FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB9912, 592 aa 1>>>pF1KB9912 592 - 592 aa - 592 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.7568+/-0.0011; mu= -1.2867+/- 0.066 mean_var=223.3806+/-46.329, 0's: 0 Z-trim(110.9): 44 B-trim: 284 in 1/51 Lambda= 0.085813 statistics sampled from 11928 (11965) to 11928 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.713), E-opt: 0.2 (0.368), width: 16 Scan time: 3.570 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS34906.1 EYA1 gene_id:2138|Hs108|chr8 ( 592) 3955 502.8 5.1e-142 CCDS75750.1 EYA1 gene_id:2138|Hs108|chr8 ( 586) 3874 492.7 5.3e-139 CCDS47873.1 EYA1 gene_id:2138|Hs108|chr8 ( 559) 3683 469.1 6.6e-132 CCDS75521.1 EYA4 gene_id:2070|Hs108|chr6 ( 645) 2744 352.9 7.4e-97 CCDS43506.1 EYA4 gene_id:2070|Hs108|chr6 ( 616) 2428 313.7 4.2e-85 CCDS5165.1 EYA4 gene_id:2070|Hs108|chr6 ( 639) 2316 299.9 6.5e-81 CCDS34907.1 EYA1 gene_id:2138|Hs108|chr8 ( 557) 2303 298.2 1.8e-80 CCDS75523.1 EYA4 gene_id:2070|Hs108|chr6 ( 585) 2272 294.4 2.7e-79 CCDS5166.1 EYA4 gene_id:2070|Hs108|chr6 ( 639) 2263 293.3 6.2e-79 CCDS13403.1 EYA2 gene_id:2139|Hs108|chr20 ( 538) 2097 272.7 8.2e-73 CCDS316.1 EYA3 gene_id:2140|Hs108|chr1 ( 573) 1871 244.8 2.3e-64 CCDS60050.1 EYA3 gene_id:2140|Hs108|chr1 ( 520) 1861 243.5 5e-64 CCDS60051.1 EYA3 gene_id:2140|Hs108|chr1 ( 527) 1579 208.6 1.6e-53 CCDS60052.1 EYA3 gene_id:2140|Hs108|chr1 ( 536) 1443 191.8 1.9e-48 CCDS54471.1 EYA2 gene_id:2139|Hs108|chr20 ( 459) 1333 178.1 2.1e-44 >>CCDS34906.1 EYA1 gene_id:2138|Hs108|chr8 (592 aa) initn: 3955 init1: 3955 opt: 3955 Z-score: 2663.2 bits: 502.8 E(32554): 5.1e-142 Smith-Waterman score: 3955; 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CCDS75 MEDSQDLNEQSVKKTCTESDVSQSQNSRSMEMQDLASPHT-LVGGGDTPGSSKLEKSNLS 10 20 30 40 50 40 50 60 pF1KB9 SNSMTPNGT----------------------------EVKTEPMSSSETASTTADGSLNN :.:.: ::: :::::..::::..::.::.:.. CCDS75 STSVTTNGTGGENMTVLNTADWLLSCNTPSSATMSLLAVKTEPLNSSETTATTGDGALDT 60 70 80 90 100 110 70 80 90 100 110 120 pF1KB9 FSGSAIGSSSFSPRPTHQFSPPQIYPSNRPYPHILPTPSSQTMAAY-GQTQFTTGMQQAT :.::.: ::..::: .::.:: :.::: .:::::: ::..:::.:: ::::.. :::: . 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CCDS43 MEDSQDLNEQSVKKTCTESDVSQSQNSRSMEMQDLASPHT-LVGGGDTPGSSKLEKSNLS 10 20 30 40 50 40 50 60 70 80 pF1KB9 SNSMTPNGT-----EVKTEPMSSSETASTTADGSLNNFSGSAIGSSSFSPRPTHQFSPPQ :.:.: ::: :::::..::::..::.::.:..:.::.: ::..::: .::.:: : CCDS43 STSVTTNGTGVSLLAVKTEPLNSSETTATTGDGALDTFTGSVITSSGYSPRSAHQYSP-Q 60 70 80 90 100 110 90 100 110 120 130 140 pF1KB9 IYPSNRPYPHILPTPSSQTMAAY-GQTQFTTGMQQATAYATYPQPGQPYGISSY--GALW .::: .:::::: ::..:::.:: ::::.. :::: ..:..: : ::::.. .: :.. CCDS43 