FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6638, 237 aa 1>>>pF1KE6638 237 - 237 aa - 237 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0719+/-0.000853; mu= 15.3842+/- 0.051 mean_var=63.4242+/-12.671, 0's: 0 Z-trim(106.2): 27 B-trim: 138 in 1/47 Lambda= 0.161045 statistics sampled from 8833 (8860) to 8833 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.655), E-opt: 0.2 (0.272), width: 16 Scan time: 1.610 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS41866.1 GALNT9 gene_id:50614|Hs108|chr12 ( 237) 1656 393.2 7.8e-110 CCDS81755.1 GALNT9 gene_id:50614|Hs108|chr12 ( 603) 1656 393.5 1.7e-109 CCDS5540.1 WBSCR17 gene_id:64409|Hs108|chr7 ( 598) 1038 249.9 2.8e-66 CCDS7807.1 GALNT18 gene_id:374378|Hs108|chr11 ( 607) 844 204.8 1e-52 CCDS8533.1 GALNT8 gene_id:26290|Hs108|chr12 ( 637) 757 184.6 1.3e-46 CCDS8813.1 GALNT6 gene_id:11226|Hs108|chr12 ( 622) 386 98.4 1.1e-20 CCDS55860.1 GALNT4 gene_id:100528030|Hs108|chr12 ( 575) 385 98.2 1.3e-20 CCDS53817.1 GALNT4 gene_id:8693|Hs108|chr12 ( 578) 385 98.2 1.3e-20 CCDS6737.1 GALNT12 gene_id:79695|Hs108|chr9 ( 581) 385 98.2 1.3e-20 CCDS2199.1 GALNT13 gene_id:114805|Hs108|chr2 ( 556) 367 94.0 2.2e-19 CCDS77472.1 GALNT13 gene_id:114805|Hs108|chr2 ( 561) 367 94.0 2.2e-19 CCDS11915.1 GALNT1 gene_id:2589|Hs108|chr18 ( 559) 363 93.0 4.2e-19 CCDS58705.1 GALNT14 gene_id:79623|Hs108|chr2 ( 532) 359 92.1 7.8e-19 CCDS1773.2 GALNT14 gene_id:79623|Hs108|chr2 ( 552) 359 92.1 8e-19 CCDS58706.1 GALNT14 gene_id:79623|Hs108|chr2 ( 557) 359 92.1 8.1e-19 CCDS1582.1 GALNT2 gene_id:2590|Hs108|chr1 ( 571) 343 88.4 1.1e-17 CCDS32107.1 GALNT16 gene_id:57452|Hs108|chr14 ( 558) 336 86.8 3.3e-17 CCDS2226.1 GALNT3 gene_id:2591|Hs108|chr2 ( 633) 332 85.9 6.9e-17 CCDS33711.1 GALNT15 gene_id:117248|Hs108|chr3 ( 639) 327 84.7 1.6e-16 CCDS2203.1 GALNT5 gene_id:11227|Hs108|chr2 ( 940) 304 79.5 8.7e-15 CCDS5930.1 GALNT11 gene_id:63917|Hs108|chr7 ( 608) 285 74.9 1.3e-13 CCDS3815.1 GALNT7 gene_id:51809|Hs108|chr4 ( 657) 279 73.6 3.6e-13 CCDS82742.1 GALNT15 gene_id:117248|Hs108|chr3 ( 617) 269 71.2 1.7e-12 CCDS5929.1 GALNTL5 gene_id:168391|Hs108|chr7 ( 443) 257 68.3 9.1e-12 CCDS34104.1 GALNTL6 gene_id:442117|Hs108|chr4 ( 601) 254 67.7 1.9e-11 >>CCDS41866.1 GALNT9 gene_id:50614|Hs108|chr12 (237 aa) initn: 1656 init1: 1656 opt: 1656 Z-score: 2085.4 bits: 393.2 E(32554): 7.8e-110 Smith-Waterman score: 1656; 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CCDS55 RRYNNTVAYGELRNNKAKDVCLDQGPLENHTAILYPCHGWGPQLARYTKEGFLHLGALGT 460 470 480 490 500 510 160 170 180 190 200 210 pF1KE6 TAFLPDSKCLVDDGTGRMPTLKKCEDVARPTQRLWDFTQSGPIVSRATGRCLEVEMSKDA :..:::..::::.. .:.: : :. : . :.: :.: :....:::::::: : CCDS55 TTLLPDTRCLVDNSKSRLPQLLDCDKVKSSLYKRWNFIQNGAIMNKGTGRCLEVENRGLA 520 530 540 550 560 570 220 230 pF1KE6 NFGLRLVVQRCSGQKWMIRNWIKHARH :. :... :.::.: :.: :: CCDS55 --GIDLILRSCTGQRWTIKNSIK 580 590 >>CCDS7807.1 GALNT18 gene_id:374378|Hs108|chr11 (607 aa) initn: 803 init1: 653 opt: 844 Z-score: 1059.8 bits: 204.8 E(32554): 1e-52 Smith-Waterman score: 844; 48.7% identity (78.6% similar) in 234 aa overlap (1-233:372-603) 10 20 30 pF1KE6 MEVLPCSRVAHIERTRKPYNNDIDYYAKRN .:::::::.:::::..:::..:. ...:: CCDS78 QEIGLLDEGMEVYGGENVELGIRVWQCGGSVEVLPCSRIAHIERAHKPYTEDLTAHVRRN 350 360 370 380 390 400 40 50 60 70 80 90 pF1KE6 ALRAAEVWMDDFKSHVYMAWNIPMSNPGVDFGDVSERLALRQRLKCRSFKWYLENVYPEM :::.::::::.::::::::::::. . :.:.::.. : :::..:.:..:.::: .::::: CCDS78 ALRVAEVWMDEFKSHVYMAWNIPQEDSGIDIGDITARKALRKQLQCKTFRWYLVSVYPEM 410 420 430 440 450 460 100 110 120 130 140 150 pF1KE6 RVYNNTLTYGEVRNSKASAYCLDQGAEDGDRAILYPCHGMSSQLVRYSADGLLQLGPLGS :.:.. ..:: ..:: . ::::: . . :.: ::::. : : :... ...: :. CCDS78 RMYSDIIAYGVLQNSLKTDLCLDQGPDTENVPIMYICHGMTPQNVYYTSSQQIHVGILSP 470 480 490 500 510 520 160 170 180 190 200 pF1KE6 TAFLPDSKCLVDDGTGRMPTLKKCEDVARPTQRL-WDFTQSGPIVSRATGRCLEVEMSKD :. :..:::: .. : : .: . ..: :.:.:.::: .: . ::::.. ..: CCDS78 TVDDDDNRCLVD--VNSRPRLIECSYAKAKRMKLHWQFSQGGPIQNRKSKRCLELQENSD 530 540 550 560 570 210 220 230 pF1KE6 ANFGLRLVVQRCSGQKWMIRNWIKHARH .::..::.:.::::.: : : .. CCDS78 LEFGFQLVLQKCSGQHWSITNVLRSLAS 580 590 600 >>CCDS8533.1 GALNT8 gene_id:26290|Hs108|chr12 (637 aa) initn: 725 init1: 612 opt: 757 Z-score: 950.2 bits: 184.6 E(32554): 1.3e-46 Smith-Waterman score: 757; 47.0% identity (69.2% similar) in 234 aa overlap (1-233:399-629) 10 20 30 pF1KE6 MEVLPCSRVAHIERTRKPYNNDIDYYAKRN .:.:::::.::.:: .::: :. ::: CCDS85 GEIGSLDGGMLIYGGENVELSLRVWQCGGKVEILPCSRIAHLERHHKPYALDLTAALKRN 370 380 390 400 410 420 40 50 60 70 80 90 pF1KE6 ALRAAEVWMDDFKSHVYMAWNIPMSNPGVDFGDVSERLALRQRLKCRSFKWYLENVYPEM :::.::.:::. : ::.:::::..: :.:::::: :.:::..:::..: :::.:::: . CCDS85 ALRVAEIWMDEHKHMVYLAWNIPLQNSGIDFGDVSSRMALREKLKCKTFDWYLKNVYPLL 430 440 450 460 470 480 100 110 120 130 140 150 pF1KE6 RVYNNTLTYGEVRNSKASAYCLDQGAEDGDRAILYPCHGMSSQLVRYSADGLLQLGPLGS . .. . ::...: ::::: :. :.: :: .::: : : : : .: : . CCDS85 KPLHTIVGYGRMKNLLDENVCLDQGPVPGNTPIMYYCHEFSSQNVYYHLTGELYVGQLIA 490 500 510 520 530 540 160 170 180 190 200 pF1KE6 TAFLPDSKCLVDDGTGRMPTLKKCEDVARPTQRL-WDFTQSGPIVSRATGRCLEVEMSKD : : .::.: : .. :::. : .:. .. ::: .: ...: : :::: :.:: CCDS85 EASASD-RCLTDPGKAEKPTLEPCSKAAKNRLHIYWDFKPGGAVINRDTKRCLE--MKKD 550 560 570 580 590 600 210 220 230 pF1KE6 ANFGLRLVVQRCSGQKWMIRNWIKHARH . ::.: :: : : :.. .. CCDS85 LLGSHVLVLQTCSTQVWEIQHTVRDWGQTNSQ 610 620 630 >>CCDS8813.1 GALNT6 gene_id:11226|Hs108|chr12 (622 aa) initn: 340 init1: 190 opt: 386 Z-score: 484.5 bits: 98.4 E(32554): 1.1e-20 Smith-Waterman score: 386; 35.0% identity (63.6% similar) in 217 aa overlap (1-210:397-606) 10 20 pF1KE6 MEVLPCSRVAHIERTRKPYN-NDIDYYAKR .:..::: :.:. ::..:.. : CCDS88 EHIGTYDNQMEIWGGENVEMSFRVWQCGGQLEIIPCSVVGHVFRTKSPHTFPKGTSVIAR 370 380 390 400 410 420 30 40 50 60 70 80 pF1KE6 NALRAAEVWMDDFKSHVYMAWNIPMSNPGVD--FGDVSERLALRQRLKCRSFKWYLENVY : .: ::::::..:. ... :. .. . . :::.:::: ::..:.:..:.:::.::: CCDS88 NQVRLAEVWMDSYKK-IFYRRNLQAAKMAQEKSFGDISERLQLREQLHCHNFSWYLHNVY 430 440 450 460 470 480 90 100 110 120 130 140 pF1KE6 PEMRVYNNTLT-YGEVRNSKASAYCLDQGAED--GDRAILYPCHGMS-SQLVRYSADGLL ::: : . : : :: ..: .. ::: : .. : :.: :::.. .: .:... : CCDS88 PEMFVPDLTPTFYGAIKNL-GTNQCLDVGENNRGGKPLIMYSCHGLGGNQYFEYTTQRDL 490 500 510 520 530 540 150 160 170 180 190 200 pF1KE6 QLGPLGSTAFLPDSKCLVDDGTGRMPTLKKCEDVARPTQRLWDFTQSGPIVSRATGRCLE . . ... : :: . : : : .: : .. :...:. : . ..: :: CCDS88 RHN-IAKQLCLHVSKGAL--GLGSCHFTGKNSQV--PKDEEWELAQDQLIRNSGSGTCLT 550 560 570 580 590 210 220 230 pF1KE6 VEMSKDANFGLRLVVQRCSGQKWMIRNWIKHARH . .: : CCDS88 SQDKKPAMAPCNPSDPHQLWLFV 600 610 620 >>CCDS55860.1 GALNT4 