Result of FASTA (ccds) for pFN21AE2070
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2070, 728 aa
  1>>>pF1KE2070 728 - 728 aa - 728 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3702+/-0.00105; mu= 14.7051+/- 0.062
 mean_var=131.0030+/-26.683, 0's: 0 Z-trim(106.8): 235  B-trim: 14 in 2/50
 Lambda= 0.112056
 statistics sampled from 8898 (9170) to 8898 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.647), E-opt: 0.2 (0.282), width:  16
 Scan time:  3.600

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS33908.1 MASP1 gene_id:5648|Hs108|chr3          ( 728) 5077 833.3       0
CCDS33907.1 MASP1 gene_id:5648|Hs108|chr3          ( 699) 3333 551.3 1.8e-156
CCDS33909.1 MASP1 gene_id:5648|Hs108|chr3          ( 380) 2565 426.9 2.8e-119
CCDS123.1 MASP2 gene_id:10747|Hs108|chr1           ( 686) 1629 275.8 1.5e-73
CCDS81658.1 C1R gene_id:715|Hs108|chr12            ( 705) 1298 222.3   2e-57
CCDS31735.1 C1S gene_id:716|Hs108|chr12            ( 688) 1280 219.4 1.5e-56
CCDS124.1 MASP2 gene_id:10747|Hs108|chr1           ( 185)  686 122.8 4.6e-28
CCDS8487.1 ST14 gene_id:6768|Hs108|chr11           ( 855)  457 86.5 1.9e-16
CCDS7449.1 TLL2 gene_id:7093|Hs108|chr10           (1015)  441 83.9 1.3e-15
CCDS31476.1 F2 gene_id:2147|Hs108|chr11            ( 622)  431 82.1 2.8e-15
CCDS74857.1 TMPRSS6 gene_id:164656|Hs108|chr22     ( 824)  402 77.6 8.8e-14
CCDS45469.1 PRSS8 gene_id:5652|Hs108|chr16         ( 343)  392 75.6 1.4e-13
CCDS60760.1 PAMR1 gene_id:25891|Hs108|chr11        ( 609)  378 73.5   1e-12
CCDS6316.2 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8         (3538)  364 72.0 1.8e-11
CCDS6317.1 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8         (3667)  364 72.0 1.8e-11
CCDS6315.1 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8         (3707)  364 72.0 1.8e-11


>>CCDS33908.1 MASP1 gene_id:5648|Hs108|chr3               (728 aa)
 initn: 5077 init1: 5077 opt: 5077  Z-score: 4446.1  bits: 833.3 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5077; 100.0% identity (100.0% similar) in 728 aa overlap (1-728:1-728)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MRWLLLYYALCFSLSKASAHTVELNNMFGQIQSPGYPDSYPSDSEVTWNITVPDGFRIKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MRWLLLYYALCFSLSKASAHTVELNNMFGQIQSPGYPDSYPSDSEVTWNITVPDGFRIKL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 YFMHFNLESSYLCEYDYVKVETEDQVLATFCGRETTDTEQTPGQEVVLSPGSFMSITFRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YFMHFNLESSYLCEYDYVKVETEDQVLATFCGRETTDTEQTPGQEVVLSPGSFMSITFRS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 DFSNEERFTGFDAHYMAVDVDECKEREDEELSCDHYCHNYIGGYYCSCRFGYILHTDNRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DFSNEERFTGFDAHYMAVDVDECKEREDEELSCDHYCHNYIGGYYCSCRFGYILHTDNRT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 CRVECSDNLFTQRTGVITSPDFPNPYPKSSECLYTIELEEGFMVNLQFEDIFDIEDHPEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CRVECSDNLFTQRTGVITSPDFPNPYPKSSECLYTIELEEGFMVNLQFEDIFDIEDHPEV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 PCPYDYIKIKVGPKVLGPFCGEKAPEPISTQSHSVLILFHSDNSGENRGWRLSYRAAGNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PCPYDYIKIKVGPKVLGPFCGEKAPEPISTQSHSVLILFHSDNSGENRGWRLSYRAAGNE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 CPELQPPVHGKIEPSQAKYFFKDQVLVSCDTGYKVLKDNVEMDTFQIECLKDGTWSNKIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CPELQPPVHGKIEPSQAKYFFKDQVLVSCDTGYKVLKDNVEMDTFQIECLKDGTWSNKIP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 TCKIVDCRAPGELEHGLITFSTRNNLTTYKSEIKYSCQEPYYKMLNNNTGIYTCSAQGVW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TCKIVDCRAPGELEHGLITFSTRNNLTTYKSEIKYSCQEPYYKMLNNNTGIYTCSAQGVW
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 MNKVLGRSLPTCLPECGQPSRSLPSLVKRIIGGRNAEPGLFPWQALIVVEDTSRVPNDKW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MNKVLGRSLPTCLPECGQPSRSLPSLVKRIIGGRNAEPGLFPWQALIVVEDTSRVPNDKW
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 FGSGALLSASWILTAAHVLRSQRRDTTVIPVSKEHVTVYLGLHDVRDKSGAVNSSAARVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FGSGALLSASWILTAAHVLRSQRRDTTVIPVSKEHVTVYLGLHDVRDKSGAVNSSAARVV
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 LHPDFNIQNYNHDIALVQLQEPVPLGPHVMPVCLPRLEPEGPAPHMLGLVAGWGISNPNV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LHPDFNIQNYNHDIALVQLQEPVPLGPHVMPVCLPRLEPEGPAPHMLGLVAGWGISNPNV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 TVDEIISSGTRTLSDVLQYVKLPVVPHAECKTSYESRSGNYSVTENMFCAGYYEGGKDTC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TVDEIISSGTRTLSDVLQYVKLPVVPHAECKTSYESRSGNYSVTENMFCAGYYEGGKDTC
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 LGDSGGAFVIFDDLSQRWVVQGLVSWGGPEECGSKQVYGVYTKVSNYVDWVWEQMGLPQS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LGDSGGAFVIFDDLSQRWVVQGLVSWGGPEECGSKQVYGVYTKVSNYVDWVWEQMGLPQS
              670       680       690       700       710       720

