Result of FASTA (ccds) for pFN21AE6489
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE6489, 593 aa
  1>>>pF1KE6489 593 - 593 aa - 593 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3994+/-0.00102; mu= 18.0570+/- 0.062
 mean_var=70.5065+/-14.127, 0's: 0 Z-trim(103.4): 182  B-trim: 4 in 1/50
 Lambda= 0.152742
 statistics sampled from 7219 (7406) to 7219 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.599), E-opt: 0.2 (0.227), width:  16
 Scan time:  3.260

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS34094.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 593) 3960 882.4       0
CCDS54815.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 597) 3895 868.1       0
CCDS54816.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 505) 3339 745.6 3.6e-215
CCDS82974.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 496) 3117 696.6 1.9e-200
CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5          ( 587) 3068 685.9 3.8e-197
CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5         ( 555) 3020 675.3 5.6e-194
CCDS82975.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4         ( 427) 2828 632.9 2.5e-181
CCDS58969.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5         ( 505) 2748 615.3 5.7e-176
CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1       ( 642) 1785 403.2 5.3e-112
CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1         ( 609) 1600 362.4 9.5e-100
CCDS1429.1 KLHL12 gene_id:59349|Hs108|chr1         ( 568) 1485 337.0 3.8e-92
CCDS54756.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4         ( 568) 1484 336.8 4.4e-92
CCDS33975.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4         ( 709) 1484 336.9 5.3e-92
CCDS33974.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4         ( 755) 1484 336.9 5.6e-92
CCDS33749.1 KLHL18 gene_id:23276|Hs108|chr3        ( 574) 1453 330.0 5.1e-90
CCDS9445.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13         ( 748) 1416 321.9 1.8e-87
CCDS3449.1 KLHL5 gene_id:51088|Hs108|chr4          ( 694) 1399 318.1 2.3e-86
CCDS14457.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX         ( 718) 1373 312.4 1.2e-84
CCDS14456.1 KLHL4 gene_id:56062|Hs108|chrX         ( 720) 1359 309.3 1.1e-83
CCDS73582.1 KLHL1 gene_id:57626|Hs108|chr13        ( 687) 1344 306.0   1e-82
CCDS9680.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14        ( 571) 1323 301.3 2.1e-81
CCDS76675.1 KLHL28 gene_id:54813|Hs108|chr14       ( 585) 1323 301.4 2.2e-81
CCDS3617.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4          ( 620) 1277 291.2 2.6e-78
CCDS12239.1 KEAP1 gene_id:9817|Hs108|chr19         ( 624) 1249 285.1 1.9e-76
CCDS34609.1 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7         ( 586) 1066 244.7 2.4e-64
CCDS77937.1 KLHL8 gene_id:57563|Hs108|chr4         ( 544) 1060 243.4 5.7e-64
CCDS3246.1 KLHL24 gene_id:54800|Hs108|chr3         ( 600)  999 230.0 6.9e-60
CCDS5378.2 KLHL7 gene_id:55975|Hs108|chr7          ( 538)  998 229.7 7.4e-60
CCDS54335.1 KLHL29 gene_id:114818|Hs108|chr2       ( 875)  946 218.4 3.1e-56
CCDS55479.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX        ( 613)  919 212.3 1.4e-54
CCDS55481.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX        ( 639)  919 212.3 1.5e-54
CCDS14571.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX        ( 655)  919 212.4 1.5e-54
CCDS55480.1 KLHL13 gene_id:90293|Hs108|chrX        ( 658)  919 212.4 1.5e-54
CCDS6503.1 KLHL9 gene_id:55958|Hs108|chr9          ( 617)  910 210.4 5.7e-54
CCDS10339.1 KLHL25 gene_id:64410|Hs108|chr15       ( 589)  898 207.7 3.4e-53
CCDS3245.2 KLHL6 gene_id:89857|Hs108|chr3          ( 621)  895 207.1 5.6e-53
CCDS4021.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5            ( 589)  888 205.5 1.6e-52
CCDS10935.1 GAN gene_id:8139|Hs108|chr16           ( 597)  836 194.0 4.5e-49
CCDS12384.1 KLHL26 gene_id:55295|Hs108|chr19       ( 615)  815 189.4 1.1e-47
CCDS46555.2 KLHL30 gene_id:377007|Hs108|chr2       ( 578)  796 185.2   2e-46
CCDS43766.1 KLHL38 gene_id:340359|Hs108|chr8       ( 581)  787 183.2 7.8e-46
CCDS10948.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16       ( 616)  777 181.0 3.8e-45
CCDS58958.1 ENC1 gene_id:8507|Hs108|chr5           ( 516)  776 180.8 3.8e-45
CCDS30575.1 KLHL21 gene_id:9903|Hs108|chr1         ( 597)  770 179.5 1.1e-44
CCDS13780.1 KLHL22 gene_id:84861|Hs108|chr22       ( 634)  722 168.9 1.7e-41
CCDS76909.1 KLHL36 gene_id:79786|Hs108|chr16       ( 553)  692 162.3 1.5e-39
CCDS44685.2 KLHL35 gene_id:283212|Hs108|chr11      ( 583)  640 150.8 4.4e-36
CCDS42340.1 KLHL10 gene_id:317719|Hs108|chr17      ( 608)  621 146.7 8.3e-35
CCDS44132.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1            ( 582)  619 146.2 1.1e-34
CCDS30702.1 IPP gene_id:3652|Hs108|chr1            ( 584)  610 144.2 4.3e-34


