FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6382, 327 aa 1>>>pF1KE6382 327 - 327 aa - 327 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6400+/-0.000866; mu= 13.6537+/- 0.052 mean_var=61.5190+/-12.160, 0's: 0 Z-trim(105.8): 30 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.163520 statistics sampled from 8614 (8641) to 8614 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.652), E-opt: 0.2 (0.265), width: 16 Scan time: 1.920 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS34525.1 CLVS2 gene_id:134829|Hs108|chr6 ( 327) 2187 524.5 4.6e-149 CCDS6176.1 CLVS1 gene_id:157807|Hs108|chr8 ( 354) 1789 430.6 9.1e-121 CCDS32324.1 RLBP1 gene_id:6017|Hs108|chr15 ( 317) 670 166.6 2.4e-41 CCDS13332.2 TTPAL gene_id:79183|Hs108|chr20 ( 342) 623 155.5 5.6e-38 CCDS6178.1 TTPA gene_id:7274|Hs108|chr8 ( 278) 480 121.7 6.6e-28 CCDS13877.1 SEC14L3 gene_id:266629|Hs108|chr22 ( 400) 266 71.3 1.5e-12 CCDS54517.1 SEC14L4 gene_id:284904|Hs108|chr22 ( 360) 255 68.7 8e-12 CCDS13878.1 SEC14L4 gene_id:284904|Hs108|chr22 ( 406) 255 68.7 9e-12 >>CCDS34525.1 CLVS2 gene_id:134829|Hs108|chr6 (327 aa) initn: 2187 init1: 2187 opt: 2187 Z-score: 2789.6 bits: 524.5 E(32554): 4.6e-149 Smith-Waterman score: 2187; 100.0% identity (100.0% similar) in 327 aa overlap (1-327:1-327) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MTHLQAGLSPETLEKARLELNENPDTLHQDIQEVRDMVITRPDIGFLRTDDAFILRFLRA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 MTHLQAGLSPETLEKARLELNENPDTLHQDIQEVRDMVITRPDIGFLRTDDAFILRFLRA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 RKFHHFEAFRLLAQYFEYRQQNLDMFKSFKATDPGIKQALKDGFPGGLANLDHYGRKILV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 RKFHHFEAFRLLAQYFEYRQQNLDMFKSFKATDPGIKQALKDGFPGGLANLDHYGRKILV 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 LFAANWDQSRYTLVDILRAILLSLEAMIEDPELQVNGFVLIIDWSNFTFKQASKLTPSML :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 LFAANWDQSRYTLVDILRAILLSLEAMIEDPELQVNGFVLIIDWSNFTFKQASKLTPSML 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 RLAIEGLQDSFPARFGGIHFVNQPWYIHALYTVIRPFLKEKTRKRIFLHGNNLNSLHQLI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 RLAIEGLQDSFPARFGGIHFVNQPWYIHALYTVIRPFLKEKTRKRIFLHGNNLNSLHQLI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 HPEILPSEFGGMLPPYDMGTWARTLLDHEYDDDSEYNVDSYSMPVKEVEKELSPKSMKRS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 HPEILPSEFGGMLPPYDMGTWARTLLDHEYDDDSEYNVDSYSMPVKEVEKELSPKSMKRS 250 260 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 QSVVDPTVLKRMDKNEEENMQPLLSLD ::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 QSVVDPTVLKRMDKNEEENMQPLLSLD 310 320 >>CCDS6176.1 CLVS1 gene_id:157807|Hs108|chr8 (354 aa) initn: 1649 init1: 1649 opt: 1789 Z-score: 2281.6 bits: 430.6 E(32554): 9.1e-121 Smith-Waterman score: 1789; 79.8% identity (92.5% similar) in 332 aa overlap (1-327:23-354) 10 20 30 pF1KE6 MTHLQAGLSPETLEKARLELNENPDTLHQDIQEVRDMV ::::::::::::.::::::::::::.::::::.::::. 