Result of FASTA (omim) for
pFN21AB8028
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB8028, 1104 aa
1>>>pF1KB8028 1104 - 1104 aa - 1104 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.1788+/-0.000465; mu= -2.8937+/- 0.029
mean_var=438.7333+/-91.945, 0's: 0 Z-trim(121.4): 94 B-trim: 771 in 1/57
Lambda= 0.061231
statistics sampled from 37967 (38065) to 37967 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.754), E-opt: 0.2 (0.446), width: 16
Scan time: 18.020
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001171720 (OMIM: 606745) partitioning defective (1244) 1045 107.9 3.8e-22
NP_001171723 (OMIM: 606745) partitioning defective ( 988) 1021 105.7 1.4e-21
XP_005252592 (OMIM: 606745) PREDICTED: partitionin (1017) 1021 105.7 1.4e-21
NP_001171719 (OMIM: 606745) partitioning defective (1266) 1021 105.8 1.7e-21
NP_001171718 (OMIM: 606745) partitioning defective (1273) 1021 105.8 1.7e-21
XP_011517880 (OMIM: 606745) PREDICTED: partitionin (1298) 1021 105.8 1.7e-21
NP_001171717 (OMIM: 606745) partitioning defective (1310) 1021 105.8 1.7e-21
NP_001171715 (OMIM: 606745) partitioning defective (1340) 1021 105.8 1.7e-21
XP_011517872 (OMIM: 606745) PREDICTED: partitionin (1343) 1021 105.8 1.8e-21
XP_011517874 (OMIM: 606745) PREDICTED: partitionin (1340) 547 64.0 7e-09
XP_005252593 (OMIM: 606745) PREDICTED: partitionin ( 741) 539 63.0 7.7e-09
XP_011517886 (OMIM: 606745) PREDICTED: partitionin ( 744) 539 63.0 7.7e-09
NP_001171722 (OMIM: 606745) partitioning defective (1000) 539 63.1 9.4e-09
XP_016871919 (OMIM: 606745) PREDICTED: partitionin (1015) 539 63.1 9.5e-09
XP_005252591 (OMIM: 606745) PREDICTED: partitionin (1030) 539 63.1 9.6e-09
NP_001171721 (OMIM: 606745) partitioning defective (1031) 539 63.1 9.6e-09
XP_011517885 (OMIM: 606745) PREDICTED: partitionin (1034) 539 63.1 9.6e-09
XP_011517873 (OMIM: 606745) PREDICTED: partitionin (1341) 541 63.4 1e-08
XP_011517883 (OMIM: 606745) PREDICTED: partitionin (1144) 539 63.2 1e-08
XP_011517881 (OMIM: 606745) PREDICTED: partitionin (1278) 539 63.2 1.1e-08
XP_005252589 (OMIM: 606745) PREDICTED: partitionin (1309) 539 63.2 1.1e-08
XP_011517878 (OMIM: 606745) PREDICTED: partitionin (1312) 539 63.2 1.1e-08
NP_001171716 (OMIM: 606745) partitioning defective (1319) 539 63.2 1.1e-08
XP_011517877 (OMIM: 606745) PREDICTED: partitionin (1322) 539 63.2 1.1e-08
XP_005252588 (OMIM: 606745) PREDICTED: partitionin (1323) 539 63.2 1.1e-08
XP_011517875 (OMIM: 606745) PREDICTED: partitionin (1326) 539 63.2 1.1e-08
XP_005252587 (OMIM: 606745) PREDICTED: partitionin (1338) 539 63.3 1.1e-08
XP_005252585 (OMIM: 606745) PREDICTED: partitionin (1352) 539 63.3 1.2e-08
NP_001171714 (OMIM: 606745) partitioning defective (1353) 539 63.3 1.2e-08
XP_011517871 (OMIM: 606745) PREDICTED: partitionin (1355) 539 63.3 1.2e-08
NP_062565 (OMIM: 606745) partitioning defective 3 (1356) 539 63.3 1.2e-08
XP_011517879 (OMIM: 606745) PREDICTED: partitionin (1300) 519 61.5 3.8e-08
XP_011538772 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p ( 954) 335 45.1 0.0024
XP_006710341 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p (1296) 335 45.2 0.003
XP_005270404 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p (1300) 335 45.2 0.003
XP_011538771 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p (1344) 335 45.2 0.0031
XP_011538770 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p (1515) 335 45.3 0.0033
NP_795352 (OMIM: 603199) inaD-like protein [Homo s (1801) 335 45.4 0.0037
XP_011538769 (OMIM: 603199) PREDICTED: inaD-like p (1856) 335 45.4 0.0038
>>NP_001171720 (OMIM: 606745) partitioning defective 3 h (1244 aa)
initn: 1665 init1: 519 opt: 1045 Z-score: 518.5 bits: 107.9 E(85289): 3.8e-22
Smith-Waterman score: 2227; 40.2% identity (64.6% similar) in 1116 aa overlap (4-980:4-1094)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MKVTVCFGRTGIVVPCKEGQLRVGELTQQALQRYLKTREKGPGYWVKIHHLEYTDGGILD
::::::: .:::: .:...: : :::. :: :. : :.::...:.::. ::::::
NP_001 MKVTVCFGRTRVVVPCGDGHMKVFSLIQQAVTRYRKAIAKDPNYWIQVHRLEHGDGGILD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB8 PDDVLADVVEDKDKLIAVFEEQEPLHKIESPSGNPADRQSPDAFETEVAAQ-LAAFKPIG
::.: ::..:::.:.:::.::.: : .. :.. . :::. : .:.... ..::.:
NP_001 LDDILCDVADDKDRLVAVFDEQDPHHGGDGTSASSTGTQSPEIFGSELGTNNVSAFQPYQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KB8 G--EIEVTPSALKLGTPLLVRRSSDP----VPGPPADT-----QPSASHPGGQS-----L
. :::::::.:. . :: ::::::: . .:. .:: ..: : :
NP_001 ATSEIEVTPSVLRANMPLHVRRSSDPALIGLSTSVSDSNFSSEEPSRKNPTRWSTTAGFL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210
pF1KB8 KLVVPDSTQNLEDREVLNGVQTE-LLTSPRTK-DT---------LSDMTRTVEISGEGGP
: . : .. ::. .:.. . . : . :: :.::.. ::. ..:::
NP_001 KQNTAGSPKTC-DRKDEDGTEEDNSRVEPVGHADTGLEHIPNFSLDDMVKLVEVPNDGGP
190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 LGIHVVPFFSSLSGRILGLFIRGIEDNSRSKREGLFHENECIVKINNVDLVDKTFAQAQD
:::::::: :. .:: :::... .: ......:.::.::.:::.::. :: .. : :::
NP_001 LGIHVVPF-SARGGRTLGLLVKRLEKGGKAEHENLFRENDCIVRINDGDLRNRRFEQAQH
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 VFRQAMKSPSVLLHVLPPQNREQYEK-SVIGSLNIFGNNDGVLKTKVPPPVHGKSGLKTA
.:::::..: . .::.: :.::::. : . : ... . . . ...::.:.
NP_001 MFRQAMRTPIIWFHVVPAANKEQYEQLSQSEKNNYYSSRFSPDSQYIDNRSVNSAGLHTV
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380
pF1KB8 NLTG--TDSPET-DASASLQQNKSPRVPRLGGKPSSPSLSPLM--------GFGSNKNAK
. . . :: :. . : .. : : ::.:. .: :....: .:
NP_001 QRAPRLNHPPEQIDSHSRLPHSAHPS----GKPPSAPASAPQNVFSTTVSSGYNTKKIGK
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 KIKIDLKKGPEGLGFTVVTRDSSIHGPGPIFVKNILPKGAAIKDGRLQSGDRILEVNGRD
...:.:::: :::::....:: .: : .::.::::::.::::.::::..:::..:::: :
NP_001 RLNIQLKKGTEGLGFSITSRDVTIGGSAPIYVKNILPRGAAIQDGRLKAGDRLIEVNGVD
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490
pF1KB8 VTGRTQEELVAMLRSTKQGETASLVIARQEGHFLPRELKGEPDCCALSLE-TSEQLTFEI
..:..:::.:..:::::. :.::.. ::: : :::::.: . .:. . : : ::::.
NP_001 LVGKSQEEVVSLLRSTKMEGTVSLLVFRQEDAFHPRELKAEDEDIVLTPDGTREFLTFEV
480 490 500 510 520 530
500 510 520 530 540 550
pF1KB8 PLNDSGSAGLGVSLKGNKSRETGTDLGIFIKSIIHGGAAFKDGRLRMNDQLIAVNGESLL
:::::::::::::.:::.:.:. .:::::.::::.:::: ::::::.:::::::::::::
NP_001 PLNDSGSAGLGVSVKGNRSKENHADLGIFVKSIINGGAASKDGRLRVNDQLIAVNGESLL
540 550 560 570 580 590
560 570 580 590 600
pF1KB8 GKSNHEAMETLRRSMSMEGNIRGMIQLVILRR---------------PERPME---DPAE
::.:..:::::::::: ::: ::::::.. :: :: :.: : :
NP_001 GKTNQDAMETLRRSMSTEGNKRGMIQLIVARRISKCNELKSPGSPPGPELPIETALDDRE
600 610 620 630 640 650
610 620 630 640 650
pF1KB8 CGAFSKPCFENCQNAVTTSRRNDNSILHPLGTCS-------PQDKQKGLLLPNDGWAESE
.:. . . .. . :: .. . .: . ::: ... .:
NP_001 -RRISHSLYSGIEGLDESPSRN-AALSRIMGKYQLSPTVNMPQDDT--VIIEDDRLPV--
660 670 680 690 700
660 670 680 690 700
pF1KB8 VPP------SPTPHSALGLGLED---YSHSSGVDSA--VYFPDQH--INFRSVTPARQPE
.:: : . :. .:. : ..... ::: :: . :. .::
NP_001 LPPHLSDQSSSSSHDDVGFVTADAGTWAKAAISDSADCSLSPDVDPVLAFQREGFGRQ--
710 720 730 740 750 760
710 720 730 740 750
pF1KB8 SINLKASKSMDLVPDESKVHSLAGQKSES------PSKDFGPTLGLKKSSSLESLQTAVA
:.. : .:... : :.. . .::.: ::.: ::.:::::::::::::::::
NP_001 SMSEKRTKQFS---DASQLDFVKTRKSKSMDLGSSPSRDVGPSLGLKKSSSLESLQTAVA
770 780 790 800 810 820
760 770 780 790 800
pF1KB8 EVRKN-DLPFHRPRPHMVRGRGCNESFRAAIDKSYDGP---------EEIEADGLSDKSS
:: : :.:::::::...:::::::::::::::::: : : .: : ...::
NP_001 EVTLNGDIPFHRPRPRIIRGRGCNESFRAAIDKSYDKPAVDDDDEGMETLEED--TEESS
830 840 850 860 870 880
810 820 830 840 850
pF1KB8 HSGQGALNCES-APQ--------GNSELEDMENKAR-KVKKTKEKEKKKEKGKLKVKE--
.::. ... : :. ::.: : .. . :. : :.:.. ::: :.:.:.
