Result of FASTA (omim) for pFN21AE5063
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE5063, 517 aa
  1>>>pF1KE5063 517 - 517 aa - 517 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3670+/-0.000887; mu= 21.7393+/- 0.056
 mean_var=330.2933+/-67.893, 0's: 0 Z-trim(106.4): 2109  B-trim: 71 in 1/52
 Lambda= 0.070571
 statistics sampled from 12203 (14518) to 12203 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.428), E-opt: 0.2 (0.17), width:  16
 Scan time:  5.520

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_009070 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 is ( 517) 3644 386.8 8.4e-107
NP_689839 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 is ( 586) 3644 386.9 8.8e-107
NP_001274461 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 ( 554) 3603 382.7 1.5e-105
NP_001274463 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 ( 510) 3598 382.1 2.1e-105
NP_001274462 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 ( 510) 3598 382.1 2.1e-105
NP_001243102 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 ( 531) 2576 278.1 4.6e-74
NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 is ( 595) 2576 278.2 4.8e-74
XP_011526566 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 536) 2563 276.8 1.1e-73
NP_001243100 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 ( 625) 2561 276.7 1.4e-73
XP_011526565 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 640) 2561 276.7 1.4e-73
XP_016882723 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger ( 518) 2557 276.1 1.7e-73
NP_001265593 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 586) 2525 273.0 1.7e-72
XP_016883008 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 586) 2525 273.0 1.7e-72
XP_016883007 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 586) 2525 273.0 1.7e-72
XP_011526746 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2525 273.0 1.8e-72
XP_011526745 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2525 273.0 1.8e-72
XP_016883005 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2525 273.0 1.8e-72
NP_001265590 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 618) 2525 273.0 1.8e-72
NP_001265591 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 618) 2525 273.0 1.8e-72
XP_016883003 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2525 273.0 1.8e-72
NP_001265606 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 618) 2525 273.0 1.8e-72
XP_016883004 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 618) 2525 273.0 1.8e-72
NP_975011 (OMIM: 604768) zinc finger protein 254 i ( 659) 2525 273.1 1.8e-72
XP_011526750 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 574) 2499 270.3 1.1e-71
NP_001265607 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 574) 2499 270.3 1.1e-71
NP_001265592 (OMIM: 604768) zinc finger protein 25 ( 574) 2499 270.3 1.1e-71
XP_016883006 (OMIM: 604768) PREDICTED: zinc finger ( 607) 2499 270.4 1.1e-71
NP_112495 (OMIM: 603975) zinc finger protein 93 [H ( 620) 2499 270.4 1.1e-71
NP_001243580 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 2461 266.7 1.7e-70
NP_001243583 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 744) 2461 266.7 1.7e-70
XP_016882701 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2461 266.7 1.8e-70
XP_016882698 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2461 266.7 1.8e-70
XP_011526561 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2461 266.7 1.8e-70
XP_016882702 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2461 266.7 1.8e-70
NP_001243577 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2461 266.7 1.8e-70
XP_016882704 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2461 266.7 1.8e-70
XP_016882705 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2461 266.7 1.8e-70
XP_016882703 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2461 266.7 1.8e-70
XP_016882697 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2461 266.7 1.8e-70
XP_016882699 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2461 266.7 1.8e-70
NP_001243578 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2461 266.7 1.8e-70
XP_016882696 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2461 266.7 1.8e-70
NP_001243579 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 803) 2461 266.7 1.8e-70
XP_016882700 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2461 266.7 1.8e-70
XP_011526559 (OMIM: 603972) PREDICTED: zinc finger ( 803) 2461 266.7 1.8e-70
NP_003414 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 is ( 809) 2461 266.7 1.8e-70
NP_001243582 (OMIM: 603972) zinc finger protein 43 ( 818) 2461 266.8 1.8e-70
XP_016867773 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 2430 263.6 1.6e-69
NP_001013768 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 783) 2430 263.6 1.6e-69
XP_016867775 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 2430 263.6 1.6e-69


