Result of FASTA (ccds) for pFN21AE1259
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE1259, 593 aa
  1>>>pF1KE1259 593 - 593 aa - 593 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7131+/-0.000849; mu= 17.2436+/- 0.051
 mean_var=82.7599+/-16.829, 0's: 0 Z-trim(108.6): 23  B-trim: 176 in 1/50
 Lambda= 0.140982
 statistics sampled from 10323 (10346) to 10323 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.675), E-opt: 0.2 (0.318), width:  16
 Scan time:  3.610

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS35196.1 ARSD gene_id:414|Hs108|chrX            ( 593) 4204 865.1       0
CCDS35198.1 ARSH gene_id:347527|Hs108|chrX         ( 562) 2645 547.9 1.2e-155
CCDS14122.1 ARSE gene_id:415|Hs108|chrX            ( 589) 2616 542.1 7.6e-154
CCDS75948.1 ARSE gene_id:415|Hs108|chrX            ( 614) 2616 542.1 7.8e-154
CCDS14123.1 ARSF gene_id:416|Hs108|chrX            ( 590) 2452 508.7 8.3e-144
CCDS75949.1 ARSE gene_id:415|Hs108|chrX            ( 544) 2430 504.2 1.7e-142
CCDS14127.1 STS gene_id:412|Hs108|chrX             ( 583) 2005 417.8 1.9e-116
CCDS10970.1 GALNS gene_id:2588|Hs108|chr16         ( 522)  402 91.7 2.5e-18
CCDS14100.2 ARSA gene_id:410|Hs108|chr22           ( 509)  390 89.3 1.3e-17
CCDS11676.1 ARSG gene_id:22901|Hs108|chr17         ( 525)  376 86.4 9.8e-17
CCDS46736.1 ARSA gene_id:410|Hs108|chr22           ( 423)  341 79.2 1.1e-14
CCDS43334.1 ARSB gene_id:411|Hs108|chr5            ( 413)  331 77.2 4.6e-14
CCDS4043.1 ARSB gene_id:411|Hs108|chr5             ( 533)  331 77.3 5.6e-14


>>CCDS35196.1 ARSD gene_id:414|Hs108|chrX                 (593 aa)
 initn: 4204 init1: 4204 opt: 4204  Z-score: 4621.1  bits: 865.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 4204; 99.8% identity (99.8% similar) in 593 aa overlap (1-593:1-593)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MRSAARRGRAAPAARDSLPVLLFLCLLLKTCEPKTANAFKPNILLIMADDLGTGDLGCYG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MRSAARRGRAAPAARDSLPVLLFLCLLLKTCEPKTANAFKPNILLIMADDLGTGDLGCYG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 NNTLRTPNIDQLAEEGVRLTQHLAAAPLCTPSRAAFLTGRHSFRSGMDASNGYRALQWNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NNTLRTPNIDQLAEEGVRLTQHLAAAPLCTPSRAAFLTGRHSFRSGMDASNGYRALQWNA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 GSGGLPENETTFARILQQHGYATGLIGKWHQGVNCASRGDHCHHPLNHGFDYFYGMPFTL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 GSGGLPENETTFARILQQHGYATGLIGKWHQGVNCASRGDHCHHPLNHGFDYFYGMPFTL
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 TNDCDPGRPPEVDAALRAQLWGYTQFLALGILTLAAGQTCGFFCVSARAVTGMAGVGCLF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::
CCDS35 TNDCDPGRPPEVDAALRAQLWGYTQFLALGILTLAAGQTCGFFSVSARAVTGMAGVGCLF
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 FISWYSSFGFVRRWNCILMRNHDVTEQPMVLEKTASLMLKEAVSYIERHKHGPFLLFLSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 FISWYSSFGFVRRWNCILMRNHDVTEQPMVLEKTASLMLKEAVSYIERHKHGPFLLFLSL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 LHVHIPLVTTSAFLGKSQHGLYGDNVEEMDWLIGKVLNAIEDNGLKNSTFTYFTSDHGGH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LHVHIPLVTTSAFLGKSQHGLYGDNVEEMDWLIGKVLNAIEDNGLKNSTFTYFTSDHGGH
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 LEARDGHSQLGGWNGIYKGGKGMGGWEGGIRVPGIFHWPGVLPAGRVIGEPTSLMDVFPT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LEARDGHSQLGGWNGIYKGGKGMGGWEGGIRVPGIFHWPGVLPAGRVIGEPTSLMDVFPT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 VVQLVGGEVPQDRVIDGHSLVPLLQGAEARSAHEFLFHYCGQHLHAARWHQKDSGSVWKV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 VVQLVGGEVPQDRVIDGHSLVPLLQGAEARSAHEFLFHYCGQHLHAARWHQKDSGSVWKV
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE1 HYTTPQFHPEGAGACYGRGVCPCSGEGVTHHRPPLLFDLSRDPSEARPLTPDSEPLYHAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 HYTTPQFHPEGAGACYGRGVCPCSGEGVTHHRPPLLFDLSRDPSEARPLTPDSEPLYHAV
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590   
pF1KE1 IARVGAAVSEHRQTLSPVPQQFSMSNILWKPWLQPCCGHFPFCSCHEDGDGTP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 IARVGAAVSEHRQTLSPVPQQFSMSNILWKPWLQPCCGHFPFCSCHEDGDGTP
              550       560       570       580       590   

>>CCDS35198.1 ARSH gene_id:347527|Hs108|chrX              (562 aa)
 initn: 2287 init1: 1853 opt: 2645  Z-score: 2907.7  bits: 547.9 E(32554): 1.2e-155
Smith-Waterman score: 2645; 64.6% identity (84.3% similar) in 560 aa overlap (35-593:2-559)

