FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9457, 1321 aa 1>>>pF1KE9457 1321 - 1321 aa - 1321 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9121+/-0.00096; mu= 22.1237+/- 0.058 mean_var=128.4412+/-25.649, 0's: 0 Z-trim(109.5): 192 B-trim: 6 in 1/52 Lambda= 0.113168 statistics sampled from 10751 (10967) to 10751 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.664), E-opt: 0.2 (0.337), width: 16 Scan time: 5.870 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS33964.1 ADGRA3 gene_id:166647|Hs108|chr4 (1321) 8849 1457.3 0 CCDS6097.2 ADGRA2 gene_id:25960|Hs108|chr8 (1338) 3039 508.8 4.1e-143 CCDS41580.1 ADGRA1 gene_id:84435|Hs108|chr10 ( 560) 1237 214.1 8.3e-55 CCDS76362.1 ADGRA1 gene_id:84435|Hs108|chr10 ( 463) 906 160.0 1.4e-38 CCDS44933.1 LRIG3 gene_id:121227|Hs108|chr12 (1059) 430 82.7 5.8e-15 CCDS8960.1 LRIG3 gene_id:121227|Hs108|chr12 (1119) 430 82.7 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CCDS60 MGAGGRRMRGAPARLLLPLLPWLLLLLAPEARGAPGCPLSI-RSCKCSGERPKGLSGGV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 AGAAEGKVVCSSLELAQVLPPDTLPNRTVTLILSNNKISELKNGSFSGLSLLERLDLRNN : :. .::::. .: . : ::: ::::.::::::. :.:::: ::::::.:::::: CCDS60 PGPARRRVVCSGGDLPEPPEPGLLPNGTVTLLLSNNKITGLRNGSFLGLSLLEKLDLRNN 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 LISSIDPGAFWGLSSLKRLDLTNNRIGCLNADIFRGLTNLVRLNLSGNLFSSLSQGTFDY .::...:::: ::. ::::::.:::::::... :.:: :.:::.:::.::::. :.:: CCDS60 IISTVQPGAFLGLGELKRLDLSNNRIGCLTSETFQGLPRLLRLNISGNIFSSLQPGVFDE 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 LASLRSLEFQTEYLLCDCNILWMHRWVKEKNITVRD-TRCVYPKSLQAQPVTGVKQELLT : .:. ... ::.: :::.. :. :...... . . : :.::..:.:: . .... : CCDS60 LPALKVVDLGTEFLTCDCHLRWLLPWAQNRSLQLSEHTLCAYPSALHAQALGSLQEAQLC 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 CDPPLELPSFYMTPSHRQVVFEGDSLPFQCMASYIDQDMQVLWYQDGRIVETDESQGIFV :. ::: . .. :: :::::.:: ::::: :::. .: .. ::.. :: ::. ::.. 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CCDS60 PLIICGITAAVNIHNY--RDHSPYCWLVWRPSLGAFYIPVALILLITWIYFLCAGLRLRG 900 910 920 930 940 950 950 960 970 980 990 pF1KE9 ---RHPE---RKYELKEPTEEQQRLAANENGEINHQDSMSLSLISTSAL-------ENEH ..:. . :. : . .: . .:: :: : . :: :. CCDS60 PLAQNPKAGNSRASLEAGEELRGSTRLRGSGPL-LSDSGSL-LATGSARVGTPGPPEDGD 960 970 980 990 1000 1010 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE9 TFHSQ--LLGASLTL-LLYVALWMFGALAVSLYYPLDLVFSFVFGATSLSFSAFFVVHHC ...: ::: .: .::.:.: :::::: . .: : ..:... ... : .::: CCDS60 