Result of FASTA (ccds) for
pFN21AB9932
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB9932, 638 aa
1>>>pF1KB9932 638 - 638 aa - 638 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3331+/-0.00108; mu= 19.4403+/- 0.065
mean_var=75.3030+/-15.148, 0's: 0 Z-trim(104.5): 178 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.147798
statistics sampled from 7736 (7915) to 7736 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.603), E-opt: 0.2 (0.243), width: 16
Scan time: 3.450
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34120.1 KLKB1 gene_id:3818|Hs108|chr4 ( 638) 4456 960.2 0
CCDS82982.1 KLKB1 gene_id:3818|Hs108|chr4 ( 514) 3438 743.0 2.3e-214
CCDS3847.1 F11 gene_id:2160|Hs108|chr4 ( 625) 2687 583.0 4.2e-166
CCDS58185.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 ( 563) 768 173.7 5.9e-43
CCDS33564.1 TMPRSS2 gene_id:7113|Hs108|chr21 ( 492) 767 173.5 6.1e-43
CCDS54486.1 TMPRSS2 gene_id:7113|Hs108|chr21 ( 529) 767 173.5 6.5e-43
CCDS55788.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 ( 532) 757 171.4 2.8e-42
CCDS41721.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 ( 567) 757 171.4 3e-42
CCDS74856.1 TMPRSS6 gene_id:164656|Hs108|chr22 ( 802) 757 171.5 3.9e-42
CCDS13941.1 TMPRSS6 gene_id:164656|Hs108|chr22 ( 811) 757 171.5 4e-42
CCDS58790.1 TMPRSS3 gene_id:64699|Hs108|chr21 ( 453) 751 170.0 6.1e-42
CCDS13686.1 TMPRSS3 gene_id:64699|Hs108|chr21 ( 454) 740 167.7 3.1e-41
CCDS73391.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11 ( 413) 726 164.7 2.3e-40
CCDS73392.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11 ( 448) 726 164.7 2.4e-40
CCDS44735.1 TMPRSS5 gene_id:80975|Hs108|chr11 ( 457) 726 164.7 2.5e-40
CCDS13571.1 TMPRSS15 gene_id:5651|Hs108|chr21 (1019) 721 163.9 9.7e-40
CCDS32993.1 HPN gene_id:3249|Hs108|chr19 ( 417) 710 161.3 2.4e-39
CCDS10430.1 TPSG1 gene_id:25823|Hs108|chr16 ( 321) 681 155.0 1.4e-37
CCDS12088.1 TMPRSS9 gene_id:360200|Hs108|chr19 (1059) 671 153.2 1.6e-36
CCDS5976.1 PRSS55 gene_id:203074|Hs108|chr8 ( 352) 658 150.1 4.6e-36
CCDS76482.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 290) 655 149.4 6.2e-36
CCDS53717.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 397) 655 149.5 8e-36
CCDS44743.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 432) 655 149.6 8.5e-36
CCDS53716.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 435) 655 149.6 8.6e-36
CCDS31684.1 TMPRSS4 gene_id:56649|Hs108|chr11 ( 437) 655 149.6 8.6e-36
CCDS75122.1 CORIN gene_id:10699|Hs108|chr4 ( 938) 658 150.4 1e-35
CCDS3477.1 CORIN gene_id:10699|Hs108|chr4 (1042) 658 150.5 1.1e-35
CCDS10481.1 PRSS22 gene_id:64063|Hs108|chr16 ( 317) 650 148.4 1.4e-35
CCDS43129.2 TMPRSS7 gene_id:344805|Hs108|chr3 ( 717) 654 149.5 1.5e-35
CCDS8487.1 ST14 gene_id:6768|Hs108|chr11 ( 855) 654 149.6 1.7e-35
CCDS3520.1 TMPRSS11F gene_id:389208|Hs108|chr4 ( 438) 644 147.2 4.4e-35
CCDS3521.1 TMPRSS11B gene_id:132724|Hs108|chr4 ( 416) 634 145.1 1.8e-34
CCDS1563.1 PRSS38 gene_id:339501|Hs108|chr1 ( 326) 632 144.6 2e-34
CCDS10431.1 TPSAB1 gene_id:7177|Hs108|chr16 ( 275) 629 143.9 2.8e-34
CCDS3518.1 TMPRSS11D gene_id:9407|Hs108|chr4 ( 418) 623 142.7 9.4e-34
CCDS74669.1 PRSS56 gene_id:646960|Hs108|chr2 ( 603) 621 142.4 1.7e-33
CCDS83495.1 F9 gene_id:2158|Hs108|chrX ( 423) 619 141.9 1.7e-33
CCDS14666.1 F9 gene_id:2158|Hs108|chrX ( 461) 619 141.9 1.8e-33
CCDS44881.1 TMPRSS12 gene_id:283471|Hs108|chr12 ( 348) 617 141.4 2e-33
CCDS32490.1 CTRB1 gene_id:1504|Hs108|chr16 ( 263) 612 140.2 3.3e-33
CCDS32489.1 CTRB2 gene_id:440387|Hs108|chr16 ( 263) 606 139.0 8e-33
