Result of FASTA (ccds) for pFN21AB9912
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB9912, 592 aa
  1>>>pF1KB9912 592 - 592 aa - 592 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.7568+/-0.0011; mu= -1.2867+/- 0.066
 mean_var=223.3806+/-46.329, 0's: 0 Z-trim(110.9): 44  B-trim: 284 in 1/51
 Lambda= 0.085813
 statistics sampled from 11928 (11965) to 11928 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.713), E-opt: 0.2 (0.368), width:  16
 Scan time:  3.570

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS34906.1 EYA1 gene_id:2138|Hs108|chr8           ( 592) 3955 502.8 5.1e-142
CCDS75750.1 EYA1 gene_id:2138|Hs108|chr8           ( 586) 3874 492.7 5.3e-139
CCDS47873.1 EYA1 gene_id:2138|Hs108|chr8           ( 559) 3683 469.1 6.6e-132
CCDS75521.1 EYA4 gene_id:2070|Hs108|chr6           ( 645) 2744 352.9 7.4e-97
CCDS43506.1 EYA4 gene_id:2070|Hs108|chr6           ( 616) 2428 313.7 4.2e-85
CCDS5165.1 EYA4 gene_id:2070|Hs108|chr6            ( 639) 2316 299.9 6.5e-81
CCDS34907.1 EYA1 gene_id:2138|Hs108|chr8           ( 557) 2303 298.2 1.8e-80
CCDS75523.1 EYA4 gene_id:2070|Hs108|chr6           ( 585) 2272 294.4 2.7e-79
CCDS5166.1 EYA4 gene_id:2070|Hs108|chr6            ( 639) 2263 293.3 6.2e-79
CCDS13403.1 EYA2 gene_id:2139|Hs108|chr20          ( 538) 2097 272.7 8.2e-73
CCDS316.1 EYA3 gene_id:2140|Hs108|chr1             ( 573) 1871 244.8 2.3e-64
CCDS60050.1 EYA3 gene_id:2140|Hs108|chr1           ( 520) 1861 243.5   5e-64
CCDS60051.1 EYA3 gene_id:2140|Hs108|chr1           ( 527) 1579 208.6 1.6e-53
CCDS60052.1 EYA3 gene_id:2140|Hs108|chr1           ( 536) 1443 191.8 1.9e-48
CCDS54471.1 EYA2 gene_id:2139|Hs108|chr20          ( 459) 1333 178.1 2.1e-44


>>CCDS34906.1 EYA1 gene_id:2138|Hs108|chr8                (592 aa)
 initn: 3955 init1: 3955 opt: 3955  Z-score: 2663.2  bits: 502.8 E(32554): 5.1e-142
Smith-Waterman score: 3955; 100.0% identity (100.0% similar) in 592 aa overlap (1-592:1-592)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MEMQDLTSPHSRLSGSSESPSGPKLGNSHINSNSMTPNGTEVKTEPMSSSETASTTADGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MEMQDLTSPHSRLSGSSESPSGPKLGNSHINSNSMTPNGTEVKTEPMSSSETASTTADGS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 LNNFSGSAIGSSSFSPRPTHQFSPPQIYPSNRPYPHILPTPSSQTMAAYGQTQFTTGMQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LNNFSGSAIGSSSFSPRPTHQFSPPQIYPSNRPYPHILPTPSSQTMAAYGQTQFTTGMQQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 ATAYATYPQPGQPYGISSYGALWAGIKTEGGLSQSQSPGQTGFLSYGTSFSTPQPGQAPY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ATAYATYPQPGQPYGISSYGALWAGIKTEGGLSQSQSPGQTGFLSYGTSFSTPQPGQAPY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 SYQMQGSSFTTSSGIYTGNNSLTNSSGFNSSQQDYPSYPSFGQGQYAQYYNSSPYPAHYM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SYQMQGSSFTTSSGIYTGNNSLTNSSGFNSSQQDYPSYPSFGQGQYAQYYNSSPYPAHYM
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 TSSNTSPTTPSTNATYQLQEPPSGITSQAVTDPTAEYSTIHSPSTPIKDSDSDRLRRGSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TSSNTSPTTPSTNATYQLQEPPSGITSQAVTDPTAEYSTIHSPSTPIKDSDSDRLRRGSD
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 GKSRGRGRRNNNPSPPPDSDLERVFIWDLDETIIVFHSLLTGSYANRYGRDPPTSVSLGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GKSRGRGRRNNNPSPPPDSDLERVFIWDLDETIIVFHSLLTGSYANRYGRDPPTSVSLGL
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 RMEEMIFNLADTHLFFNDLEECDQVHIDDVSSDDNGQDLSTYNFGTDGFPAAATSANLCL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RMEEMIFNLADTHLFFNDLEECDQVHIDDVSSDDNGQDLSTYNFGTDGFPAAATSANLCL
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 ATGVRGGVDWMRKLAFRYRRVKEIYNTYKNNVGGLLGPAKREAWLQLRAEIEALTDSWLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ATGVRGGVDWMRKLAFRYRRVKEIYNTYKNNVGGLLGPAKREAWLQLRAEIEALTDSWLT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 LALKALSLIHSRTNCVNILVTTTQLIPALAKVLLYGLGIVFPIENIYSATKIGKESCFER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LALKALSLIHSRTNCVNILVTTTQLIPALAKVLLYGLGIVFPIENIYSATKIGKESCFER
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590  
pF1KB9 IIQRFGRKVVYVVIGDGVEEEQGAKKHAMPFWRISSHSDLMALHHALELEYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IIQRFGRKVVYVVIGDGVEEEQGAKKHAMPFWRISSHSDLMALHHALELEYL
              550       560       570       580       590  

