Result of FASTA (ccds) for pFN21AE2442
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE2442, 1956 aa
  1>>>pF1KE2442 1956 - 1956 aa - 1956 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7190+/-0.00111; mu= 13.2276+/- 0.066
 mean_var=129.3274+/-26.576, 0's: 0 Z-trim(107.4): 107  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.112779
 statistics sampled from 9467 (9574) to 9467 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.631), E-opt: 0.2 (0.294), width:  16
 Scan time:  5.410

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS33736.1 SCN10A gene_id:6336|Hs108|chr3         (1956) 13035 2133.7       0
CCDS46799.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3          (2016) 6011 990.8       0
CCDS46796.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3          (2016) 6011 990.8       0
CCDS46797.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3          (2015) 6003 989.5       0
CCDS54569.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3          (1962) 5399 891.2       0
CCDS46440.1 SCN3A gene_id:6328|Hs108|chr2          (1951) 4732 782.7       0
CCDS54570.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3          (1983) 3990 662.0 6.6e-189
CCDS33313.1 SCN2A gene_id:6326|Hs108|chr2          (2005) 3986 661.3  1e-188
CCDS33314.1 SCN2A gene_id:6326|Hs108|chr2          (2005) 3986 661.3  1e-188
CCDS33312.1 SCN3A gene_id:6328|Hs108|chr2          (2000) 3922 650.9 1.4e-185
CCDS54414.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2          (1981) 3902 647.7 1.4e-184
CCDS33316.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2          (1998) 3902 647.7 1.4e-184
CCDS54413.1 SCN1A gene_id:6323|Hs108|chr2          (2009) 3902 647.7 1.4e-184
CCDS45761.1 SCN4A gene_id:6329|Hs108|chr17         (1836) 3892 646.0 3.9e-184
CCDS46441.1 SCN9A gene_id:6335|Hs108|chr2          (1977) 3847 638.7 6.7e-182
CCDS53794.1 SCN8A gene_id:6334|Hs108|chr12         (1939) 3818 634.0 1.7e-180
CCDS44891.1 SCN8A gene_id:6334|Hs108|chr12         (1980) 3789 629.3 4.6e-179
CCDS81692.1 SCN8A gene_id:6334|Hs108|chr12         (1980) 3789 629.3 4.6e-179
CCDS46798.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3          (1998) 2858 477.8 1.9e-133
CCDS33737.1 SCN11A gene_id:11280|Hs108|chr3        (1791) 2754 460.9 2.1e-128
CCDS46442.1 SCN7A gene_id:6332|Hs108|chr2          (1682) 2613 437.9 1.6e-121
CCDS46849.1 CACNA1D gene_id:776|Hs108|chr3         (2137) 1154 200.6 5.7e-50
CCDS44795.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12        (2146) 1148 199.6 1.1e-49
CCDS44801.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12        (2146) 1147 199.4 1.3e-49
CCDS44796.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12        (2144) 1142 198.6 2.2e-49
CCDS53735.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12        (2157) 1129 196.5 9.6e-49
CCDS59166.1 CACNA1F gene_id:778|Hs108|chrX         (1912) 1120 195.0 2.4e-48
CCDS59167.1 CACNA1F gene_id:778|Hs108|chrX         (1966) 1120 195.0 2.4e-48
CCDS35253.1 CACNA1F gene_id:778|Hs108|chrX         (1977) 1120 195.0 2.5e-48
CCDS53734.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12        (2138) 1119 194.9 2.9e-48
CCDS44791.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12        (2138) 1119 194.9 2.9e-48
CCDS53733.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12        (2173) 1119 194.9   3e-48
CCDS44798.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12        (2138) 1118 194.7 3.3e-48
CCDS44793.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12        (2157) 1115 194.2 4.7e-48
CCDS44799.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12        (2157) 1114 194.1 5.2e-48
CCDS55665.1 CACNA1E gene_id:777|Hs108|chr1         (2251) 1114 194.1 5.4e-48
CCDS53443.1 CACNA1E gene_id:777|Hs108|chr1         (2270) 1114 194.1 5.5e-48
CCDS55664.1 CACNA1E gene_id:777|Hs108|chr1         (2313) 1114 194.1 5.5e-48
CCDS44794.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12        (2138) 1105 192.6 1.4e-47
CCDS44787.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12        (2138) 1104 192.4 1.6e-47
CCDS44800.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12        (2138) 1104 192.4 1.6e-47
CCDS53736.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12        (2173) 1104 192.4 1.6e-47
CCDS44789.1 CACNA1C gene_id:775|Hs108|chr12        (2158) 1028 180.1 8.5e-44
CCDS45733.1 CACNA1G gene_id:8913|Hs108|chr17       (2266)  875 155.2 2.8e-36
CCDS58568.1 CACNA1G gene_id:8913|Hs108|chr17       (2314)  875 155.2 2.8e-36
CCDS46848.1 CACNA1D gene_id:776|Hs108|chr3         (2161)  849 151.0   5e-35
CCDS2872.1 CACNA1D gene_id:776|Hs108|chr3          (2181)  849 151.0   5e-35
CCDS1407.1 CACNA1S gene_id:779|Hs108|chr1          (1873)  822 146.5 9.2e-34
CCDS59523.1 CACNA1B gene_id:774|Hs108|chr9         (2237)  817 145.8 1.9e-33
CCDS59522.1 CACNA1B gene_id:774|Hs108|chr9         (2339)  817 145.8   2e-33