SLYSPGVQLGALVTTHFLYLAMWACGALAVSQRWLPRVVCSCLYGVAASALGLFVFTHHC 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KE9 VNREDVRLAWIMTCCPGRSSYSVQVNVQPPNSNGTNGE-APKCPNSSAESSCTNKSASSF . :.::: .: .::: : . .. :: . . .: . . . : .. :.:: CCDS60 ARRRDVRASW-RACCPPASPAAPHA---PPRALPAAAEDGSPVFGEGPPSLKSSPSGSSG 1080 1090 1100 1110 1120 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KE9 KNSSQG-CKLTNLQAAAAQ-CHANSLPLNSTPQLDNSLTEHSMDNDIKMHVAPLEVQFRT . . : ::::::: : .: :.:.. .. . . . :. .. : : .:. CCDS60 HPLALGPCKLTNLQLAQSQVCEAGA-AAGGEGEPEPAGTRGNL-----AHRHPNNVH--- 1130 1140 1150 1160 1170 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KE9 NVHSSRHHKNRSKGHRA------SRLTVLR---EYAYDVPTSVEGSVQNGLPKSRLGNNE :. : ::.:.::::: .:: .:: : .. .: ::..:. : ::... CCDS60 --HGRRAHKSRAKGHRAGEACGKNRLKALRGGAAGALELLSSESGSLHNSPTDSYLGSSR 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KE9 GHSRSRRAYLAYRERQYNPPQQDSSDACSTLPKSSRNFEKPVSTTSKKDALRKPAVVELE . : : : . . . :.. :. . . : ...: .. ....:.:. ...: : CCDS60 N---SPGAGLQLEGEPMLTPSEGSDTSAAPLSEAGRAGQR---RSASRDSLKGGGALEKE 1240 1250 1260 1270 1280 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KE9 NQQKSYGLNLAIQNGPIKSNGQEG-PLLGTD--STGNVRTGLWKHETTV ....:: :: : :: :.. . :.:.. : : ..::::: :::: CCDS60 SHRRSYPLNAASLNGAPKGGKYDDVTLMGAEVASGGCMKTGLWKSETTV 1290 1300 1310 1320 1330 >>CCDS41580.1 ADGRA1 gene_id:84435|Hs108|chr10 (560 aa) initn: 1386 init1: 661 opt: 1237 Z-score: 1097.4 bits: 214.1 E(32554): 8.3e-55 Smith-Waterman score: 1438; 43.1% identity (66.6% similar) in 587 aa overlap (744-1321:1-560) 720 730 740 750 760 770 pF1KE9 GWKSDGCHILYSDENITTIQCYSLSNYAVLMDL-TGSELYTQAASLLHPVVYTTAIILLL ::: : : . .::::::. . ..:: CCDS41 MDLKTVLSLPRYPGEFLHPVVYACTAVMLL 10 20 30 780 790 800 810 820 830 pF1KE9 CLLAVIVSYIYHHSLIRISLKSWHMLVNLCFHIFLTCVVFVGGITQTRNASICQAVGIIL :::: .:.:: :.: :::: :. : :.:.::: :: .::.:::..:. .::::::.: CCDS41 CLLASFVTYIVHQSAIRISRKGRHTLLNFCFHAALTFTVFAGGINRTKYPILCQAVGIVL 40 50 60 70 80 90 840 850 860 870 880 890 pF1KE9 HYSTLATVLWVGVTARNIYKQVTKKAKRCQDPDEPPPPPRPMLRFYLIGGGIPIIVCGIT :::::.:.::.::::::::::::::: : : :.:: : .:.:::::..::.:.:.::.: CCDS41 HYSTLSTMLWIGVTARNIYKQVTKKAPLCLDTDQPPYPRQPLLRFYLVSGGVPFIICGVT 100 110 120 130 140 150 900 910 920 930 940 950 pF1KE9 AAANIKNYGSRP-NAPYCWMAWEPSLGAFYGPASFITFVNCMYFLSIFIQLKRHPERKYE ::.::.:::.. .. :::::::::::::::::..::.:.:.:::. ..::.::: :.:: CCDS41 AATNIRNYGTEDEDTAYCWMAWEPSLGAFYGPAAIITLVTCVYFLGTYVQLRRHPGRRYE 160 170 180 190 200 