>>CCDS75750.1 EYA1 gene_id:2138|Hs108|chr8                (586 aa)
 initn: 3569 init1: 2992 opt: 3874  Z-score: 2609.1  bits: 492.7 E(32554): 5.3e-139
Smith-Waterman score: 3874; 98.8% identity (99.0% similar) in 592 aa overlap (1-592:1-586)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MEMQDLTSPHSRLSGSSESPSGPKLGNSHINSNSMTPNGTEVKTEPMSSSETASTTADGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MEMQDLTSPHSRLSGSSESPSGPKLGNSHINSNSMTPNGTEVKTEPMSSSETASTTADGS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 LNNFSGSAIGSSSFSPRPTHQFSPPQIYPSNRPYPHILPTPSSQTMAAYGQTQFTTGMQQ
       :::::::::::::::::::::::::::::: .::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LNNFSGSAIGSSSFSPRPTHQFSPPQIYPS-KPYPHILPTPSSQTMAAYGQTQFTTGMQQ
               70        80        90        100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 ATAYATYPQPGQPYGISSYGALWAGIKTEGGLSQSQSPGQTGFLSYGTSFSTPQPGQAPY
       ::::::::::::::::::::     :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ATAYATYPQPGQPYGISSYG-----IKTEGGLSQSQSPGQTGFLSYGTSFSTPQPGQAPY
     120       130            140       150       160       170    

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 SYQMQGSSFTTSSGIYTGNNSLTNSSGFNSSQQDYPSYPSFGQGQYAQYYNSSPYPAHYM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SYQMQGSSFTTSSGIYTGNNSLTNSSGFNSSQQDYPSYPSFGQGQYAQYYNSSPYPAHYM
          180       190       200       210       220       230    

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 TSSNTSPTTPSTNATYQLQEPPSGITSQAVTDPTAEYSTIHSPSTPIKDSDSDRLRRGSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TSSNTSPTTPSTNATYQLQEPPSGITSQAVTDPTAEYSTIHSPSTPIKDSDSDRLRRGSD
          240       250       260       270       280       290    

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 GKSRGRGRRNNNPSPPPDSDLERVFIWDLDETIIVFHSLLTGSYANRYGRDPPTSVSLGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GKSRGRGRRNNNPSPPPDSDLERVFIWDLDETIIVFHSLLTGSYANRYGRDPPTSVSLGL
          300       310       320       330       340       350    

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 RMEEMIFNLADTHLFFNDLEECDQVHIDDVSSDDNGQDLSTYNFGTDGFPAAATSANLCL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RMEEMIFNLADTHLFFNDLEECDQVHIDDVSSDDNGQDLSTYNFGTDGFPAAATSANLCL
          360       370       380       390       400       410    

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 ATGVRGGVDWMRKLAFRYRRVKEIYNTYKNNVGGLLGPAKREAWLQLRAEIEALTDSWLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 ATGVRGGVDWMRKLAFRYRRVKEIYNTYKNNVGGLLGPAKREAWLQLRAEIEALTDSWLT
          420       430       440       450       460       470    

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 LALKALSLIHSRTNCVNILVTTTQLIPALAKVLLYGLGIVFPIENIYSATKIGKESCFER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LALKALSLIHSRTNCVNILVTTTQLIPALAKVLLYGLGIVFPIENIYSATKIGKESCFER
          480       490       500       510       520       530    

              550       560       570       580       590  
pF1KB9 IIQRFGRKVVYVVIGDGVEEEQGAKKHAMPFWRISSHSDLMALHHALELEYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 IIQRFGRKVVYVVIGDGVEEEQGAKKHAMPFWRISSHSDLMALHHALELEYL
          540       550       560       570       580      

>>CCDS47873.1 EYA1 gene_id:2138|Hs108|chr8                (559 aa)
 initn: 3683 init1: 3683 opt: 3683  Z-score: 2481.6  bits: 469.1 E(32554): 6.6e-132
Smith-Waterman score: 3683; 100.0% identity (100.0% similar) in 551 aa overlap (42-592:9-559)

              20        30        40        50        60        70 
pF1KB9 RLSGSSESPSGPKLGNSHINSNSMTPNGTEVKTEPMSSSETASTTADGSLNNFSGSAIGS
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47                       MLLFPQVAVKTEPMSSSETASTTADGSLNNFSGSAIGS
                                     10        20        30        

              80        90       100       110       120       130 
pF1KB9 SSFSPRPTHQFSPPQIYPSNRPYPHILPTPSSQTMAAYGQTQFTTGMQQATAYATYPQPG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SSFSPRPTHQFSPPQIYPSNRPYPHILPTPSSQTMAAYGQTQFTTGMQQATAYATYPQPG
       40        50        60        70        80        90        