           10        20        30        40        50        60    
pF1KE1 ARRGRAAPAARDSLPVLLFLCLLLKTCEPKTANAFKPNILLIMADDLGTGDLGCYGNNTL
                                     : :: .:::.:.::::::.::: :::::..
CCDS35                              MTRNA-RPNIVLLMADDLGVGDLCCYGNNSV
                                             10        20        30

           70        80        90       100        110       120   
pF1KE1 RTPNIDQLAEEGVRLTQHLAAAPLCTPSRAAFLTGRHSFRSGM-DASNGYRALQWNAGSG
        :::::.:: :::::::::::: .::::::::::::. .:::: .: :  ::. : .:::
CCDS35 STPNIDRLASEGVRLTQHLAAASMCTPSRAAFLTGRYPIRSGMVSAYNLNRAFTWLGGSG
               40        50        60        70        80        90

           130       140       150       160       170       180   
pF1KE1 GLPENETTFARILQQHGYATGLIGKWHQGVNCASRGDHCHHPLNHGFDYFYGMPFTLTND
       ::: ::::::..::..:: :::::::: :..::::.:::.::::::: ::::.:: : .:
CCDS35 GLPTNETTFAKLLQHRGYRTGLIGKWHLGLSCASRNDHCYHPLNHGFHYFYGVPFGLLSD
              100       110       120       130       140       150

           190       200       210       220       230       240   
pF1KE1 CDPGRPPEVDAALRAQLWGYTQFLALGILTLAAGQTCGFFCVSARAVTGMAGVGCLFFIS
       :. .. ::.   :: .::  :  :::  . :   .   .: :  ...  .: .. ::: :
CCDS35 CQASKTPELHRWLRIKLWISTVALALVPFLLLIPKFARWFSVPWKVIFVFALLAFLFFTS
              160       170       180       190       200       210

           250       260       270       280       290       300   
pF1KE1 WYSSFGFVRRWNCILMRNHDVTEQPMVLEKTASLMLKEAVSYIERHKHGPFLLFLSLLHV
       ::::.::.:::::::::::.. .:::  ::.::::::::...:::.:. :::::.:.:::
CCDS35 WYSSYGFTRRWNCILMRNHEIIQQPMKEEKVASLMLKEALAFIERYKREPFLLFFSFLHV
              220       230       240       250       260       270

           310       320       330       340       350       360   
pF1KE1 HIPLVTTSAFLGKSQHGLYGDNVEEMDWLIGKVLNAIEDNGLKNSTFTYFTSDHGGHLEA
       : ::.. . :.:.:..: ::::::::::..::.:.:.... : : :..:::::.::::: 
CCDS35 HTPLISKKKFVGRSKYGRYGDNVEEMDWMVGKILDALDQERLANHTLVYFTSDNGGHLEP
              280       290       300       310       320       330

           370       380       390       400       410       420   
pF1KE1 RDGHSQLGGWNGIYKGGKGMGGWEGGIRVPGIFHWPGVLPAGRVIGEPTSLMDVFPTVVQ
        ::  ::::::::::::::::::::::::::::.::.:: :::::.:::::::..::.  
CCDS35 LDGAVQLGGWNGIYKGGKGMGGWEGGIRVPGIFRWPSVLEAGRVINEPTSLMDIYPTLSY
              340       350       360       370       380       390

           430       440       450       460       470       480   
pF1KE1 LVGGEVPQDRVIDGHSLVPLLQGAEARSAHEFLFHYCGQHLHAARWHQKDSGSVWKVHYT
       . :: . :::::::..:.:::.:  ..: ::::::::: .::..:::::: ..:::.::.
CCDS35 IGGGILSQDRVIDGQNLMPLLEGRASHSDHEFLFHYCGVYLHTVRWHQKDCATVWKAHYV
              400       410       420       430       440       450

           490       500       510       520       530       540   
pF1KE1 TPQFHPEGAGACYGRGVCPCSGEGVTHHRPPLLFDLSRDPSEARPLTPDSEPLYHAVIAR
       ::.:.:::.::::: :.: :::. ::.: ::::::.::::::: ::.::.:::. .:: .
CCDS35 TPKFYPEGTGACYGSGICSCSGD-VTYHDPPLLFDISRDPSEALPLNPDNEPLFDSVIKK
              460       470        480       490       500         

           550       560       570       580       590      
pF1KE1 VGAAVSEHRQTLSPVPQQFSMSNILWKPWLQPCCGHFPFCSCHEDGDGTP   
       . ::. :::.::.:::::::. : .:::::::::: ::::.: .. :  :   
CCDS35 MEAAIREHRRTLTPVPQQFSVFNTIWKPWLQPCCGTFPFCGCDKEDDILPMAP
     510       520       530       540       550       560  

>>CCDS14122.1 ARSE gene_id:415|Hs108|chrX                 (589 aa)
 initn: 2674 init1: 2613 opt: 2616  Z-score: 2875.5  bits: 542.1 E(32554): 7.6e-154
Smith-Waterman score: 2616; 63.5% identity (82.8% similar) in 576 aa overlap (15-590:12-587)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MRSAARRGRAAPAARDSLPVLLFLCLLLKTCEPKTANAFKPNILLIMADDLGTGDLGCYG
                     :. ::..: . : :     .  .: .:::::.:::::: ::.::::
CCDS14    MLHLHHSCLCFRSWLPAMLAVLLSLAPSASSDISASRPNILLLMADDLGIGDIGCYG
                  10        20        30        40        50       

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 NNTLRTPNIDQLAEEGVRLTQHLAAAPLCTPSRAAFLTGRHSFRSGMDASNGYRALQWNA
       :::.::::::.:::.::.::::..:: :::::::::::::.  :::: .: :::.:::..
CCDS14 NNTMRTPNIDRLAEDGVKLTQHISAASLCTPSRAAFLTGRYPVRSGMVSSIGYRVLQWTG
        60        70        80        90       100       110       