NP_001 RSGRESVSTASDQPSHSLERQMNGNQEKGDKTDRKKDKTGKEKKKDRDKEKDKMKAKKGM
890 900 910 920 930 940
860 870 880 890
pF1KB8 --------KKRKEENEDPERKIKKKGFGAMLRFGKK--KEDK---GGKAEQKGTL-----
. . . : ::. ... .. . : . .:. :: . .:..
NP_001 LKGLGDMFRIQAKTREFRERQARERDYAEIQDFHRTFGCDDELMYGGVSSYEGSMALNAR
950 960 970 980 990 1000
900 910 920 930 940
pF1KB8 ----KHGGLREEELEKMKEER-------ESGRPTGGSTDRIQKLRKEYYQARREGFPLYE
..: . . ..:. : .:.: : .. ::::.::.:. ::... :
NP_001 PQSPREGHMMDALYAQVKKPRNSKPSPVDSNRSTPSNHDRIQRLRQEFQQAKQD-----E
1010 1020 1030 1040 1050
950 960 970 980 990 1000
pF1KB8 DDEGRARPSEYDLLWVPGRGP--DGNAHNLRFE-GMERQYASLPRGGPADPVDYLPAAPR
: : : : .. : :. : ... :.. : :.::
NP_001 DVEDRRRTYSFEQPW-PNARPATQSGRHSVSVEVQMQRQRQEERESSQQAQRQYSSLPRQ
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KB8 GLYKERELPYYPGAHPMHPPKGSYPRPTELRVADLRYPQHYPPPPAPQHKGPFRQDVPPS
NP_001 SRKNASSVSQDSWEQNYSPGEGFQSAKENPRYSSYQGSRNGYLGGHGFNARVMLETQELL
1120 1130 1140 1150 1160 1170
>>NP_001171723 (OMIM: 606745) partitioning defective 3 h (988 aa)
initn: 1700 init1: 519 opt: 1021 Z-score: 508.3 bits: 105.7 E(85289): 1.4e-21
Smith-Waterman score: 1949; 41.2% identity (63.9% similar) in 969 aa overlap (48-885:48-987)
20 30 40 50 60 70
pF1KB8 EGQLRVGELTQQALQRYLKTREKGPGYWVKIHHLEYTDGGILDPDDVLADVVEDKDKLIA
.:.::. :::::: ::.: ::..:::.:.:
NP_001 DGHMKVFSLIQQAVTRYRKAIAKDPNYWIQVHRLEHGDGGILDLDDILCDVADDKDRLVA
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KB8 VFEEQEPLHKIESPSGNPADRQSPDAFETEVAAQ-LAAFKPIGG--EIEVTPSALKLGTP
::.::.: : .. :.. . :::. : .:.... ..::.: . :::::::.:. . :
NP_001 VFDEQDPHHGGDGTSASSTGTQSPEIFGSELGTNNVSAFQPYQATSEIEVTPSVLRANMP
80 90 100 110 120 130
140
pF1KB8 LLVRRSSDPV-----------------PG---P---------------------------
: :::::::. :. :
NP_001 LHVRRSSDPALIGLSTSVSDSNFSSEEPSRKNPTRWSTTAGFLKQNTAGSPKTCDRKKDE
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180
pF1KB8 -----PADTQP--------------SASHPG-GQSLKLVVPDSTQNLEDR---EVLNGVQ
: ::. ::::: :. :. : . :: : .. ..
NP_001 NYRSLPRDTSNWSNQFQRDNARSSLSASHPMVGKWLEKQEQDEDGTEEDNSRVEPVGHAD
200 210 220 230 240 250
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 TELLTSPRTKDTLSDMTRTVEISGEGGPLGIHVVPFFSSLSGRILGLFIRGIEDNSRSKR
: : : .:.::.. ::. ..::::::::::: :. .:: :::... .: ......
NP_001 TGLEHIPNF--SLDDMVKLVEVPNDGGPLGIHVVPF-SARGGRTLGLLVKRLEKGGKAEH
260 270 280 290 300 310
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 EGLFHENECIVKINNVDLVDKTFAQAQDVFRQAMKSPSVLLHVLPPQNREQYEK-SVIGS
:.::.::.:::.::. :: .. : ::: .:::::..: . .::.: :.::::. : .
NP_001 ENLFRENDCIVRINDGDLRNRRFEQAQHMFRQAMRTPIIWFHVVPAANKEQYEQLSQSEK
320 330 340 350 360 370
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LNIFGNNDGVLKTKVPPPVHGKSGLKTANLTG--TDSPET-DASASLQQNKSPRVPRLGG
: ... . . . ...::.:.. . . :: :. . : .. : :
NP_001 NNYYSSRFSPDSQYIDNRSVNSAGLHTVQRAPRLNHPPEQIDSHSRLPHSAHPS----GK
380 390 400 410 420 430
370 380 390 400 410
pF1KB8 KPSSPSLSPLM--------GFGSNKNAKKIKIDLKKGPEGLGFTVVTRDSSIHGPGPIFV
::.:. .: :....: .:...:.:::: :::::....:: .: : .::.:
NP_001 PPSAPASAPQNVFSTTVSSGYNTKKIGKRLNIQLKKGTEGLGFSITSRDVTIGGSAPIYV
440 450 460 470 480 490
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 KNILPKGAAIKDGRLQSGDRILEVNGRDVTGRTQEELVAMLRSTKQGETASLVIARQEGH
:::::.::::.::::..:::..:::: :..:..:::.:..:::::. :.::.. :::
NP_001 KNILPRGAAIQDGRLKAGDRLIEVNGVDLVGKSQEEVVSLLRSTKMEGTVSLLVFRQEDA
500 510 520 530 540 550
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 FLPRELKGEPDCCALSLE-TSEQLTFEIPLNDSGSAGLGVSLKGNKSRETGTDLGIFIKS
: :::::.: . .:. . : : ::::.:::::::::::::.:::.:.:. .:::::.::
NP_001 FHPRELKAEDEDIVLTPDGTREFLTFEVPLNDSGSAGLGVSVKGNRSKENHADLGIFVKS
560 570 580 590 600 610
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 IIHGGAAFKDGRLRMNDQLIAVNGESLLGKSNHEAMETLRRSMSMEGNIRGMIQLVILRR
::.:::: ::::::.:::::::::::::::.:..:::::::::: ::: ::::::.. ::
NP_001 IINGGAASKDGRLRVNDQLIAVNGESLLGKTNQDAMETLRRSMSTEGNKRGMIQLIVARR
620 630 640 650 660 670
600 610 620 630
pF1KB8 ---------------PERPME---DPAECGAFSKPCFENCQNAVTTSRRNDNSILHPLGT
:: :.: : : .:. . . .. . :: .. . .:
NP_001 ISKCNELKSPGSPPGPELPIETALDDRE-RRISHSLYSGIEGLDESPSRN-AALSRIMGK
680 690 700 710 720
640 650 660 670 680
pF1KB8 --CSPQDKQKGLLLPNDGWA--ESEVPPSPTPHSALGLGLEDYSHSSGVDSAVYFPDQHI
:: . .:.: . :.. : :: : : : ::. :.. . .
NP_001 YQLSPT-----VNMPQDDTVIIEDDRLPVLPPH------LSDQSSSSSHDDVGFVTADAG
730 740 750 760 770
690 700 710 720 730
pF1KB8 NFR----------SVTPARQPESINLKASKSMDLVPDESKVHSLAGQKSESPSKDFGPTL
.. :..: .: . .. . ::.:.... ::. :::.: ::.:
NP_001 TWAKAAISDSADCSLSPDVDP-VLAFQREGFGRQIADETKLNTVDDQKAGSPSRDVGPSL
780 790 800 810 820 830
740 750 760 770 780 790
pF1KB8 GLKKSSSLESLQTAVAEVRKN-DLPFHRPRPHMVRGRGCNESFRAAIDKSYDGP------
:::::::::::::::::: : :.:::::::...:::::::::::::::::: :
NP_001 GLKKSSSLESLQTAVAEVTLNGDIPFHRPRPRIIRGRGCNESFRAAIDKSYDKPAVDDDD
840 850 860 870 880 890
800 810 820 830 840
pF1KB8 ---EEIEADGLSDKSSHSGQGALNCESAPQGNSELEDMENKARKVKKTKEKEKKKEKGKL
: .: : ...::.::. ... : ..: ..:... .: :: ..::.:
NP_001 EGMETLEED--TEESSRSGRESVSTASDQPSHSLERQMNGNQEKGDKT---DRKKDKTG-
900 910 920 930 940 950
850 860 870 880 890 900
pF1KB8 KVKEKKRKEENEDPERKIKK---KGFGAMLRFGKKKEDKGGKAEQKGTLKHGGLREEELE
::::. ...: . : :: ::.: :. ..: : .:
NP_001 --KEKKKDRDKEKDKMKAKKGMLKGLGDMFSLAKLKPEKR
960 970 980
910 920 930 940 950 960
pF1KB8 KMKEERESGRPTGGSTDRIQKLRKEYYQARREGFPLYEDDEGRARPSEYDLLWVPGRGPD
>>XP_005252592 (OMIM: 606745) PREDICTED: partitioning de (1017 aa)
initn: 1740 init1: 519 opt: 1021 Z-score: 508.2 bits: 105.7 E(85289): 1.4e-21
Smith-Waterman score: 1991; 41.2% identity (63.6% similar) in 990 aa overlap (48-885:48-1016)
20 30 40 50 60 70
pF1KB8 EGQLRVGELTQQALQRYLKTREKGPGYWVKIHHLEYTDGGILDPDDVLADVVEDKDKLIA
.:.::. :::::: ::.: ::..:::.:.:
XP_005 DGHMKVFSLIQQAVTRYRKAIAKDPNYWIQVHRLEHGDGGILDLDDILCDVADDKDRLVA
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KB8 VFEEQEPLHKIESPSGNPADRQSPDAFETEVAAQ-LAAFKPIGG--EIEVTPSALKLGTP
::.::.: : .. :.. . :::. : .:.... ..::.: . :::::::.:. . :
XP_005 VFDEQDPHHGGDGTSASSTGTQSPEIFGSELGTNNVSAFQPYQATSEIEVTPSVLRANMP
80 90 100 110 120 130
140
pF1KB8 LLVRRSSDPV-----------------PG---P---------------------------
: :::::::. :. :
XP_005 LHVRRSSDPALIGLSTSVSDSNFSSEEPSRKNPTRWSTTAGFLKQNTAGSPKTCDRKKDE
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180
pF1KB8 -----PADTQP--------------SASHPG-GQSLKLVVPDSTQNLEDR---EVLNGVQ
: ::. ::::: :. :. : . :: : .. ..