210 960 970 980 990 1000 1010 pF1KE9 LKEPTEEQQRLAANENGE-INHQDSMSLSLISTSALENEHTFHSQLLGASLTLLLYVALW :. :::.:::. :.:. : . . ..:.:.:::.:..:: .:..::.:..: : CCDS41 LRTQPEEQRRLATPEGGRGIRPGTPPAHDAPGASVLQNEHSFQAQLRAAAFTLFLFTATW 220 230 240 250 260 270 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KE9 MFGALAVSLYYPLDLVFSFVFGATSLSFSAFFVVHHCVNREDVRLAWIMTCCPGRSSYSV ::::::: . ::.::: ..:: .... : ..:::..:::: : .::: :. CCDS41 AFGALAVSQGHFLDMVFSCLYGAFCVTLGLFVLIHHCAKREDVWQCW-WACCPPRK---- 280 290 300 310 320 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KE9 QVNVQPP-NSNGTNGEAPKCPNSSAESSCTNKSASSFKNSSQGCKLTNLQAAAAQCHANS ...: ..::. : .: . .. .: . ::.::::: :: ::. CCDS41 --DAHPALDANGAALGRAACLHSPGLGQ-----PRGFAHPPGPCKMTNLQA--AQGHASC 330 340 350 360 370 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KE9 LPLNSTPQLDNSLTEHSMDNDIKMHVAPLEVQFRTNVHSSRHHKNRSKGHRASRLTVLR- : .:: . : .. ..:. : : . : ..:.: :: . . CCDS41 LS-PATPCCAKMHCEPLTADEAHVHLQE-EGAFGHDPHLHGCLQGRTKPPYFSRHPAEEP 380 390 400 410 420 430 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KE9 EYAYDVPTSVEGSVQNGL---PKSRLGNNEG-HSRSRRAYLAYRERQYNPPQQDSSDACS :::: .:.:..:: ... : : : . : :. . . .: .:.: : CCDS41 EYAYHIPSSLDGSPRSSRTDSPPSSLDGPAGTHTLACCTQGDPFPMVTQPEGSDGSPALY 440 450 460 470 480 490 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KE9 TLPKSSRNFEKPVSTTSKKDALRKPAVVELENQQKSYGLNLAIQNGPIKSNGQEGPLLGT . : : ..: :. .:. . .: .. ::: :.. :: .:: CCDS41 SCP-----------TQPGREAALGPGHLEMLRRTQSLPFGGPSQNGLPKGKLLEGLPFGT 500 510 520 530 540 1310 1320 pF1KE9 DSTGNVRTGLWKHETTV :.:::.::: ::.:::: CCDS41 DGTGNIRTGPWKNETTV 550 560 >>CCDS76362.1 ADGRA1 gene_id:84435|Hs108|chr10 (463 aa) initn: 1058 init1: 333 opt: 906 Z-score: 806.4 bits: 160.0 E(32554): 1.4e-38 Smith-Waterman score: 1107; 41.0% identity (65.9% similar) in 490 aa overlap (840-1321:1-463) 810 820 830 840 850 860 pF1KE9 VVFVGGITQTRNASICQAVGIILHYSTLATVLWVGVTARNIYKQVTKKAKRCQDPDEPPP .::.::::::::::::::: : : :.:: CCDS76 MLWIGVTARNIYKQVTKKAPLCLDTDQPPY 10 20 30 870 880 890 900 910 920 pF1KE9 PPRPMLRFYLIGGGIPIIVCGITAAANIKNYGSRP-NAPYCWMAWEPSLGAFYGPASFIT : .:.:::::..::.:.:.::.:::.::.:::.. .. :::::::::::::::::..:: CCDS76 PRQPLLRFYLVSGGVPFIICGVTAATNIRNYGTEDEDTAYCWMAWEPSLGAFYGPAAIIT 40 50 60 70 80 90 930 940 950 960 970 980 pF1KE9 FVNCMYFLSIFIQLKRHPERKYELKEPTEEQQRLAANENGE-INHQDSMSLSLISTSALE .:.:.:::. ..::.::: :.:::. :::.:::. :.:. : . . ..:.:. CCDS76 LVTCVYFLGTYVQLRRHPGRRYELRTQPEEQRRLATPEGGRGIRPGTPPAHDAPGASVLQ 100 