Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6754
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6754, 714 aa
1>>>pF1KE6754 714 - 714 aa - 714 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4804+/-0.000941; mu= 19.9710+/- 0.056
mean_var=82.6411+/-16.753, 0's: 0 Z-trim(106.3): 35 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.141084
statistics sampled from 8855 (8883) to 8855 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.639), E-opt: 0.2 (0.273), width: 16
Scan time: 2.650
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43143.1 SLC12A8 gene_id:84561|Hs108|chr3 ( 714) 4735 974.0 0
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CCDS4144.1 SLC12A2 gene_id:6558|Hs108|chr5 (1212) 681 149.1 3.8e-35
CCDS10129.2 SLC12A1 gene_id:6557|Hs108|chr15 (1099) 419 95.7 4e-19
CCDS59069.1 SLC12A9 gene_id:56996|Hs108|chr7 ( 538) 415 94.6 4e-19
CCDS59068.1 SLC12A9 gene_id:56996|Hs108|chr7 ( 631) 415 94.7 4.6e-19
CCDS53940.1 SLC12A1 gene_id:6557|Hs108|chr15 (1099) 417 95.3 5.3e-19
CCDS5707.1 SLC12A9 gene_id:56996|Hs108|chr7 ( 914) 415 94.8 6.1e-19
CCDS58464.1 SLC12A3 gene_id:6559|Hs108|chr16 (1021) 401 92.0 4.8e-18
CCDS45491.1 SLC12A3 gene_id:6559|Hs108|chr16 (1029) 401 92.0 4.8e-18
CCDS10770.1 SLC12A3 gene_id:6559|Hs108|chr16 (1030) 401 92.0 4.8e-18
CCDS34129.1 SLC12A7 gene_id:10723|Hs108|chr5 (1083) 282 67.8 9.8e-11
CCDS13391.1 SLC12A5 gene_id:57468|Hs108|chr20 (1116) 282 67.8 1e-10
>>CCDS43143.1 SLC12A8 gene_id:84561|Hs108|chr3 (714 aa)
initn: 4735 init1: 4735 opt: 4735 Z-score: 5207.2 bits: 974.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4735; 99.7% identity (100.0% similar) in 714 aa overlap (1-714:1-714)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MTQMSQVQELFHEAAQQDALAQPQPWWKTQLFMWEPVLFGTWDGVFTSCMINIFGVVLFL
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CCDS43 MTQMSQVQELFHEAAQQDALAQPQPWWKTQLFMWEPVLFGTWDGVFTSCMINIFGVVLFL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RTGWLVGNTGVLLGMFLVSFVILVALVTVLSGIGVGERSSIGSGGVYSMISSVLGGQTGG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TIGLLYVFGQCVAGAMYITGFAESISDLLGLGNIWAVRGISVAVLLALLGINLAGVKWII
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190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RLQLLLLFLLAVSTLDFVVGSFTHLDPEHGFIGYSPELLQNNTLPDYSPGESFFTVFGVF
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CCDS43 FPAATGVMAGFNMGGDLREPAASIPLGSLAAVGISWFLYIIFVFLLGAICTREALRYDFL
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310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IAEKVSLMGFLFLLGLYISSLASCMGGLYGAPRILQCIAQEKVIPALACLGQGKGPNKTP
310 320 330 340 350 360
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CCDS43 VAAICLTSLVTMAFVFVGQVNVLAPIVTINFMLTYVAVDYSYFSLSMCSCSLTPVPEPVL
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430 440 450 460 470 480
pF1KE6 REGAEGLHCSEHLLLEKAPSYGSEGPAQRVLEGTLLEFTKDMDQLLQLTRKLESSQPRQG
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CCDS43 REGAEGLHCSEHLLLEKAPSYGSEGPAQRVLEGTLLEFTKDMDQLLQLTRKLESSQPRQG
