FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE0898, 1369 aa 1>>>pF1KE0898 1369 - 1369 aa - 1369 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3854+/-0.00114; mu= 14.8105+/- 0.069 mean_var=161.6523+/-31.414, 0's: 0 Z-trim(107.2): 46 B-trim: 26 in 1/52 Lambda= 0.100875 statistics sampled from 9373 (9404) to 9373 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.626), E-opt: 0.2 (0.289), width: 16 Scan time: 5.030 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS34158.1 DHX29 gene_id:54505|Hs108|chr5 (1369) 8928 1312.9 0 CCDS3171.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3 (1008) 1330 207.0 2.2e-52 CCDS54657.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3 ( 994) 1163 182.7 4.5e-45 CCDS4113.1 YTHDC2 gene_id:64848|Hs108|chr5 (1430) 1004 159.7 5.5e-38 CCDS2759.1 DHX30 gene_id:22907|Hs108|chr3 (1194) 861 138.8 8.8e-32 CCDS41444.1 DHX9 gene_id:1660|Hs108|chr1 (1270) 772 125.9 7.3e-28 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YQIRMESRACESTRLLYCTTGVLLRKLQEDGLLSNVSHVIVDEVHERSVQSDFLLIILKE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 YQIRMESRACESTRLLYCTTGVLLRKLQEDGLLSNVSHVIVDEVHERSVQSDFLLIILKE 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KE0 ILQKRSDLHLILMSATVDSEKFSTYFTHCPILRISGRSYPVEVFHLEDIIEETGFVLEKD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 ILQKRSDLHLILMSATVDSEKFSTYFTHCPILRISGRSYPVEVFHLEDIIEETGFVLEKD 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KE0 SEYCQKFLEEEEEVTINVTSKAGGIKKYQEYIPVQTGAHADLNPFYQKYSSRTQHAILYM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 SEYCQKFLEEEEEVTINVTSKAGGIKKYQEYIPVQTGAHADLNPFYQKYSSRTQHAILYM 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 pF1KE0 NPHKINLDLILELLAYLDKSPQFRNIEGAVLIFLPGLAHIQQLYDLLSNDRRFYSERYKV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 NPHKINLDLILELLAYLDKSPQFRNIEGAVLIFLPGLAHIQQLYDLLSNDRRFYSERYKV 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 pF1KE0 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1190 1200 pF1KE0 AYLGWKKARQEGGYRSEITYCRRNFLNRTSLLTLEDVKQELIKLVKAAGFSSSTTSTSWE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 AYLGWKKARQEGGYRSEITYCRRNFLNRTSLLTLEDVKQELIKLVKAAGFSSSTTSTSWE 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KE0 GNRASQTLSFQEIALLKAVLVAGLYDNVGKIIYTKSVDVTEKLACIVETAQGKAQVHPSS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 GNRASQTLSFQEIALLKAVLVAGLYDNVGKIIYTKSVDVTEKLACIVETAQGKAQVHPSS 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KE0 VNRDLQTHGWLLYQEKIRYARVYLRETTLITPFPVLLFGGDIEVQHRERLLSIDGWIYFQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 VNRDLQTHGWLLYQEKIRYARVYLRETTLITPFPVLLFGGDIEVQHRERLLSIDGWIYFQ 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KE0 APVKIAVIFKQLRVLIDSVLRKKLENPKMSLENDKILQIITELIKTENN ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS34 APVKIAVIFKQLRVLIDSVLRKKLENPKMSLENDKILQIITELIKTENN 1330 1340 1350 1360 >>CCDS3171.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3 (1008 aa) initn: 1380 init1: 590 opt: 1330 Z-score: 1053.9 bits: 207.0 E(32554): 2.2e-52 Smith-Waterman score: 1995; 39.9% identity (69.7% similar) in 887 aa overlap (497-1367:138-990) 470 480 490 500 510 520 pF1KE0 LEWSDAEKKREELNKMETNKPRDLFIAKLLNKLKQQQQQ---QQQHSENKRENSEDPEES ::: :... :... :. : ..: CCDS31 KESEAQISWFAPEDHGYGTEVSTKNTPCSENKLDIQEKKLINQEKKMFRIRNRSYIDRDS 110 120 130 140 150 160 530 540 550 560 570 580 pF1KE0 WENLVSDEDFSALSLESANVEDLEPVRNLFRKLQSTPKYQKLLKERQQLPVFKHRDSIVE : :..... .. .:.. .:::. .: .: : .. . :..:: . . .:. CCDS31 -EYLLQENEPDG-TLDQKLLEDLQKKKNDLR-------YIEMQHFREKLPSYGMQKELVN 170 180 190 200 210 590 600 610 620 630 640 pF1KE0 TLKRHRVVVVAGETGSGKSTQVPHFLLEDLLLNEWEASKCNIVCTQPRRISAVSLANRVC . :.:.:..:::: ::.::: .:.:.. . .. ..: : :::::::::::.:.:.:: CCDS31 LIDNHQVTVISGETGCGKTTQVTQFILDNYI-ERGKGSACRIVCTQPRRISAISVAERVA 220 230 240 250 260 270 650 660 670 680 690 700 pF1KE0 DELGCENGPGGRNSLCGYQIRMESR-ACESTRLLYCTTGVLLRKLQEDGLLSNVSHVIVD : . : : :: :::::..:: .. .::::::..:. :: : ::.:::...: CCDS31 AERAESCGSG--NST-GYQIRLQSRLPRKQGSILYCTTGIILQWLQSDPYLSSVSHIVLD 280 290 300 310 320 330 710 720 730 740 750 760 pF1KE0 EVHERSVQSDFLLIILKEILQKRSDLHLILMSATVDSEKFSTYFTHCPILRISGRSYPVE :.:::..::: :. ..:..:. ::::..::::::...:::: :: .::...: : ..:: CCDS31 EIHERNLQSDVLMTVVKDLLNFRSDLKVILMSATLNAEKFSEYFGNCPMIHIPGFTFPVV 340 350 360 370 380 390 770 780 790 800 810 820 pF1KE0 VFHLEDIIEETGFVLEKDSEYCQKFLEEEEEVTINVTSKAGGIKKYQEYIPVQTGAHADL . :::.::. .: :. .:. ..: . . .: : :.: : . CCDS31 EYLLEDVIEKIRYVPEQ-KEHRSQFKRGFMQGHVNRQEKEEKEAIYKERWPDY------V 400 410 420 430 440 830 840 850 860 870 880 pF1KE0 NPFYQKYSSRTQHAILYMNPHKINLDLILELLAYLDKSPQFRNIEGAVLIFLPGLAHIQQ . ..::. : .: .:. :..:.::. :. :. ... .::.:.:::: .:. CCDS31 RELRRRYSASTVDVIEMMEDDKVDLNLIVALIRYI----VLEEEDGAILVFLPGWDNIST 450 460 470 480 490 500 890 900 910 920 930 940 pF1KE0 LYDLLSNDRRFYSERYKVIALHSILSTQDQAAAFTLPPPGVRKIVLATNIAETGITIPDV :.::: .. : :... .: :::.. : .:. .: ::::::::.:::::::.::: :: CCDS31 LHDLLMSQVMFKSDKFLIIPLHSLMPTVNQTQVFKRTPPGVRKIVIATNIAETSITIDDV 510 520 530 540 550 560 950 960 970 980 990 1000 pF1KE0 VFVIDTGRTKENKYHESSQMSSLVETFVSKASALQRQGRAGRVRDGFCFRMYTRERFEGF :.::: :. ::... ....:.. .::::.: ::.::::::. : :...:. : . CCDS31 VYVIDGGKIKETHFDTQNNISTMSAEWVSKANAKQRKGRAGRVQPGHCYHLYNGLRASLL 570 580 590 600 610 620 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KE0 MDYSVPEILRVPLEELCLHIMKCNLGSPEDFLSKALDPPQLQVISNAMNLLRKIGACELN ::..:::::.:::::::.: ::. :::. .:::. ... .. : ...: . . CCDS31 DDYQLPEILRTPLEELCLQIKILRLGGIAYFLSRLMDPPSNEAVLLSIRHLMELNALDKQ 630 640 650 660 670 680 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KE0 EPKLTPLGQHLAALPVNVKIGKMLIFGAIFGCLDPVATLAAVMTEKSPFTTPIGRKDEAD : .::::: ::: :::. .::::..:::.: ::::: :.:: .. :.::. :.:.. :: CCDS31 E-ELTPLGVHLARLPVEPHIGKMILFGALFCCLDPVLTIAASLSFKDPFVIPLGKEKIAD 690 700 710 720 730 740 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KE0 LAKSALAM-ADSDHLTIYNAYLGWKKARQEGGYRSEITYCRRNFLNRTSLLTLEDVKQEL .. :: . :::::. ::. ::..::..: .: : :: . ::. ..: :...: .. CCDS31 ARRKELAKDTRSDHLTVVNAFEGWEEARRRG-FRYEKDYCWEYFLSSNTLQMLHNMKGQF 750 760 770 780 790 800 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KE0 IKLVKAAGFSSSTTSTSWEGNRASQTLSFQEIALLKAVLVAGLYDNVGKIIYTKSVDVTE . . .::: :: . . :.: :.. . ..:::. :::: .:.:: .. . CCDS31 AEHLLGAGFVSSRNPKDPESNINSDNEK-----IIKAVICAGLYPKVAKI--RLNLGKKR 810 820 830 840 850 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KE0 KLACIVETAQGKAQVHPSSVNRDLQT---HGWLLYQEKIRYARVYLRETTLITPFPVLLF :.. . ..: . :::.::: . :: ..::.:. :.: . .:: . : ..:. .:.: CCDS31 KMVKVYTKTDGLVAVHPKSVNVE-QTDFHYNWLIYHLKMRTSSIYLYDCTEVSPYCLLFF 860 870 880 890 900 910 1300 1310 1320 1330 1340 1350 pF1KE0 GGDIEVQ--HRERLLSIDGWIYFQAPVKIAVIFKQLRVLIDSVLRKKLENPKMSLENDK- :::: .: . .. ...: :: ::.:..:: . :.:: .: .:..:.:.:. :: CCDS31 GGDISIQKDNDQETIAVDEWIVFQSPARIAHLVKELRKELDILLQEKIESPHPVDWNDTK 920 930 940 950 960 970 1360 pF1KE0 -----ILQIITELIKTENN .:. : .::::. CCDS31 SRDCAVLSAIIDLIKTQEKATPRNFPPRFQDGYYS 980 990 1000 >>CCDS54657.1 DHX36 gene_id:170506|Hs108|chr3 (994 aa) initn: 1310 init1: 449 opt: 1163 Z-score: 922.7 bits: 182.7 E(32554): 4.5e-45 Smith-Waterman score: 1914; 39.3% identity (68.8% similar) in 887 aa overlap (497-1367:138-976) 470 480 490 500 510 520 pF1KE0 LEWSDAEKKREELNKMETNKPRDLFIAKLLNKLKQQQQQ---QQQHSENKRENSEDPEES ::: :... :... :. : ..: CCDS54 KESEAQISWFAPEDHGYGTEVSTKNTPCSENKLDIQEKKLINQEKKMFRIRNRSYIDRDS 110 120 130 140 150 160 530 540 550 560 570 580 pF1KE0 WENLVSDEDFSALSLESANVEDLEPVRNLFRKLQSTPKYQKLLKERQQLPVFKHRDSIVE : :..... .. .:.. .:::. .: .: : .. . :..:: . . .:. CCDS54 -EYLLQENEPDG-TLDQKLLEDLQKKKNDLR-------YIEMQHFREKLPSYGMQKELVN 170 180 190 200 210 590 600 610 620 630 640 pF1KE0 TLKRHRVVVVAGETGSGKSTQVPHFLLEDLLLNEWEASKCNIVCTQPRRISAVSLANRVC . :.:.:..:::: ::.::: .:.:.. . .. ..: : :::::::::::.:.:.:: CCDS54 LIDNHQVTVISGETGCGKTTQVTQFILDNYI-ERGKGSACRIVCTQPRRISAISVAERVA 220 230 240 250 260 270 650 660 670 680 690 700 pF1KE0 DELGCENGPGGRNSLCGYQIRMESR-ACESTRLLYCTTGVLLRKLQEDGLLSNVSHVIVD : . : : :: :::::..:: .. .::::::..:. :: : ::.:::...: CCDS54 AERAESCGSG--NST-GYQIRLQSRLPRKQGSILYCTTGIILQWLQSDPYLSSVSHIVLD 280 290 300 310 320 330 710 720 730 740 750 760 pF1KE0 EVHERSVQSDFLLIILKEILQKRSDLHLILMSATVDSEKFSTYFTHCPILRISGRSYPVE :.:::..::: :. ..:..:. ::::..::::::...:::: :: .::...: : ..:: CCDS54 EIHERNLQSDVLMTVVKDLLNFRSDLKVILMSATLNAEKFSEYFGNCPMIHIPGFTFPVV 340 350 360 370 380 390 770 780 790 