>>CCDS34094.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4              (593 aa)
 initn: 3960 init1: 3960 opt: 3960  Z-score: 4715.1  bits: 882.4 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3960; 99.8% identity (99.8% similar) in 593 aa overlap (1-593:1-593)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 METPPLPPACTKQGHQKPLDSKDDNTEKHCPVTVNPWHMKKAFKVMNELRSQNLLCDVTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 METPPLPPACTKQGHQKPLDSKDDNTEKHCPVTVNPWHMKKAFKVMNELRSQNLLCDVTI
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 VAEDMEISAHRVVLAACSPYFHAMFTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYTAEIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VAEDMEISAHRVVLAACSPYFHAMFTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYTAEIQ
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 VTEENVQVLLPAAGLLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKANTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VTEENVQVLLPAAGLLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKANTY
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 AEQHFADVVLSEEFLNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFMAR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AEQHFADVVLSEEFLNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFMAR
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 LMEHVRLPLLPREYLVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTRLR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LMEHVRLPLLPREYLVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTRLR
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE6 TPMNLPKLMVVVGGQAPKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSGRCRAGMVYMAGLVFAVGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::
CCDS34 TPMNLPKLMVVVGGQAPKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSRRCRAGMVYMAGLVFAVGG
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE6 FNGSLRVRTVDSYDPVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVEAY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FNGSLRVRTVDSYDPVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVEAY
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE6 NIKSNEWFHVAPMNTRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTYIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NIKSNEWFHVAPMNTRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTYIA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE6 EMSTRRSGAGVGVLNNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGVCA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EMSTRRSGAGVGVLNNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGVCA
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590   
pF1KE6 VNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
              550       560       570       580       590   

>>CCDS54815.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4              (597 aa)
 initn: 3892 init1: 3892 opt: 3895  Z-score: 4637.6  bits: 868.1 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 3895; 99.0% identity (99.3% similar) in 590 aa overlap (4-593:8-597)

                   10        20        30        40        50      
pF1KE6     METPPLPPACTKQGHQKPLDSKDDNTEKHCPVTVNPWHMKKAFKVMNELRSQNLLC
              : .  .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MVWLEARPQILFVCTKQGHQKPLDSKDDNTEKHCPVTVNPWHMKKAFKVMNELRSQNLLC
               10        20        30        40        50        60

         60        70        80        90       100       110      
pF1KE6 DVTIVAEDMEISAHRVVLAACSPYFHAMFTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DVTIVAEDMEISAHRVVLAACSPYFHAMFTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYT
               70        80        90       100       110       120

        120       130       140       150       160       170      
pF1KE6 AEIQVTEENVQVLLPAAGLLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AEIQVTEENVQVLLPAAGLLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNK
              130       140       150       160       170       180

        180       190       200       210       220       230      
pF1KE6 ANTYAEQHFADVVLSEEFLNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ANTYAEQHFADVVLSEEFLNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQE
              190       200       210       220       230       240

        240       250       260       270       280       290      
pF1KE6 FMARLMEHVRLPLLPREYLVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FMARLMEHVRLPLLPREYLVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVR
              250       260       270       280       290       300

        300       310       320       330       340       350      
pF1KE6 TRLRTPMNLPKLMVVVGGQAPKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSGRCRAGMVYMAGLVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS54 TRLRTPMNLPKLMVVVGGQAPKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSRRCRAGMVYMAGLVF
              310       320       330       340       350       360

        360       370       380       390       400       410      
pF1KE6 AVGGFNGSLRVRTVDSYDPVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AVGGFNGSLRVRTVDSYDPVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSS
              370       380       390       400       410       420

