FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE4174, 634 aa 1>>>pF1KE4174 634 - 634 aa - 634 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.5949+/-0.00047; mu= 23.7128+/- 0.029 mean_var=77.7151+/-16.296, 0's: 0 Z-trim(109.2): 366 B-trim: 937 in 1/50 Lambda= 0.145486 statistics sampled from 16960 (17364) to 16960 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.562), E-opt: 0.2 (0.204), width: 16 Scan time: 10.430 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001003760 (OMIM: 610749) kelch-like protein 31 ( 634) 4230 898.4 0 XP_016866347 (OMIM: 610749) PREDICTED: kelch-like ( 634) 4230 898.4 0 XP_005249164 (OMIM: 610749) PREDICTED: kelch-like ( 634) 4230 898.4 0 NP_061335 (OMIM: 611201) kelch-like protein 9 [Hom ( 617) 1325 288.6 4.3e-77 NP_001161775 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 613) 1315 286.5 1.8e-76 NP_001161773 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 639) 1315 286.6 1.9e-76 XP_016885439 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 639) 1315 286.6 1.9e-76 NP_001161774 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 639) 1315 286.6 1.9e-76 NP_001161772 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 649) 1315 286.6 1.9e-76 XP_011529713 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 655) 1315 286.6 1.9e-76 NP_277030 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 iso ( 655) 1315 286.6 1.9e-76 NP_001161771 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 ( 658) 1315 286.6 1.9e-76 XP_011529711 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 661) 1315 286.6 1.9e-76 XP_011529712 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like ( 661) 1315 286.6 1.9e-76 NP_065856 (OMIM: 613772) kelch-like protein 14 [Ho ( 628) 985 217.3 1.3e-55 NP_001165125 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 568) 781 174.4 9.6e-43 NP_001007076 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 i ( 709) 781 174.5 1.1e-42 NP_057074 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 755) 781 174.6 1.2e-42 XP_011512003 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 781 174.6 1.2e-42 XP_016863765 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 781 174.6 1.2e-42 XP_016863764 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 781 174.6 1.2e-42 XP_011512002 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 788) 781 174.6 1.2e-42 XP_005262712 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 789) 781 174.6 1.2e-42 XP_011512001 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 781 174.6 1.2e-42 XP_016863763 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 781 174.6 1.2e-42 XP_016863762 (OMIM: 608064) PREDICTED: kelch-like ( 804) 781 174.6 1.2e-42 XP_016876167 (OMIM: 605332) PREDICTED: kelch-like ( 575) 774 173.0 2.7e-42 NP_065917 (OMIM: 605332) kelch-like protein 1 isof ( 748) 774 173.1 3.2e-42 NP_061990 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 718) 753 168.7 6.6e-41 NP_476503 (OMIM: 300348) kelch-like protein 4 isof ( 720) 753 168.7 6.6e-41 NP_001273654 (OMIM: 605332) kelch-like protein 1 i ( 687) 739 165.7 4.9e-40 NP_950240 (OMIM: 608064) kelch-like protein 5 isof ( 694) 732 164.2 1.4e-39 XP_016876168 (OMIM: 605332) PREDICTED: kelch-like ( 525) 730 163.7 1.5e-39 XP_006724581 (OMIM: 300980,300982) PREDICTED: kelc ( 604) 683 153.9 1.6e-36 NP_085127 (OMIM: 300980,300982) kelch-like protein ( 604) 683 153.9 1.6e-36 NP_071324 (OMIM: 