>>CCDS33736.1 SCN10A gene_id:6336|Hs108|chr3              (1956 aa)
 initn: 13035 init1: 13035 opt: 13035  Z-score: 11458.6  bits: 2133.7 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 13035; 99.9% identity (100.0% similar) in 1956 aa overlap (1-1956:1-1956)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE2 MEFPIGSLETNNFRRFTPESLVEIEKQIAAKQGTKKAREKHREQKDQEEKPRPQLDLKAC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MEFPIGSLETNNFRRFTPESLVEIEKQIAAKQGTKKAREKHREQKDQEEKPRPQLDLKAC
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE2 NQLPKFYGELPAELIGEPLEDLDPFYSTHRTFMVLNKGRTISRFSATRALWLFSPFNLIR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NQLPKFYGELPAELIGEPLEDLDPFYSTHRTFMVLNKGRTISRFSATRALWLFSPFNLIR
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE2 RTAIKVSVHSWFSLFITVTILVNCVCMTRTDLPEKIEYVFTVIYTFEALIKILARGFCLN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 RTAIKVSVHSWFSLFITVTILVNCVCMTRTDLPEKIEYVFTVIYTFEALIKILARGFCLN
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE2 EFTYLRDPWNWLDFSVITLAYVGTAIDLRGISGLRTFRVLRALKTVSVIPGLKVIVGALI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EFTYLRDPWNWLDFSVITLAYVGTAIDLRGISGLRTFRVLRALKTVSVIPGLKVIVGALI
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE2 HSVKKLADVTILTIFCLSVFALVGLQLFKGNLKNKCVKNDMAVNETTNYSSHRKPDIYIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 HSVKKLADVTILTIFCLSVFALVGLQLFKGNLKNKCVKNDMAVNETTNYSSHRKPDIYIN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE2 KRGTSDPLLCGNGSDSGHCPDGYICLKTSDNPDFNYTSFDSFAWAFLSLFRLMTQDSWER
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KRGTSDPLLCGNGSDSGHCPDGYICLKTSDNPDFNYTSFDSFAWAFLSLFRLMTQDSWER
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE2 LYQQTLRTSGKIYMIFFVLVIFLGSFYLVNLILAVVTMAYEEQNQATTDEIEAKEKKFQE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LYQQTLRTSGKIYMIFFVLVIFLGSFYLVNLILAVVTMAYEEQNQATTDEIEAKEKKFQE
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE2 ALEMLRKEQEVLAALGIDTTSLHSHNGSPLTSKNASERRHRIKPRVSEGSTEDNKSPRSD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ALEMLRKEQEVLAALGIDTTSLHSHNGSPLTSKNASERRHRIKPRVSEGSTEDNKSPRSD
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE2 PYNQRRMSFLGLASGKRRASHGSVFHFRSPGRDISLPEGVTDDGVFPGDHESHRGSLLLG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PYNQRRMSFLGLASGKRRASHGSVFHFRSPGRDISLPEGVTDDGVFPGDHESHRGSLLLG
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE2 GGAGQQGPLPRSPLPQPSNPDSRHGEDEHQPPPTSELAPGAVDVSAFDAGQKKTFLSAEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GGAGQQGPLPRSPLPQPSNPDSRHGEDEHQPPPTSELAPGAVDVSAFDAGQKKTFLSAEY