XP_005 NYRSLPRDTSNWSNQFQRDNARSSLSASHPMVGKWLEKQEQDEDGTEEDNSRVEPVGHAD
200 210 220 230 240 250
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 TELLTSPRTKDTLSDMTRTVEISGEGGPLGIHVVPFFSSLSGRILGLFIRGIEDNSRSKR
: : : .:.::.. ::. ..::::::::::: :. .:: :::... .: ......
XP_005 TGLEHIPNF--SLDDMVKLVEVPNDGGPLGIHVVPF-SARGGRTLGLLVKRLEKGGKAEH
260 270 280 290 300 310
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 EGLFHENECIVKINNVDLVDKTFAQAQDVFRQAMKSPSVLLHVLPPQNREQYEK-SVIGS
:.::.::.:::.::. :: .. : ::: .:::::..: . .::.: :.::::. : .
XP_005 ENLFRENDCIVRINDGDLRNRRFEQAQHMFRQAMRTPIIWFHVVPAANKEQYEQLSQSEK
320 330 340 350 360 370
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LNIFGNNDGVLKTKVPPPVHGKSGLKTANLTG--TDSPET-DASASLQQNKSPRVPRLGG
: ... . . . ...::.:.. . . :: :. . : .. : :
XP_005 NNYYSSRFSPDSQYIDNRSVNSAGLHTVQRAPRLNHPPEQIDSHSRLPHSAHPS----GK
380 390 400 410 420 430
370 380 390 400 410
pF1KB8 KPSSPSLSPLM--------GFGSNKNAKKIKIDLKKGPEGLGFTVVTRDSSIHGPGPIFV
::.:. .: :....: .:...:.:::: :::::....:: .: : .::.:
XP_005 PPSAPASAPQNVFSTTVSSGYNTKKIGKRLNIQLKKGTEGLGFSITSRDVTIGGSAPIYV
440 450 460 470 480 490
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 KNILPKGAAIKDGRLQSGDRILEVNGRDVTGRTQEELVAMLRSTKQGETASLVIARQEGH
:::::.::::.::::..:::..:::: :..:..:::.:..:::::. :.::.. :::
XP_005 KNILPRGAAIQDGRLKAGDRLIEVNGVDLVGKSQEEVVSLLRSTKMEGTVSLLVFRQEDA
500 510 520 530 540 550
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 FLPRELKGEPDCCALSLE-TSEQLTFEIPLNDSGSAGLGVSLKGNKSRETGTDLGIFIKS
: :::::.: . .:. . : : ::::.:::::::::::::.:::.:.:. .:::::.::
XP_005 FHPRELKAEDEDIVLTPDGTREFLTFEVPLNDSGSAGLGVSVKGNRSKENHADLGIFVKS
560 570 580 590 600 610
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 IIHGGAAFKDGRLRMNDQLIAVNGESLLGKSNHEAMETLRRSMSMEGNIRGMIQLVILRR
::.:::: ::::::.:::::::::::::::.:..:::::::::: ::: ::::::.. ::
XP_005 IINGGAASKDGRLRVNDQLIAVNGESLLGKTNQDAMETLRRSMSTEGNKRGMIQLIVARR
620 630 640 650 660 670
600 610 620 630
pF1KB8 ---------------PERPME---DPAECGAFSKPCFENCQNAVTTSRRNDNSILHPLGT
:: :.: : : .:. . . .. . :: .. . .:
XP_005 ISKCNELKSPGSPPGPELPIETALDDRE-RRISHSLYSGIEGLDESPSRN-AALSRIMGK
680 690 700 710 720
640 650 660
pF1KB8 CS-------PQDKQKGLLLPNDGWAESEVPP------SPTPHSALGL-----GL------
. ::: ... .: .:: : . :. .:. :
XP_005 YQLSPTVNMPQDDT--VIIEDDRLPV--LPPHLSDQSSSSSHDDVGFVTADAGTWAKAAI
730 740 750 760 770 780
670 680 690 700 710
pF1KB8 ---EDYSHSSGVDSAVYFPDQHINFRSVTPAR--------QPESINLKASKSMDLVPDES
: : : :: .. : . .. .:.. : : . .. . ::::::: ::.
XP_005 SDSADCSLSPDVDPVLAFQREGFGRQSMSEKRTKQFSDASQLDFVKTRKSKSMDLVADET
790 800 810 820 830 840
720 730 740 750 760 770
pF1KB8 KVHSLAGQKSESPSKDFGPTLGLKKSSSLESLQTAVAEVRKN-DLPFHRPRPHMVRGRGC
:.... ::. :::.: ::.::::::::::::::::::: : :.:::::::...:::::
XP_005 KLNTVDDQKAGSPSRDVGPSLGLKKSSSLESLQTAVAEVTLNGDIPFHRPRPRIIRGRGC
850 860 870 880 890 900
780 790 800 810 820
pF1KB8 NESFRAAIDKSYDGP---------EEIEADGLSDKSSHSGQGALNCESAPQGNSELEDME
::::::::::::: : : .: : ...::.::. ... : ..: ..:.
XP_005 NESFRAAIDKSYDKPAVDDDDEGMETLEED--TEESSRSGRESVSTASDQPSHSLERQMN
910 920 930 940 950 960
830 840 850 860 870 880
pF1KB8 NKARKVKKTKEKEKKKEKGKLKVKEKKRKEENEDPERKIKK---KGFGAMLRFGKKKEDK
.. .: :: ..::.: ::::. ...: . : :: ::.: :. ..: : .:
XP_005 GNQEKGDKT---DRKKDKTG---KEKKKDRDKEKDKMKAKKGMLKGLGDMFSLAKLKPEK
970 980 990 1000 1010
890 900 910 920 930 940
pF1KB8 GGKAEQKGTLKHGGLREEELEKMKEERESGRPTGGSTDRIQKLRKEYYQARREGFPLYED
XP_005 R
>>NP_001171719 (OMIM: 606745) partitioning defective 3 h (1266 aa)
initn: 1590 init1: 519 opt: 1021 Z-score: 507.0 bits: 105.8 E(85289): 1.7e-21
Smith-Waterman score: 2281; 41.6% identity (65.7% similar) in 1096 aa overlap (4-1000:4-1058)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MKVTVCFGRTGIVVPCKEGQLRVGELTQQALQRYLKTREKGPGYWVKIHHLEYTDGGILD
::::::: .:::: .:...: : :::. :: :. : :.::...:.::. ::::::
NP_001 MKVTVCFGRTRVVVPCGDGHMKVFSLIQQAVTRYRKAIAKDPNYWIQVHRLEHGDGGILD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB8 PDDVLADVVEDKDKLIAVFEEQEPLHKIESPSGNPADRQSPDAFETEVAAQ-LAAFKPIG
::.: ::..:::.:.:::.::.: : .. :.. . :::. : .:.... ..::.:
NP_001 LDDILCDVADDKDRLVAVFDEQDPHHGGDGTSASSTGTQSPEIFGSELGTNNVSAFQPYQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KB8 G--EIEVTPSALKLGTPLLVRRSSDP----VPGPPADT-----QPSASHPGGQS-----L
. :::::::.:. . :: ::::::: . .:. .:: ..: : :
NP_001 ATSEIEVTPSVLRANMPLHVRRSSDPALIGLSTSVSDSNFSSEEPSRKNPTRWSTTAGFL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210
pF1KB8 KLVVPDSTQNLEDREVLNGVQTE-LLTSPRTK-DT---------LSDMTRTVEISGEGGP
: . : .. ::. .:.. . . : . :: :.::.. ::. ..:::
NP_001 KQNTAGSPKTC-DRKDEDGTEEDNSRVEPVGHADTGLEHIPNFSLDDMVKLVEVPNDGGP
190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 LGIHVVPFFSSLSGRILGLFIRGIEDNSRSKREGLFHENECIVKINNVDLVDKTFAQAQD
:::::::: :. .:: :::... .: ......:.::.::.:::.::. :: .. : :::
NP_001 LGIHVVPF-SARGGRTLGLLVKRLEKGGKAEHENLFRENDCIVRINDGDLRNRRFEQAQH
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 VFRQAMKSPSVLLHVLPPQNREQYEK-SVIGSLNIFGNNDGVLKTKVPPPVHGKSGLKTA
.:::::..: . .::.: :.::::. : . : ... . . . ...::.:.
NP_001 MFRQAMRTPIIWFHVVPAANKEQYEQLSQSEKNNYYSSRFSPDSQYIDNRSVNSAGLHTV
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380
pF1KB8 NLTG--TDSPET-DASASLQQNKSPRVPRLGGKPSSPSLSPLM--------GFGSNKNAK
. . . :: :. . : .. : : ::.:. .: :....: .:
NP_001 QRAPRLNHPPEQIDSHSRLPHSAHPS----GKPPSAPASAPQNVFSTTVSSGYNTKKIGK
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 KIKIDLKKGPEGLGFTVVTRDSSIHGPGPIFVKNILPKGAAIKDGRLQSGDRILEVNGRD
...:.:::: :::::....:: .: : .::.::::::.::::.::::..:::..:::: :
NP_001 RLNIQLKKGTEGLGFSITSRDVTIGGSAPIYVKNILPRGAAIQDGRLKAGDRLIEVNGVD
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490
pF1KB8 VTGRTQEELVAMLRSTKQGETASLVIARQEGHFLPRELKGEPDCCALSLE-TSEQLTFEI
..:..:::.:..:::::. :.::.. ::: : :::::.: . .:. . : : ::::.
NP_001 LVGKSQEEVVSLLRSTKMEGTVSLLVFRQEDAFHPRELKAEDEDIVLTPDGTREFLTFEV
480 490 500 510 520 530
500 510 520 530 540 550
pF1KB8 PLNDSGSAGLGVSLKGNKSRETGTDLGIFIKSIIHGGAAFKDGRLRMNDQLIAVNGESLL
:::::::::::::.:::.:.:. .:::::.::::.:::: ::::::.:::::::::::::
NP_001 PLNDSGSAGLGVSVKGNRSKENHADLGIFVKSIINGGAASKDGRLRVNDQLIAVNGESLL
540 550 560 570 580 590
560 570 580 590 600
pF1KB8 GKSNHEAMETLRRSMSMEGNIRGMIQLVILRR---------------PERPME---DPAE
::.:..:::::::::: ::: ::::::.. :: :: :.: : :
NP_001 GKTNQDAMETLRRSMSTEGNKRGMIQLIVARRISKCNELKSPGSPPGPELPIETALDDRE
600 610 620 630 640 650
610 620 630 640 650
pF1KB8 CGAFSKPCFENCQNAVTTSRRNDNSILHPLGT--CSPQDKQKGLLLPNDGWA--ESEVPP
.:. . . .. . :: .. . .: :: . .:.: . :.. :
NP_001 -RRISHSLYSGIEGLDESPSRN-AALSRIMGKYQLSPT-----VNMPQDDTVIIEDDRLP
660 670 680 690 700
660 670 680 690 700
pF1KB8 SPTPHSALGLGLEDYSHSSGVDSAVYFPDQHINFR----------SVTPARQPESINLKA
:: : : : ::. :.. . . .. :..: .: . ..
