Result of FASTA (ccds) for pFN21AE5791
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE5791, 631 aa
  1>>>pF1KE5791 631 - 631 aa - 631 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2825+/-0.00111; mu= 14.5139+/- 0.066
 mean_var=82.7493+/-16.812, 0's: 0 Z-trim(103.8): 71  B-trim: 140 in 1/48
 Lambda= 0.140991
 statistics sampled from 7529 (7600) to 7529 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.583), E-opt: 0.2 (0.233), width:  16
 Scan time:  3.370

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX        ( 631) 4164 857.3       0
CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6          ( 648) 2527 524.4 1.9e-148
CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22        ( 729) 1148 243.9 5.8e-64
CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22        ( 731) 1148 243.9 5.8e-64
CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17          ( 614) 1130 240.2 6.3e-63
CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17          ( 614) 1130 240.2 6.3e-63
CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5          (1031) 1068 227.7 6.2e-59
CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5          (1032) 1068 227.7 6.2e-59
CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17        ( 938)  978 209.3 1.8e-53
CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5          ( 575)  845 182.2 1.7e-45
CCDS47208.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5          ( 690)  845 182.2   2e-45
CCDS54854.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5          ( 704)  845 182.2   2e-45
CCDS3969.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5           ( 724)  845 182.2   2e-45
CCDS55404.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX          ( 646)  756 164.1 5.2e-40
CCDS43931.1 DDX3X gene_id:1654|Hs108|chrX          ( 662)  756 164.1 5.3e-40
CCDS14782.1 DDX3Y gene_id:8653|Hs108|chrY          ( 660)  736 160.1 8.9e-39
CCDS30964.1 DDX59 gene_id:83479|Hs108|chr1         ( 619)  713 155.4 2.2e-37
CCDS13416.1 DDX27 gene_id:55661|Hs108|chr20        ( 796)  695 151.7 3.4e-36
CCDS31907.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12        ( 881)  679 148.5 3.6e-35
CCDS44984.1 DDX54 gene_id:79039|Hs108|chr12        ( 882)  679 148.5 3.6e-35
CCDS8655.1 DDX47 gene_id:51202|Hs108|chr12         ( 455)  670 146.6   7e-35
CCDS73144.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10         ( 715)  661 144.8 3.7e-34
CCDS31211.1 DDX21 gene_id:9188|Hs108|chr10         ( 783)  661 144.8 4.1e-34
CCDS11323.1 DDX52 gene_id:11056|Hs108|chr17        ( 599)  654 143.4 8.6e-34
CCDS4427.1 DDX41 gene_id:51428|Hs108|chr5          ( 622)  643 141.1 4.2e-33
CCDS44751.1 DDX6 gene_id:1656|Hs108|chr11          ( 483)  640 140.5 5.1e-33
CCDS7283.1 DDX50 gene_id:79009|Hs108|chr10         ( 737)  636 139.7 1.3e-32
CCDS11767.1 EIF4A3 gene_id:9775|Hs108|chr17        ( 411)  629 138.2 2.1e-32
CCDS11113.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17        ( 406)  608 133.9   4e-31
CCDS3282.1 EIF4A2 gene_id:1974|Hs108|chr3          ( 407)  604 133.1   7e-31
CCDS2120.1 DDX18 gene_id:8886|Hs108|chr2           ( 670)  594 131.2 4.5e-30
CCDS12390.1 DDX49 gene_id:54555|Hs108|chr19        ( 483)  591 130.5 5.1e-30
CCDS4697.1 DDX39B gene_id:7919|Hs108|chr6          ( 428)  565 125.2 1.8e-28
CCDS8342.1 DDX10 gene_id:1662|Hs108|chr11          ( 875)  565 125.3 3.4e-28
CCDS12308.1 DDX39A gene_id:10212|Hs108|chr19       ( 427)  560 124.2 3.6e-28
CCDS842.1 DDX20 gene_id:11218|Hs108|chr1           ( 824)  522 116.6 1.4e-25
CCDS8770.1 DDX23 gene_id:9416|Hs108|chr12          ( 820)  482 108.4 3.9e-23
CCDS44766.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11        ( 483)  456 103.1 9.4e-22
CCDS10889.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16       ( 478)  453 102.4 1.4e-21
CCDS10888.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16       ( 479)  453 102.4 1.4e-21
CCDS58511.1 EIF4A1 gene_id:1973|Hs108|chr17        ( 347)  441 99.9 5.8e-21
CCDS81646.1 DDX25 gene_id:29118|Hs108|chr11        ( 369)  436 98.9 1.2e-20
CCDS42187.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16       ( 370)  430 97.7 2.9e-20
CCDS59053.1 DDX56 gene_id:54606|Hs108|chr7         ( 507)  427 97.2 5.9e-20
CCDS82009.1 DDX19A gene_id:55308|Hs108|chr16       ( 447)  397 91.0 3.6e-18
CCDS32475.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16       ( 448)  397 91.0 3.6e-18
CCDS58478.1 DDX19B gene_id:11269|Hs108|chr16       ( 453)  397 91.0 3.7e-18
CCDS6952.1 DDX31 gene_id:64794|Hs108|chr9          ( 585)  394 90.5   7e-18
CCDS5492.1 DDX56 gene_id:54606|Hs108|chr7          ( 547)  342 79.9   1e-14
CCDS9251.1 DDX55 gene_id:57696|Hs108|chr12         ( 600)  298 71.0 5.4e-12


