Result of FASTA (omim) for pFN21AE5976
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE5976, 312 aa
  1>>>pF1KE5976 312 - 312 aa - 312 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.3612+/-0.000486; mu= 21.3411+/- 0.030
 mean_var=91.2820+/-22.568, 0's: 0 Z-trim(108.9): 332  B-trim: 1971 in 2/52
 Lambda= 0.134240
 statistics sampled from 16513 (16974) to 16513 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.55), E-opt: 0.2 (0.199), width:  16
 Scan time:  6.020

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309)  970 198.6 1.4e-50
NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311)  818 169.2 9.9e-42
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307)  807 167.0 4.3e-41
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314)  795 164.7 2.2e-40
NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312)  783 162.4 1.1e-39
NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314)  783 162.4 1.1e-39
NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314)  776 161.0 2.8e-39
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300)  775 160.8 3.1e-39
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312)  771 160.1 5.4e-39
NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312)  768 159.5 8.1e-39
XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312)  768 159.5 8.1e-39
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322)  768 159.5 8.3e-39
XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317)  765 158.9 1.2e-38
XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317)  765 158.9 1.2e-38
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317)  765 158.9 1.2e-38
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311)  761 158.1 2.1e-38
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327)  750 156.0 9.3e-38
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308)  730 152.1 1.3e-36
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317)  701 146.5 6.6e-35
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312)  696 145.5 1.3e-34
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318)  505 108.6 1.8e-23
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320)  474 102.6 1.1e-21
NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370)  201 49.8   1e-05
NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332)  198 49.1 1.4e-05
NP_005285 (OMIM: 601909) probable G-protein couple ( 349)  198 49.2 1.5e-05
XP_005251990 (OMIM: 601909) PREDICTED: probable G- ( 349)  198 49.2 1.5e-05
NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337)  188 47.2 5.5e-05
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323)  185 46.6 8.1e-05
NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor  ( 428)  186 47.0 8.3e-05
NP_001699 (OMIM: 190900,613522) short-wave-sensiti ( 348)  185 46.6 8.4e-05
NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348)  182 46.1 0.00013
NP_001006632 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466)  183 46.4 0.00013
NP_001006633 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466)  183 46.4 0.00013
NP_001006631 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466)  183 46.4 0.00013
XP_011514071 (OMIM: 118493) PREDICTED: muscarinic  ( 466)  183 46.4 0.00013
NP_001006629 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466)  183 46.4 0.00013
NP_001006627 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466)  183 46.4 0.00013
NP_000730 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholine  ( 466)  183 46.4 0.00013
NP_001006630 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466)  183 46.4 0.00013
NP_001006628 (OMIM: 118493) muscarinic acetylcholi ( 466)  183 46.4 0.00013
NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471)  182 46.2 0.00015
XP_011508791 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 313)  179 45.4 0.00018
NP_005904 (OMIM: 600042) melanocortin receptor 5 [ ( 325)  179 45.4 0.00018
XP_006712259 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 333)  179 45.5 0.00018
XP_006712258 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 370)  179 45.5  0.0002
XP_011508790 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 376)  179 45.5  0.0002
XP_011508789 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 403)  179 45.6 0.00021
NP_001265426 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412)  179 45.6 0.00021
NP_001265429 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412)  179 45.6 0.00021
NP_001265428 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412)  179 45.6 0.00021


>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H  (309 aa)
 initn: 1010 init1: 970 opt: 970  Z-score: 1029.3  bits: 198.6 E(85289): 1.4e-50
Smith-Waterman score: 970; 47.2% identity (77.1% similar) in 301 aa overlap (4-304:2-302)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MDGENHSVVSEFLFLGLTHSWEIQLLLLVFSSVLYVASITGNILIVFSVTTDPHLHSPMY
          ::.. ..::..::::.. ..: ...:   :.:. ...: .::: ..:..: : ::::
NP_001   MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMY
                 10        20        30        40        50        

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 FLLASLSFIDLGACSVTSPKMIYDLFRKRKVISFGGCIAQIFFIHVIGGVEMVLLIAMAF
       . :: :::::    ::..:..:   .  .:.: :.::..:.:  : .::.: .:: .::.
NP_001 LSLAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAY
       60        70        80        90       100       110        

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 DRYVALCKPLHYLTIMSPRMCLSFLAVAWTLGVSHSLFQLAFLVNLAFCGPNVLDSFYCD
       :.:::.::::::.:::.  .:  ...:.:  :  :. .:. :. .: ::::::.: :.::
NP_001 DHYVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCD
      120       130       140       150       160       170        