        420       430       440       450       460       470      
pF1KE6 VEAYNIKSNEWFHVAPMNTRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VEAYNIKSNEWFHVAPMNTRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEW
              430       440       450       460       470       480

        480       490       500       510       520       530      
pF1KE6 TYIAEMSTRRSGAGVGVLNNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TYIAEMSTRRSGAGVGVLNNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNA
              490       500       510       520       530       540

        540       550       560       570       580       590   
pF1KE6 GVCAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GVCAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
              550       560       570       580       590       

>>CCDS54816.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4              (505 aa)
 initn: 3339 init1: 3339 opt: 3339  Z-score: 3976.5  bits: 745.6 E(32554): 3.6e-215
Smith-Waterman score: 3339; 99.8% identity (99.8% similar) in 505 aa overlap (89-593:1-505)

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE6 TIVAEDMEISAHRVVLAACSPYFHAMFTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYTAE
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54                               MSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYTAE
                                             10        20        30

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE6 IQVTEENVQVLLPAAGLLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKAN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IQVTEENVQVLLPAAGLLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKAN
               40        50        60        70        80        90

      180       190       200       210       220       230        
pF1KE6 TYAEQHFADVVLSEEFLNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TYAEQHFADVVLSEEFLNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFM
              100       110       120       130       140       150

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE6 ARLMEHVRLPLLPREYLVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ARLMEHVRLPLLPREYLVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTR
              160       170       180       190       200       210

      300       310       320       330       340       350        
pF1KE6 LRTPMNLPKLMVVVGGQAPKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSGRCRAGMVYMAGLVFAV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::
CCDS54 LRTPMNLPKLMVVVGGQAPKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSRRCRAGMVYMAGLVFAV
              220       230       240       250       260       270

      360       370       380       390       400       410        
pF1KE6 GGFNGSLRVRTVDSYDPVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GGFNGSLRVRTVDSYDPVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVE
              280       290       300       310       320       330

      420       430       440       450       460       470        
pF1KE6 AYNIKSNEWFHVAPMNTRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AYNIKSNEWFHVAPMNTRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTY
              340       350       360       370       380       390

      480       490       500       510       520       530        
pF1KE6 IAEMSTRRSGAGVGVLNNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 IAEMSTRRSGAGVGVLNNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGV
              400       410       420       430       440       450

      540       550       560       570       580       590   
pF1KE6 CAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 CAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
              460       470       480       490       500     

>>CCDS82974.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4              (496 aa)
 initn: 3114 init1: 3114 opt: 3117  Z-score: 3712.3  bits: 696.6 E(32554): 1.9e-200
Smith-Waterman score: 3117; 95.9% identity (97.5% similar) in 489 aa overlap (105-593:9-496)

           80        90       100       110       120       130    
pF1KE6 AACSPYFHAMFTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYTAEIQVTEENVQVLLPAAG
                                     : . .::.. .   . .    .::::::::
CCDS82                       MSQLWQKTWKF-LLIEWCWPPVVLIFMPCLQVLLPAAG
                                     10         20        30       

          140       150       160       170       180       190    
pF1KE6 LLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKANTYAEQHFADVVLSEEF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKANTYAEQHFADVVLSEEF
        40        50        60        70        80        90       

          200       210       220       230       240       250    
pF1KE6 LNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFMARLMEHVRLPLLPREY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFMARLMEHVRLPLLPREY
       100       110       120       130       140       150       

          260       270       280       290       300       310    
pF1KE6 LVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTRLRTPMNLPKLMVVVGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTRLRTPMNLPKLMVVVGG
       160       170       180       190       200       210       

          320       330       340       350       360       370    
pF1KE6 QAPKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSGRCRAGMVYMAGLVFAVGGFNGSLRVRTVDSYD
       ::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QAPKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSRRCRAGMVYMAGLVFAVGGFNGSLRVRTVDSYD
       220       230       240       250       260       270       

          380       390       400       410       420       430    
pF1KE6 PVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVEAYNIKSNEWFHVAPMN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVEAYNIKSNEWFHVAPMN
       280       290       300       310       320       330       

          440       450       460       470       480       490    
pF1KE6 TRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTYIAEMSTRRSGAGVGVL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTYIAEMSTRRSGAGVGVL
       340       350       360       370       380       390       

          500       510       520       530       540       550    
pF1KE6 NNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVVGGDDGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 NNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVVGGDDGS
       400       410       420       430       440       450       

          560       570       580       590   
pF1KE6 CNLASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 CNLASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
       460       470       480       490      

