FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2137, 894 aa 1>>>pF1KE2137 894 - 894 aa - 894 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7206+/-0.00152; mu= 16.1470+/- 0.092 mean_var=225.5471+/-43.299, 0's: 0 Z-trim(107.3): 957 B-trim: 46 in 2/50 Lambda= 0.085400 statistics sampled from 8457 (9491) to 8457 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.604), E-opt: 0.2 (0.292), width: 16 Scan time: 3.730 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS43307.1 PRDM9 gene_id:56979|Hs108|chr5 ( 894) 6389 801.8 0 CCDS45557.1 PRDM7 gene_id:11105|Hs108|chr16 ( 492) 2415 311.8 2e-84 CCDS74704.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 ( 635) 2093 272.3 2e-72 CCDS13134.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 ( 653) 2081 270.8 5.8e-72 CCDS74703.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 ( 667) 2081 270.8 5.8e-72 CCDS63235.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 ( 591) 2080 270.6 5.9e-72 CCDS63234.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 ( 654) 2077 270.3 8.1e-72 CCDS63233.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 ( 657) 2077 270.3 8.1e-72 CCDS74692.1 ZNF343 gene_id:79175|Hs108|chr20 ( 509) 2058 267.8 3.6e-71 CCDS13028.1 ZNF343 gene_id:79175|Hs108|chr20 ( 599) 2058 267.9 3.9e-71 CCDS74693.1 ZNF343 gene_id:79175|Hs108|chr20 ( 640) 2052 267.2 6.8e-71 CCDS82339.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19 ( 598) 1999 260.6 6e-69 CCDS82338.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19 ( 640) 1999 260.7 6.3e-69 CCDS12502.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19 ( 659) 1999 260.7 6.4e-69 CCDS82337.1 HKR1 gene_id:284459|Hs108|chr19 ( 641) 1997 260.4 7.4e-69 CCDS6709.2 ZNF169 gene_id:169841|Hs108|chr9 ( 603) 1845 241.7 3.1e-63 CCDS12848.1 ZNF432 gene_id:9668|Hs108|chr19 ( 652) 1819 238.5 3e-62 CCDS13174.1 ZNF337 gene_id:26152|Hs108|chr20 ( 751) 1814 238.0 5e-62 CCDS12846.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 731) 1782 234.0 7.5e-61 CCDS82387.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 736) 1782 234.0 7.6e-61 CCDS59418.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 742) 1782 234.0 7.6e-61 CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1749 230.0 1.3e-59 CCDS62706.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 819) 1705 224.6 5.8e-58 CCDS42574.1 ZNF229 gene_id:7772|Hs108|chr19 ( 825) 1705 224.6 5.8e-58 CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1703 224.3 6.2e-58 CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 1695 223.3 1.3e-57 CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 769) 1695 223.3 1.3e-57 CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 1693 223.1 1.6e-57 CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1690 222.9 2.4e-57 CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1690 222.9 2.4e-57 CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1666 219.5 1.2e-56 CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX ( 779) 1669 220.1 1.2e-56 CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1664 219.4 1.6e-56 CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1664 219.4 1.7e-56 CCDS12637.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 907) 1666 219.9 1.7e-56 CCDS54276.1 ZNF112 gene_id:7771|Hs108|chr19 ( 913) 1666 219.9 1.7e-56 CCDS31938.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 641) 1660 218.9 2.3e-56 CCDS53850.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 672) 1660 218.9 2.4e-56 CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1658 218.6 2.7e-56 CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1658 218.7 2.8e-56 CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1658 218.7 2.8e-56 CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1658 218.7 2.9e-56 CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1653 217.9 3.8e-56 CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1653 218.0 4e-56 CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1653 218.1 4.3e-56 CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1653 218.1 4.4e-56 CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12 ( 947) 1654 218.4 4.9e-56 CCDS12495.