LYPS-KPYPHILSTPAAQTMSAYAGQTQYS-GMQQPAVYTAYSQTGQPYSLPTYDLGVML 120 130 140 150 160 170 150 160 170 180 190 200 pF1KB9 AGIKTEGGLSQSQSPGQTGFLSYGTSFSTPQPGQAPYSYQMQGSSFTTSSGIYTGNNSLT .::::.::::.::: :.: :::. .::::::::.:::::: ::::. :: ::. :::.. CCDS43 PAIKTESGLSQTQSPLQSGCLSYSPGFSTPQPGQTPYSYQMPGSSFAPSSTIYA-NNSVS 180 190 200 210 220 230 210 220 230 240 250 260 pF1KB9 NSSGFNSSQQDYPSYPSFGQGQYAQYYNSSPYPAHYMTSSNTSPTTPSTNATYQLQEPPS ::..:..:::::::: .:::.::::::..: : : ::::.::. :::...:::::: CCDS43 NSTNFSGSQQDYPSYTAFGQNQYAQYYSASTYGA-YMTSNNTADGTPSSTSTYQLQESLP 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 pF1KB9 GITSQAVTDPTAEYSTIHSPSTPIKDSDSDRLRRGSDGKSRGRGRRNNNPSPPPDSDLER :.:.: : .:..:..:::::::: : .: :.: .:::::::.:: ::::::::::: CCDS43 GLTNQ----P-GEFDTMQSPSTPIKDLD-ERTCRSSGSKSRGRGRKNN-PSPPPDSDLER 300 310 320 330 340 330 340 350 360 370 380 pF1KB9 VFIWDLDETIIVFHSLLTGSYANRYGRDPPTSVSLGLRMEEMIFNLADTHLFFNDLEECD ::.:::::::::::::::::::..::.::: .:.:::::::::::::::::::::::::: CCDS43 VFVWDLDETIIVFHSLLTGSYAQKYGKDPPMAVTLGLRMEEMIFNLADTHLFFNDLEECD 350 360 370 380 390 400 390 400 410 420 430 440 pF1KB9 QVHIDDVSSDDNGQDLSTYNFGTDGFPAAATSANLCLATGVRGGVDWMRKLAFRYRRVKE :::::::::::::::::::.:.:::: :::.:::::: :::::::::::::::::::::: CCDS43 QVHIDDVSSDDNGQDLSTYSFATDGFHAAASSANLCLPTGVRGGVDWMRKLAFRYRRVKE 410 420 430 440 450 460 450 460 470 480 490 500 pF1KB9 IYNTYKNNVGGLLGPAKREAWLQLRAEIEALTDSWLTLALKALSLIHSRTNCVNILVTTT .:::::::::::::::::.::::::::::.::::::: :::.::.: .:.::.:.::::: CCDS43 LYNTYKNNVGGLLGPAKRDAWLQLRAEIEGLTDSWLTNALKSLSIISTRSNCINVLVTTT 470 480 490 500 510 520 510 520 530 540 550 560 pF1KB9 QLIPALAKVLLYGLGIVFPIENIYSATKIGKESCFERIIQRFGRKVVYVVIGDGVEEEQG ::::::::::::.:: .:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::. CCDS43 QLIPALAKVLLYSLGGAFPIENIYSATKIGKESCFERIMQRFGRKVVYVVIGDGVEEEQA 530 540 550 560 570 580 570 580 590 pF1KB9 AKKHAMPFWRISSHSDLMALHHALELEYL :::: ::::::::::::.:::.::::::: CCDS43 AKKHNMPFWRISSHSDLLALHQALELEYL 590 600 610 >>CCDS5165.1 EYA4 gene_id:2070|Hs108|chr6 (639 aa) initn: 2236 init1: 1719 opt: 2316 Z-score: 1566.1 bits: 299.9 E(32554): 6.5e-81 Smith-Waterman score: 2793; 70.1% identity (86.7% similar) in 623 aa overlap (1-592:30-639) 10 20 30 pF1KB9 MEMQDLTSPHSRLSGSSESPSGPKLGNSHIN ::::::.:::. : :....:.. :: .:... CCDS51 MEDSQDLNEQSVKKTCTESDVSQSQNSRSMEMQDLASPHT-LVGGGDTPGSSKLEKSNLS 10 20 30 40 50 40 50 60 pF1KB9 SNSMTPNGT----------------------------EVKTEPMSSSETASTTADGSLNN :.:.: ::: :::::..::::..::.::.:.. CCDS51 STSVTTNGTGGENMTVLNTADWLLSCNTPSSATMSLLAVKTEPLNSSETTATTGDGALDT 60 70 80 90 100 110 70 80 90 100 110 120 pF1KB9 FSGSAIGSSSFSPRPTHQFSPPQIYPSNRPYPHILPTPSSQTMAAY-GQTQFTTGMQQAT :.::.: ::..::: .::.:: :.::: .:::::: ::..:::.:: ::::.. :::: . CCDS51 