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pF1KE6 EGNRTPESQKRKSKKATKQTLQDSFLLDLKSPPSFPVEISDRLPAASWEGQESCWNKQTS
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CCDS43 EGNRTPESQKRKSKKATKQTLQDSFLLDLKSPPSFPVEISDRLPAASWEGQESCWNKQTS
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pF1KE6 KSEGTQPEGTYGEQLVPELCNQSESSGEDFFLKSRLQEQDVWRRSTSFYTHMCNPWVSLL
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CCDS43 KSEGTQPEGTYGEQLVPELCNQSESSGEDFFLKSRLQEQDVWRRSTSFYTHMCNPWVSLL
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610 620 630 640 650 660
pF1KE6 GAVGSLLIMFVIQWVYTLVNMGVAAIVYFYIGRASPGLHLGSASNFSFFRWMRSLLLPSC
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CCDS43 GAVGSLLIMFVIQWVYTLVNMGVAAIVYFYIGRASPGLHLGSASNFSFFRWMRSLLLPSC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KE6 RSLQSPQEQIILAPSLAKVDMEMTQLTQENADFATRDRYHHSSLVNREQLMPHY
:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RSLRSPQEQIILAPSLAKVDMEMTQLTQENADFATRDRYHHSSLVNREQLMPHY
670 680 690 700 710
>>CCDS58965.1 SLC12A2 gene_id:6558|Hs108|chr5 (1196 aa)
initn: 842 init1: 319 opt: 681 Z-score: 744.6 bits: 149.1 E(32554): 3.8e-35
Smith-Waterman score: 846; 33.3% identity (67.4% similar) in 430 aa overlap (37-421:283-709)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 VQELFHEAAQQDALAQPQPWWKTQLFMWEPVLFGTWDGVFTSCMINIFGVVLFLRTGWLV
: :: ::.. ::.::.::.::.: .:.:
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70 80 90 100 110 120
pF1KE6 GNTGVLLGMFLVSFVILVALVTVLSGIGVGERSSIGSGGVYSMISSVLGGQTGGTIGLLY
:..:. :..... .. .:. .: :: ... . . .::.: .:: :: . ::.:::..
CCDS58 GQAGIGLSVLVIMMATVVTTITGLSTSAIATNGFVRGGGAYYLISRSLGPEFGGAIGLIF
320 330 340 350 360 370
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VFGQCVAGAMYITGFAESISDLLG------LGNIWAVRGISVAVLLALLGINLAGVKWII
.:.. :: :::..::::.. .:: . .: .: :.. ... ::::..::..:
CCDS58 AFANAVAVAMYVVGFAETVVELLKEHSILMIDEINDIRIIGAITVVILLGISVAGMEWEA
380 390 400 410 420 430
190 200 210 220 230
pF1KE6 RLQLLLLFLLAVSTLDFVVGSFTHLDPEH--GFIGYSPELLQNNTLPDYSPGESFFTVFG
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CCDS58 KAQIVLLVILLLAIGDFVIGTFIPLESKKPKGFFGYKSEIFNENFGPDFREEETFFSVFA
440 450 460 470 480 490
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 VFFPAATGVMAGFNMGGDLREPAASIPLGSLAAVGISWFLYIVFVFLLGAICTREA----
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CCDS58 IFFPAATGILAGANISGDLADPQSAIPKGTLLAILITTLVYVGIAVSVGSCVVRDATGNV
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300 310 320
pF1KE6 -----------------LRYDFLIAEK----VSLM----------GFLFLL--GLYISSL
: .:: :. .:: :: :. :.. ..:
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330 340 350 360 370 380
pF1KE6 ASCMGGLYGAPRILQCIAQEKVIPALACLGQGKGPNKTPVAAICLTSLVTMAFVFVGQVN
.: ...: .::.:.: . .... ::. ...: : :. :. . :: :....:......:
CCDS58 SSALASLVSAPKIFQALCKDNIYPAFQMFAKGYGKNNEPLRGYILTFLIALGFILIAELN
620 630 640 650 660 670
390 400 410 420 430 440
pF1KE6 VLAPIVTINFMLTYVAVDYSYFSLSMCSCSLTPVPEPVLREGAEGLHCSEHLLLEKAPSY
:.:::.. :. .:. ...: : :. . .: .:...