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 616) 1649 217.5 5.9e-56 CCDS74349.1 ZNF567 gene_id:163081|Hs108|chr19 ( 647) 1649 217.6 6e-56 CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 1646 217.2 7.6e-56 >>CCDS43307.1 PRDM9 gene_id:56979|Hs108|chr5 (894 aa) initn: 6389 init1: 6389 opt: 6389 Z-score: 4272.6 bits: 801.8 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6389; 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CCDS74 RSSPAGGWSDPLFFGGAGISFSKPELITQLEQGKE---TWREEKKCSPATCPDPEPELYL 40 50 60 70 80 90 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 CPSCCLAFSSQKFLSQHVERNHSSQNFPGPSARKLLQPENPCPGDQNQEQQYPDPHSRND : : .:::::: ::: :: : :. .:: .: ::::...:: . . .: CCDS74 DPFCPPGFSSQKFPMQHVLCNHPPWIFTCLCAEGNIQPGDPGPGDQEKQQQASEGRPWSD 100 110 120 130 140 150 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 KTKGQEIKERSKLLNKRTWQREISRAFSSPPKGQMGSCRVGKRIMEEESRTGQKVNPGNT ...: : : . : :: .: .. ::: ::. : : : : : .: :. .:. :: .: CCDS74 QAEGPE-GEGAMPLFGRTKKRTLG-AFSRPPQRQPVSSRNGLRGVELEASPAQSGNPEET 160 170 180 190 200 210 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 GKLFVGVGISRIAKVKYGECGQGFSVKSDVITHQRTHTGEKLYVCRECGRGFSWKSHLLI ::. . . .. :. :::: .:: .....::: :.::: ::: : .::: :. : CCDS74 DKLLKRIEVLGFGTVNCGECGLSFSKMTNLLSHQRIHSGEKPYVCGVCEKGFSLKKSLAR 220 230 240 250 260 270 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 HQRIHTGEKPYVCRECGRGFSWQSVLLTHQRTHTGEKPYVCRECGRGFSRQSVLLTHQRR ::. :.:::: :::::::::. .:.:. :.:::.:::::.: :::::::..: :. ::: CCDS74 HQKAHSGEKPIVCRECGRGFNRKSTLIIHERTHSGEKPYMCSECGRGFSQKSNLIIHQRT 280 290 300 310 320 330 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 HTGEKPYVCRECGRGFSRQSVLLTHQRRHTGEKPYVCRECGRGFSWQSVLLSHQRTHTGE :.:::::::::::.:::..:... ::: : :: :: .:: ::: .: :.::::::.:: CCDS74 HSGEKPYVCRECGKGFSQKSAVVRHQRTHLEEKTIVCSDCGLGFSDRSNLISHQRTHSGE 340 350 360 370 380 390 690 700 710 720 730 740 pF1KE2 KPYVCRECGRGFSWQSVLLTHQRTHTGEKPYVCRECGRGFSNKSHLLRHQRTHTGEKPYV :::.:.:::: : ...:..:::::. :::::: ::..::..: :. :.:::::::::: CCDS74 KPYACKECGRCFRQRTTLVNHQRTHSKEKPYVCGVCGHSFSQNSTLISHRRTHTGEKPYV 400 410 420 430 440 450 750 760 770 780 790 800 pF1KE2 CRECGRGFRDKSHLLRHQRTHTGEKPYVCRECGRGFRDKSNLLSHQRTHTGEKPYVCREC : ::::: :::: ::: :.:::: ::..::::: ..:::. :::::.::::.:: :: CCDS74 CGVCGRGFSLKSHLNRHQNIHSGEKPIVCKDCGRGFSQQSNLIRHQRTHSGEKPMVCGEC 460 470 480 490 500 510 810 820 830 840 850 860 pF1KE2 GRGFSNKSHLLRHQRTHTGEKPYVCRECGRGFRNKSHLLRHQRTHTGEKPYVCRECGRGF :::::.::.:. :::::.::.::::::::::: ... :.::.: :. ::::.::.:: :: CCDS74 GRGFSQKSNLVAHQRTHSGERPYVCRECGRGFSHQAGLIRHKRKHSREKPYMCRQCGLGF 520 530 540 550 560 570 870 880 890 pF1KE2 SDRSSLCYHQRTHTGEKPYVCREDE ...:.: :.:.:. ::: :::: CCDS74 GNKSALITHKRAHSEEKPCVCRECGQGFLQKSHLTLHQMTHTGEKPYVCKTCGRGFSLKS 580 590 600 610 620 630 >>CCDS63235.1 ZNF133 gene_id:7692|Hs108|chr20 (591 aa) initn: 1909 init1: 1909 opt: 2080 Z-score: 1405.3 bits: 270.6 E(32554): 5.9e-72 Smith-Waterman score: 2080; 55.7% identity (76.9% similar) in 519 aa overlap (374-892:5-519) 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 CRVIRPGCELLVWYGDEYGQELGIKWGSKWKKELMAGREPKPEIHPCPSCCLAFSSQKFL .: ..: .:.::.. : : .:::::: CCDS63 MCNGRKTVLA--DPEPELYLDPFCPPGFSSQKFP 10 20 30 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 SQHVERNHSSQNFPGPSARKLLQPENPCPGDQNQEQQYPDPHSRNDKTKGQEIKERSKLL ::: :: : :. .:: .: ::::...:: . . .:...: : : . : CCDS63 MQHVLCNHPPWIFTCLCAEGNIQPGDPGPGDQEKQQQASEGRPWSDQAEGPE-GEGAMPL 40 50 60 70 80 90 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 NKRTWQREISRAFSSPPKGQMGSCRVGKRIMEEESRTGQKVNPGNTGKLFVGVGISRIAK :: .: .. ::: ::. : : : : : .: :. .:. :: .: ::. . . .. 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