800 810 820 pF1KE0 VFHLEDIIEETGFVLEKDSEYCQKFLEEEEEVTINVTSKAGGIKKYQEYIPVQTGAHADL . :::.::. .: :. .:. ..: . . .: : :.: : . CCDS54 EYLLEDVIEKIRYVPEQ-KEHRSQFKRGFMQGHVNRQEKEEKEAIYKERWPDY------V 400 410 420 430 440 830 840 850 860 870 880 pF1KE0 NPFYQKYSSRTQHAILYMNPHKINLDLILELLAYLDKSPQFRNIEGAVLIFLPGLAHIQQ . ..::. : .: .:. :..:.::. :. :. ... .::.:.:::: .:. CCDS54 RELRRRYSASTVDVIEMMEDDKVDLNLIVALIRYI----VLEEEDGAILVFLPGWDNIST 450 460 470 480 490 500 890 900 910 920 930 940 pF1KE0 LYDLLSNDRRFYSERYKVIALHSILSTQDQAAAFTLPPPGVRKIVLATNIAETGITIPDV :.::: .. . ..:. .:: .: ::::::::.:::::::.::: :: CCDS54 LHDLLMSQ----------VMFKSVNQTQ----VFKRTPPGVRKIVIATNIAETSITIDDV 510 520 530 540 950 960 970 980 990 1000 pF1KE0 VFVIDTGRTKENKYHESSQMSSLVETFVSKASALQRQGRAGRVRDGFCFRMYTRERFEGF :.::: :. ::... ....:.. .::::.: ::.::::::. : :...:. : . CCDS54 VYVIDGGKIKETHFDTQNNISTMSAEWVSKANAKQRKGRAGRVQPGHCYHLYNGLRASLL 550 560 570 580 590 600 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KE0 MDYSVPEILRVPLEELCLHIMKCNLGSPEDFLSKALDPPQLQVISNAMNLLRKIGACELN ::..:::::.:::::::.: ::. :::. .:::. ... .. : ...: . . CCDS54 DDYQLPEILRTPLEELCLQIKILRLGGIAYFLSRLMDPPSNEAVLLSIRHLMELNALDKQ 610 620 630 640 650 660 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KE0 EPKLTPLGQHLAALPVNVKIGKMLIFGAIFGCLDPVATLAAVMTEKSPFTTPIGRKDEAD : .::::: ::: :::. .::::..:::.: ::::: :.:: .. :.::. :.:.. :: CCDS54 E-ELTPLGVHLARLPVEPHIGKMILFGALFCCLDPVLTIAASLSFKDPFVIPLGKEKIAD 670 680 690 700 710 720 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KE0 LAKSALAM-ADSDHLTIYNAYLGWKKARQEGGYRSEITYCRRNFLNRTSLLTLEDVKQEL .. :: . :::::. ::. ::..::..: .: : :: . ::. ..: :...: .. CCDS54 ARRKELAKDTRSDHLTVVNAFEGWEEARRRG-FRYEKDYCWEYFLSSNTLQMLHNMKGQF 730 740 750 760 770 780 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KE0 IKLVKAAGFSSSTTSTSWEGNRASQTLSFQEIALLKAVLVAGLYDNVGKIIYTKSVDVTE . . .::: :: . . :.: :.. . ..:::. :::: .:.:: .. . CCDS54 AEHLLGAGFVSSRNPKDPESNINSDNEK-----IIKAVICAGLYPKVAKI--RLNLGKKR 790 800 810 820 830 840 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KE0 KLACIVETAQGKAQVHPSSVNRDLQT---HGWLLYQEKIRYARVYLRETTLITPFPVLLF :.. . ..: . :::.::: . :: ..::.:. :.: . .:: . : ..:. .:.: CCDS54 KMVKVYTKTDGLVAVHPKSVNVE-QTDFHYNWLIYHLKMRTSSIYLYDCTEVSPYCLLFF 850 860 870 880 890 1300 1310 1320 1330 1340 1350 pF1KE0 GGDIEVQ--HRERLLSIDGWIYFQAPVKIAVIFKQLRVLIDSVLRKKLENPKMSLENDK- :::: .: . .. ...: :: ::.:..:: . :.:: .: .:..:.:.:. :: CCDS54 GGDISIQKDNDQETIAVDEWIVFQSPARIAHLVKELRKELDILLQEKIESPHPVDWNDTK 900 910 920 930 940 950 1360 pF1KE0 -----ILQIITELIKTENN .:. : .::::. CCDS54 SRDCAVLSAIIDLIKTQEKATPRNFPPRFQDGYYS 960 970 980 990 >>CCDS4113.1 YTHDC2 gene_id:64848|Hs108|chr5 (1430 aa) initn: 1384 init1: 479 opt: 1004 Z-score: 795.5 bits: 159.7 E(32554): 5.5e-38 Smith-Waterman score: 1376; 33.7% identity (58.8% similar) in 894 aa overlap (569-1300:190-1065) 540 550 560 570 580 590 pF1KE0 ESANVEDLEPVRNLFRKLQSTPKYQKLLKERQQLPVFKHRDSIVETLKRHRVVVVAGETG ::.::::.... ::. .:...::...:::: CCDS41 NREMSKTSGRLNNGIPQIPVKRGESEFDSFRQSLPVFEKQEEIVKIIKENKVVLIVGETG 160 170 180 190 200 210 600 610 620 630 640 650 pF1KE0 SGKSTQVPHFLLEDLLLNEWEASKCNIVCTQPRRISAVSLANRVCDELGCENGPGGRNSL :::.::.:.:::.: . : . : : ::::::..:...:.:: : . : . CCDS41 SGKTTQIPQFLLDDCFKN---GIPCRIFCTQPRRLAAIAVAERVAAERRERIG-----QT 220 230 240 250 260 270 660 670 680 690 700 710 pF1KE0 CGYQIRMESRACESTRLLYCTTGVLLRKLQE-DGLLSNVSHVIVDEVHERSVQSDFLLII :::::.:::. .: : .::.::::: :. :. ::.:.::::::::::. ::::: CCDS41 IGYQIRLESRVSPKTLLTFCTNGVLLRTLMAGDSTLSTVTHVIVDEVHERDRFSDFLLTK 280 290 300 310 320 330 720 730 740 750 760 770 pF1KE0 LKEILQKRSDLHLILMSATVDSEKFSTYFTHCPILRISGRSYPVEVFHLEDIIEETGFVL :...:::. :.::: ::..: . : :: ::.. :.:: . :. . ::::.. ::.. CCDS41 LRDLLQKHPTLKLILSSAALDVNLFIRYFGSCPVIYIQGRPFEVKEMFLEDILRTTGYTN 340 350 360 370 380 390 780 790 800 pF1KE0 EKDSEYCQKFLEEEEEVT-----------------------INVTSKA-----GG----- .. .: .. .::.. : .:::.. :: CCDS41 KEMLKYKKEKQQEEKQQTTLTEWYSAQENSFKPESQRQRTVLNVTDEYDLLDDGGDAVFS 400 410 420 430 440 450 810 820 830 pF1KE0 ------IKKYQEYIPVQTGA-------HADLNPFYQ--------------KYSSRTQHAI .. . .. . : : :.. : : ..: . :. CCDS41 QLTEKDVNCLEPWLIKEMDACLSDIWLHKDIDAFAQVFHLILTENVSVDYRHSETSATAL 460 470 480 490 500 510 