>>CCDS4192.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5               (587 aa)
 initn: 3449 init1: 3054 opt: 3068  Z-score: 3652.8  bits: 685.9 E(32554): 3.8e-197
Smith-Waterman score: 3068; 77.5% identity (92.8% similar) in 582 aa overlap (12-593:7-587)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE6 METPPLPPACTKQGHQKPLDSKDDNTEKHCPVTVNPWHMKKAFKVMNELRSQNLLCDVTI
                  : . :  ... ::. ...  .:::: :: :::::::::::..::::: :
CCDS41      MEGESVKLSSQTLIQAGDDEKNQRT-ITVNPAHMGKAFKVMNELRSKQLLCDVMI
                    10        20         30        40        50    

               70        80        90       100       110       120
pF1KE6 VAEDMEISAHRVVLAACSPYFHAMFTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYTAEIQ
       ::::.:: ::::::::::::: :::::.::::.::...::.::: ::  ::::.:::::.
CCDS41 VAEDVEIEAHRVVLAACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAEIE
           60        70        80        90       100       110    

              130       140       150       160       170       180
pF1KE6 VTEENVQVLLPAAGLLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKANTY
       :::::::::::::.::::.::...::.::.:::::.::::::::::.:.:::::..::.:
CCDS41 VTEENVQVLLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAY
          120       130       140       150       160       170    

              190       200       210       220       230       240
pF1KE6 AEQHFADVVLSEEFLNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFMAR
       ::::: .:.:.::::.:...::::::::::::.:::::::::::.:.:..:..: : ::.
CCDS41 AEQHFPEVMLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAK
          180       190       200       210       220       230    

              250       260       270       280       290       300
pF1KE6 LMEHVRLPLLPREYLVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTRLR
       ::::::::::::.:::: ::::::.::...:::.::::::::::: .::.:.:. ::. :
CCDS41 LMEHVRLPLLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTKPR
          240       250       260       270       280       290    

              310       320       330       340       350       360
pF1KE6 TPMNLPKLMVVVGGQAPKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSGRCRAGMVYMAGLVFAVGG
       ::..:::.:.::::::::::::::::::.:.:: :.::::: :::::.:.::: :.::::
CCDS41 TPVSLPKVMIVVGGQAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAVGG
          300       310       320       330       340       350    

              370       380       390       400       410       420
pF1KE6 FNGSLRVRTVDSYDPVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVEAY
       ::::::::::: :: :::::::.:.:..::::::::::: ::::::::::::::.:::::
CCDS41 FNGSLRVRTVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVEAY
          360       370       380       390       400       410    

              430       440       450       460       470       480
pF1KE6 NIKSNEWFHVAPMNTRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTYIA
       . :.:::: :::::::::::::::: : ::::::::::::::::::: :: .:::: :.:
CCDS41 SYKTNEWFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVA
          420       430       440       450       460       470    

              490       500       510       520       530       540
pF1KE6 EMSTRRSGAGVGVLNNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGVCA
       .:::::::::::::.. :::.::::::::::::::::: ::.:.::::::::::::::::
CCDS41 DMSTRRSGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCA
          480       490       500       510       520       530    

              550       560       570       580       590   
pF1KE6 VNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
       :::::::::::::::::::::::::.:::::.. . ::::::::::.:: : :
CCDS41 VNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
          540       550       560       570       580       

>>CCDS58970.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5              (555 aa)
 initn: 3410 init1: 3015 opt: 3020  Z-score: 3596.0  bits: 675.3 E(32554): 5.6e-194
Smith-Waterman score: 3020; 79.6% identity (94.1% similar) in 555 aa overlap (39-593:1-555)

       10        20        30        40        50        60        
pF1KE6 ACTKQGHQKPLDSKDDNTEKHCPVTVNPWHMKKAFKVMNELRSQNLLCDVTIVAEDMEIS
                                     : :::::::::::..::::: :::::.:: 
CCDS58                               MGKAFKVMNELRSKQLLCDVMIVAEDVEIE
                                             10        20        30

       70        80        90       100       110       120        
pF1KE6 AHRVVLAACSPYFHAMFTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYTAEIQVTEENVQV
       ::::::::::::: :::::.::::.::...::.::: ::  ::::.:::::.::::::::
CCDS58 AHRVVLAACSPYFCAMFTGDMSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAEIEVTEENVQV
               40        50        60        70        80        90