               
pF1KE2 VVEPQVER
       ::::::::
CCDS33 VVEPQVER
               

>>CCDS33907.1 MASP1 gene_id:5648|Hs108|chr3               (699 aa)
 initn: 3447 init1: 3081 opt: 3333  Z-score: 2922.6  bits: 551.3 E(32554): 1.8e-156
Smith-Waterman score: 3585; 73.3% identity (84.7% similar) in 726 aa overlap (1-717:1-697)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MRWLLLYYALCFSLSKASAHTVELNNMFGQIQSPGYPDSYPSDSEVTWNITVPDGFRIKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MRWLLLYYALCFSLSKASAHTVELNNMFGQIQSPGYPDSYPSDSEVTWNITVPDGFRIKL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 YFMHFNLESSYLCEYDYVKVETEDQVLATFCGRETTDTEQTPGQEVVLSPGSFMSITFRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YFMHFNLESSYLCEYDYVKVETEDQVLATFCGRETTDTEQTPGQEVVLSPGSFMSITFRS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 DFSNEERFTGFDAHYMAVDVDECKEREDEELSCDHYCHNYIGGYYCSCRFGYILHTDNRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DFSNEERFTGFDAHYMAVDVDECKEREDEELSCDHYCHNYIGGYYCSCRFGYILHTDNRT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 CRVECSDNLFTQRTGVITSPDFPNPYPKSSECLYTIELEEGFMVNLQFEDIFDIEDHPEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CRVECSDNLFTQRTGVITSPDFPNPYPKSSECLYTIELEEGFMVNLQFEDIFDIEDHPEV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 PCPYDYIKIKVGPKVLGPFCGEKAPEPISTQSHSVLILFHSDNSGENRGWRLSYRAAGNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PCPYDYIKIKVGPKVLGPFCGEKAPEPISTQSHSVLILFHSDNSGENRGWRLSYRAAGNE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 CPELQPPVHGKIEPSQAKYFFKDQVLVSCDTGYKVLKDNVEMDTFQIECLKDGTWSNKIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CPELQPPVHGKIEPSQAKYFFKDQVLVSCDTGYKVLKDNVEMDTFQIECLKDGTWSNKIP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 TCKIVDCRAPGELEHGLITFSTRNNLTTYKSEIKYSCQEPYYKMLNNNTGIYTCSAQGVW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TCKIVDCRAPGELEHGLITFSTRNNLTTYKSEIKYSCQEPYYKMLNNNTGIYTCSAQGVW
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 MNKVLGRSLPTCLPECGQPSRSLPSLVKRIIGGRNAEPGLFPWQALIVVEDTSRVPNDKW
       :::::::::::::: :: :. :  .:. ::..:: :. :  :: :..     :.. : . 
CCDS33 MNKVLGRSLPTCLPVCGLPKFSR-KLMARIFNGRPAQKGTTPWIAML-----SHL-NGQP
              430       440        450       460             470   

              490       500              510       520        530  
pF1KE2 FGSGALLSASWILTAAHVLRSQR-------RDTTVIPVSKEHVTVYLGLH-DVRDKSGAV
       : .:.::..:::.:::: :...        ::. ..  :     . :: :  .:.  .  
CCDS33 FCGGSLLGSSWIVTAAHCLHQSLDPEDPTLRDSDLL--SPSDFKIILGKHWRLRSDENEQ
           480       490       500         510       520       530 

            540       550       560       570       580        590 
pF1KE2 NSSAARVVLHPDFNIQNYNHDIALVQLQEPVPLGPHVMPVCLPRLEPEGPAPH-MLGLVA
       . .. ...:::... .....:.:::.: :   :.  :::.:::    :::  .  . .:.
CCDS33 HLGVKHTTLHPQYDPNTFENDVALVELLESPVLNAFVMPICLP----EGPQQEGAMVIVS
             540       550       560       570           580       

             600       610       620       630       640       650 
pF1KE2 GWGISNPNVTVDEIISSGTRTLSDVLQYVKLPVVPHAECKTSYESRSGNYSVTENMFCAG
       :::            ..  . . ..:. ...:.: :. :. .:   . .  ::..:.:::
CCDS33 GWG------------KQFLQRFPETLMEIEIPIVDHSTCQKAYAPLKKK--VTRDMICAG
       590                   600       610       620         630   