>>CCDS35214.1 DDX53 gene_id:168400|Hs108|chrX             (631 aa)
 initn: 4164 init1: 4164 opt: 4164  Z-score: 4578.4  bits: 857.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4164; 100.0% identity (100.0% similar) in 631 aa overlap (1-631:1-631)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MSHWAPEWKRAEANPRDLGASWDVRGSRGSGWSGPFGHQGPRAAGSREPPLCFKIKNNMV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MSHWAPEWKRAEANPRDLGASWDVRGSRGSGWSGPFGHQGPRAAGSREPPLCFKIKNNMV
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 GVVIGYSGSKIKDLQHSTNTKIQIINGESEAKVRIFGNREMKAKAKAAIETLIRKQESYN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 GVVIGYSGSKIKDLQHSTNTKIQIINGESEAKVRIFGNREMKAKAKAAIETLIRKQESYN
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 SESSVDNAASQTPIGRNLGRNDIVGEAEPLSNWDRIRAAVVECEKRKWADLPPVKKNFYI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SESSVDNAASQTPIGRNLGRNDIVGEAEPLSNWDRIRAAVVECEKRKWADLPPVKKNFYI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 ESKATSCMSEMQVINWRKENFNITCDDLKSGEKRLIPKPTCRFKDAFQQYPDLLKSIIRV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ESKATSCMSEMQVINWRKENFNITCDDLKSGEKRLIPKPTCRFKDAFQQYPDLLKSIIRV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 GIVKPTPIQSQAWPIILQGIDLIVVAQTGTGKTLSYLMPGFIHLDSQPISREQRNGPGML
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 GIVKPTPIQSQAWPIILQGIDLIVVAQTGTGKTLSYLMPGFIHLDSQPISREQRNGPGML
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 VLTPTRELALHVEAECSKYSYKGLKSICIYGGRNRNGQIEDISKGVDIIIATPGRLNDLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 VLTPTRELALHVEAECSKYSYKGLKSICIYGGRNRNGQIEDISKGVDIIIATPGRLNDLQ
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE5 MNNSVNLRSITYLVIDEADKMLDMEFEPQIRKILLDVRPDRQTVMTSATWPDTVRQLALS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MNNSVNLRSITYLVIDEADKMLDMEFEPQIRKILLDVRPDRQTVMTSATWPDTVRQLALS
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE5 YLKDPMIVYVGNLNLVAVNTVKQNIIVTTEKEKRALTQEFVENMSPNDKVIMFVSQKHIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 YLKDPMIVYVGNLNLVAVNTVKQNIIVTTEKEKRALTQEFVENMSPNDKVIMFVSQKHIA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE5 DDLSSDFNIQGISAESLHGNSEQSDQERAVEDFKSGNIKILITTDIVSRGLDLNDVTHVY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DDLSSDFNIQGISAESLHGNSEQSDQERAVEDFKSGNIKILITTDIVSRGLDLNDVTHVY
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE5 NYDFPRNIDVYVHRVGYIGRTGKTGTSVTLITQRDSKMAGELIKILDRANQSVPEDLVVM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NYDFPRNIDVYVHRVGYIGRTGKTGTSVTLITQRDSKMAGELIKILDRANQSVPEDLVVM
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630 
pF1KE5 AEQYKLNQQKRHRETRSRKPGQRRKEFYFLS
       :::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 AEQYKLNQQKRHRETRSRKPGQRRKEFYFLS
              610       620       630 

>>CCDS4977.1 DDX43 gene_id:55510|Hs108|chr6               (648 aa)
 initn: 2544 init1: 2229 opt: 2527  Z-score: 2778.6  bits: 524.4 E(32554): 1.9e-148
Smith-Waterman score: 2527; 61.8% identity (84.0% similar) in 626 aa overlap (5-628:26-648)

                                    10        20        30         
pF1KE5                      MSHWAPEWKRAEANPRDLGASWDVRGSRGSGWSGPFGHQ
                                ::: . ::   :    ...:  .::. : :     
CCDS49 MSHHGGAPKASTWVVASRRSSTVSRAPERRPAEELNRTGPEGYSV--GRGGRWRGTSRPP
               10        20        30        40          50        

      40        50        60        70        80        90         
pF1KE5 GPRAAGSREPPLCFKIKNNMVGVVIGYSGSKIKDLQHSTNTKIQIINGESEAKVRIFGNR
          ::: .: :::: .:...::.::: .:::::..: .::: ::::. . :. :.:::..
CCDS49 EAVAAGHEELPLCFALKSHFVGAVIGRGGSKIKNIQSTTNTTIQIIQEQPESLVKIFGSK
       60        70        80        90       100       110        

     100       110        120       130       140        150       
pF1KE5 EMKAKAKAAIETLIRK-QESYNSESSVDNAASQTPIGRNLGR-NDIVGEAEPLSNWDRIR
        :..::::.:.....: .:.:::: ..:.:  :  .:.. .  :..:.  .:: .::.::
CCDS49 AMQTKAKAVIDNFVKKLEENYNSECGIDTAF-QPSVGKDGSTDNNVVAGDRPLIDWDQIR
      120       130       140        150       160       170       

       160       170       180       190       200       210       
pF1KE5 AAVVECEKRKWADLPPVKKNFYIESKATSCMSEMQVINWRKENFNITCDDLKSGEKRLIP
          .. .: :::::::.::::: :: ::: ::.... .::::::::: ::::.:::: ::
CCDS49 EEGLKWQKTKWADLPPIKKNFYKESTATSAMSKVEADSWRKENFNITWDDLKDGEKRPIP
       180       190       200       210       220       230       