CCDS58 VIAPIISNFFLASYALINFSVFHASLAK---SPGWRPAFKYYNMWISLLGAILCCIVMFV
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450 460 470 480 490 500
pF1KE6 GSEGPAQRVLEGTLLEFTKDMDQLLQLTRKLESSQPRQGEGNRTPESQKRKSKKATKQTL
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>>CCDS4144.1 SLC12A2 gene_id:6558|Hs108|chr5 (1212 aa)
initn: 842 init1: 319 opt: 681 Z-score: 744.5 bits: 149.1 E(32554): 3.8e-35
Smith-Waterman score: 846; 33.3% identity (67.4% similar) in 430 aa overlap (37-421:283-709)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 VQELFHEAAQQDALAQPQPWWKTQLFMWEPVLFGTWDGVFTSCMINIFGVVLFLRTGWLV
: :: ::.. ::.::.::.::.: .:.:
CCDS41 EPFEDGFANGEESTPTRDAVVTYTAESKGVVKFGWIKGVLVRCMLNIWGVMLFIRLSWIV
260 270 280 290 300 310
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 GNTGVLLGMFLVSFVILVALVTVLSGIGVGERSSIGSGGVYSMISSVLGGQTGGTIGLLY
:..:. :..... .. .:. .: :: ... . . .::.: .:: :: . ::.:::..
CCDS41 GQAGIGLSVLVIMMATVVTTITGLSTSAIATNGFVRGGGAYYLISRSLGPEFGGAIGLIF
320 330 340 350 360 370
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VFGQCVAGAMYITGFAESISDLLG------LGNIWAVRGISVAVLLALLGINLAGVKWII
.:.. :: :::..::::.. .:: . .: .: :.. ... ::::..::..:
CCDS41 AFANAVAVAMYVVGFAETVVELLKEHSILMIDEINDIRIIGAITVVILLGISVAGMEWEA
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190 200 210 220 230
pF1KE6 RLQLLLLFLLAVSTLDFVVGSFTHLDPEH--GFIGYSPELLQNNTLPDYSPGESFFTVFG
. :..:: .: .. :::.:.: :. .. ::.::. :....: ::. :.::.::.
CCDS41 KAQIVLLVILLLAIGDFVIGTFIPLESKKPKGFFGYKSEIFNENFGPDFREEETFFSVFA
440 450 460 470 480 490
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 VFFPAATGVMAGFNMGGDLREPAASIPLGSLAAVGISWFLYIVFVFLLGAICTREA----
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CCDS41 IFFPAATGILAGANISGDLADPQSAIPKGTLLAILITTLVYVGIAVSVGSCVVRDATGNV
500 510 520 530 540 550
300 310 320
pF1KE6 -----------------LRYDFLIAEK----VSLM----------GFLFLL--GLYISSL
: .:: :. .:: :: :. :.. ..:
CCDS41 NDTIVTELTNCTSAACKLNFDFSSCESSPCSYGLMNNFQVMSMVSGFTPLISAGIFSATL
560 570 580 590 600 610
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 ASCMGGLYGAPRILQCIAQEKVIPALACLGQGKGPNKTPVAAICLTSLVTMAFVFVGQVN
.: ...: .::.:.: . .... ::. ...: : :. :. . :: :....:......:
CCDS41 SSALASLVSAPKIFQALCKDNIYPAFQMFAKGYGKNNEPLRGYILTFLIALGFILIAELN
620 630 640 650 660 670
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pF1KE6 VLAPIVTINFMLTYVAVDYSYFSLSMCSCSLTPVPEPVLREGAEGLHCSEHLLLEKAPSY
:.:::.. :. .:. ...: : :. . .: .:...
CCDS41 VIAPIISNFFLASYALINFSVFHASLAK---SPGWRPAFKYYNMWISLLGAILCCIVMFV
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pF1KE6 GSEGPAQRVLEGTLLEFTKDMDQLLQLTRKLESSQPRQGEGNRTPESQKRKSKKATKQTL
CCDS41 INWWAALLTYVIVLGLYIYVTYKKPDVNWGSSTQALTYLNALQHSIRLSGVEDHVKNFRP
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>>CCDS10129.2 SLC12A1 gene_id:6557|Hs108|chr15 (1099 aa)
initn: 911 init1: 334 opt: 419 Z-score: 456.9 bits: 95.7 E(32554): 4e-19
Smith-Waterman score: 807; 32.9% identity (64.7% similar) in 416 aa overlap (37-406:175-590)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 VQELFHEAAQQDALAQPQPWWKTQLFMWEPVLFGTWDGVFTSCMINIFGVVLFLRTGWLV
: :: ::.. ::.::.::.::.: .:.:
CCDS10 TPSSADRVANGDGIPGDEQAENKEDDQAGVVKFGWVKGVLVRCMLNIWGVMLFIRLSWIV
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pF1KE6 GNTGVLLGMFLVSFVILVALVTVLSGIGVGERSSIGSGGVYSMISSVLGGQTGGTIGLLY
:..:. ::.... . .:. .: :: ... . . .::.: .:: :: . ::.:::..