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE2 LDEPFRAQRAMSVVSIITSVLEELEESEQKCPPCLTSLSQKYLIWDCCPMWVKLKTILFG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LDEPFRAQRAMSVVSIITSVLEELEESEQKCPPCLTSLSQKYLIWDCCPMWVKLKTILFG
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE2 LVTDPFAELTITLCIVVNTIFMAMEHHGMSPTFEAMLQIGNIVFTIFFTAEMVFKIIAFD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LVTDPFAELTITLCIVVNTIFMAMEHHGMSPTFEAMLQIGNIVFTIFFTAEMVFKIIAFD
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE2 PYYYFQKKWNIFDCIIVTVSLLELGVAKKGSLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNTLIKII
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PYYYFQKKWNIFDCIIVTVSLLELGVAKKGSLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNTLIKII
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE2 GNSVGALGNLTIILAIIVFVFALVGKQLLGENYRNNRKNISAPHEDWPRWHMHDFFHSFL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GNSVGALGNLTIILAIIVFVFALVGKQLLGENYRNNRKNISAPHEDWPRWHMHDFFHSFL
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE2 IVFRILCGEWIENMWACMEVGQKSICLILFLTVMVLGNLVVLNLFIALLLNSFSADNLTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IVFRILCGEWIENMWACMEVGQKSICLILFLTVMVLGNLVVLNLFIALLLNSFSADNLTA
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE2 PEDDGEVNNLQVALARIQVFGHRTKQALCSFFSRSCPFPQPKAEPELVVKLPLSSSKAEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 PEDDGEVNNLQVALARIQVFGHRTKQALCSFFSRSCPFPQPKAEPELVVKLPLSSSKAEN
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE2 HIAANTARGSSGGLQAPRGPRDEHSDFIANPTVWVSVPIAEGESDLDDLEDDGGEDAQSF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 HIAANTARGSSGGLQAPRGPRDEHSDFIANPTVWVSVPIAEGESDLDDLEDDGGEDAQSF
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE2 QQEVIPKGQQEQLQQVERCGDHLTPRSPGTGTSSEDLAPSLGETWKDESVPQVPAEGVDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QQEVIPKGQQEQLQQVERCGDHLTPRSPGTGTSSEDLAPSLGETWKDESVPQVPAEGVDD
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE2 TSSSEGSTVDCLDPEEILRKIPELADDLEEPDDCFTEGCIRHCPCCKLDTTKSPWDVGWQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TSSSEGSTVDCLDPEEILRKIPELADDLEEPDDCFTEGCIRHCPCCKLDTTKSPWDVGWQ
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE2 VRKTCYRIVEHSWFESFIIFMILLSSGSLAFEDYYLDQKPTVKALLEYTDRVFTFIFVFE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VRKTCYRIVEHSWFESFIIFMILLSSGSLAFEDYYLDQKPTVKALLEYTDRVFTFIFVFE
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             1210      1220      1230      1240      1250      1260
pF1KE2 MLLKWVAYGFKKYFTNAWCWLDFLIVNISLISLTAKILEYSEVAPIKALRTLRALRPLRA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MLLKWVAYGFKKYFTNAWCWLDFLIVNISLISLTAKILEYSEVAPIKALRTLRALRPLRA
             1210      1220      1230      1240      1250      1260