      130       140       150       160       170       180        
pF1KE6 LLPAAGLLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKANTYAEQHFADV
       :::::.::::.::...::.::.:::::.::::::::::.:.:::::..::.:::::: .:
CCDS58 LLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQANAYAEQHFPEV
              100       110       120       130       140       150

      190       200       210       220       230       240        
pF1KE6 VLSEEFLNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFMARLMEHVRLP
       .:.::::.:...::::::::::::.:::::::::::.:.:..:..: : ::.::::::::
CCDS58 MLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHMAKLMEHVRLP
              160       170       180       190       200       210

      250       260       270       280       290       300        
pF1KE6 LLPREYLVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTRLRTPMNLPKL
       ::::.:::: ::::::.::...:::.::::::::::: .::.:.:. ::. :::..:::.
CCDS58 LLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTKPRTPVSLPKV
              220       230       240       250       260       270

      310       320       330       340       350       360        
pF1KE6 MVVVGGQAPKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSGRCRAGMVYMAGLVFAVGGFNGSLRVR
       :.::::::::::::::::::.:.:: :.::::: :::::.:.::: :.::::::::::::
CCDS58 MIVVGGQAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAVGGFNGSLRVR
              280       290       300       310       320       330

      370       380       390       400       410       420        
pF1KE6 TVDSYDPVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVEAYNIKSNEWF
       ::: :: :::::::.:.:..::::::::::: ::::::::::::::.:::::. :.::::
CCDS58 TVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVEAYSYKTNEWF
              340       350       360       370       380       390

      430       440       450       460       470       480        
pF1KE6 HVAPMNTRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTYIAEMSTRRSG
        :::::::::::::::: : ::::::::::::::::::: :: .:::: :.:.:::::::
CCDS58 FVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIYVADMSTRRSG
              400       410       420       430       440       450

      490       500       510       520       530       540        
pF1KE6 AGVGVLNNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVV
       ::::::.. :::.::::::::::::::::: ::.:.::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVV
              460       470       480       490       500       510

      550       560       570       580       590   
pF1KE6 GGDDGSCNLASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
       :::::::::::::::::.:::::.. . ::::::::::.:: : :
CCDS58 GGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
              520       530       540       550     

>>CCDS82975.1 KLHL2 gene_id:11275|Hs108|chr4              (427 aa)
 initn: 2828 init1: 2828 opt: 2828  Z-score: 3369.0  bits: 632.9 E(32554): 2.5e-181
Smith-Waterman score: 2828; 99.8% identity (99.8% similar) in 427 aa overlap (167-593:1-427)

        140       150       160       170       180       190      
pF1KE6 QLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKANTYAEQHFADVVLSEEFLN
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82                               MHACTDLLNKANTYAEQHFADVVLSEEFLN
                                             10        20        30

        200       210       220       230       240       250      
pF1KE6 LGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFMARLMEHVRLPLLPREYLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFMARLMEHVRLPLLPREYLV
               40        50        60        70        80        90

        260       270       280       290       300       310      
pF1KE6 QRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTRLRTPMNLPKLMVVVGGQA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTRLRTPMNLPKLMVVVGGQA
              100       110       120       130       140       150

        320       330       340       350       360       370      
pF1KE6 PKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSGRCRAGMVYMAGLVFAVGGFNGSLRVRTVDSYDPV
       ::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSRRCRAGMVYMAGLVFAVGGFNGSLRVRTVDSYDPV
              160       170       180       190       200       210

        380       390       400       410       420       430      
pF1KE6 KDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVEAYNIKSNEWFHVAPMNTR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVEAYNIKSNEWFHVAPMNTR
              220       230       240       250       260       270

        440       450       460       470       480       490      
pF1KE6 RSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTYIAEMSTRRSGAGVGVLNN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTYIAEMSTRRSGAGVGVLNN
              280       290       300       310       320       330

        500       510       520       530       540       550      
pF1KE6 LLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVVGGDDGSCN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVVGGDDGSCN
              340       350       360       370       380       390

        560       570       580       590   
pF1KE6 LASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 LASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
              400       410       420       

>>CCDS58969.1 KLHL3 gene_id:26249|Hs108|chr5              (505 aa)
 initn: 3143 init1: 2748 opt: 2748  Z-score: 3272.7  bits: 615.3 E(32554): 5.7e-176
Smith-Waterman score: 2748; 79.2% identity (94.3% similar) in 505 aa overlap (89-593:1-505)

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE6 TIVAEDMEISAHRVVLAACSPYFHAMFTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYTAE
                                     ::::.::...::.::: ::  ::::.::::
CCDS58                               MSESKAKKIEIKDVDGQTLSKLIDYIYTAE
                                             10        20        30