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 GSGGLPENETTFARILQQHGYATGLIGKWHQGVNCASRGDHCHHPLNHGFDYFYGMPFTL
       .::::: ::::::.::...::::::::::: :.:: : .:::::::.::::.::::::.:
CCDS14 ASGGLPTNETTFAKILKEKGYATGLIGKWHLGLNCESASDHCHHPLHHGFDHFYGMPFSL
       120       130       140       150       160       170       

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 TNDCDPGRPPEVDAALRAQLWGYTQFLALGILTLAAGQTCGFFCVSARAVTGMAGVGCLF
        .::   .  :  . :. .:    : :::  :::.::.   .. ::   :   :  . :.
CCDS14 MGDCARWELSEKRVNLEQKLNFLFQVLALVALTLVAGKLTHLIPVSWMPVIWSALSAVLL
       180       190       200       210       220       230       

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 FISWYSSFGFVRRWNCILMRNHDVTEQPMVLEKTASLMLKEAVSYIERHKHGPFLLFLSL
       . : :   ... . .:.::::: .::::: ...:. :.:.:..:...:.::::::::.:.
CCDS14 LASSYFVGALIVHADCFLMRNHTITEQPMCFQRTTPLILQEVASFLKRNKHGPFLLFVSF
       240       250       260       270       280       290       

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 LHVHIPLVTTSAFLGKSQHGLYGDNVEEMDWLIGKVLNAIEDNGLKNSTFTYFTSDHGGH
       :::::::.:   ::::: :::::::::::::..:..:.... .::.:::. :::::::: 
CCDS14 LHVHIPLITMENFLGKSLHGLYGDNVEEMDWMVGRILDTLDVEGLSNSTLIYFTSDHGGS
       300       310       320       330       340       350       

              370       380       390       400       410       420
pF1KE1 LEARDGHSQLGGWNGIYKGGKGMGGWEGGIRVPGIFHWPGVLPAGRVIGEPTSLMDVFPT
       :: . :..: ::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::
CCDS14 LENQLGNTQYGGWNGIYKGGKGMGGWEGGIRVPGIFRWPGVLPAGRVIGEPTSLMDVFPT
       360       370       380       390       400       410       

              430       440       450       460       470       480
pF1KE1 VVQLVGGEVPQDRVIDGHSLVPLLQGAEARSAHEFLFHYCGQHLHAARWHQKDSGSVWKV
       ::.:.::::::::::::..:.::: :.  .: ::::.::: . ::::::::.: :..:::
CCDS14 VVRLAGGEVPQDRVIDGQDLLPLLLGTAQHSDHEFLMHYCERFLHAARWHQRDRGTMWKV
       420       430       440       450       460       470       

              490       500       510       520       530       540
pF1KE1 HYTTPQFHPEGAGACYGRGVCPCSGEGVTHHRPPLLFDLSRDPSEARPLTPDSEPLYHAV
       :..:: :.:::::::::: :::: :: :.:: :::::::::::::.. ::: :::... :
CCDS14 HFVTPVFQPEGAGACYGRKVCPCFGEKVVHHDPPLLFDLSRDPSETHILTPASEPVFYQV
       480       490       500       510       520       530       

              550       560       570       580       590   
pF1KE1 IARVGAAVSEHRQTLSPVPQQFSMSNILWKPWLQPCCGHFPFCSCHEDGDGTP
       . ::  :: ::..:::::: :..  . .:.:::::::: ::.: : .. :   
CCDS14 MERVQQAVWEHQRTLSPVPLQLDRLGNIWRPWLQPCCGPFPLCWCLREDDPQ 
       540       550       560       570       580          

>>CCDS75948.1 ARSE gene_id:415|Hs108|chrX                 (614 aa)
 initn: 2648 init1: 2613 opt: 2616  Z-score: 2875.3  bits: 542.1 E(32554): 7.8e-154
Smith-Waterman score: 2616; 63.5% identity (82.8% similar) in 576 aa overlap (15-590:37-612)

                               10        20        30        40    
pF1KE1                 MRSAARRGRAAPAARDSLPVLLFLCLLLKTCEPKTANAFKPNIL
                                     :. ::..: . : :     .  .: .::::
CCDS75 RCAPGSLDLMLPQAASEGIVFHSLQISLCFRSWLPAMLAVLLSLAPSASSDISASRPNIL
         10        20        30        40        50        60      

           50        60        70        80        90       100    
pF1KE1 LIMADDLGTGDLGCYGNNTLRTPNIDQLAEEGVRLTQHLAAAPLCTPSRAAFLTGRHSFR
       :.:::::: ::.:::::::.::::::.:::.::.::::..:: :::::::::::::.  :
CCDS75 LLMADDLGIGDIGCYGNNTMRTPNIDRLAEDGVKLTQHISAASLCTPSRAAFLTGRYPVR
         70        80        90       100       110       120      

          110       120       130       140       150       160    
pF1KE1 SGMDASNGYRALQWNAGSGGLPENETTFARILQQHGYATGLIGKWHQGVNCASRGDHCHH
       ::: .: :::.:::...::::: ::::::.::...::::::::::: :.:: : .:::::
CCDS75 SGMVSSIGYRVLQWTGASGGLPTNETTFAKILKEKGYATGLIGKWHLGLNCESASDHCHH
        130       140       150       160       170       180      

          170       180       190       200       210       220    
pF1KE1 PLNHGFDYFYGMPFTLTNDCDPGRPPEVDAALRAQLWGYTQFLALGILTLAAGQTCGFFC
       ::.::::.::::::.: .::   .  :  . :. .:    : :::  :::.::.   .. 
CCDS75 PLHHGFDHFYGMPFSLMGDCARWELSEKRVNLEQKLNFLFQVLALVALTLVAGKLTHLIP
        190       200       210       220       230       240      