gene_id:100528030|Hs108|chr12 (575 aa) initn: 309 init1: 153 opt: 385 Z-score: 483.8 bits: 98.2 E(32554): 1.3e-20 Smith-Waterman score: 385; 33.5% identity (59.8% similar) in 209 aa overlap (1-202:349-545) 10 20 30 pF1KE6 MEVLPCSRVAHIERTRKPYNNDIDYYAKRN .:. :::.:.:. : :: .. .: CCDS55 QYLGTYDTGMEVWGGENLELSFRVWQCGGKLEIHPCSHVGHVFPKRAPYARP-NFL--QN 320 330 340 350 360 370 40 50 60 70 80 90 pF1KE6 ALRAAEVWMDDFKSHVYMAWNIPMSNPGVDFGDVSERLALRQRLKCRSFKWYLENVYPEM . ::::::::..: : : : : . . .::.::: ::.::.:.:: :::.::.:.. CCDS55 TARAAEVWMDEYKEHFY-NRNPPARKEA--YGDISERKLLRERLRCKSFDWYLKNVFPNL 380 390 400 410 420 430 100 110 120 130 140 pF1KE6 RVYNNTLTY-GEVRNSKASAYCLDQGAED----GDRAILYPCHGMS-SQLVRYSADGLLQ .: .. . : .:. :. ::: .. : : :. :::.. .:. .:... .. CCDS55 HVPEDRPGWHGAIRSRGISSECLDYNSPDNNPTGANLSLFGCHGQGGNQFFEYTSNKEIR 440 450 460 470 480 490 150 160 170 180 190 200 pF1KE6 LGPLGST-AFLPDSKCLVDDGTGRMPTLKKCEDVARPTQRLWDFTQSGPIVSRATGRCLE .. . : .:..: : : : . :.. .: : ..: : .: :: CCDS55 FNSVTELCAEVPEQKNYV--GMQNCPK----DGFPVPANIIWHFKEDGTIFHPHSGLCLS 500 510 520 530 540 210 220 230 pF1KE6 VEMSKDANFGLRLVVQRCSGQKWMIRNWIKHARH CCDS55 AYRTPEGRPDVQMRTCDALDKNQIWSFEK 550 560 570 >>CCDS53817.1 GALNT4 gene_id:8693|Hs108|chr12 (578 aa) initn: 309 init1: 153 opt: 385 Z-score: 483.8 bits: 98.2 E(32554): 1.3e-20 Smith-Waterman score: 385; 33.5% identity (59.8% similar) in 209 aa overlap (1-202:352-548) 10 20 30 pF1KE6 MEVLPCSRVAHIERTRKPYNNDIDYYAKRN .:. :::.:.:. : :: .. .: CCDS53 QYLGTYDTGMEVWGGENLELSFRVWQCGGKLEIHPCSHVGHVFPKRAPYARP-NFL--QN 330 340 350 360 370 40 50 60 70 80 90 pF1KE6 ALRAAEVWMDDFKSHVYMAWNIPMSNPGVDFGDVSERLALRQRLKCRSFKWYLENVYPEM . ::::::::..: : : : : . . .::.::: ::.::.:.:: :::.::.:.. CCDS53 TARAAEVWMDEYKEHFY-NRNPPARKEA--YGDISERKLLRERLRCKSFDWYLKNVFPNL 380 390 400 410 420 430 100 110 120 130 140 pF1KE6 RVYNNTLTY-GEVRNSKASAYCLDQGAED----GDRAILYPCHGMS-SQLVRYSADGLLQ .: .. . : .:. :. ::: .. : : :. :::.. .:. .:... .. CCDS53 HVPEDRPGWHGAIRSRGISSECLDYNSPDNNPTGANLSLFGCHGQGGNQFFEYTSNKEIR 440 450 460 470 480 490 150 160 170 180 190 200 pF1KE6 LGPLGST-AFLPDSKCLVDDGTGRMPTLKKCEDVARPTQRLWDFTQSGPIVSRATGRCLE .. . : .:..: : : : . :.. .: : ..: : .: :: CCDS53 FNSVTELCAEVPEQKNYV--GMQNCPK----DGFPVPANIIWHFKEDGTIFHPHSGLCLS 