NP_001 VLPPH------LSDQSSSSSHDDVGFVTADAGTWAKAAISDSADCSLSPDVDP-VLAFQR
710 720 730 740 750 760
710 720 730 740 750 760
pF1KB8 SKSMDLVPDESKVHSLAGQKSESPSKDFGPTLGLKKSSSLESLQTAVAEVRKN-DLPFHR
. ::.:.... ::. :::.: ::.::::::::::::::::::: : :.::::
NP_001 EGFGRQIADETKLNTVDDQKAGSPSRDVGPSLGLKKSSSLESLQTAVAEVTLNGDIPFHR
770 780 790 800 810 820
770 780 790 800 810
pF1KB8 PRPHMVRGRGCNESFRAAIDKSYDGP---------EEIEADGLSDKSSHSGQGALNCESA
:::...:::::::::::::::::: : : .: : ...::.::. ... :
NP_001 PRPRIIRGRGCNESFRAAIDKSYDKPAVDDDDEGMETLEED--TEESSRSGRESVSTASD
830 840 850 860 870
820 830 840 850 860 870
pF1KB8 PQGNSELEDMENKARKVKKTKEKEKKKEKGKLKVKEKKRKEENEDPERKIKK---KGFGA
..: ..:... .: :: ..::.: ::::. ...: . : :: ::.:
NP_001 QPSHSLERQMNGNQEKGDKT---DRKKDKTG---KEKKKDRDKEKDKMKAKKGMLKGLGD
880 890 900 910 920 930
880 890 900 910 920 930
pF1KB8 MLRFGKKKEDKGGKAEQKGTLK--HGGLREEELEKMKEERESGRPTGGSTDRIQKLRKEY
:.::::...: : :. : .: .. ::: .::.:.: ::: .:.
NP_001 MFRFGKHRKD--DKIEKTGKIKIQESFTSEEERIRMKQEQE----------RIQAKTREF
940 950 960 970 980
940 950 960 970 980
pF1KB8 Y--QARREGFPLYEDDEGRARPSEYDLLWVPGRGPDGN-AHNLR----FEG--MERQYAS
:::.. . .: :. . .:.. . .:. : : : :: :. ::.
NP_001 RERQARERDYAEIQD-FHRTFGCDDELMYGGVSSYEGSMALNARPQSPREGHMMDALYAQ
990 1000 1010 1020 1030
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KB8 L--PRGGPADPVDYLPAAPRGLYKERELPYYPGAHPMHPPKGSYPRPTELRVADLRYPQH
. ::.. .::: ..:
NP_001 VKKPRNSKPSPVDSNRSTPSNHDRIQRLRQEFQQAKQDEDVEDRRRTYSFEQPWPNARPA
1040 1050 1060 1070 1080 1090
>>NP_001171718 (OMIM: 606745) partitioning defective 3 h (1273 aa)
initn: 1522 init1: 519 opt: 1021 Z-score: 507.0 bits: 105.8 E(85289): 1.7e-21
Smith-Waterman score: 2006; 38.6% identity (61.6% similar) in 1105 aa overlap (48-980:48-1123)
20 30 40 50 60 70
pF1KB8 EGQLRVGELTQQALQRYLKTREKGPGYWVKIHHLEYTDGGILDPDDVLADVVEDKDKLIA
.:.::. :::::: ::.: ::..:::.:.:
NP_001 DGHMKVFSLIQQAVTRYRKAIAKDPNYWIQVHRLEHGDGGILDLDDILCDVADDKDRLVA
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KB8 VFEEQEPLHKIESPSGNPADRQSPDAFETEVAAQ-LAAFKPIGG--EIEVTPSALKLGTP
::.::.: : .. :.. . :::. : .:.... ..::.: . :::::::.:. . :
NP_001 VFDEQDPHHGGDGTSASSTGTQSPEIFGSELGTNNVSAFQPYQATSEIEVTPSVLRANMP
80 90 100 110 120 130
140
pF1KB8 LLVRRSSDPV-----------------PG---P---------------------------
: :::::::. :. :
NP_001 LHVRRSSDPALIGLSTSVSDSNFSSEEPSRKNPTRWSTTAGFLKQNTAGSPKTCDRKKDE
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180
pF1KB8 -----PADTQP--------------SASHPG-GQSLKLVVPDSTQNLEDR---EVLNGVQ
: ::. ::::: :. :. : . :: : .. ..
NP_001 NYRSLPRDTSNWSNQFQRDNARSSLSASHPMVGKWLEKQEQDEDGTEEDNSRVEPVGHAD
200 210 220 230 240 250
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 TELLTSPRTKDTLSDMTRTVEISGEGGPLGIHVVPFFSSLSGRILGLFIRGIEDNSRSKR
: : : .:.::.. ::. ..::::::::::: :. .:: :::... .: ......
NP_001 TGLEHIPNF--SLDDMVKLVEVPNDGGPLGIHVVPF-SARGGRTLGLLVKRLEKGGKAEH
260 270 280 290 300 310
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 EGLFHENECIVKINNVDLVDKTFAQAQDVFRQAMKSPSVLLHVLPPQNREQYEK-SVIGS
:.::.::.:::.::. :: .. : ::: .:::::..: . .::.: :.::::. : .
NP_001 ENLFRENDCIVRINDGDLRNRRFEQAQHMFRQAMRTPIIWFHVVPAANKEQYEQLSQSEK
320 330 340 350 360 370
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LNIFGNNDGVLKTKVPPPVHGKSGLKTANLTG--TDSPET-DASASLQQNKSPRVPRLGG
: ... . . . ...::.:.. . . :: :. . : .. : :
NP_001 NNYYSSRFSPDSQYIDNRSVNSAGLHTVQRAPRLNHPPEQIDSHSRLPHSAHPS----GK
380 390 400 410 420 430
370 380 390 400 410
pF1KB8 KPSSPSLSPLM--------GFGSNKNAKKIKIDLKKGPEGLGFTVVTRDSSIHGPGPIFV
::.:. .: :....: .:...:.:::: :::::....:: .: : .::.:
NP_001 PPSAPASAPQNVFSTTVSSGYNTKKIGKRLNIQLKKGTEGLGFSITSRDVTIGGSAPIYV
440 450 460 470 480 490
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 KNILPKGAAIKDGRLQSGDRILEVNGRDVTGRTQEELVAMLRSTKQGETASLVIARQEGH
:::::.::::.::::..:::..:::: :..:..:::.:..:::::. :.::.. :::
NP_001 KNILPRGAAIQDGRLKAGDRLIEVNGVDLVGKSQEEVVSLLRSTKMEGTVSLLVFRQEDA
500 510 520 530 540 550
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 FLPRELKGEPDCCALSLE-TSEQLTFEIPLNDSGSAGLGVSLKGNKSRETGTDLGIFIKS
: :::::.: . .:. . : : ::::.:::::::::::::.:::.:.:. .:::::.::
NP_001 FHPRELKAEDEDIVLTPDGTREFLTFEVPLNDSGSAGLGVSVKGNRSKENHADLGIFVKS
560 570 580 590 600 610
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 IIHGGAAFKDGRLRMNDQLIAVNGESLLGKSNHEAMETLRRSMSMEGNIRGMIQLVILRR
::.:::: ::::::.:::::::::::::::.:..:::::::::: ::: ::::::.. ::
NP_001 IINGGAASKDGRLRVNDQLIAVNGESLLGKTNQDAMETLRRSMSTEGNKRGMIQLIVARR
620 630 640 650 660 670
600 610 620 630
pF1KB8 ---------------PERPME---DPAECGAFSKPCFENCQNAVTTSRRNDNSILHPLGT
:: :.: : : .:. . . .. . :: .. . .:
NP_001 ISKCNELKSPGSPPGPELPIETALDDRE-RRISHSLYSGIEGLDESPSRN-AALSRIMGK
680 690 700 710 720
640 650 660 670 680
pF1KB8 --CSPQDKQKGLLLPNDGWA--ESEVPPSPTPHSALGLGLEDYSHSSGVDSAVYFPDQHI
:: . .:.: . :.. : :: : : : ::. :.. . .
NP_001 YQLSPT-----VNMPQDDTVIIEDDRLPVLPPH------LSDQSSSSSHDDVGFVTADAG
730 740 750 760 770
690 700 710 720 730
pF1KB8 NFR----------SVTPARQPESINLKASKSMDLVPDESKVHSLAGQKSESPSKDFGPTL
.. :..: .: . .. . ::.:.... ::. :::.: ::.:
NP_001 TWAKAAISDSADCSLSPDVDP-VLAFQREGFGRQIADETKLNTVDDQKAGSPSRDVGPSL
780 790 800 810 820 830
740 750 760 770 780 790
pF1KB8 GLKKSSSLESLQTAVAEVRKN-DLPFHRPRPHMVRGRGCNESFRAAIDKSYDGP------
:::::::::::::::::: : :.:::::::...:::::::::::::::::: :
NP_001 GLKKSSSLESLQTAVAEVTLNGDIPFHRPRPRIIRGRGCNESFRAAIDKSYDKPAVDDDD
840 850 860 870 880 890
800 810 820 830
pF1KB8 ---EEIEADGLSDKSSHSGQGALNCES-APQ--------GNSELEDMENKAR-KVKKTKE
: .: : ...::.::. ... : :. ::.: : .. . :. : :.
NP_001 EGMETLEED--TEESSRSGRESVSTASDQPSHSLERQMNGNQEKGDKTDRKKDKTGKEKK
900 910 920 930 940 950
840 850 860 870 880
pF1KB8 KEKKKEKGKLKVKE----------KKRKEENEDPERKIKKKGFGAMLRFGKK--KEDK--
:.. ::: :.:.:. . . . : ::. ... .. . : . .:.
