FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5791, 631 aa 1>>>pF1KE5791 631 - 631 aa - 631 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2825+/-0.00111; mu= 14.5139+/- 0.066 mean_var=82.7493+/-16.812, 0's: 0 Z-trim(103.8): 71 B-trim: 140 in 1/48 Lambda= 0.140991 statistics sampled from 7529 (7600) to 7529 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.583), E-opt: 0.2 (0.233), width: 16 Scan time: 3.370 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX ( 631) 4164 857.3 0 CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6 ( 648) 2527 524.4 1.9e-148 CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 729) 1148 243.9 5.8e-64 CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 ( 731) 1148 243.9 5.8e-64 CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 1130 240.2 6.3e-63 CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 ( 614) 1130 240.2 6.3e-63 CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1031) 1068 227.7 6.2e-59 CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1032) 1068 227.7 6.2e-59 CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17 ( 938) 978 209.3 1.8e-53 CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 575) 845 182.2 1.7e-45 CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 690) 845 182.2 2e-45 CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 704) 845 182.2 2e-45 CCDS3969.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5 ( 724) 845 182.2 2e-45 CCDS55404.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 646) 756 164.1 5.2e-40 CCDS43931.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX ( 662) 756 164.1 5.3e-40 CCDS14782.1 DDX3Y gene_id:8653|Hs108|chrY ( 660) 736 160.1 8.9e-39 CCDS30964.1 DDX59 gene_id:83479|Hs108|chr1 ( 619) 713 155.4 2.2e-37 CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20 ( 796) 695 151.7 3.4e-36 CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 881) 679 148.5 3.6e-35 CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12 ( 882) 679 148.5 3.6e-35 CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12 ( 455) 670 146.6 7e-35 CCDS73144.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 715) 661 144.8 3.7e-34 CCDS31211.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10 ( 783) 661 144.8 4.1e-34 CCDS11323.1 DDX52 gene_id:11056|Hs108|chr17 ( 599) 654 143.4 8.6e-34 CCDS4427.1 DDX41 gene_id:51428|Hs108|chr5 ( 622) 643 141.1 4.2e-33 CCDS44751.1 DDX6 gene_id:1656|Hs108|chr11 ( 483) 640 140.5 5.1e-33 CCDS7283.1 DDX50 gene_id:79009|Hs108|chr10 ( 737) 636 139.7 1.3e-32 CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17 ( 411) 629 138.2 2.1e-32 CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 406) 608 133.9 4e-31 CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3 ( 407) 604 133.1 7e-31 CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2 ( 670) 594 131.2 4.5e-30 CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19 ( 483) 591 130.5 5.1e-30 CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6 ( 428) 565 125.2 1.8e-28 CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11 ( 875) 565 125.3 3.4e-28 CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19 ( 427) 560 124.2 3.6e-28 CCDS842.1 DDX20 gene_id:11218|Hs108|chr1 ( 824) 522 116.6 1.4e-25 CCDS8770.1 DDX23 gene_id:9416|Hs108|chr12 ( 820) 482 108.4 3.9e-23 CCDS44766.