110 120 130 140 150 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE9 NEHTFHSQLLGASLTLLLYVALWMFGALAVSLYYPLDLVFSFVFGATSLSFSAFFVVHHC :::.:..:: .:..::.:..: : ::::::: . ::.::: ..:: .... : ..::: CCDS76 NEHSFQAQLRAAAFTLFLFTATWAFGALAVSQGHFLDMVFSCLYGAFCVTLGLFVLIHHC 160 170 180 190 200 210 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KE9 VNREDVRLAWIMTCCPGRSSYSVQVNVQPP-NSNGTNGEAPKCPNSSAESSCTNKSASSF ..:::: : .::: :. ...: ..::. : .: . .. .: CCDS76 AKREDVWQCW-WACCPPRK------DAHPALDANGAALGRAACLHSPGLGQ-----PRGF 220 230 240 250 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KE9 KNSSQGCKLTNLQAAAAQCHANSLPLNSTPQLDNSLTEHSMDNDIKMHVAPLEVQFRTNV . ::.:::::: : ::. : .:: . : .. ..:. : : . CCDS76 AHPPGPCKMTNLQAA--QGHASCLS-PATPCCAKMHCEPLTADEAHVHLQE-EGAFGHDP 260 270 280 290 300 310 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KE9 HSSRHHKNRSKGHRASRLTVLR-EYAYDVPTSVEGSVQNGLPKSRLGNNEGHSRSRRAYL : ..:.: :: . . :::: .:.:..:: ... : .. .: . .. : CCDS76 HLHGCLQGRTKPPYFSRHPAEEPEYAYHIPSSLDGSPRSSRTDSPPSSLDGPAGTHT--L 320 330 340 350 360 370 1230 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KE9 AYRERQYNP-P---QQDSSDACSTLPKSSRNFEKPVSTTSKKDALRKPAVVELENQQKSY : : .: : : ..::. .: . : : ..: :. .:. . .: CCDS76 AC-CTQGDPFPMVTQPEGSDGSPAL------YSCP--TQPGREAALGPGHLEMLRRTQSL 380 390 400 410 420 1290 1300 1310 1320 pF1KE9 GLNLAIQNGPIKSNGQEGPLLGTDSTGNVRTGLWKHETTV .. ::: :.. :: .:::.:::.::: ::.:::: CCDS76 PFGGPSQNGLPKGKLLEGLPFGTDGTGNIRTGPWKNETTV 430 440 450 460 >>CCDS44933.1 LRIG3 gene_id:121227|Hs108|chr12 (1059 aa) initn: 340 init1: 236 opt: 430 Z-score: 382.0 bits: 82.7 E(32554): 5.8e-15 Smith-Waterman score: 430; 31.1% identity (66.1% similar) in 254 aa overlap (85-333:279-530) 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 AAGAAEGKVVCSSLELAQVLPPDTLPNRTVTLILSNNKISELKNGSFSGLSLLERLDLRN :: ..::..: . . .: ::: :. :::.: CCDS44 FCQKLSELDLTFNHLSRLDDSSFLGLSLLNTLHIGNNRVSYIADCAFRGLSSLKTLDLKN 250 260 270 280 290 300 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 NLIS-SIDP--GAFWGLSSLKRLDLTNNRIGCLNADIFRGLTNLVRLNLSGNLFSSLSQG : :: .:. ::: ::..:.:: : .::: .. : :: : .:.:: : . ::. . CCDS44 NEISWTIEDMNGAFSGLDKLRRLILQGNRIRSITKKAFTGLDALEHLDLSDNAIMSLQGN 310 320 330 340 350 360 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 TFDYLASLRSLEFQTEYLLCDCNILWMHRWVKEKNI-TVRDTRCVYPKSLQAQPVTGVKQ .:. . .:..:...: :::::.. :. .:: :.:. . .. :..:. :... . .:. CCDS44 AFSQMKKLQQLHLNTSSLLCDCQLKWLPQWVAENNFQSFVNASCAHPQLLKGRSIFAVSP 370 380 