             660       670       680       690       700       710 
pF1KE2 YYEGGKDTCLGDSGGAFVIFDDLSQRWVVQGLVSWGGPEECGSKQVYGVYTKVSNYVDWV
         :::::.: ::::: .: ..    .: . : ::::  ..::.:. ::::. . .  ::.
CCDS33 EKEGGKDACAGDSGGPMVTLNRERGQWYLVGTVSWG--DDCGKKDRYGVYSYIHHNKDWI
           640       650       660         670       680       690 

             720        
pF1KE2 WEQMGLPQSVVEPQVER
        .  :.           
CCDS33 QRVTGVRN         
                        

>>CCDS33909.1 MASP1 gene_id:5648|Hs108|chr3               (380 aa)
 initn: 2561 init1: 2561 opt: 2565  Z-score: 2255.0  bits: 426.9 E(32554): 2.8e-119
Smith-Waterman score: 2565; 96.6% identity (97.6% similar) in 379 aa overlap (1-379:1-379)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MRWLLLYYALCFSLSKASAHTVELNNMFGQIQSPGYPDSYPSDSEVTWNITVPDGFRIKL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MRWLLLYYALCFSLSKASAHTVELNNMFGQIQSPGYPDSYPSDSEVTWNITVPDGFRIKL
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 YFMHFNLESSYLCEYDYVKVETEDQVLATFCGRETTDTEQTPGQEVVLSPGSFMSITFRS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YFMHFNLESSYLCEYDYVKVETEDQVLATFCGRETTDTEQTPGQEVVLSPGSFMSITFRS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 DFSNEERFTGFDAHYMAVDVDECKEREDEELSCDHYCHNYIGGYYCSCRFGYILHTDNRT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DFSNEERFTGFDAHYMAVDVDECKEREDEELSCDHYCHNYIGGYYCSCRFGYILHTDNRT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 CRVECSDNLFTQRTGVITSPDFPNPYPKSSECLYTIELEEGFMVNLQFEDIFDIEDHPEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CRVECSDNLFTQRTGVITSPDFPNPYPKSSECLYTIELEEGFMVNLQFEDIFDIEDHPEV
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 PCPYDYIKIKVGPKVLGPFCGEKAPEPISTQSHSVLILFHSDNSGENRGWRLSYRAAGNE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PCPYDYIKIKVGPKVLGPFCGEKAPEPISTQSHSVLILFHSDNSGENRGWRLSYRAAGNE
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 CPELQPPVHGKIEPSQAKYFFKDQVLVSCDTGYKVLKDNVEMDTFQIECLKDGTWSNKIP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CPELQPPVHGKIEPSQAKYFFKDQVLVSCDTGYKVLKDNVEMDTFQIECLKDGTWSNKIP
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 TCKIVDCRAPGELEHGLITFSTRNNLTTYKSEIKYSCQEPYYKMLNNNTGIYTCSAQGVW
       :::  .    .::.   .:                                         
CCDS33 TCKKNEIDLESELKSEQVTE                                        
              370       380                                        

>>CCDS123.1 MASP2 gene_id:10747|Hs108|chr1                (686 aa)
 initn: 2112 init1: 1435 opt: 1629  Z-score: 1433.9  bits: 275.8 E(32554): 1.5e-73
Smith-Waterman score: 2100; 43.0% identity (69.2% similar) in 714 aa overlap (1-711:1-679)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MRWLLLYYALCFSLSKASAHTVELNNMFGQIQSPGYPDSYPSDSEVTWNITVPDGFRIKL
       :: : :   :: :..   .     . .::.. :::.:  : .:.:  :..:.: :.:..:
CCDS12 MRLLTLLGLLCGSVATPLGPKWP-EPVFGRLASPGFPGEYANDQERRWTLTAPPGYRLRL
               10        20         30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 YFMHFNLESSYLCEYDYVKVETEDQVLATFCGRETTDTEQTPGQEVVLSPGSFMSITFRS
       :: ::.:: :.:::::.::. .  .::::.::.:.::::..::...  : :: ..:::::
CCDS12 YFTHFDLELSHLCEYDFVKLSSGAKVLATLCGQESTDTERAPGKDTFYSLGSSLDITFRS
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 DFSNEERFTGFDAHYMAVDVDECKEREDEELSCDHYCHNYIGGYYCSCRFGYILHTDNRT
       :.:::. ::::.: : : :.:::.    :  .:::.:::..::.::::: ::.:: ..::
CCDS12 DYSNEKPFTGFEAFYAAEDIDECQVAPGEAPTCDHHCHNHLGGFYCSCRAGYVLHRNKRT
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 CRVECSDNLFTQRTGVITSPDFPNPYPKSSECLYTIELEEGFMVNLQFEDIFDIEDHPEV
       : . :: ..::::.: ..::..: :::: : : :.: ::::: : :.: . ::.: :::.
CCDS12 CSALCSGQVFTQRSGELSSPEYPRPYPKLSSCTYSISLEEGFSVILDFVESFDVETHPET
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 PCPYDYIKIKVGPKVLGPFCGEKAPEPISTQSHSVLILFHSDNSGENRGWRLSYRAAGNE
        ::::..::..  .  :::::.  :. : :.:..: : : .:.::.. ::.. : .... 
CCDS12 LCPYDFLKIQTDREEHGPFCGKTLPHRIETKSNTVTITFVTDESGDHTGWKIHYTSTAQP
     240       250       260       270       280       290         