NP_001 KDRDKEKDKMKAKKGMLKGLGDMFRIQAKTREFRERQARERDYAEIQDFHRTFGCDDELM
960 970 980 990 1000 1010
890 900 910 920
pF1KB8 -GGKAEQKGTL---------KHGGLREEELEKMKEER-------ESGRPTGGSTDRIQKL
:: . .:.. ..: . . ..:. : .:.: : .. ::::.:
NP_001 YGGVSSYEGSMALNARPQSPREGHMMDALYAQVKKPRNSKPSPVDSNRSTPSNHDRIQRL
1020 1030 1040 1050 1060 1070
930 940 950 960 970 980
pF1KB8 RKEYYQARREGFPLYEDDEGRARPSEYDLLWVPGRGP--DGNAHNLRFE-GMERQYASLP
:.:. ::... :: : : : .. : :. : ... :.. : :.::
NP_001 RQEFQQAKQD-----EDVEDRRRTYSFEQPW-PNARPATQSGRHSVSVEVQMQRQRQEER
1080 1090 1100 1110 1120
990 1000 1010 1020 1030 1040
pF1KB8 RGGPADPVDYLPAAPRGLYKERELPYYPGAHPMHPPKGSYPRPTELRVADLRYPQHYPPP
NP_001 ESSQQAQRQYSSLPRQSRKNASSVSQDSWEQNYSPGEGFQSAKENPRYSSYQGSRNGYLG
1130 1140 1150 1160 1170 1180
>>XP_011517880 (OMIM: 606745) PREDICTED: partitioning de (1298 aa)
initn: 1635 init1: 519 opt: 1021 Z-score: 506.9 bits: 105.8 E(85289): 1.7e-21
Smith-Waterman score: 2332; 41.6% identity (65.6% similar) in 1116 aa overlap (4-1000:4-1090)
10 20 30 40 50 60
pF1KB8 MKVTVCFGRTGIVVPCKEGQLRVGELTQQALQRYLKTREKGPGYWVKIHHLEYTDGGILD
::::::: .:::: .:...: : :::. :: :. : :.::...:.::. ::::::
XP_011 MKVTVCFGRTRVVVPCGDGHMKVFSLIQQAVTRYRKAIAKDPNYWIQVHRLEHGDGGILD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB8 PDDVLADVVEDKDKLIAVFEEQEPLHKIESPSGNPADRQSPDAFETEVAAQ-LAAFKPIG
::.: ::..:::.:.:::.::.: : .. :.. . :::. : .:.... ..::.:
XP_011 LDDILCDVADDKDRLVAVFDEQDPHHGGDGTSASSTGTQSPEIFGSELGTNNVSAFQPYQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KB8 G--EIEVTPSALKLGTPLLVRRSSDP----VPGPPADT-----QPSASHPGGQS-----L
. :::::::.:. . :: ::::::: . .:. .:: ..: : :
XP_011 ATSEIEVTPSVLRANMPLHVRRSSDPALIGLSTSVSDSNFSSEEPSRKNPTRWSTTAGFL
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210
pF1KB8 KLVVPDSTQNLEDREVLNGVQTE-LLTSPRTK-DT---------LSDMTRTVEISGEGGP
: . : .. ::. .:.. . . : . :: :.::.. ::. ..:::
XP_011 KQNTAGSPKTC-DRKDEDGTEEDNSRVEPVGHADTGLEHIPNFSLDDMVKLVEVPNDGGP
190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB8 LGIHVVPFFSSLSGRILGLFIRGIEDNSRSKREGLFHENECIVKINNVDLVDKTFAQAQD
:::::::: :. .:: :::... .: ......:.::.::.:::.::. :: .. : :::
XP_011 LGIHVVPF-SARGGRTLGLLVKRLEKGGKAEHENLFRENDCIVRINDGDLRNRRFEQAQH
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB8 VFRQAMKSPSVLLHVLPPQNREQYEK-SVIGSLNIFGNNDGVLKTKVPPPVHGKSGLKTA
.:::::..: . .::.: :.::::. : . : ... . . . ...::.:.
XP_011 MFRQAMRTPIIWFHVVPAANKEQYEQLSQSEKNNYYSSRFSPDSQYIDNRSVNSAGLHTV
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380
pF1KB8 NLTG--TDSPET-DASASLQQNKSPRVPRLGGKPSSPSLSPLM--------GFGSNKNAK
. . . :: :. . : .. : : ::.:. .: :....: .:
XP_011 QRAPRLNHPPEQIDSHSRLPHSAHPS----GKPPSAPASAPQNVFSTTVSSGYNTKKIGK
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KB8 KIKIDLKKGPEGLGFTVVTRDSSIHGPGPIFVKNILPKGAAIKDGRLQSGDRILEVNGRD
...:.:::: :::::....:: .: : .::.::::::.::::.::::..:::..:::: :
XP_011 RLNIQLKKGTEGLGFSITSRDVTIGGSAPIYVKNILPRGAAIQDGRLKAGDRLIEVNGVD
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490
pF1KB8 VTGRTQEELVAMLRSTKQGETASLVIARQEGHFLPRELKGEPDCCALSLE-TSEQLTFEI
..:..:::.:..:::::. :.::.. ::: : :::::.: . .:. . : : ::::.
XP_011 LVGKSQEEVVSLLRSTKMEGTVSLLVFRQEDAFHPRELKAEDEDIVLTPDGTREFLTFEV
480 490 500 510 520 530
500 510 520 530 540 550
pF1KB8 PLNDSGSAGLGVSLKGNKSRETGTDLGIFIKSIIHGGAAFKDGRLRMNDQLIAVNGESLL
:::::::::::::.:::.:.:. .:::::.::::.:::: ::::::.:::::::::::::
XP_011 PLNDSGSAGLGVSVKGNRSKENHADLGIFVKSIINGGAASKDGRLRVNDQLIAVNGESLL
540 550 560 570 580 590
560 570 580 590 600
pF1KB8 GKSNHEAMETLRRSMSMEGNIRGMIQLVILRR---------------PERPME---DPAE
::.:..:::::::::: ::: ::::::.. :: :: :.: : :
XP_011 GKTNQDAMETLRRSMSTEGNKRGMIQLIVARRISKCNELKSPGSPPGPELPIETALDDRE
600 610 620 630 640 650
610 620 630 640 650
pF1KB8 CGAFSKPCFENCQNAVTTSRRNDNSILHPLGTCSPQDKQKGLLLPNDGWAESE------V
.:. . . .. . :: .. . .: . . . . .:.: . : .
XP_011 -RRISHSLYSGIEGLDESPSRN-AALSRIMGESGKYQLSPTVNMPQDDTVIIEDDRLPVL
660 670 680 690 700 710
660 670 680 690
pF1KB8 PP------SPTPHSALGL-----GL---------EDYSHSSGVDSAVYFPDQHINFRSVT
:: : . :. .:. : : : : :: .. : . .. .:..
XP_011 PPHLSDQSSSSSHDDVGFVTADAGTWAKAAISDSADCSLSPDVDPVLAFQREGFGRQSMS
720 730 740 750 760 770
700 710 720 730 740
pF1KB8 PAR--------QPESINLKASKSMDLVPDESKVHSLAGQKSESPSKDFGPTLGLKKSSSL
: : . .. . ::::::: ::.:.... ::. :::.: ::.:::::::::
XP_011 EKRTKQFSDASQLDFVKTRKSKSMDLVADETKLNTVDDQKAGSPSRDVGPSLGLKKSSSL
780 790 800 810 820 830
750 760 770 780 790
pF1KB8 ESLQTAVAEVRKN-DLPFHRPRPHMVRGRGCNESFRAAIDKSYDGP---------EEIEA
:::::::::: : :.:::::::...:::::::::::::::::: : : .:
XP_011 ESLQTAVAEVTLNGDIPFHRPRPRIIRGRGCNESFRAAIDKSYDKPAVDDDDEGMETLEE
840 850 860 870 880 890
800 810 820 830 840 850
pF1KB8 DGLSDKSSHSGQGALNCESAPQGNSELEDMENKARKVKKTKEKEKKKEKGKLKVKEKKRK
: ...::.::. ... : ..: ..:... .: :: ..::.: ::::.
XP_011 D--TEESSRSGRESVSTASDQPSHSLERQMNGNQEKGDKT---DRKKDKTG---KEKKKD
900 910 920 930 940
860 870 880 890 900 910
pF1KB8 EENEDPERKIKK---KGFGAMLRFGKKKEDKGGKAEQKGTLK--HGGLREEELEKMKEER
...: . : :: ::.: :.::::...: : :. : .: .. ::: .::.:.
XP_011 RDKEKDKMKAKKGMLKGLGDMFRFGKHRKD--DKIEKTGKIKIQESFTSEEERIRMKQEQ
950 960 970 980 990 1000
920 930 940 950 960
pF1KB8 ESGRPTGGSTDRIQKLRKEYY--QARREGFPLYEDDEGRARPSEYDLLWVPGRGPDGN-A
: ::: .:. :::.. . .: :. . .:.. . .:. :
XP_011 E----------RIQAKTREFRERQARERDYAEIQD-FHRTFGCDDELMYGGVSSYEGSMA
1010 1020 1030 1040 1050
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB8 HNLR----FEG--MERQYASL--PRGGPADPVDYLPAAPRGLYKERELPYYPGAHPMHPP
: : :: :. ::.. ::.. .::: ..:
XP_011 LNARPQSPREGHMMDALYAQVKKPRNSKPSPVDSNRSTPSNHDRIQRLRQEFQQAKQDED
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB8 KGSYPRPTELRVADLRYPQHYPPPPAPQHKGPFRQDVPPSPPQHQRMPAYQETGRPGPRG
XP_011 VEDRRRTYSFEQPWPNARPATQSGRHSVSVEVQMQRQRQEERESSQQAQRQYSSLPRQSR
1120 1130 1140 1150 1160 1170
>>NP_001171717 (OMIM: 606745) partitioning defective 3 h (1310 aa)
initn: 1700 init1: 519 opt: 1021 Z-score: 506.8 bits: 105.8 E(85289): 1.7e-21
Smith-Waterman score: 2035; 39.8% identity (62.6% similar) in 1097 aa overlap (48-1000:48-1102)
20 30 40 50 60 70
pF1KB8 EGQLRVGELTQQALQRYLKTREKGPGYWVKIHHLEYTDGGILDPDDVLADVVEDKDKLIA
.:.::. :::::: ::.: ::..:::.:.:
NP_001 DGHMKVFSLIQQAVTRYRKAIAKDPNYWIQVHRLEHGDGGILDLDDILCDVADDKDRLVA
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KB8 VFEEQEPLHKIESPSGNPADRQSPDAFETEVAAQ-LAAFKPIGG--EIEVTPSALKLGTP
::.::.: : .. :.. . :::. : .:.... ..::.: . :::::::.:. . :
NP_001 VFDEQDPHHGGDGTSASSTGTQSPEIFGSELGTNNVSAFQPYQATSEIEVTPSVLRANMP
80 90 100 110 120 130
140
pF1KB8 LLVRRSSDPV-----------------PG---P---------------------------
: :::::::. :. :
NP_001 LHVRRSSDPALIGLSTSVSDSNFSSEEPSRKNPTRWSTTAGFLKQNTAGSPKTCDRKKDE
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180
pF1KB8 -----PADTQP--------------SASHPG-GQSLKLVVPDSTQNLEDR---EVLNGVQ
: ::. ::::: :. :. : . :: : .. ..