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 LPRLLRLACTDTYRLQFMVTVNSGFICVGTFFILLISYVFILFTVWKHSSGGSSKALSTL
       :  :: ::::::. :......::::::. .: .::.::: :: ..  ::  .  ::::: 
NP_001 LNPLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTC
      180       190       200       210       220       230        

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 SAHSTVVLLFFGPPMFVYTRPHPNSQMDKFLAIFDAVLTPFLNPVVYTFRNKEMKAAIKR
        .: :::.::: : .::: ::  .  .:: .::: ...::.:::..::..: .:: ::..
NP_001 VSHITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRK
      240       250       260       270       280       290        

              310  
pF1KE5 VCKQLVIYKRIS
       .:..        
NP_001 LCSRKDISGDK 
      300          

>>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H  (311 aa)
 initn: 706 init1: 556 opt: 818  Z-score: 870.2  bits: 169.2 E(85289): 9.9e-42
Smith-Waterman score: 818; 40.0% identity (74.8% similar) in 305 aa overlap (3-304:4-308)

                10        20        30        40        50         
pF1KE5  MDGENHSVVSEFLFLGLTHSWEIQLLLLVFSSVLYVASITGNILIVFSVTTDPHLHSPM
          : : . .. :..::..   .:  .:...  :.:..:.. :. ..  .  : :::.::
NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE5 YFLLASLSFIDLGACSVTSPKMIYDLFRKRKVISFGGCIAQIFFIHVIGGVEMVLLIAMA
       ::.:..:::::.   : : :::. .:......:.: ::: : :.. ..:  :  :. :::
NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA
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pF1KE5 FDRYVALCKPLHYLTIMSPRMCLSFLAVAWTLGVSHSLFQLAFLVNLAFCGPNVLDSFYC
       .:::.:.:.:: : .:::: .:. ..  :.  :.. ::::.. :..: ::: ::.  :.:
NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC
              130       140       150       160       170       180

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pF1KE5 DLPRLLRLACTDTYRLQFMVTVNSGFICVGTFFILLISYVFILFTVWKHSSG-GSSKALS
       :.:.:: :.::::. .: :... . :. ... ....::: .: ... : .:. : :::..
NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN
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      240       250         260       270       280       290      
pF1KE5 TLSAHSTVVLLFFGPPMFVY--TRPHPNSQMDKFLAIFDAVLTPFLNPVVYTFRNKEMKA
       : ..: :.: ::.   .:::  .    .:..:.: ..: .:. :.:::..:..::::.: 
NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD
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        300       310  
pF1KE5 AIKRVCKQLVIYKRIS
       :.::. :.        
NP_001 ALKRLQKRKCC     
              310      

>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H  (307 aa)
 initn: 837 init1: 612 opt: 807  Z-score: 858.8  bits: 167.0 E(85289): 4.3e-41
Smith-Waterman score: 807; 39.3% identity (75.7% similar) in 300 aa overlap (5-301:2-301)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MDGENHSVVSEFLFLGLTHSWEIQLLLLVFSSVLYVASITGNILIVFSVTTDPHLHSPMY
           :::::.::..::::.. :.: ....:  ..:.... ::.::...   .  ::.:::
NP_001    MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAKIYNNTLHTPMY
                  10        20        30        40        50       

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 FLLASLSFIDLGACSVTSPKMIYDLFRKRKVISFGGCIAQIFFIHVIGGVEMVLLIAMAF
        .: .:. .:.   .   :::.  .. ....::..::..:.:..    :.::::. .::.
NP_001 VFLLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLGAEMVLFTTMAY
        60        70        80        90       100       110       

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 DRYVALCKPLHYLTIMSPRMCLSFLAVAWTLGVSHSLFQLAFLVNLAFCGPNVLDSFYCD
       :::::.: :::: :::. .::...:... ...:..:  . :... :.:::::..: :.:.
NP_001 DRYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWVHTALIMRLTFCGPNTIDHFFCE
       120       130       140       150       160       170       

              190       200       210       220        230         
pF1KE5 LPRLLRLACTDTYRLQFMVTVNSGFICVGTFFILLISYVFILFTVWK-HSSGGSSKALST
       .: :: :.:. .   . :: : .  . .: :..  ::: ::. .. . ..  :. ::.::
NP_001 IPPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILRIRTVEGKRKAFST
       180       190       200       210       220       230       