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 CPELQPPVHGKIEPSQAKYFFKDQVLVSCDTGYKVLKDNVEMDTFQIECLKDGTWSNKIP
       ::  . : .:.. : ::::..::.  . :.:::..:. .. . .:   : :::.:.  .:
CCDS12 CPYPMAPPNGHVSPVQAKYILKDSFSIFCETGYELLQGHLPLKSFTAVCQKDGSWDRPMP
     300       310       320       330       340       350         

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 TCKIVDCRAPGELEHGLITFSTRNNLTTYKSEIKYSCQEPYYKMLNNNTGIYTCSAQGVW
       .:.::::  : .:  : . . :  ..::::. :.:::.: .: : . : : :.: :.: :
CCDS12 ACSIVDCGPPDDLPSGRVEYITGPGVTTYKAVIQYSCEETFYTM-KVNDGKYVCEADGFW
     360       370       380       390       400        410        

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 MNKVLGRSLPTCLPECGQPSRSLPSLVKRIIGGRNAEPGLFPWQALIVVEDTSRVPNDKW
        ..   .:::.: : ::  .:.  .   :: ::..:.:: ::::.::.   :.       
CCDS12 TSSKGEKSLPVCEPVCGLSARTTGG---RIYGGQKAKPGDFPWQVLILGGTTA-------
      420       430       440          450       460               

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 FGSGALLSASWILTAAHVLRSQRRDTTVIPVSKEHVTVYLGLHDVRDKSGAVNSSAARVV
         .::::  .:.:::::..  :..:.... . .  .   :. : ..  : ::        
CCDS12 --AGALLYDNWVLTAAHAVYEQKHDASALDI-RMGTLKRLSPHYTQAWSEAV-------F
        470       480       490        500       510               

               550       560       570       580        590        
pF1KE2 LHPDFNIQ-NYNHDIALVQLQEPVPLGPHVMPVCLPRLEPEGPA-PHMLGLVAGWGISNP
       .:  .. . ....::::..:.. : .. .. :.:::: : :.      .: ..:::... 
CCDS12 IHEGYTHDAGFDNDIALIKLNNKVVINSNITPICLPRKEAESFMRTDDIGTASGWGLTQR
      520       530       540       550       560       570        

      600       610       620       630       640        650       
pF1KE2 NVTVDEIISSGTRTLSDVLQYVKLPVVPHAECKTSYESRSGNY-SVTENMFCAGYYEGGK
       .             :.  :.:: .:.: : .: ..::.      ::: ::.:::   :::
CCDS12 GF------------LARNLMYVDIPIVDHQKCTAAYEKPPYPRGSVTANMLCAGLESGGK
      580                   590       600       610       620      

       660       670       680       690       700       710       
pF1KE2 DTCLGDSGGAFVIFDDLSQRWVVQGLVSWGGPEECGSKQVYGVYTKVSNYVDWVWEQMGL
       :.: ::::::.:..:. ..:: : :.::::.  .::    ::::::: ::. :.      
CCDS12 DSCRGDSGGALVFLDSETERWFVGGIVSWGS-MNCGEAGQYGVYTKVINYIPWIENIISD
        630       640       650        660       670       680     

       720        
pF1KE2 PQSVVEPQVER
                  
CCDS12 F          
                  

>>CCDS81658.1 C1R gene_id:715|Hs108|chr12                 (705 aa)
 initn: 1682 init1: 567 opt: 1298  Z-score: 1144.6  bits: 222.3 E(32554): 2e-57
Smith-Waterman score: 1862; 38.6% identity (66.0% similar) in 736 aa overlap (3-715:2-701)

               10        20         30        40        50         
pF1KE2 MRWLLLYYALCFSLSKASAHTVEL-NNMFGQIQSPGYPDSYPSDSEVTWNITVPDGFRIK
         :::  : :  .:   .. .. . ...::.. :: .:  ::.. :.:  :::: :.:.:
CCDS81  MWLL--YLLVPALFCRAGGSIPIPQKLFGEVTSPLFPKPYPNNFETTTVITVPTGYRVK
                  10        20        30        40        50       

      60        70        80        90       100       110         
pF1KE2 LYFMHFNLESSYLCEYDYVKVETEDQVLATFCGRETTDTEQTPGQEVVLSPGSFMSITFR
       : :..:.:: :  : :::::. .. . :. :::.  .   . ::..  .: :. : .::.
CCDS81 LVFQQFDLEPSEGCFYDYVKISADKKSLGRFCGQLGSPLGNPPGKKEFMSQGNKMLLTFH
        60        70        80        90       100       110       

     120            130       140            150       160         
pF1KE2 SDFSNEER-----FTGFDAHYMAVDVDECKER-----EDEELSCDHYCHNYIGGYYCSCR
       .::::::      . :: :.:.:::.:::  :     :: . .:.: ::::.:::.::::
CCDS81 TDFSNEENGTIMFYKGFLAYYQAVDLDECASRSKSGEEDPQPQCQHLCHNYVGGYFCSCR
       120       130       140       150       160       170       

     170       180       190       200       210       220         
pF1KE2 FGYILHTDNRTCRVECSDNLFTQRTGVITSPDFPNPYPKSSECLYTIELEEGFMVNLQFE
        :: :. : ..:..:::..:.:. .: :.: ..:  :: . .: :.:..:.:. ..:.: 
CCDS81 PGYELQEDRHSCQAECSSELYTEASGYISSLEYPRSYPPDLRCNYSIRVERGLTLHLKFL
       180       190       200       210       220       230       