CCDS33993.1 TMPRSS11E gene_id:28983|Hs108|chr4 ( 423) 602 138.3 2.1e-32
CCDS73602.1 F7 gene_id:2155|Hs108|chr13 ( 382) 600 137.8 2.6e-32
CCDS9529.1 F7 gene_id:2155|Hs108|chr13 ( 444) 600 137.8 2.9e-32
CCDS9528.1 F7 gene_id:2155|Hs108|chr13 ( 466) 600 137.9 3.1e-32
CCDS3709.1 PRSS12 gene_id:8492|Hs108|chr4 ( 875) 603 138.7 3.2e-32
CCDS3369.1 HGFAC gene_id:3083|Hs108|chr4 ( 655) 601 138.2 3.5e-32
CCDS46816.1 PRSS42 gene_id:339906|Hs108|chr3 ( 293) 596 136.9 3.8e-32
CCDS5279.1 PLG gene_id:5340|Hs108|chr6 ( 810) 600 138.0 4.7e-32
CCDS10852.1 CTRL gene_id:1506|Hs108|chr16 ( 264) 593 136.2 5.5e-32
>>CCDS34120.1 KLKB1 gene_id:3818|Hs108|chr4 (638 aa)
initn: 4456 init1: 4456 opt: 4456 Z-score: 5133.9 bits: 960.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4456; 100.0% identity (100.0% similar) in 638 aa overlap (1-638:1-638)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MILFKQATYFISLFATVSCGCLTQLYENAFFRGGDVASMYTPNAQYCQMRCTFHPRCLLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MILFKQATYFISLFATVSCGCLTQLYENAFFRGGDVASMYTPNAQYCQMRCTFHPRCLLF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 SFLPASSINDMEKRFGCFLKDSVTGTLPKVHRTGAVSGHSLKQCGHQISACHRDIYKGVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SFLPASSINDMEKRFGCFLKDSVTGTLPKVHRTGAVSGHSLKQCGHQISACHRDIYKGVD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 MRGVNFNVSKVSSVEECQKRCTSNIRCQFFSYATQTFHKAEYRNNCLLKYSPGGTPTAIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MRGVNFNVSKVSSVEECQKRCTSNIRCQFFSYATQTFHKAEYRNNCLLKYSPGGTPTAIK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 VLSNVESGFSLKPCALSEIGCHMNIFQHLAFSDVDVARVLTPDAFVCRTICTYHPNCLFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VLSNVESGFSLKPCALSEIGCHMNIFQHLAFSDVDVARVLTPDAFVCRTICTYHPNCLFF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 TFYTNVWKIESQRNVCLLKTSESGTPSSSTPQENTISGYSLLTCKRTLPEPCHSKIYPGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TFYTNVWKIESQRNVCLLKTSESGTPSSSTPQENTISGYSLLTCKRTLPEPCHSKIYPGV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 DFGGEELNVTFVKGVNVCQETCTKMIRCQFFTYSLLPEDCKEEKCKCFLRLSMDGSPTRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DFGGEELNVTFVKGVNVCQETCTKMIRCQFFTYSLLPEDCKEEKCKCFLRLSMDGSPTRI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 AYGTQGSSGYSLRLCNTGDNSVCTTKTSTRIVGGTNSSWGEWPWQVSLQVKLTAQRHLCG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AYGTQGSSGYSLRLCNTGDNSVCTTKTSTRIVGGTNSSWGEWPWQVSLQVKLTAQRHLCG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 GSLIGHQWVLTAAHCFDGLPLQDVWRIYSGILNLSDITKDTPFSQIKEIIIHQNYKVSEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GSLIGHQWVLTAAHCFDGLPLQDVWRIYSGILNLSDITKDTPFSQIKEIIIHQNYKVSEG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 NHDIALIKLQAPLNYTEFQKPICLPSKGDTSTIYTNCWVTGWGFSKEKGEIQNILQKVNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NHDIALIKLQAPLNYTEFQKPICLPSKGDTSTIYTNCWVTGWGFSKEKGEIQNILQKVNI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 PLVTNEECQKRYQDYKITQRMVCAGYKEGGKDACKGDSGGPLVCKHNGMWRLVGITSWGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PLVTNEECQKRYQDYKITQRMVCAGYKEGGKDACKGDSGGPLVCKHNGMWRLVGITSWGE
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KB9 GCARREQPGVYTKVAEYMDWILEKTQSSDGKAQMQSPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GCARREQPGVYTKVAEYMDWILEKTQSSDGKAQMQSPA
610 620 630
>>CCDS82982.1 KLKB1 gene_id:3818|Hs108|chr4 (514 aa)
initn: 3843 init1: 3438 opt: 3438 Z-score: 3962.1 bits: 743.0 E(32554): 2.3e-214