>>NP_009070 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 isofor  (517 aa)
 initn: 3644 init1: 3644 opt: 3644  Z-score: 2038.5  bits: 386.8 E(85289): 8.4e-107
Smith-Waterman score: 3644; 100.0% identity (100.0% similar) in 517 aa overlap (1-517:1-517)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MVDKTPVMCSHFAQDVWPEHSIKDSFQKVILRTYGKYGHENLQLRKDHKSVDACKVYKGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 MVDKTPVMCSHFAQDVWPEHSIKDSFQKVILRTYGKYGHENLQLRKDHKSVDACKVYKGG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 YNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVKVFHKFPNVNRNKIRHTGKKPFKCKNRGKSFCMLSQLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 YNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVKVFHKFPNVNRNKIRHTGKKPFKCKNRGKSFCMLSQLT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 QHKKIHTREYSYKCEECGKAFNWSSTLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 QHKKIHTREYSYKCEECGKAFNWSSTLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 IHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTKHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQFSILNKHKRIHME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 IHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTKHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQFSILNKHKRIHME
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 DKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKIIHTGEKPY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 DKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKIIHTGEKPY
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 KCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 KCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE5 CGKAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPYKCEECGKAFSVFSTLTKHKIIHTREKPYKCEECGKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 CGKAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPYKCEECGKAFSVFSTLTKHKIIHTREKPYKCEECGKA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE5 FNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEKCGNAFNQSSNLTARKIIYTGEKPYKYEECDKAFNKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 FNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEKCGNAFNQSSNLTARKIIYTGEKPYKYEECDKAFNKF
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       
pF1KE5 STLITHQIIYTGEKPCKHECGRAFNKSSNYTKEKLQT
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_009 STLITHQIIYTGEKPCKHECGRAFNKSSNYTKEKLQT
              490       500       510       

>>NP_689839 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 isofor  (586 aa)
 initn: 3644 init1: 3644 opt: 3644  Z-score: 2038.1  bits: 386.9 E(85289): 8.8e-107
Smith-Waterman score: 3644; 100.0% identity (100.0% similar) in 517 aa overlap (1-517:70-586)

                                             10        20        30
pF1KE5                               MVDKTPVMCSHFAQDVWPEHSIKDSFQKVI
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 LVFLGIAVSKPDLITWLEQGKEPWNLKRHEMVDKTPVMCSHFAQDVWPEHSIKDSFQKVI
      40        50        60        70        80        90         

               40        50        60        70        80        90
pF1KE5 LRTYGKYGHENLQLRKDHKSVDACKVYKGGYNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVKVFHKFPN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 LRTYGKYGHENLQLRKDHKSVDACKVYKGGYNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVKVFHKFPN
     100       110       120       130       140       150         

              100       110       120       130       140       150
pF1KE5 VNRNKIRHTGKKPFKCKNRGKSFCMLSQLTQHKKIHTREYSYKCEECGKAFNWSSTLTKH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 VNRNKIRHTGKKPFKCKNRGKSFCMLSQLTQHKKIHTREYSYKCEECGKAFNWSSTLTKH
     160       170       180       190       200       210         

              160       170       180       190       200       210
pF1KE5 KIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTKHKRIH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 KIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTKHKRIH
     220       230       240       250       260       270         

              220       230       240       250       260       270
pF1KE5 TEEKPYKCEECGKAFNQFSILNKHKRIHMEDKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKIIHTGEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 TEEKPYKCEECGKAFNQFSILNKHKRIHMEDKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKIIHTGEK
     280       290       300       310       320       330         

              280       290       300       310       320       330
pF1KE5 PYKCEECGKAFNQFSNLTKHKIIHTGEKPYKCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHTGEKPYKC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 PYKCEECGKAFNQFSNLTKHKIIHTGEKPYKCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHTGEKPYKC
     340       350       360       370       380       390         

              340       350       360       370       380       390
pF1KE5 EECGKAFKQSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEKCGKAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPYKCEECG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 EECGKAFKQSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEKCGKAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPYKCEECG
     400       410       420       430       440       450         

              400       410       420       430       440       450
pF1KE5 KAFSVFSTLTKHKIIHTREKPYKCEECGKAFNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEKCGNAFN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 KAFSVFSTLTKHKIIHTREKPYKCEECGKAFNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEKCGNAFN
     460       470       480       490       500       510         