CCDS10 GEAGIGLGVLIILLSTMVTSITGLSTSAIATNGFVRGGGAYYLISRSLGPEFGGSIGLIF
210 220 230 240 250 260
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pF1KE6 VFGQCVAGAMYITGFAESISDLLGLGNIWAV------RGISVAVLLALLGINLAGVKWII
.:.. :: :::..::::.. ::: .. : : :. ... ::::..::..:
CCDS10 AFANAVAVAMYVVGFAETVVDLLKESDSMMVDPTNDIRIIGSITVVILLGISVAGMEWEA
270 280 290 300 310 320
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pF1KE6 RLQLLLLFLLAVSTLDFVVGSFTHLDPEH---GFIGYSPELLQNNTLPDYSPGESFFTVF
. :..:: .: .. .: .:. . :. ::..:. .. .: : .. ::.::.::
CCDS10 KAQVILLVILLIAIANFFIGTVIPSNNEKKSRGFFNYQASIFAENFGPRFTKGEGFFSVF
330 340 350 360 370 380
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pF1KE6 GVFFPAATGVMAGFNMGGDLREPAASIPLGSLAAVGISWFLYIVFVFLLGAICTREA---
..:::::::..:: :..:::..: .:: :.. :. :. :. .. .:: .:.:
CCDS10 AIFFPAATGILAGANISGDLEDPQDAIPRGTMLAIFITTVAYLGVAICVGACVVRDATGN
390 400 410 420 430 440
300 310 320
pF1KE6 ------------------LRYDF----------------LIAEKVSLMGFLFLLGLYISS
: ::: . :: .: :. :.. ..
CCDS10 MNDTIISGMNCNGSAACGLGYDFSRCRHEPCQYGLMNNFQVMSMVSGFGPLITAGIFSAT
450 460 470 480 490 500
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pF1KE6 LASCMGGLYGAPRILQCIAQEKVIPALACLGQGKGPNKTPVAAICLTSLVTMAFVFVGQV
:.: ...: .::...: . .... :: ...: : :. :. . :: :..:::......
CCDS10 LSSALASLVSAPKVFQALCKDNIYKALQFFAKGYGKNNEPLRGYILTFLIAMAFILIAEL
510 520 530 540 550 560
390 400 410 420 430 440
pF1KE6 NVLAPIVTINFMLTYVAVDYSYFSLSMCSCSLTPVPEPVLREGAEGLHCSEHLLLEKAPS
:..:::.. :. .:. ...: : :
CCDS10 NTIAPIISNFFLASYALINFSCFHASYAKSPGWRPAYGIYNMWVSLFGAVLCCAVMFVIN
570 580 590 600 610 620
>>CCDS59069.1 SLC12A9 gene_id:56996|Hs108|chr7 (538 aa)
initn: 420 init1: 384 opt: 415 Z-score: 456.8 bits: 94.6 E(32554): 4e-19
Smith-Waterman score: 428; 29.4% identity (59.6% similar) in 344 aa overlap (92-409:18-354)
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 TGWLVGNTGVLLGMFLVSFVILVALVTVLSGIGVGERSSIGSGGVYSMISSVLGGQTGGT
:... .. : ::. . :.. : . :
CCDS59 MASESSPLLAYRLLGEEGVALPANGAGGPGGASARKLSTFLGVVVPT
10 20 30 40
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 IGLLYVFGQCVAGAMYITGFAESISDLLGLGNIWAVRGISVAVLLALLG-INLAGVKWII
. : .:. : . :: : .: : : . . ..::.:.: . :.
CCDS59 V--LSMFSIVVFLRIDATG--PSGLRVLPQGYGWNL--LYGSLLLGLVGGVCTLGAGLYA
50 60 70 80 90 100
190 200 210 220
pF1KE6 RLQLLLLFLLAVSTLDFVVGSF------------------THLDPEHG-FIGYSPELLQN
: ..: :::. ..: :. :: . : :. : : :.. :..
