGCEILLDTSQTFVRQGSLIQV 410 420 430 440 450 460 800 810 820 830 840 pF1KE4 HCCDE-EISF----SLRLYEHIHDLSLFLFNDALLVSSRGTSHTPFERTSKTTYQFIASV .. .:. :: : .. . . :::. :.. .::. CCDS10 PMSEKGKITRGRLGSLSLKKE-GERQCFLFSKHLIICTRGSGGKLHLTKNGVISLIDCTL 470 480 490 500 510 520 850 860 870 880 890 900 pF1KE4 ALHRLLIENIPDSKYVKNAFILQGPKYKWICATEIEDDKFLWLSVLRNAIKSSMEK CCDS10 LEEPESTEEEAKGSGQDIDHLDFKIGVEPKDSPPFTVILVASSRQEKAAWTSDISQCVDN 530 540 550 560 570 580 >>CCDS4052.1 RASGRF2 gene_id:5924|Hs108|chr5 (1237 aa) initn: 183 init1: 103 opt: 311 Z-score: 335.9 bits: 73.8 E(32554): 2.2e-12 Smith-Waterman score: 311; 23.8% identity (61.2% similar) in 273 aa overlap (562-829:239-509) 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 EDNSWDTKSRLSKNDLNFEALINLERILQKDSAEKRARVVRELLQSERKYVQILEIVRDV .: .:: ..: ....: .::. : :. . 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CCDS13 HTPASHPDHPLLQ---DALRISQNFLSSINEEITPRRQSMTVKKGEHRQLLKDSFMVELV 670 680 690 700 710 790 800 810 820 830 840 pF1KE4 RVQDVAQLHCCDEEISFSLRLYEHIHDLSLFLFNDALLVSSRGTSHTPFERTSKTTYQFI CCDS13 EGARKLRHVFLFTDLLLCTKLKKQSGGKTQQYDCKWYIPLTDLSFQMVDELEAVPNIPLV 720 730 740 750 760 770 >>CCDS13806.1 BCR gene_id:613|Hs108|chr22 (1271 aa) initn: 299 init1: 211 opt: 304 Z-score: 328.0 bits: 72.4 E(32554): 6e-12 Smith-Waterman score: 304; 26.4% identity (55.1% similar) in 314 aa overlap (465-769:401-703) 440 450 460 470 480 490 pF1KE4 WLGSQWGKAPSSIYFCESKLQTWSSFTDFLEETLKTVRK--QLYPFFKELQKSISGRMIG : :. ::: :..: .. . .. : : CCDS13 SQNSQQSFDSSSPPTPQCHKRHRHCPVVVSEATIVGVRKTGQIWP--NDGEGAFHGDADG 380 390 400 410 420 500 510 520 530 540 550 pF1KE4 QFMFDTMGMTNILNNQDTAQALADGLMELSKEDSERNVVEDNSWDTKSRLSKNDLNFEAL .: :. . . . ::: . .:: . . .: :: . . .:. CCDS13 SFGTPP-GYGCAADRAEEQRRHQDGLPYI--DDSPSSSPHLSSKGRGSRDALVSGALEST 430 440 450 460 470 480 560 570 580 590 600 610 pF1KE4 INLERILQKDSAEKRARVVRELLQSERKYVQILEIVRDVYVAPLKAALSSNRAILSAANI : :.: . : : :. .: ::. :.. :: . . . ::::: .... .:.. .: CCDS13 KASELDLEK-GLEMRKWVLSGILASEETYLSHLEALL-LPMKPLKAAATTSQPVLTSQQI 490 500 510 520 530 540 620 630 640 650 660 670 pF1KE4 QIIFCDILQILSLNRQFLDNLRDRLQEWGPAHCVGEIVTKFGSQLNTYTNFFNNYPVILK . :: . .. ....: :.: :.:.:. . ::.. :..:::..: : .:: : .. CCDS13 ETIFFKVPELYEIHKEFYDGLFPRVQQWSHQQRVGDLFQKLASQLGVYRAFVDNYGVAME 550 560 570 580 590 600 680 690 700 710 720 pF1KE4 TIEKC-------REMIPAFRTFLKRHDKTIVTKMLSLPELLLYPSRRFEEYLNLLYAVRL ::: :. .:. .. : .:: :: :: : : . .:. . CCDS13 MAEKCCQANAQFAEISENLRARSNKDAKDPTTKN-SLETLLYKPVDRVTRSTLVLHDLLK 610 620 630 640 650 660 730 740 750 760 770 780 pF1KE4 HTPAEHVDRGDLTTAIDQIKKYKGYIDQMKQNITMKDHLSDIQRIIWGCPTLSEVNRYLI :::: : :. : : .. ..........:: . . ... CCDS13 HTPASHPDHPLLQ---DALRISQNFLSSINEEITPRRQSMTVKKGEHRQLLKDSFMVELV 670 680 690 700 710 790 800 810 820 830 840 pF1KE4 RVQDVAQLHCCDEEISFSLRLYEHIHDLSLFLFNDALLVSSRGTSHTPFERTSKTTYQFI CCDS13 EGARKLRHVFLFTDLLLCTKLKKQSGGKTQQYDCKWYIPLTDLSFQMVDELEAVPNIPLV 720 730 740 750 760 770 904 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 02:28:24 2016 done: Sun Nov 6 02:28:25 2016 Total Scan time: 3.600 Total Display time: 0.160 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]