       220       230       240       250       260       270       
pF1KE5 KPTCRFKDAFQQYPDLLKSIIRVGIVKPTPIQSQAWPIILQGIDLIVVAQTGTGKTLSYL
       .::: : :::: ::.....: ..:. ::::::::::::.::::::: :::::::::: ::
CCDS49 NPTCTFDDAFQCYPEVMENIKKAGFQKPTPIQSQAWPIVLQGIDLIGVAQTGTGKTLCYL
       240       250       260       270       280       290       

       280       290       300       310       320       330       
pF1KE5 MPGFIHLDSQPISREQRNGPGMLVLTPTRELALHVEAECSKYSYKGLKSICIYGGRNRNG
       :::::::  ::  . ::: ::::::::::::::.::.:: :::::::.:.:.::: ::. 
CCDS49 MPGFIHLVLQPSLKGQRNRPGMLVLTPTRELALQVEGECCKYSYKGLRSVCVYGGGNRDE
       300       310       320       330       340       350       

       340       350       360       370       380       390       
pF1KE5 QIEDISKGVDIIIATPGRLNDLQMNNSVNLRSITYLVIDEADKMLDMEFEPQIRKILLDV
       :::...::::::::::::::::::.: :::..:::::.::::::::: ::::: ::::::
CCDS49 QIEELKKGVDIIIATPGRLNDLQMSNFVNLKNITYLVLDEADKMLDMGFEPQIMKILLDV
       360       370       380       390       400       410       

       400       410       420       430       440       450       
pF1KE5 RPDRQTVMTSATWPDTVRQLALSYLKDPMIVYVGNLNLVAVNTVKQNIIVTTEKEKRALT
       :::::::::::::: .:..:: ::::.:::::::.:.::::..::::::::::.:: .  
CCDS49 RPDRQTVMTSATWPHSVHRLAQSYLKEPMIVYVGTLDLVAVSSVKQNIIVTTEEEKWSHM
       420       430       440       450       460       470       

       460       470       480       490       500       510       
pF1KE5 QEFVENMSPNDKVIMFVSQKHIADDLSSDFNIQGISAESLHGNSEQSDQERAVEDFKSGN
       : :...:: .::::.:::.: .:: ::::. . .::.:::::. :: :.:.:.:.::.:.
CCDS49 QTFLQSMSSTDKVIVFVSRKAVADHLSSDLILGNISVESLHGDREQRDREKALENFKTGK
       480       490       500       510       520       530       

       520       530       540       550       560       570       
pF1KE5 IKILITTDIVSRGLDLNDVTHVYNYDFPRNIDVYVHRVGYIGRTGKTGTSVTLITQRDSK
       ..:::.::..:::::..:::::::.::::::. ::::.:  ::.:.::.:.: .:. : .
CCDS49 VRILIATDLASRGLDVHDVTHVYNFDFPRNIEEYVHRIGRTGRAGRTGVSITTLTRNDWR
       540       550       560       570       580       590       

       580       590       600       610       620       630 
pF1KE5 MAGELIKILDRANQSVPEDLVVMAEQYKLNQQKRHRETRSRKPGQRRKEFYFLS
       .:.:::.::.:::::.::.:: :::..: .::::. : . ..:  : :.:.   
CCDS49 VASELINILERANQSIPEELVSMAERFKAHQQKREMERKMERPQGRPKKFH   
       600       610       620       630       640           

>>CCDS33646.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22             (729 aa)
 initn: 1002 init1: 627 opt: 1148  Z-score: 1261.9  bits: 243.9 E(32554): 5.8e-64
Smith-Waterman score: 1148; 43.6% identity (72.8% similar) in 445 aa overlap (165-603:119-554)

          140       150       160         170       180       190  
pF1KE5 GRNLGRNDIVGEAEPLSNWDRIRAAVVECEKRKW--ADLPPVKKNFYIESKATSCMSEMQ
                                     :.::  ..::  .::::.:   .. .. ..
CCDS33 DRDRDRGGFGARGGGGLPPKKFGNPGERLRKKKWDLSELPKFEKNFYVEHPEVARLTPYE
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pF1KE5 VINWRKENFNITCDDLKSGEKRLIPKPTCRFKDA-FQQYPDLLKSIIRVGIVKPTPIQSQ
       : . :... .::   ...:.  . :::.  :. : : ::  ..  ..   ...::::: :
CCDS33 VDELRRKK-EIT---VRGGD--VCPKPVFAFHHANFPQY--VMDVLMDQHFTEPTPIQCQ
      150           160         170       180         190       200

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pF1KE5 AWPIILQGIDLIVVAQTGTGKTLSYLMPGFIHLDSQPISREQRNGPGMLVLTPTRELALH
       ..:. :.: :.. .::::.::::.::.:...:.. ::   :. .::  :::.:::::: .
CCDS33 GFPLALSGRDMVGIAQTGSGKTLAYLLPAIVHINHQPYL-ERGDGPICLVLAPTRELAQQ
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pF1KE5 VEAECSKYSYKG-LKSICIYGGRNRNGQIEDISKGVDIIIATPGRLNDLQMNNSVNLRSI
       :.   . :.  . ::: :::::  .. ::.:. .::.: ::::::: :.  ....:::  
CCDS33 VQQVADDYGKCSRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLESGKTNLRRC
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pF1KE5 TYLVIDEADKMLDMEFEPQIRKILLDVRPDRQTVMTSATWPDTVRQLALSYLKDPMIVYV
       ::::.::::.:::: ::::::::. ..::::::.: :::::  ::::: ..:.:   . :
CCDS33 TYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLRDYTQINV
     320       330       340       350       360       370         