FTGSVITSSGYSPRSAHQYSP-QLYPS-KPYPHILSTPAAQTMSAYAGQTQYS-GMQQPA 120 130 140 150 160 170 130 140 150 160 170 180 pF1KB9 AYATYPQPGQPYGISSY--GALWAGIKTEGGLSQSQSPGQTGFLSYGTSFSTPQPGQAPY .:..: : ::::.. .: :.. .::::.::::.::: :.: :::. .::::::::.:: CCDS51 VYTAYSQTGQPYSLPTYDLGVMLPAIKTESGLSQTQSPLQSGCLSYSPGFSTPQPGQTPY 180 190 200 210 220 230 190 200 210 220 230 240 pF1KB9 SYQMQGSSFTTSSGIYTGNNSLTNSSGFNSSQQDYPSYPSFGQGQYAQYYNSSPYPAHYM :::: ::::. :: ::. :::..::..:..:::::::: .:::.::::::..: : : :: CCDS51 SYQMPGSSFAPSSTIYA-NNSVSNSTNFSGSQQDYPSYTAFGQNQYAQYYSASTYGA-YM 240 250 260 270 280 290 250 260 270 280 290 300 pF1KB9 TSSNTSPTTPSTNATYQLQEPPSGITSQAVTDPTAEYSTIHSPSTPIKDSDSDRLRRGSD ::.::. :::...:::::: :.:.: : .:..:..:::::::: : .: :.: CCDS51 TSNNTADGTPSSTSTYQLQESLPGLTNQ----P-GEFDTMQSPSTPIKDLD-ERTCRSSG 300 310 320 330 340 310 320 330 340 350 360 pF1KB9 GKSRGRGRRNNNPSPPPDSDLERVFIWDLDETIIVFHSLLTGSYANRYGRDPPTSVSLGL .:::::::.:: :::::::::::::.:::::::::::::::::::..::.::: .:.::: CCDS51 SKSRGRGRKNN-PSPPPDSDLERVFVWDLDETIIVFHSLLTGSYAQKYGKDPPMAVTLGL 350 360 370 380 390 400 370 380 390 400 410 420 pF1KB9 RMEEMIFNLADTHLFFNDLEECDQVHIDDVSSDDNGQDLSTYNFGTDGFPAAATSANLCL ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:::: :::.:::::: CCDS51 RMEEMIFNLADTHLFFNDLEECDQVHIDDVSSDDNGQDLSTYSFATDGFHAAASSANLCL 410 420 430 440 450 460 430 440 450 460 470 480 pF1KB9 ATGVRGGVDWMRKLAFRYRRVKEIYNTYKNNVGGLLGPAKREAWLQLRAEIEALTDSWLT ::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::::::::::.::::::: CCDS51 PTGVRGGVDWMRKLAFRYRRVKELYNTYKNNVGGLLGPAKRDAWLQLRAEIEGLTDSWLT 470 480 490 500 510 520 490 500 510 520 530 540 pF1KB9 LALKALSLIHSRTNCVNILVTTTQLIPALAKVLLYGLGIVFPIENIYSATKIGKESCFER :::.::.: .:.::.:.:::::::::::::::::.:: .:::::::::::::::::::: CCDS51 NALKSLSIISTRSNCINVLVTTTQLIPALAKVLLYSLGGAFPIENIYSATKIGKESCFER 530 540 550 560 570 580 550 560 570 580 590 pF1KB9 IIQRFGRKVVYVVIGDGVEEEQGAKKHAMPFWRISSHSDLMALHHALELEYL :.::::::::::::::::::::.:::: ::::::::::::.:::.::::::: CCDS51 IMQRFGRKVVYVVIGDGVEEEQAAKKHNMPFWRISSHSDLLALHQALELEYL 590 600 610 620 630 >>CCDS34907.1 EYA1 gene_id:2138|Hs108|chr8 (557 aa) initn: 3731 init1: 1398 opt: 2303 Z-score: 1558.3 bits: 298.2 E(32554): 1.8e-80 Smith-Waterman score: 3628; 94.1% identity (94.1% similar) in 592 aa overlap (1-592:1-557) 10 20 30 40 50 60 pF1KB9 MEMQDLTSPHSRLSGSSESPSGPKLGNSHINSNSMTPNGTEVKTEPMSSSETASTTADGS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 MEMQDLTSPHSRLSGSSESPSGPKLGNSHINSNSMTPNGTEVKTEPMSSSETASTTADGS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB9 LNNFSGSAIGSSSFSPRPTHQFSPPQIYPSNRPYPHILPTPSSQTMAAYGQTQFTTGMQQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 LNNFSGSAIGSSSFSPRPTHQFSPPQIYPSNRPYPHILPTPSSQTMAAYGQTQFTTGMQQ 