390 400 410 420 240 250 260 270 280 pF1KE9 ELLTCDPPLELPSFYMTPSHRQVVFEGDSLPFQC-MASYIDQDMQVLWYQDGRIVETDES . ..:: . :.. . : . : ...:..: : : :: :. : : .:..... : CCDS44 DGFVCDD-FPKPQITVQP-ETQSAIKGSNLSFICSAASSSDSPMTFAWKKDNELLHDAEM 430 440 450 460 470 480 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 QGIFVEKNMIHNCSLIASALTISNIQAGSTGNWGCHVQTKRGNNTRTVDIVVLESSAQYC .. . . . .. : . ... .: :.. : .... :.. CCDS44 ENYAHLRAQGGEVMEYTTILRLREVEFASEGKYQCVISNHFGSSYSVKAKLTVNMLPSFT 490 500 510 520 530 540 350 360 370 380 390 400 pF1KE9 PPERVVNNKGDFRWPRTLAGITAYLQCTRNTHGSGIYPGNPQDERKAWRRCDRGGFWADD CCDS44 KTPMDLTIRAGAMARLECAAVGHPAPQIAWQKDGGTDFPAARERRMHVMPEDDVFFIVDV 550 560 570 580 590 600 >>CCDS8960.1 LRIG3 gene_id:121227|Hs108|chr12 (1119 aa) initn: 343 init1: 236 opt: 430 Z-score: 381.8 bits: 82.7 E(32554): 6.1e-15 Smith-Waterman score: 430; 31.1% identity (66.1% similar) in 254 aa overlap (85-333:339-590) 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 AAGAAEGKVVCSSLELAQVLPPDTLPNRTVTLILSNNKISELKNGSFSGLSLLERLDLRN :: ..::..: . . .: ::: :. :::.: CCDS89 FCQKLSELDLTFNHLSRLDDSSFLGLSLLNTLHIGNNRVSYIADCAFRGLSSLKTLDLKN 310 320 330 340 350 360 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 NLIS-SIDP--GAFWGLSSLKRLDLTNNRIGCLNADIFRGLTNLVRLNLSGNLFSSLSQG : :: .:. ::: ::..:.:: : .::: .. : :: : .:.:: : . ::. . CCDS89 NEISWTIEDMNGAFSGLDKLRRLILQGNRIRSITKKAFTGLDALEHLDLSDNAIMSLQGN 370 380 390 400 410 420 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 TFDYLASLRSLEFQTEYLLCDCNILWMHRWVKEKNI-TVRDTRCVYPKSLQAQPVTGVKQ .:. . .:..:...: :::::.. :. .:: :.:. . .. :..:. :... . .:. CCDS89 AFSQMKKLQQLHLNTSSLLCDCQLKWLPQWVAENNFQSFVNASCAHPQLLKGRSIFAVSP 430 440 450 460 470 480 240 250 260 270 280 pF1KE9 ELLTCDPPLELPSFYMTPSHRQVVFEGDSLPFQC-MASYIDQDMQVLWYQDGRIVETDES . ..:: . :.. . : . : ...:..: : : :: :. : : .:..... : CCDS89 DGFVCDD-FPKPQITVQP-ETQSAIKGSNLSFICSAASSSDSPMTFAWKKDNELLHDAEM 490 500 510 520 530 540 290 300 310 320 330 340 pF1KE9 QGIFVEKNMIHNCSLIASALTISNIQAGSTGNWGCHVQTKRGNNTRTVDIVVLESSAQYC .. . . . .. : . ... .: :.. : .... :.. CCDS89 ENYAHLRAQGGEVMEYTTILRLREVEFASEGKYQCVISNHFGSSYSVKAKLTVNMLPSFT 550 560 570 580 590 600 350 360 370 380 390 400 pF1KE9 PPERVVNNKGDFRWPRTLAGITAYLQCTRNTHGSGIYPGNPQDERKAWRRCDRGGFWADD CCDS89 KTPMDLTIRAGAMARLECAAVGHPAPQIAWQKDGGTDFPAARERRMHVMPEDDVFFIVDV 610 620 630 640 650 660 >>CCDS35409.1 ADGRG4 gene_id:139378|Hs108|chrX (3080 aa) initn: 302 init1: 258 opt: 431 Z-score: 377.4 bits: 83.4 E(32554): 1.1e-14 