256850,605379) gigaxonin [Homo sa ( 597) 677 152.6 3.7e-36 XP_016863164 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 415) 621 140.7 1e-32 XP_016857484 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 471) 615 139.5 2.6e-32 XP_011508138 (OMIM: 614522) PREDICTED: kelch-like ( 526) 615 139.5 2.8e-32 NP_569713 (OMIM: 614214) kelch-like protein 6 [Hom ( 621) 586 133.5 2.1e-30 NP_001026880 (OMIM: 611119,612943,617055) kelch-li ( 586) 536 123.0 3e-27 XP_016867928 (OMIM: 611119,612943,617055) PREDICTE ( 564) 519 119.4 3.4e-26 XP_016862148 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 519 119.5 3.6e-26 XP_005247610 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 519 119.5 3.6e-26 XP_005247611 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 519 119.5 3.6e-26 XP_005247609 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 519 119.5 3.6e-26 XP_011511240 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 519 119.5 3.6e-26 XP_005247613 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 519 119.5 3.6e-26 NP_060114 (OMIM: 611295) kelch-like protein 24 [Ho ( 600) 519 119.5 3.6e-26 XP_016862149 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 519 119.5 3.6e-26 >>NP_001003760 (OMIM: 610749) kelch-like protein 31 [Hom (634 aa) initn: 4230 init1: 4230 opt: 4230 Z-score: 4800.2 bits: 898.4 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 4230; 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NP_061 MKNIRFPLMTPQDLINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEASNYQMMPYMQPVMQSDRTAIRSD 240 250 260 270 280 290 320 330 340 350 360 370 pF1KE4 CRVLVTVGG--RPGLTEKSLSRDI-LYRDPENGWSKLTEMPAKSFNQCVAVMDGFLYVAG :::.:: : :. .:... .: . . : .:. : : ... .::. .::::.: NP_061 STHLVTLGGVLRQQLV---VSKELRMYDERAQEWRSLAPMDAPRYQHGIAVIGNFLYVVG 300 310 320 330 340 350 380 390 400 410 420 430 pF1KE4 GEDQNDARNQAKHAVSNFCRYDPRFNTWIHLASMNQKRTHFSLSVFNGLVYAAGGRNAEG :... :... : ::.. :.:::.: :...::.:.::: : ::...: .::.:::.: : NP_061 GQSNYDTKG--KTAVDTVFRFDPRYNKWMQVASLNEKRTFFHLSALKGHLYAVGGRSAAG 360 370 380 390 400 410 440 450 460 470 480 490 pF1KE4 SLASLECYVPSTNQWQPKTPLEVARCCHASAVADGRVLVTGGYIANAYSRSVCAYDPASD ::..::: : :.:. . . . ::..: : . ..:: .... . .:: .: NP_061 ELATVECYNPRMNEWSYVAKMSEPHYGHAGTVYGGLMYISGGITHDTFQNELMCFDPDTD 420 430 440 450 460 470 500 510 520 530 540 550 pF1KE4 SWQELPNLSTPRGWHCAVTLSDRVYVMGGSQLGPRGERVDVLTVECYSPATGQWSYAAPL .:.. ..: :: :: :..:..::.::... .. :::. : :::. ::. : . 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NP_001 VVLQGFDQLRLEGLLCDVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIK 40 50 60 70 80 90 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 LNDISPLGLATVIAYAYTGKLTLSLYTIGSIISAAVYLQIHTLIKMCSDFLIREMSVENC :. .: .:: .: . ::.::.:.. .. . . :: .::: .. .:. ::: ....:: NP_001 LHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNC 100 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 MYVVNIAETYSLKNAKAAAQKFIRDNFLEFAESDQFMKLTFEQINELLIDDDLQLPSEIV . : ::.::.: .. ...:. :: . . .:.:: ::.. .: ...:. .:. NP_001 VEVGRIANTYNLTEVDKYVNSFVLKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELE 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 AFQIAMKWLEFDQKRVKYAADLLSNIRFGTISAQDLVNYVQSVPRMMQDADCHRLLVDAM :. . .::.... :. .:: :..:::: .. :.:.::::.: : : : ::..: NP_001 LFKATCRWLRLEEPRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEAS 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 pF1KE4 NYHLLPYHQNTLQSRRTRIRGGCRVLVTVGG--RPGLTEKSLSRDI-LYRDPENGWSKLT ::...:: : ..:: :: ::. :::.:: : :. .:... .: . . :..:. 