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pF1KE5 GNLNLVAVNTVKQNIIVTTEKEK-RALTQEFVENMSPND-KVIMFVSQKHIADDLSSDFN
       :::.: : ... : . :  :.:: . : : . : :. .. :.:.::  :.  :::.  . 
CCDS33 GNLELSANHNILQIVDVCMESEKDHKLIQLMEEIMAEKENKTIIFVETKRRCDDLTRRMR
     380       390       400       410       420       430         

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pF1KE5 IQGISAESLHGNSEQSDQERAVEDFKSGNIKILITTDIVSRGLDLNDVTHVYNYDFPRNI
        .:  :  .::.. : ... ....:.::.  :::.::..:::::..::  : :::.: . 
CCDS33 RDGWPAMCIHGDKSQPERDWVLNEFRSGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSS
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pF1KE5 DVYVHRVGYIGRTGKTGTSVTLITQRDSKMAGELIKILDRANQSVPEDLVVMAEQYKLNQ
       . ::::.:  .:. . ::. :..:  . :.: ::::.:..:::..   :. ....     
CCDS33 EDYVHRIGRTARSTNKGTAYTFFTPGNLKQARELIKVLEEANQAINPKLMQLVDHRGGGG
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pF1KE5 QKRHRETRSRKPGQRRKEFYFLS                                     
                                                                   
CCDS33 GGGGRSRYRTTSSANNPNLMYQDECDRRLRGVKDGGRRDSASYRDRSETDRAGYANGSGY
     560       570       580       590       600       610         

>>CCDS46706.1 DDX17 gene_id:10521|Hs108|chr22             (731 aa)
 initn: 1002 init1: 627 opt: 1148  Z-score: 1261.8  bits: 243.9 E(32554): 5.8e-64
Smith-Waterman score: 1148; 43.6% identity (72.8% similar) in 445 aa overlap (165-603:119-554)

          140       150       160         170       180       190  
pF1KE5 GRNLGRNDIVGEAEPLSNWDRIRAAVVECEKRKW--ADLPPVKKNFYIESKATSCMSEMQ
                                     :.::  ..::  .::::.:   .. .. ..
CCDS46 DRDRDRGGFGARGGGGLPPKKFGNPGERLRKKKWDLSELPKFEKNFYVEHPEVARLTPYE
       90       100       110       120       130       140        

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pF1KE5 VINWRKENFNITCDDLKSGEKRLIPKPTCRFKDA-FQQYPDLLKSIIRVGIVKPTPIQSQ
       : . :... .::   ...:.  . :::.  :. : : ::  ..  ..   ...::::: :
CCDS46 VDELRRKK-EIT---VRGGD--VCPKPVFAFHHANFPQY--VMDVLMDQHFTEPTPIQCQ
      150           160         170       180         190       200

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pF1KE5 AWPIILQGIDLIVVAQTGTGKTLSYLMPGFIHLDSQPISREQRNGPGMLVLTPTRELALH
       ..:. :.: :.. .::::.::::.::.:...:.. ::   :. .::  :::.:::::: .
CCDS46 GFPLALSGRDMVGIAQTGSGKTLAYLLPAIVHINHQPYL-ERGDGPICLVLAPTRELAQQ
              210       220       230        240       250         

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pF1KE5 VEAECSKYSYKG-LKSICIYGGRNRNGQIEDISKGVDIIIATPGRLNDLQMNNSVNLRSI
       :.   . :.  . ::: :::::  .. ::.:. .::.: ::::::: :.  ....:::  
CCDS46 VQQVADDYGKCSRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLESGKTNLRRC
     260       270       280       290       300       310         

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pF1KE5 TYLVIDEADKMLDMEFEPQIRKILLDVRPDRQTVMTSATWPDTVRQLALSYLKDPMIVYV
       ::::.::::.:::: ::::::::. ..::::::.: :::::  ::::: ..:.:   . :
CCDS46 TYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLRDYTQINV
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pF1KE5 GNLNLVAVNTVKQNIIVTTEKEK-RALTQEFVENMSPND-KVIMFVSQKHIADDLSSDFN
       :::.: : ... : . :  :.:: . : : . : :. .. :.:.::  :.  :::.  . 
CCDS46 GNLELSANHNILQIVDVCMESEKDHKLIQLMEEIMAEKENKTIIFVETKRRCDDLTRRMR
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pF1KE5 IQGISAESLHGNSEQSDQERAVEDFKSGNIKILITTDIVSRGLDLNDVTHVYNYDFPRNI
        .:  :  .::.. : ... ....:.::.  :::.::..:::::..::  : :::.: . 
CCDS46 RDGWPAMCIHGDKSQPERDWVLNEFRSGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSS
     440       450       460       470       480       490         

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pF1KE5 DVYVHRVGYIGRTGKTGTSVTLITQRDSKMAGELIKILDRANQSVPEDLVVMAEQYKLNQ
       . ::::.:  .:. . ::. :..:  . :.: ::::.:..:::..   :. ....     
CCDS46 EDYVHRIGRTARSTNKGTAYTFFTPGNLKQARELIKVLEEANQAINPKLMQLVDHRGGGG
     500       510       520       530       540       550         

      610       620       630                                      
pF1KE5 QKRHRETRSRKPGQRRKEFYFLS                                     
                                                                   
CCDS46 GGGKGGRSRYRTTSSANNPNLMYQDECDRRLRGVKDGGRRDSASYRDRSETDRAGYANGS
     560       570       580       590       600       610         