NP_001 NYRSLPRDTSNWSNQFQRDNARSSLSASHPMVGKWLEKQEQDEDGTEEDNSRVEPVGHAD
200 210 220 230 240 250
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 TELLTSPRTKDTLSDMTRTVEISGEGGPLGIHVVPFFSSLSGRILGLFIRGIEDNSRSKR
: : : .:.::.. ::. ..::::::::::: :. .:: :::... .: ......
NP_001 TGLEHIPNF--SLDDMVKLVEVPNDGGPLGIHVVPF-SARGGRTLGLLVKRLEKGGKAEH
260 270 280 290 300 310
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 EGLFHENECIVKINNVDLVDKTFAQAQDVFRQAMKSPSVLLHVLPPQNREQYEK-SVIGS
:.::.::.:::.::. :: .. : ::: .:::::..: . .::.: :.::::. : .
NP_001 ENLFRENDCIVRINDGDLRNRRFEQAQHMFRQAMRTPIIWFHVVPAANKEQYEQLSQSEK
320 330 340 350 360 370
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LNIFGNNDGVLKTKVPPPVHGKSGLKTANLTG--TDSPET-DASASLQQNKSPRVPRLGG
: ... . . . ...::.:.. . . :: :. . : .. : :
NP_001 NNYYSSRFSPDSQYIDNRSVNSAGLHTVQRAPRLNHPPEQIDSHSRLPHSAHPS----GK
380 390 400 410 420 430
370 380 390 400 410
pF1KB8 KPSSPSLSPLM--------GFGSNKNAKKIKIDLKKGPEGLGFTVVTRDSSIHGPGPIFV
::.:. .: :....: .:...:.:::: :::::....:: .: : .::.:
NP_001 PPSAPASAPQNVFSTTVSSGYNTKKIGKRLNIQLKKGTEGLGFSITSRDVTIGGSAPIYV
440 450 460 470 480 490
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 KNILPKGAAIKDGRLQSGDRILEVNGRDVTGRTQEELVAMLRSTKQGETASLVIARQEGH
:::::.::::.::::..:::..:::: :..:..:::.:..:::::. :.::.. :::
NP_001 KNILPRGAAIQDGRLKAGDRLIEVNGVDLVGKSQEEVVSLLRSTKMEGTVSLLVFRQEDA
500 510 520 530 540 550
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 FLPRELKGEPDCCALSLE-TSEQLTFEIPLNDSGSAGLGVSLKGNKSRETGTDLGIFIKS
: :::::.: . .:. . : : ::::.:::::::::::::.:::.:.:. .:::::.::
NP_001 FHPRELKAEDEDIVLTPDGTREFLTFEVPLNDSGSAGLGVSVKGNRSKENHADLGIFVKS
560 570 580 590 600 610
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 IIHGGAAFKDGRLRMNDQLIAVNGESLLGKSNHEAMETLRRSMSMEGNIRGMIQLVILRR
::.:::: ::::::.:::::::::::::::.:..:::::::::: ::: ::::::.. ::
NP_001 IINGGAASKDGRLRVNDQLIAVNGESLLGKTNQDAMETLRRSMSTEGNKRGMIQLIVARR
620 630 640 650 660 670
600 610 620 630
pF1KB8 ---------------PERPME---DPAECGAFSKPCFENCQNAVTTSRRNDNSILHPLGT
:: :.: : : .:. . . .. . :: .. . .:
NP_001 ISKCNELKSPGSPPGPELPIETALDDRE-RRISHSLYSGIEGLDESPSRN-AALSRIMGK
680 690 700 710 720
640 650 660 670 680
pF1KB8 --CSPQDKQKGLLLPNDGWA--ESEVPPSPTPHSALGLGLEDYSHSSGVDSAVYFPDQHI
:: . .:.: . :.. : :: : : : ::. :.. . .
NP_001 YQLSPT-----VNMPQDDTVIIEDDRLPVLPPH------LSDQSSSSSHDDVGFVTADAG
730 740 750 760 770
690 700 710 720 730
pF1KB8 NFR----------SVTPARQPESINLKASKSMDLVPDESKVHSLAGQKSESPSKDFGPTL
.. :..: .: . .. . ::.:.... ::. :::.: ::.:
NP_001 TWAKAAISDSADCSLSPDVDP-VLAFQREGFGRQIADETKLNTVDDQKAGSPSRDVGPSL
780 790 800 810 820 830
740 750 760 770 780 790
pF1KB8 GLKKSSSLESLQTAVAEVRKN-DLPFHRPRPHMVRGRGCNESFRAAIDKSYDGP------
:::::::::::::::::: : :.:::::::...:::::::::::::::::: :
NP_001 GLKKSSSLESLQTAVAEVTLNGDIPFHRPRPRIIRGRGCNESFRAAIDKSYDKPAVDDDD
840 850 860 870 880 890
800 810 820 830 840
pF1KB8 ---EEIEADGLSDKSSHSGQGALNCESAPQGNSELEDMENKARKVKKTKEKEKKKEKGKL
: .: : ...::.::. ... : ..: ..:... .: :: ..::.:
NP_001 EGMETLEED--TEESSRSGRESVSTASDQPSHSLERQMNGNQEKGDKT---DRKKDKTG-
900 910 920 930 940 950
850 860 870 880 890 900
pF1KB8 KVKEKKRKEENEDPERKIKK---KGFGAMLRFGKKKEDKGGKAEQKGTLK--HGGLREEE
::::. ...: . : :: ::.: :.::::...: : :. : .: .. :::
NP_001 --KEKKKDRDKEKDKMKAKKGMLKGLGDMFRFGKHRKDD--KIEKTGKIKIQESFTSEEE
960 970 980 990 1000
910 920 930 940 950 960
pF1KB8 LEKMKEERESGRPTGGSTDRIQKLRKEYY--QARREGFPLYEDDEGRARPSEYDLLWVPG
.::.:.: ::: .:. :::.. . .: . :. . .:..
NP_001 RIRMKQEQE----------RIQAKTREFRERQARERDYAEIQDFH-RTFGCDDELMYGGV
1010 1020 1030 1040 1050
970 980 990 1000 1010
pF1KB8 RGPDGN-AHNLR----FEG--MERQYASL--PRGGPADPVDYLPAAPRGLYKERELPYYP
. .:. : : : :: :. ::.. ::.. .::: ..:
NP_001 SSYEGSMALNARPQSPREGHMMDALYAQVKKPRNSKPSPVDSNRSTPSNHDRIQRLRQEF
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB8 GAHPMHPPKGSYPRPTELRVADLRYPQHYPPPPAPQHKGPFRQDVPPSPPQHQRMPAYQE
NP_001 QQAKQDEDVEDRRRTYSFEQPWPNARPATQSGRHSVSVEVQMQRQRQEERESSQQAQRQY
1120 1130 1140 1150 1160 1170
>>NP_001171715 (OMIM: 606745) partitioning defective 3 h (1340 aa)
initn: 1590 init1: 519 opt: 1021 Z-score: 506.7 bits: 105.8 E(85289): 1.7e-21
Smith-Waterman score: 2064; 39.8% identity (62.4% similar) in 1119 aa overlap (48-1000:48-1132)
20 30 40 50 60 70
pF1KB8 EGQLRVGELTQQALQRYLKTREKGPGYWVKIHHLEYTDGGILDPDDVLADVVEDKDKLIA
.:.::. :::::: ::.: ::..:::.:.:
NP_001 DGHMKVFSLIQQAVTRYRKAIAKDPNYWIQVHRLEHGDGGILDLDDILCDVADDKDRLVA
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KB8 VFEEQEPLHKIESPSGNPADRQSPDAFETEVAAQ-LAAFKPIGG--EIEVTPSALKLGTP
::.::.: : .. :.. . :::. : .:.... ..::.: . :::::::.:. . :
NP_001 VFDEQDPHHGGDGTSASSTGTQSPEIFGSELGTNNVSAFQPYQATSEIEVTPSVLRANMP
80 90 100 110 120 130
140
pF1KB8 LLVRRSSDPV-----------------PG---P---------------------------
: :::::::. :. :
NP_001 LHVRRSSDPALIGLSTSVSDSNFSSEEPSRKNPTRWSTTAGFLKQNTAGSPKTCDRKKDE
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180
pF1KB8 -----PADTQP--------------SASHPG-GQSLKLVVPDSTQNLEDR---EVLNGVQ
: ::. ::::: :. :. : . :: : .. ..
NP_001 NYRSLPRDTSNWSNQFQRDNARSSLSASHPMVGKWLEKQEQDEDGTEEDNSRVEPVGHAD
200 210 220 230 240 250
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 TELLTSPRTKDTLSDMTRTVEISGEGGPLGIHVVPFFSSLSGRILGLFIRGIEDNSRSKR
: : : .:.::.. ::. ..::::::::::: :. .:: :::... .: ......
NP_001 TGLEHIPNF--SLDDMVKLVEVPNDGGPLGIHVVPF-SARGGRTLGLLVKRLEKGGKAEH
260 270 280 290 300 310
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 EGLFHENECIVKINNVDLVDKTFAQAQDVFRQAMKSPSVLLHVLPPQNREQYEK-SVIGS
:.::.::.:::.::. :: .. : ::: .:::::..: . .::.: :.::::. : .