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB9 ATAYATYPQPGQPYGISSYGALWAGIKTEGGLSQSQSPGQTGFLSYGTSFSTPQPGQAPY :::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 ATAYATYPQPGQPYGISSYG-----IKTEGGLSQSQSPGQTGFLSYGTSFSTPQPGQAPY 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KB9 SYQMQGSSFTTSSGIYTGNNSLTNSSGFNSSQQDYPSYPSFGQGQYAQYYNSSPYPAHYM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 SYQMQGSSFTTSSGIYTGNNSLTNSSGFNSSQQDYPSYPSFGQGQYAQYYNSSPYPAHYM 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KB9 TSSNTSPTTPSTNATYQLQEPPSGITSQAVTDPTAEYSTIHSPSTPIKDSDSDRLRRGSD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 TSSNTSPTTPSTNATYQLQEPPSGITSQAVTDPTAEYSTIHSPSTPIKDSDSDRLRRGSD 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KB9 GKSRGRGRRNNNPSPPPDSDLERVFIWDLDETIIVFHSLLTGSYANRYGRDPPTSVSLGL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 GKSRGRGRRNNNPSPPPDSDLERVFIWDLDETIIVFHSLLTGSYANRYGR---------- 300 310 320 330 340 370 380 390 400 410 420 pF1KB9 RMEEMIFNLADTHLFFNDLEECDQVHIDDVSSDDNGQDLSTYNFGTDGFPAAATSANLCL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 --------------------ECDQVHIDDVSSDDNGQDLSTYNFGTDGFPAAATSANLCL 350 360 370 380 430 440 450 460 470 480 pF1KB9 ATGVRGGVDWMRKLAFRYRRVKEIYNTYKNNVGGLLGPAKREAWLQLRAEIEALTDSWLT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 ATGVRGGVDWMRKLAFRYRRVKEIYNTYKNNVGGLLGPAKREAWLQLRAEIEALTDSWLT 390 400 410 420 430 440 490 500 510 520 530 540 pF1KB9 LALKALSLIHSRTNCVNILVTTTQLIPALAKVLLYGLGIVFPIENIYSATKIGKESCFER :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 LALKALSLIHSRTNCVNILVTTTQLIPALAKVLLYGLGIVFPIENIYSATKIGKESCFER 450 460 470 480 490 500 550 560 570 580 590 pF1KB9 IIQRFGRKVVYVVIGDGVEEEQGAKKHAMPFWRISSHSDLMALHHALELEYL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 IIQRFGRKVVYVVIGDGVEEEQGAKKHAMPFWRISSHSDLMALHHALELEYL 510 520 530 540 550 >>CCDS75523.1 EYA4 gene_id:2070|Hs108|chr6 (585 aa) initn: 2068 init1: 1666 opt: 2272 Z-score: 1537.2 bits: 294.4 E(32554): 2.7e-79 Smith-Waterman score: 2632; 69.1% identity (86.1% similar) in 595 aa overlap (1-592:30-585) 10 20 30 pF1KB9 MEMQDLTSPHSRLSGSSESPSGPKLGNSHIN ::::::.:::. : :....:.. :: .:... CCDS75 MEDSQDLNEQSVKKTCTESDVSQSQNSRSMEMQDLASPHT-LVGGGDTPGSSKLEKSNLS 10 20 30 40 50 40 50 60 70 80 90 pF1KB9 SNSMTPNGTEVKTEPMSSSETASTTADGSLNNFSGSAIGSSSFSPRPTHQFSPPQIYPSN :.:.: ::: : : ::..::: .::.:: :.::: CCDS75 STSVTTNGTGV--------------------------ITSSGYSPRSAHQYSP-QLYPS- 60 70 80 90 100 110 120 130 140 pF1KB9 RPYPHILPTPSSQTMAAY-GQTQFTTGMQQATAYATYPQPGQPYGISSY--GALWAGIKT .:::::: ::..:::.:: ::::.. :::: ..:..: : ::::.. .: :.. .::: CCDS75 KPYPHILSTPAAQTMSAYAGQTQYS-GMQQPAVYTAYSQTGQPYSLPTYDLGVMLPAIKT 100 110 120 130 140 