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CCDS32 SL--SPEAVRCTIEAGYPGVLSSRDKYGRVVMLFNIENWQSQEITFDEILQAYCFILEKL 130 140 150 160 170 180 150 160 170 180 190 200 pF1KE6 IEDPELQVNGFVLIIDWSNFTFKQASKLTPSMLRLAIEGLQDSFPARFGGIHFVNQPWYI .:. : :.::: .: ....::..::..: : :: .. ::::::::: .:::..::::. CCDS32 LENEETQINGFCIIENFKGFTMQQAASLRTSDLRKMVDMLQDSFPARFKAIHFIHQPWYF 190 200 210 220 230 240 210 220 230 240 250 260 pF1KE6 HALYTVIRPFLKEKTRKRIFLHGNNLNSLHQLIHPEILPSEFGGMLPPYDMGTWARTLLD . :.:..:::: : .:.:.::..:....: : .::::.::: :: :: . :. :. CCDS32 TTTYNVVKPFLKSKLLERVFVHGDDLSGFYQEIDENILPSDFGGTLPKYDGKAVAEQLFG 250 260 270 280 290 300 270 280 290 300 310 320 pF1KE6 HEYDDDSEYNVDSYSMPVKEVEKELSPKSMKRSQSVVDPTVLKRMDKNEEENMQPLLSLD CCDS32 PQAQAENTAF 310 >>CCDS13332.2 TTPAL gene_id:79183|Hs108|chr20 (342 aa) initn: 569 init1: 386 opt: 623 Z-score: 795.3 bits: 155.5 E(32554): 5.6e-38 Smith-Waterman score: 623; 39.1% identity (69.4% similar) in 271 aa overlap (8-276:35-301) 10 20 30 pF1KE6 MTHLQAGLSPETLEKARLELNENPDTLHQDIQEVRDM :. . . ::: ::.:.:. .:.: .::: CCDS13 SDSLRTSPSVASLSENELPPPPEPPGYVCSLTEDLVTKAREELQEKPEWRLRDVQALRDM 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KE6 VITRPDIGFLRT--DDAFILRFLRARKFHHFEAFRLLAQYFEYRQQNLDMFKSFKATDPG : : . : : ::::.::::::::: . .:..::..: :.. ..:...: . . CCDS13 V--RKEYPNLSTSLDDAFLLRFLRARKFDYDRALQLLVNYHSCRRSWPEVFNNLKPS--A 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KE6 IKQALKDGFPGGLANLDHYGRKILVLFAANWDQSRYTLVDILRAILLSLEAMIEDPELQV .:..: .:: : . : : ... . : : : ... .::: :.:: .:.. : :: CCDS13 LKDVLASGFLTVLPHTDPRGCHVVCIRPDRWIPSNYPITENIRAIYLTLEKLIQSEETQV 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KE6 NGFVLIIDWSNFTFKQASKLTPSMLRLAIEGLQDSFPARFGGIHFVNQPWYIHALYTVIR ::.:.. :... ....::.. : . . .: :::.:: :. ..: ::.: .......:. CCDS13 NGIVILADYKGVSLSKASHFGPFIAKKVIGILQDGFPIRIKAVHVVNEPRIFKGIFAIIK 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KE6 PFLKEKTRKRIFLHGNNLNSLHQLIHPEILPSEFGGMLPPYDMGTWARTLLDHEYDDDSE :::::: .:.::::..::::: . :::.:.:: : .:: .:: : : .: CCDS13 PFLKEKIANRFFLHGSDLNSLHTNLPRSILPKEYGGTAGELDTATWNAVLLASEDDFVKE 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 pF1KE6 YNVDSYSMPVKEVEKELSPKSMKRSQSVVDPTVLKRMDKNEEENMQPLLSLD . 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CCDS61 LITSELIVQEVETQRNGIKAIFDLEGWQFSHAFQITPSVAKKIAAVLTDSFPLKVRGIHL 140 150 160 170 180 190 210 220 230 240 250 pF1KE6 VNQPWYIHALYTVIRPFLKEKTRKRIFLHGNNLN-SLHQLIHPEILPSEFGGMLPPYDMG .:.: .::....:.::: :: ..:: .:::: . :: : . :.::: :.:: CCDS61 INEPVIFHAVFSMIKPFLTEKIKERIHMHGNNYKQSLLQHF-PDILPLEYGGEEFSMEDI 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE6 TWARTLLDHEYDDDSEYNVDSYSMPVKEVEKELSPKSMKRSQSVVDPTVLKRMDKNEEEN CCDS61 CQEWTNFIMKSEDYLSSISESIQ 260 270 >>CCDS13877.1 SEC14L3 gene_id:266629|Hs108|chr22 (400 aa) initn: 267 init1: 95 opt: 266 Z-score: 339.0 bits: 71.3 