     230       240       250       260       270       280         
pF1KE2 DIFDIEDHPEVPCPYDYIKIKVGPKVLGPFCGEKAPEPISTQSHSVLILFHSDNSGENRG
       . :::.:: .: :::: ..: .. : .: :::.. :  ..:.:..: .:: .:.::..::
CCDS81 EPFDIDDHQQVHCPYDQLQIYANGKNIGEFCGKQRPPDLDTSSNAVDLLFFTDESGDSRG
       240       250       260       270       280       290       

     290       300       310          320       330       340      
pF1KE2 WRLSYRAAGNECPELQPPVHGK---IEPSQAKYFFKDQVLVSCDTGYKVLKDNVEMDTFQ
       :.: : .   .::  :: .  .   :.  : .: :.:  ...:  ::.... :  . .: 
CCDS81 WKLRYTTEIIKCP--QPKTLDEFTIIQNLQPQYQFRDYFIATCKQGYQLIEGNQVLHSFT
       300       310         320       330       340       350     

        350       360       370       380       390       400      
pF1KE2 IECLKDGTWSNKIPTCKIVDCRAPGELEHGLITFSTRNNLTTYKSEIKYSCQEPYYKMLN
         :  ::::   .: ::: ::  : .: .: . ..:  ...:::..:.: :.:::::: .
CCDS81 AVCQDDGTWHRAMPRCKIKDCGQPRNLPNGDFRYTTTMGVNTYKARIQYYCHEPYYKMQT
         360       370       380       390       400       410     

              410       420       430       440       450       460
pF1KE2 ------NNTGIYTCSAQGVWMNKVLGRSLPTCLPECGQPSRSLPSLVKRIIGGRNAEPGL
             .. :.:::.:::.: :.  :...: ::: ::.:   . .  .:::::..:. : 
CCDS81 RAGSRESEQGVYTCTAQGIWKNEQKGEKIPRCLPVCGKPVNPVEQR-QRIIGGQKAKMGN
         420       430       440       450       460        470    

              470       480       490       500       510       520
pF1KE2 FPWQALIVVEDTSRVPNDKWFGSGALLSASWILTAAHVLRSQRRDTTVIPVSKEHVTVYL
       ::::..  ..           :.::::.  :::::::.:  .....     :.  . :.:
CCDS81 FPWQVFTNIHGR---------GGGALLGDRWILTAAHTLYPKEHEAQ----SNASLDVFL
          480                490       500       510           520 

              530       540          550       560       570       
pF1KE2 GLHDVRDKSGAVNSSAARVVLHPDFNIQ---NYNHDIALVQLQEPVPLGPHVMPVCLPRL
       :  .:..     :    :: .:::.  .   :.. ::::..:.. : :::...:.:::  
CCDS81 GHTNVEELMKLGNHPIRRVSVHPDYRQDESYNFEGDIALLELENSVTLGPNLLPICLPDN
             530       540       550       560       570       580 

       580       590       600       610       620       630       
pF1KE2 EPEGPAPHMLGLVAGWGISNPNVTVDEIISSGTRTLSDVLQYVKLPVVPHAECKTSYESR
       .       ..: :.:.:. . ... :             :..:.:::.    :..  ...
CCDS81 DTFYDLG-LMGYVSGFGVMEEKIAHD-------------LRFVRLPVANPQACENWLRGK
              590       600                    610       620       

       640       650       660       670       680       690       
pF1KE2 SGNYSVTENMFCAGYYEGGKDTCLGDSGGAFVIFDDLSQRWVVQGLVSWGGPEECGSKQV
       .     ..::::::.    .:.: :::::.:.. :  ..:::. :.::::     : .. 
CCDS81 NRMDVFSQNMFCAGHPSLKQDACQGDSGGVFAVRDPNTDRWVATGIVSWG----IGCSRG
       630       640       650       660       670           680   

       700       710       720        
pF1KE2 YGVYTKVSNYVDWVWEQMGLPQSVVEPQVER
       :: :::: :::::. ..:             
CCDS81 YGFYTKVLNYVDWIKKEMEEED         
           690       700              

>>CCDS31735.1 C1S gene_id:716|Hs108|chr12                 (688 aa)
 initn: 908 init1: 424 opt: 1280  Z-score: 1129.0  bits: 219.4 E(32554): 1.5e-56
Smith-Waterman score: 1711; 38.1% identity (65.3% similar) in 724 aa overlap (11-715:3-679)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MRWLLLYYALCFSLSKASAHTVELNNMFGQIQSPGYPDSYPSDSEVTWNITVPDGFRIKL
                 :. : .  : .    .:.:.: ::.::..:::. : .:.: ::.:. :.:
CCDS31         MWCIVLFSLLAWVYAEPTMYGEILSPNYPQAYPSEVEKSWDIEVPEGYGIHL
                       10        20        30        40        50  

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 YFMHFNLESSYLCEYDYVKVETEDQVLATFCGRETTDTEQTPGQEVVLSPGSFMSITFRS
       :: :...: :  : :: :.. . :   . .::...... ..:  :    : . ... :.:
CCDS31 YFTHLDIELSENCAYDSVQIISGDTEEGRLCGQRSSNNPHSPIVEEFQVPYNKLQVIFKS
             60        70        80        90       100       110  