150 150 160 170 180 190 200 pF1KB9 EGGLSQSQSPGQTGFLSYGTSFSTPQPGQAPYSYQMQGSSFTTSSGIYTGNNSLTNSSGF :.::::.::: :.: :::. .::::::::.:::::: ::::. :: ::. :::..::..: CCDS75 ESGLSQTQSPLQSGCLSYSPGFSTPQPGQTPYSYQMPGSSFAPSSTIYA-NNSVSNSTNF 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 pF1KB9 NSSQQDYPSYPSFGQGQYAQYYNSSPYPAHYMTSSNTSPTTPSTNATYQLQEPPSGITSQ ..:::::::: .:::.::::::..: : : ::::.::. :::...:::::: :.:.: CCDS75 SGSQQDYPSYTAFGQNQYAQYYSASTYGA-YMTSNNTADGTPSSTSTYQLQESLPGLTNQ 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KB9 AVTDPTAEYSTIHSPSTPIKDSDSDRLRRGSDGKSRGRGRRNNNPSPPPDSDLERVFIWD : .:..:..:::::::: : .: :.: .:::::::.:: :::::::::::::.:: CCDS75 ----P-GEFDTMQSPSTPIKDLD-ERTCRSSGSKSRGRGRKNN-PSPPPDSDLERVFVWD 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 pF1KB9 LDETIIVFHSLLTGSYANRYGRDPPTSVSLGLRMEEMIFNLADTHLFFNDLEECDQVHID :::::::::::::::::..::.::: .:.::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS75 LDETIIVFHSLLTGSYAQKYGKDPPMAVTLGLRMEEMIFNLADTHLFFNDLEECDQVHID 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KB9 DVSSDDNGQDLSTYNFGTDGFPAAATSANLCLATGVRGGVDWMRKLAFRYRRVKEIYNTY ::::::::::::::.:.:::: :::.:::::: ::::::::::::::::::::::.:::: CCDS75 DVSSDDNGQDLSTYSFATDGFHAAASSANLCLPTGVRGGVDWMRKLAFRYRRVKELYNTY 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 pF1KB9 KNNVGGLLGPAKREAWLQLRAEIEALTDSWLTLALKALSLIHSRTNCVNILVTTTQLIPA :::::::::::::.::::::::::.::::::: :::.::.: .:.::.:.:::::::::: CCDS75 KNNVGGLLGPAKRDAWLQLRAEIEGLTDSWLTNALKSLSIISTRSNCINVLVTTTQLIPA 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 pF1KB9 LAKVLLYGLGIVFPIENIYSATKIGKESCFERIIQRFGRKVVYVVIGDGVEEEQGAKKHA :::::::.:: .:::::::::::::::::::::..::: ...::::::: .::..:..: CCDS75 LAKVLLYSLGGAFPIENIYSATKIGKESCFERIVSRFGTNITYVVIGDGRDEEHAANQHN 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KB9 MPFWRISSHSDLMALHHALELEYL ::::::::::::.:::.::::::: CCDS75 MPFWRISSHSDLLALHQALELEYL 570 580 >>CCDS5166.1 EYA4 gene_id:2070|Hs108|chr6 (639 aa) initn: 2183 init1: 1666 opt: 2263 Z-score: 1530.6 bits: 293.3 E(32554): 6.2e-79 Smith-Waterman score: 2740; 68.5% identity (86.4% similar) in 623 aa overlap (1-592:30-639) 10 20 30 pF1KB9 MEMQDLTSPHSRLSGSSESPSGPKLGNSHIN ::::::.:::. : :....:.. :: .:... CCDS51 MEDSQDLNEQSVKKTCTESDVSQSQNSRSMEMQDLASPHT-LVGGGDTPGSSKLEKSNLS 10 20 30 40 50 40 50 60 pF1KB9 SNSMTPNGT----------------------------EVKTEPMSSSETASTTADGSLNN :.:.: ::: :::::..::::..::.::.:.. CCDS51 STSVTTNGTGGENMTVLNTADWLLSCNTPSSATMSLLAVKTEPLNSSETTATTGDGALDT 60 70 80 90 100 110 70 80 90 100 110 120 pF1KB9 FSGSAIGSSSFSPRPTHQFSPPQIYPSNRPYPHILPTPSSQTMAAY-GQTQFTTGMQQAT :.::.: ::..::: .::.:: :.::: .:::::: ::..:::.:: ::::.. :::: . 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