CCDS59 RASFLT-FLLVSGSLASVLISFVAVGPRDIRLTPRPGPNGSSLPPRFGHFTGFNSSTLKD
110 120 130 140 150 160
230 240 250 260 270
pF1KE6 NT----LPDYSPGE--SFFTVFGVFFPAATGVMAGFNMGGDLREPAASIPLGSLAAVGIS
: ::. : .: .::.:.: . ::.::: ::.:.:..:. .::::...::. .
CCDS59 NLGAGYAEDYTTGAVMNFASVFAVLFNGCTGIMAGANMSGELKDPSRAIPLGTIVAVAYT
170 180 190 200 210 220
280 290 300 310 320 330
pF1KE6 WFLYIVFVFLLGAICTREALRYDFLIAEKVSLMGFLFLLGLYISSLASCMGGLYGAPRIL
.:.:... :: . : : :. :. . . .:: : :.:.: ..:.. :..: :: :::
CCDS59 FFVYVLLFFLSSFTCDRTLLQEDYGFFRAISLWPPLVLIGIYATALSASMSSLIGASRIL
230 240 250 260 270 280
340 350 360 370 380 390
pF1KE6 QCIAQEKVIPALACLGQGKGPNKTPVAAICLTSLVTMAFVFVGQVNVLAPIVTINFMLTY
. .:.. .. .. .. . . .: ::. . ... ...:..:.:: .::. ....:
CCDS59 HALARDDLFGVILAPAKVVSRGGNPWAAVLYSWGLVQLVLLAGKLNTLAAVVTVFYLVAY
290 300 310 320 330 340
400 410 420 430 440 450
pF1KE6 VAVDYSYFSLSMCSCSLTPVPEPVLREGAEGLHCSEHLLLEKAPSYGSEGPAQRVLEGTL
.::: : .:: :
CCDS59 AAVDLSCLSLEWASAPNFRPTFSLFSWHTCLLGVASCLLMMFLISPGAAGGSLLLMGLLA
350 360 370 380 390 400
>>CCDS59068.1 SLC12A9 gene_id:56996|Hs108|chr7 (631 aa)
initn: 647 init1: 384 opt: 415 Z-score: 455.8 bits: 94.7 E(32554): 4.6e-19
Smith-Waterman score: 632; 31.4% identity (65.0% similar) in 411 aa overlap (39-409:37-443)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 ELFHEAAQQDALAQPQPWWKTQLFMWEPVLFGTWDGVFTSCMINIFGVVLFLRTGWLVGN
..:. :: . ....:..:.::: :..::.
CCDS59 PLLAYRLLGEEGVALPANGAGGPGGASARKLSTFLGVVVPTVLSMFSIVVFLRIGFVVGH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 TGVL--LGMFLVSFVILVALVTVLSGIGVGERSSIGSGGVYSMISSVLGGQTGGTIGLLY
.:.: :.:.::.. ::. .:::: ... ... .::.: ::: .:: ..::.:::..
CCDS59 AGLLQALAMLLVAYFILA--LTVLSVCAIATNGAVQGGGAYFMISRTLGPEVGGSIGLMF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE6 VFGQCVAGAMYITGFAESISDLLGLGNIWAVRGISV------------AVLLALLG-INL
... . :. . :..::. :..: .. . :. : ..::.:.: .
CCDS59 YLANVCGCAVSLLGLVESVLDVFG-ADATGPSGLRVLPQGYGWNLLYGSLLLGLVGGVCT
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210
pF1KE6 AGVKWIIRLQLLLLFLLAVSTLDFVVGSF------------------THLDPEHG-FIGY
:. : ..: :::. ..: :. :: . : :. : : :.
CCDS59 LGAGLYARASFLT-FLLVSGSLASVLISFVAVGPRDIRLTPRPGPNGSSLPPRFGHFTGF
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260
pF1KE6 SPELLQNNT----LPDYSPGE--SFFTVFGVFFPAATGVMAGFNMGGDLREPAASIPLGS
. :..: ::. : .: .::.:.: . ::.::: ::.:.:..:. .::::.