>>CCDS82190.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17               (614 aa)
 initn: 1034 init1: 641 opt: 1130  Z-score: 1243.3  bits: 240.2 E(32554): 6.3e-63
Smith-Waterman score: 1130; 41.8% identity (70.5% similar) in 474 aa overlap (165-627:43-505)

          140       150       160         170       180       190  
pF1KE5 GRNLGRNDIVGEAEPLSNWDRIRAAVVECEKRKWA--DLPPVKKNFYIESKATSCMSEMQ
                                     :.::   .::  .:::: :    .  . ..
CCDS82 SVRFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQE
             20        30        40        50        60        70  

            200       210       220       230        240       250 
pF1KE5 VINWRKENFNITCDDLKSGEKRLIPKPTCRFKDAFQQYP-DLLKSIIRVGIVKPTPIQSQ
       : ..:. . .::      :..   :::.  : .:  ..: ...  : : ....:: ::.:
CCDS82 VETYRRSK-EITV----RGHN--CPKPVLNFYEA--NFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQ
             80               90         100       110       120   

             260       270       280       290       300       310 
pF1KE5 AWPIILQGIDLIVVAQTGTGKTLSYLMPGFIHLDSQPISREQRNGPGMLVLTPTRELALH
       .::. :.:.:.. :::::.:::::::.:...:.. ::.  :. .::  :::.:::::: .
CCDS82 GWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFL-ERGDGPICLVLAPTRELAQQ
           130       140       150       160        170       180  

             320        330       340       350       360       370
pF1KE5 VEAECSKYSYKG-LKSICIYGGRNRNGQIEDISKGVDIIIATPGRLNDLQMNNSVNLRSI
       :.   ..:     ::: :::::  .. ::.:. .::.: ::::::: :.   ...:::  
CCDS82 VQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRT
            190       200       210       220       230       240  

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pF1KE5 TYLVIDEADKMLDMEFEPQIRKILLDVRPDRQTVMTSATWPDTVRQLALSYLKDPMIVYV
       ::::.::::.:::: ::::::::. ..::::::.: :::::  ::::: ..::: . . .
CCDS82 TYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINI
            250       260       270       280       290       300  

              440       450        460        470       480        
pF1KE5 GNLNLVAVNTVKQNIIVTTEKEK-RALTQEFVENMSPND-KVIMFVSQKHIADDLSSDFN
       : :.: : ... : . :  . :: . : . . : :: .. :.:.::  :.  :.:.  . 
CCDS82 GALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMR
            310       320       330       340       350       360  

      490       500       510       520       530       540        
pF1KE5 IQGISAESLHGNSEQSDQERAVEDFKSGNIKILITTDIVSRGLDLNDVTHVYNYDFPRNI
        .:  : ..::.. :.... ....:: :.  :::.::..:::::..::  : :::.: . 
CCDS82 RDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSS
            370       380       390       400       410       420  

      550       560       570       580       590       600        
pF1KE5 DVYVHRVGYIGRTGKTGTSVTLITQRDSKMAGELIKILDRANQSVPEDLVVMAEQYKLNQ
       . :.::.:  .:. ::::. :..:  . :....::..: .:::..   :. ..:. . . 
CCDS82 EDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVED-RGSG
            430       440       450       460       470        480 

      610            620       630                                 
pF1KE5 QKRHR-----ETRSRKPGQRRKEFYFLS                                
       ..: :     . :.:  . .:  :                                    
CCDS82 RSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAANYT
             490       500       510       520       530       540 

>>CCDS11659.1 DDX5 gene_id:1655|Hs108|chr17               (614 aa)
 initn: 1039 init1: 641 opt: 1130  Z-score: 1243.3  bits: 240.2 E(32554): 6.3e-63
Smith-Waterman score: 1130; 41.8% identity (70.5% similar) in 474 aa overlap (165-627:43-505)

          140       150       160         170       180       190  
pF1KE5 GRNLGRNDIVGEAEPLSNWDRIRAAVVECEKRKWA--DLPPVKKNFYIESKATSCMSEMQ
                                     :.::   .::  .:::: :    .  . ..
CCDS11 DRGFGAPRFGGSRAGPLSGKKFGNPGEKLVKKKWNLDELPKFEKNFYQEHPDLARRTAQE
             20        30        40        50        60        70  

            200       210       220       230        240       250 
pF1KE5 VINWRKENFNITCDDLKSGEKRLIPKPTCRFKDAFQQYP-DLLKSIIRVGIVKPTPIQSQ
       : ..:. . .::      :..   :::.  : .:  ..: ...  : : ....:: ::.:
CCDS11 VETYRRSK-EITV----RGHN--CPKPVLNFYEA--NFPANVMDVIARQNFTEPTAIQAQ
             80               90         100       110       120   

             260       270       280       290       300       310 
pF1KE5 AWPIILQGIDLIVVAQTGTGKTLSYLMPGFIHLDSQPISREQRNGPGMLVLTPTRELALH
       .::. :.:.:.. :::::.:::::::.:...:.. ::.  :. .::  :::.:::::: .
CCDS11 GWPVALSGLDMVGVAQTGSGKTLSYLLPAIVHINHQPFL-ERGDGPICLVLAPTRELAQQ
           130       140       150       160        170       180  

             320        330       340       350       360       370
pF1KE5 VEAECSKYSYKG-LKSICIYGGRNRNGQIEDISKGVDIIIATPGRLNDLQMNNSVNLRSI
       :.   ..:     ::: :::::  .. ::.:. .::.: ::::::: :.   ...:::  
CCDS11 VQQVAAEYCRACRLKSTCIYGGAPKGPQIRDLERGVEICIATPGRLIDFLECGKTNLRRT
            190       200       210       220       230       240  