              460       470       480       490       500       510
pF1KE5 QSSNLTARKIIYTGEKPYKYEECDKAFNKFSTLITHQIIYTGEKPCKHECGRAFNKSSNY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 QSSNLTARKIIYTGEKPYKYEECDKAFNKFSTLITHQIIYTGEKPCKHECGRAFNKSSNY
     520       530       540       550       560       570         

              
pF1KE5 TKEKLQT
       :::::::
NP_689 TKEKLQT
     580      

>>NP_001274461 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 iso  (554 aa)
 initn: 3603 init1: 3603 opt: 3603  Z-score: 2015.7  bits: 382.7 E(85289): 1.5e-105
Smith-Waterman score: 3603; 100.0% identity (100.0% similar) in 511 aa overlap (7-517:44-554)

                                       10        20        30      
pF1KE5                         MVDKTPVMCSHFAQDVWPEHSIKDSFQKVILRTYGK
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SLEEWQCLDTAQRNLYRDVMLENYRNLVFLVMCSHFAQDVWPEHSIKDSFQKVILRTYGK
            20        30        40        50        60        70   

         40        50        60        70        80        90      
pF1KE5 YGHENLQLRKDHKSVDACKVYKGGYNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVKVFHKFPNVNRNKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YGHENLQLRKDHKSVDACKVYKGGYNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVKVFHKFPNVNRNKI
            80        90       100       110       120       130   

        100       110       120       130       140       150      
pF1KE5 RHTGKKPFKCKNRGKSFCMLSQLTQHKKIHTREYSYKCEECGKAFNWSSTLTKHKIIHTG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RHTGKKPFKCKNRGKSFCMLSQLTQHKKIHTREYSYKCEECGKAFNWSSTLTKHKIIHTG
           140       150       160       170       180       190   

        160       170       180       190       200       210      
pF1KE5 EKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTKHKRIHTEEKPY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTKHKRIHTEEKPY
           200       210       220       230       240       250   

        220       230       240       250       260       270      
pF1KE5 KCEECGKAFNQFSILNKHKRIHMEDKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKIIHTGEKPYKCEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KCEECGKAFNQFSILNKHKRIHMEDKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKIIHTGEKPYKCEE
           260       270       280       290       300       310   

        280       290       300       310       320       330      
pF1KE5 CGKAFNQFSNLTKHKIIHTGEKPYKCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CGKAFNQFSNLTKHKIIHTGEKPYKCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKA
           320       330       340       350       360       370   

        340       350       360       370       380       390      
pF1KE5 FKQSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEKCGKAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPYKCEECGKAFSVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FKQSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEKCGKAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPYKCEECGKAFSVF
           380       390       400       410       420       430   

        400       410       420       430       440       450      
pF1KE5 STLTKHKIIHTREKPYKCEECGKAFNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEKCGNAFNQSSNLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 STLTKHKIIHTREKPYKCEECGKAFNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEKCGNAFNQSSNLT
           440       450       460       470       480       490   

        460       470       480       490       500       510      
pF1KE5 ARKIIYTGEKPYKYEECDKAFNKFSTLITHQIIYTGEKPCKHECGRAFNKSSNYTKEKLQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ARKIIYTGEKPYKYEECDKAFNKFSTLITHQIIYTGEKPCKHECGRAFNKSSNYTKEKLQ
           500       510       520       530       540       550   

        
pF1KE5 T
       :
NP_001 T
        

>>NP_001274463 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 iso  (510 aa)
 initn: 3598 init1: 3598 opt: 3598  Z-score: 2013.2  bits: 382.1 E(85289): 2.1e-105
Smith-Waterman score: 3598; 100.0% identity (100.0% similar) in 510 aa overlap (8-517:1-510)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MVDKTPVMCSHFAQDVWPEHSIKDSFQKVILRTYGKYGHENLQLRKDHKSVDACKVYKGG
              :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001        MCSHFAQDVWPEHSIKDSFQKVILRTYGKYGHENLQLRKDHKSVDACKVYKGG
                      10        20        30        40        50   

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 YNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVKVFHKFPNVNRNKIRHTGKKPFKCKNRGKSFCMLSQLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVKVFHKFPNVNRNKIRHTGKKPFKCKNRGKSFCMLSQLT
            60        70        80        90       100       110   

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 QHKKIHTREYSYKCEECGKAFNWSSTLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QHKKIHTREYSYKCEECGKAFNWSSTLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKI
           120       130       140       150       160       170   

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 IHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTKHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQFSILNKHKRIHME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTKHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQFSILNKHKRIHME
           180       190       200       210       220       230   

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 DKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKIIHTGEKPY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKIIHTGEKPY
           240       250       260       270       280       290   

