FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB8967, 356 aa 1>>>pF1KB8967 356 - 356 aa - 356 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4363+/-0.000998; mu= 15.0847+/- 0.059 mean_var=91.6965+/-24.611, 0's: 0 Z-trim(104.6): 180 B-trim: 1008 in 2/46 Lambda= 0.133936 statistics sampled from 7748 (7977) to 7748 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.612), E-opt: 0.2 (0.245), width: 16 Scan time: 2.480 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS46814.1 CCRL2 gene_id:9034|Hs108|chr3 ( 356) 2372 469.1 2.6e-132 CCDS43079.1 CCRL2 gene_id:9034|Hs108|chr3 ( 344) 2297 454.6 5.8e-128 CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 870 178.8 6e-45 CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 861 177.1 2e-44 CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 849 174.8 1e-43 CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 849 174.8 1e-43 CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 360) 837 172.5 5.1e-43 CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 374) 830 171.1 1.3e-42 CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 692 144.4 1.4e-34 CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 635 133.4 2.8e-31 CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 387) 580 122.8 4.7e-28 CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 355) 577 122.2 6.6e-28 CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3 ( 384) 558 118.6 9e-27 CCDS2735.1 CXCR6 gene_id:10663|Hs108|chr3 ( 342) 476 102.7 4.9e-22 CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 352) 458 99.2 5.5e-21 CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 356) 453 98.3 1.1e-20 CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 453 98.3 1.1e-20 CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 453 98.3 1.1e-20 CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 449 97.5 1.9e-20 CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 449 97.5 1.9e-20 CCDS3075.1 ACKR4 gene_id:51554|Hs108|chr3 ( 350) 446 96.9 2.7e-20 CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 433 94.4 1.6e-19 CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 422 92.3 6.8e-19 CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 416 91.1 1.6e-18 CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 368) 405 89.0 6.9e-18 CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 415) 405 89.0 7.5e-18 CCDS8927.1 GPR182 gene_id:11318|Hs108|chr12 ( 404) 380 84.2 2.1e-16 CCDS2736.1 XCR1 gene_id:2829|Hs108|chr3 ( 333) 359 80.1 3e-15 CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 345 77.4 2.1e-14 CCDS1405.1 GPR25 gene_id:2848|Hs108|chr1 ( 361) 342 76.8 3.1e-14 CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 334 75.3 9.7e-14 CCDS11435.1 CCR10 gene_id:2826|Hs108|chr17 ( 362) 329 74.3 1.8e-13 CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 329 74.3 1.8e-13 CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 327 73.9 2.3e-13 CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 327 73.9 2.5e-13 CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 327 74.0 2.5e-13 CCDS6151.1 NPBWR1 