             1270      1280      1290      1300      1310      1320
pF1KE2 LSRFEGMRVVVDALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFWRCINYTDGEFSL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LSRFEGMRVVVDALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFWRCINYTDGEFSL
             1270      1280      1290      1300      1310      1320

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pF1KE2 VPLSIVNNKSDCKIQNSTGSFFWVNVKVNFDNVAMGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VPLSIVNNKSDCKIQNSTGSFFWVNVKVNFDNVAMGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSR
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             1390      1400      1410      1420      1430      1440
pF1KE2 EVNMQPKWEDNVYMYLYFVIFIIFGGFFTLNLFVGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEEQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EVNMQPKWEDNVYMYLYFVIFIIFGGFFTLNLFVGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEEQK
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             1450      1460      1470      1480      1490      1500
pF1KE2 KYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPLNKFQGFVFDIVTRQAFDITIMVLICLNMITMMVETDDQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPLNKFQGFVFDIVTRQAFDITIMVLICLNMITMMVETDDQ
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pF1KE2 SEEKTKILGKINQFFVAVFTGECVMKMFALRQYYFTNGWNVFDFIVVVLSIASLIFSAIL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SEEKTKILGKINQFFVAVFTGECVMKMFALRQYYFTNGWNVFDFIVVVLSIASLIFSAIL
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pF1KE2 KSLQSYFSPTLFRVIRLARIGRILRLIRAAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 KSLQSYFSPTLFRVIRLARIGRILRLIRAAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFI
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             1630      1640      1650      1660      1670      1680
pF1KE2 YSIFGMSSFPHVRWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLSPILNTGPPYCDP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YSIFGMSSFPHVRWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLSPILNTGPPYCDP
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             1690      1700      1710      1720      1730      1740
pF1KE2 NLPNSNGTRGDCGSPAVGIIFFTTYIIISFLIVVNMYIAVILENFNVATEESTEPLSEDD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NLPNSNGTRGDCGSPAVGIIFFTTYIIISFLIMVNMYIAVILENFNVATEESTEPLSEDD
             1690      1700      1710      1720      1730      1740

             1750      1760      1770      1780      1790      1800
pF1KE2 FDMFYETWEKFDPEATQFITFSALSDFADTLSGPLRIPKPNRNILIQMDLPLVPGDKIHC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FDMFYETWEKFDPEATQFITFSALSDFADTLSGPLRIPKPNRNILIQMDLPLVPGDKIHC
             1750      1760      1770      1780      1790      1800

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pF1KE2 LDILFAFTKNVLGESGELDSLKANMEEKFMATNLSKSSYEPIATTLRWKQEDISATVIQK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LDILFAFTKNVLGESGELDSLKANMEEKFMATNLSKSSYEPIATTLRWKQEDISATVIQK
             1810      1820      1830      1840      1850      1860

             1870      1880      1890      1900      1910      1920
pF1KE2 AYRSYVLHRSMALSNTPCVPRAEEEAASLPDEGFVAFTANENCVLPDKSETASATSFPPS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AYRSYVLHRSMALSNTPCVPRAEEEAASLPDEGFVAFTANENCVLPDKSETASATSFPPS
             1870      1880      1890      1900      1910      1920

             1930      1940      1950      
pF1KE2 YESVTRGLSDRVNMRTSSSIQNEDEATSMELIAPGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YESVTRGLSDRVNMRTSSSIQNEDEATSMELIAPGP
             1930      1940      1950      

>>CCDS46799.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3               (2016 aa)
 initn: 6972 init1: 1963 opt: 6011  Z-score: 5282.0  bits: 990.8 E(32554):    0
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pF1KE2 MEFPIGSLETNNFRRFTPESLVEIEKQIAAKQ--GTKKAREKHREQKDQEEKPRPQLDLK
                           :. :::..: ::  :.   .:. ::   .:: :::::::.
CCDS46 MANFLLPRGTSSFRRFTRESLAAIEKRMAEKQARGSTTLQES-REGLPEEEAPRPQLDLQ
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pF1KE2 ACNQLPKFYGELPAELIGEPLEDLDPFYSTHRTFMVLNKGRTISRFSATRALWLFSPFNL
       : ..:: .::. : ::::::::::::::::..::.:::::.:: ::::: ::...:::. 
CCDS46 ASKKLPDLYGNPPQELIGEPLEDLDPFYSTQKTFIVLNKGKTIFRFSATNALYVLSPFHP
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pF1KE2 IRRTAIKVSVHSWFSLFITVTILVNCVCMTRTDLP---EKIEYVFTVIYTFEALIKILAR
       :::.:.:. ::: :...:  :::.::: :.. : :   . .::.::.:::::.:.:::::
CCDS46 IRRAAVKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMAQHDPPPWTKYVEYTFTAIYTFESLVKILAR
     120       130       140       150       160       170         

         180       190       200       210       220       230     
pF1KE2 GFCLNEFTYLRDPWNWLDFSVITLAYVGTAIDLRGISGLRTFRVLRALKTVSVIPGLKVI
       ::::. ::.::::::::::::: .:::.  : : ..:.::::::::::::.:::::::.:
CCDS46 GFCLHAFTFLRDPWNWLDFSVIIMAYVSENIKLGNLSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTI
     180       190       200       210       220       230         