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 483) 456 103.1 9.4e-22 CCDS10889.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 ( 478) 453 102.4 1.4e-21 CCDS10888.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 479) 453 102.4 1.4e-21 CCDS58511.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17 ( 347) 441 99.9 5.8e-21 CCDS81646.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11 ( 369) 436 98.9 1.2e-20 CCDS42187.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 370) 430 97.7 2.9e-20 CCDS59053.1 DDX56 gene_id:54606|Hs108|chr7 ( 507) 427 97.2 5.9e-20 CCDS82009.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16 ( 447) 397 91.0 3.6e-18 CCDS32475.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 448) 397 91.0 3.6e-18 CCDS58478.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16 ( 453) 397 91.0 3.7e-18 CCDS6952.1 DDX31 gene_id:64794|Hs108|chr9 ( 585) 394 90.5 7e-18 CCDS5492.1 DDX56 gene_id:54606|Hs108|chr7 ( 547) 342 79.9 1e-14 CCDS9251.1 DDX55 gene_id:57696|Hs108|chr12 ( 600) 298 71.0 5.4e-12 >>CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX (631 aa) initn: 4164 init1: 4164 opt: 4164 Z-score: 4578.4 bits: 857.3 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 4164; 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CCDS49 EAVAAGHEELPLCFALKSHFVGAVIGRGGSKIKNIQSTTNTTIQIIQEQPESLVKIFGSK 60 70 80 90 100 110 100 110 120 130 140 150 pF1KE5 EMKAKAKAAIETLIRK-QESYNSESSVDNAASQTPIGRNLGR-NDIVGEAEPLSNWDRIR :..::::.:.....: .:.:::: ..:.: : .:.. . :..:. .:: .::.:: CCDS49 AMQTKAKAVIDNFVKKLEENYNSECGIDTAF-QPSVGKDGSTDNNVVAGDRPLIDWDQIR 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 210 pF1KE5 AAVVECEKRKWADLPPVKKNFYIESKATSCMSEMQVINWRKENFNITCDDLKSGEKRLIP .. .: :::::::.::::: :: ::: ::.... .::::::::: ::::.:::: :: CCDS49 EEGLKWQKTKWADLPPIKKNFYKESTATSAMSKVEADSWRKENFNITWDDLKDGEKRPIP 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE5 KPTCRFKDAFQQYPDLLKSIIRVGIVKPTPIQSQAWPIILQGIDLIVVAQTGTGKTLSYL .::: : :::: ::.....: ..:. ::::::::::::.::::::: :::::::::: :: CCDS49 NPTCTFDDAFQCYPEVMENIKKAGFQKPTPIQSQAWPIVLQGIDLIGVAQTGTGKTLCYL 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KE5 MPGFIHLDSQPISREQRNGPGMLVLTPTRELALHVEAECSKYSYKGLKSICIYGGRNRNG ::::::: :: . ::: ::::::::::::::.::.:: :::::::.:.:.::: ::. 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CCDS49 VRILIATDLASRGLDVHDVTHVYNFDFPRNIEEYVHRIGRTGRAGRTGVSITTLTRNDWR 540 550 560 570 580 590 580 590 600 610 620 630 pF1KE5 MAGELIKILDRANQSVPEDLVVMAEQYKLNQQKRHRETRSRKPGQRRKEFYFLS .:.:::.::.:::::.::.:: :::..: .::::. : . ..: : :.:. CCDS49 VASELINILERANQSIPEELVSMAERFKAHQQKREMERKMERPQGRPKKFH 600 610 620 630 640 >>CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 (729 aa) initn: 1002 init1: 627 opt: 1148 Z-score: 1261.9 bits: 243.9 E(32554): 5.8e-64 Smith-Waterman score: 1148; 43.6% identity (72.8% similar) in 445 aa overlap (165-603:119-554) 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 GRNLGRNDIVGEAEPLSNWDRIRAAVVECEKRKW--ADLPPVKKNFYIESKATSCMSEMQ :.:: ..:: .::::.: .. .. .. 