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 KCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEK
           300       310       320       330       340       350   

              370       380       390       400       410       420
pF1KE5 CGKAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPYKCEECGKAFSVFSTLTKHKIIHTREKPYKCEECGKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CGKAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPYKCEECGKAFSVFSTLTKHKIIHTREKPYKCEECGKA
           360       370       380       390       400       410   

              430       440       450       460       470       480
pF1KE5 FNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEKCGNAFNQSSNLTARKIIYTGEKPYKYEECDKAFNKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEKCGNAFNQSSNLTARKIIYTGEKPYKYEECDKAFNKF
           420       430       440       450       460       470   

              490       500       510       
pF1KE5 STLITHQIIYTGEKPCKHECGRAFNKSSNYTKEKLQT
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 STLITHQIIYTGEKPCKHECGRAFNKSSNYTKEKLQT
           480       490       500       510

>>NP_001274462 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 iso  (510 aa)
 initn: 3598 init1: 3598 opt: 3598  Z-score: 2013.2  bits: 382.1 E(85289): 2.1e-105
Smith-Waterman score: 3598; 100.0% identity (100.0% similar) in 510 aa overlap (8-517:1-510)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE5 MVDKTPVMCSHFAQDVWPEHSIKDSFQKVILRTYGKYGHENLQLRKDHKSVDACKVYKGG
              :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001        MCSHFAQDVWPEHSIKDSFQKVILRTYGKYGHENLQLRKDHKSVDACKVYKGG
                      10        20        30        40        50   

               70        80        90       100       110       120
pF1KE5 YNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVKVFHKFPNVNRNKIRHTGKKPFKCKNRGKSFCMLSQLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVKVFHKFPNVNRNKIRHTGKKPFKCKNRGKSFCMLSQLT
            60        70        80        90       100       110   

              130       140       150       160       170       180
pF1KE5 QHKKIHTREYSYKCEECGKAFNWSSTLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QHKKIHTREYSYKCEECGKAFNWSSTLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKI
           120       130       140       150       160       170   

              190       200       210       220       230       240
pF1KE5 IHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTKHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQFSILNKHKRIHME
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTKHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQFSILNKHKRIHME
           180       190       200       210       220       230   

              250       260       270       280       290       300
pF1KE5 DKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKIIHTGEKPY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKIIHTGEKPY
           240       250       260       270       280       290   

              310       320       330       340       350       360
pF1KE5 KCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEK
           300       310       320       330       340       350   

              370       380       390       400       410       420
pF1KE5 CGKAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPYKCEECGKAFSVFSTLTKHKIIHTREKPYKCEECGKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CGKAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPYKCEECGKAFSVFSTLTKHKIIHTREKPYKCEECGKA
           360       370       380       390       400       410   

              430       440       450       460       470       480
pF1KE5 FNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEKCGNAFNQSSNLTARKIIYTGEKPYKYEECDKAFNKF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEKCGNAFNQSSNLTARKIIYTGEKPYKYEECDKAFNKF
           420       430       440       450       460       470   

              490       500       510       
pF1KE5 STLITHQIIYTGEKPCKHECGRAFNKSSNYTKEKLQT
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 STLITHQIIYTGEKPCKHECGRAFNKSSNYTKEKLQT
           480       490       500       510

>>NP_001243102 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 iso  (531 aa)
 initn: 4338 init1: 2535 opt: 2576  Z-score: 1450.7  bits: 278.1 E(85289): 4.6e-74
Smith-Waterman score: 2576; 71.7% identity (84.9% similar) in 516 aa overlap (1-515:7-522)

                     10        20        30        40        50    
pF1KE5       MVDKTPVMCSHFAQDVWPEHSIKDSFQKVILRTYGKYGHENLQLRKDHKSVDAC
             :: :  :::::::::.:::..:::::::: :. :::  :::: :::  .:.: :
NP_001 MKRHEIMVAKPTVMCSHFAQDLWPEQNIKDSFQKVTLKRYGKCRHENLPLRKGCESMDEC
               10        20        30        40        50        60

           60        70        80        90       100       110    
pF1KE5 KVYKGGYNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVKVFHKFPNVNRNKIRHTGKKPFKCKNRGKSFC
       :..::: ::::::::.:.:::::::::::: ::: : ::..:::: :::::: . :::: 
NP_001 KMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKVAHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCTKCGKSFG
               70        80        90       100       110       120

