FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4181, 653 aa 1>>>pF1KE4181 653 - 653 aa - 653 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4738+/-0.00098; mu= 11.2420+/- 0.059 mean_var=171.2781+/-34.618, 0's: 0 Z-trim(111.1): 53 B-trim: 175 in 2/49 Lambda= 0.097999 statistics sampled from 12049 (12102) to 12049 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.705), E-opt: 0.2 (0.372), width: 16 Scan time: 3.670 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS41629.1 KCNA4 gene_id:3739|Hs108|chr11 ( 653) 4351 627.7 1.6e-179 CCDS828.2 KCNA3 gene_id:3738|Hs108|chr1 ( 575) 2243 329.6 7.4e-90 CCDS827.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 ( 499) 2188 321.8 1.5e-87 CCDS12755.1 KCNA7 gene_id:3743|Hs108|chr19 ( 456) 1910 282.4 9.3e-76 CCDS55625.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 ( 356) 1341 201.9 1.3e-51 CCDS8535.1 KCNA1 gene_id:3736|Hs108|chr12 ( 495) 1280 193.4 6.4e-49 CCDS8536.1 KCNA5 gene_id:3741|Hs108|chr12 ( 613) 1216 184.4 4e-46 CCDS8534.1 KCNA6 gene_id:3742|Hs108|chr12 ( 529) 1199 182.0 1.9e-45 CCDS826.1 KCNA10 gene_id:3744|Hs108|chr1 ( 511) 1120 170.8 4.2e-42 CCDS6209.1 KCNB2 gene_id:9312|Hs108|chr8 ( 911) 721 114.6 6.2e-25 CCDS13418.1 KCNB1 gene_id:3745|Hs108|chr20 ( 858) 716 113.9 9.7e-25 CCDS1692.1 KCNS3 gene_id:3790|Hs108|chr2 ( 491) 701 111.5 2.8e-24 CCDS44193.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 ( 626) 641 103.1 1.2e-21 CCDS821.1 KCNC4 gene_id:3749|Hs108|chr1 ( 635) 641 103.1 1.2e-21 CCDS12019.1 KCNG2 gene_id:26251|Hs108|chr18 ( 466) 632 101.7 2.3e-21 CCDS7827.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 ( 511) 626 100.9 4.5e-21 CCDS44547.1 KCNC1 gene_id:3746|Hs108|chr11 ( 585) 627 101.1 4.5e-21 CCDS13436.1 KCNG1 gene_id:3755|Hs108|chr20 ( 513) 625 100.8 5e-21 CCDS12793.1 KCNC3 gene_id:3748|Hs108|chr19 ( 757) 620 100.2 1.1e-20 CCDS13342.1 KCNS1 gene_id:3787|Hs108|chr20 ( 526) 610 98.7 2.2e-20 CCDS6279.1 KCNS2 gene_id:3788|Hs108|chr8 ( 477) 605 97.9 3.3e-20 CCDS6314.1 KCNV1 gene_id:27012|Hs108|chr8 ( 500) 594 96.4 1e-19 CCDS42674.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 425) 585 95.1 2.2e-19 CCDS1676.1 KCNF1 gene_id:3754|Hs108|chr2 ( 494) 585 95.1 2.4e-19 CCDS10945.1 KCNG4 gene_id:93107|Hs108|chr16 ( 519) 583 94.9 3.1e-19 CCDS1809.1 KCNG3 gene_id:170850|Hs108|chr2 ( 436) 571 93.1 8.7e-19 CCDS6447.1 KCNV2 gene_id:169522|Hs108|chr9 ( 545) 553 90.6 6e-18 CCDS9005.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 613) 519 85.9 1.8e-16 CCDS58257.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 618) 519 85.9 1.8e-16 CCDS58256.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 629) 519 85.9 1.9e-16 CCDS9007.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 638) 519 85.9 1.9e-16 CCDS9006.