840 850 860 pF1KE0 LYM-----------------NPHK------INLDL--------ILELLAYLDKSPQFRNI . : :. . :: :..:: . . .: :. CCDS41 MVAAGRGFASQVEQLISMGANVHSKASNGWMALDWAKHFGQTEIVDLLESYSATLEFGNL 520 530 540 550 560 570 870 pF1KE0 E--------------------------------------------------GAVLIFLPG . ::::::::: CCDS41 DESSLVQTNGSDLSAEDRELLKAYHHSFDDEKVDLDLIMHLLYNICHSCDAGAVLIFLPG 580 590 600 610 620 630 880 890 900 910 920 930 pF1KE0 LAHIQQLYD-LLSNDRRFY--SERYKVIALHSILSTQDQAAAFTLPPPGVRKIVLATNIA .: : : .: .:.:: ..::.:. ::: ..:.:: .. :: :::::.:.:::: CCDS41 YDEIVGLRDRILFDDKRFADSTHRYQVFMLHSNMQTSDQKKVLKNPPAGVRKIILSTNIA 640 650 660 670 680 690 940 950 960 970 980 990 pF1KE0 ETGITIPDVVFVIDTGRTKENKYHESSQMSSLVETFVSKASALQRQGRAGRVRDGFCFRM ::.::. :::::::.:..::... . .. : ...:::::.::.::::: : :.:::. CCDS41 ETSITVNDVVFVIDSGKVKEKSFDALNFVTMLKMVWISKASAIQRKGRAGRCRPGICFRL 700 710 720 730 740 750 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KE0 YTRERFEGFMDYSVPEILRVPLEELCLHI-MKCNLGSP-EDFLSKALDPPQLQVISNAMN ..: ::........::.::.::.::::: . .. : ::: :: .:: .. ::.. CCDS41 FSRLRFQNMLEFQTPELLRMPLQELCLHTKLLAPVNCPIADFLMKAPEPPPALIVRNAVQ 760 770 780 790 800 810 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KE0 LLRKIGACELNEPKLTPLGQHLAALPVNVKIGKMLIFGAIFGCLDPVATLAAVMTEKSPF .:. : : . : :: :: ::: :::. ..:::.. .... ::::. :.: ... ..:: CCDS41 MLKTIDAMDTWED-LTELGYHLADLPVEPHLGKMVLCAVVLKCLDPILTIACTLAYRDPF 820 830 840 850 860 870 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KE0 TTPI--GRKDEADLAKSAL-AMADSDHLTIYNAYLGWKKARQEGGYRSEITYCRRNFLNR . : ..: : : .. . : : :::... :. .:.:::..: :. .:..:::.. CCDS41 VLPTQASQKRAAMLCRKRFTAGAFSDHMALLRAFQAWQKARSDGWERA---FCEKNFLSQ 880 890 900 910 920 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KE0 TSLLTLEDVKQELIKLVKAAGFSSSTTSTSWEGNRASQTLSFQEIALLKAVLVAGLYDNV ... . .. .:. ..:.:: . . :. . . . .. :..::.::::.: :. CCDS41 ATMEIIIGMRTQLLGQLRASGFVRARGG----GDIRDVNTNSENWAVVKAALVAGMYPNL 930 940 950 960 970 980 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KE0 GKI-----IYT--KSVDVTEKLACIVETAQGKAQVHPSS----VNRDLQTHGWLLYQEKI .. . : : : . : .. : : .. :.. . . : : ::.:.: CCDS41 VHVDRENLVLTGPKEKKVRFHPASVLSQPQYK-KIPPANGQAAAIKALPTD-WLIYDEMT 990 1000 1010 1020 1030 1040 1280 1290 1300 1310 1320 1330 pF1KE0 RYARVY-LRETTLITPFPVLLFGGDIEVQHRERLLSIDGWIYFQAPVKIAVIFKQLRVLI : :. .: . .:: .:.: : CCDS41 RAHRIANIRCCSAVTPVTILVFCGPARLASNALQEPSSFRVDGIPNDSSDSEMEDKTTAN 1050 1060 1070 1080 1090 1100 >>CCDS2759.1 DHX30 gene_id:22907|Hs108|chr3 (1194 aa) initn: 1042 init1: 534 opt: 861 Z-score: 684.1 bits: 138.8 E(32554): 8.8e-32 Smith-Waterman score: 1441; 34.6% identity (64.7% similar) in 855 aa overlap (538-1365:406-1180) 510 520 530 540 550 560 pF1KE0 QHSENKRENSEDPEESWENLVSDEDFSALSLESANVEDLEPVRNLFRKLQSTPKYQKLLK ::. .:. . . .:.:. : .: CCDS27 LRLQSDDILPLGKDSGPLSDPITGKPYVPLLEAEEVRLSQSLLELWRR--RGPVWQ---- 380 390 400 410 420 570 580 590 600 610 620 pF1KE0 ERQQLPVFKHRDSIVETLKRHRVVVVAGETGSGKSTQVPHFLLEDLLLNEWEASKCNIVC : :::: :::.:......: :::..:.:: ::.:..:..::: . .: ....::.. CCDS27 EAPQLPVDPHRDTILNAIEQHPVVVISGDTGCGKTTRIPQLLLERYV-TEGRGARCNVII 430 440 450 460 470 480 630 640 650 660 670 680 pF1KE0 TQPRRISAVSLANRVCDELGCENGPGGRNSLCGYQIRMESRA-CESTRLLYCTTGVLLRK ::::::::::.:.:: ::: :. : .. :.:.:.::. .. ::.::.:.:::: CCDS27 TQPRRISAVSVAQRVSHELG----PSLRRNV-GFQVRLESKPPSRGGALLFCTVGILLRK 490 500 510 520 530 540 690 700 710 720 730 740 pF1KE0 LQEDGLLSNVSHVIVDEVHERSVQSDFLLIILKEILQKRSDLHLILMSATVDSEKFSTYF :: . : .::::::::::::.:..:::::.:: . . :.:.::::: :.:.:: :: CCDS27 LQSNPSLEGVSHVIVDEVHERDVNTDFLLILLKGLQRLNPALRLVLMSATGDNERFSRYF 550 560 570 580 590 600 750 760 770 780 790 800 pF1KE0 THCPILRISGRSYPVEVFHLEDIIEETGFVLEKDSEYCQKFLEEEEEVTINVTSKAGGIK ::.... : :::. .::::. . : CCDS27 GGCPVIKVPGFMYPVKEHYLEDILAKLG-------------------------------- 610 620 630 810 820 830 840 850 860 pF1KE0 KYQEYIPVQTGAHADLNPFYQKYSSRTQHAILYMNPHKINLDLILELLAYLDKSPQFRNI :.: :. : .... :. . :. .:::. .:. ..: :. CCDS27 KHQ-YL------HR-----HRHHESEDECAL--------DLDLVTDLVLHIDA----RGE 640 650 660 870 880 890 900 910 920 pF1KE0 EGAVLIFLPGLAHIQQLYDLLSNDRRFYSERYKVIALHSILSTQDQAAAFTLPPPGVRKI :..: :::: .:. . . :.. .. .: .. .:: . .:: : : :: ::::: CCDS27 PGGILCFLPGWQEIKGVQQRLQEALGMHESKYLILPVHSNIPMMDQKAIFQQPPVGVRKI 