FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3112, 284 aa 1>>>pF1KE3112 284 - 284 aa - 284 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1294+/-0.00103; mu= 15.9011+/- 0.062 mean_var=64.7184+/-13.791, 0's: 0 Z-trim(103.4): 31 B-trim: 430 in 1/48 Lambda= 0.159426 statistics sampled from 7352 (7377) to 7352 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.595), E-opt: 0.2 (0.227), width: 16 Scan time: 2.280 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS34159.1 PLPP1 gene_id:8611|Hs108|chr5 ( 284) 1905 447.1 6.7e-126 CCDS34160.1 PLPP1 gene_id:8611|Hs108|chr5 ( 285) 1687 397.0 8.3e-111 CCDS12023.1 PLPP2 gene_id:8612|Hs108|chr19 ( 288) 1084 258.3 4.7e-69 CCDS12024.1 PLPP2 gene_id:8612|Hs108|chr19 ( 309) 1032 246.3 2e-65 CCDS604.1 PLPP3 gene_id:8613|Hs108|chr1 ( 311) 939 224.9 5.5e-59 CCDS45889.1 PLPP2 gene_id:8612|Hs108|chr19 ( 232) 866 208.1 4.9e-54 CCDS30779.1 PLPPR5 gene_id:163404|Hs108|chr1 ( 316) 358 91.3 9.4e-19 CCDS30778.1 PLPPR5 gene_id:163404|Hs108|chr1 ( 321) 354 90.4 1.8e-18 CCDS757.1 PLPPR4 gene_id:9890|Hs108|chr1 ( 763) 350 89.7 7e-18 CCDS6751.1 PLPPR1 gene_id:54886|Hs108|chr9 ( 325) 343 87.9 1.1e-17 CCDS58636.1 PLPPR3 gene_id:79948|Hs108|chr19 ( 718) 285 74.7 2.1e-13 CCDS47841.1 PLPP5 gene_id:84513|Hs108|chr8 ( 264) 247 65.7 4e-11 >>CCDS34159.1 PLPP1 gene_id:8611|Hs108|chr5 (284 aa) initn: 1905 init1: 1905 opt: 1905 Z-score: 2373.8 bits: 447.1 E(32554): 6.7e-126 Smith-Waterman score: 1905; 100.0% identity (100.0% similar) in 284 aa overlap (1-284:1-284) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MFDKTRLPYVALDVLCVLLAGLPFAILTSRHTPFQRGVFCNDESIKYPYKEDTIPYALLG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 MFDKTRLPYVALDVLCVLLAGLPFAILTSRHTPFQRGVFCNDESIKYPYKEDTIPYALLG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 GIIIPFSIIVIILGETLSVYCNLLHSNSFIRNNYIATIYKAIGTFLFGAAASQSLTDIAK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 GIIIPFSIIVIILGETLSVYCNLLHSNSFIRNNYIATIYKAIGTFLFGAAASQSLTDIAK 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 YSIGRLRPHFLDVCDPDWSKINCSDGYIEYYICRGNAERVKEGRLSFYSGHSSFSMYCML :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 YSIGRLRPHFLDVCDPDWSKINCSDGYIEYYICRGNAERVKEGRLSFYSGHSSFSMYCML 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 FVALYLQARMKGDWARLLRPTLQFGLVAVSIYVGLSRVSDYKHHWSDVLTGLIQGALVAI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 FVALYLQARMKGDWARLLRPTLQFGLVAVSIYVGLSRVSDYKHHWSDVLTGLIQGALVAI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 LVAVYVSDFFKERTSFKERKEEDSHTTLHETPTTGNHYPSNHQP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 LVAVYVSDFFKERTSFKERKEEDSHTTLHETPTTGNHYPSNHQP 250 260 270 280 >>CCDS34160.1 PLPP1 gene_id:8611|Hs108|chr5 (285 aa) initn: 1691 init1: 1548 opt: 1687 Z-score: 2102.8 bits: 397.0 E(32554): 8.3e-111 Smith-Waterman score: 1687; 88.8% identity (95.1% similar) in 285 aa overlap (1-284:1-285) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MFDKTRLPYVALDVLCVLLAGLPFAILT-SRHTPFQRGVFCNDESIKYPYKEDTIPYALL ::::::::::::::::::::..:.:.: .. ::::: ::.:.::.:::...:. ..: CCDS34 MFDKTRLPYVALDVLCVLLASMPMAVLKLGQIYPFQRGFFCKDNSINYPYHDSTVTSTVL 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 GGIIIPFSIIVIILGETLSVYCNLLHSNSFIRNNYIATIYKAIGTFLFGAAASQSLTDIA . . . : ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 ILVGVGLPISSIILGETLSVYCNLLHSNSFIRNNYIATIYKAIGTFLFGAAASQSLTDIA 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 KYSIGRLRPHFLDVCDPDWSKINCSDGYIEYYICRGNAERVKEGRLSFYSGHSSFSMYCM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 KYSIGRLRPHFLDVCDPDWSKINCSDGYIEYYICRGNAERVKEGRLSFYSGHSSFSMYCM 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 LFVALYLQARMKGDWARLLRPTLQFGLVAVSIYVGLSRVSDYKHHWSDVLTGLIQGALVA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 LFVALYLQARMKGDWARLLRPTLQFGLVAVSIYVGLSRVSDYKHHWSDVLTGLIQGALVA 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 pF1KE3 ILVAVYVSDFFKERTSFKERKEEDSHTTLHETPTTGNHYPSNHQP ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 ILVAVYVSDFFKERTSFKERKEEDSHTTLHETPTTGNHYPSNHQP 250 260 270 280 >>CCDS12023.1 PLPP2 gene_id:8612|Hs108|chr19 (288 aa) initn: 1074 init1: 808 opt: 1084 Z-score: 1353.2 bits: 258.3 E(32554): 4.7e-69 Smith-Waterman score: 1084; 58.0% identity (78.7% similar) in 286 aa overlap (4-282:2-285) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MFDKTRLPYVALDVLCVLLAGLPFAILTSRHTPFQRGVFCNDESIKYPYKEDTIPYALLG . : .: :::::.:.:.::::::: ..:..:: .:.:.::.:::. ::: ..:.. CCDS12 MQRRWVFVLLDVLCLLVASLPFAILTLVNAPYKRGFYCGDDSIRYPYRPDTITHGLMA 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 GIIIPFSIIVIILGETLSVYCNLLHSNSFIRNNYIATIYKAIGTFLFGAAASQSLTDIAK :. : ..:.. ::. :: . :.: : . :::.:..::..::::::::.::::::.:: CCDS12 GVTITATVILVSAGEAYLVYTDRLYSRSDF-NNYVAAVYKVLGTFLFGAAVSQSLTDLAK 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE3 YSIGRLRPHFLDVCDPDWSKINCSDGYIEYY-ICRGNAERVKEGRLSFYSGHSSFSMYCM : ::::::.:: :::::::..::: :.. .:::: : :.:::::::::::.:::: CCDS12 YMIGRLRPNFLAVCDPDWSRVNCSV-YVQLEKVCRGNPADVTEARLSFYSGHSSFGMYCM 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 LFVALYLQARMKGDWARLLRPTLQFGLVAVSIYVGLSRVSDYKHHWSDVLTGLIQGALVA .:.:::.:::. ::::::::.:: ::: ..::: .:::::::::::::.::.:::::: CCDS12 VFLALYVQARLCWKWARLLRPTVQFFLVAFALYVGYTRVSDYKHHWSDVLVGLLQGALVA 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 ILVAVYVSDFFKERTSFKERKEED--SHTTLHETPTTG----NHYPSNHQP :.. :.::::: : . :::. . .: : : : ::: : CCDS12 ALTVCYISDFFKARPPQHCLKEEELERKPSLSLTLTLGEADHNHYGYPHSSS 240 250 260 270 280 >>CCDS12024.1 PLPP2 gene_id:8612|Hs108|chr19 (309 aa) initn: 1025 init1: 808 opt: 1032 Z-score: 1288.1 bits: 246.3 E(32554): 2e-65 Smith-Waterman score: 1032; 58.5% identity (78.7% similar) in 