             140       150       160       170       180       190 
pF1KB9 QPYGISSYGALWAGIKTEGGLSQSQSPGQTGFLSYGTSFSTPQPGQAPYSYQMQGSSFTT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QPYGISSYGALWAGIKTEGGLSQSQSPGQTGFLSYGTSFSTPQPGQAPYSYQMQGSSFTT
      100       110       120       130       140       150        

             200       210       220       230       240       250 
pF1KB9 SSGIYTGNNSLTNSSGFNSSQQDYPSYPSFGQGQYAQYYNSSPYPAHYMTSSNTSPTTPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SSGIYTGNNSLTNSSGFNSSQQDYPSYPSFGQGQYAQYYNSSPYPAHYMTSSNTSPTTPS
      160       170       180       190       200       210        

             260       270       280       290       300       310 
pF1KB9 TNATYQLQEPPSGITSQAVTDPTAEYSTIHSPSTPIKDSDSDRLRRGSDGKSRGRGRRNN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TNATYQLQEPPSGITSQAVTDPTAEYSTIHSPSTPIKDSDSDRLRRGSDGKSRGRGRRNN
      220       230       240       250       260       270        

             320       330       340       350       360       370 
pF1KB9 NPSPPPDSDLERVFIWDLDETIIVFHSLLTGSYANRYGRDPPTSVSLGLRMEEMIFNLAD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NPSPPPDSDLERVFIWDLDETIIVFHSLLTGSYANRYGRDPPTSVSLGLRMEEMIFNLAD
      280       290       300       310       320       330        

             380       390       400       410       420       430 
pF1KB9 THLFFNDLEECDQVHIDDVSSDDNGQDLSTYNFGTDGFPAAATSANLCLATGVRGGVDWM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 THLFFNDLEECDQVHIDDVSSDDNGQDLSTYNFGTDGFPAAATSANLCLATGVRGGVDWM
      340       350       360       370       380       390        

             440       450       460       470       480       490 
pF1KB9 RKLAFRYRRVKEIYNTYKNNVGGLLGPAKREAWLQLRAEIEALTDSWLTLALKALSLIHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RKLAFRYRRVKEIYNTYKNNVGGLLGPAKREAWLQLRAEIEALTDSWLTLALKALSLIHS
      400       410       420       430       440       450        

             500       510       520       530       540       550 
pF1KB9 RTNCVNILVTTTQLIPALAKVLLYGLGIVFPIENIYSATKIGKESCFERIIQRFGRKVVY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RTNCVNILVTTTQLIPALAKVLLYGLGIVFPIENIYSATKIGKESCFERIIQRFGRKVVY
      460       470       480       490       500       510        

             560       570       580       590  
pF1KB9 VVIGDGVEEEQGAKKHAMPFWRISSHSDLMALHHALELEYL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VVIGDGVEEEQGAKKHAMPFWRISSHSDLMALHHALELEYL
      520       530       540       550         

>>CCDS75521.1 EYA4 gene_id:2070|Hs108|chr6                (645 aa)
 initn: 2191 init1: 1719 opt: 2744  Z-score: 1852.4  bits: 352.9 E(32554): 7.4e-97
Smith-Waterman score: 2806; 70.2% identity (86.7% similar) in 624 aa overlap (1-592:30-645)

                                            10        20        30 
pF1KB9                              MEMQDLTSPHSRLSGSSESPSGPKLGNSHIN
                                    ::::::.:::. : :....:.. :: .:...
CCDS75 MEDSQDLNEQSVKKTCTESDVSQSQNSRSMEMQDLASPHT-LVGGGDTPGSSKLEKSNLS
               10        20        30        40         50         

              40                                    50        60   
pF1KB9 SNSMTPNGT----------------------------EVKTEPMSSSETASTTADGSLNN
       :.:.: :::                             :::::..::::..::.::.:..
CCDS75 STSVTTNGTGGENMTVLNTADWLLSCNTPSSATMSLLAVKTEPLNSSETTATTGDGALDT
      60        70        80        90       100       110         

            70        80        90       100        110       120  
pF1KB9 FSGSAIGSSSFSPRPTHQFSPPQIYPSNRPYPHILPTPSSQTMAAY-GQTQFTTGMQQAT
       :.::.: ::..::: .::.:: :.::: .:::::: ::..:::.:: ::::.. :::: .
CCDS75 FTGSVITSSGYSPRSAHQYSP-QLYPS-KPYPHILSTPAAQTMSAYAGQTQYS-GMQQPA
     120       130       140         150       160       170       

            130         140       150       160       170       180
pF1KB9 AYATYPQPGQPYGISSY--GALWAGIKTEGGLSQSQSPGQTGFLSYGTSFSTPQPGQAPY
       .:..: : ::::.. .:  :..  .::::.::::.::: :.: :::. .::::::::.::
CCDS75 VYTAYSQTGQPYSLPTYDLGVMLPAIKTESGLSQTQSPLQSGCLSYSPGFSTPQPGQTPY
        180       190       200       210       220       230      