         240       250       260       270       280       290     
pF1KE2 VGALIHSVKKLADVTILTIFCLSVFALVGLQLFKGNLKNKCVKNDMAVNETTNYSSH---
       :::::.:::::::: .::.::::::::.::::: :::..:::.:  :.:  :: : .   
CCDS46 VGALIQSVKKLADVMVLTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRHKCVRNFTALN-GTNGSVEADG
     240       250       260       270       280        290        

                      300       310       320       330       340  
pF1KE2 ----------RKPDIYINKRGTSDPLLCGNGSDSGHCPDGYICLKTSDNPDFNYTSFDSF
                   :. :. : :::: :::::.::.: ::.:: :::...::: .:::::::
CCDS46 LVWESLDLYLSDPENYLLKNGTSDVLLCGNSSDAGTCPEGYRCLKAGENPDHGYTSFDSF
      300       310       320       330       340       350        

            350       360       370       380       390       400  
pF1KE2 AWAFLSLFRLMTQDSWERLYQQTLRTSGKIYMIFFVLVIFLGSFYLVNLILAVVTMAYEE
       :::::.:::::::: ::::::::::..::::::::.::::::::::::::::::.:::::
CCDS46 AWAFLALFRLMTQDCWERLYQQTLRSAGKIYMIFFMLVIFLGSFYLVNLILAVVAMAYEE
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            410       420       430       440       450       460  
pF1KE2 QNQATTDEIEAKEKKFQEALEMLRKEQEVLAALGIDTTSLHSHNGSPLTSKNASERRHRI
       :::::  : : :::.::::.:::.::.:.:.  :.::.:  : . :::.  :. ::: . 
CCDS46 QNQATIAETEEKEKRFQEAMEMLKKEHEALTIRGVDTVSRSSLEMSPLAPVNSHERRSKR
      420       430       440       450       460       470        

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pF1KE2 KPRVSEGSTE--DNKSPRSDPYN-QRRMSFLGLASG------KRRASHGSVFHFRSPGRD
       . :.: :. :  ... :.::  .  : :. :.:. :      : :.:.::.: ::   ::
CCDS46 RKRMSSGTEECGEDRLPKSDSEDGPRAMNHLSLTRGLSRTSMKPRSSRGSIFTFRR--RD
      480       490       500       510       520       530        

           520        530           540       550              560 
pF1KE2 ISLPEGVTDD-GVFPGDHESHRGSLL----LGGGAGQQGPLPRSPLP-------QPSNPD
       ..     .:: .   :. :::. :::    :   ..:  : : .  :       . :. :
CCDS46 LGSEADFADDENSTAGESESHHTSLLVPWPLRRTSAQGQPSPGTSAPGHALHGKKNSTVD
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                    570       580             590           600    
pF1KE2 SRH-------GEDEHQPPPTSELAPGAVD------VSAFDAGQKKTFLS----AEYLDEP
                 :. :   : .  : :  ..      . . . :  . . :    .. ..::
CCDS46 CNGVVSLLGAGDPEATSPGSHLLRPVMLEHPPDTTTPSEEPGGPQMLTSQAPCVDGFEEP
        600       610       620       630       640       650      

          610       620       630       640       650       660    
pF1KE2 FRAQRAMSVVSIITSVLEELEESEQKCPPCLTSLSQKYLIWDCCPMWVKLKTILFGLVTD
          :::.:.::..::.:::::::..::::: . :.:.::::.:::.:...:  .  .: :
CCDS46 GARQRALSAVSVLTSALEELEESRHKCPPCWNRLAQRYLIWECCPLWMSIKQGVKLVVMD
        660       670       680       690       700       710      

          670       680       690       700       710       720    
pF1KE2 PFAELTITLCIVVNTIFMAMEHHGMSPTFEAMLQIGNIVFTIFFTAEMVFKIIAFDPYYY
       ::..::::.:::.::.:::.::..:.  :: :::.::.::: .:::::.:::::.:::::
CCDS46 PFTDLTITMCIVLNTLFMALEHYNMTSEFEEMLQVGNLVFTGIFTAEMTFKIIALDPYYY
        720       730       740       750       760       770      