          120       130       140       150       160       170    
pF1KE5 MLSQLTQHKKIHTREYSYKCEECGKAFNWSSTLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSN
       :.: ::.:..::::   :::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::.:::
NP_001 MISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSN
              130       140       150       160       170       180

          180       190       200       210       220       230    
pF1KE5 LTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTKHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQFSILNKH
       : ::: :::::::::::::::.::: :::: :: ::: ::::::.:::::::. : :. :
NP_001 LIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTH
              190       200       210       220       230       240

          240       250       260       270       280       290    
pF1KE5 KRIHMEDKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQFSNLTKHKIIH
       ..::  .::::::::::::.  : :  :::::::::::::..::::::: ..:: :..::
NP_001 RKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIH
              250       260       270       280       290       300

          300       310       320       330       340       350    
pF1KE5 TGEKPYKCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTEHKIIHTGEK
       ::::::::..::::::. : :: :: ::::::::::.:::::::.:::::.:::::::::
NP_001 TGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEK
              310       320       330       340       350       360

          360       370       380       390       400       410    
pF1KE5 PYKCEKCGKAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPYKCEECGKAFSVFSTLTKHKIIHTREKPYKC
       ::::..: :::. :: .:.::. :  .:::.::.:::::.  :.::.::  ::.::::::
NP_001 PYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKC
              370       380       390       400       410       420

          420       430       440       450       460       470    
pF1KE5 EECGKAFNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEKCGNAFNQSSNLTARKIIYTGEKPYKYEECD
       :::::.:.  : .: ::::::  : ::::.::.::::::.:: .: :.::::::  ::: 
NP_001 EECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECG
              430       440       450       460       470       480

          480       490        500       510              
pF1KE5 KAFNKFSTLITHQIIYTGEKPCK-HECGRAFNKSSNYTKEKLQT       
       ::::. :.:  :. :.::::: : .:: .::. ::  ::.:.         
NP_001 KAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI
              490       500       510       520       530 

>>NP_003420 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 isofor  (595 aa)
 initn: 4338 init1: 2535 opt: 2576  Z-score: 1450.4  bits: 278.2 E(85289): 4.8e-74
Smith-Waterman score: 2576; 71.7% identity (84.9% similar) in 516 aa overlap (1-515:71-586)

                                             10        20        30
pF1KE5                               MVDKTPVMCSHFAQDVWPEHSIKDSFQKVI
                                     :: :  :::::::::.:::..:::::::: 
NP_003 VFLGITVSKPDLITCLEQGKEAWSMKRHEIMVAKPTVMCSHFAQDLWPEQNIKDSFQKVT
               50        60        70        80        90       100

               40        50        60        70        80        90
pF1KE5 LRTYGKYGHENLQLRKDHKSVDACKVYKGGYNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVKVFHKFPN
       :. :::  :::: :::  .:.: ::..::: ::::::::.:.:::::::::::: ::: :
NP_003 LKRYGKCRHENLPLRKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKVAHKFSN
              110       120       130       140       150       160

              100       110       120       130       140       150
pF1KE5 VNRNKIRHTGKKPFKCKNRGKSFCMLSQLTQHKKIHTREYSYKCEECGKAFNWSSTLTKH
        ::..:::: :::::: . :::: :.: ::.:..::::   :::::::::::::::::::
NP_003 SNRHEIRHTKKKPFKCTKCGKSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTLTKH
              170       180       190       200       210       220

              160       170       180       190       200       210
pF1KE5 KIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTKHKRIH
       : ::::::::::::::::::.:::: ::: :::::::::::::::.::: :::: :: ::
NP_003 KRIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTLTTHKIIH
              230       240       250       260       270       280

              220       230       240       250       260       270
pF1KE5 TEEKPYKCEECGKAFNQFSILNKHKRIHMEDKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKIIHTGEK
       : ::::::.:::::::. : :. :..::  .::::::::::::.  : :  :::::::::
NP_003 TGEKPYKCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEK
              290       300       310       320       330       340

              280       290       300       310       320       330
pF1KE5 PYKCEECGKAFNQFSNLTKHKIIHTGEKPYKCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHTGEKPYKC
       ::::..::::::: ..:: :..::::::::::..::::::. : :: :: ::::::::::
NP_003 PYKCKKCGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKC
              350       360       370       380       390       400