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 SYQMQGSSFTTSSGIYTGNNSLTNSSGFNSSQQDYPSYPSFGQGQYAQYYNSSPYPAHYM
       :::: ::::. :: ::. :::..::..:..:::::::: .:::.::::::..: : : ::
CCDS75 SYQMPGSSFAPSSTIYA-NNSVSNSTNFSGSQQDYPSYTAFGQNQYAQYYSASTYGA-YM
        240       250        260       270       280       290     

              250       260       270        280       290         
pF1KB9 TSSNTSPTTPSTNATYQLQEPPSGITSQAVTD-PTAEYSTIHSPSTPIKDSDSDRLRRGS
       ::.::.  :::...::::::   :.:.:  ::   .:..:..:::::::: : .:  :.:
CCDS75 TSNNTADGTPSSTSTYQLQESLPGLTNQPGTDLHPGEFDTMQSPSTPIKDLD-ERTCRSS
          300       310       320       330       340        350   

     300       310       320       330       340       350         
pF1KB9 DGKSRGRGRRNNNPSPPPDSDLERVFIWDLDETIIVFHSLLTGSYANRYGRDPPTSVSLG
        .:::::::.:: :::::::::::::.:::::::::::::::::::..::.::: .:.::
CCDS75 GSKSRGRGRKNN-PSPPPDSDLERVFVWDLDETIIVFHSLLTGSYAQKYGKDPPMAVTLG
           360        370       380       390       400       410  

     360       370       380       390       400       410         
pF1KB9 LRMEEMIFNLADTHLFFNDLEECDQVHIDDVSSDDNGQDLSTYNFGTDGFPAAATSANLC
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::: :::.:::::
CCDS75 LRMEEMIFNLADTHLFFNDLEECDQVHIDDVSSDDNGQDLSTYSFATDGFHAAASSANLC
            420       430       440       450       460       470  

     420       430       440       450       460       470         
pF1KB9 LATGVRGGVDWMRKLAFRYRRVKEIYNTYKNNVGGLLGPAKREAWLQLRAEIEALTDSWL
       : ::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::::::::::.::::::
CCDS75 LPTGVRGGVDWMRKLAFRYRRVKELYNTYKNNVGGLLGPAKRDAWLQLRAEIEGLTDSWL
            480       490       500       510       520       530  

     480       490       500       510       520       530         
pF1KB9 TLALKALSLIHSRTNCVNILVTTTQLIPALAKVLLYGLGIVFPIENIYSATKIGKESCFE
       : :::.::.: .:.::.:.:::::::::::::::::.:: .:::::::::::::::::::
CCDS75 TNALKSLSIISTRSNCINVLVTTTQLIPALAKVLLYSLGGAFPIENIYSATKIGKESCFE
            540       550       560       570       580       590  

     540       550       560       570       580       590  
pF1KB9 RIIQRFGRKVVYVVIGDGVEEEQGAKKHAMPFWRISSHSDLMALHHALELEYL
       ::.::::::::::::::::::::.:::: ::::::::::::.:::.:::::::
CCDS75 RIMQRFGRKVVYVVIGDGVEEEQAAKKHNMPFWRISSHSDLLALHQALELEYL
            600       610       620       630       640     

>>CCDS43506.1 EYA4 gene_id:2070|Hs108|chr6                (616 aa)
 initn: 2236 init1: 1719 opt: 2428  Z-score: 1641.3  bits: 313.7 E(32554): 4.2e-85
Smith-Waterman score: 2839; 72.8% identity (90.0% similar) in 600 aa overlap (1-592:30-616)

                                            10        20        30 
pF1KB9                              MEMQDLTSPHSRLSGSSESPSGPKLGNSHIN
                                    ::::::.:::. : :....:.. :: .:...
CCDS43 MEDSQDLNEQSVKKTCTESDVSQSQNSRSMEMQDLASPHT-LVGGGDTPGSSKLEKSNLS
               10        20        30        40         50         

              40             50        60        70        80      
pF1KB9 SNSMTPNGT-----EVKTEPMSSSETASTTADGSLNNFSGSAIGSSSFSPRPTHQFSPPQ
       :.:.: :::      :::::..::::..::.::.:..:.::.: ::..::: .::.:: :
CCDS43 STSVTTNGTGVSLLAVKTEPLNSSETTATTGDGALDTFTGSVITSSGYSPRSAHQYSP-Q
      60        70        80        90       100       110         

         90       100        110       120       130         140   
pF1KB9 IYPSNRPYPHILPTPSSQTMAAY-GQTQFTTGMQQATAYATYPQPGQPYGISSY--GALW
       .::: .:::::: ::..:::.:: ::::.. :::: ..:..: : ::::.. .:  :.. 
CCDS43 LYPS-KPYPHILSTPAAQTMSAYAGQTQYS-GMQQPAVYTAYSQTGQPYSLPTYDLGVML
      120        130       140        150       160       170      

           150       160       170       180       190       200   
pF1KB9 AGIKTEGGLSQSQSPGQTGFLSYGTSFSTPQPGQAPYSYQMQGSSFTTSSGIYTGNNSLT
        .::::.::::.::: :.: :::. .::::::::.:::::: ::::. :: ::. :::..
CCDS43 PAIKTESGLSQTQSPLQSGCLSYSPGFSTPQPGQTPYSYQMPGSSFAPSSTIYA-NNSVS
        180       190       200       210       220       230      