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NP_001 DKDEWHKVFDLPESLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP 600 610 620 630 >>XP_016885439 (OMIM: 300655) PREDICTED: kelch-like prot (639 aa) initn: 1430 init1: 615 opt: 1315 Z-score: 1493.5 bits: 286.6 E(85289): 1.9e-76 Smith-Waterman score: 1316; 34.4% identity (67.9% similar) in 613 aa overlap (39-629:32-638) 10 20 30 40 50 pF1KE4 KKNKGDINEMTIIVEDSPLNKLNALNGLLEGGNGLSCISSELTDASYGPN---------- ::. .. .::.: ... ::. XP_016 DHLHRGELVAAILRNRSLVEEEDQHMKLSLGGSEMG-LSSHLQSSKAGPTRIFTSNTHSS 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 -LLEGLSKMRQENFLCDLVI--GTKTKSFDVHKSVMASCSEYFYNILK---KDPSIQRVD .:.:....: :..:::... : .: ::. .::: :.:: .. :. ... . XP_016 VVLQGFDQLRLEGLLCDVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIK 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 LNDISPLGLATVIAYAYTGKLTLSLYTIGSIISAAVYLQIHTLIKMCSDFLIREMSVENC :. .: .:: .: . ::.::.:.. .. . . :: .::: .. .:. ::: ....:: XP_016 LHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNC 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 MYVVNIAETYSLKNAKAAAQKFIRDNFLEFAESDQFMKLTFEQINELLIDDDLQLPSEIV . : ::.::.: .. ...:. :: . . .:.:: ::.. .: ...:. .:. XP_016 VEVGRIANTYNLTEVDKYVNSFVLKNFPALLSTGEFLKLPFERLAFVLSSNSLKHCTELE 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE4 AFQIAMKWLEFDQKRVKYAADLLSNIRFGTISAQDLVNYVQSVPRMMQDADCHRLLVDAM :. . .::.... :. .:: :..:::: .. :.:.::::.: : : : ::..: XP_016 LFKATCRWLRLEEPRMDFAAKLMKNIRFPLMTPQELINYVQTVDFMRTDNTCVNLLLEAS 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 pF1KE4 NYHLLPYHQNTLQSRRTRIRGGCRVLVTVGG--RPGLTEKSLSRDI-LYRDPENGWSKLT ::...:: : ..:: :: ::. :::.:: : :. .:... .: . . :..:. 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XP_016 ISGGITHDTFQKELMCFDPDTDKWIQKAPMTTVRGLHCMCTVGERLYVIGGNHFRGTSDY 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KE4 VDVLTVECYSPATGQWSYAAPLQVGVSTAGVSALHGRAYLVGGWNEGEKKYKKCIQCFSP :::. : ::: ::. : . : : .::...... :.:::.. ... . . .: ..: XP_016 DDVLSCEYYSPILDQWTPIAAMLRGQSDVGVAVFENKIYVVGGYSWNNRCMVEIVQKYDP 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 pF1KE4 ELNEWTEDDELPEATVGVSCCTLSM--PNNVT-RESRASSVSSVPVSI . .:: . .:::. :. :::.. :...: :: : .:. XP_016 DKDEWHKVFDLPESLGGIRACTLTVFPPEETTPSPSRESPLSAP 600 610 620 630 >>NP_001161774 (OMIM: 300655) kelch-like protein 13 isof (639 aa) initn: 1430 init1: 615 opt: 1315 Z-score: 1493.5 bits: 286.6 E(85289): 1.9e-76 Smith-Waterman score: 1316; 34.4% identity (67.9% similar) in 613 aa overlap (39-629:32-638) 10 20 30 40 50 pF1KE4 KKNKGDINEMTIIVEDSPLNKLNALNGLLEGGNGLSCISSELTDASYGPN---------- ::. .. .::.: ... ::. NP_001 DHLHRGELVAAILRNRSLVEEEDQHMKLSLGGSEMG-LSSHLQSSKAGPTRIFTSNTHSS 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE4 -LLEGLSKMRQENFLCDLVI--GTKTKSFDVHKSVMASCSEYFYNILK---KDPSIQRVD .:.:....: :..:::... : .: ::. .::: :.:: .. :. ... . NP_001 VVLQGFDQLRLEGLLCDVTLMPGDTDDAFPVHRVMMASASDYFKAMFTGGMKEQDLMCIK 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE4 LNDISPLGLATVIAYAYTGKLTLSLYTIGSIISAAVYLQIHTLIKMCSDFLIREMSVENC :. .: .:: .: . ::.::.:.. .. . . :: .::: .. .:. ::: ....:: NP_001 LHGVSKVGLRKIIDFIYTAKLSLNMDNLQDTLEAASFLQILPVLDFCKVFLISGVTLDNC 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE4 MYVVNIAETYSLKNAKAAAQKFIRDNFLEFAESDQFMKLTFEQINELLIDDDLQLPSEIV . : ::.::.: .. ...:. :: . . .:.:: ::.. .: ...:. .:. 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