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pF1KE5 LSAHSTVVLLFFGPPMFVYTRPHPNS--QMDKFLAIFDAVLTPFLNPVVYTFRNKEMKAA
        :.: ::: :...: ...: ::  .   . :: .: . ...:: :::.::.:.:.::.:.
NP_001 CSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQAG
       240       250       260       270       280       290       

       300       310  
pF1KE5 IKRVCKQLVIYKRIS
       :..:           
NP_001 IRKVFAFLKH     
       300            

>>NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 [Ho  (314 aa)
 initn: 796 init1: 592 opt: 795  Z-score: 846.1  bits: 164.7 E(85289): 2.2e-40
Smith-Waterman score: 795; 39.1% identity (73.0% similar) in 304 aa overlap (1-301:1-304)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MDGENHSVVSEFLFLGLTHSWEIQLLLLVFSSVLYVASITGNILIVFSVTTDPHLHSPMY
       ::: : :. ..:..::..   ... .:.:   . :. ...::  :..    :::::.:::
NP_001 MDGTNGSTQTHFILLGFSDRPHLERILFVVILIAYLLTLVGNTTIILVSRLDPHLHTPMY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 FLLASLSFIDLGACSVTSPKMIYDLFRKRKVISFGGCIAQIFFIHVIGGVEMVLLIAMAF
       :.:: :::.::.  . . :...:.:    :.::. ::  :.:..  .:::: .:: .::.
NP_001 FFLAHLSFLDLSFTTSSIPQLLYNLNGCDKTISYMGCAIQLFLFLGLGGVECLLLAVMAY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 DRYVALCKPLHYLTIMSPRMCLSFLAVAWTLGVSHSLFQLAFLVNLAFCGPNVLDSFYCD
       :: ::.::::::..::.::.: ....:.:  ::..:: .    . :  :: . .: :  .
NP_001 DRCVAICKPLHYMVIMNPRLCRGLVSVTWGCGVANSLAMSPVTLRLPRCGHHEVDHFLRE
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220        230         
pF1KE5 LPRLLRLACTDTYRLQFMVTVNSGFICVGTFFILLISYVFILFTVWK-HSSGGSSKALST
       .: :.:.::..:  ..  : : .  . .. . ..:.:: .:. .: . .:..: .::..:
NP_001 MPALIRMACVSTVAIEGTVFVLAVGVVLSPLVFILLSYSYIVRAVLQIRSASGRQKAFGT
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260         270       280       290       
pF1KE5 LSAHSTVVLLFFGPPMFVYTRPHPNSQMDK--FLAIFDAVLTPFLNPVVYTFRNKEMKAA
        ..: ::: ::.:  ...: .:  .:..:.  :: .:  ..::.:::..::.::.:.:.:
NP_001 CGSHLTVVSLFYGNIIYMYMQPGASSSQDQGMFLMLFYNIVTPLLNPLIYTLRNREVKGA
              250       260       270       280       290       300

       300       310  
pF1KE5 IKRVCKQLVIYKRIS
       . :.           
NP_001 LGRLLLGKRELGKE 
              310     

>>NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [Homo   (312 aa)
 initn: 764 init1: 583 opt: 783  Z-score: 833.6  bits: 162.4 E(85289): 1.1e-39
Smith-Waterman score: 783; 42.7% identity (71.9% similar) in 302 aa overlap (5-301:3-302)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MDGENHSVVSEFLFLGLTHSWEIQLLLLVFSSVLYVASITGNILIVFSVTTDPHLHSPMY
           :.: .  ::.::...   ..  :.:   . :. ...:: ::..  . ::.::::::
NP_009   MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMY
                 10        20        30        40        50        

               70          80        90       100       110        
pF1KE5 FLLASLSFIDLGACSVTS--PKMIYDLFRKRKVISFGGCIAQIFFIHVIGGVEMVLLIAM
       :.:..:::.::  : .::  :.:. .:.  .:.:::  : .:::..  .: .: .:: .:
NP_009 FFLSNLSFLDL--CFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVM
       60          70        80        90       100       110      

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE5 AFDRYVALCKPLHYLTIMSPRMCLSFLAVAWTLGVSHSLFQLAFLVNLAFCGPNVLDSFY
       :::::::.:.:::: ::. ::.: .. .:::..:. .:. :    ..: ::    .:.: 
NP_009 AFDRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFV
        120       130       140       150       160       170      

      180       190       200       210       220        230       
pF1KE5 CDLPRLLRLACTDTYRLQFMVTVNSGFICVGTFFILLISYVFILFTVWK-HSSGGSSKAL
       :..: :.::.: ::   ...:.: : :: :  . ..:.::  : ..: . .:. :  ::.
NP_009 CEVPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAF
        180       190       200       210       220       230      