              380       390       400       410       420       430
pF1KE5 TYLVIDEADKMLDMEFEPQIRKILLDVRPDRQTVMTSATWPDTVRQLALSYLKDPMIVYV
       ::::.::::.:::: ::::::::. ..::::::.: :::::  ::::: ..::: . . .
CCDS11 TYLVLDEADRMLDMGFEPQIRKIVDQIRPDRQTLMWSATWPKEVRQLAEDFLKDYIHINI
            250       260       270       280       290       300  

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pF1KE5 GNLNLVAVNTVKQNIIVTTEKEK-RALTQEFVENMSPND-KVIMFVSQKHIADDLSSDFN
       : :.: : ... : . :  . :: . : . . : :: .. :.:.::  :.  :.:.  . 
CCDS11 GALELSANHNILQIVDVCHDVEKDEKLIRLMEEIMSEKENKTIVFVETKRRCDELTRKMR
            310       320       330       340       350       360  

      490       500       510       520       530       540        
pF1KE5 IQGISAESLHGNSEQSDQERAVEDFKSGNIKILITTDIVSRGLDLNDVTHVYNYDFPRNI
        .:  : ..::.. :.... ....:: :.  :::.::..:::::..::  : :::.: . 
CCDS11 RDGWPAMGIHGDKSQQERDWVLNEFKHGKAPILIATDVASRGLDVEDVKFVINYDYPNSS
            370       380       390       400       410       420  

      550       560       570       580       590       600        
pF1KE5 DVYVHRVGYIGRTGKTGTSVTLITQRDSKMAGELIKILDRANQSVPEDLVVMAEQYKLNQ
       . :.::.:  .:. ::::. :..:  . :....::..: .:::..   :. ..:. . . 
CCDS11 EDYIHRIGRTARSTKTGTAYTFFTPNNIKQVSDLISVLREANQAINPKLLQLVED-RGSG
            430       440       450       460       470        480 

      610            620       630                                 
pF1KE5 QKRHR-----ETRSRKPGQRRKEFYFLS                                
       ..: :     . :.:  . .:  :                                    
CCDS11 RSRGRGGMKDDRRDRYSAGKRGGFNTFRDRENYDRGYSSLLKRDFGAKTQNGVYSAANYT
             490       500       510       520       530       540 

>>CCDS34240.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5               (1031 aa)
 initn: 936 init1: 334 opt: 1068  Z-score: 1171.5  bits: 227.7 E(32554): 6.2e-59
Smith-Waterman score: 1068; 39.5% identity (69.4% similar) in 461 aa overlap (173-629:330-780)

            150       160       170       180       190       200  
pF1KE5 IVGEAEPLSNWDRIRAAVVECEKRKWADLPPVKKNFYIESKATSCMSEMQVINWRKENFN
                                     : .::::.:    . ::. .:  .: :  .
CCDS34 EVDLQTALTGYQTKQRKLLEPVDHGKIEYEPFRKNFYVEVPELAKMSQEEVNVFRLEMEG
     300       310       320       330       340       350         

            210       220       230       240       250       260  
pF1KE5 ITCDDLKSGEKRLIPKPTCRFKDAFQQYPDLLKSIIRVGIVKPTPIQSQAWPIILQGIDL
       ::       . .  :::   . .   ..  .:.:. . :  ::::::.:: : :..: ::
CCDS34 ITV------KGKGCPKPIKSWVQCGISMK-ILNSLKKHGYEKPTPIQTQAIPAIMSGRDL
     360             370       380        390       400       410  

            270       280       290       300       310       320  
pF1KE5 IVVAQTGTGKTLSYLMPGFIHLDSQPISREQRNGPGMLVLTPTRELALHVEAECSKYSYK
       : .:.::.:::...:.: : :. .:  : :. .::  ...::::::::..  ::.:.:  
CCDS34 IGIAKTGSGKTIAFLLPMFRHIMDQR-SLEEGEGPIAVIMTPTRELALQITKECKKFSKT
            420       430        440       450       460       470 

             330       340       350       360          370        
pF1KE5 -GLKSICIYGGRNRNGQIEDISKGVDIIIATPGRLNDLQMNNS---VNLRSITYLVIDEA
        ::. .:.::: . . :: ....:..::. ::::. :.   ::   .::: .::.:.:::
CCDS34 LGLRVVCVYGGTGISEQIAELKRGAEIIVCTPGRMIDMLAANSGRVTNLRRVTYVVLDEA
             480       490       500       510       520       530 

      380       390       400       410       420       430        
pF1KE5 DKMLDMEFEPQIRKILLDVRPDRQTVMTSATWPDTVRQLALSYLKDPMIVYVGNLNLVAV
       :.:.:: ::::. .:. .::::::::: :::.: ... ::   :. :. : ::. ..:  
CCDS34 DRMFDMGFEPQVMRIVDNVRPDRQTVMFSATFPRAMEALARRILSKPIEVQVGGRSVVC-
             540       550       560       570       580       590 

      440       450       460       470       480       490        
pF1KE5 NTVKQNIIVTTEKEKRALTQEFVENMSPNDKVIMFVSQKHIADDLSSDFNIQGISAESLH
       . :.:..::  :..:     :.. ... . .::.::.... :: : .:.   .    :::
CCDS34 SDVEQQVIVIEEEKKFLKLLELLGHYQESGSVIIFVDKQEHADGLLKDLMRASYPCMSLH
              600       610       620       630       640       650