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 558) 517 85.6 2.1e-16 CCDS58255.1 KCNC2 gene_id:3747|Hs108|chr12 ( 583) 517 85.6 2.2e-16 CCDS14314.1 KCND1 gene_id:3750|Hs108|chrX ( 647) 512 84.9 3.8e-16 CCDS5776.1 KCND2 gene_id:3751|Hs108|chr7 ( 630) 510 84.6 4.5e-16 CCDS844.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 636) 506 84.1 6.7e-16 CCDS843.1 KCND3 gene_id:3752|Hs108|chr1 ( 655) 506 84.1 6.9e-16 >>CCDS41629.1 KCNA4 gene_id:3739|Hs108|chr11 (653 aa) initn: 4351 init1: 4351 opt: 4351 Z-score: 3336.7 bits: 627.7 E(32554): 1.6e-179 Smith-Waterman score: 4351; 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CCDS82 NSTSGSR---AGASSFSDPFFVVETLCIIWFSFELLVRFFACPSKATFSRNIMNLIDIVA 280 290 300 310 320 330 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 ILPYFITLGTDLAQQQGGGNGQQQQAMSFAILRIIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGHTL :.::::::::.::..::.: :::::.::::.:::::::::::::::::::::::.:: CCDS82 IIPYFITLGTELAERQGNG----QQAMSLAILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTL 340 350 360 370 380 390 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 RASMRELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADEPTTHFQSIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMK .::::::::::::::::::::::::::::::.::. :.:::::::::::::::::::::. CCDS82 KASMRELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADDPTSGFSSIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMH 400 410 420 430 440 450 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 PITVGGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETENEEQTQLTQNAVSCPYLPS :.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.: ... :: .: : CCDS82 PVTIGGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETEGEEQSQY-MHVGSCQHLSS 460 470 480 490 500 510 600 610 620 630 640 pF1KE4 NLLKKFRSSTSSSLGDKSEYLEMEEG-VKESLCAKEEKCQGKGDDSETDKNN---CSNAK . ...:.. :.: .::::. .::: ...: . :.. . : .:: : : : CCDS82 SA-EELRKARSNSTLSKSEYMVIEEGGMNHSAFPQTPFKTGNSTATCTTNNNPNSCVNIK 520 530 540 550 560 650 pF1KE4 AVETDV . ::: CCDS82 KIFTDV 570 >>CCDS827.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 (499 aa) initn: 1877 init1: 872 opt: 2188 Z-score: 1685.5 bits: 321.8 E(32554): 1.5e-87 Smith-Waterman score: 2200; 71.7% identity (85.3% similar) in 477 aa overlap (146-621:7-468) 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 KILRELSEEEEDEEEEEEEEEEGRFYYSEDDHGDECSYTDLLPQDEGGGGYSSVRYSDCC : .:: . ::: :. .:: CCDS82 MTVATGDPADEAAALPGHPQDT----YDPEADHECC 10 20 30 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 ERVVINVSGLRFETQMKTLAQFPETLLGDPEKRTQYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYY ::::::.::::::::.::::::::::::::.:: .::::::::::::::::::::::::: CCDS82 ERVVINISGLRFETQLKTLAQFPETLLGDPKKRMRYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYY 40 50 60 70 80 90 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 