CCDS59 NSSTLKDNLGAGYAEDYTTGAVMNFASVFAVLFNGCTGIMAGANMSGELKDPSRAIPLGT
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 LAAVGISWFLYIVFVFLLGAICTREALRYDFLIAEKVSLMGFLFLLGLYISSLASCMGGL
..::. ..:.:... :: . : : :. :. . . .:: : :.:.: ..:.. :..:
CCDS59 IVAVAYTFFVYVLLFFLSSFTCDRTLLQEDYGFFRAISLWPPLVLIGIYATALSASMSSL
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 YGAPRILQCIAQEKVIPALACLGQGKGPNKTPVAAICLTSLVTMAFVFVGQVNVLAPIVT
:: :::. .:.. .. .. .. . . .: ::. . ... ...:..:.:: .::
CCDS59 IGASRILHALARDDLFGVILAPAKVVSRGGNPWAAVLYSWGLVQLVLLAGKLNTLAAVVT
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KE6 INFMLTYVAVDYSYFSLSMCSCSLTPVPEPVLREGAEGLHCSEHLLLEKAPSYGSEGPAQ
. ....:.::: : .:: :
CCDS59 VFYLVAYAAVDLSCLSLEWASAPNFRPTFSLFSWHTCLLGVASCLLMMFLISPGAAGGSL
430 440 450 460 470 480
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Smith-Waterman score: 805; 32.7% identity (64.9% similar) in 416 aa overlap (37-406:175-590)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 VQELFHEAAQQDALAQPQPWWKTQLFMWEPVLFGTWDGVFTSCMINIFGVVLFLRTGWLV
: :: ::.. ::.::.::.::.: .:.:
CCDS53 TPSSADRVANGDGIPGDEQAENKEDDQAGVVKFGWVKGVLVRCMLNIWGVMLFIRLSWIV
150 160 170 180 190 200
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pF1KE6 GNTGVLLGMFLVSFVILVALVTVLSGIGVGERSSIGSGGVYSMISSVLGGQTGGTIGLLY
:..:. ::...... ..:. .: .: .. . . .::.: .:: :: . ::.:::..
CCDS53 GEAGIGLGVIIIGLSVVVTTLTGISMSAICTNGVVRGGGAYYLISRSLGPEFGGSIGLIF
210 220 230 240 250 260
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 VFGQCVAGAMYITGFAESISDLLGLGNIWAV------RGISVAVLLALLGINLAGVKWII
.:.. :: :::..::::.. ::: .. : : :. ... ::::..::..:
CCDS53 AFANAVAVAMYVVGFAETVVDLLKESDSMMVDPTNDIRIIGSITVVILLGISVAGMEWEA
270 280 290 300 310 320
190 200 210 220 230
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. :..:: .: .. .: .:. . :. ::..:. .. .: : .. ::.::.::
CCDS53 KAQVILLVILLIAIANFFIGTVIPSNNEKKSRGFFNYQASIFAENFGPRFTKGEGFFSVF
330 340 350 360 370 380
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pF1KE6 GVFFPAATGVMAGFNMGGDLREPAASIPLGSLAAVGISWFLYIVFVFLLGAICTREA---
..:::::::..:: :..:::..: .:: :.. :. :. :. .. .:: .:.:
CCDS53 AIFFPAATGILAGANISGDLEDPQDAIPRGTMLAIFITTVAYLGVAICVGACVVRDATGN
390 400 410 420 430 440
300 310 320
pF1KE6 ------------------LRYDF----------------LIAEKVSLMGFLFLLGLYISS
: ::: . :: .: :. :.. ..
CCDS53 MNDTIISGMNCNGSAACGLGYDFSRCRHEPCQYGLMNNFQVMSMVSGFGPLITAGIFSAT
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pF1KE6 LASCMGGLYGAPRILQCIAQEKVIPALACLGQGKGPNKTPVAAICLTSLVTMAFVFVGQV
:.: ...: .::...: . .... :: ...: : :. :. . :: :..:::......
CCDS53 LSSALASLVSAPKVFQALCKDNIYKALQFFAKGYGKNNEPLRGYILTFLIAMAFILIAEL
510 520 530 540 550 560
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:..:::.. :. .:. ...: : :
CCDS53 NTIAPIISNFFLASYALINFSCFHASYAKSPGWRPAYGIYNMWVSLFGAVLCCAVMFVIN
570 580 590 600 610 620
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Smith-Waterman score: 632; 31.4% identity (65.0% similar) in 411 aa overlap (39-409:37-443)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 ELFHEAAQQDALAQPQPWWKTQLFMWEPVLFGTWDGVFTSCMINIFGVVLFLRTGWLVGN
..:. :: . ....:..:.::: :..::.