              340       350       360       370       380       390
pF1KE5 EECGKAFKQSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEKCGKAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPYKCEECG
       .:::::::.:::::.:::::::::::::..: :::. :: .:.::. :  .:::.::.::
NP_003 KECGKAFKHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCG
              410       420       430       440       450       460

              400       410       420       430       440       450
pF1KE5 KAFSVFSTLTKHKIIHTREKPYKCEECGKAFNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEKCGNAFN
       :::.  :.::.::  ::.:::::::::::.:.  : .: ::::::  : ::::.::.:::
NP_003 KAFNQSSNLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFN
              470       480       490       500       510       520

              460       470       480       490        500         
pF1KE5 QSSNLTARKIIYTGEKPYKYEECDKAFNKFSTLITHQIIYTGEKPCK-HECGRAFNKSSN
       :::.:: .: :.::::::  ::: ::::. :.:  :. :.::::: : .:: .::. :: 
NP_003 QSSKLTKHKKIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSV
              530       540       550       560       570       580

     510              
pF1KE5 YTKEKLQT       
        ::.:.         
NP_003 LTKHKIIHTGEKLQI
              590     

>>XP_011526566 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger pro  (536 aa)
 initn: 4324 init1: 2521 opt: 2563  Z-score: 1443.5  bits: 276.8 E(85289): 1.1e-73
Smith-Waterman score: 2563; 71.7% identity (85.2% similar) in 512 aa overlap (5-515:16-527)

                          10        20        30        40         
pF1KE5            MVDKTPVMCSHFAQDVWPEHSIKDSFQKVILRTYGKYGHENLQLRKDHK
                      . :::::::::.:::..:::::::: :. :::  :::: :::  .
XP_011 MSLSAQPSSSFYKPVSEVMCSHFAQDLWPEQNIKDSFQKVTLKRYGKCRHENLPLRKGCE
               10        20        30        40        50        60

      50        60        70        80        90       100         
pF1KE5 SVDACKVYKGGYNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVKVFHKFPNVNRNKIRHTGKKPFKCKNR
       :.: ::..::: ::::::::.:.:::::::::::: ::: : ::..:::: :::::: . 
XP_011 SMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKVAHKFSNSNRHEIRHTKKKPFKCTKC
               70        80        90       100       110       120

     110       120       130       140       150       160         
pF1KE5 GKSFCMLSQLTQHKKIHTREYSYKCEECGKAFNWSSTLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAF
       :::: :.: ::.:..::::   :::::::::::::::::::: :::::::::::::::::
XP_011 GKSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAF
              130       140       150       160       170       180

     170       180       190       200       210       220         
pF1KE5 NRSSNLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTKHKRIHTEEKPYKCEECGKAFNQFS
       :.:::: ::: :::::::::::::::.::: :::: :: ::: ::::::.:::::::. :
XP_011 NQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFNRSS
              190       200       210       220       230       240

     230       240       250       260       270       280         
pF1KE5 ILNKHKRIHMEDKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQFSNLTK
        :. :..::  .::::::::::::.  : :  :::::::::::::..::::::: ..:: 
XP_011 TLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKKCGKAFNQSAHLTT
              250       260       270       280       290       300

     290       300       310       320       330       340         
pF1KE5 HKIIHTGEKPYKCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSTLTEHKII
       :..::::::::::..::::::. : :: :: ::::::::::.:::::::.:::::.::::
XP_011 HEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKAFKHSSTLTKHKII
              310       320       330       340       350       360

     350       360       370       380       390       400         
pF1KE5 HTGEKPYKCEKCGKAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPYKCEECGKAFSVFSTLTKHKIIHTRE
       :::::::::..: :::. :: .:.::. :  .:::.::.:::::.  :.::.::  ::.:
XP_011 HTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQSSNLTRHKKSHTEE
              370       380       390       400       410       420

     410       420       430       440       450       460         
pF1KE5 KPYKCEECGKAFNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEKCGNAFNQSSNLTARKIIYTGEKPYK
       ::::::::::.:.  : .: ::::::  : ::::.::.::::::.:: .: :.:::::: 
XP_011 KPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLTKHKKIHTGEKPYT
              430       440       450       460       470       480