          230       240       250       260       270       280    
pF1KE1 VSARAVTGMAGVGCLFFISWYSSFGFVRRWNCILMRNHDVTEQPMVLEKTASLMLKEAVS
       ::   :   :  . :.. : :   ... . .:.::::: .::::: ...:. :.:.:..:
CCDS75 VSWMPVIWSALSAVLLLASSYFVGALIVHADCFLMRNHTITEQPMCFQRTTPLILQEVAS
        250       260       270       280       290       300      

          290       300       310       320       330       340    
pF1KE1 YIERHKHGPFLLFLSLLHVHIPLVTTSAFLGKSQHGLYGDNVEEMDWLIGKVLNAIEDNG
       ...:.::::::::.:.:::::::.:   ::::: :::::::::::::..:..:.... .:
CCDS75 FLKRNKHGPFLLFVSFLHVHIPLITMENFLGKSLHGLYGDNVEEMDWMVGRILDTLDVEG
        310       320       330       340       350       360      

          350       360       370       380       390       400    
pF1KE1 LKNSTFTYFTSDHGGHLEARDGHSQLGGWNGIYKGGKGMGGWEGGIRVPGIFHWPGVLPA
       :.:::. :::::::: :: . :..: ::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS75 LSNSTLIYFTSDHGGSLENQLGNTQYGGWNGIYKGGKGMGGWEGGIRVPGIFRWPGVLPA
        370       380       390       400       410       420      

          410       420       430       440       450       460    
pF1KE1 GRVIGEPTSLMDVFPTVVQLVGGEVPQDRVIDGHSLVPLLQGAEARSAHEFLFHYCGQHL
       ::::::::::::::::::.:.::::::::::::..:.::: :.  .: ::::.::: . :
CCDS75 GRVIGEPTSLMDVFPTVVRLAGGEVPQDRVIDGQDLLPLLLGTAQHSDHEFLMHYCERFL
        430       440       450       460       470       480      

          470       480       490       500       510       520    
pF1KE1 HAARWHQKDSGSVWKVHYTTPQFHPEGAGACYGRGVCPCSGEGVTHHRPPLLFDLSRDPS
       :::::::.: :..::::..:: :.:::::::::: :::: :: :.:: ::::::::::::
CCDS75 HAARWHQRDRGTMWKVHFVTPVFQPEGAGACYGRKVCPCFGEKVVHHDPPLLFDLSRDPS
        490       500       510       520       530       540      

          530       540       550       560       570       580    
pF1KE1 EARPLTPDSEPLYHAVIARVGAAVSEHRQTLSPVPQQFSMSNILWKPWLQPCCGHFPFCS
       :.. ::: :::... :. ::  :: ::..:::::: :..  . .:.:::::::: ::.: 
CCDS75 ETHILTPASEPVFYQVMERVQQAVWEHQRTLSPVPLQLDRLGNIWRPWLQPCCGPFPLCW
        550       560       570       580       590       600      

          590   
pF1KE1 CHEDGDGTP
       : .. :   
CCDS75 CLREDDPQ 
        610     

>>CCDS14123.1 ARSF gene_id:416|Hs108|chrX                 (590 aa)
 initn: 2354 init1: 1976 opt: 2452  Z-score: 2695.2  bits: 508.7 E(32554): 8.3e-144
Smith-Waterman score: 2452; 59.8% identity (82.0% similar) in 577 aa overlap (15-588:4-577)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MRSAARRGRAAPAARDSLPVLLFLCLLLKTCEPKTANAFKPNILLIMADDLGTGDLGCYG
                     :  :  . ..: ::.::. . ..  ::::.:::.:::: :::::::
CCDS14            MRPRRPLVFMSLVCALLNTCQAHRVHDDKPNIVLIMVDDLGIGDLGCYG
                          10        20        30        40         

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 NNTLRTPNIDQLAEEGVRLTQHLAAAPLCTPSRAAFLTGRHSFRSGMDASNGYRALQWNA
       :.:.:::.::.::.::::::::..:: ::.:::.::::::. .:::: .:.. :..:  :
CCDS14 NDTMRTPHIDRLAREGVRLTQHISAASLCSPSRSAFLTGRYPIRSGMVSSGNRRVIQNLA
      50        60        70        80        90       100         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 GSGGLPENETTFARILQQHGYATGLIGKWHQGVNCASRGDHCHHPLNHGFDYFYGMPFTL
         .::: ::::.: .:...::.::::::::::.:: ::.:.:::: :.::::.:::::::
CCDS14 VPAGLPLNETTLAALLKKQGYSTGLIGKWHQGLNCDSRSDQCHHPYNYGFDYYYGMPFTL
     110       120       130       140       150       160         

                190       200       210       220       230        
pF1KE1 TNDC--DPGRPPEVDAALRAQLWGYTQFLALGILTLAAGQTCGFFCVSARAVTGMAGVGC
       ...:  ::.:  :.  :...:::  .:..:..::::. :.  :.  :    . .:     
CCDS14 VDSCWPDPSRNTEL--AFESQLWLCVQLVAIAILTLTFGKLSGWVSVPWLLIFSMILFIF
     170       180         190       200       210       220       

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE1 LFFISWYSSFGFVRRWNCILMRNHDVTEQPMVLEKTASLMLKEAVSYIERHKHGPFLLFL
       :.  .:.::      :.:.:::.:..:::::  :...:.:.:::.:..:::..  ::::.
CCDS14 LLGYAWFSSHTSPLYWDCLLMRGHEITEQPMKAERAGSIMVKEAISFLERHSKETFLLFF
       230       240       250       260       270       280       