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 DFSNEERFTGFDAHYMAVDVDECKEREDEELSCDHYCHNYIGGYYCSCRFGYILHTDNRT
       ::::::::::: :.:.:.:..:: .  :  . :.:.:.:.::::.:::   :.:: : ..
CCDS31 DFSNEERFTGFAAYYVATDINECTDFVD--VPCSHFCNNFIGGYFCSCPPEYFLHDDMKN
            120       130       140         150       160       170

              190       200       210       220         230        
pF1KE2 CRVECSDNLFTQRTGVITSPDFPNPYPKSSECLYTIELEEGF--MVNLQFEDIFDIEDHP
       : :.:: ..::   : :.::..:.:::..:.: : :.::.::  .:.:. :: ::.:   
CCDS31 CGVNCSGDVFTALIGEIASPNYPKPYPENSRCEYQIRLEKGFQVVVTLRRED-FDVEAAD
              180       190       200       210       220          

      240       250       260         270       280       290      
pF1KE2 EVPCPYDYIKIKVGPKVLGPFCGEKAPEP--ISTQSHSVLILFHSDNSGENRGWRLSYRA
        .    : . . .: . .::.::.  : :  : :.:... :.:..: .:...::.: :..
CCDS31 SAGNCLDSLVFVAGDRQFGPYCGHGFPGPLNIETKSNALDIIFQTDLTGQKKGWKLRYHG
     230       240       250       260       270       280         

        300       310       320       330       340       350      
pF1KE2 AGNECPELQPPVHGKIEPSQAKYFFKDQVLVSCDTGYKVLKDNVEMDTFQIECLKDGTWS
           ::. . : ..  ::..::: :.: : ..:  :..:..  :   .:   : ..: ::
CCDS31 DPMPCPKEDTP-NSVWEPAKAKYVFRDVVQITCLDGFEVVEGRVGATSFYSTCQSNGKWS
     290       300        310       320       330       340        

        360       370       380       390       400       410      
pF1KE2 NKIPTCKIVDCRAPGELEHGLITFSTRNNLTTYKSEIKYSCQEPYYKMLNNNTGIYTCSA
       :.   :. :::  :  .:.: .      . : . : :.:.:.:::: : :.. : : :..
CCDS31 NSKLKCQPVDCGIPESIENGKV---EDPESTLFGSVIRYTCEEPYYYMENGGGGEYHCAG
      350       360       370          380       390       400     

        420       430       440       450       460       470      
pF1KE2 QGVWMNKVLGRSLPTCLPECGQPSRSLPSLVKRIIGGRNAEPGLFPWQALIVVEDTSRVP
       .: :.:.:::  :: :.: :: : . .    .::::: .:.   ::::...         
CCDS31 NGSWVNEVLGPELPKCVPVCGVPREPFEEK-QRIIGGSDADIKNFPWQVFF---------
         410       420       430        440       450              

        480       490       500       510       520       530      
pF1KE2 NDKWFGSGALLSASWILTAAHVLRSQRRDTTVIPVSKEHVTVYLGLHDVRDKSGAVNS--
       .. : : :::..  :.::::::....:.     :      :.:.:  .:. .  : ..  
CCDS31 DNPWAG-GALINEYWVLTAAHVVEGNRE-----P------TMYVGSTSVQTSRLAKSKML
         460        470       480                  490       500   

          540              550       560       570       580       
pF1KE2 SAARVVLHPDFNI-------QNYNHDIALVQLQEPVPLGPHVMPVCLPRLEPE-GPAPHM
       .  .: .:: ...        :...:::::.:..:: .:: : :.:::    . .     
CCDS31 TPEHVFIHPGWKLLEVPEGRTNFDNDIALVRLKDPVKMGPTVSPICLPGTSSDYNLMDGD
           510       520       530       540       550       560   

        590       600       610       620       630        640     
pF1KE2 LGLVAGWGISNPNVTVDEIISSGTRTLSDVLQYVKLPVVPHAECK-TSYESRSGN---YS
       :::..::: ..     :. .          :. ..:::.:  .:: .. :. ...   : 
CCDS31 LGLISGWGRTEKR---DRAVR---------LKAARLPVAPLRKCKEVKVEKPTADAEAYV
           570          580                590       600       610 

            650       660       670        680       690       700 
pF1KE2 VTENMFCAGYYEGGKDTCLGDSGGAFVIFDDLSQ-RWVVQGLVSWGGPEECGSKQVYGVY
        : ::.:::  : : :.: :::::::.. :  .. .. . :::::: :. ::.   ::.:
CCDS31 FTPNMICAGG-EKGMDSCKGDSGGAFAVQDPNDKTKFYAAGLVSWG-PQ-CGT---YGLY
             620        630       640       650         660        

             710       720        
pF1KE2 TKVSNYVDWVWEQMGLPQSVVEPQVER
       :.:.:::::. . :             
CCDS31 TRVKNYVDWIMKTMQENSTPRED    
         670       680            