NP_001 ENLFRENDCIVRINDGDLRNRRFEQAQHMFRQAMRTPIIWFHVVPAANKEQYEQLSQSEK
320 330 340 350 360 370
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LNIFGNNDGVLKTKVPPPVHGKSGLKTANLTG--TDSPET-DASASLQQNKSPRVPRLGG
: ... . . . ...::.:.. . . :: :. . : .. : :
NP_001 NNYYSSRFSPDSQYIDNRSVNSAGLHTVQRAPRLNHPPEQIDSHSRLPHSAHPS----GK
380 390 400 410 420 430
370 380 390 400 410
pF1KB8 KPSSPSLSPLM--------GFGSNKNAKKIKIDLKKGPEGLGFTVVTRDSSIHGPGPIFV
::.:. .: :....: .:...:.:::: :::::....:: .: : .::.:
NP_001 PPSAPASAPQNVFSTTVSSGYNTKKIGKRLNIQLKKGTEGLGFSITSRDVTIGGSAPIYV
440 450 460 470 480 490
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 KNILPKGAAIKDGRLQSGDRILEVNGRDVTGRTQEELVAMLRSTKQGETASLVIARQEGH
:::::.::::.::::..:::..:::: :..:..:::.:..:::::. :.::.. :::
NP_001 KNILPRGAAIQDGRLKAGDRLIEVNGVDLVGKSQEEVVSLLRSTKMEGTVSLLVFRQEDA
500 510 520 530 540 550
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 FLPRELKGEPDCCALSLE-TSEQLTFEIPLNDSGSAGLGVSLKGNKSRETGTDLGIFIKS
: :::::.: . .:. . : : ::::.:::::::::::::.:::.:.:. .:::::.::
NP_001 FHPRELKAEDEDIVLTPDGTREFLTFEVPLNDSGSAGLGVSVKGNRSKENHADLGIFVKS
560 570 580 590 600 610
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 IIHGGAAFKDGRLRMNDQLIAVNGESLLGKSNHEAMETLRRSMSMEGNIRGMIQLVILRR
::.:::: ::::::.:::::::::::::::.:..:::::::::: ::: ::::::.. ::
NP_001 IINGGAASKDGRLRVNDQLIAVNGESLLGKTNQDAMETLRRSMSTEGNKRGMIQLIVARR
620 630 640 650 660 670
600 610 620 630
pF1KB8 ---------------PERPME---DPAECGAFSKPCFENCQNAVTTSRRNDNSILHPLGT
:: :.: : : .:. . . .. . :: .. . .:
NP_001 ISKCNELKSPGSPPGPELPIETALDDRE-RRISHSLYSGIEGLDESPSRN-AALSRIMGK
680 690 700 710 720
640 650 660
pF1KB8 CS-------PQDKQKGLLLPNDGWAESEVPP------SPTPHSALGL-----GL------
. ::: ... .: .:: : . :. .:. :
NP_001 YQLSPTVNMPQDDT--VIIEDDRLPV--LPPHLSDQSSSSSHDDVGFVTADAGTWAKAAI
730 740 750 760 770 780
670 680 690 700 710
pF1KB8 ---EDYSHSSGVDSAVYFPDQHINFRSVTPAR--------QPESINLKASKSMDL-VPDE
: : : :: .. : . .. .:.. : : . .. . :::::: . ::
NP_001 SDSADCSLSPDVDPVLAFQREGFGRQSMSEKRTKQFSDASQLDFVKTRKSKSMDLGIADE
790 800 810 820 830 840
720 730 740 750 760 770
pF1KB8 SKVHSLAGQKSESPSKDFGPTLGLKKSSSLESLQTAVAEVRKN-DLPFHRPRPHMVRGRG
.:.... ::. :::.: ::.::::::::::::::::::: : :.:::::::...::::
NP_001 TKLNTVDDQKAGSPSRDVGPSLGLKKSSSLESLQTAVAEVTLNGDIPFHRPRPRIIRGRG
850 860 870 880 890 900
780 790 800 810 820
pF1KB8 CNESFRAAIDKSYDGP---------EEIEADGLSDKSSHSGQGALNCESAPQGNSELEDM
:::::::::::::: : : .: : ...::.::. ... : ..: ..:
NP_001 CNESFRAAIDKSYDKPAVDDDDEGMETLEED--TEESSRSGRESVSTASDQPSHSLERQM
910 920 930 940 950 960
830 840 850 860 870 880
pF1KB8 ENKARKVKKTKEKEKKKEKGKLKVKEKKRKEENEDPERKIKK---KGFGAMLRFGKKKED
... .: :: ..::.: ::::. ...: . : :: ::.: :.::::...:
NP_001 NGNQEKGDKT---DRKKDKTG---KEKKKDRDKEKDKMKAKKGMLKGLGDMFRFGKHRKD
970 980 990 1000 1010
890 900 910 920 930 940
pF1KB8 KGGKAEQKGTLK--HGGLREEELEKMKEERESGRPTGGSTDRIQKLRKEYY--QARREGF
: :. : .: .. ::: .::.:.: ::: .:. :::.. .
NP_001 D--KIEKTGKIKIQESFTSEEERIRMKQEQE----------RIQAKTREFRERQARERDY
1020 1030 1040 1050 1060
950 960 970 980 990
pF1KB8 PLYEDDEGRARPSEYDLLWVPGRGPDGN-AHNLR----FEG--MERQYASL--PRGGPAD
.: . :. . .:.. . .:. : : : :: :. ::.. ::.. .
NP_001 AEIQDFH-RTFGCDDELMYGGVSSYEGSMALNARPQSPREGHMMDALYAQVKKPRNSKPS
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KB8 PVDYLPAAPRGLYKERELPYYPGAHPMHPPKGSYPRPTELRVADLRYPQHYPPPPAPQHK
::: ..:
NP_001 PVDSNRSTPSNHDRIQRLRQEFQQAKQDEDVEDRRRTYSFEQPWPNARPATQSGRHSVSV
1130 1140 1150 1160 1170 1180
>>XP_011517872 (OMIM: 606745) PREDICTED: partitioning de (1343 aa)
initn: 1590 init1: 519 opt: 1021 Z-score: 506.7 bits: 105.8 E(85289): 1.8e-21
Smith-Waterman score: 2073; 39.7% identity (62.5% similar) in 1118 aa overlap (48-1000:48-1135)
20 30 40 50 60 70
pF1KB8 EGQLRVGELTQQALQRYLKTREKGPGYWVKIHHLEYTDGGILDPDDVLADVVEDKDKLIA
.:.::. :::::: ::.: ::..:::.:.:
XP_011 DGHMKVFSLIQQAVTRYRKAIAKDPNYWIQVHRLEHGDGGILDLDDILCDVADDKDRLVA
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KB8 VFEEQEPLHKIESPSGNPADRQSPDAFETEVAAQ-LAAFKPIGG--EIEVTPSALKLGTP
::.::.: : .. :.. . :::. : .:.... ..::.: . :::::::.:. . :
XP_011 VFDEQDPHHGGDGTSASSTGTQSPEIFGSELGTNNVSAFQPYQATSEIEVTPSVLRANMP
80 90 100 110 120 130
140
pF1KB8 LLVRRSSDPV-----------------PG---P---------------------------
: :::::::. :. :
XP_011 LHVRRSSDPALIGLSTSVSDSNFSSEEPSRKNPTRWSTTAGFLKQNTAGSPKTCDRKKDE
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180
pF1KB8 -----PADTQP--------------SASHPG-GQSLKLVVPDSTQNLEDR---EVLNGVQ
: ::. ::::: :. :. : . :: : .. ..
XP_011 NYRSLPRDTSNWSNQFQRDNARSSLSASHPMVGKWLEKQEQDEDGTEEDNSRVEPVGHAD
200 210 220 230 240 250
190 200 210 220 230 240
pF1KB8 TELLTSPRTKDTLSDMTRTVEISGEGGPLGIHVVPFFSSLSGRILGLFIRGIEDNSRSKR
: : : .:.::.. ::. ..::::::::::: :. .:: :::... .: ......
XP_011 TGLEHIPNF--SLDDMVKLVEVPNDGGPLGIHVVPF-SARGGRTLGLLVKRLEKGGKAEH
260 270 280 290 300 310
250 260 270 280 290 300
pF1KB8 EGLFHENECIVKINNVDLVDKTFAQAQDVFRQAMKSPSVLLHVLPPQNREQYEK-SVIGS
:.::.::.:::.::. :: .. : ::: .:::::..: . .::.: :.::::. : .
XP_011 ENLFRENDCIVRINDGDLRNRRFEQAQHMFRQAMRTPIIWFHVVPAANKEQYEQLSQSEK
320 330 340 350 360 370
310 320 330 340 350 360
pF1KB8 LNIFGNNDGVLKTKVPPPVHGKSGLKTANLTG--TDSPET-DASASLQQNKSPRVPRLGG
: ... . . . ...::.:.. . . :: :. . : .. : :
XP_011 NNYYSSRFSPDSQYIDNRSVNSAGLHTVQRAPRLNHPPEQIDSHSRLPHSAHPS----GK
380 390 400 410 420 430
370 380 390 400 410
pF1KB8 KPSSPSLSPLM--------GFGSNKNAKKIKIDLKKGPEGLGFTVVTRDSSIHGPGPIFV
::.:. .: :....: .:...:.:::: :::::....:: .: : .::.:
XP_011 PPSAPASAPQNVFSTTVSSGYNTKKIGKRLNIQLKKGTEGLGFSITSRDVTIGGSAPIYV
440 450 460 470 480 490
420 430 440 450 460 470
pF1KB8 KNILPKGAAIKDGRLQSGDRILEVNGRDVTGRTQEELVAMLRSTKQGETASLVIARQEGH
:::::.::::.::::..:::..:::: :..:..:::.:..:::::. :.::.. :::
XP_011 KNILPRGAAIQDGRLKAGDRLIEVNGVDLVGKSQEEVVSLLRSTKMEGTVSLLVFRQEDA
500 510 520 530 540 550
480 490 500 510 520 530
pF1KB8 FLPRELKGEPDCCALSLE-TSEQLTFEIPLNDSGSAGLGVSLKGNKSRETGTDLGIFIKS
: :::::.: . .:. . : : ::::.:::::::::::::.:::.:.:. .:::::.::
XP_011 FHPRELKAEDEDIVLTPDGTREFLTFEVPLNDSGSAGLGVSVKGNRSKENHADLGIFVKS
560 570 580 590 600 610
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 IIHGGAAFKDGRLRMNDQLIAVNGESLLGKSNHEAMETLRRSMSMEGNIRGMIQLVILRR
::.:::: ::::::.:::::::::::::::.:..:::::::::: ::: ::::::.. ::
XP_011 IINGGAASKDGRLRVNDQLIAVNGESLLGKTNQDAMETLRRSMSTEGNKRGMIQLIVARR
620 630 640 650 660 670
600 610 620 630
pF1KB8 ---------------PERPME---DPAECGAFSKPCFENCQNAVTTSRRNDNSILHPLGT
:: :.: : : .:. . . .. . :: .. . .:
XP_011 ISKCNELKSPGSPPGPELPIETALDDRE-RRISHSLYSGIEGLDESPSRN-AALSRIMGE
680 690 700 710 720
640 650 660
pF1KB8 CSPQDKQKGLLLPNDGWAESE------VPP------SPTPHSALGL-----GL-------
. . . . .:.: . : .:: : . :. .:. :
XP_011 SGKYQLSPTVNMPQDDTVIIEDDRLPVLPPHLSDQSSSSSHDDVGFVTADAGTWAKAAIS
730 740 750 760 770 780
670 680 690 700 710
pF1KB8 --EDYSHSSGVDSAVYFPDQHINFRSVTPAR--------QPESINLKASKSMDL-VPDES
: : : :: .. : . .. .:.. : : . .. . :::::: . ::.
XP_011 DSADCSLSPDVDPVLAFQREGFGRQSMSEKRTKQFSDASQLDFVKTRKSKSMDLGIADET
790 800 810 820 830 840
720 730 740 750 760 770
pF1KB8 KVHSLAGQKSESPSKDFGPTLGLKKSSSLESLQTAVAEVRKN-DLPFHRPRPHMVRGRGC
:.... ::. :::.: ::.::::::::::::::::::: : :.:::::::...:::::
XP_011 KLNTVDDQKAGSPSRDVGPSLGLKKSSSLESLQTAVAEVTLNGDIPFHRPRPRIIRGRGC
850 860 870 880 890 900
780 790 800 810 820
pF1KB8 NESFRAAIDKSYDGP---------EEIEADGLSDKSSHSGQGALNCESAPQGNSELEDME
::::::::::::: : : .: : ...::.::. ... : ..: ..:.