Smith-Waterman score: 505; 24.5% identity (52.1% similar) in 789 aa overlap (294-1062:2329-3003) 270 280 290 300 310 320 pF1KE9 CMASYIDQDMQVLWYQDGRIVETDESQGIFVEKNMIHNCSLIASALTISNIQAGSTGNW- : . .:. : .::. . .:.. ::. CCDS35 SEEEMVMDRAILEQREGQEMATISYVPYSCVCQVIIKASSSLASSELMRKIKSKIHGNFT 2300 2310 2320 2330 2340 2350 330 340 350 360 370 380 pF1KE9 -GCHVQTKRGNNTRTVDIVVLESSAQYCPPERVVNN-KGDFRWPRTLAGITAYLQCTRNT : .: . . ..: . : ...... :: ..: : :: .: .: CCDS35 HGNFTQDQLTLLVNCEHVAVKKLEPGNCKADETASKYKGTYKWLLTNPTETAQTRCIKNE 2360 2370 2380 2390 2400 2410 390 400 410 420 430 pF1KE9 HGSGIYPGNPQDERKAWRRC----DRG-GFWADDDYSRCQYANDVTRVLYMFNQMPLNLT :. : : : . : . : ...:. ... . . .. .. CCDS35 DGN------------ATRFCSISINTGKSQWEKPKFKQCKLLQELPDKIVDLANITISDE 2420 2430 2440 2450 2460 440 450 460 470 480 490 pF1KE9 NAVATARQLLAYTVEAANFSDKMDVIFVAEMIEKFGRFTK-EEKSKELGDVMVDIASNIM :: .:...: :. .. . :.:. :.. ... .: : .: ::..: :.. CCDS35 NAEDVAEHILNLINESPALGKEETKIIVS----KISDISQCDEISMNLTHVMLQII-NVV 2470 2480 2490 2500 2510 2520 500 510 520 530 540 550 pF1KE9 LADERVLWLAQREAKACSRIVQCLQRIATYRLAGGAHVYSTYSPNIALEAYVIKSTGFTG : :. :. . ..:.. ..: . ... .... . ..:: : . . : : CCDS35 L--EKQNNSASDLHEISNEILRIIERTG-HKMEFSGQIANLTVAGLAL-AVLRGDHTFDG 2530 2540 2550 2560 2570 560 570 580 590 600 610 pF1KE9 MTCTVFQKVAASDRTGLSDYGRRDPEGNLDKQLSFKCNVSNTFSSLALKNTIVEASIQLP :. .. : . : ::: : :: . ::: :: CCDS35 MAFSIH-----SYEEGT------DPE-------IFLGNVPVG---------GILASIYLP 2580 2590 2600 2610 620 630 640 650 660 670 pF1KE9 PSLFSPKQKRELRPTDDSLYKLQLIAFRNGKLFPATGNSTNLADDGKRRTVVTPVILTKI :: : : : .:: : :: :... . . ....: :. ..: CCDS35 KSL------TERIP----LSNLQTI------LFNFFGQTSLFKTKNVTKALTTYVVSASI 2620 2630 2640 2650 680 690 700 710 720 730 pF1KE9 -DGVNVDTHHIPVNVTLRRIAHGAD---AVAARWDFDLLNGQGGWKSDGCHILYSDENIT : . ... :: .::..:. . . . : :::. :: :::.:.::.. .. : : CCDS35 SDDMFIQNLADPVVITLQHIGGNQNYGQVHCAFWDFENNNGLGGWNSSGCKVKETNVNYT 2660 2670 2680 2690 2700 2710 740 750 760 770 780 790 pF1KE9 TIQCYSLSNYAVLMDLTGSELYTQAASLLHPVVYTTAIILLLCLLAVIVSYIYHHSLIRI :: :....:::::. : . . ..: ..:: : . : ...:.:: :.: : CCDS35 ICQCDHLTHFGVLMDLSRSTVDSVNEQILALITYTGCGISSIFLGVAVVTYIAFHKL-RK 2720 2730 2740 2750 2760 2770 800 810 820 830 840 pF1KE9 SLKSWHMLVNLCFHIFLTCVVFV--GGITQTRNASICQAVGIILHYSTLATVLWVGVTAR . . ..:.::: ... .::. . ... .....: .... ::: :.. :.:. : CCDS35 DYPA-KILINLCTALLMLNLVFLINSWLSSFQKVGVCITAAVALHYFLLVSFTWMGLEAV 2780 2790 2800 2810 2820 2830 850 860 870 880 890 900 pF1KE9 