           210       220       230       240       250       260   
pF1KB9 NSSGFNSSQQDYPSYPSFGQGQYAQYYNSSPYPAHYMTSSNTSPTTPSTNATYQLQEPPS
       ::..:..:::::::: .:::.::::::..: : : ::::.::.  :::...::::::   
CCDS43 NSTNFSGSQQDYPSYTAFGQNQYAQYYSASTYGA-YMTSNNTADGTPSSTSTYQLQESLP
         240       250       260        270       280       290    

           270       280       290       300       310       320   
pF1KB9 GITSQAVTDPTAEYSTIHSPSTPIKDSDSDRLRRGSDGKSRGRGRRNNNPSPPPDSDLER
       :.:.:    : .:..:..:::::::: : .:  :.: .:::::::.:: :::::::::::
CCDS43 GLTNQ----P-GEFDTMQSPSTPIKDLD-ERTCRSSGSKSRGRGRKNN-PSPPPDSDLER
              300        310        320       330        340       

           330       340       350       360       370       380   
pF1KB9 VFIWDLDETIIVFHSLLTGSYANRYGRDPPTSVSLGLRMEEMIFNLADTHLFFNDLEECD
       ::.:::::::::::::::::::..::.::: .:.::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VFVWDLDETIIVFHSLLTGSYAQKYGKDPPMAVTLGLRMEEMIFNLADTHLFFNDLEECD
       350       360       370       380       390       400       

           390       400       410       420       430       440   
pF1KB9 QVHIDDVSSDDNGQDLSTYNFGTDGFPAAATSANLCLATGVRGGVDWMRKLAFRYRRVKE
       :::::::::::::::::::.:.:::: :::.:::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS43 QVHIDDVSSDDNGQDLSTYSFATDGFHAAASSANLCLPTGVRGGVDWMRKLAFRYRRVKE
       410       420       430       440       450       460       

           450       460       470       480       490       500   
pF1KB9 IYNTYKNNVGGLLGPAKREAWLQLRAEIEALTDSWLTLALKALSLIHSRTNCVNILVTTT
       .:::::::::::::::::.::::::::::.::::::: :::.::.: .:.::.:.:::::
CCDS43 LYNTYKNNVGGLLGPAKRDAWLQLRAEIEGLTDSWLTNALKSLSIISTRSNCINVLVTTT
       470       480       490       500       510       520       

           510       520       530       540       550       560   
pF1KB9 QLIPALAKVLLYGLGIVFPIENIYSATKIGKESCFERIIQRFGRKVVYVVIGDGVEEEQG
       ::::::::::::.:: .:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::.
CCDS43 QLIPALAKVLLYSLGGAFPIENIYSATKIGKESCFERIMQRFGRKVVYVVIGDGVEEEQA
       530       540       550       560       570       580       

           570       580       590  
pF1KB9 AKKHAMPFWRISSHSDLMALHHALELEYL
       :::: ::::::::::::.:::.:::::::
CCDS43 AKKHNMPFWRISSHSDLLALHQALELEYL
       590       600       610      

>>CCDS5165.1 EYA4 gene_id:2070|Hs108|chr6                 (639 aa)
 initn: 2236 init1: 1719 opt: 2316  Z-score: 1566.1  bits: 299.9 E(32554): 6.5e-81
Smith-Waterman score: 2793; 70.1% identity (86.7% similar) in 623 aa overlap (1-592:30-639)

                                            10        20        30 
pF1KB9                              MEMQDLTSPHSRLSGSSESPSGPKLGNSHIN
                                    ::::::.:::. : :....:.. :: .:...
CCDS51 MEDSQDLNEQSVKKTCTESDVSQSQNSRSMEMQDLASPHT-LVGGGDTPGSSKLEKSNLS
               10        20        30        40         50         

              40                                    50        60   
pF1KB9 SNSMTPNGT----------------------------EVKTEPMSSSETASTTADGSLNN
       :.:.: :::                             :::::..::::..::.::.:..
CCDS51 STSVTTNGTGGENMTVLNTADWLLSCNTPSSATMSLLAVKTEPLNSSETTATTGDGALDT
      60        70        80        90       100       110         

            70        80        90       100        110       120  
pF1KB9 FSGSAIGSSSFSPRPTHQFSPPQIYPSNRPYPHILPTPSSQTMAAY-GQTQFTTGMQQAT
       :.::.: ::..::: .::.:: :.::: .:::::: ::..:::.:: ::::.. :::: .
CCDS51 FTGSVITSSGYSPRSAHQYSP-QLYPS-KPYPHILSTPAAQTMSAYAGQTQYS-GMQQPA
     120       130       140         150       160       170       

            130         140       150       160       170       180
pF1KB9 AYATYPQPGQPYGISSY--GALWAGIKTEGGLSQSQSPGQTGFLSYGTSFSTPQPGQAPY
       .:..: : ::::.. .:  :..  .::::.::::.::: :.: :::. .::::::::.::
CCDS51 VYTAYSQTGQPYSLPTYDLGVMLPAIKTESGLSQTQSPLQSGCLSYSPGFSTPQPGQTPY
        180       190       200       210       220       230      