gene_id:2831|Hs108|chr8 ( 328) 322 72.9 4.3e-13 CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 319 72.4 7.2e-13 CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 319 72.4 7.3e-13 CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 319 72.4 7.3e-13 CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 319 72.4 7.4e-13 CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 319 72.4 7.4e-13 CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 319 72.4 7.5e-13 CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 319 72.4 7.6e-13 CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 319 72.4 7.6e-13 CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 319 72.5 8e-13 CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 319 72.5 8.6e-13 CCDS5322.1 GPER1 gene_id:2852|Hs108|chr7 ( 375) 315 71.6 1.2e-12 CCDS55068.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 319) 311 70.8 1.8e-12 CCDS9482.1 OXGR1 gene_id:27199|Hs108|chr13 ( 337) 311 70.8 1.9e-12 >>CCDS46814.1 CCRL2 gene_id:9034|Hs108|chr3 (356 aa) initn: 2372 init1: 2372 opt: 2372 Z-score: 2488.9 bits: 469.1 E(32554): 2.6e-132 Smith-Waterman score: 2372; 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CCDS27 MDYQVSSPIYDINYYTSEPCQKINVKQIAARLLPPLYSLVFIFGFV 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 DNLLVVLILVKYKGLKRVENIYLLNLAVSNLCFLLTLPFWAHAG------GDPMCKILIG :.::.:::.. : :: . .:::::::.:.: ::::.::::: . :. ::..: : CCDS27 GNMLVILILINCKRLKSMTDIYLLNLAISDLFFLLTVPFWAHYAAAQWDFGNTMCQLLTG 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KB8 LYFVGLYSETFFNCLLTVQRYLVFLHKGNFFSARRRVPCGIITSVLAWVTAILATLPEYV :::.:..: :: :::..:::. .: . : : : :..:::..::.:..:.:: . CCDS27 LYFIGFFSGIFFIILLTIDRYLAVVH-AVFALKARTVTFGVVTSVITWVVAVFASLPGII 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 pF1KB8 VYKPQMEDQKYKCAFSRTPFLPADETFWKHFLTLKMNISVLVLPLFIFTFLYVQMRKTL- . : : .: :. :. :. .. :::.: :::. : :::::..... : . ::: CCDS27 FTRSQKEGLHYTCS-SHFPY--SQYQFWKNFQTLKIVILGLVLPLLVMVICYSGILKTLL 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 --RFREQRYSLFKLVFAIMVVFLLMWAPYNIAFFLSTFKEHFSLSDCKSSYNLDKSVHIT : ...:. .:.:.::.:..:.::::::...:.::.: :.:..:.:: ::.....: CCDS27 RCRNEKKRHRAVRLIFTIMIVYFLFWAPYNIVLLLNTFQEFFGLNNCSSSNRLDQAMQVT 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 KLIATTHCCINPLLYAFLDGTFSKYLCRCFHLRSNTPLQPRGQSAQGTSREEPDHSTEV . .. :::::::..:::. : .:: :. 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CCDS27 MTTSLDTVETFGTTSYYDDVGLLCEKADTRALMAQFVPPLYSLVFTVGLLGNV 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 LVVLILVKYKGLKRVENIYLLNLAVSNLCFLLTLPFWAHA--G-----GDPMCKILIGLY .::.::.::. :. . ::::::::.:.: ::.::::: : : : :::.: :.: CCDS27 VVVMILIKYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHNWVFGHGMCKLLSGFY 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB8 FVGLYSETFFNCLLTVQRYLVFLHKGNFFSAR-RRVPCGIITSVLAWVTAILATLPEYVV .::::: :: :::..:::...: :. : : : :.:::...: :.::.:::.. CCDS27 HTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHA--VFALRARTVTFGVITSIVTWGLAVLAALPEFIF 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KB8 YKPQMEDQKYKCAFSRTPFLPADETF-WKHFLTLKMNISVLVLPLFIFTFLYVQMRKTLR :. . .. : . . : : .. :.:: ::.:.: :::::..... :. . ::: CCDS27 YETEELFEETLC----SALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICYTGIIKTL- 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 pF1KB8 FR---EQRYSLFKLVFAIMVVFLLMWAPYNIAFFLSTFKEHFSLSDCKSSYNLDKSVHIT .: ...:. ..:.:.::.::...:.:::.:..::... . .::. : .:: . .: CCDS27 LRCPSKKKYKAIRLIFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFGNDCERSKHLDLVMLVT 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 KLIATTHCCINPLLYAFLDGTFSKYLCRCFHLRSNTPLQPRGQSAQGTSREEPDHSTEV ..:: .:::.::..:::. : ::: . :: CCDS27 EVIAYSHCCMNPVIYAFVGERFRKYLRHFFHRHLLMHLGRYIPFLPSEKLERTSSVSPST 290 300 310 320 330 340 CCDS27 AEPELSIVF 350 >>CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 (376 aa) initn: 815 init1: 283 opt: 849 Z-score: 898.2 bits: 174.8 E(32554): 1e-43 Smith-Waterman score: 849; 44.9% identity (73.4% similar) in 301 aa overlap (40-328:45-338) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 SLKMANYTLAPEDEYDVLIEGELESDEAEQCDKYDAQALSAQLVPSLCSAVFVIGVLDNL :.: :..:: ::.:: : : ::..:.: :. CCDS54 GSSRRSEMTTSLDTVETFGTTSYYDDVGLLCEKADTRALMAQFVPPLYSLVFTVGLLGNV 20 30 40 50 60 70 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 LVVLILVKYKGLKRVENIYLLNLAVSNLCFLLTLPFWAHA--G-----GDPMCKILIGLY .::.::.::. :. . ::::::::.:.: ::.::::: : : : :::.: :.: CCDS54 VVVMILIKYRRLRIMTNIYLLNLAISDLLFLVTLPFWIHYVRGHNWVFGHGMCKLLSGFY 80 90 100 110 120 130 130 140 150 160 170 180 pF1KB8 FVGLYSETFFNCLLTVQRYLVFLHKGNFFSAR-RRVPCGIITSVLAWVTAILATLPEYVV .::::: :: :::..:::...: :. : : : :.:::...: :.::.:::.. CCDS54 HTGLYSEIFFIILLTIDRYLAIVHA--VFALRARTVTFGVITSIVTWGLAVLAALPEFIF 140 150 160 170 180 190 190 200 210 220 230 240 pF1KB8 YKPQMEDQKYKCAFSRTPFLPADETF-WKHFLTLKMNISVLVLPLFIFTFLYVQMRKTLR :. . .. : . . : : .. :.:: ::.:.: :::::..... :. . ::: CCDS54 YETEELFEETLC----SALYPEDTVYSWRHFHTLRMTIFCLVLPLLVMAICYTGIIKTL- 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 FR---EQRYSLFKLVFAIMVVFLLMWAPYNIAFFLSTFKEHFSLSDCKSSYNLDKSVHIT .: ...:. ..:.:.::.::...:.:::.:..::... . .::. : .:: . .: CCDS54 LRCPSKKKYKAIRLIFVIMAVFFIFWTPYNVAILLSSYQSILFGNDCERSKHLDLVMLVT 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 KLIATTHCCINPLLYAFLDGTFSKYLCRCFHLRSNTPLQPRGQSAQGTSREEPDHSTEV ..:: .:::.::..:::. : ::: . :: CCDS54 EVIAYSHCCMNPVIYAFVGERFRKYLRHFFHRHLLMHLGRYIPFLPSEKLERTSSVSPST 310 320 330 340 350 360 CCDS54 AEPELSIVF 370 >>CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 (360 aa) initn: 628 init1: 303 opt: 837 Z-score: 885.9 bits: 172.5 E(32554): 5.1e-43 Smith-Waterman score: 837; 42.3% identity (72.8% similar) in 305 aa overlap (32-327:24-320) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 IYTRFLKGSLKMANYTLAPEDEYDVLIEGELESDEAEQCDKYDAQALSAQLVPSLCSAVF .. : . : :.:.. ..:::.: : : :: CCDS46 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYSLVF 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KB8 VIGVLDNLLVVLILVKYKGLKRVENIYLLNLAVSNLCFLLTLPFWAHAG------GDPMC ..: . :.::::::.. : :: . .:::::::.:.: ::.:::.:::.. :. :: CCDS46 IFGFVGNMLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSAANEWVFGNAMC 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 