      500       510       520       530       540       550        
pF1KE5 GNSEQSDQERAVEDFKSGNIKILITTDIVSRGLDLNDVTHVYNYDFPRNIDVYVHRVGYI
       :. .: :..  ..:::.:. :.:..:....::::.. .  : ::. : . . ::::.:  
CCDS34 GGIDQYDRDSIINDFKNGTCKLLVATSVAARGLDVKHLILVVNYSCPNHYEDYVHRAGRT
              660       670       680       690       700       710

      560       570       580       590       600       610        
pF1KE5 GRTGKTGTSVTLITQRDSKMAGELIKILDRANQSVPEDLVVMAEQYKLNQQKRHRETRSR
       ::.:. : . :.::. ....::..:: :. .. .:: ::  .  ..: .::: . .  ..
CCDS34 GRAGNKGYAYTFITEDQARYAGDIIKALELSGTAVPPDLEKLWSDFK-DQQKAEGKIIKK
              720       730       740       750        760         

      620       630                                                
pF1KE5 KPGQRRKEFYFLS                                               
       . :   : : :                                                 
CCDS34 SSGFSGKGFKFDETEQALANERKKLQKAALGLQDSDDEDAAVDIDEQIESMFNSKKRVKD
     770       780       790       800       810       820         

>>CCDS75306.1 DDX46 gene_id:9879|Hs108|chr5               (1032 aa)
 initn: 936 init1: 334 opt: 1068  Z-score: 1171.5  bits: 227.7 E(32554): 6.2e-59
Smith-Waterman score: 1068; 39.5% identity (69.4% similar) in 461 aa overlap (173-629:330-780)

            150       160       170       180       190       200  
pF1KE5 IVGEAEPLSNWDRIRAAVVECEKRKWADLPPVKKNFYIESKATSCMSEMQVINWRKENFN
                                     : .::::.:    . ::. .:  .: :  .
CCDS75 EVDLQTALTGYQTKQRKLLEPVDHGKIEYEPFRKNFYVEVPELAKMSQEEVNVFRLEMEG
     300       310       320       330       340       350         

            210       220       230       240       250       260  
pF1KE5 ITCDDLKSGEKRLIPKPTCRFKDAFQQYPDLLKSIIRVGIVKPTPIQSQAWPIILQGIDL
       ::       . .  :::   . .   ..  .:.:. . :  ::::::.:: : :..: ::
CCDS75 ITV------KGKGCPKPIKSWVQCGISMK-ILNSLKKHGYEKPTPIQTQAIPAIMSGRDL
     360             370       380        390       400       410  

            270       280       290       300       310       320  
pF1KE5 IVVAQTGTGKTLSYLMPGFIHLDSQPISREQRNGPGMLVLTPTRELALHVEAECSKYSYK
       : .:.::.:::...:.: : :. .:  : :. .::  ...::::::::..  ::.:.:  
CCDS75 IGIAKTGSGKTIAFLLPMFRHIMDQR-SLEEGEGPIAVIMTPTRELALQITKECKKFSKT
            420       430        440       450       460       470 

             330       340       350       360          370        
pF1KE5 -GLKSICIYGGRNRNGQIEDISKGVDIIIATPGRLNDLQMNNS---VNLRSITYLVIDEA
        ::. .:.::: . . :: ....:..::. ::::. :.   ::   .::: .::.:.:::
CCDS75 LGLRVVCVYGGTGISEQIAELKRGAEIIVCTPGRMIDMLAANSGRVTNLRRVTYVVLDEA
             480       490       500       510       520       530 

      380       390       400       410       420       430        
pF1KE5 DKMLDMEFEPQIRKILLDVRPDRQTVMTSATWPDTVRQLALSYLKDPMIVYVGNLNLVAV
       :.:.:: ::::. .:. .::::::::: :::.: ... ::   :. :. : ::. ..:  
CCDS75 DRMFDMGFEPQVMRIVDNVRPDRQTVMFSATFPRAMEALARRILSKPIEVQVGGRSVVC-
             540       550       560       570       580       590 

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pF1KE5 NTVKQNIIVTTEKEKRALTQEFVENMSPNDKVIMFVSQKHIADDLSSDFNIQGISAESLH
       . :.:..::  :..:     :.. ... . .::.::.... :: : .:.   .    :::
CCDS75 SDVEQQVIVIEEEKKFLKLLELLGHYQESGSVIIFVDKQEHADGLLKDLMRASYPCMSLH
              600       610       620       630       640       650

      500       510       520       530       540       550        
pF1KE5 GNSEQSDQERAVEDFKSGNIKILITTDIVSRGLDLNDVTHVYNYDFPRNIDVYVHRVGYI
       :. .: :..  ..:::.:. :.:..:....::::.. .  : ::. : . . ::::.:  
CCDS75 GGIDQYDRDSIINDFKNGTCKLLVATSVAARGLDVKHLILVVNYSCPNHYEDYVHRAGRT
              660       670       680       690       700       710

      560       570       580       590       600       610        
pF1KE5 GRTGKTGTSVTLITQRDSKMAGELIKILDRANQSVPEDLVVMAEQYKLNQQKRHRETRSR
       ::.:. : . :.::. ....::..:: :. .. .:: ::  .  ..: .::: . .  ..
CCDS75 GRAGNKGYAYTFITEDQARYAGDIIKALELSGTAVPPDLEKLWSDFK-DQQKAEGKIIKK
              720       730       740       750        760         