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 SYQMQGSSFTTSSGIYTGNNSLTNSSGFNSSQQDYPSYPSFGQGQYAQYYNSSPYPAHYM
       :::: ::::. :: ::. :::..::..:..:::::::: .:::.::::::..: : : ::
CCDS51 SYQMPGSSFAPSSTIYA-NNSVSNSTNFSGSQQDYPSYTAFGQNQYAQYYSASTYGA-YM
        240       250        260       270       280       290     

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 TSSNTSPTTPSTNATYQLQEPPSGITSQAVTDPTAEYSTIHSPSTPIKDSDSDRLRRGSD
       ::.::.  :::...::::::   :.:.:    : .:..:..:::::::: : .:  :.: 
CCDS51 TSNNTADGTPSSTSTYQLQESLPGLTNQ----P-GEFDTMQSPSTPIKDLD-ERTCRSSG
          300       310       320            330       340         

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 GKSRGRGRRNNNPSPPPDSDLERVFIWDLDETIIVFHSLLTGSYANRYGRDPPTSVSLGL
       .:::::::.:: :::::::::::::.:::::::::::::::::::..::.::: .:.:::
CCDS51 SKSRGRGRKNN-PSPPPDSDLERVFVWDLDETIIVFHSLLTGSYAQKYGKDPPMAVTLGL
      350        360       370       380       390       400       

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 RMEEMIFNLADTHLFFNDLEECDQVHIDDVSSDDNGQDLSTYNFGTDGFPAAATSANLCL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::: :::.::::::
CCDS51 RMEEMIFNLADTHLFFNDLEECDQVHIDDVSSDDNGQDLSTYSFATDGFHAAASSANLCL
       410       420       430       440       450       460       

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 ATGVRGGVDWMRKLAFRYRRVKEIYNTYKNNVGGLLGPAKREAWLQLRAEIEALTDSWLT
        ::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::::::::::.:::::::
CCDS51 PTGVRGGVDWMRKLAFRYRRVKELYNTYKNNVGGLLGPAKRDAWLQLRAEIEGLTDSWLT
       470       480       490       500       510       520       

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 LALKALSLIHSRTNCVNILVTTTQLIPALAKVLLYGLGIVFPIENIYSATKIGKESCFER
        :::.::.: .:.::.:.:::::::::::::::::.:: .::::::::::::::::::::
CCDS51 NALKSLSIISTRSNCINVLVTTTQLIPALAKVLLYSLGGAFPIENIYSATKIGKESCFER
       530       540       550       560       570       580       

              550       560       570       580       590  
pF1KB9 IIQRFGRKVVYVVIGDGVEEEQGAKKHAMPFWRISSHSDLMALHHALELEYL
       :.::::::::::::::::::::.:::: ::::::::::::.:::.:::::::
CCDS51 IMQRFGRKVVYVVIGDGVEEEQAAKKHNMPFWRISSHSDLLALHQALELEYL
       590       600       610       620       630         

>>CCDS34907.1 EYA1 gene_id:2138|Hs108|chr8                (557 aa)
 initn: 3731 init1: 1398 opt: 2303  Z-score: 1558.3  bits: 298.2 E(32554): 1.8e-80
Smith-Waterman score: 3628; 94.1% identity (94.1% similar) in 592 aa overlap (1-592:1-557)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB9 MEMQDLTSPHSRLSGSSESPSGPKLGNSHINSNSMTPNGTEVKTEPMSSSETASTTADGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MEMQDLTSPHSRLSGSSESPSGPKLGNSHINSNSMTPNGTEVKTEPMSSSETASTTADGS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB9 LNNFSGSAIGSSSFSPRPTHQFSPPQIYPSNRPYPHILPTPSSQTMAAYGQTQFTTGMQQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LNNFSGSAIGSSSFSPRPTHQFSPPQIYPSNRPYPHILPTPSSQTMAAYGQTQFTTGMQQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB9 ATAYATYPQPGQPYGISSYGALWAGIKTEGGLSQSQSPGQTGFLSYGTSFSTPQPGQAPY
       ::::::::::::::::::::     :::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ATAYATYPQPGQPYGISSYG-----IKTEGGLSQSQSPGQTGFLSYGTSFSTPQPGQAPY
              130       140            150       160       170     

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 SYQMQGSSFTTSSGIYTGNNSLTNSSGFNSSQQDYPSYPSFGQGQYAQYYNSSPYPAHYM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SYQMQGSSFTTSSGIYTGNNSLTNSSGFNSSQQDYPSYPSFGQGQYAQYYNSSPYPAHYM
         180       190       200       210       220       230     

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 TSSNTSPTTPSTNATYQLQEPPSGITSQAVTDPTAEYSTIHSPSTPIKDSDSDRLRRGSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TSSNTSPTTPSTNATYQLQEPPSGITSQAVTDPTAEYSTIHSPSTPIKDSDSDRLRRGSD
         240       250       260       270       280       290     

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 GKSRGRGRRNNNPSPPPDSDLERVFIWDLDETIIVFHSLLTGSYANRYGRDPPTSVSLGL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::          
CCDS34 GKSRGRGRRNNNPSPPPDSDLERVFIWDLDETIIVFHSLLTGSYANRYGR----------
         300       310       320       330       340               