272 aa overlap (18-282:37-306) 10 20 30 40 pF1KE3 MFDKTRLPYVALDVLCVLLAGLPFAILTSRHTPFQRGVFCNDESIKY : :.::::::: ..:..:: .:.:.::.: CCDS12 PGSRGQHPPPRQQEVCAEGPRARLHPAPPGLGASLPFAILTLVNAPYKRGFYCGDDSIRY 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE3 PYKEDTIPYALLGGIIIPFSIIVIILGETLSVYCNLLHSNSFIRNNYIATIYKAIGTFLF ::. ::: ..:..:. : ..:.. ::. :: . :.: : . :::.:..::..::::: CCDS12 PYRPDTITHGLMAGVTITATVILVSAGEAYLVYTDRLYSRSDF-NNYVAAVYKVLGTFLF 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 GAAASQSLTDIAKYSIGRLRPHFLDVCDPDWSKINCSDGYIEYY-ICRGNAERVKEGRLS :::.::::::.::: ::::::.:: :::::::..::: :.. .:::: : :.::: CCDS12 GAAVSQSLTDLAKYMIGRLRPNFLAVCDPDWSRVNCSV-YVQLEKVCRGNPADVTEARLS 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 FYSGHSSFSMYCMLFVALYLQARMKGDWARLLRPTLQFGLVAVSIYVGLSRVSDYKHHWS ::::::::.::::.:.:::.:::. ::::::::.:: ::: ..::: .:::::::::: CCDS12 FYSGHSSFGMYCMVFLALYVQARLCWKWARLLRPTVQFFLVAFALYVGYTRVSDYKHHWS 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 DVLTGLIQGALVAILVAVYVSDFFKERTSFKERKEED--SHTTLHETPTTG----NHYPS :::.::.:::::: :.. :.::::: : . :::. . .: : : : ::: CCDS12 DVLVGLLQGALVAALTVCYISDFFKARPPQHCLKEEELERKPSLSLTLTLGEADHNHYGY 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 NHQP : CCDS12 PHSSS >>CCDS604.1 PLPP3 gene_id:8613|Hs108|chr1 (311 aa) initn: 911 init1: 810 opt: 939 Z-score: 1172.4 bits: 224.9 E(32554): 5.5e-59 Smith-Waterman score: 939; 56.9% identity (79.8% similar) in 253 aa overlap (6-256:33-284) 10 20 30 pF1KE3 MFDKTRLPYVALDVLCVLLAGLPFAIL-TSRHTPF :. . ::..:...::::: :. :: :. CCDS60 NYKYDKAIVPESKNGGSPALNNNPRRSGSKRVLLICLDLFCLFMAGLPFLIIETSTIKPY 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KE3 QRGVFCNDESIKYPYKE-DTIPYALLGGIIIPFSIIVIILGETLSVYCNLLHSNSFIRNN .:: .::::::::: : .:: :.: .. : ..:..:: :: .: : .: : :.: CCDS60 HRGFYCNDESIKYPLKTGETINDAVLCAVGIVIAILAIITGEFYRIY-YLKKSRSTIQNP 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 YIATIYKAIGTFLFGAAASQSLTDIAKYSIGRLRPHFLDVCDPDWSKINCSDGYIEYYIC :.:..:: .: :::: : :::.::::: ::::::::::.::.::.:.::::.:::. : : CCDS60 YVAALYKQVGCFLFGCAISQSFTDIAKVSIGRLRPHFLSVCNPDFSQINCSEGYIQNYRC 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KE3 RGNAERVKEGRLSFYSGHSSFSMYCMLFVALYLQARMKGDWARLLRPTLQFGLVAVSIYV ::. .:.:.: ::.:::.::::: ::...::::::. :::::: ::: :. ...:. CCDS60 RGDDSKVQEARKSFFSGHASFSMYTMLYLVLYLQARFTWRGARLLRPLLQFTLIMMAFYT 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KE3 GLSRVSDYKHHWSDVLTGLIQGALVAILVAVYVSDFFKERTSFKERKEEDSHTTLHETPT :::::::.::: ::::.:. :::::: .. .:::.:: .:.. CCDS60 GLSRVSDHKHHPSDVLAGFAQGALVACCIVFFVSDLFKTKTTLSLPAPAIRKEILSPVDI 250 260 270 280 290 300 280 pF1KE3 TGNHYPSNHQP CCDS60 IDRNNHHNMM 310 >>CCDS45889.1 PLPP2 gene_id:8612|Hs108|chr19 (232 aa) initn: 849 init1: 808 opt: 866 Z-score: 1083.6 bits: 208.1 E(32554): 4.9e-54 Smith-Waterman score: 866; 58.9% identity (77.5% similar) in 