       240       250       260         270       280       290     
pF1KE5 STLSAHSTVVLLFFGPPMFVYTRP-HPNSQM-DKFLAIFDAVLTPFLNPVVYTFRNKEMK
       .: :.: ::: ::..  . :: .: .: .:   ::...: :: :: :::..::.::::. 
NP_009 GTCSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEVT
        240       250       260       270       280       290      

         300       310  
pF1KE5 AAIKRVCKQLVIYKRIS
        :..:.           
NP_009 RAFRRLLGKEMGLTQS 
        300       310   

>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo   (314 aa)
 initn: 796 init1: 613 opt: 783  Z-score: 833.5  bits: 162.4 E(85289): 1.1e-39
Smith-Waterman score: 783; 36.5% identity (73.7% similar) in 304 aa overlap (1-301:1-304)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MDGENHSVVSEFLFLGLTHSWEIQLLLLVFSSVLYVASITGNILIVFSVTTDPHLHSPMY
       :  .:.. ..::..:::. . :.:..:..:  :.:. .. ::. ... .  : .::.:::
NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 FLLASLSFIDLGACSVTSPKMIYDLFRKRKVISFGGCIAQIFFIHVIGGVEMVLLIAMAF
       :.::.:::.:.   .. .:::. ::. ..:.:::.::. :..:.  .. .: .:.  ::.
NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 DRYVALCKPLHYLTIMSPRMCLSFLAVAWTLGVSHSLFQLAFLVNLAFCGPNVLDSFYCD
       :::.:.:.:: :  :::  . :.. : :.. :. . . . . . .:.::  ::.  :.::
NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220        230         
pF1KE5 LPRLLRLACTDTYRLQFMVTVNSGFICVGTFFILLISYVFILFTVWK-HSSGGSSKALST
        : :..:.:.::   . . .. .:   :::....: :: ..::.... ::. :  .:.::
NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
              190       200       210       220       230       240

     240       250       260         270       280       290       
pF1KE5 LSAHSTVVLLFFGPPMFVYTRPHPNSQM--DKFLAIFDAVLTPFLNPVVYTFRNKEMKAA
        ..: :...::..  ...: ::  . ..  ::  ..: .:. :.:::..:..:.::.: :
NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
              250       260       270       280       290       300

       300       310  
pF1KE5 IKRVCKQLVIYKRIS
       .  :           
NP_003 LANVISRKRTSSFL 
              310     

>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo   (314 aa)
 initn: 760 init1: 576 opt: 776  Z-score: 826.2  bits: 161.0 E(85289): 2.8e-39
Smith-Waterman score: 776; 37.8% identity (72.3% similar) in 307 aa overlap (5-306:7-311)

                 10        20        30        40        50        
pF1KE5   MDGENHSVVSEFLFLGLTHSWEIQLLLLVFSSVLYVASITGNILIVFSVTTDPHLHSP
             :...:.::..::.    :.:..:...  .::.  . ::: ... .  ::::..:
NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP
               10        20        30        40        50        60

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE5 MYFLLASLSFIDLGACSVTSPKMIYDLFRKRKVISFGGCIAQIFFIHVIGGVEMVLLIAM
       :::.:..:::.::   :   :::. ... . : ::. ::  :..:. ... .:  .: ::
NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM
               70        80        90       100       110       120

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE5 AFDRYVALCKPLHYLTIMSPRMCLSFLAVAWTLGVSHSLFQLAFLVNLAFCGPNVLDSFY
       :.:::::.:.:: : ..::  .:. ......  :   :: . .:   : .:  ::.. :.
NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
              130       140       150       160       170       180

      180       190       200       210       220        230       
pF1KE5 CDLPRLLRLACTDTYRLQFMVTVNSGFICVGTFFILLISYVFILFTVWK-HSSGGSSKAL
       :::: ::.:.::::   ...... .. . .  :.:..::: :::..: : .: .: .:..
NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF
              190       200       210       220       230       240

       240       250       260           270       280       290   
pF1KE5 STLSAHSTVVLLFFGPPMFVYTRPH----PNSQMDKFLAIFDAVLTPFLNPVVYTFRNKE
       :: ..: : : .. :  .:.:.::     ::.  ::....: ... : :::..:..:::.
NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNT--DKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKD
              250       260       270         280       290        