CCDS57 PLLAYRLLGEEGVALPANGAGGPGGASARKLSTFLGVVVPTVLSMFSIVVFLRIGFVVGH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 TGVL--LGMFLVSFVILVALVTVLSGIGVGERSSIGSGGVYSMISSVLGGQTGGTIGLLY
.:.: :.:.::.. ::. .:::: ... ... .::.: ::: .:: ..::.:::..
CCDS57 AGLLQALAMLLVAYFILA--LTVLSVCAIATNGAVQGGGAYFMISRTLGPEVGGSIGLMF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE6 VFGQCVAGAMYITGFAESISDLLGLGNIWAVRGISV------------AVLLALLG-INL
... . :. . :..::. :..: .. . :. : ..::.:.: .
CCDS57 YLANVCGCAVSLLGLVESVLDVFG-ADATGPSGLRVLPQGYGWNLLYGSLLLGLVGGVCT
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210
pF1KE6 AGVKWIIRLQLLLLFLLAVSTLDFVVGSF------------------THLDPEHG-FIGY
:. : ..: :::. ..: :. :: . : :. : : :.
CCDS57 LGAGLYARASFLT-FLLVSGSLASVLISFVAVGPRDIRLTPRPGPNGSSLPPRFGHFTGF
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260
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. :..: ::. : .: .::.:.: . ::.::: ::.:.:..:. .::::.
CCDS57 NSSTLKDNLGAGYAEDYTTGAVMNFASVFAVLFNGCTGIMAGANMSGELKDPSRAIPLGT
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KE6 LAAVGISWFLYIVFVFLLGAICTREALRYDFLIAEKVSLMGFLFLLGLYISSLASCMGGL
..::. ..:.:... :: . : : :. :. . . .:: : :.:.: ..:.. :..:
CCDS57 IVAVAYTFFVYVLLFFLSSFTCDRTLLQEDYGFFRAISLWPPLVLIGIYATALSASMSSL
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KE6 YGAPRILQCIAQEKVIPALACLGQGKGPNKTPVAAICLTSLVTMAFVFVGQVNVLAPIVT
:: :::. .:.. .. .. .. . . .: ::. . ... ...:..:.:: .::
CCDS57 IGASRILHALARDDLFGVILAPAKVVSRGGNPWAAVLYSWGLVQLVLLAGKLNTLAAVVT
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KE6 INFMLTYVAVDYSYFSLSMCSCSLTPVPEPVLREGAEGLHCSEHLLLEKAPSYGSEGPAQ
. ....:.::: : .:: :
CCDS57 VFYLVAYAAVDLSCLSLEWASAPNFRPTFSLFSWHTCLLGVASCLLMMFLISPGAAGGSL
430 440 450 460 470 480
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10 20 30 40 50 60
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::: :: ::. ::.::.::.:.:: :
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.....:..: ... . . :. .: :: ... ... :::.: .:: :: . ::.:::
CCDS58 ITAQAGIVLTWIIILLSVTVTSITGLSISAISTNGKVKSGGTYFLISRSLGPELGGSIGL
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pF1KE6 LYVFGQCVAGAMYITGFAESISDLLG------LGNIWAVRGISVAVLLALLGINLAGVKW
...:.. :. ::. .::::.. ::: . : .: :.:. . .::.:.:::..:
CCDS58 IFAFANAVGVAMHTVGFAETVRDLLQEYGAPIVDPINDIRIIAVVSVTVLLAISLAGMEW
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pF1KE6 IIRLQLLLLFLLAVSTLDFVVGSF---THLDPEHGFIGYSPELLQNNTLPDY-SPGESFF
. :.:..... :: ...::.. .. .::..: ... .: .::. .: .::
CCDS58 ESKAQVLFFLVIMVSFANYLVGTLIPPSEDKASKGFFSYRADIFVQNLVPDWRGPDGTFF
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.:..:::.:::..:: :..:::..:: .:: :.: :. . . :... .:. .:.:
CCDS58 GMFSIFFPSATGILAGANISGDLKDPAIAIPKGTLMAIFWTTISYLAISATIGSCVVRDA
350 360 370 380 390 400
300 310
pF1KE6 ---------------------LRYDF------------LIA--EKVSLM-GF--LFLLGL
..: :: . .:.. :: :. :.