E(32554): 1.5e-12 Smith-Waterman score: 266; 27.3% identity (58.8% similar) in 245 aa overlap (25-257:14-249) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MTHLQAGLSPETLEKARLELNENPDTLHQDIQEVRDMVITRPDIGFLRTDDAFILRFLRA .:: . ..:.:.. . :. :: :.::.::: CCDS13 MSGRVGDLSPKQAETLAKFRENVQDVLPALPN-----PDDYFLLRWLRA 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 RKFHHFEAFRLLAQYFEYRQQNLDMFKSFKATDPGIKQALKDGFPGGLANLDHYGRKILV :.: .. :: .:.:.:. ..:. . . : . : .:::: . :. : . 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CCDS54 NFDLQKSEDMLRRHMEFRKQQDLDNIVTWQ--PPEVIQ-LYDS--GGLCGYDYEGCPVYF 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 pF1KE6 LFAANWDQSRYTLV----DILRAILLSLEAMIEDPELQVNGF-------VLIIDWSNFTF . .. : . : :..: . : .... :::.. . ....: .... CCDS54 NIIGSLDPKGLLLSASKQDMIRKRIKVCELLLHECELQTQKLGRKIEMALMVFDMEGLSL 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 KQASKLTPSMLRLAIEGLQDSFPARFGGIHFVNQPWYIHALYTVIRPFLKEKTRKRIFLH :. : . . . . :. ..: . .. . : . . ..... :..:.::..: . CCDS54 KHLWKPAVEVYQQFFSILEANYPETLKNLIVIRAPKLFPVAFNLVKSFMSEETRRKIVIL 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE6 GNNLNS-LHQLIHPEILPSEFGGMLPPYDMGTWARTLLDHEYDDDSEYNVDSYSMPVKEV :.: .. : ..: :. :: :::: . : CCDS54 GDNWKQELTKFISPDQLPVEFGGTMTDPDGNPKCLTKINYGGEVPKSYYLCEQVRLQYEH 230 240 250 260 270 280 >>CCDS13878.1 SEC14L4 gene_id:284904|Hs108|chr22 (406 aa) initn: 157 init1: 93 opt: 255 Z-score: 324.9 bits: 68.7 E(32554): 9e-12 Smith-Waterman score: 255; 24.7% identity (59.0% similar) in 239 aa overlap (32-257:21-249) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 THLQAGLSPETLEKARLELNENPDTLHQDIQEVRDMVITRPDIGFLRTDDAFILRFLRAR ....:.. :. .:: :.::.:::: CCDS13 MSSRVGDLSPQQQEALARFRENLQDLLPILPN-----ADDYFLLRWLRAR 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 KFHHFEAFRLLAQYFEYR-QQNLDMFKSFKATDPGIKQALKDGFPGGLANLDHYGRKILV .: .. .: ...:.: ::.:: . ... : . : : :. ::: . :. : . CCDS13 NFDLQKSEDMLRRHMEFRKQQDLDNIVTWQ--PPEVIQ-LYDS--GGLCGYDYEGCPVYF 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 pF1KE6 LFAANWDQSRYTLV----DILRAILLSLEAMIEDPELQVNGF-------VLIIDWSNFTF . .. : . : :..: . : .... :::.. . ....: .... CCDS13 NIIGSLDPKGLLLSASKQDMIRKRIKVCELLLHECELQTQKLGRKIEMALMVFDMEGLSL 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 pF1KE6 KQASKLTPSMLRLAIEGLQDSFPARFGGIHFVNQPWYIHALYTVIRPFLKEKTRKRIFLH :. : . . . . :. ..: . .. . : . . ..... :..:.::..: . CCDS13 KHLWKPAVEVYQQFFSILEANYPETLKNLIVIRAPKLFPVAFNLVKSFMSEETRRKIVIL 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE6 GNNLNS-LHQLIHPEILPSEFGGMLPPYDMGTWARTLLDHEYDDDSEYNVDSYSMPVKEV :.: .. : ..: :. :: :::: . : CCDS13 GDNWKQELTKFISPDQLPVEFGGTMTDPDGNPKCLTKINYGGEVPKSYYLCEQVRLQYEH 230 240 250 260 270 280 327 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 12:46:02 2016 done: Tue Nov 8 12:46:02 2016 Total Scan time: 1.920 Total Display time: 0.000 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]