Smith-Waterman score: 3438; 99.4% identity (100.0% similar) in 494 aa overlap (39-532:1-494)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 YFISLFATVSCGCLTQLYENAFFRGGDVASMYTPNAQYCQMRCTFHPRCLLFSFLPASSI
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MYTPNAQYCQMRCTFHPRCLLFSFLPASSI
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 NDMEKRFGCFLKDSVTGTLPKVHRTGAVSGHSLKQCGHQISACHRDIYKGVDMRGVNFNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 NDMEKRFGCFLKDSVTGTLPKVHRTGAVSGHSLKQCGHQISACHRDIYKGVDMRGVNFNV
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 SKVSSVEECQKRCTSNIRCQFFSYATQTFHKAEYRNNCLLKYSPGGTPTAIKVLSNVESG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SKVSSVEECQKRCTSNIRCQFFSYATQTFHKAEYRNNCLLKYSPGGTPTAIKVLSNVESG
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 FSLKPCALSEIGCHMNIFQHLAFSDVDVARVLTPDAFVCRTICTYHPNCLFFTFYTNVWK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 FSLKPCALSEIGCHMNIFQHLAFSDVDVARVLTPDAFVCRTICTYHPNCLFFTFYTNVWK
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 IESQRNVCLLKTSESGTPSSSTPQENTISGYSLLTCKRTLPEPCHSKIYPGVDFGGEELN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 IESQRNVCLLKTSESGTPSSSTPQENTISGYSLLTCKRTLPEPCHSKIYPGVDFGGEELN
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 VTFVKGVNVCQETCTKMIRCQFFTYSLLPEDCKEEKCKCFLRLSMDGSPTRIAYGTQGSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VTFVKGVNVCQETCTKMIRCQFFTYSLLPEDCKEEKCKCFLRLSMDGSPTRIAYGTQGSS
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 GYSLRLCNTGDNSVCTTKTSTRIVGGTNSSWGEWPWQVSLQVKLTAQRHLCGGSLIGHQW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GYSLRLCNTGDNSVCTTKTSTRIVGGTNSSWGEWPWQVSLQVKLTAQRHLCGGSLIGHQW
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 VLTAAHCFDGLPLQDVWRIYSGILNLSDITKDTPFSQIKEIIIHQNYKVSEGNHDIALIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VLTAAHCFDGLPLQDVWRIYSGILNLSDITKDTPFSQIKEIIIHQNYKVSEGNHDIALIK
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 LQAPLNYTEFQKPICLPSKGDTSTIYTNCWVTGWGFSKEKGEIQNILQKVNIPLVTNEEC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::...
CCDS82 LQAPLNYTEFQKPICLPSKGDTSTIYTNCWVTGWGFSKEKGRFRWSLSLQTQWNVAFGGH
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 QKRYQDYKITQRMVCAGYKEGGKDACKGDSGGPLVCKHNGMWRLVGITSWGEGCARREQP
CCDS82 HQLG
>>CCDS3847.1 F11 gene_id:2160|Hs108|chr4 (625 aa)
initn: 3042 init1: 1445 opt: 2687 Z-score: 3095.5 bits: 583.0 E(32554): 4.2e-166
Smith-Waterman score: 2687; 58.5% identity (83.4% similar) in 627 aa overlap (1-627:1-624)
10 20 30 40 50 60
pF1KB9 MILFKQATYFISLFATVSCGCLTQLYENAFFRGGDVASMYTPNAQYCQMRCTFHPRCLLF
::.. :...:: ::..:: :.::: ... :.:::.....::.:.:::. ::.:::::::
CCDS38 MIFLYQVVHFI-LFTSVSGECVTQLLKDTCFEGGDITTVFTPSAKYCQVVCTYHPRCLLF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB9 SFLPASSINDMEKRFGCFLKDSVTGTLPKVHRTGAVSGHSLKQCGHQISACHRDIYKGVD
.: : .: . : : :::::: :::.:.::.:.::.:.:::.::::::..::: .:
CCDS38 TFTAESPSEDPTRWFTCVLKDSVTETLPRVNRTAAISGYSFKQCSHQISACNKDIYVDLD
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB9 MRGVNFNVSKVSSVEECQKRCTSNIRCQFFSYATQTFHKAEYRNNCLLKYSPGGTPTAIK
:.:.:.: : ..:..:::.:::....:.::.:::. : . :.:: ::::.. :::: :
CCDS38 MKGINYNSSVAKSAQECQERCTDDVHCHFFTYATRQFPSLEHRNICLLKHTQTGTPTRIT
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB9 VLSNVESGFSLKPCALSEIGCHMNIFQHLAFSDVDVARVLTPDAFVCRTICTYHPNCLFF
:..: :::::: ::::...: .:: . .:.: .. :..:::::: :::.::.::::
CCDS38 KLDKVVSGFSLKSCALSNLACIRDIFPNTVFADSNIDSVMAPDAFVCGRICTHHPGCLFF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB9 TFYTNVWKIESQRNVCLLKTSESGTPSSSTPQENTISGYSLLTCKRTLPEPCHSKIYPGV
::... : :::::.::::::::: ::. . ...::.:: .:....: :::..: .