670 680 690 700 710 720 930 940 950 960 970 980 pF1KE0 VLATNIAETGITIPDVVFVIDTGRTKENKYHESSQMSSLVETFVSKASALQRQGRAGRVR :::::::::.::: :.: :.:.: ::..: ....: : ..::.:...::.::::: . CCDS27 VLATNIAETSITINDIVHVVDSGLHKEERYDLKTKVSCLETVWVSRANVIQRRGRAGRCQ 730 740 750 760 770 780 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE0 DGFCFRMYTRERFEGFMDYSVPEILRVPLEELCLHIMKCNLGSPE----DFLSKALDPPQ .:: .... : :.: .. ..::::::.:::.: ... .. :: .:::::.: :. CCDS27 SGFAYHLFPRSRLEKMVPFQVPEILRTPLENL---VLQAKIHMPEKTAVEFLSKAVDSPN 790 800 810 820 830 840 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KE0 LQVISNAMNLLRKIGACELNEPKLTPLGQHLAALPVNVKIGKMLIFGAIFGCLDPVATLA ......:. ::..::. . : :: :::.:: . .. ...: ....::: :: :. ... CCDS27 IKAVDEAVILLQEIGVLDQRE-YLTTLGQRLAHISTDPRLAKAIVLAAIFRCLHPLLVVV 850 860 870 880 890 900 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KE0 AVMTEKSPFTTPIGRKDEADLAKSALAM-ADSDHLTIYNAYLGWKKARQEGGYRSEITYC . .: ..::.. . . :.: .:. :. . ::::.. : ::... . :. .: CCDS27 SCLT-RDPFSSSLQNRAEVDKVKALLSHDSGSDHLAFVRAVAGWEEVLRWQDRSSRENYL 910 920 930 940 950 960 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KE0 RRNFLNRTSLLTLED-VKQELIKLVKA--AGFSSSTTSTSWEGNRASQTLSFQEIALLKA ..:.: :: .. .:: .. .: .: :. : .: . :. :. : :.:. CCDS27 EENLLYAPSLRFIHGLIKQFSENIYEAFLVGKPSDCTLASAQCNEYSE-----EEELVKG 970 980 990 1000 1010 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KE0 VLVAGLYDNVGKIIYTKSVDVTEKL---ACIVETAQGKAQVHPSSVNRD---LQTHGWLL ::.:::: :. .. : : :. . .: .:. .: :..::. :... :: CCDS27 VLMAGLYPNLIQVRQGK-VTRQGKFKPNSVTYRTKSGNILLHKSTINREATRLRSR-WLT 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KE0 YQEKIRY-ARVYLRETTLITPFPVLLF-GGDIEVQHRERL----LSIDGWIYFQAPVKIA : .. . :..:... . :. :::. ::.... : :: . . ... . . CCDS27 YFMAVKSNGSVFVRDSSQVHPLAVLLLTDGDVHIRDDGRRATISLSDSDLLRLEGDSRTV 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1330 1340 1350 1360 pF1KE0 VIFKQLRV----LIDSVLRKKLEN--PKMSLENDKILQIITELIKTENN ..:.:: ... ::..: :... :. ..: ...::.. CCDS27 RLLKELRRALGRMVERSLRSELAALPPSVQEEHGQLLALLAELLRGPCGSFDVRKTADD 1140 1150 1160 1170 1180 1190 >>CCDS41444.1 DHX9 gene_id:1660|Hs108|chr1 (1270 aa) initn: 1273 init1: 536 opt: 772 Z-score: 613.7 bits: 125.9 E(32554): 7.3e-28 Smith-Waterman score: 1559; 33.8% identity (63.1% similar) in 946 aa overlap (435-1365:249-1136) 410 420 430 440 450 460 pF1KE0 GRYWKCRVRVIKSEDDVLVVCPTILTEDGMQAQHLGATLALYRLVK---GQSVHQLLPPT : :::.. : :.: :..:. CCDS41 IKQLGRRIFAREHGSNKKLAAQSCALSLVRQLYHLGVVEAYSGLTKKKEGETVEPYKVNL 220 230 240 250 260 270 470 480 490 500 510 pF1KE0 YRDVWLEWSDAEKKREELNKMETNKPRDLFIAKLLN--KLKQQQQQQQQHSENKRENSED .: :: . .. .::: :.: . :: :: : . .:.:.. . : CCDS41 SQD--LE-HQLQNIIQELNLEILPPPEDPSVPVALNIGKLAQFEPSQRQNQVGVVPWSP- 280 290 300 310 320 330 520 530 540 550 560 570 pF1KE0 PEESWENLVSDE-DFSALSLESANVEDLEPVRNLFRKLQSTPKYQKLLKERQQLPVFKHR :. .:. .:.. : . :.. . . ... .:. .:.. : .:.::. ::: : . CCDS41 PQSNWNPWTSSNIDEGPLAFATPEQISMDLKNELMYQLEQDHDLQAILQERELLPVKKFE 340 350 360 370 380 390 580 590 600 610 620 630 pF1KE0 DSIVETLKRHRVVVVAGETGSGKSTQVPHFLLEDLLLNEWEASKCNIVCTQPRRISAVSL . :.:..... ::.. : :: ::.::::.:.:.:.. :. .:..:::: ::::::::::. CCDS41 SEILEAISQNSVVIIRGATGCGKTTQVPQFILDDFIQND-RAAECNIVVTQPRRISAVSV 400 410 420 430 440 450 640 650 660 670 680 690 pF1KE0 ANRVCDELGCENGPGGRNSLCGYQIRMES-RACESTRLLYCTTGVLLRKLQEDGLLSNVS :.:: : : : :: :::..:.:: . ...::.::::::: : :. ..: CCDS41 AERVAFERGEE--PGKS---CGYSVRFESILPRPHASIMFCTVGVLLRKL-EAGI-RGIS 460 470 480 490 500 700 710 720 730 740 750 pF1KE0 HVIVDEVHERSVQSDFLLIILKEILQKRSDLHLILMSATVDSEKFSTYFTHCPILRISGR ::::::.:::....::::..:....: .....:::::.:. : :: .:::... :: CCDS41 HVIVDEIHERDINTDFLLVVLRDVVQAYPEVRIVLMSATIDTSMFCEYFFNCPIIEVYGR 510 520 530 540 550 560 760 770 780 790 800 810 pF1KE0 SYPVEVFHLEDIIEETGFVLE-KDSEYCQKFLEEEEEVTINVTSKAGGIKKYQEYIPVQT .:::. . ::: :. : :: ::.. .: . :. : . : .:: : CCDS41 TYPVQEYFLEDCIQMTHFVPPPKDKKKKDKDDDGGEDDDANCNLICG-----DEYGP--- 570 580 590 600 610 820 830 840 850 860 870 pF1KE0 GAHADLNPFYQKYSSRTQHAILYMNPHKINLDLILELLAYLDKSPQFRNIEGAVLIFLPG .:. .. .: .. ..:: :: :.. :. ::::.:::: CCDS41 ---------------ETRLSMSQLNEKETPFELIEALLKYIETL----NVPGAVLVFLPG 620 630 640 650 880 890 900 910 920 