>>CCDS124.1 MASP2 gene_id:10747|Hs108|chr1                (185 aa)
 initn: 676 init1: 676 opt: 686  Z-score: 617.3  bits: 122.8 E(32554): 4.6e-28
Smith-Waterman score: 686; 51.4% identity (76.2% similar) in 181 aa overlap (1-181:1-180)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MRWLLLYYALCFSLSKASAHTVELNNMFGQIQSPGYPDSYPSDSEVTWNITVPDGFRIKL
       :: : :   :: :..   .     . .::.. :::.:  : .:.:  :..:.: :.:..:
CCDS12 MRLLTLLGLLCGSVATPLGPKWP-EPVFGRLASPGFPGEYANDQERRWTLTAPPGYRLRL
               10        20         30        40        50         

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 YFMHFNLESSYLCEYDYVKVETEDQVLATFCGRETTDTEQTPGQEVVLSPGSFMSITFRS
       :: ::.:: :.:::::.::. .  .::::.::.:.::::..::...  : :: ..:::::
CCDS12 YFTHFDLELSHLCEYDFVKLSSGAKVLATLCGQESTDTERAPGKDTFYSLGSSLDITFRS
      60        70        80        90       100       110         

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 DFSNEERFTGFDAHYMAVDVDECKEREDEELSCDHYCHNYIGGYYCSCRFGYILHTDNRT
       :.:::. ::::.: : : :.:::.    :  .:::.:::..::.::::: ::.:: ..::
CCDS12 DYSNEKPFTGFEAFYAAEDIDECQVAPGEAPTCDHHCHNHLGGFYCSCRAGYVLHRNKRT
     120       130       140       150       160       170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 CRVECSDNLFTQRTGVITSPDFPNPYPKSSECLYTIELEEGFMVNLQFEDIFDIEDHPEV
       :                                                           
CCDS12 CSEQSL                                                      
     180                                                           

>>CCDS8487.1 ST14 gene_id:6768|Hs108|chr11                (855 aa)
 initn: 545 init1: 128 opt: 457  Z-score: 408.7  bits: 86.5 E(32554): 1.9e-16
Smith-Waterman score: 625; 25.4% identity (51.6% similar) in 727 aa overlap (33-717:230-855)

             10        20        30         40        50        60 
pF1KE2 WLLLYYALCFSLSKASAHTVELNNMFGQIQSPGYPDS-YPSDSEVTWNITVPDGFRIKLY
                                     .::.::: ::. ..  : .       ..: 
CCDS84 PTDSKTVQRTQDNSCSFGLHARGVELMRFTTPGFPDSPYPAHARCQWALRGDADSVLSLT
     200       210       220       230       240       250         

              70        80             90       100        110     
pF1KE2 FMHFNLESSYLCEYDYVKVET-----EDQVLATFCGRETTDTEQTPGQEVVL-SPGSFMS
       :  :.: :      : : : .     : ..:. .::         :. .... :  . . 
CCDS84 FRSFDLASCDERGSDLVTVYNTLSPMEPHALVQLCGT------YPPSYNLTFHSSQNVLL
     260       270       280       290             300       310   

         120       130       140       150       160       170     
pF1KE2 ITFRSDFSNEERFTGFDAHYMAVDVDECKEREDEELSCDHYCHNYIGGYYCSCRFGYILH
       ::. ..  .:.:  ::.: .. .       : .   ::        ::            
CCDS84 ITLITN--TERRHPGFEATFFQLP------RMS---SC--------GGR-----------
             320       330                340                      

         180       190       200       210       220       230     
pF1KE2 TDNRTCRVECSDNLFTQRTGVITSPDFPNPYPKSSECLYTIELEEGFMVNLQFEDIFDIE
                     . .  :...:: .:. :: . .: ..::. ..  :...:. .. .:
CCDS84 --------------LRKAQGTFNSPYYPGHYPPNIDCTWNIEVPNNQHVKVRFKFFYLLE
                         350       360       370       380         

         240          250       260       270       280       290  
pF1KE2 DHPEVP---CPYDYIKIKVGPKVLGPFCGEKAPEPISTQSHSVLILFHSDNSGENRGW--
         : ::   :: ::..:. : :    .:::..   ....:... . ::::.:  . :.  
CCDS84 --PGVPAGTCPKDYVEIN-GEK----YCGERSQFVVTSNSNKITVRFHSDQSYTDTGFLA
       390       400            410       420       430       440  

               300       310       320       330       340         
pF1KE2 -RLSYRAAGNECPELQPPVHGKIEPSQAKYFFKDQVLVSCDTGYKVLKDNVEMDTFQIEC
         ::: .. . ::       :..    .. . :.   . :: :.    :.   : ..  :
CCDS84 EYLSYDSS-DPCP-------GQFTCRTGRCIRKE---LRCD-GWADCTDH--SDELNCSC
            450               460          470        480          

     350       360               370           380       390       
pF1KE2 LKDGTWSNKIPTCK--------IVDCRAPGELEHGLI----TFSTRNNLTTYKSEI---K
            .. :   ::        . ::   .. :.:      ::   :.    ::.    :
CCDS84 DAGHQFTCKNKFCKPLFWVCDSVNDCGDNSD-EQGCSCPAQTFRCSNGKCLSKSQQCNGK
      490       500       510        520       530       540       

          400       410       420         430         440          
pF1KE2 YSCQEPYYKMLNNNTGIYTCSAQGVW-MNKV-LGRSLPTC--LPECGQPSR------SLP
        .: .   .    .... ::. .    .: . :... : :    .:.. :       .: 
CCDS84 DDCGDGSDEASCPKVNVVTCTKHTYRCLNGLCLSKGNPECDGKEDCSDGSDEKDCDCGLR
       550       560       570       580       590       600       