XP_011 NESFRAAIDKSYDKPAVDDDDEGMETLEED--TEESSRSGRESVSTASDQPSHSLERQMN
910 920 930 940 950 960
830 840 850 860 870 880
pF1KB8 NKARKVKKTKEKEKKKEKGKLKVKEKKRKEENEDPERKIKK---KGFGAMLRFGKKKEDK
.. .: :: ..::.: ::::. ...: . : :: ::.: :.::::...:
XP_011 GNQEKGDKT---DRKKDKTG---KEKKKDRDKEKDKMKAKKGMLKGLGDMFRFGKHRKDD
970 980 990 1000 1010 1020
890 900 910 920 930 940
pF1KB8 GGKAEQKGTLK--HGGLREEELEKMKEERESGRPTGGSTDRIQKLRKEYY--QARREGFP
: :. : .: .. ::: .::.:.: ::: .:. :::.. .
XP_011 --KIEKTGKIKIQESFTSEEERIRMKQEQE----------RIQAKTREFRERQARERDYA
1030 1040 1050 1060
950 960 970 980 990
pF1KB8 LYEDDEGRARPSEYDLLWVPGRGPDGN-AHNLR----FEG--MERQYASL--PRGGPADP
.: . :. . .:.. . .:. : : : :: :. ::.. ::.. .:
XP_011 EIQDFH-RTFGCDDELMYGGVSSYEGSMALNARPQSPREGHMMDALYAQVKKPRNSKPSP
1070 1080 1090 1100 1110 1120
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KB8 VDYLPAAPRGLYKERELPYYPGAHPMHPPKGSYPRPTELRVADLRYPQHYPPPPAPQHKG
:: ..:
XP_011 VDSNRSTPSNHDRIQRLRQEFQQAKQDEDVEDRRRTYSFEQPWPNARPATQSGRHSVSVE
1130 1140 1150 1160 1170 1180
>>XP_011517874 (OMIM: 606745) PREDICTED: partitioning de (1340 aa)
initn: 1665 init1: 519 opt: 547 Z-score: 280.4 bits: 64.0 E(85289): 7e-09
Smith-Waterman score: 1935; 38.9% identity (61.6% similar) in 1106 aa overlap (62-1000:62-1132)
40 50 60 70 80 90
pF1KB8 QRYLKTREKGPGYWVKIHHLEYTDGGILDPDDVLADVVEDKDKLIAVFEEQEPLHKIESP
::.: ::..:::.:.:::.::.: : ..
XP_011 TRYRKAIAKDPNYWIQVHRLEHGDGGILDLDDILCDVADDKDRLVAVFDEQDPHHGGDGT
40 50 60 70 80 90
100 110 120 130 140
pF1KB8 SGNPADRQSPDAFETEVAAQ-LAAFKPIGG--EIEVTPSALKLGTPLLVRRSSDPV----
:.. . :::. : .:.... ..::.: . :::::::.:. . :: :::::::.
XP_011 SASSTGTQSPEIFGSELGTNNVSAFQPYQATSEIEVTPSVLRANMPLHVRRSSDPALIGL
100 110 120 130 140 150
150
pF1KB8 -------------PG---P--------------------------------PADTQP---
:. : : ::.
XP_011 STSVSDSNFSSEEPSRKNPTRWSTTAGFLKQNTAGSPKTCDRKKDENYRSLPRDTSNWSN
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190
pF1KB8 -----------SASHPG-GQSLKLVVPDSTQNLEDR---EVLNGVQTELLTSPRTKDTLS
::::: :. :. : . :: : .. ..: : : .:.
XP_011 QFQRDNARSSLSASHPMVGKWLEKQEQDEDGTEEDNSRVEPVGHADTGLEHIPNF--SLD
220 230 240 250 260
200 210 220 230 240 250
pF1KB8 DMTRTVEISGEGGPLGIHVVPFFSSLSGRILGLFIRGIEDNSRSKREGLFHENECIVKIN
::.. ::. ..::::::::::: :. .:: :::... .: ......:.::.::.:::.::
XP_011 DMVKLVEVPNDGGPLGIHVVPF-SARGGRTLGLLVKRLEKGGKAEHENLFRENDCIVRIN
270 280 290 300 310 320
260 270 280 290 300 310
pF1KB8 NVDLVDKTFAQAQDVFRQAMKSPSVLLHVLPPQNREQYEK-SVIGSLNIFGNNDGVLKTK
. :: .. : ::: .:::::..: . .::.: :.::::. : . : ... . .
XP_011 DGDLRNRRFEQAQHMFRQAMRTPIIWFHVVPAANKEQYEQLSQSEKNNYYSSRFSPDSQY
330 340 350 360 370 380
320 330 340 350 360 370
pF1KB8 VPPPVHGKSGLKTANLTG--TDSPET-DASASLQQNKSPRVPRLGGKPSSPSLSPLM---
. ...::.:.. . . :: :. . : .. : : ::.:. .:
XP_011 IDNRSVNSAGLHTVQRAPRLNHPPEQIDSHSRLPHSAHPS----GKPPSAPASAPQNVFS
390 400 410 420 430 440
380 390 400 410 420
pF1KB8 -----GFGSNKNAKKIKIDLKKGPEGLGFTVVTRDSSIHGPGPIFVKNILPKGAAIKDGR
:....: .:...:.:::: :::::....:: .: : .::.::::::.::::.:::
XP_011 TTVSSGYNTKKIGKRLNIQLKKGTEGLGFSITSRDVTIGGSAPIYVKNILPRGAAIQDGR
450 460 470 480 490 500
430 440 450 460 470 480
pF1KB8 LQSGDRILEVNGRDVTGRTQEELVAMLRSTKQGETASLVIARQEGHFLPRELKGEPDCCA
:..:::..:::: :..:..:::.:..:::::. :.::.. ::: : ::::..::.
XP_011 LKAGDRLIEVNGVDLVGKSQEEVVSLLRSTKMEGTVSLLVFRQEDAFHPRELNAEPSQMQ
510 520 530 540 550 560
490 500 510 520 530
pF1KB8 LSLETS--------------EQLTFEIPLNDSGSAGLGVSLKGNKSRETGTDLGIFIKSI
. ::. : ::::.:::::::::::::.:::.:.:. .:::::.:::
XP_011 IPKETKAEDEDIVLTPDGTREFLTFEVPLNDSGSAGLGVSVKGNRSKENHADLGIFVKSI
570 580 590 600 610 620
540 550 560 570 580 590
pF1KB8 IHGGAAFKDGRLRMNDQLIAVNGESLLGKSNHEAMETLRRSMSMEGNIRGMIQLVILRR-
:.:::: ::::::.:::::::::::::::.:..:::::::::: ::: ::::::.. ::
XP_011 INGGAASKDGRLRVNDQLIAVNGESLLGKTNQDAMETLRRSMSTEGNKRGMIQLIVARRI
630 640 650 660 670 680
600 610 620 630
pF1KB8 --------------PERPME---DPAECGAFSKPCFENCQNAVTTSRRNDNSILHPLGTC
:: :.: : : .:. . . .. . :: .. . .:
XP_011 SKCNELKSPGSPPGPELPIETALDDRE-RRISHSLYSGIEGLDESPSRN-AALSRIMGES
690 700 710 720 730 740
640 650 660 670
pF1KB8 SPQDKQKGLLLPNDGWAESE------VPP------SPTPHSALGLGLED---YSHSSGVD
. . . . .:.: . : .:: : . :. .:. : ..... :
XP_011 GKYQLSPTVNMPQDDTVIIEDDRLPVLPPHLSDQSSSSSHDDVGFVTADAGTWAKAAISD
750 760 770 780 790 800
680 690 700 710 720 730
pF1KB8 SA--VYFPDQH--INFRSVTPARQPESINLKASKSMDLVPDESKVHSLAGQKSES-----
:: :: . :. .:: :.. : .:... : :.. . .::.:
XP_011 SADCSLSPDVDPVLAFQREGFGRQ--SMSEKRTKQFS---DASQLDFVKTRKSKSMDLGS
810 820 830 840 850
740 750 760 770 780
pF1KB8 PSKDFGPTLGLKKSSSLESLQTAVAEVRKN-DLPFHRPRPHMVRGRGCNESFRAAIDKSY
::.: ::.::::::::::::::::::: : :.:::::::...:::::::::::::::::
XP_011 PSRDVGPSLGLKKSSSLESLQTAVAEVTLNGDIPFHRPRPRIIRGRGCNESFRAAIDKSY
860 870 880 890 900 910
790 800 810 820 830 840
pF1KB8 DGP---------EEIEADGLSDKSSHSGQGALNCESAPQGNSELEDMENKARKVKKTKEK
: : : .: : ...::.::. ... : ..: ..:... .: ::
XP_011 DKPAVDDDDEGMETLEED--TEESSRSGRESVSTASDQPSHSLERQMNGNQEKGDKT---
920 930 940 950 960 970
850 860 870 880 890
pF1KB8 EKKKEKGKLKVKEKKRKEENEDPERKIKK---KGFGAMLRFGKKKEDKGGKAEQKGTLK-
..::.: ::::. ...: . : :: ::.: :.::::...: : :. : .:
XP_011 DRKKDKTG---KEKKKDRDKEKDKMKAKKGMLKGLGDMFRFGKHRKDD--KIEKTGKIKI
980 990 1000 1010 1020
900 910 920 930 940 950
pF1KB8 -HGGLREEELEKMKEERESGRPTGGSTDRIQKLRKEYY--QARREGFPLYEDDEGRARPS
.. ::: .::.:.: ::: .:. :::.. . .: :.
XP_011 QESFTSEEERIRMKQEQE----------RIQAKTREFRERQARERDYAEIQD-FHRTFGC
1030 1040 1050 1060 1070
960 970 980 990 1000
pF1KB8 EYDLLWVPGRGPDGN-AHNLR----FEG--MERQYASL--PRGGPADPVDYLPAAPRGLY
. .:.. . .:. : : : :: :. ::.. ::.. .::: ..:
XP_011 DDELMYGGVSSYEGSMALNARPQSPREGHMMDALYAQVKKPRNSKPSPVDSNRSTPSNHD
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KB8 KERELPYYPGAHPMHPPKGSYPRPTELRVADLRYPQHYPPPPAPQHKGPFRQDVPPSPPQ
XP_011 RIQRLRQEFQQAKQDEDVEDRRRTYSFEQPWPNARPATQSGRHSVSVEVQMQRQRQEERE
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1104 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 11:00:25 2016 done: Sun Nov 6 11:00:28 2016
Total Scan time: 18.020 Total Display time: 0.440
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]