930 pF1KE0 LAHIQQLYDLLSNDRRFYSERYKVIALHSILSTQDQAAAFTLPPPGVRKIVLATNIAETG : . : . .: :.::... ::: . ..: .: : :: :..:.::::::. CCDS41 WNLIYTMQKHLEMNPHFGSHRYQILPLHSQIPREEQRKVFDPVPVGVTKVILSTNIAETS 660 670 680 690 700 710 940 950 960 970 980 990 pF1KE0 ITIPDVVFVIDTGRTKENKYHESSQMSSLVETFVSKASALQRQGRAGRVRDGFCFRMYTR ::: :::.:::. . : . . ..:.. . ...::.. ::.::::::: ::::.. .: CCDS41 ITINDVVYVIDSCKQKVKLFTAHNNMTNYATVWASKTNLEQRKGRAGRVRPGFCFHLCSR 720 730 740 750 760 770 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KE0 ERFEGFMDYSVPEILRVPLEELCLHIMKCNLGSPEDFLSKALDPPQLQVISNAMNLLRKI ::: . . .::..:.::.:. : : ::. .::.::..:: :... .: . ::.. CCDS41 ARFERLETHMTPEMFRTPLHEIALSIKLLRLGGIGQFLAKAIEPPPLDAVIEAEHTLREL 780 790 800 810 820 830 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KE0 GACELNEPKLTPLGQHLAALPVNVKIGKMLIFGAIFGCLDPVATLAAVMTEKSPFTTPIG : . :. .:::::. :: ::.. ..:::.:.: :: : . :.::. :: . : CCDS41 DALDAND-ELTPLGRILAKLPIEPRFGKMMIMGCIFYVGDAICTIAAATCFPEPFINE-G 840 850 860 870 880 890 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KE0 RKDEADLAKSALAMADSDHLTIYNAYLGWKKARQEGGYRSEITYCRRNFLNRTSLLTLED .. . . .. . :::... ... .: ::. :: ..:: .:... :: ..: . CCDS41 KR-LGYIHRNFAGNRFSDHVALLSVFQAWDDARM-GGEEAEIRFCEHKRLNMATLRMTWE 900 910 920 930 940 950 1180 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KE0 VKQELIKLVKAAGFSSSTTSTSWEGNRASQTLSFQEIALLKAVLVAGLYDNVGKIIYTKS .: .: ... .:: . :. : . .. .. .. ..:. :.: :: : : CCDS41 AKVQLKEILINSGFPEDCLLTQVFTNTGPDN----NLDVVISLLAFGVYPNV---CYHK- 960 970 980 990 1000 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KE0 VDVTEKLACIVETAQGK-AQVHPSSVN-----RDLQTHG-WLLYQEKIRYARVYLRETTL :: . :..:. : .: :::: .:.. . .... :::: . . :: CCDS41 ----EKRK--ILTTEGRNALIHKSSVNCPFSSQDMKYPSPFFVFGEKIRTRAISAKGMTL 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1290 1300 1310 1320 1330 1340 pF1KE0 ITPFPVLLFGGDIEVQHRERLLSIDGWIYFQAPVKIAVIFKQLRVLIDSVLRKKLENPKM .::. .:::.. .:: ... .: :: .: . :. . ::. ..... . ..: . CCDS41 VTPLQLLLFASK-KVQSDGQIVLVDDWIKLQISHEAAACITGLRAAMEALVVEVTKQPAI 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1350 1360 pF1KE0 SLENDKILQIITELIKTENN . : . . . ..:. CCDS41 ISQLDPVNERMLNMIRQISRPSAAGINLMIGSTRYGDGPRPPKMARYDNGSGYRRGGSSY 1130 1140 1150 1160 1170 1180 >>CCDS1800.1 DHX57 gene_id:90957|Hs108|chr2 (1386 aa) initn: 1763 init1: 477 opt: 771 Z-score: 612.4 bits: 125.8 E(32554): 8.6e-28 Smith-Waterman score: 1966; 38.2% identity (68.1% similar) in 936 aa overlap (476-1351:445-1366) 450 460 470 480 490 500 pF1KE0 YRLVKGQSVHQLLPPTYRDVWLEWSDAEKKREELNKMETNK---PRDLFIAKLLNKLKQQ : ..:. .: : . :... . .... CCDS18 LEEESEIVKLLTNTHHKYSDPPVNFLPVPSRTRINNPACHKTVIPNNSFVSNQIPEVEKA 420 430 440 450 460 470 510 520 530 540 550 pF1KE0 QQQQQQHSENKRENSEDPEESWENL---VSDE-DFSALSLESANVEDLEPVRNLFRKLQS ...... .. .::. :: .: . :..: :... : . . . :: :. CCDS18 SESEESDEDDGPAPVIVENESYVNLKKKISKRYDWQAKSVHAENGK----ICKQFRMKQA 480 490 500 510 520 530 560 570 580 590 600 610 pF1KE0 TPKYQKLLKERQQLPVFKHRDSIVETLKRHRVVVVAGETGSGKSTQVPHFLLEDLLLNEW . ..:..:.:::.::....:..:.. :..:.:::..: :: ::.::.:.:.:.: : : CCDS18 SRQFQSILQERQSLPAWEERETILNLLRKHQVVVISGMTGCGKTTQIPQFILDDSL-NGP 540 550 560 570 580 620 630 640 650 660 670 pF1KE0 EASKCNIVCTQPRRISAVSLANRVCDELGCENGPGGRNSLCGYQIRMESRACESTRLLYC . ::.:::::::::.:.:.:: : . . : :::::.:: .:::::: CCDS18 PEKVANIICTQPRRISAISVAERVAKERAERVG-----LTVGYQIRLESVKSSATRLLYC 590 600 610 620 630 640 680 690 700 710 720 730 pF1KE0 TTGVLLRKLQEDGLLSNVSHVIVDEVHERSVQSDFLLIILKEILQKRSDLHLILMSATVD :::::::.:. : :..:::.::::::::. .:::::..::.:...: :..::::::.. CCDS18 TTGVLLRRLEGDTALQGVSHIIVDEVHERTEESDFLLLVLKDIVSQRPGLQVILMSATLN 650 660 670 680 690 700 740 750 760 770 780 pF1KE0 SEKFSTYFTHCPILRISGRSYPVEVFHLEDIIEETGFVLEKDSEYCQKFLE--------- .: :: ::. ::.. : ::..::. : ::: : : .::. : : ... . CCDS18 AELFSDYFNSCPVITIPGRTFPVDQFFLEDAIAVTRYVLQDGSPYMRSMKQISKEKLKAR 710 720 730 740 750 760 790 800 810 820 830 840 pF1KE0 ------EEEEVTINVTSKAGGIKKYQEYIPVQTGAHADLNPFYQKYSSRTQHAILYMNPH :: : . .. . . .. .: : .: :. :. . ... :. . CCDS18 RNRTAFEEVEEDLRLSLHLQDQDSVKDAVPDQQLDFKQLLARYKGVSKSVIKTMSIMDFE 770 780 790 800 810 820 850 860 870 880 890 pF1KE0 KINLDLILELLAYL-DKSPQFRNIEGAVLIFLPGLAHIQQLYDLLSNDRRF---YSERYK :.::.:: :: .. : . .. ::.:.::::::.:..::. :... : :.: CCDS18 KVNLELIEALLEWIVDGKHSYP--PGAILVFLPGLAEIKMLYEQLQSNSLFNNRRSNRCV 830 840 850 860 870 880 900 910 920 930 940 950 pF1KE0 VIALHSILSTQDQAAAFTLPPPGVRKIVLATNIAETGITIPDVVFVIDTGRTKENKYHES . ::: ::...: :.:. :: :: ::...::::::.::: :::.:::.:. ::..: : CCDS18 IHPLHSSLSSEEQQAVFVKPPAGVTKIIISTNIAETSITIDDVVYVIDSGKMKEKRYDAS 890 900 910 920 930 940 960 970 980 990 1000 1010 pF1KE0 SQMSSLVETFVSKASALQRQGRAGRVRDGFCFRMYTRERFEG-FMDYSVPEILRVPLEEL . : :: .::::.:.::::.:::::: .: ::...: .... .. ..::: :::::.: CCDS18 KGMESLEDTFVSQANALQRKGRAGRVASGVCFHLFTSHHYNHQLLKQQLPEIQRVPLEQL 950 960 970 980 990 1000 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KE0 CLHIMKCNLGSPEDF---LSKALDPPQLQVISNAMNLLRKIGACELNEPKLTPLGQHLAA ::.: .. : ... .:. ..::. . . . :: .:: .: .::::: :::. CCDS18 CLRIKILEMFSAHNLQSVFSRLIEPPHTDSLRASKIRLRDLGALTPDE-RLTPLGYHLAS 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KE0 LPVNVKIGKMLIFGAIFGCLDPVATLAAVMTEKSPFTTPIGRKDEADLAKSALAMADSDH :::.:.:::...::.:: ::::. :.:: .. ::::..: .:.::. : .:.:.::. CCDS18 LPVDVRIGKLMLFGSIFRCLDPALTIAASLAFKSPFVSPWDKKEEANQKKLEFAFANSDY 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KE0 LTIYNAYLGWKKARQEGGYRSEITYCRRNFLNRTSLLTLEDVKQELIKLVKAAGFS---- :.. .:: ::. . .:: :. .:::.:::. : . ..:... .:.. ::. CCDS18 LALLQAYKGWQLSTKEG-VRASYNYCRQNFLSGRVLQEMASLKRQFTELLSDIGFAREGL 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1200 1210 1220 1230 pF1KE0 -SSTTSTSWEGNRASQTLSFQEIA-------LLKAVLVAGLYDNV-------GKIIYTKS . .:. . . .: :..:.: :.:: :: ::. :.. CCDS18 RAREIEKRAQGGDGVLDATGEEANSNAENPKLISAMLCAALYPNVVQVKSPEGKFQKTST 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1240 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KE0 --VDVTEKLACI--VETAQGKAQVHPSSVNRDLQTHG--WLLYQEKIRYARVYLRETTLI : . : : . : .: ...:::::: ... .:::.:::. .::..:. ... CCDS18 GAVRMQPKSAELKFVTKNDGYVHIHPSSVNYQVRHFDSPYLLYHEKIKTSRVFIRDCSMV 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1300 1310 1320 1330 1340 pF1KE0 TPFPVLLFGG---DIEVQHRERLLSID-GWIYFQAPV-KIAVIFKQLRVLIDSVLRKKLE . .:..:::: ....:. : ..:.: ::: : : ..: . :.:: .:..:. :.. CCDS18 SVYPLVLFGGGQVNVQLQRGEFVVSLDDGWIRFVAASHQVAELVKELRCELDQLLQDKIK 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1350 1360 pF1KE0 NPKMSLENDKILQIITELIKTENN ::...: CCDS18 NPSIDLCTCPRGSRIISTIVKLVTTQ 1370 1380 >>CCDS12700.1 DHX34 gene_id:9704|Hs108|chr19 (1143 aa) initn: 1311 init1: 442 opt: 748 Z-score: 595.4 bits: 122.3 E(32554): 7.6e-27 Smith-Waterman score: 1190; 35.7% identity (61.9% similar) in 638 aa overlap (553-1190:143-696) 530 540 550 560 570 580 pF1KE0 SWENLVSDEDFSALSLESANVEDLEPVRNLFRKLQSTPKYQKLLKERQQLPVFKHRDSIV : . :. . :: .:: ::. .. . :. CCDS12 PATRGSQGLGRHLPAERVAEFRRALLHYLDFGQKQAFGRLAKLQRERAALPIAQYGNRIL 120 130 140 150 160 170 590 600 610 620 630 640 pF1KE0 ETLKRHRVVVVAGETGSGKSTQVPHFLLEDLLLNEWEASKCNIVCTQPRRISAVSLANRV .:::.:.::::::.:: :::::::..:: :. ...:::::::. .:::.:: CCDS12 QTLKEHQVVVVAGDTGCGKSTQVPQYLLA--------AGFSHVACTQPRRIACISLAKRV 180 190 200 210 220 650 660 670 680 690 700 pF1KE0 CDELGCENGPGGRNSLCGYQIRMESRACESTRLLYCTTGVLLRKLQEDGLLSNVSHVIVD : . : : :::::.:: .:.... :.:.:::..:.. : . .::: CCDS12 GFESLSQYG-----SQVGYQIRFESTRSAATKIVFLTVGLLLRQIQREPSLPQYEVLIVD 230 240 250 260 270 710 720 730 740 750 760 pF1KE0 EVHERSVQSDFLLIILKEILQKRSDLHLILMSATVDSEKFSTYFTHCPILRISGRSYPVE ::::: ...:::: .:...: : ::..::::::.. ::.::.. :.... :: .:. CCDS12 EVHERHLHNDFLLGVLQRLLPTRPDLKVILMSATINISLFSSYFSNAPVVQVPGRLFPIT 280 290 300 310 320 330 770 780 790 800 810 820 pF1KE0 VFHLEDIIEETGFVLEKDSEYCQKFLEEEEEVTINVTSKAGGIKKYQEYIPVQTGAHADL : . .: : : :::. . : CCDS12 VV----------------------YQPQEAEPT---TSKSEKL---------------DP 340 350 830 840 850 860 870 880 pF1KE0 NPFYQKYSSRTQHAILYMNPHKINLDLILELLAYLDKSPQFRNIEGAVLIFLPGLAHIQQ :: . .: :: :. : : .:.:: :.:.:. CCDS12 RPFLR---------VLESIDHKY--------------PPEER---GDLLVFLSGMAEISA 360 370 380 390 890 900 910 920 930 940 pF1KE0 LYDLLSNDRRFYSERYKVIALHSILSTQDQAAAFTLPPPGVRKIVLATNIAETGITIPDV . . .. ...:. :. ::: ::. :: .: . :::::: .:.::::::..:: . CCDS12 VLEA-AQTYASHTQRWVVLPLHSALSVADQDKVFDVAPPGVRKCILSTNIAETSVTIDGI 400 410 420 430 440 450 950 960 970 980 990 1000 pF1KE0 