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 RMEEMIFNLADTHLFFNDLEECDQVHIDDVSSDDNGQDLSTYNFGTDGFPAAATSANLCL
                           ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 --------------------ECDQVHIDDVSSDDNGQDLSTYNFGTDGFPAAATSANLCL
                             350       360       370       380     

              430       440       450       460       470       480
pF1KB9 ATGVRGGVDWMRKLAFRYRRVKEIYNTYKNNVGGLLGPAKREAWLQLRAEIEALTDSWLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ATGVRGGVDWMRKLAFRYRRVKEIYNTYKNNVGGLLGPAKREAWLQLRAEIEALTDSWLT
         390       400       410       420       430       440     

              490       500       510       520       530       540
pF1KB9 LALKALSLIHSRTNCVNILVTTTQLIPALAKVLLYGLGIVFPIENIYSATKIGKESCFER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LALKALSLIHSRTNCVNILVTTTQLIPALAKVLLYGLGIVFPIENIYSATKIGKESCFER
         450       460       470       480       490       500     

              550       560       570       580       590  
pF1KB9 IIQRFGRKVVYVVIGDGVEEEQGAKKHAMPFWRISSHSDLMALHHALELEYL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IIQRFGRKVVYVVIGDGVEEEQGAKKHAMPFWRISSHSDLMALHHALELEYL
         510       520       530       540       550       

>>CCDS75523.1 EYA4 gene_id:2070|Hs108|chr6                (585 aa)
 initn: 2068 init1: 1666 opt: 2272  Z-score: 1537.2  bits: 294.4 E(32554): 2.7e-79
Smith-Waterman score: 2632; 69.1% identity (86.1% similar) in 595 aa overlap (1-592:30-585)

                                            10        20        30 
pF1KB9                              MEMQDLTSPHSRLSGSSESPSGPKLGNSHIN
                                    ::::::.:::. : :....:.. :: .:...
CCDS75 MEDSQDLNEQSVKKTCTESDVSQSQNSRSMEMQDLASPHT-LVGGGDTPGSSKLEKSNLS
               10        20        30        40         50         

              40        50        60        70        80        90 
pF1KB9 SNSMTPNGTEVKTEPMSSSETASTTADGSLNNFSGSAIGSSSFSPRPTHQFSPPQIYPSN
       :.:.: ::: :                          : ::..::: .::.:: :.::: 
CCDS75 STSVTTNGTGV--------------------------ITSSGYSPRSAHQYSP-QLYPS-
      60        70                                  80         90  

             100        110       120       130         140        
pF1KB9 RPYPHILPTPSSQTMAAY-GQTQFTTGMQQATAYATYPQPGQPYGISSY--GALWAGIKT
       .:::::: ::..:::.:: ::::.. :::: ..:..: : ::::.. .:  :..  .:::
CCDS75 KPYPHILSTPAAQTMSAYAGQTQYS-GMQQPAVYTAYSQTGQPYSLPTYDLGVMLPAIKT
             100       110        120       130       140       150

      150       160       170       180       190       200        
pF1KB9 EGGLSQSQSPGQTGFLSYGTSFSTPQPGQAPYSYQMQGSSFTTSSGIYTGNNSLTNSSGF
       :.::::.::: :.: :::. .::::::::.:::::: ::::. :: ::. :::..::..:
CCDS75 ESGLSQTQSPLQSGCLSYSPGFSTPQPGQTPYSYQMPGSSFAPSSTIYA-NNSVSNSTNF
              160       170       180       190        200         

      210       220       230       240       250       260        
pF1KB9 NSSQQDYPSYPSFGQGQYAQYYNSSPYPAHYMTSSNTSPTTPSTNATYQLQEPPSGITSQ
       ..:::::::: .:::.::::::..: : : ::::.::.  :::...::::::   :.:.:
CCDS75 SGSQQDYPSYTAFGQNQYAQYYSASTYGA-YMTSNNTADGTPSSTSTYQLQESLPGLTNQ
     210       220       230        240       250       260        

      270       280       290       300       310       320        
pF1KB9 AVTDPTAEYSTIHSPSTPIKDSDSDRLRRGSDGKSRGRGRRNNNPSPPPDSDLERVFIWD
           : .:..:..:::::::: : .:  :.: .:::::::.:: :::::::::::::.::
CCDS75 ----P-GEFDTMQSPSTPIKDLD-ERTCRSSGSKSRGRGRKNN-PSPPPDSDLERVFVWD
           270       280        290       300        310       320 

      330       340       350       360       370       380        
pF1KB9 LDETIIVFHSLLTGSYANRYGRDPPTSVSLGLRMEEMIFNLADTHLFFNDLEECDQVHID
       :::::::::::::::::..::.::: .:.:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LDETIIVFHSLLTGSYAQKYGKDPPMAVTLGLRMEEMIFNLADTHLFFNDLEECDQVHID
             330       340       350       360       370       380 

      390       400       410       420       430       440        
pF1KB9 DVSSDDNGQDLSTYNFGTDGFPAAATSANLCLATGVRGGVDWMRKLAFRYRRVKEIYNTY
       ::::::::::::::.:.:::: :::.:::::: ::::::::::::::::::::::.::::
CCDS75 DVSSDDNGQDLSTYSFATDGFHAAASSANLCLPTGVRGGVDWMRKLAFRYRRVKELYNTY
             390       400       410       420       430       440 