      620       630                                                
pF1KE5 KPGQRRKEFYFLS                                               
       . :   : : :                                                 
CCDS75 SSGFSGKGFKFDETEQALANERKKLQKAALGLQDSDDEDAAVDIDEQIESMFNSKKRVKD
     770       780       790       800       810       820         

>>CCDS32704.1 DDX42 gene_id:11325|Hs108|chr17             (938 aa)
 initn: 940 init1: 779 opt: 978  Z-score: 1073.2  bits: 209.3 E(32554): 1.8e-53
Smith-Waterman score: 979; 36.1% identity (69.4% similar) in 454 aa overlap (170-619:209-650)

     140       150       160       170       180       190         
pF1KE5 RNDIVGEAEPLSNWDRIRAAVVECEKRKWADLPPVKKNFYIESKATSCMSEMQVINWR-K
                                     : :: .:::: : .  . .. .:.:. : :
CCDS32 DNLEYDSDGNPIAPTKKIIDPLPPIDHSEIDYPPFEKNFYNEHEEITNLTPQQLIDLRHK
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pF1KE5 ENFNITCDDLKSGEKRLIPKPTCRFKDAFQQYPDLLKSIIRVGIVKPTPIQSQAWPIILQ
        :. .      ::     :.:   :   :    .:...: .   ..::::: :. :. :.
CCDS32 LNLRV------SGAAP--PRPGSSFAH-FGFDEQLMHQIRKSEYTQPTPIQCQGVPVALS
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pF1KE5 GIDLIVVAQTGTGKTLSYLMPGFIHLDSQPISREQRNGPGMLVLTPTRELALHVEAECSK
       : :.: .:.::.::: ... : .::. .:    :  .::  ... :::::  ...:::..
CCDS32 GRDMIGIAKTGSGKTAAFIWPMLIHIMDQK-ELEPGDGPIAVIVCPTRELCQQIHAECKR
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pF1KE5 YSYK-GLKSICIYGGRNRNGQIEDISKGVDIIIATPGRLNDLQMNNSVNLRSITYLVIDE
       ..   .:.:. .::: .   : . ...:..:.. ::::: :   ....::. ..:::.::
CCDS32 FGKAYNLRSVAVYGGGSMWEQAKALQEGAEIVVCTPGRLIDHVKKKATNLQRVSYLVFDE
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pF1KE5 ADKMLDMEFEPQIRKILLDVRPDRQTVMTSATWPDTVRQLALSYLKDPMIVYVGNLNLVA
       ::.:.:: :: :.:.:   :::::::.. :::.   ...:: . : ::. :  :...  :
CCDS32 ADRMFDMGFEYQVRSIASHVRPDRQTLLFSATFRKKIEKLARDILIDPIRVVQGDIGE-A
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pF1KE5 VNTVKQ--NIIVTTEKEKRALTQEFVENMSPNDKVIMFVSQKHIADDLSSDFNIQGISAE
        . : :  .:. .  ..   ::...:: .. . .:..::..:  :..:..... .: .  
CCDS32 NEDVTQIVEILHSGPSKWNWLTRRLVE-FTSSGSVLLFVTKKANAEELANNLKQEGHNLG
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pF1KE5 SLHGNSEQSDQERAVEDFKSGNIKILITTDIVSRGLDLNDVTHVYNYDFPRNIDVYVHRV
        :::. .::...... :::. .: .:..::...::::. ..  : :::  :.::...::.
CCDS32 LLHGDMDQSERNKVISDFKKKDIPVLVATDVAARGLDIPSIKTVINYDVARDIDTHTHRI
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pF1KE5 GYIGRTGKTGTSVTLITQRDSKMAGELIKILDRANQSVPEDLVVMAEQYKLNQQKRHRET
       :  ::.:. :.. ::.: .::..::.:.. :. ::: : ..:. .: :    ...: .  
CCDS32 GRTGRAGEKGVAYTLLTPKDSNFAGDLVRNLEGANQHVSKELLDLAMQNAWFRKSRFKGG
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pF1KE5 RSRKPGQRRKEFYFLS                                            
       ...:                                                        
CCDS32 KGKKLNIGGGGLGYRERPGLGSENMDRGNNNVMSNYEAYKPSTGAMGDRLTAMKAAFQSQ
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>>CCDS54855.1 DDX4 gene_id:54514|Hs108|chr5               (575 aa)
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CCDS54 DEDSIFAHYQTGINFDKYDTILVEVSGHDAPPAILTFEEA-NLCQTLNNNIAKAGYTKLT
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       :.:. . :::: : ::.. ::::.::: ..:.: . :.  :.   :: .. . :  ....
CCDS54 PVQKYSIPIILAGRDLMACAQTGSGKTAAFLLPILAHMMHDGITASRFKELQEPECIIVA
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pF1KE5 PTRELALHVEAECSKYSYKG-LKSICIYGGRNRNGQIEDISKGVDIIIATPGRLNDLQMN
       :::::. ..  :  :.:.   .... :::: . . .:..: .: .:. :::::: :.  .
CCDS54 PTRELVNQIYLEARKFSFGTCVRAVVIYGGTQLGHSIRQIVQGCNILCATPGRLMDIIGK
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CCDS54 AEFLKSNYLFVAVGQVGG-ACRDVQQTVLQVGQFSKREKLVEILRNIG-DERTMVFVETK
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CCDS54 KKADFIATFLCQEKISTTSIHGDREQREREQALGDFRFGKCPVLVATSVAARGLDIENVQ
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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