QSGGRLKRPVNVPFDIFTEEVKFYQLGEEALLKFREDEGFVREEEDRALPENEFKKQIWL ::::::.::::::.:::.::..::.:::::. ::::::...::: : ::::::..:.:: CCDS82 QSGGRLRRPVNVPLDIFSEEIRFYELGEEAMEMFREDEGYIKEEE-RPLPENEFQRQVWL 100 110 120 130 140 150 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 LFEYPESSSPARGIAIVSVLVILISIVIFCLETLPEFRDDRDLVMALSAGGHGGLLNDTS ::::::::.::: ::::::.::::::: ::::::: :::. . . : : .. : CCDS82 LFEYPESSGPARIIAIVSVMVILISIVSFCLETLPIFRDENE-----DMHGSGVTFHTYS 160 170 180 190 200 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 APHLENSGHTIFNDPFFIVETVCIVWFSFEFVVRCFACPSQALFFKNIMNIIDIVSILPY . . : :.::::::::.::.::::::.:: :::::.: :: :::::::::.:.:: CCDS82 NSTIGYQQSTSFTDPFFIVETLCIIWFSFEFLVRFFACPSKAGFFTNIMNIIDIVAIIPY 210 220 230 240 250 260 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 FITLGTDLAQQQGGGNGQQQQAMSFAILRIIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGHTLRASM ::::::.::.. .. : :::::.::::.:::::::::::::::::::::::.::.::: CCDS82 FITLGTELAEKPEDAQ-QGQQAMSLAILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLKASM 270 280 290 300 310 320 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 RELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADEPTTHFQSIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMKPITV :::::::::::::::::::::::::::: ..: :::::::::::.::::::::: : :. CCDS82 RELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADERESQFPSIPDAFWWAVVSMTTVGYGDMVPTTI 330 340 350 360 370 380 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 GGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETENEEQTQLTQNAVSCPYLPSNL-L :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.: : ..::: .::. : CCDS82 GGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETEGEEQAQYLQ-VTSCPKIPSSPDL 390 400 410 420 430 440 600 610 620 630 640 650 pF1KE4 KKFRSSTSSSLGDKSEYLEMEEGVKESLCAKEEKCQGKGDDSETDKNNCSNAKAVETDV :: ::... : ::.:.:..:::..: CCDS82 KKSRSASTIS---KSDYMEIQEGVNNSNEDFREENLKTANCTLANTNYVNITKMLTDV 450 460 470 480 490 >>CCDS12755.1 KCNA7 gene_id:3743|Hs108|chr19 (456 aa) initn: 1944 init1: 821 opt: 1910 Z-score: 1473.6 bits: 282.4 E(32554): 9.3e-76 Smith-Waterman score: 1910; 69.4% identity (86.4% similar) in 412 aa overlap (174-581:11-415) 150 160 170 180 190 200 pF1KE4 EDDHGDECSYTDLLPQDEGGGGYSSVRYSDCCERVVINVSGLRFETQMKTLAQFPETLLG ::::.:.::.::::::. .::..::.:::: CCDS12 MEPRCPPPCGCCERLVLNVAGLRFETRARTLGRFPDTLLG 10 20 30 40 210 220 230 240 250 260 pF1KE4 DPEKRTQYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYYQSGGRLKRPVNVPFDIFTEEVKFYQLGE :: .: ...: : ::::::.::::::.::::::::::.::..::.:.: ::: :: :: CCDS12 DPARRGRFYDDARREYFFDRHRPSFDAVLYYYQSGGRLRRPAHVPLDVFLEEVAFYGLGA 50 60 70 80 90 100 270 280 290 300 310 320 pF1KE4 EALLKFREDEGFVREEEDRALPENEFKKQIWLLFEYPESSSPARGIAIVSVLVILISIVI :: ..::::: : : ::. : .:.:::::.::::. :: .:.:::::::.:::. CCDS12 AALARLREDEGCPVPPE-RPLPRRAFARQLWLLFEFPESSQAARVLAVVSVLVILVSIVV 