      300       310       320       330       340       350        
pF1KE1 SLLHVHIPLVTTSAFLGKSQHGLYGDNVEEMDWLIGKVLNAIEDNGLKNSTFTYFTSDHG
       :.:::: :: ::. : : :.:::::::::::: ..::.:.::.: ::.:.:..:::::::
CCDS14 SFLHVHTPLPTTDDFTGTSKHGLYGDNVEEMDSMVGKILDAIDDFGLRNNTLVYFTSDHG
       290       300       310       320       330       340       

      360       370       380       390       400       410        
pF1KE1 GHLEARDGHSQLGGWNGIYKGGKGMGGWEGGIRVPGIFHWPGVLPAGRVIGEPTSLMDVF
       :::::: ::.::::::::::::::::::::::::::: .::: .::::.: :::::::..
CCDS14 GHLEARRGHAQLGGWNGIYKGGKGMGGWEGGIRVPGIVRWPGKVPAGRLIKEPTSLMDIL
       350       360       370       380       390       400       

      420       430       440       450       460       470        
pF1KE1 PTVVQLVGGEVPQDRVIDGHSLVPLLQGAEARSAHEFLFHYCGQHLHAARWHQKD-SGSV
       :::... :: .::::::::..:.:::::   .: :::::::::..:::.::  :: ::::
CCDS14 PTVASVSGGSLPQDRVIDGRDLMPLLQGNVRHSEHEFLFHYCGSYLHAVRWIPKDDSGSV
       410       420       430       440       450       460       

       480       490       500       510       520       530       
pF1KE1 WKVHYTTPQFHPEGAGACYGRGVCPCSGEGVTHHRPPLLFDLSRDPSEARPLTPDSEPLY
       ::.::.:: :.: ..:.::  ..: : :: ::.: :::::::::::::. :::: .:::.
CCDS14 WKAHYVTPVFQPPASGGCYVTSLCRCFGEQVTYHNPPLLFDLSRDPSESTPLTPATEPLH
       470       480       490       500       510       520       

       540       550       560       570       580       590       
pF1KE1 HAVIARVGAAVSEHRQTLSPVPQQFSMSNILWKPWLQPCCGHFPFCSCHEDGDGTP    
         :: .:. :..::..:. ::  :.:  :   . ::.:::: :::: : ..         
CCDS14 DFVIKKVANALKEHQETIVPVTYQLSELN-QGRTWLKPCCGVFPFCLCDKEEEVSQPRGP
       530       540       550        560       570       580      

CCDS14 NEKR
        590

>>CCDS75949.1 ARSE gene_id:415|Hs108|chrX                 (544 aa)
 initn: 2465 init1: 2430 opt: 2430  Z-score: 2671.6  bits: 504.2 E(32554): 1.7e-142
Smith-Waterman score: 2430; 64.4% identity (83.6% similar) in 525 aa overlap (66-590:18-542)

          40        50        60        70        80        90     
pF1KE1 ANAFKPNILLIMADDLGTGDLGCYGNNTLRTPNIDQLAEEGVRLTQHLAAAPLCTPSRAA
                                     :::::.:::.::.::::..:: ::::::::
CCDS75              MSGSRERDNMLHLHHSWTPNIDRLAEDGVKLTQHISAASLCTPSRAA
                            10        20        30        40       

         100       110       120       130       140       150     
pF1KE1 FLTGRHSFRSGMDASNGYRALQWNAGSGGLPENETTFARILQQHGYATGLIGKWHQGVNC
       :::::.  :::: .: :::.:::...::::: ::::::.::...::::::::::: :.::
CCDS75 FLTGRYPVRSGMVSSIGYRVLQWTGASGGLPTNETTFAKILKEKGYATGLIGKWHLGLNC
        50        60        70        80        90       100       

         160       170       180       190       200       210     
pF1KE1 ASRGDHCHHPLNHGFDYFYGMPFTLTNDCDPGRPPEVDAALRAQLWGYTQFLALGILTLA
        : .:::::::.::::.::::::.: .::   .  :  . :. .:    : :::  :::.
CCDS75 ESASDHCHHPLHHGFDHFYGMPFSLMGDCARWELSEKRVNLEQKLNFLFQVLALVALTLV
       110       120       130       140       150       160       

         220       230       240       250       260       270     
pF1KE1 AGQTCGFFCVSARAVTGMAGVGCLFFISWYSSFGFVRRWNCILMRNHDVTEQPMVLEKTA
       ::.   .. ::   :   :  . :.. : :   ... . .:.::::: .::::: ...:.
CCDS75 AGKLTHLIPVSWMPVIWSALSAVLLLASSYFVGALIVHADCFLMRNHTITEQPMCFQRTT
       170       180       190       200       210       220       

         280       290       300       310       320       330     
pF1KE1 SLMLKEAVSYIERHKHGPFLLFLSLLHVHIPLVTTSAFLGKSQHGLYGDNVEEMDWLIGK
        :.:.:..:...:.::::::::.:.:::::::.:   ::::: :::::::::::::..:.
CCDS75 PLILQEVASFLKRNKHGPFLLFVSFLHVHIPLITMENFLGKSLHGLYGDNVEEMDWMVGR
       230       240       250       260       270       280       

         340       350       360       370       380       390     
pF1KE1 VLNAIEDNGLKNSTFTYFTSDHGGHLEARDGHSQLGGWNGIYKGGKGMGGWEGGIRVPGI
       .:.... .::.:::. :::::::: :: . :..: :::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ILDTLDVEGLSNSTLIYFTSDHGGSLENQLGNTQYGGWNGIYKGGKGMGGWEGGIRVPGI
       290       300       310       320       330       340       