NIYKQVTKKAKRCQDPDEPPPPPRPMLRFYLIGGGIPIIVCGITAAANIKNYGS-RPNAP ..: ..: . : .:.: :.: ::: :. .::.... ::. :..: CCDS35 HMYLALVKVFN--------IYIPNYILKFCLVGWGIPAIMVAITVSVKKDLYGTLSPTTP 2840 2850 2860 2870 2880 910 920 930 940 950 960 pF1KE9 YCWMAWEPSLGAFYGPASF--ITFVNCMYFLSIFIQLKRHPERKYELKEPTEEQQRLAAN .::. . :. . : : : ..: .: ....::. .: .. .: CCDS35 FCWIK-DDSIFYISVVAYFCLIFLMNLSMFCTVLVQLNS-------VKSQIQKTRRKM-- 2890 2900 2910 2920 2930 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KE9 ENGEINHQDSMSLSLISTSALENEHTFHSQLLGASLTLLLYVALWMFGALAVSLYYPLDL : :. . ..:: :: ::: :: : :. .: . :. CCDS35 ----ILHDLKGTMSL----------TF---LLG--LT-------WGFAFFA---WGPMRN 2940 2950 2960 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KE9 VFSFVFGATSLSFSAFFV-VHHCVNREDVRLAW-IMTCCPGRSSYSVQVNVQPPNSNGTN : ..:. . ....::. : ::: .:.:: : : :: CCDS35 FFLYLFAIFN-TLQGFFIFVFHCVMKESVREQWQIHLCCGWLRLDNSSDGSSRCQIKVGY 2970 2980 2990 3000 3010 3020 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KE9 GEAPKCPNSSAESSCTNKSASSFKNSSQGCKLTNLQAAAAQCHANSLPLNSTPQLDNSLT CCDS35 KQEGLKKIFEHKLLTPSLKSTATSSTFKSLGSAQGTPSEISFPNDDFDKDPYCSSP 3030 3040 3050 3060 3070 3080 >>CCDS33783.1 LRIG1 gene_id:26018|Hs108|chr3 (1093 aa) initn: 383 init1: 196 opt: 375 Z-score: 333.3 bits: 73.7 E(32554): 3e-12 Smith-Waterman score: 375; 30.4% identity (62.8% similar) in 253 aa overlap (86-332:336-585) 60 70 80 90 100 110 pF1KE9 AGAAEGKVVCSSLELAQVLPPDTLPNRTVTLILSNNKISELKNGSFSGLSLLERLDLRNN : ::.:.::.. .:.:.:: :. ::: .: CCDS33 CQKLHELVLSFNNLTRLDEESLAELSSLSVLRLSHNSISHIAEGAFKGLRSLRVLDLDHN 310 320 330 340 350 360 120 130 140 150 160 170 pF1KE9 LIS-SIDP--GAFWGLSSLKRLDLTNNRIGCLNADIFRGLTNLVRLNLSGNLFSSLSQGT :: .:. ::: ::.::..: : .:.: . : :: .: .:::.:: . :.. . CCDS33 EISGTIEDTSGAFSGLDSLSKLTLFGNKIKSVAKRAFSGLEGLEHLNLGGNAIRSVQFDA 370 380 390 400 410 420 180 190 200 210 220 230 pF1KE9 FDYLASLRSLEFQTEYLLCDCNILWMHRWVKEKNITVRDT-RCVYPKSLQAQPVTGVKQE : . .:. :..... .::::.. :. :. . . . : :..:.::..: . .: : CCDS33 FVKMKNLKELHISSDSFLCDCQLKWLPPWLIGRMLQAFVTATCAHPESLKGQSIFSVPPE 430 440 450 460 470 480 240 250 260 270 280 290 pF1KE9 LLTCDPPLELPSFYMTPSHRQVVFEGDSLPFQC-MASYIDQDMQVLWYQDGRIVETDESQ ..:: :. :.. : . ... : .. : : :: .. : : .:.... :. .. CCDS33 SFVCDDFLK-PQIITQP-ETTMAMVGKDIRFTCSAASSSSSPMTFAWKKDNEVL-TNADM 490 500 510 520 530 540 300 310 320 330 340 pF1KE9 GIFVEKNMIHNCSL-IASALTISNIQAGSTGNWGCHVQTKRGNNTRTVDIVVLESSAQYC ::. . . . .. : . .. : : . : . .. :. 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