      450       460       470       480       490       500        
pF1KB9 KNNVGGLLGPAKREAWLQLRAEIEALTDSWLTLALKALSLIHSRTNCVNILVTTTQLIPA
       :::::::::::::.::::::::::.::::::: :::.::.: .:.::.:.::::::::::
CCDS75 KNNVGGLLGPAKRDAWLQLRAEIEGLTDSWLTNALKSLSIISTRSNCINVLVTTTQLIPA
             450       460       470       480       490       500 

      510       520       530       540       550       560        
pF1KB9 LAKVLLYGLGIVFPIENIYSATKIGKESCFERIIQRFGRKVVYVVIGDGVEEEQGAKKHA
       :::::::.:: .:::::::::::::::::::::..::: ...::::::: .::..:..: 
CCDS75 LAKVLLYSLGGAFPIENIYSATKIGKESCFERIVSRFGTNITYVVIGDGRDEEHAANQHN
             510       520       530       540       550       560 

      570       580       590  
pF1KB9 MPFWRISSHSDLMALHHALELEYL
       ::::::::::::.:::.:::::::
CCDS75 MPFWRISSHSDLLALHQALELEYL
             570       580     

>>CCDS5166.1 EYA4 gene_id:2070|Hs108|chr6                 (639 aa)
 initn: 2183 init1: 1666 opt: 2263  Z-score: 1530.6  bits: 293.3 E(32554): 6.2e-79
Smith-Waterman score: 2740; 68.5% identity (86.4% similar) in 623 aa overlap (1-592:30-639)

                                            10        20        30 
pF1KB9                              MEMQDLTSPHSRLSGSSESPSGPKLGNSHIN
                                    ::::::.:::. : :....:.. :: .:...
CCDS51 MEDSQDLNEQSVKKTCTESDVSQSQNSRSMEMQDLASPHT-LVGGGDTPGSSKLEKSNLS
               10        20        30        40         50         

              40                                    50        60   
pF1KB9 SNSMTPNGT----------------------------EVKTEPMSSSETASTTADGSLNN
       :.:.: :::                             :::::..::::..::.::.:..
CCDS51 STSVTTNGTGGENMTVLNTADWLLSCNTPSSATMSLLAVKTEPLNSSETTATTGDGALDT
      60        70        80        90       100       110         

            70        80        90       100        110       120  
pF1KB9 FSGSAIGSSSFSPRPTHQFSPPQIYPSNRPYPHILPTPSSQTMAAY-GQTQFTTGMQQAT
       :.::.: ::..::: .::.:: :.::: .:::::: ::..:::.:: ::::.. :::: .
CCDS51 FTGSVITSSGYSPRSAHQYSP-QLYPS-KPYPHILSTPAAQTMSAYAGQTQYS-GMQQPA
     120       130       140         150       160       170       

            130         140       150       160       170       180
pF1KB9 AYATYPQPGQPYGISSY--GALWAGIKTEGGLSQSQSPGQTGFLSYGTSFSTPQPGQAPY
       .:..: : ::::.. .:  :..  .::::.::::.::: :.: :::. .::::::::.::
CCDS51 VYTAYSQTGQPYSLPTYDLGVMLPAIKTESGLSQTQSPLQSGCLSYSPGFSTPQPGQTPY
        180       190       200       210       220       230      

              190       200       210       220       230       240
pF1KB9 SYQMQGSSFTTSSGIYTGNNSLTNSSGFNSSQQDYPSYPSFGQGQYAQYYNSSPYPAHYM
       :::: ::::. :: ::. :::..::..:..:::::::: .:::.::::::..: : : ::
CCDS51 SYQMPGSSFAPSSTIYA-NNSVSNSTNFSGSQQDYPSYTAFGQNQYAQYYSASTYGA-YM
        240       250        260       270       280       290     

              250       260       270       280       290       300
pF1KB9 TSSNTSPTTPSTNATYQLQEPPSGITSQAVTDPTAEYSTIHSPSTPIKDSDSDRLRRGSD
       ::.::.  :::...::::::   :.:.:    : .:..:..:::::::: : .:  :.: 
CCDS51 TSNNTADGTPSSTSTYQLQESLPGLTNQ----P-GEFDTMQSPSTPIKDLD-ERTCRSSG
          300       310       320            330       340         

              310       320       330       340       350       360
pF1KB9 GKSRGRGRRNNNPSPPPDSDLERVFIWDLDETIIVFHSLLTGSYANRYGRDPPTSVSLGL
       .:::::::.:: :::::::::::::.:::::::::::::::::::..::.::: .:.:::
CCDS51 SKSRGRGRKNN-PSPPPDSDLERVFVWDLDETIIVFHSLLTGSYAQKYGKDPPMAVTLGL
      350        360       370       380       390       400       

              370       380       390       400       410       420
pF1KB9 RMEEMIFNLADTHLFFNDLEECDQVHIDDVSSDDNGQDLSTYNFGTDGFPAAATSANLCL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::: :::.::::::
CCDS51 RMEEMIFNLADTHLFFNDLEECDQVHIDDVSSDDNGQDLSTYSFATDGFHAAASSANLCL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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