         400       410       420       430       440       450     
pF1KE1 FHWPGVLPAGRVIGEPTSLMDVFPTVVQLVGGEVPQDRVIDGHSLVPLLQGAEARSAHEF
       :.:::::::::::::::::::::::::.:.::::::::::::..:.::: :.  .: :::
CCDS75 FRWPGVLPAGRVIGEPTSLMDVFPTVVRLAGGEVPQDRVIDGQDLLPLLLGTAQHSDHEF
       350       360       370       380       390       400       

         460       470       480       490       500       510     
pF1KE1 LFHYCGQHLHAARWHQKDSGSVWKVHYTTPQFHPEGAGACYGRGVCPCSGEGVTHHRPPL
       :.::: . ::::::::.: :..::::..:: :.:::::::::: :::: :: :.:: :::
CCDS75 LMHYCERFLHAARWHQRDRGTMWKVHFVTPVFQPEGAGACYGRKVCPCFGEKVVHHDPPL
       410       420       430       440       450       460       

         520       530       540       550       560       570     
pF1KE1 LFDLSRDPSEARPLTPDSEPLYHAVIARVGAAVSEHRQTLSPVPQQFSMSNILWKPWLQP
       ::::::::::.. ::: :::... :. ::  :: ::..:::::: :..  . .:.:::::
CCDS75 LFDLSRDPSETHILTPASEPVFYQVMERVQQAVWEHQRTLSPVPLQLDRLGNIWRPWLQP
       470       480       490       500       510       520       

         580       590   
pF1KE1 CCGHFPFCSCHEDGDGTP
       ::: ::.: : .. :   
CCDS75 CCGPFPLCWCLREDDPQ 
       530       540     

>>CCDS14127.1 STS gene_id:412|Hs108|chrX                  (583 aa)
 initn: 1940 init1: 1940 opt: 2005  Z-score: 2204.0  bits: 417.8 E(32554): 1.9e-116
Smith-Waterman score: 2005; 49.1% identity (75.8% similar) in 579 aa overlap (12-588:2-575)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE1 MRSAARRGRAAPAARDSLPVLLFLCLLLKTCEPKTANAFKPNILLIMADDLGTGDLGCYG
                  :  . ..: ::.. :     : ..  : .:::.:.:::::: :: ::::
CCDS14           MPLRKMKIPFLLLFFLW----EAESHAASRPNIILVMADDLGIGDPGCYG
                         10            20        30        40      

               70        80        90       100       110       120
pF1KE1 NNTLRTPNIDQLAEEGVRLTQHLAAAPLCTPSRAAFLTGRHSFRSGMDASNGYRALQWNA
       :.:.::::::.::  ::.:::::::.::::::::::.:::.  :::: . .   .. ..:
CCDS14 NKTIRTPNIDRLASGGVKLTQHLAASPLCTPSRAAFMTGRYPVRSGMASWSRTGVFLFTA
         50        60        70        80        90       100      

              130       140       150       160       170       180
pF1KE1 GSGGLPENETTFARILQQHGYATGLIGKWHQGVNCASRGDHCHHPLNHGFDYFYGMPFTL
       .::::: .: :::..:...::.:.:::::: :..: :. : :::::.:::.::::. .: 
CCDS14 SSGGLPTDEITFAKLLKDQGYSTALIGKWHLGMSCHSKTDFCHHPLHHGFNYFYGISLTN
        110       120       130       140       150       160      

              190       200       210       220       230       240
pF1KE1 TNDCDPGRPPEVDAALRAQLWGYTQFLALGILTLAAGQTCGFFCVSARAVTGMAGVGCLF
         :: ::.     ....  ..   :.... .::::: .  :.. :   .  ..  .. :.
CCDS14 LRDCKPGEGSVFTTGFKRLVFLPLQIVGVTLLTLAALNCLGLLHVPLGVFFSLLFLAALI
        170       180       190       200       210       220      

              250       260       270       280       290       300
pF1KE1 FISWYSSFGFVRRWNCILMRNHDVTEQPMVLEKTASLMLKEAVSYIERHKHGPFLLFLSL
       .  . . . . :  ::..:::... .:::  .. .. .  ::...:.:. . :::: :: 
CCDS14 LTLFLGFLHYFRPLNCFMMRNYEIIQQPMSYDNLTQRLTVEAAQFIQRNTETPFLLVLSY
        230       240       250       260       270       280      

              310       320       330       340       350       360
pF1KE1 LHVHIPLVTTSAFLGKSQHGLYGDNVEEMDWLIGKVLNAIEDNGLKNSTFTYFTSDHGGH
       ::::  : ... : ::::::.::: :::::: .:..:: ...  : :.:. :::::.:.:
CCDS14 LHVHTALFSSKDFAGKSQHGVYGDAVEEMDWSVGQILNLLDELRLANDTLIYFTSDQGAH
        290       300       310       320       330       340      

              370        380       390       400       410         
pF1KE1 LEARDGHSQL-GGWNGIYKGGKGMGGWEGGIRVPGIFHWPGVLPAGRVIGEPTSLMDVFP
       .:  ...... :: ::::::::. ..::::::::::..:: :. ::. : :::: ::.::
CCDS14 VEEVSSKGEIHGGSNGIYKGGKA-NNWEGGIRVPGILRWPRVIQAGQKIDEPTSNMDIFP
        350       360        370       380       390       400     

     420       430       440       450       460       470         
pF1KE1 TVVQLVGGEVPQDRVIDGHSLVPLLQGAEARSAHEFLFHYCGQHLHAARWHQKDSGSVWK
       ::..:.:. .:.::.:::..:.:::.:   :: ::::::::. .:.:.::: ..: :.::
CCDS14 TVAKLAGAPLPEDRIIDGRDLMPLLEGKSQRSDHEFLFHYCNAYLNAVRWHPQNSTSIWK
         410       420       430       440       450       460     