      120       130       140       150       160       170        
pF1KE6 IQVTEENVQVLLPAAGLLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKAN
       :.:::::::::::::.::::.::...::.::.:::::.::::::::::.:.:::::..::
CCDS58 IEVTEENVQVLLPAASLLQLMDVRQNCCDFLQSQLHPTNCLGIRAFADVHTCTDLLQQAN
               40        50        60        70        80        90

      180       190       200       210       220       230        
pF1KE6 TYAEQHFADVVLSEEFLNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFM
       .:::::: .:.:.::::.:...::::::::::::.:::::::::::.:.:..:..: : :
CCDS58 AYAEQHFPEVMLGEEFLSLSLDQVCSLISSDKLTVSSEEKVFEAVISWINYEKETRLEHM
              100       110       120       130       140       150

      240       250       260       270       280       290        
pF1KE6 ARLMEHVRLPLLPREYLVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTR
       :.::::::::::::.:::: ::::::.::...:::.::::::::::: .::.:.:. ::.
CCDS58 AKLMEHVRLPLLPRDYLVQTVEEEALIKNNNTCKDFLIEAMKYHLLPLDQRLLIKNPRTK
              160       170       180       190       200       210

      300       310       320       330       340       350        
pF1KE6 LRTPMNLPKLMVVVGGQAPKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSGRCRAGMVYMAGLVFAV
        :::..:::.:.::::::::::::::::::.:.:: :.::::: :::::.:.::: :.::
CCDS58 PRTPVSLPKVMIVVGGQAPKAIRSVECYDFEEDRWDQIAELPSRRCRAGVVFMAGHVYAV
              220       230       240       250       260       270

      360       370       380       390       400       410        
pF1KE6 GGFNGSLRVRTVDSYDPVKDQWTSVANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVE
       ::::::::::::: :: :::::::.:.:..::::::::::: ::::::::::::::.:::
CCDS58 GGFNGSLRVRTVDVYDGVKDQWTSIASMQERRSTLGAAVLNDLLYAVGGFDGSTGLASVE
              280       290       300       310       320       330

      420       430       440       450       460       470        
pF1KE6 AYNIKSNEWFHVAPMNTRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTY
       ::. :.:::: :::::::::::::::: : ::::::::::::::::::: :: .:::: :
CCDS58 AYSYKTNEWFFVAPMNTRRSSVGVGVVEGKLYAVGGYDGASRQCLSTVEQYNPATNEWIY
              340       350       360       370       380       390

      480       490       500       510       520       530        
pF1KE6 IAEMSTRRSGAGVGVLNNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGV
       .:.:::::::::::::.. :::.::::::::::::::::: ::.:.::::::::::::::
CCDS58 VADMSTRRSGAGVGVLSGQLYATGGHDGPLVRKSVEVYDPGTNTWKQVADMNMCRRNAGV
              400       410       420       430       440       450

      540       550       560       570       580       590   
pF1KE6 CAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL
       :::::::::::::::::::::::::::.:::::.. . ::::::::::.:: : :
CCDS58 CAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPVTDKWTLLPTNMSTGRSYAGVAVIHKSL
              460       470       480       490       500     

>>CCDS30550.1 KLHL17 gene_id:339451|Hs108|chr1            (642 aa)
 initn: 2404 init1: 1354 opt: 1785  Z-score: 2124.3  bits: 403.2 E(32554): 5.3e-112
Smith-Waterman score: 1787; 47.6% identity (74.7% similar) in 597 aa overlap (4-590:31-623)

                                          10            20         
pF1KE6                            METPPLPPAC----TKQGHQKPLDSKDD-----
                                     :: :::     :.  . .:    .      
CCDS30 MQPRSERPAGRTQSPEHGSPGPGPEAPPPPPPQPPAPEAERTRPRQARPAAPMEGAVQLL
               10        20        30        40        50        60

           30        40        50        60        70        80    
pF1KE6 NTEKHCPVTVNPWHMKKAFKVMNELRSQNLLCDVTIVAEDMEISAHRVVLAACSPYFHAM
       . : :  .  .  :.. :: .:...:...::::... .   :: ::.::::.::::::::
CCDS30 SREGHSVAHNSKRHYHDAFVAMSRMRQRGLLCDIVLHVAAKEIRAHKVVLASCSPYFHAM
               70        80        90       100       110       120