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CCDS33 GFPLALSGRDMVGIAQTGSGKTLAYLLPAIVHINHQPYL-ERGDGPICLVLAPTRELAQQ 210 220 230 240 250 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 VEAECSKYSYKG-LKSICIYGGRNRNGQIEDISKGVDIIIATPGRLNDLQMNNSVNLRSI :. . :. . ::: ::::: .. ::.:. .::.: ::::::: :. ....::: CCDS33 VQQVADDYGKCSRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLESGKTNLRRC 260 270 280 290 300 310 380 390 400 410 420 430 pF1KE5 TYLVIDEADKMLDMEFEPQIRKILLDVRPDRQTVMTSATWPDTVRQLALSYLKDPMIVYV ::::.::::.:::: ::::::::. ..::::::.: ::::: ::::: ..:.: . : CCDS33 TYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLRDYTQINV 320 330 340 350 360 370 440 450 460 470 480 pF1KE5 GNLNLVAVNTVKQNIIVTTEKEK-RALTQEFVENMSPND-KVIMFVSQKHIADDLSSDFN :::.: : ... : . : :.:: . : : . : :. .. :.:.:: :. :::. . CCDS33 GNLELSANHNILQIVDVCMESEKDHKLIQLMEEIMAEKENKTIIFVETKRRCDDLTRRMR 380 390 400 410 420 430 490 500 510 520 530 540 pF1KE5 IQGISAESLHGNSEQSDQERAVEDFKSGNIKILITTDIVSRGLDLNDVTHVYNYDFPRNI .: : .::.. : ... ....:.::. :::.::..:::::..:: : :::.: . CCDS33 RDGWPAMCIHGDKSQPERDWVLNEFRSGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSS 440 450 460 470 480 490 550 560 570 580 590 600 pF1KE5 DVYVHRVGYIGRTGKTGTSVTLITQRDSKMAGELIKILDRANQSVPEDLVVMAEQYKLNQ . ::::.: .:. . ::. :..: . :.: ::::.:..:::.. :. .... CCDS33 EDYVHRIGRTARSTNKGTAYTFFTPGNLKQARELIKVLEEANQAINPKLMQLVDHRGGGG 500 510 520 530 540 550 610 620 630 pF1KE5 QKRHRETRSRKPGQRRKEFYFLS CCDS33 GGGGRSRYRTTSSANNPNLMYQDECDRRLRGVKDGGRRDSASYRDRSETDRAGYANGSGY 560 570 580 590 600 610 >>CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22 (731 aa) initn: 1002 init1: 627 opt: 1148 Z-score: 1261.8 bits: 243.9 E(32554): 5.8e-64 Smith-Waterman score: 1148; 43.6% identity (72.8% similar) in 445 aa overlap (165-603:119-554) 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 GRNLGRNDIVGEAEPLSNWDRIRAAVVECEKRKW--ADLPPVKKNFYIESKATSCMSEMQ :.:: ..:: .::::.: .. .. .. CCDS46 DRDRDRGGFGARGGGGLPPKKFGNPGERLRKKKWDLSELPKFEKNFYVEHPEVARLTPYE 90 100 110 120 130 140 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 VINWRKENFNITCDDLKSGEKRLIPKPTCRFKDA-FQQYPDLLKSIIRVGIVKPTPIQSQ : . :... .:: ...:. . :::. :. : : :: .. .. ...::::: : CCDS46 VDELRRKK-EIT---VRGGD--VCPKPVFAFHHANFPQY--VMDVLMDQHFTEPTPIQCQ 150 160 170 180 190 200 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 AWPIILQGIDLIVVAQTGTGKTLSYLMPGFIHLDSQPISREQRNGPGMLVLTPTRELALH ..:. :.: :.. .::::.::::.::.:...:.. :: :. .:: :::.:::::: . CCDS46 GFPLALSGRDMVGIAQTGSGKTLAYLLPAIVHINHQPYL-ERGDGPICLVLAPTRELAQQ 210 220 230 240 250 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 VEAECSKYSYKG-LKSICIYGGRNRNGQIEDISKGVDIIIATPGRLNDLQMNNSVNLRSI :. . :. . ::: ::::: .. ::.:. .::.: ::::::: :. ....::: CCDS46 VQQVADDYGKCSRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLESGKTNLRRC 260 270 280 290 300 310 380 390 400 410 420 430 pF1KE5 TYLVIDEADKMLDMEFEPQIRKILLDVRPDRQTVMTSATWPDTVRQLALSYLKDPMIVYV ::::.::::.:::: ::::::::. ..::::::.: ::::: ::::: ..:.: . : CCDS46 TYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLRDYTQINV 320 330 340 350 360 370 440 450 460 470 480 pF1KE5 GNLNLVAVNTVKQNIIVTTEKEK-RALTQEFVENMSPND-KVIMFVSQKHIADDLSSDFN :::.: : ... : . : :.:: . : : . : :. .. :.:.:: :. :::. . CCDS46 GNLELSANHNILQIVDVCMESEKDHKLIQLMEEIMAEKENKTIIFVETKRRCDDLTRRMR 380 390 400 410 420 430 490 500 510 520 530 540 pF1KE5 IQGISAESLHGNSEQSDQERAVEDFKSGNIKILITTDIVSRGLDLNDVTHVYNYDFPRNI .: : .::.. : ... ....:.::. :::.::..:::::..:: : :::.: . CCDS46 RDGWPAMCIHGDKSQPERDWVLNEFRSGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSS 440 450 460 470 480 490 550 560 570 580 590 600 pF1KE5 DVYVHRVGYIGRTGKTGTSVTLITQRDSKMAGELIKILDRANQSVPEDLVVMAEQYKLNQ . ::::.: .:. . ::. :..: . :.: ::::.:..:::.. :. .... CCDS46 EDYVHRIGRTARSTNKGTAYTFFTPGNLKQARELIKVLEEANQAINPKLMQLVDHRGGGG 500 510 520 530 540 550 610 620 630 pF1KE5 QKRHRETRSRKPGQRRKEFYFLS CCDS46 GGGKGGRSRYRTTSSANNPNLMYQDECDRRLRGVKDGGRRDSASYRDRSETDRAGYANGS 560 570 580 590 600 610 >>CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 (614 aa) initn: 1034 init1: 641 opt: 1130 Z-score: 1243.3 bits: 240.2 E(32554): 6.3e-63 Smith-Waterman score: 1130; 41.8% identity (70.5% similar) in 474 aa overlap (165-627:43-505) 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 GRNLGRNDIVGEAEPLSNWDRIRAAVVECEKRKWA--DLPPVKKNFYIESKATSCMSEMQ :.:: .:: .:::: : . . .. CCDS82 SVRFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQE 20 30 40 50 60 70 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 VINWRKENFNITCDDLKSGEKRLIPKPTCRFKDAFQQYP-DLLKSIIRVGIVKPTPIQSQ : ..:. . .:: :.. :::. : .: ..: ... : : ....:: ::.: CCDS82 VETYRRSK-EITV----RGHN--CPKPVLNFYEA--NFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQ 80 90 100 110 120 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 AWPIILQGIDLIVVAQTGTGKTLSYLMPGFIHLDSQPISREQRNGPGMLVLTPTRELALH .::. :.:.:.. :::::.:::::::.:...:.. ::. :. .:: :::.:::::: . CCDS82 GWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFL-ERGDGPICLVLAPTRELAQQ 130 140 150 160 170 180 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 VEAECSKYSYKG-LKSICIYGGRNRNGQIEDISKGVDIIIATPGRLNDLQMNNSVNLRSI :. ..: ::: ::::: .. ::.:. .::.: ::::::: :. ...::: CCDS82 VQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRT 190 200 210 220 230 240 380 390 400 410 420 430 pF1KE5 TYLVIDEADKMLDMEFEPQIRKILLDVRPDRQTVMTSATWPDTVRQLALSYLKDPMIVYV ::::.::::.:::: ::::::::. ..::::::.: ::::: ::::: ..::: . . . CCDS82 TYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINI 250 260 270 280 290 300 440 450 460 470 480 pF1KE5 GNLNLVAVNTVKQNIIVTTEKEK-RALTQEFVENMSPND-KVIMFVSQKHIADDLSSDFN : :.: : ... : . : . :: . : . . : :: .. :.:.:: :. :.:. . CCDS82 GALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMR 310 320 330 340 350 360 490 500 510 520 530 540 pF1KE5 IQGISAESLHGNSEQSDQERAVEDFKSGNIKILITTDIVSRGLDLNDVTHVYNYDFPRNI .: : ..::.. :.... ....:: :. :::.::..:::::..:: : :::.: . CCDS82 RDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSS 370 380 390 400 410 420 550 560 570 580 590 600 pF1KE5 DVYVHRVGYIGRTGKTGTSVTLITQRDSKMAGELIKILDRANQSVPEDLVVMAEQYKLNQ . :.::.: .:. ::::. :..: . :....::..: .:::.. :. ..:. . . CCDS82 EDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVED-RGSG 430 440 450 460 470 480 610 620 630 pF1KE5 QKRHR-----ETRSRKPGQRRKEFYFLS ..: : . :.: . .: : CCDS82 RSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAANYT 490 500 510 520 530 540 >>CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17 (614 aa) initn: 1039 init1: 641 opt: 1130 Z-score: 1243.3 bits: 240.2 E(32554): 6.3e-63 Smith-Waterman score: 1130; 41.8% identity (70.5% similar) in 474 aa overlap (165-627:43-505) 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 GRNLGRNDIVGEAEPLSNWDRIRAAVVECEKRKWA--DLPPVKKNFYIESKATSCMSEMQ :.:: .:: .:::: : . . .. CCDS11 DRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQE 20 30 40 50 60 70 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 VINWRKENFNITCDDLKSGEKRLIPKPTCRFKDAFQQYP-DLLKSIIRVGIVKPTPIQSQ : ..:. . .:: :.. :::. : .: ..: ... : : ....:: ::.: CCDS11 VETYRRSK-EITV----RGHN--CPKPVLNFYEA--NFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQ 80 90 100 110 120 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 AWPIILQGIDLIVVAQTGTGKTLSYLMPGFIHLDSQPISREQRNGPGMLVLTPTRELALH .::. :.:.:.. :::::.:::::::.:...:.. ::. :. .:: :::.:::::: . CCDS11 GWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFL-ERGDGPICLVLAPTRELAQQ 130 140 150 160 170 180 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 VEAECSKYSYKG-LKSICIYGGRNRNGQIEDISKGVDIIIATPGRLNDLQMNNSVNLRSI :. ..: ::: ::::: .. ::.:. .::.: ::::::: :. ...::: CCDS11 VQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRT 190 200 210 220 230 240 380 390 400 410 420 430 pF1KE5 TYLVIDEADKMLDMEFEPQIRKILLDVRPDRQTVMTSATWPDTVRQLALSYLKDPMIVYV ::::.::::.:::: ::::::::. ..::::::.: ::::: ::::: ..::: . . . CCDS11 TYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINI 250 260 270 280 290 300 440 450 460 470 480 pF1KE5 GNLNLVAVNTVKQNIIVTTEKEK-RALTQEFVENMSPND-KVIMFVSQKHIADDLSSDFN : :.: : ... : . : . :: . : . . : :: .. :.:.:: :. :.:. . CCDS11 GALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMR 310 320 330 340 350 360 490 500 510 520 530 540 pF1KE5 IQGISAESLHGNSEQSDQERAVEDFKSGNIKILITTDIVSRGLDLNDVTHVYNYDFPRNI .: : ..::.. :.... ....:: :. :::.::..:::::..:: : :::.: . CCDS11 RDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSS 370 380 390 400 410 420 550 560 570 580 590 600 pF1KE5 DVYVHRVGYIGRTGKTGTSVTLITQRDSKMAGELIKILDRANQSVPEDLVVMAEQYKLNQ . :.::.: .:. ::::. :..: . :....::..: .:::.. :. ..:. . . CCDS11 EDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVED-RGSG 430 440 450 460 470 480 610 620 630 pF1KE5 QKRHR-----ETRSRKPGQRRKEFYFLS ..: : . :.: . .: : CCDS11 RSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAANYT 490 500 510 520 530 540 >>CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1031 