231 aa overlap (59-282:1-229) 30 40 50 60 70 80 pF1KE3 SRHTPFQRGVFCNDESIKYPYKEDTIPYALLGGIIIPFSIIVIILGETLSVYCNLLHSNS ..:. : ..:.. ::. :: . :.: : CCDS45 MAGVTITATVILVSAGEAYLVYTDRLYSRS 10 20 30 90 100 110 120 130 140 pF1KE3 FIRNNYIATIYKAIGTFLFGAAASQSLTDIAKYSIGRLRPHFLDVCDPDWSKINCSDGYI . :::.:..::..::::::::.::::::.::: ::::::.:: :::::::..::: :. CCDS45 DF-NNYVAAVYKVLGTFLFGAAVSQSLTDLAKYMIGRLRPNFLAVCDPDWSRVNCSV-YV 40 50 60 70 80 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 EYY-ICRGNAERVKEGRLSFYSGHSSFSMYCMLFVALYLQARMKGDWARLLRPTLQFGLV . .:::: : :.:::::::::::.::::.:.:::.:::. ::::::::.:: :: CCDS45 QLEKVCRGNPADVTEARLSFYSGHSSFGMYCMVFLALYVQARLCWKWARLLRPTVQFFLV 90 100 110 120 130 140 210 220 230 240 250 260 pF1KE3 AVSIYVGLSRVSDYKHHWSDVLTGLIQGALVAILVAVYVSDFFKERTSFKERKEED--SH : ..::: .:::::::::::::.::.:::::: :.. :.::::: : . :::. . CCDS45 AFALYVGYTRVSDYKHHWSDVLVGLLQGALVAALTVCYISDFFKARPPQHCLKEEELERK 150 160 170 180 190 200 270 280 pF1KE3 TTLHETPTTG----NHYPSNHQP .: : : : ::: : CCDS45 PSLSLTLTLGEADHNHYGYPHSSS 210 220 230 >>CCDS30779.1 PLPPR5 gene_id:163404|Hs108|chr1 (316 aa) initn: 309 init1: 177 opt: 358 Z-score: 450.1 bits: 91.3 E(32554): 9.4e-19 Smith-Waterman score: 432; 28.5% identity (61.5% similar) in 270 aa overlap (36-277:41-308) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 RLPYVALDVLCVLLAGLPFAILTSRHTPFQRGVFCNDESIKYPYK--EDT--IPYALLGG .: ::.: . . :: ::. .: .:: . 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CCDS30 SMLYFQMVIMAGTVMLAYYFEYTDTFTVNVQGFFCHDSAYRKPYPGPEDSSAVPPVLLYS 20 30 40 50 60 70 70 80 90 100 pF1KE3 IIIPFSIIVIILGETLSVYCNLLHSNSFIRNN---------YIATIYKA----IGTFLFG . ..:::.::: .:.: : . .: .. :: . . .: . :: CCDS30 LAAGVPVLVIIVGET-AVFCLQLATRDFENQEKTILTGDCCYINPLVRRTVRFLGIYTFG 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE3 AAASQSLTDIAKYSIGRLRPHFLDVCDPDWSKINCSDGYIEYY----ICRGNAERVKEGR :.. ... .. : : :::: .: :... ..:.. : .. : :: . . ..: CCDS30 LFATDIFVNAGQVVTGNLAPHFLALCKPNYTALGCQQ-YTQFISGEEACTGNPDLIMRAR 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 LSFYSGHSSFSMYCMLFVALYLQARMKGDWARLLRPTLQFGLVAVSIYVGLSRVSDYKHH .: : ....:.: .....:. .:. .:: .:.: .::. ... .::.::..:..: CCDS30 KTFPSKEAALSVYAAMYLTMYITNTIKAKGTRLAKPVLCLGLMCLAFLTGLNRVAEYRNH 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 WSDVLTGLIQGALVAILVAVYVSDFFKERTSFKERKEEDSHTTLHETPTTGNHYPSNHQP ::::..:.. : .:....: : . :: : . .:. . :. CCDS30 WSDVIAGFLVGISIAVFLVVCVVNNFKGRQAENEHIHMDNLAQMPMISIPRVESPLEKVT 250 260 270 280 290 300 CCDS30 SVQNHITAFAEVT 310 320 >>CCDS757.1 PLPPR4 gene_id:9890|Hs108|chr1 (763 aa) initn: 229 init1: 134 opt: 350 Z-score: 434.6 bits: 89.7 E(32554): 7e-18 Smith-Waterman score: 439; 29.8% identity (60.6% similar) in 292 aa overlap (5-272:65-354) 10 20 30 pF1KE3 MFDKTRLP---YVALDVLCVLLAGLPFAILTSRH : :: .: : .: ...: : ::. 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