     480       490       500       510       520       530         
pF1KE1 VHYTTPQFHPEGAGACYGRGVCPCSGEGVTHHRPPLLFDLSRDPSEARPLTPDSEPLYHA
       . . ::.:.: :...:..  :: : :  :::: ::::::.:.:: :  :::: ::: .. 
CCDS14 AFFFTPNFNPVGSNGCFATHVCFCFGSYVTHHDPPLLFDISKDPRERNPLTPASEPRFYE
         470       480       490       500       510       520     

     540       550       560       570       580        590      
pF1KE1 VIARVGAAVSEHRQTLSPVPQQFSMSNILWKPWLQPCCGHFPF-CSCHEDGDGTP   
       ..  .  :...: :::  ::.::: .:.::::::: ::    . :.: ..        
CCDS14 ILKVMQEAADRHTQTLPEVPDQFSWNNFLWKPWLQLCCPSTGLSCQCDREKQDKRLSR
         530       540       550       560       570       580   

>>CCDS10970.1 GALNS gene_id:2588|Hs108|chr16              (522 aa)
 initn: 854 init1: 264 opt: 402  Z-score: 442.6  bits: 91.7 E(32554): 2.5e-18
Smith-Waterman score: 899; 33.0% identity (58.8% similar) in 548 aa overlap (41-583:31-507)

               20        30        40        50        60        70
pF1KE1 APAARDSLPVLLFLCLLLKTCEPKTANAFKPNILLIMADDLGTGDLGCYGNNTLRTPNID
                                     :::::.. ::.: :::: ::. . .:::.:
CCDS10 MAAVVAATRWWQLLLVLSAAGMGASGAPQPPNILLLLMDDMGWGDLGVYGEPSRETPNLD
               10        20        30        40        50        60

               80        90       100       110         120        
pF1KE1 QLAEEGVRLTQHLAAAPLCTPSRAAFLTGRHSFRSGMDASNGY--RALQWNAGSGGLPEN
       ..: ::. . .  .: :::.:::::.::::  .:.:. ..:..   :   .   ::.:..
CCDS10 RMAAEGLLFPNFYSANPLCSPSRAALLTGRLPIRNGFYTTNAHARNAYTPQEIVGGIPDS
               70        80        90       100       110       120

      130       140       150       160       170       180        
pF1KE1 ETTFARILQQHGYATGLIGKWHQGVNCASRGDHCHHPLNHGFDYFYGMPFTLTNDCDPGR
       :  . ..:.. ::.. ..:::: :     : .   :::.:::: ..: :     .:  : 
CCDS10 EQLLPELLKKAGYVSKIVGKWHLG----HRPQ--FHPLKHGFDEWFGSP-----NCHFG-
              130       140             150       160              

      190       200       210       220       230       240        
pF1KE1 PPEVDAALRAQLWGYTQFLALGILTLAAGQTCGFFCVSARAVTGMAGVGCLFFISWYSSF
       :   :   : ..  : ..  .:                                 .:  :
CCDS10 P--YDNKARPNIPVYRDWEMVG--------------------------------RYYEEF
        170       180                                       190    

      250       260       270       280        290       300       
pF1KE1 GFVRRWNCILMRNHDVTEQPMVLEKTASLMLKEAVSYIERH-KHGPFLLFLSLLHVHIPL
        .          :  . :  ..     ...:.::...:.:. .: ::.:. ..  .: :.
CCDS10 PI----------NLKTGEANLT-----QIYLQEALDFIKRQARHHPFFLYWAVDATHAPV
                    200            210       220       230         

       310       320       330       340       350       360       
pF1KE1 VTTSAFLGKSQHGLYGDNVEEMDWLIGKVLNAIEDNGLKNSTFTYFTSDHGGHLEARDGH
        ... ::: ::.: ::: :.:.:  :::.:. ..:  . ..::..::::.:. : .    
CCDS10 YASKPFLGTSQRGRYGDAVREIDDSIGKILELLQDLHVADNTFVFFTSDNGAALISAP--
     240       250       260       270       280       290         

       370       380       390       400       410       420       
pF1KE1 SQLGGWNGIYKGGKGMGGWEGGIRVPGIFHWPGVLPAGRVIGEPTSLMDVFPTVVQLVGG
        . :: :: .  :: .  .:::.: :..  ::: . ::.:  .  :.::.: : . :.: 
CCDS10 -EQGGSNGPFLCGK-QTTFEGGMREPALAWWPGHVTAGQVSHQLGSIMDLFTTSLALAGL
        300       310        320       330       340       350     

       430       440        450       460       470       480      
pF1KE1 EVPQDRVIDGHSLVP-LLQGAEARSAHEFLFHYCGQHLHAARWHQKDSGSVWKVHYTTPQ
         :.::.::: .:.: ::::   :   . .:.: :. : ::   :. .   :    .  .
CCDS10 TPPSDRAIDGLNLLPTLLQG---RLMDRPIFYYRGDTLMAATLGQHKA-HFWTWTNSWEN
         360       370          380       390       400        410 

        490       500       510        520       530       540     
pF1KE1 FHPEGAGACYGRGVCPCSGEGVTHH-RPPLLFDLSRDPSEARPLTPDSEPLYHAVIARVG
       :. .:   : :..:   . ...  : . ::.: :.:::.:  ::.  :   :. ...:. 
CCDS10 FR-QGIDFCPGQNVSGVTTHNLEDHTKLPLIFHLGRDPGERFPLSFASAE-YQEALSRIT
              420       430       440       450       460          

         550       560       570       580       590        
pF1KE1 AAVSEHRQTLSPVPQQFSMSNILWKPWLQPCCGHFPFCSCHEDGDGTP     
       ..:..:...: :.  :... :     :  : : ..  :               
CCDS10 SVVQQHQEALVPAQPQLNVCNWAVMNWAPPGCEKLGKCLTPPESIPKKCLWSH
     470       480       490       500       510       520  