aa) initn: 936 init1: 334 opt: 1068 Z-score: 1171.5 bits: 227.7 E(32554): 6.2e-59 Smith-Waterman score: 1068; 39.5% identity (69.4% similar) in 461 aa overlap (173-629:330-780) 150 160 170 180 190 200 pF1KE5 IVGEAEPLSNWDRIRAAVVECEKRKWADLPPVKKNFYIESKATSCMSEMQVINWRKENFN : .::::.: . ::. .: .: : . CCDS34 EVDLQTALTGYQTKQRKLLEPVDHGKIEYEPFRKNFYVEVPELAKMSQEEVNVFRLEMEG 300 310 320 330 340 350 210 220 230 240 250 260 pF1KE5 ITCDDLKSGEKRLIPKPTCRFKDAFQQYPDLLKSIIRVGIVKPTPIQSQAWPIILQGIDL :: . . ::: . . .. .:.:. . : ::::::.:: : :..: :: CCDS34 ITV------KGKGCPKPIKSWVQCGISMK-ILNSLKKHGYEKPTPIQTQAIPAIMSGRDL 360 370 380 390 400 410 270 280 290 300 310 320 pF1KE5 IVVAQTGTGKTLSYLMPGFIHLDSQPISREQRNGPGMLVLTPTRELALHVEAECSKYSYK : .:.::.:::...:.: : :. .: : :. .:: ...::::::::.. ::.:.: CCDS34 IGIAKTGSGKTIAFLLPMFRHIMDQR-SLEEGEGPIAVIMTPTRELALQITKECKKFSKT 420 430 440 450 460 470 330 340 350 360 370 pF1KE5 -GLKSICIYGGRNRNGQIEDISKGVDIIIATPGRLNDLQMNNS---VNLRSITYLVIDEA ::. .:.::: . . :: ....:..::. ::::. :. :: .::: .::.:.::: CCDS34 LGLRVVCVYGGTGISEQIAELKRGAEIIVCTPGRMIDMLAANSGRVTNLRRVTYVVLDEA 480 490 500 510 520 530 380 390 400 410 420 430 pF1KE5 DKMLDMEFEPQIRKILLDVRPDRQTVMTSATWPDTVRQLALSYLKDPMIVYVGNLNLVAV :.:.:: ::::. .:. .::::::::: :::.: ... :: :. :. : ::. ..: CCDS34 DRMFDMGFEPQVMRIVDNVRPDRQTVMFSATFPRAMEALARRILSKPIEVQVGGRSVVC- 540 550 560 570 580 590 440 450 460 470 480 490 pF1KE5 NTVKQNIIVTTEKEKRALTQEFVENMSPNDKVIMFVSQKHIADDLSSDFNIQGISAESLH . :.:..:: :..: :.. ... . .::.::.... :: : .:. . ::: CCDS34 SDVEQQVIVIEEEKKFLKLLELLGHYQESGSVIIFVDKQEHADGLLKDLMRASYPCMSLH 600 610 620 630 640 650 500 510 520 530 540 550 pF1KE5 GNSEQSDQERAVEDFKSGNIKILITTDIVSRGLDLNDVTHVYNYDFPRNIDVYVHRVGYI :. .: :.. ..:::.:. :.:..:....::::.. . : ::. : . . ::::.: CCDS34 GGIDQYDRDSIINDFKNGTCKLLVATSVAARGLDVKHLILVVNYSCPNHYEDYVHRAGRT 660 670 680 690 700 710 560 570 580 590 600 610 pF1KE5 GRTGKTGTSVTLITQRDSKMAGELIKILDRANQSVPEDLVVMAEQYKLNQQKRHRETRSR ::.:. : . :.::. ....::..:: :. .. .:: :: . ..: .::: . . .. CCDS34 GRAGNKGYAYTFITEDQARYAGDIIKALELSGTAVPPDLEKLWSDFK-DQQKAEGKIIKK 720 730 740 750 760 620 630 pF1KE5 KPGQRRKEFYFLS . : : : : CCDS34 SSGFSGKGFKFDETEQALANERKKLQKAALGLQDSDDEDAAVDIDEQIESMFNSKKRVKD 770 780 790 800 810 820 >>CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5 (1032 aa) initn: 936 init1: 334 opt: 1068 Z-score: 1171.5 bits: 227.7 E(32554): 6.2e-59 Smith-Waterman score: 1068; 39.5% identity (69.4% similar) in 461 aa overlap (173-629:330-780) 150 160 170 180 190 200 pF1KE5 IVGEAEPLSNWDRIRAAVVECEKRKWADLPPVKKNFYIESKATSCMSEMQVINWRKENFN : .::::.: . ::. .: .: : . CCDS75 EVDLQTALTGYQTKQRKLLEPVDHGKIEYEPFRKNFYVEVPELAKMSQEEVNVFRLEMEG 300 310 320 330 340 350 210 220 230 240 250 260 pF1KE5 ITCDDLKSGEKRLIPKPTCRFKDAFQQYPDLLKSIIRVGIVKPTPIQSQAWPIILQGIDL :: . . ::: . . .. .:.:. . : ::::::.:: : :..: :: CCDS75 ITV------KGKGCPKPIKSWVQCGISMK-ILNSLKKHGYEKPTPIQTQAIPAIMSGRDL 360 370 380 390 400 410 270 280 290 300 310 320 pF1KE5 IVVAQTGTGKTLSYLMPGFIHLDSQPISREQRNGPGMLVLTPTRELALHVEAECSKYSYK : .:.::.:::...:.: : :. .: : :. .:: ...::::::::.. ::.:.: CCDS75 