VFVIDTGRTKENKYHESSQMSSLVETFVSKASALQRQGRAGRVRDGFCFRMYTRERFEGF ::.:.:..:: .: ..... : : ..:.::: ::.:::::. : :::.:.. ...: CCDS12 RFVVDSGKVKEMSYDPQAKLQRLQEFWISQASAEQRKGRAGRTGPGVCFRLYAESDYDAF 460 470 480 490 500 510 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KE0 MDYSVPEILRVPLEELCLHIMKCNLGSPEDFLSKALDPPQLQVISNAMNLLRKIGACELN : :::: :: :. : :.. . ..:.:. : ..:: . .:. :: :: . . CCDS12 APYPVPEIRRVALDSLVLQMKSMSVGDPRTF--PFIEPPPPASLETAILYLRDQGALDSS 520 530 540 550 560 570 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KE0 EPKLTPLGQHLAALPVNVKIGKMLIFGAIFGCLDPVATLAAVMTEKSPFTTPIGRKDEAD : :::.:. :: :::.: ::::::.:..:. ..:: :.::... .:::: . : CCDS12 EA-LTPIGSLLAQLPVDVVIGKMLILGSMFSLVEPVLTIAAALSVQSPFTRSAQSSPECA 580 590 600 610 620 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KE0 LAKSALAMADSDHLTIYNAYLGWKKARQEGGYRSEITYCRRNFLNRTSLLTLEDVKQELI :. : ..: .:..:.. .: ....: . :. .::: ... : . ...... CCDS12 AARRPLESDQGDPFTLFNVFNAWVQVKSERS-RNSRKWCRRRGIEEHRLYEMANLRRQFK 630 640 650 660 670 680 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KE0 KLVKAAGFSSSTTSTSWEGNRASQTLSFQEIALLKAVLVAGLYDNVGKIIYTKSVDVTEK .:.. :. CCDS12 ELLEDHGLLAGAQAAQVGDSYSRLQQRRERRALHQLKRQHEEGAGRRRKVLRLQEEQDGG 690 700 710 720 730 740 >>CCDS33966.1 DHX15 gene_id:1665|Hs108|chr4 (795 aa) initn: 1079 init1: 345 opt: 647 Z-score: 518.1 bits: 107.5 E(32554): 1.5e-22 Smith-Waterman score: 1124; 31.0% identity (56.7% similar) in 838 aa overlap (463-1292:40-755) 440 450 460 470 480 490 pF1KE0 GMQAQHLGATLALYRLVKGQSVHQLLPPTYRDVWLEWSDAEKKREELNKMETNKPRD-LF :: . .: :..::. .. : . .. CCDS33 GEDYPSGKKRAGTDGKDRDRDRDREDRSKDRDRERDRGDREREREKEKEKELRASTNAML 10 20 30 40 50 60 500 510 520 530 540 550 pF1KE0 IAKLLNKLKQQQQQQQQHSENKRENSEDPEESWENLVSDEDFSALSLESANVEDLEPVRN :. : :: ... .. :: .. ..... . . . :. .: : CCDS33 ISAGLPPLKASHSAHSTHSAHSTHSTHSAHSTHAG-------------HAGHTSLPQCIN 70 80 90 100 110 560 570 580 590 600 610 pF1KE0 LFRKLQSTPKYQKLLKERQQLPVFKHRDSIVETLKRHRVVVVAGETGSGKSTQVPHFLLE : .: ::.: .::.: ::::....: ... : ::. :..:::::::.::.:.. .: CCDS33 PFTNLPHTPRYYDILKKRLQLPVWEYKDRFTDILVRHQSFVLVGETGSGKTTQIPQWCVE 120 130 140 150 160 170 620 630 640 650 660 670 pF1KE0 DLLLNEWEASKCNIVCTQPRRISAVSLANRVCDELGCENGPGGRNSLCGYQIRMESRACE . . : ...::::::..:.:.:.:: ::. : . ::.::.:. . CCDS33 --YMRSLPGPKRGVACTQPRRVAAMSVAQRVADEMDVMLG-----QEVGYSIRFEDCSSA 180 190 200 210 220 680 690 700 710 720 730 pF1KE0 STRLLYCTTGVLLRKLQEDGLLSNVSHVIVDEVHERSVQSDFLLIILKEILQKRSDLHLI .: : : : :.:::. ..: :: . .:.::.:::.. .:.:. .:::....::::..: CCDS33 KTILKYMTDGMLLREAMNDPLLERYGVIILDEAHERTLATDILMGVLKEVVRQRSDLKVI 230 240 250 260 270 280 740 750 760 770 780 790 pF1KE0 LMSATVDSEKFSTYFTHCPILRISGRSYPVEVFHLEDIIEETGFVLEKDSEYCQKFLEEE .::::.:. ::. :: .::.: : ::..:::.:. . : .. : . :: CCDS33 VMSATLDAGKFQIYFDNCPLLTIPGRTHPVEIFYTPE--PERDYLEAAIRTVIQIHMCEE 290 300 310 320 330 340 800 810 820 830 840 850 pF1KE0 EEVTINVTSKAGGIKKYQEYIPVQTGAHADLNPFYQKYSSRTQHAILYMNPHKINLDLIL :: : ::.: CCDS33 EE----------G-------------------------------------------DLLL 350 860 870 880 890 900 910 pF1KE0 ELLAYLDKSPQFRNIEGAVLIFLPGLAHIQQLYDLLSNDRRFYSERYKVIALHSILSTQD : . . . . :. : . : .. : :.: :.: : :. CCDS33 FLTGQEEIDEACKRIKREVDDLGPEVGDI------------------KIIPLYSTLPPQQ 360 370 380 390 920 930 940 950 960 pF1KE0 QAAAFTLPPP----GV--RKIVLATNIAETGITIPDVVFVIDTGRTKENKYHESSQMSSL : : ::: :. ::.:..::::::..:: :::::: : .:.. :. .. :: CCDS33 QQRIFEPPPPKKQNGAIGRKVVVSTNIAETSLTIDGVVFVIDPGFAKQKVYNPRIRVESL 400 410 420 430 440 450 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KE0 VETFVSKASALQRQGRAGRVRDGFCFRMYTRERFEGFM-DYSVPEILRVPLEELCLHIMK . : .::::: :: :::::.: : :::.::.. .. : : . ::::: : . :.. : CCDS33 LVTAISKASAQQRAGRAGRTRPGKCFRLYTEKAYKTEMQDNTYPEILRSNLGSVVLQLKK 460 470 480 490 500 510 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KE0 CNLGSPEDFLSKALDPPQLQVISNAMNLLRKIGACELNEPKLTPLGQHLAALPVNVKIGK :: . .::: ... :..:: ..: . .. :: ::. .: .:.. ...: CCDS33 --LGIDDLVHFDFMDPPAPETLMRALELLNYLAALN-DDGDLTELGSMMAEFPLDPQLAK 520 530 540 550 560 570 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KE0 MLIFGAIFGCLDPVATLAAVMTEKSPFTTPIGRKDEADLAKSALAMADSDHLTIYNAYLG :.: . ..: . : ...:... . :. : : :: :: .: :.::::. :.: . 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