110 120 130 140 150 330 340 350 360 370 pF1KE4 FCLETLPEFRDDRD---LVMALSAGGHGGLLNDTSA-PHLENSGHTIFNDPFFIVETVCI :::::::.:::::: :. : .:: . :: .: : : . ::::::.:::.:: CCDS12 FCLETLPDFRDDRDGTGLAAAAAAGPFPAPLNGSSQMPG--NPPRLPFNDPFFVVETLCI 160 170 180 190 200 210 380 390 400 410 420 430 pF1KE4 VWFSFEFVVRCFACPSQALFFKNIMNIIDIVSILPYFITLGTDLAQQQGGGNGQQQQAMS :::::..:: ..:::.:.::::.::.::.:.:::::..:::.::.:.: : ::::: CCDS12 CWFSFELLVRLLVCPSKAIFFKNVMNLIDFVAILPYFVALGTELARQRGVG----QQAMS 220 230 240 250 260 270 440 450 460 470 480 490 pF1KE4 FAILRIIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGHTLRASMRELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFA .::::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::.::::::::: CCDS12 LAILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLRASMRELGLLIFFLFIGVVLFSSAVYFA 280 290 300 310 320 330 500 510 520 530 540 550 pF1KE4 EADEPTTHFQSIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMKPITVGGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVI :.:. .:: :::..:::::::::::::::: :.:::::::::::::::::::.:::::: CCDS12 EVDRVDSHFTSIPESFWWAVVTMTTVGYGDMAPVTVGGKIVGSLCAIAGVLTISLPVPVI 340 350 360 370 380 390 560 570 580 590 600 610 pF1KE4 VSNFNYFYHRETENEEQTQLTQNAVSCPYLPSNLLKKFRSSTSSSLGDKSEYLEMEEGVK ::::.::::::::.:: .... CCDS12 VSNFSYFYHRETEGEEAGMFSHVDMQPCGPLEGKANGGLVDGEVPELPPPLWAPPGKHLV 400 410 420 430 440 450 >>CCDS55625.1 KCNA2 gene_id:3737|Hs108|chr1 (356 aa) initn: 1054 init1: 658 opt: 1341 Z-score: 1040.2 bits: 201.9 E(32554): 1.3e-51 Smith-Waterman score: 1349; 65.2% identity (80.7% similar) in 322 aa overlap (146-467:7-315) 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 KILRELSEEEEDEEEEEEEEEEGRFYYSEDDHGDECSYTDLLPQDEGGGGYSSVRYSDCC : .:: . ::: :. .:: CCDS55 MTVATGDPADEAAALPGHPQDT----YDPEADHECC 10 20 30 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 ERVVINVSGLRFETQMKTLAQFPETLLGDPEKRTQYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYY ::::::.::::::::.::::::::::::::.:: .::::::::::::::::::::::::: CCDS55 ERVVINISGLRFETQLKTLAQFPETLLGDPKKRMRYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYY 40 50 60 70 80 90 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 QSGGRLKRPVNVPFDIFTEEVKFYQLGEEALLKFREDEGFVREEEDRALPENEFKKQIWL ::::::.::::::.:::.::..::.:::::. ::::::...::: : ::::::..:.:: CCDS55 QSGGRLRRPVNVPLDIFSEEIRFYELGEEAMEMFREDEGYIKEEE-RPLPENEFQRQVWL 100 110 120 130 140 150 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 LFEYPESSSPARGIAIVSVLVILISIVIFCLETLPEFRDDRDLVMALSAGGHGGLLNDTS ::::::::.::: ::::::.::::::: ::::::: :::. . . : : .. : CCDS55 LFEYPESSGPARIIAIVSVMVILISIVSFCLETLPIFRDENE-----DMHGSGVTFHTYS 160 170 180 190 200 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 APHLENSGHTIFNDPFFIVETVCIVWFSFEFVVRCFACPSQALFFKNIMNIIDIVSILPY . . : :.::::::::.::.::::::.:: :::::.: :: :::::::::.:.:: CCDS55 NSTIGYQQSTSFTDPFFIVETLCIIWFSFEFLVRFFACPSKAGFFTNIMNIIDIVAIIPY 210 220 230 240 250 260 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 FITLGTDLAQQQGGGNGQQQQAMSFAILRIIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGHTLRASM ::::::.::.. .. : :::::.::::.::: : : .. .. ..: : : CCDS55 FITLGTELAEKPEDAQ-QGQQAMSLAILRVIRLER--RPLQSQKSKRGRQHLNTSHDCTL 270 280 290 300 310 320 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 RELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADEPTTHFQSIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMKPITV CCDS55 GINLVAGMTVQWTRASGPDDRQTPAVTTLHRMY 330 340 350 >>CCDS8535.1 KCNA1 gene_id:3736|Hs108|chr12 (495 aa) initn: 1874 init1: 859 opt: 1280 Z-score: 991.7 bits: 193.4 E(32554): 6.4e-49 Smith-Waterman score: 2217; 68.7% identity (85.4% similar) in 508 aa overlap (149-653:10-495) 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 RELSEEEEDEEEEEEEEEEGRFYYSEDDHGDECSYTDLLPQDEGGGGYSSVRYSD---CC :: : . ::: :.: : :: CCDS85 MTVMSGENVDEASAAPGHPQD---GSYPRQADHDDHECC 10 20 30 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 ERVVINVSGLRFETQMKTLAQFPETLLGDPEKRTQYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYY ::::::.::::::::.:::::::.::::.:.:: .::::::::::::::::::::::::: CCDS85 ERVVINISGLRFETQLKTLAQFPNTLLGNPKKRMRYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYY 40 50 60 70 80 90 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 QSGGRLKRPVNVPFDIFTEEVKFYQLGEEALLKFREDEGFVREEEDRALPENEFKKQIWL ::::::.::::::.:.:.::.:::.:::::. ::::::::..::: : :::.:...:.:: CCDS85 QSGGRLRRPVNVPLDMFSEEIKFYELGEEAMEKFREDEGFIKEEE-RPLPEKEYQRQVWL 100 110 120 130 140 150 300 310 320 330 340 350 pF1KE4 LFEYPESSSPARGIAIVSVLVILISIVIFCLETLPEFRDDRDLVMALSAGGHGGLLNDTS ::::::::.::: ::::::.::::::::::::::::..::.:.. : ...:. CCDS85 LFEYPESSGPARVIAIVSVMVILISIVIFCLETLPELKDDKDFT------GTVHRIDNTT 160 170 180 190 200 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 APHLENSGHTIFNDPFFIVETVCIVWFSFEFVVRCFACPSQALFFKNIMNIIDIVSILPY . . :: .::.::::::::.::.:::::.::: :::::.. :::::::.::::.:.:: CCDS85 V--IYNS--NIFTDPFFIVETLCIIWFSFELVVRFFACPSKTDFFKNIMNFIDIVAIIPY 210 220 230 240 250 260 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 FITLGTDLAQQQGGGNGQQQQAMSFAILRIIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGHTLRASM ::::::..:.:.:. .:. :: :.::::.:::::::::::::::::::::::.::.::: CCDS85 FITLGTEIAEQEGNQKGE--QATSLAILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGQTLKASM 270 280 290 300 310 320 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 RELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADEPTTHFQSIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMKPITV ::::::::::::::::::::::::::.: .::.:::::::::::.::::::::: :.:. CCDS85 RELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEAEEAESHFSSIPDAFWWAVVSMTTVGYGDMYPVTI 