           90       100       110       120       130       140    
pF1KE6 FTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYTAEIQVTEENVQVLLPAAGLLQLQDVKKT
       ::.::::::  .: ....:  .: .:....::::: : : :::.:::::.::::. :. .
CCDS30 FTNEMSESRQTHVTLHDIDPQALDQLVQFAYTAEIVVGEGNVQTLLPAASLLQLNGVRDA
              130       140       150       160       170       180

          150       160       170       180       190       200    
pF1KE6 CCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKANTYAEQHFADVVLSEEFLNLGIEQVCS
       ::.:: ::: : ::::::.::: :.:.:::. :. :. :::.::. .:::. : ..::  
CCDS30 CCKFLLSQLDPSNCLGIRGFADAHSCSDLLKAAHRYVLQHFVDVAKTEEFMLLPLKQVLE
              190       200       210       220       230       240

          210       220       230       240       250       260    
pF1KE6 LISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFMARLMEHVRLPLLPREYLVQRVEEEAL
       :.:::.:.. :::.:..::..::.:: :.:.. . :::. :::::: :..:. .:. :.:
CCDS30 LVSSDSLNVPSEEEVYRAVLSWVKHDVDARRQHVPRLMKCVRLPLLSRDFLLGHVDAESL
              250       260       270       280       290       300

          270       280       290       300       310       320    
pF1KE6 VKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTRLRTPMNLPKLMVVVGGQAPKAIRS-V
       :..   ::: ::::.:.:::: ::: .. . ::: :   .   .. .::: .  ::..  
CCDS30 VRHHPDCKDLLIEALKFHLLP-EQRGVLGTSRTRPRRCEGAGPVLFAVGGGSLFAIHGDC
              310       320        330       340       350         

           330       340       350       360       370       380   
pF1KE6 ECYDFKEERWHQVAELPSGRCRAGMVYMAGLVFAVGGFNGSLRVRTVDSYDPVKDQWTSV
       : :: . .::: :: . . : :.:.. ... ..::::..:.  . ::.::::: . :   
CCDS30 EAYDTRTDRWHVVASMSTRRARVGVAAVGNRLYAVGGYDGTSDLATVESYDPVTNTWQPE
     360       370       380       390       400       410         

           390       400       410       420       430       440   
pF1KE6 ANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVEAYNIKSNEWFHVAPMNTRRSSVGVG
       ..:  ::: ::.:.:.::::..::.::.. :.:.: :.  .. :  :: :.:::  : :.
CCDS30 VSMGTRRSCLGVAALHGLLYSAGGYDGASCLNSAERYDPLTGTWTSVAAMSTRRRYVRVA
     420       430       440       450       460       470         

           450       460       470       480       490       500   
pF1KE6 VVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTYIAEMSTRRSGAGVGVLNNLLYAVGG
       .. : ::::::::..:.  :.::: :.  .: :. .: : .:::.:::.::.. ::..::
CCDS30 TLDGNLYAVGGYDSSSH--LATVEKYEPQVNVWSPVASMLSRRSSAGVAVLEGALYVAGG
     480       490         500       510       520       530       

           510       520       530       540       550       560   
pF1KE6 HDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGVCAVNGLLYVVGGDDGSCNLASVEYY
       .::    .::: :.: ..::..:: ::. : .  . :..: ::.:::.::: .: :.: :
CCDS30 NDGTSCLNSVERYSPKAGAWESVAPMNIRRSTHDLVAMDGWLYAVGGNDGSSSLNSIEKY
       540       550       560       570       580       590       

           570       580       590                   
pF1KE6 NPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL                
       :: :.:: :..::: : :: .::.:..                   
CCDS30 NPRTNKW-VAASCMFTRRSSVGVAVLELLNFPPPSSPTLSVSSTSL
       600        610       620       630       640  

>>CCDS1310.1 KLHL20 gene_id:27252|Hs108|chr1              (609 aa)
 initn: 1836 init1: 997 opt: 1600  Z-score: 1904.3  bits: 362.4 E(32554): 9.5e-100
Smith-Waterman score: 1600; 45.7% identity (73.5% similar) in 558 aa overlap (34-589:46-599)

            10        20        30        40        50        60   
pF1KE6 PPLPPACTKQGHQKPLDSKDDNTEKHCPVTVNPWHMKKAFKVMNELRSQNLLCDVTIVAE
                                     ..  : .....:.: ::..  ::::..:. 
CCDS13 ETGMDVTSRCTLGDPNKLPEGVPQPARMPYISDKHPRQTLEVINLLRKHRELCDVVLVVG
          20        30        40        50        60        70     