CCDS58 SGVLNDTVTPGWGACEGLACSYGWNFTECTQQHSCHYGLINYYQTMSMVSGFAPLITAGI
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. ..:.: .. : .: ...::. .... : .. .:.: : :: :: . :. ...::..
CCDS58 FGATLSSALACLVSAAKVFQCLCEDQLYPLIGFFGKGYGKNKEPVRGYLLAYAIAVAFII
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....:..:::.. :. .:. ...: : :.
CCDS58 IAELNTIAPIISNFFLCSYALINFSCFHASITNSPGWRPSFQYYNKWAALFGAIISVVIM
530 540 550 560 570 580
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CCDS58 FLLTWWAALIAIGVVLFLLLYVIYKKPEVNWGSSVQAGSYNLALSYSVGLNEVEDHIKNY
590 600 610 620 630 640
>>CCDS45491.1 SLC12A3 gene_id:6559|Hs108|chr16 (1029 aa)
initn: 912 init1: 320 opt: 401 Z-score: 437.5 bits: 92.0 E(32554): 4.8e-18
Smith-Waterman score: 755; 31.1% identity (65.6% similar) in 421 aa overlap (35-407:131-551)
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pF1KE6 SQVQELFHEAAQQDALAQPQPWWKTQLFMWEPVLFGTWDGVFTSCMINIFGVVLFLRTGW
::: :: ::. ::.::.::.:.:: :
CCDS45 ALAFDSRPSHEMTDGLVEGEAGTSSEKNPEEPVRFGWVKGVMIRCMLNIWGVILYLRLPW
110 120 130 140 150 160
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pF1KE6 LVGNTGVLLGMFLVSFVILVALVTVLSGIGVGERSSIGSGGVYSMISSVLGGQTGGTIGL
.....:..: ... . . :. .: :: ... ... :::.: .:: :: . ::.:::
CCDS45 ITAQAGIVLTWIIILLSVTVTSITGLSISAISTNGKVKSGGTYFLISRSLGPELGGSIGL
170 180 190 200 210 220
130 140 150 160 170
pF1KE6 LYVFGQCVAGAMYITGFAESISDLLG------LGNIWAVRGISVAVLLALLGINLAGVKW
...:.. :. ::. .::::.. ::: . : .: :.:. . .::.:.:::..:
CCDS45 IFAFANAVGVAMHTVGFAETVRDLLQEYGAPIVDPINDIRIIAVVSVTVLLAISLAGMEW
230 240 250 260 270 280
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 IIRLQLLLLFLLAVSTLDFVVGSF---THLDPEHGFIGYSPELLQNNTLPDY-SPGESFF
. :.:..... :: ...::.. .. .::..: ... .: .::. .: .::
CCDS45 ESKAQVLFFLVIMVSFANYLVGTLIPPSEDKASKGFFSYRADIFVQNLVPDWRGPDGTFF
290 300 310 320 330 340
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pF1KE6 TVFGVFFPAATGVMAGFNMGGDLREPAASIPLGSLAAVGISWFLYIVFVFLLGAICTREA
.:..:::.:::..:: :..:::..:: .:: :.: :. . . :... .:. .:.:
CCDS45 GMFSIFFPSATGILAGANISGDLKDPAIAIPKGTLMAIFWTTISYLAISATIGSCVVRDA
350 360 370 380 390 400
300 310
pF1KE6 ---------------------LRYDF------------LIA--EKVSLM-GF--LFLLGL
..: :: . .:.. :: :. :.
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. ..:.: .. : .: ...::. .... : .. .:.: : :: :: . :. ...::..
CCDS45 FGATLSSALACLVSAAKVFQCLCEDQLYPLIGFFGKGYGKNKEPVRGYLLAYAIAVAFII
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pF1KE6 VGQVNVLAPIVTINFMLTYVAVDYSYFSLSMCSCSLTPVPEPVLREGAEGLHCSEHLLLE
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CCDS45 IAELNTIAPIISNFFLCSYALINFSCFHASITNSPGWRPSFQYYNKWAALFGAIISVVIM
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CCDS45 FLLTWWAALIAIGVVLFLLLYVIYKKPEVNWGSSVQAGSYNLALSYSVGLNEVEDHIKNY
590 600 610 620 630 640
714 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 16:03:13 2016 done: Tue Nov 8 16:03:13 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]