           300       310  
pF1KE5 MKAAIKRVCKQLVIYKRIS
       .: : ..: .. :      
NP_006 VKDAAEKVLRSKVDSS   
      300       310       

>>XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory recep  (300 aa)
 initn: 756 init1: 583 opt: 775  Z-score: 825.4  bits: 160.8 E(85289): 3.1e-39
Smith-Waterman score: 775; 43.2% identity (72.0% similar) in 296 aa overlap (5-295:3-296)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MDGENHSVVSEFLFLGLTHSWEIQLLLLVFSSVLYVASITGNILIVFSVTTDPHLHSPMY
           :.: .  ::.::...   ..  :.:   . :. ...:: ::..  . ::.::::::
XP_011   MVNQSSTPGFLLLGFSEHPGLERTLFVVVLTSYLLTLVGNTLIILLSALDPKLHSPMY
                 10        20        30        40        50        

               70          80        90       100       110        
pF1KE5 FLLASLSFIDLGACSVTS--PKMIYDLFRKRKVISFGGCIAQIFFIHVIGGVEMVLLIAM
       :.:..:::.::  : .::  :.:. .:.  .:.:::  : .:::..  .: .: .:: .:
XP_011 FFLSNLSFLDL--CFTTSCVPQMLVNLWGPKKTISFLDCSVQIFIFLSLGTTECILLTVM
       60          70        80        90       100       110      

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE5 AFDRYVALCKPLHYLTIMSPRMCLSFLAVAWTLGVSHSLFQLAFLVNLAFCGPNVLDSFY
       :::::::.:.:::: ::. ::.: .. .:::..:. .:. :    ..: ::    .:.: 
XP_011 AFDRYVAVCQPLHYATIIHPRLCWQLASVAWVIGLVESVVQTPSTLHLPFCPDRQVDDFV
        120       130       140       150       160       170      

      180       190       200       210       220        230       
pF1KE5 CDLPRLLRLACTDTYRLQFMVTVNSGFICVGTFFILLISYVFILFTVWK-HSSGGSSKAL
       :..: :.::.: ::   ...:.: : :: :  . ..:.::  : ..: . .:. :  ::.
XP_011 CEVPALIRLSCEDTSYNEIQVAVASVFILVVPLSLILVSYGAITWAVLRINSAKGRRKAF
        180       190       200       210       220       230      

       240       250       260         270       280       290     
pF1KE5 STLSAHSTVVLLFFGPPMFVYTRP-HPNSQM-DKFLAIFDAVLTPFLNPVVYTFRNKEMK
       .: :.: ::: ::..  . :: .: .: .:   ::...: :: :: :::..::.::::.:
XP_011 GTCSSHLTVVTLFYSSVIAVYLQPKNPYAQERGKFFGLFYAVGTPSLNPLIYTLRNKEQK
        240       250       260       270       280       290      

         300       310  
pF1KE5 AAIKRVCKQLVIYKRIS
                        
XP_011 RRGS             
        300             

>>NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [Homo   (312 aa)
 initn: 748 init1: 602 opt: 771  Z-score: 821.0  bits: 160.1 E(85289): 5.4e-39
Smith-Waterman score: 771; 37.5% identity (73.7% similar) in 315 aa overlap (1-312:1-312)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MDGENHSVVSEFLFLGLTHSWEIQLLLLVFSSVLYVASITGNILIVFSVTTDPHLHSPMY
       ::: :.:  ::::.::...: : : .:. .   .:.....::.::......: .::.:.:
NP_002 MDGGNQSEGSEFLLLGMSESPEQQRILFWMFLSMYLVTVVGNVLIILAISSDSRLHTPVY
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 FLLASLSFIDLGACSVTSPKMIYDLFRKRKVISFGGCIAQIFFIHVIGGVEMVLLIAMAF
       :.::.::: ::   . : :::. .:  . :.::..::..:..:.  . ... ..: .::.
NP_002 FFLANLSFTDLFFVTNTIPKMLVNLQSHNKAISYAGCLTQLYFLVSLVALDNLILAVMAY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 DRYVALCKPLHYLTIMSPRMCLSFLAVAWTLGVSHSLFQLAFLVNLAFCGPNVLDSFYCD
       :::::.: :::: : :::..:. .:.. :.:.: ..:..  ... ..:::   .  ..:.
NP_002 DRYVAICCPLHYTTAMSPKLCILLLSLCWVLSVLYGLIHTLLMTRVTFCGSRKIHYIFCE
              130       140       150       160       170       180

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       .  :::.::..  ...  : . .: :: .  : ...::::.:. .. .  : . . ::.:
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       . :.  .   .::..
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312 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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