500 510 520 530 540 210 220 230 pF1KE6 VEMSKDANFGLRLVVQRCSGQKWMIRNWIKHARH CCDS53 AYRTPEGRPDVQMRTCDALDKNQIWSFEK 550 560 570 >>CCDS6737.1 GALNT12 gene_id:79695|Hs108|chr9 (581 aa) initn: 349 init1: 159 opt: 385 Z-score: 483.7 bits: 98.2 E(32554): 1.3e-20 Smith-Waterman score: 385; 30.1% identity (62.8% similar) in 239 aa overlap (1-229:353-577) 10 20 30 pF1KE6 MEVLPCSRVAHIERTRKPYNNDIDYYAKRN .:. :::.:.:. . ::. . : : CCDS67 EYLGSYDTGMEVWGGENLEFSFRIWQCGGVLETHPCSHVGHVFPKQAPYSRN---KALAN 330 340 350 360 370 40 50 60 70 80 90 pF1KE6 ALRAAEVWMDDFKSHVYMAWNIPMSNPGVDFGDVSERLALRQRLKCRSFKWYLENVYPEM ..::::::::.:: : .: ::::.:: ::..:.:..:::.::.::::. CCDS67 SVRAAEVWMDEFKELYYHRNPRARLEP---FGDVTERKQLRDKLQCKDFKWFLETVYPEL 380 390 400 410 420 430 100 110 120 130 140 pF1KE6 RVYNNTLTY-GEVRNSKASAYCLDQGAED-----GDRAILYPCHGMS-SQLVRYSADGLL .: .. . : ..:. . ::.: . : : ..::: ::::. .:. .:... . CCDS67 HVPEDRPGFFGMLQNKGLTDYCFDYNPPDENQIVGHQVILYLCHGMGQNQFFEYTSQKEI 440 450 460 470 480 490 150 160 170 180 190 200 pF1KE6 QLGPLGSTAFLPDSKCLVDDGTGRMPTLKKCEDVARPTQRLWDFTQSGPIVSRATGRCLE . . . :.. :. : . .. ::..: .:.. . ..: . . . .:.. CCDS67 RYN-----THQPEGCIAVEAGMDTL-IMHLCEETAPENQKFI-LQEDGSLFHEQSKKCVQ 500 510 520 530 540 210 220 230 pF1KE6 VEMSKDANFGLRLVVQRCSG---QKWMIRNWIKHARH . :... .. ... :.. :::... CCDS67 AA-RKESSDSFVPLLRDCTNSDHQKWFFKERML 550 560 570 580 >>CCDS2199.1 GALNT13 gene_id:114805|Hs108|chr2 (556 aa) initn: 380 init1: 231 opt: 367 Z-score: 461.4 bits: 94.0 E(32554): 2.2e-19 Smith-Waterman score: 413; 33.1% identity (60.3% similar) in 242 aa overlap (1-230:333-551) 10 20 pF1KE6 MEVLPCSRVAHIERTRKPYN--NDIDYYAK .:.. ::.:.:. : ::. . . . CCDS21 EEIGTYDAGMDIWGGENLEMSFRIWQCGGSLEIVTCSHVGHVFRKATPYTFPGGTGHVIN 310 320 330 340 350 360 30 40 50 60 70 80 pF1KE6 RNALRAAEVWMDDFKSHVYMAWNIPMSNPGV---DFGDVSERLALRQRLKCRSFKWYLEN .: : ::::::.::. :. .::: :.:::: : .::. :::. :.::::: CCDS21 KNNRRLAEVWMDEFKDFFYII------SPGVVKVDYGDVSVRKTLRENLKCKPFSWYLEN 370 380 390 400 410 90 100 110 120 130 140 pF1KE6 VYPEMRVYNNTLTYGEVRNSKASAYCLDQ-GAEDGDRAILYPCHGMS-SQLVRYSADGLL .::. .. . ::.:: . . :::. : ...... .. ::::. .:. :.:: . 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