     470       480       490        500       510              
pF1KE5 YEECDKAFNKFSTLITHQIIYTGEKPCK-HECGRAFNKSSNYTKEKLQT       
        ::: ::::. :.:  :. :.::::: : .:: .::. ::  ::.:.         
XP_011 CEECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKIIHTGEKLQI
              490       500       510       520       530      

>>NP_001243100 (OMIM: 603899) zinc finger protein 85 iso  (625 aa)
 initn: 4319 init1: 2516 opt: 2561  Z-score: 1442.0  bits: 276.7 E(85289): 1.4e-73
Smith-Waterman score: 2561; 71.8% identity (85.3% similar) in 510 aa overlap (7-515:107-616)

                                       10        20        30      
pF1KE5                         MVDKTPVMCSHFAQDVWPEHSIKDSFQKVILRTYGK
                                     .::::::::.:::..:::::::: :. :::
NP_001 GCLSKRMSYELLRKVYILMLLRSVLYASVRIMCSHFAQDLWPEQNIKDSFQKVTLKRYGK
         80        90       100       110       120       130      

         40        50        60        70        80        90      
pF1KE5 YGHENLQLRKDHKSVDACKVYKGGYNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVKVFHKFPNVNRNKI
         :::: :::  .:.: ::..::: ::::::::.:.:::::::::::: ::: : ::..:
NP_001 CRHENLPLRKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKVAHKFSNSNRHEI
        140       150       160       170       180       190      

        100       110       120       130       140       150      
pF1KE5 RHTGKKPFKCKNRGKSFCMLSQLTQHKKIHTREYSYKCEECGKAFNWSSTLTKHKIIHTG
       ::: :::::: . :::: :.: ::.:..::::   :::::::::::::::::::: ::::
NP_001 RHTKKKPFKCTKCGKSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTLTKHKRIHTG
        200       210       220       230       240       250      

        160       170       180       190       200       210      
pF1KE5 EKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTKHKRIHTEEKPY
       ::::::::::::::.:::: ::: :::::::::::::::.::: :::: :: ::: ::::
NP_001 EKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTLTTHKIIHTGEKPY
        260       270       280       290       300       310      

        220       230       240       250       260       270      
pF1KE5 KCEECGKAFNQFSILNKHKRIHMEDKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKIIHTGEKPYKCEE
       ::.:::::::. : :. :..::  .::::::::::::.  : :  :::::::::::::..
NP_001 KCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKK
        320       330       340       350       360       370      

        280       290       300       310       320       330      
pF1KE5 CGKAFNQFSNLTKHKIIHTGEKPYKCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKA
       ::::::: ..:: :..::::::::::..::::::. : :: :: ::::::::::.:::::
NP_001 CGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKA
        380       390       400       410       420       430      

        340       350       360       370       380       390      
pF1KE5 FKQSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEKCGKAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPYKCEECGKAFSVF
       ::.:::::.:::::::::::::..: :::. :: .:.::. :  .:::.::.:::::.  
NP_001 FKHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQS
        440       450       460       470       480       490      

        400       410       420       430       440       450      
pF1KE5 STLTKHKIIHTREKPYKCEECGKAFNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEKCGNAFNQSSNLT
       :.::.::  ::.:::::::::::.:.  : .: ::::::  : ::::.::.::::::.::
NP_001 SNLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLT
        500       510       520       530       540       550      

        460       470       480       490        500       510     
pF1KE5 ARKIIYTGEKPYKYEECDKAFNKFSTLITHQIIYTGEKPCK-HECGRAFNKSSNYTKEKL
        .: :.::::::  ::: ::::. :.:  :. :.::::: : .:: .::. ::  ::.:.
NP_001 KHKKIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKI
        560       570       580       590       600       610      

                
pF1KE5 QT       
                
NP_001 IHTGEKLQI
        620     

>>XP_011526565 (OMIM: 603899) PREDICTED: zinc finger pro  (640 aa)
 initn: 4319 init1: 2516 opt: 2561  Z-score: 1441.9  bits: 276.7 E(85289): 1.4e-73
Smith-Waterman score: 2561; 71.8% identity (85.3% similar) in 510 aa overlap (7-515:122-631)

                                       10        20        30      
pF1KE5                         MVDKTPVMCSHFAQDVWPEHSIKDSFQKVILRTYGK
                                     .::::::::.:::..:::::::: :. :::
XP_011 SCLSKRMSYELLRKVYILMLLRSVLYASVRIMCSHFAQDLWPEQNIKDSFQKVTLKRYGK
             100       110       120       130       140       150 