            450       460       470       480       490       500  
pF1KE2 SLVK--RIIGGRNAEPGLFPWQALIVVEDTSRVPNDKWFGSGALLSASWILTAAHVLRSQ
       :...  :..:: .:. : .:::. . .   ...      :. .:.: .:...:::   ..
CCDS84 SFTRQARVVGGTDADEGEWPWQVSLHALGQGHI-----CGA-SLISPNWLVSAAHCYIDD
       610       620       630       640             650       660 

            510       520         530       540       550       560
pF1KE2 RRDTTVIPVSKEHVTVYLGLHDVRDKS--GAVNSSAARVVLHPDFNIQNYNHDIALVQLQ
       :      :.   . :..:::::  ..:  :. .    :.. :: ::  ....::::..:.
CCDS84 RGFRYSDPT---QWTAFLGLHDQSQRSAPGVQERRLKRIISHPFFNDFTFDYDIALLELE
             670          680       690       700       710        

              570       580       590       600       610       620
pF1KE2 EPVPLGPHVMPVCLPRLEPEGPAPHMLGLVAGWGISNPNVTVDEIISSGTRTLSDVLQYV
       .:.  .  : :.:::      :: . .  :.::: ..          .:: .:  .::  
CCDS84 KPAEYSSMVRPICLPDASHVFPAGKAI-WVTGWGHTQ---------YGGTGAL--ILQKG
      720       730       740        750                760        

              630       640       650       660       670       680
pF1KE2 KLPVVPHAECKTSYESRSGNYSVTENMFCAGYYEGGKDTCLGDSGGAFVIFDDLSQRWVV
       .. :. .. :..   ..     .:  :.:.:.  :: :.: ::::: .   .  . :   
CCDS84 EIRVINQTTCENLLPQQ-----ITPRMMCVGFLSGGVDSCQGDSGGPLSSVEA-DGRIFQ
        770       780            790       800       810        820

              690       700       710       720        
pF1KE2 QGLVSWGGPEECGSKQVYGVYTKVSNYVDWVWEQMGLPQSVVEPQVER
        :.::::  . :....  ::::..  . ::. :. :.           
CCDS84 AGVVSWG--DGCAQRNKPGVYTRLPLFRDWIKENTGV           
                830       840       850                

>>CCDS7449.1 TLL2 gene_id:7093|Hs108|chr10                (1015 aa)
 initn: 402 init1: 206 opt: 441  Z-score: 393.8  bits: 83.9 E(32554): 1.3e-15
Smith-Waterman score: 614; 32.9% identity (61.8% similar) in 346 aa overlap (24-352:624-945)

                      10        20        30        40        50   
pF1KE2        MRWLLLYYALCFSLSKASAHTVELNNMFGQIQSPGYPDSYPSDSEVTWNITVP
                                     .... : : :::.:  ::.... .:....:
CCDS74 NTLGSYKCACDPGYELAADKKMCEVACGGFITKLNGTITSPGWPKEYPTNKNCVWQVVAP
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pF1KE2 DGFRIKLYFMHFNLESSYLCEYDYVKVET----EDQVLATFCGRETTDTEQTPGQEVVLS
         .::.: :  :.::.. .:.::.:.:..    . .. . ::: ::      :  ::. :
CCDS74 AQYRISLQFEVFELEGNDVCKYDFVEVRSGLSPDAKLHGRFCGSET------P--EVITS
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pF1KE2 PGSFMSITFRSDFSNEERFTGFDAHYMAVDVDECKEREDEELSCDHYCHNYIGGYYCSCR
        .. : . :.:: .  .:  :: ::... : ::: .   .. .:.: : : .:.: : ::
CCDS74 QSNNMRVEFKSDNTVSKR--GFRAHFFS-DKDECAK---DNGGCQHECVNTFGSYLCRCR
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pF1KE2 FGYILHTDNRTCRVECSDNLFTQRTGVITSPDFPNPYPKSSECLYTIELEEGFMVNLQFE
        :: :: ... :.     . ...  :...::..:. ::.  :: ..:    :  :.: :.
CCDS74 NGYWLHENGHDCKEAGCAHKISSVEGTLASPNWPDKYPSRRECTWNISSTAGHRVKLTFN
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pF1KE2 DIFDIEDHPEVPCPYDYIKIKVGPK----VLGPFCGEKAPEPISTQSHSVLILFHSDNSG
       . :.::.: :  : ::....  ::     .:: ::: : :.:  ... :... :.:: : 
CCDS74 E-FEIEQHQE--CAYDHLEMYDGPDSLAPILGRFCGSKKPDPTVASGSSMFLRFYSDASV
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       . .:..   : . .:    :.:      :...     ::.:.    : :.:. : :: : 
CCDS74 QRKGFQAVHSTECGGRLKAEVQTKELYSHAQFGDNNYPSEARC---DWVIVAED-GYGV-
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pF1KE2 KDNVEMDTFQIECLKDGTWSNKIPTCKIVDCRAPGELEHGLITFSTRNNLTTYKSEIKYS
         .. . ::..:   :                                            
CCDS74 --ELTFRTFEVEEEADCGYDYMEAYDGYDSSAPRLGRFCGSGPLEEIYSAGDSLMIRFRT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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