KILIGLYFVGLYSETFFNCLLTVQRYLVFLHKGNFFSARRRVPCGIITSVLAWVTAILAT :.. ::: .: .. :: :::..:::...: . : : : :..:::..:..:..:. CCDS46 KLFTGLYHIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVH-AVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAVFAS 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 LPEYVVYKPQMEDQKYKCAFSRTPFLPADETFWKHFLTLKMNISVLVLPLFIFTFLYVQM .: . : : ::. : :. :..: :..: :. :: :::::.:... : . CCDS46 VPGIIFTKCQKEDSVYVCG----PYFPRG---WNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGI 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 RKTL---RFREQRYSLFKLVFAIMVVFLLMWAPYNIAFFLSTFKEHFSLSDCKSSYNLDK ::: : ...:. ...:.::.:..:.:.::::...:.::.: :.::.:.:. .::. CCDS46 LKTLLRCRNEKKRHRAVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQ 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 SVHITKLIATTHCCINPLLYAFLDGTFSKYLCRCFHLRSNTPLQPRGQSAQGTSREEPDH ....:. .. :::::::..:::. : .:: : CCDS46 ATQVTETLGMTHCCINPIIYAFVGEKFRRYLSVFFRKHITKRFCKQCPVFYRETVDGVTS 290 300 310 320 330 340 pF1KB8 STEV CCDS46 TNTPSTGEQEVSAGL 350 360 >>CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 (374 aa) initn: 583 init1: 271 opt: 830 Z-score: 878.3 bits: 171.1 E(32554): 1.3e-42 Smith-Waterman score: 830; 39.5% identity (70.4% similar) in 334 aa overlap (32-356:24-345) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 IYTRFLKGSLKMANYTLAPEDEYDVLIEGELESDEAEQCDKYDAQALSAQLVPSLCSAVF .. : . : :.:.. ..:::.: : : :: CCDS43 MLSTSRSRFIRNTNESGEEVTTFFDYDYGAPCHKFDVKQIGAQLLPPLYSLVF 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KB8 VIGVLDNLLVVLILVKYKGLKRVENIYLLNLAVSNLCFLLTLPFWAHAG------GDPMC ..: . :.::::::.. : :: . .:::::::.:.: ::.:::.:::.. :. :: CCDS43 IFGFVGNMLVVLILINCKKLKCLTDIYLLNLAISDLLFLITLPLWAHSAANEWVFGNAMC 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB8 KILIGLYFVGLYSETFFNCLLTVQRYLVFLHKGNFFSARRRVPCGIITSVLAWVTAILAT :.. ::: .: .. :: :::..:::...: . : : : :..:::..:..:..:. CCDS43 KLFTGLYHIGYFGGIFFIILLTIDRYLAIVH-AVFALKARTVTFGVVTSVITWLVAVFAS 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB8 LPEYVVYKPQMEDQKYKCAFSRTPFLPADETFWKHFLTLKMNISVLVLPLFIFTFLYVQM .: . : : ::. : :. :..: :..: :. :: :::::.:... : . CCDS43 VPGIIFTKCQKEDSVYVCG----PYFPRG---WNNFHTIMRNILGLVLPLLIMVICYSGI 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB8 RKTL---RFREQRYSLFKLVFAIMVVFLLMWAPYNIAFFLSTFKEHFSLSDCKSSYNLDK ::: : ...:. ...:.::.:..:.:.::::...:.::.: :.::.:.:. .::. CCDS43 LKTLLRCRNEKKRHRAVRVIFTIMIVYFLFWTPYNIVILLNTFQEFFGLSNCESTSQLDQ 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 pF1KB8 SVHITKLIATTHCCINPLLYAFLDGTFSKYLCRCFHLRSNTPLQPRGQSAQGTSREEPDH ....:. .. :::::::..:::. : . ::. . . : . . : .: . CCDS43 ATQVTETLGMTHCCINPIIYAFVGEKFRSL----FHIALGCRIAPLQKPVCGGPGVRPGK 290 300 310 320 330 340 pF1KB8 STEV ...: CCDS43 NVKVTTQGLLDGRGKGKSIGRAPEASLQDKEGA 350 360 370 >>CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 (360 aa) initn: 586 init1: 236 opt: 692 Z-score: 734.4 bits: 144.4 E(32554): 1.4e-34 Smith-Waterman score: 694; 36.3% identity (64.6% similar) in 325 aa overlap (18-327:1-319) 10 20 30 40 50 pF1KB8 MIYTRFLKGSLKMANYTLAPEDEYDVLIEGELESDE------AEQCDKYDAQALSAQLVP . : : :. .. . :. . : : .:.. ..: CCDS26 MNPTDIADTTLDESIYSNYYLYESIPKPCTKEGIKAFGELFLP 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KB8 SLCSAVFVIGVLDNLLVVLILVKYKGLKRVENIYLLNLAVSNLCFLLTLPFWAHAGGDP- : : :::.:.: : .:::.: ::: :. . ..::::::.:.: :...::::.. ..: CCDS26 PLYSLVFVFGLLGNSVVVLVLFKYKRLRSMTDVYLLNLAISDLLFVFSLPFWGYYAADQW 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 pF1KB8 -----MCKILIGLYFVGLYSETFFNCLLTVQRYLVFLHKGNFFSAR-RRVPCGIITSVLA .::.. .:.::.:: :: :....:::...: :: : : . :.:::. . CCDS26 VFGLGLCKMISWMYLVGFYSGIFFVMLMSIDRYLAIVHA--VFSLRARTLTYGVITSLAT 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KB8 WVTAILATLPEYVVYKPQMEDQKYKCAFSRTPFLPADETFWKHFLTLKMNISVLVLPLFI : .:..:.:: .. : .. : .: . . : :: . .:..:: ::.:: : CCDS26 WSVAVFASLPGFLFSTCYTERNHTYC---KTKY-SLNSTTWKVLSSLEINILGLVIPLGI 170 180 190 200 210 230 240 250 260 270 280 pF1KB8 FTFLYVQMRKTLRF--REQRYSLFKLVFAIMVVFLLMWAPYNIAFFLSTFKEHFSLSDCK . : : .. .::. :.. . :..::..:.:: .:.::::..:: :. : :.:: CCDS26 MLFCYSMIIRTLQHCKNEKKNKAVKMIFAVVVLFLGFWTPYNIVLFLETLVELEVLQDCT 220 230 240 250 260 270 290 300 310 320 330 340 pF1KB8 SSYNLDKSVHITKLIATTHCCINPLLYAFLDGTFSKYLCRCFHLRSNTPLQPRGQSAQGT :: ... :. .: .:::.::..: :: : ::. . : CCDS26 FERYLDYAIQATETLAFVHCCLNPIIYFFLGEKFRKYILQLFKTCRGLFVLCQYCGLLQI 280 290 300 310 320 330 350 pF1KB8 SREEPDHSTEV CCDS26 YSADTPSSSYTQSTMDHDLHDAL 340 350 360 >>CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 (355 aa) initn: 619 init1: 213 opt: 635 Z-score: 675.0 bits: 133.4 E(32554): 2.8e-31 Smith-Waterman score: 635; 35.2% identity (65.4% similar) in 298 aa overlap (40-328:25-316) 10 20 30 40 50 60 pF1KB8 SLKMANYTLAPEDEYDVLIEGELESDEAEQCDKYDAQALSAQLVPSLCSAVFVIGVLDNL :: :. . :. . .::...: : CCDS26 MDYTLDLSVTTVTDYYYPDIFSSPCDAELIQTNGKLLLAVFYCLLFVFSLLGNS 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB8 LVVLILVKYKGLKRVENIYLLNLAVSNLCFLLTLPFWAH------AGGDPMCKILIGLYF ::.:.:: : :. . ..::::::.:.: :....:: .. . : :::.. :.:. CCDS26 LVILVLVVCKKLRSITDVYLLNLALSDLLFVFSFPFQTYYLLDQWVFGTVMCKVVSGFYY 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB8 VGLYSETFFNCLLTVQRYLVFLHKGNFFSARRRVPCGIITSVLAWVTAILATLPEYVVYK .:.:: :: :..:.:::. .: . . : . : . .:.:::.::.: : :. CCDS26 IGFYSSMFFITLMSVDRYLAVVH-AVYALKVRTIRMGTTLCLAVWLTAIMATIPLLVFYQ 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KB8 PQMEDQKYKCAFSRTPFLPADETFWKHFLTLKMNISVLVLPLFIFTFLYVQMRKTLRFRE :: .: .: : . :: : ..:::: :..:. :: : :... . :. : CCDS26 VASEDGVLQC-YS---FYNQQTLKWKIFTNFKMNILGLLIPFTIFMFCYIKILHQLK-RC 180 190 200 210 220 250 260 270 280 290 300 pF1KB8 QRYSLFK---LVFAIMVVFLLMWAPYNIAFFLSTFKEHFSLSDCKSSYNLDKSVHITKLI : .. : ::. .... ::.:.:.:...::.... :. :. : .: ..:.:..: CCDS26 QNHNKTKAIRLVLIVVIASLLFWVPFNVVLFLTSLHSMHILDGCSISQQLTYATHVTEII 230 240 250 260 270 280 310 320 330 340 350 pF1KB8 ATTHCCINPLLYAFLDGTFSKYLCRCFHLRSNTPLQPRGQSAQGTSREEPDHSTEV . ::::.::..:::. :.:.: . :. CCDS26 SFTHCCVNPVIYAFVGEKFKKHLSEIFQKSCSQIFNYLGRQMPRESCEKSSSCQQHSSRS 290 300 310 320 330 340 356 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 10:58:28 2016 done: Sun Nov 6 10:58:28 2016 Total Scan time: 2.480 Total Display time: 0.020 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]