CCDS38 TFFSQEWPKESQRNLCLLKTSESGLPSTRIKKSKALSGFSLQSCRHSIPVFCHSSFYHDT
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB9 DFGGEELNVTFVKGVNVCQETCTKMIRCQFFTYSLLPEDCKEEKCKCFLRLSMDGSPTRI
:: ::::... .:. ..::. ::. .:::::::. .:.: : ::.:.:: .::::.:
CCDS38 DFLGEELDIVAAKSHEACQKLCTNAVRCQFFTYTPAQASCNEGKGKCYLKLSSNGSPTKI
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB9 AYGTQGSSGYSLRLCNTGDNSVCTTKTSTRIVGGTNSSWGEWPWQVSLQVKLTAQRHLCG
.: : :::.::::. :: :::: . :::::: : :::::::.:.. .::::::
CCDS38 LHGRGGISGYTLRLCKM-DNE-CTTKIKPRIVGGTASVRGEWPWQVTLHTTSPTQRHLCG
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB9 GSLIGHQWVLTAAHCFDGLPLQDVWRIYSGILNLSDITKDTPFSQIKEIIIHQNYKVSEG
::.::.::.::::::: :. . :.:::::: :.: .:: : ..:::::..::..:.
CCDS38 GSIIGNQWILTAAHCFYGVESPKILRVYSGILNQSEIKEDTSFFGVQEIIIHDQYKMAES
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB9 NHDIALIKLQAPLNYTEFQKPICLPSKGDTSTIYTNCWVTGWGFSKEKGEIQNILQKVNI
..::::.::.. .:::. :.::::::::: ..:::.:::::::. : . .::: :::..:
CCDS38 GYDIALLKLETTVNYTDSQRPICLPSKGDRNVIYTDCWVTGWGYRKLRDKIQNTLQKAKI
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB9 PLVTNEECQKRYQDYKITQRMVCAGYKEGGKDACKGDSGGPLVCKHNGMWRLVGITSWGE
::::::::::::. .:::..:.::::.::::::::::::::: :::: .:.:::::::::
CCDS38 PLVTNEECQKRYRGHKITHKMICAGYREGGKDACKGDSGGPLSCKHNEVWHLVGITSWGE
540 550 560 570 580 590
610 620 630
pF1KB9 GCARREQPGVYTKVAEYMDWILEKTQSSDGKAQMQSPA
:::.::.:::::.:.::.::::::::.
CCDS38 GCAQRERPGVYTNVVEYVDWILEKTQAV
600 610 620
>>CCDS58185.1 TMPRSS13 gene_id:84000|Hs108|chr11 (563 aa)
initn: 715 init1: 344 opt: 768 Z-score: 884.7 bits: 173.7 E(32554): 5.9e-43
Smith-Waterman score: 768; 44.9% identity (71.9% similar) in 256 aa overlap (381-630:315-563)
360 370 380 390 400
pF1KB9 LSMDGSPTRIAYGTQGSSGYSLRLCNTGDNSVCTTKTST-RIVGGTNSSWGEWPWQVSLQ
: : .. : :::::. .: ..:::::::.
CCDS58 SFSILRYNSTIQESLHRSECPSQRYISLQCSHCGLRAMTGRIVGGALASDSKWPWQVSLH
290 300 310 320 330 340
410 420 430 440 450 460
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CCDS13 RATFQCKEDSTCISLPKVCDGQPDCLNGSDEEQCQEGVPCGTFTFQCEDRSCVKKPNPQC
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CCDS13 ------DGRP-------DCRDGSDEEHCDCG-----LQGPSSRIVGGAVSSEGEWPWQAS
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pF1KB9 LQVKLTAQRHLCGGSLIGHQWVLTAAHCF--DGLPLQDVWRIYSG-ILNLSDITKDTPFS
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