IGIAKTGSGKTIAFLLPMFRHIMDQR-SLEEGEGPIAVIMTPTRELALQITKECKKFSKT 420 430 440 450 460 470 330 340 350 360 370 pF1KE5 -GLKSICIYGGRNRNGQIEDISKGVDIIIATPGRLNDLQMNNS---VNLRSITYLVIDEA ::. .:.::: . . :: ....:..::. ::::. :. :: .::: .::.:.::: CCDS75 LGLRVVCVYGGTGISEQIAELKRGAEIIVCTPGRMIDMLAANSGRVTNLRRVTYVVLDEA 480 490 500 510 520 530 380 390 400 410 420 430 pF1KE5 DKMLDMEFEPQIRKILLDVRPDRQTVMTSATWPDTVRQLALSYLKDPMIVYVGNLNLVAV :.:.:: ::::. .:. .::::::::: :::.: ... :: :. :. : ::. ..: CCDS75 DRMFDMGFEPQVMRIVDNVRPDRQTVMFSATFPRAMEALARRILSKPIEVQVGGRSVVC- 540 550 560 570 580 590 440 450 460 470 480 490 pF1KE5 NTVKQNIIVTTEKEKRALTQEFVENMSPNDKVIMFVSQKHIADDLSSDFNIQGISAESLH . :.:..:: :..: :.. ... . .::.::.... :: : .:. . ::: CCDS75 SDVEQQVIVIEEEKKFLKLLELLGHYQESGSVIIFVDKQEHADGLLKDLMRASYPCMSLH 600 610 620 630 640 650 500 510 520 530 540 550 pF1KE5 GNSEQSDQERAVEDFKSGNIKILITTDIVSRGLDLNDVTHVYNYDFPRNIDVYVHRVGYI :. .: :.. ..:::.:. :.:..:....::::.. . : ::. : . . ::::.: CCDS75 GGIDQYDRDSIINDFKNGTCKLLVATSVAARGLDVKHLILVVNYSCPNHYEDYVHRAGRT 660 670 680 690 700 710 560 570 580 590 600 610 pF1KE5 GRTGKTGTSVTLITQRDSKMAGELIKILDRANQSVPEDLVVMAEQYKLNQQKRHRETRSR ::.:. : . :.::. ....::..:: :. .. .:: :: . ..: .::: . . .. CCDS75 GRAGNKGYAYTFITEDQARYAGDIIKALELSGTAVPPDLEKLWSDFK-DQQKAEGKIIKK 720 730 740 750 760 620 630 pF1KE5 KPGQRRKEFYFLS . : : : : CCDS75 SSGFSGKGFKFDETEQALANERKKLQKAALGLQDSDDEDAAVDIDEQIESMFNSKKRVKD 770 780 790 800 810 820 >>CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17 (938 aa) initn: 940 init1: 779 opt: 978 Z-score: 1073.2 bits: 209.3 E(32554): 1.8e-53 Smith-Waterman score: 979; 36.1% identity (69.4% similar) in 454 aa overlap (170-619:209-650) 140 150 160 170 180 190 pF1KE5 RNDIVGEAEPLSNWDRIRAAVVECEKRKWADLPPVKKNFYIESKATSCMSEMQVINWR-K : :: .:::: : . . .. .:.:. : : CCDS32 DNLEYDSDGNPIAPTKKIIDPLPPIDHSEIDYPPFEKNFYNEHEEITNLTPQQLIDLRHK 180 190 200 210 220 230 200 210 220 230 240 250 pF1KE5 ENFNITCDDLKSGEKRLIPKPTCRFKDAFQQYPDLLKSIIRVGIVKPTPIQSQAWPIILQ :. . :: :.: : : .:...: . ..::::: :. :. :. CCDS32 LNLRV------SGAAP--PRPGSSFAH-FGFDEQLMHQIRKSEYTQPTPIQCQGVPVALS 240 250 260 270 280 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 GIDLIVVAQTGTGKTLSYLMPGFIHLDSQPISREQRNGPGMLVLTPTRELALHVEAECSK : :.: .:.::.::: ... : .::. .: : .:: ... ::::: ...:::.. CCDS32 GRDMIGIAKTGSGKTAAFIWPMLIHIMDQK-ELEPGDGPIAVIVCPTRELCQQIHAECKR 290 300 310 320 330 340 320 330 340 350 360 370 pF1KE5 YSYK-GLKSICIYGGRNRNGQIEDISKGVDIIIATPGRLNDLQMNNSVNLRSITYLVIDE .. .:.:. .::: . : . ...:..:.. ::::: : ....::. ..:::.:: CCDS32 FGKAYNLRSVAVYGGGSMWEQAKALQEGAEIVVCTPGRLIDHVKKKATNLQRVSYLVFDE 350 360 370 380 390 400 380 390 400 410 420 430 pF1KE5 ADKMLDMEFEPQIRKILLDVRPDRQTVMTSATWPDTVRQLALSYLKDPMIVYVGNLNLVA ::.:.:: :: :.:.: :::::::.. :::. ...:: . : ::. : :... : CCDS32 ADRMFDMGFEYQVRSIASHVRPDRQTLLFSATFRKKIEKLARDILIDPIRVVQGDIGE-A 410 420 430 440 450 460 440 450 460 470 480 490 pF1KE5 VNTVKQ--NIIVTTEKEKRALTQEFVENMSPNDKVIMFVSQKHIADDLSSDFNIQGISAE . : : .:. . .. ::...:: .. . .:..::..: :..:..... .: . 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