330 340 350 360 370 380 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 GGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETENEEQTQLTQNAVSCPYLPSNLLK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:: . :: : : :. CCDS85 GGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETEGEEQAQLLH--VSSPNLASDSDL 390 400 410 420 430 440 600 610 620 630 640 650 pF1KE4 KFRSSTSSSLGDKSEYLEMEEGVKESLCAKEEKCQGKGDDSETDKNNCSNAKAVETDV . :::.. : ::::.:.:: ...:. :. .. . . . : ..:: : . . ::: CCDS85 SRRSSSTMS---KSEYMEIEEDMNNSI-AHYRQVNIRTANCTTANQNCVNKSKLLTDV 450 460 470 480 490 >>CCDS8536.1 KCNA5 gene_id:3741|Hs108|chr12 (613 aa) initn: 2173 init1: 877 opt: 1216 Z-score: 941.6 bits: 184.4 E(32554): 4e-46 Smith-Waterman score: 2064; 57.4% identity (74.8% similar) in 610 aa overlap (41-632:13-589) 20 30 40 50 60 70 pF1KE4 SGCNSHMPYGYAAQARARERERLAHSRAAAAAAVAAATAAVEGSGGSGGGSHHHHQSRGA : .: .. : : : . :: . . : CCDS85 MEIALVPLENGGAMTVRGGDEARAGCGQATGGELQCPPTAGL 10 20 30 40 80 90 100 110 120 pF1KE4 CTSHDPQSSRGSRRRRRQRSEKKKAHYRQSSFPHCSDLMPSGSEEKILRELSEE--EEDE . . .: :. .. : .: : :. . : : :: . . CCDS85 SDGPKEPAPKG-------RGAQRDADSGVRPLPPLPD--PG---VRPLPPLPEELPRPRR 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE4 EEEEEEEEEGRFYYSEDDHGDECSYTDLLPQDEGGGGYSSVRYSDCCERVVINVSGLRFE :.::::: : : : .. . : .:... .:: ::.:::::: CCDS85 PPPEDEEEEG-------DPG-------LGTVEDQALGTASLHH----QRVHINISGLRFE 100 110 120 130 190 200 210 220 230 240 pF1KE4 TQMKTLAQFPETLLGDPEKRTQYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYYQSGGRLKRPVNVP ::. ::::::.:::::: :: .:::::::::::::::::::.:::::::::::.::::: CCDS85 TQLGTLAQFPNTLLGDPAKRLRYFDPLRNEYFFDRNRPSFDGILYYYQSGGRLRRPVNVS 140 150 160 170 180 190 250 260 270 280 290 300 pF1KE4 FDIFTEEVKFYQLGEEALLKFREDEGFVREEEDRALPENEFKKQIWLLFEYPESSSPARG .:.:..:..:::::.::. .:::::::..::: . ::.:::..:.::.:::::::. ::. CCDS85 LDVFADEIRFYQLGDEAMERFREDEGFIKEEE-KPLPRNEFQRQVWLIFEYPESSGSARA 200 210 220 230 240 250 310 320 330 340 350 pF1KE4 IAIVSVLVILISIVIFCLETLPEFRDDRDLVM---------ALSAGGHG-GLLNDTSAPH :::::::::::::. :::::::::::.:.:. : . :..: :.. :.: CCDS85 IAIVSVLVILISIITFCLETLPEFRDERELLRHPPAPHQPPAPAPGANGSGVMAPPSGPT 260 270 280 290 300 310 360 370 380 390 400 410 pF1KE4 LENSGHTIFNDPFFIVETVCIVWFSFEFVVRCFACPSQALFFKNIMNIIDIVSILPYFIT . . ::::::::.:..::.::..:: :::::.: : .:::::::.:.:.::::: CCDS85 VAPLLPRTLADPFFIVETTCVIWFTFELLVRFFACPSKAGFSRNIMNIIDVVAIFPYFIT 320 330 340 350 360 370 420 430 440 450 460 470 pF1KE4 LGTDLAQQQ--GGGNGQQ-QQAMSFAILRIIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGHTLRASM :::.::.:: :::.::. :::::.::::.:::::::::::::::::::::::.::.::: CCDS85 LGTELAEQQPGGGGGGQNGQQAMSLAILRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGKTLQASM 380 390 400 410 420 430 480 490 500 510 520 530 pF1KE4 RELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADEPTTHFQSIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMKPITV :::::::::::::::::::::::::::. :::.:::::::::::::::::::::.:::: CCDS85 RELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADNQGTHFSSIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMRPITV 440 450 460 470 480 490 540 550 560 570 580 590 pF1KE4 GGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETENEEQTQLTQNAVSC---PYLPSN ::::::::::::::::::::::::::::::::::::..:: . : .. . : : . CCDS85 GGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETDHEEPAVLKEEQGTQSQGPGLDRG 500 510 520 530 540 550 600 610 620 630 640 650 pF1KE4 LLKKFRSSTSSSLGDKSEYLEMEEGVKESLCAKEEKCQGKGDDSETDKNNCSNAKAVETD . .: :.. .:. . :: ...... : : ::. : CCDS85 VQRKV-SGSRGSFCKAGGTLENADSARRGSCPLE-KCNVKAKSNVDLRRSLYALCLDTSR 560 570 580 590 600 pF1KE4 V CCDS85 ETDL 610 >>CCDS8534.1 KCNA6 gene_id:3742|Hs108|chr12 (529 aa) initn: 2058 init1: 864 opt: 1199 Z-score: 929.5 bits: 182.0 E(32554): 1.9e-45 Smith-Waterman score: 2019; 65.9% identity (80.6% similar) in 501 aa overlap (148-613:20-503) 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 LRELSEEEEDEEEEEEEEEEGRFYYSEDDHGDECSYTDLLPQDEGGGGYSSVRYSDCC-- :.. . :. :. :::: :: CCDS85 MRSEKSLTLAAPGEVRGPEGEQQDAGDF-PEAGGGGG--------CCSS 10 20 30 40 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 ERVVINVSGLRFETQMKTLAQFPETLLGDPEKRTQYFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYY ::.:::.::::::::..::. ::.:::::: .:...:::::::::::::::::::::::: CCDS85 ERLVINISGLRFETQLRTLSLFPDTLLGDPGRRVRFFDPLRNEYFFDRNRPSFDAILYYY 50 60 70 80 90 100 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 QSGGRLKRPVNVPFDIFTEEVKFYQLGEEALLKFREDEGFVRE--EEDRALPENEFKKQI ::::::.::::::.::: ::..:::::.::: :::::: . : :... :: . :..:. CCDS85 QSGGRLRRPVNVPLDIFLEEIRFYQLGDEALAAFREDEGCLPEGGEDEKPLPSQPFQRQV 110 120 130 140 150 160 300 310 320 330 340 pF1KE4 WLLFEYPESSSPARGIAIVSVLVILISIVIFCLETLPEFR-DDR-------DLVMALSAG ::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.:: : : . : .: : CCDS85 WLLFEYPESSGPARGIAIVSVLVILISIVIFCLETLPQFRVDGRGGNNGGVSRVSPVSRG 170 180 190 200 210 220 350 360 370 380 pF1KE4 G--------------HG---GLLNDTSAPHLENSGHTIFNDPFFIVETVCIVWFSFEFVV . :: : .. .. : . : ..:.::::.:::.:::::.::..: CCDS85 SQEEEEDEDDSYTFHHGITPGEMGTGGSSSLSTLGGSFFTDPFFLVETLCIVWFTFELLV 230 240 250 260 270 280 390 400 410 420 430 440 pF1KE4 RCFACPSQALFFKNIMNIIDIVSILPYFITLGTDLAQQQ-----GGGNGQQ-QQAMSFAI : ::::. ::.:::::::.:.:.::::::::.:.::: .::.::. :::::.:: CCDS85 RFSACPSKPAFFRNIMNIIDLVAIFPYFITLGTELVQQQEQQPASGGGGQNGQQAMSLAI 290 300 310 320 330 340 450 460 470 480 490 500 pF1KE4 LRIIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGHTLRASMRELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEAD ::.:::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::::::::::::::::: CCDS85 LRVIRLVRVFRIFKLSRHSKGLQILGKTLQASMRELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEAD 350 360 370 380 390 400 510 520 530 540 550 560 pF1KE4 EPTTHFQSIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMKPITVGGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSN . . : ::::::::::::::::::::: :.::::::::::::::::::::::::::::: CCDS85 DDDSLFPSIPDAFWWAVVTMTTVGYGDMYPMTVGGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSN 410 420 430 440 450 460 570 580 590 600 610 620 pF1KE4 FNYFYHRETENEEQTQLTQNAVSCPYLPSNLLKKFRSSTSSSLGDKSEYLEMEEGVKESL ::::::::::.::: : :. :.: :. :. .:...:: : .. : CCDS85 FNYFYHRETEQEEQGQYTH--VTCGQ-PAPDLR----ATDNGLG-KPDFPEANRERRPSY 470 480 490 500 510 630 640 650 pF1KE4 CAKEEKCQGKGDDSETDKNNCSNAKAVETDV CCDS85 LPTPHRAYAEKRMLTEV 520 >>CCDS826.1 KCNA10 gene_id:3744|Hs108|chr1 (511 aa) initn: 1983 init1: 839 opt: 1120 Z-score: 869.3 bits: 170.8 E(32554): 4.2e-42 Smith-Waterman score: 1917; 66.0% identity (84.8% similar) in 447 aa overlap (138-579:49-476) 110 120 130 140 150 160 pF1KE4 LMPSGSEEKILRELSEEEEDEEEEEEEEEEGRFYYSEDDHGDECSYTDLLPQDEGGG-GY :.. ::. . : ... : : : . : CCDS82 SDEIQEEPGYATDFDSTSPKGRPGGSSFSNGKILISESTN-HETAFSKL-PGDYADPPGP 20 30 40 50 60 70 170 180 190 200 210 220 pF1KE4 SSVRYSDCCERVVINVSGLRFETQMKTLAQFPETLLGDPEKRTQYFDPLRNEYFFDRNRP : .. .::.::..:::::::..::.::::::::: ::: :.:: .::::::::::: CCDS82 EPVVLNEGNQRVIINIAGLRFETQLRTLSQFPETLLGDREKRMQFFDSMRNEYFFDRNRP 80 90 100 110 120 130 230 240 250 260 270 280 pF1KE4 SFDAILYYYQSGGRLKRPVNVPFDIFTEEVKFYQLGEEALLKFREDEGFVREEEDRALPE :::.:::::::::...::.:::.:::..:..::.:: ::. .:::::::... : :: CCDS82 SFDGILYYYQSGGKIRRPANVPIDIFADEISFYELGSEAMDQFREDEGFIKDPET-LLPT 140 150 160 170 180 190 290 300 310 320 330 340 pF1KE4 NEFKKQIWLLFEYPESSSPARGIAIVSVLVILISIVIFCLETLPEFRDDRDLVMALSAGG :....:.::::::::::: ::..:.:::::..:::.:::::::::::.::.: CCDS82 NDIHRQFWLLFEYPESSSAARAVAVVSVLVVVISITIFCLETLPEFREDREL-------- 200 210 220 230 240 350 360 370 380 390 400 pF1KE4 HGGLLNDTSAPHLENS----GHTIFNDPFFIVETVCIVWFSFEFVVRCFACPSQALFFKN .. : :.:. : ..:.:.::::.::..:::::.::.:.: .:::.. ::.: CCDS82 --KVVRD---PNLNMSKTVLSQTMFTDPFFMVESTCIVWFTFELVLRFVVCPSKTDFFRN 250 260 270 280 290 300 410 420 430 440 450 460 pF1KE4 IMNIIDIVSILPYFITLGTDLAQQQGGGNGQQQQAMSFAILRIIRLVRVFRIFKLSRHSK :::::::.::.::: :: :.:.:. . . :: ::.:::::::::::::::::::::: CCDS82 IMNIIDIISIIPYFATLITELVQET---EPSAQQNMSLAILRIIRLVRVFRIFKLSRHSK 310 320 330 340 350 470 480 490 500 510 520 pF1KE4 GLQILGHTLRASMRELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEADEPTTHFQSIPDAFWWAVVTM ::::::.::.::::::::::::::::::::::::::::.::: .::.::::.:::::::: CCDS82 GLQILGQTLKASMRELGLLIFFLFIGVILFSSAVYFAEVDEPESHFSSIPDGFWWAVVTM 360 370 380 390 400 410 530 540 550 560 570 580 pF1KE4 TTVGYGDMKPITVGGKIVGSLCAIAGVLTIALPVPVIVSNFNYFYHRETENEEQTQLTQN :::::::: : : ::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::. .. 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