            70        80        90       100       110       120   
pF1KE6 DMEISAHRVVLAACSPYFHAMFTGEMSESRAKRVRIKEVDGWTLRMLIDYVYTAEIQVTE
         .: ::::.:.::::::.::::::..:::  .: :...:  ....:::..::..: : :
CCDS13 AKKIYAHRVILSACSPYFRAMFTGELAESRQTEVVIRDIDERAMELLIDFAYTSQITVEE
          80        90       100       110       120       130     

           130       140       150       160       170       180   
pF1KE6 ENVQVLLPAAGLLQLQDVKKTCCEFLESQLHPVNCLGIRAFADMHACTDLLNKANTYAEQ
        :::.::::: :::: .....:::::. :: : :::::::::: :.: .::  :. ....
CCDS13 GNVQTLLPAACLLQLAEIQEACCEFLKRQLDPSNCLGIRAFADTHSCRELLRIADKFTQH
         140       150       160       170       180       190     

           190       200       210       220       230       240   
pF1KE6 HFADVVLSEEFLNLGIEQVCSLISSDKLTISSEEKVFEAVIAWVNHDKDVRQEFMARLME
       .: .:. ::::. :  .:. ..::::.:.. :::.::.::.:::... . :.  . ....
CCDS13 NFQEVMESEEFMLLPANQLIDIISSDELNVRSEEQVFNAVMAWVKYSIQERRPQLPQVLQ
         200       210       220       230       240       250     

           250       260       270       280       290       300   
pF1KE6 HVRLPLLPREYLVQRVEEEALVKNSSACKDYLIEAMKYHLLPTEQRILMKSVRTRLRTPM
       :::::::  ..::  :  . :.:..  :.: . :: .: ::: : : ::.. ::: : :.
CCDS13 HVRLPLLSPKFLVGTVGSDPLIKSDEECRDLVDEAKNYLLLPQE-RPLMQGPRTRPRKPI
         260       270       280       290        300       310    

           310        320       330       340       350       360  
pF1KE6 NLPKLMVVVGGQ-APKAIRSVECYDFKEERWHQVAELPSGRCRAGMVYMAGLVFAVGGFN
          ... .:::  .  :: ::: :: . ..:..:: . . :: .:.  .  :..:::: .
CCDS13 RCGEVLFAVGGWCSGDAISSVERYDPQTNEWRMVASMSKRRCGVGVSVLDDLLYAVGGHD
          320       330       340       350       360       370    

            370       380        390       400       410       420 
pF1KE6 GSLRVRTVDSYDPVKDQWTS-VANMRDRRSTLGAAVLNGLLYAVGGFDGSTGLSSVEAYN
       ::  . .:. :::  .::.: ::     :...:.:::.:.:::::: :: . :. :: :.
CCDS13 GSSYLNSVERYDPKTNQWSSDVAPTSTCRTSVGVAVLGGFLYAVGGQDGVSCLNIVERYD
          380       390       400       410       420       430    

             430       440       450       460       470       480 
pF1KE6 IKSNEWFHVAPMNTRRSSVGVGVVGGLLYAVGGYDGASRQCLSTVECYNATTNEWTYIAE
        : :.: .:: :.::: .:.:.:.::.:::::: ::.:   :.::: ::   :.:  :: 
CCDS13 PKENKWTRVASMSTRRLGVAVAVLGGFLYAVGGSDGTSP--LNTVERYNPQENRWHTIAP
          440       450       460       470         480       490  

             490       500       510       520       530       540 
pF1KE6 MSTRRSGAGVGVLNNLLYAVGGHDGPLVRKSVEVYDPTTNAWRQVADMNMCRRNAGVCAV
       :.:::.  : .: ....:::::.:     .:.: :.: :: :  :. :.  : ..:. .:
CCDS13 MGTRRKHLGCAVYQDMIYAVGGRDDTTELSSAERYNPRTNQWSPVVAMTSRRSGVGLAVV
            500       510       520       530       540       550  

             550       560       570       580       590         
pF1KE6 NGLLYVVGGDDGSCNLASVEYYNPTTDKWTVVSSCMSTGRSYAGVTVIDKPL      
       :: :..::: ::.  : ..: ..: .. : . .. :.  :  .:: ::          
CCDS13 NGQLMAVGGFDGTTYLKTIEVFDPDANTWRLYGG-MNYRRLGGGVGVIKMTHCESHIW
            560       570       580        590       600         




593 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Tue Nov  8 13:48:26 2016 done: Tue Nov  8 13:48:27 2016
 Total Scan time:  3.260 Total Display time:  0.140

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com