>>CCDS14100.2 ARSA gene_id:410|Hs108|chr22                (509 aa)
 initn: 751 init1: 282 opt: 390  Z-score: 429.5  bits: 89.3 E(32554): 1.3e-17
Smith-Waterman score: 748; 32.1% identity (55.0% similar) in 564 aa overlap (36-586:18-503)

          10        20        30        40        50        60     
pF1KE1 RRGRAAPAARDSLPVLLFLCLLLKTCEPKTANAFKPNILLIMADDLGTGDLGCYGNNTLR
                                     : :  :::.::.::::: :::::::. .  
CCDS14              MSMGAPRSLLLALAAGLAVARPPNIVLIFADDLGYGDLGCYGHPSST
                            10        20        30        40       

          70        80        90       100       110       120     
pF1KE1 TPNIDQLAEEGVRLTQHLAAAPLCTPSRAAFLTGRHSFRSGMDASNGYRALQWNAGSGGL
       :::.::::  :.:.:.  . . ::::::::.::::   : ::     : ..   .. :::
CCDS14 TPNLDQLAAGGLRFTDFYVPVSLCTPSRAALLTGRLPVRMGM-----YPGVLVPSSRGGL
        50        60        70        80             90       100  

         130       140       150       160       170       180     
pF1KE1 PENETTFARILQQHGYATGLIGKWHQGVNCASRGDHCHHPLNHGFDYFYGMPFTLTNDCD
       : .:.: :..:  .:: ::. :::: ::.     .    : ..::  : :.:.  ..:  
CCDS14 PLEEVTVAEVLAARGYLTGMAGKWHLGVG----PEGAFLPPHQGFHRFLGIPY--SHDQG
            110       120       130           140       150        

         190       200       210       220       230       240     
pF1KE1 PGRPPEVDAALRAQLWGYTQFLALGILTLAAGQTCGFFCVSARAVTGMAGVGCLFFISWY
       :                  : :           ::  :   :    :    ::       
CCDS14 P-----------------CQNL-----------TC--F-PPATPCDG----GC-------
                         160                     170               

         250       260       270       280         290       300   
pF1KE1 SSFGFVRRWNCILMRNHDVTEQPMVLEKTASLMLKEAVSYIE--RHKHGPFLLFLSLLHV
        . :.:      :. : .:  ::  :    . ..  : . .   ...  ::.:. .  :.
CCDS14 -DQGLV---PIPLLANLSVEAQPPWLPGLEARYMAFAHDLMADAQRQDRPFFLYYASHHT
              180       190       200       210       220       230

           310       320       330       340       350       360   
pF1KE1 HIPLVTTSAFLGKSQHGLYGDNVEEMDWLIGKVLNAIEDNGLKNSTFTYFTSDHGGHLEA
       : :  . ..:  .: .: .::.. :.:  .: ...:: : :: . :.. ::.:.: .   
CCDS14 HYPQFSGQSFAERSGRGPFGDSLMELDAAVGTLMTAIGDLGLLEETLVIFTADNGPETM-
              240       250       260       270       280          

           370       380       390       400       410       420   
pF1KE1 RDGHSQLGGWNGIYKGGKGMGGWEGGIRVPGIFHWPGVLPAGRVIGEPTSLMDVFPTVVQ
          . . :: .:. . :::   .:::.: :..  ::: .  : :  : .: .:..::.. 
CCDS14 ---RMSRGGCSGLLRCGKGTT-YEGGVREPALAFWPGHIAPG-VTHELASSLDLLPTLAA
        290       300        310       320        330       340    

           430       440       450       460       470       480   
pF1KE1 LVGGEVPQDRVIDGHSLVPLLQGAEARSAHEFLFHYCGQHLHAARWHQKDSGSVWKVHYT
       :.:. .: . ..:: .: ::: :. ..: .. :: : .   ..       .:. .:.:. 
CCDS14 LAGAPLP-NVTLDGFDLSPLLLGT-GKSPRQSLFFYPSYPDEVRGVFAVRTGK-YKAHFF
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       :  . : . ..  ::.       .. ..: :.::::.:::.::.:   :   .  . :  
CCDS14 TQGSAHSDTTADPACH-------ASSSLTAHEPPLLYDLSKDPGENYNLLGGVAGATPEV
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         .. ..    ..   ...  :.: . ..    : :: :: : : :.     ::      
CCDS14 LQALKQLQLLKAQLDAAVTFGPSQVARGE---DPALQICC-H-PGCTPRPACCHCPDPHA
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        .:  : :.:..: ::.:...  :::  :.::::..:::: ..:.:.  . .  ..    
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         :::: ::::.:..::: ::.::.::::: :     .:..  ::  .::::..:.:.. 
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          :     :           ::..              :   : .. . .      :  
CCDS11 DMGCTD--TP-----------GYNH------------PPCPA-CPQGDGPSRNLQRDC--
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           :.. ..       :..: ...:::. : . :. . ..:...:.: . .  ::::..
CCDS11 ----YTDVALP------LYENLNIVEQPVNLSSLAQKYAEKATQFIQRASTSGRPFLLYV
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pF1KE1 SLLHVHIPLVTTSAFLGKSQHGLYGDNVEEMDWLIGKVLNAIEDNGLKNSTFTYFTSDHG
       .: :.:.:: .:.   .   ..::: .. ::: :.:.. . . :. .:..:: .::.:.:
CCDS11 ALAHMHVPLPVTQLPAAPRGRSLYGAGLWEMDSLVGQIKDKV-DHTVKENTFLWFTGDNG
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          .  .  ...: ..:...  .:     .  :::: :::.. .::: .:.. .     :
CCDS11 PWAQKCELAGSVGPFTGFWQTRQGGSPAKQTTWEGGHRVPALAYWPGRVPVNVTSTALLS
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