         40        50        60        70        80        90      
pF1KE5 YGHENLQLRKDHKSVDACKVYKGGYNGLNQCLTTTDSKIFQCDKYVKVFHKFPNVNRNKI
         :::: :::  .:.: ::..::: ::::::::.:.:::::::::::: ::: : ::..:
XP_011 CRHENLPLRKGCESMDECKMHKGGCNGLNQCLTATQSKIFQCDKYVKVAHKFSNSNRHEI
             160       170       180       190       200       210 

        100       110       120       130       140       150      
pF1KE5 RHTGKKPFKCKNRGKSFCMLSQLTQHKKIHTREYSYKCEECGKAFNWSSTLTKHKIIHTG
       ::: :::::: . :::: :.: ::.:..::::   :::::::::::::::::::: ::::
XP_011 RHTKKKPFKCTKCGKSFGMISCLTEHSRIHTRVNFYKCEECGKAFNWSSTLTKHKRIHTG
             220       230       240       250       260       270 

        160       170       180       190       200       210      
pF1KE5 EKPYKCEECGKAFNRSSNLTKHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNRSSTLTKHKRIHTEEKPY
       ::::::::::::::.:::: ::: :::::::::::::::.::: :::: :: ::: ::::
XP_011 EKPYKCEECGKAFNQSSNLIKHKKIHTGEKPYKCEECGKTFNRFSTLTTHKIIHTGEKPY
             280       290       300       310       320       330 

        220       230       240       250       260       270      
pF1KE5 KCEECGKAFNQFSILNKHKRIHMEDKPYKCEECGKAFRVFSILKKHKIIHTGEKPYKCEE
       ::.:::::::. : :. :..::  .::::::::::::.  : :  :::::::::::::..
XP_011 KCKECGKAFNRSSTLTTHRKIHTGEKPYKCEECGKAFKQSSNLTTHKIIHTGEKPYKCKK
             340       350       360       370       380       390 

        280       290       300       310       320       330      
pF1KE5 CGKAFNQFSNLTKHKIIHTGEKPYKCDECGKAFNQSSTLTKHKRIHTGEKPYKCEECGKA
       ::::::: ..:: :..::::::::::..::::::. : :: :: ::::::::::.:::::
XP_011 CGKAFNQSAHLTTHEVIHTGEKPYKCEKCGKAFNHFSHLTTHKIIHTGEKPYKCKECGKA
             400       410       420       430       440       450 

        340       350       360       370       380       390      
pF1KE5 FKQSSTLTEHKIIHTGEKPYKCEKCGKAFSWSSAFTKHKRNHMEDKPYKCEECGKAFSVF
       ::.:::::.:::::::::::::..: :::. :: .:.::. :  .:::.::.:::::.  
XP_011 FKHSSTLTKHKIIHTGEKPYKCKECEKAFNQSSKLTEHKKIHTGEKPYECEKCGKAFNQS
             460       470       480       490       500       510 

        400       410       420       430       440       450      
pF1KE5 STLTKHKIIHTREKPYKCEECGKAFNQSSIFTKHKIIHTEGKSYKCEKCGNAFNQSSNLT
       :.::.::  ::.:::::::::::.:.  : .: ::::::  : ::::.::.::::::.::
XP_011 SNLTRHKKSHTEEKPYKCEECGKGFKWPSTLTIHKIIHTGEKPYKCEECGKAFNQSSKLT
             520       530       540       550       560       570 

        460       470       480       490        500       510     
pF1KE5 ARKIIYTGEKPYKYEECDKAFNKFSTLITHQIIYTGEKPCK-HECGRAFNKSSNYTKEKL
        .: :.::::::  ::: ::::. :.:  :. :.::::: : .:: .::. ::  ::.:.
XP_011 KHKKIHTGEKPYTCEECGKAFNQSSNLTKHKRIHTGEKPYKCEECDKAFKWSSVLTKHKI
             580       590       600       610       620       630 

                
pF1KE5 QT       
                
XP_011 IHTGEKLQI
             640




517 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Tue Nov  8 04:40:29 2016 done: Tue Nov  8 04:40:30 2016
 Total Scan time:  5.520 Total Display time:  0.110

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com