          730       740       750       760       770       780    
pF1KE2 FQKKWNIFDCIIVTVSLLELGVAKKGSLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSV
       ::. ::::: ::: .::.:::... ..:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FQQGWNIFDSIIVILSLMELGLSRMSNLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSV
        780       790       800       810       820       830      

          790       800       810       820       830       840    
pF1KE2 GALGNLTIILAIIVFVFALVGKQLLGENYRNNRKNISAPHEDWPRWHMHDFFHSFLIVFR
       :::::::..::::::.::.:: ::.:.:: . : . :.     ::::: ::::.:::.::
CCDS46 GALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKNYSELRDSDSGL---LPRWHMMDFFHAFLIIFR
        840       850       860       870          880       890   

          850       860       870       880       890       900    
pF1KE2 ILCGEWIENMWACMEVGQKSICLILFLTVMVLGNLVVLNLFIALLLNSFSADNLTAPEDD
       ::::::::.:: ::::. .:.::..:: :::.:::::::::.::::.::::::::::..:
CCDS46 ILCGEWIETMWDCMEVSGQSLCLLVFLLVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLTAPDED
           900       910       920       930       940       950   

          910          920       930       940            950      
pF1KE2 GEVNNLQVALARIQV---FGHRTKQALCSFFSRSCPFPQPKA---EPEL--VVKLPLSSS
        :.::::.::::::    : .::   .:  . :. :  .: :   . .:   .  : :  
CCDS46 REMNNLQLALARIQRGLRFVKRTTWDFCCGLLRQRP-QKPAALAAQGQLPSCIATPYSPP
           960       970       980        990      1000      1010  

        960       970          980       990      1000      1010   
pF1KE2 KAENHIAANTARGSS--GGLQAPRG-PRDEHSDFIANPTVWVSVPIAEGESDLDDLEDD-
         :.. .  : . .    : :  .: : : .      :   : :::: .::: :: :.: 
CCDS46 PPETEKVPPTRKETRFEEGEQPGQGTPGDPE------P---VCVPIAVAESDTDDQEEDE
           1020      1030      1040               1050      1060   

               1020      1030      1040      1050      1060        
pF1KE2 ----GGEDAQSFQQEVIPKGQQEQLQQVERCGDHLTPRSPGTGTSSEDLAPSLGETWKDE
           : :. .: :::  : .   .     :  ....  . . . .: . : .  . :: :
CCDS46 ENSLGTEEESSKQQESQPVSGGPEAPPDSRTWSQVSATASSEAEASASQA-DWRQQWKAE
          1070      1080      1090      1100      1110       1120  

     1070       1080      1090      1100      1110      1120       
pF1KE2 SVPQVPAEG-VDDTSSSEGSTVDCLDPEEILRKIPELADDLEEPDDCFTEGCIRHCPCCK
         ::.:. : . . : :::::.:  .  :.:..::.:..:...:.:::::::.:.:::: 
CCDS46 --PQAPGCGETPEDSCSEGSTADMTNTAELLEQIPDLGQDVKDPEDCFTEGCVRRCPCCA
             1130      1140      1150      1160      1170      1180

      1130      1140      1150      1160      1170      1180       
pF1KE2 LDTTKSPWDVGWQVRKTCYRIVEHSWFESFIIFMILLSSGSLAFEDYYLDQKPTVKALLE
       .:::..:  : :..:::::.::::::::.:::::::::::.::::: ::... :.:.:::
CCDS46 VDTTQAPGKVWWRLRKTCYHIVEHSWFETFIIFMILLSSGALAFEDIYLEERKTIKVLLE
             1190      1200      1210      1220      1230      1240

      1190      1200      1210      1220      1230      1240       
pF1KE2 YTDRVFTFIFVFEMLLKWVAYGFKKYFTNAWCWLDFLIVNISLISLTAKILEYSEVAPIK
       :.:..::..::.:::::::::::::::::::::::::::..::.::.:. : ..:..:::
CCDS46 YADKMFTYVFVLEMLLKWVAYGFKKYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLVANTLGFAEMGPIK
             1250      1260      1270      1280      1290      1300

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pF1KE2 ALRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVDALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKF
       .:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKF
             1310      1320      1330      1340      1350      1360

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pF1KE2 WRCINYTDGEFSLVPLSIVNNKSDCKIQNSTGSFFWVNVKVNFDNVAMGYLALLQVATFK
        :::: :.:.. :   .::::::.:.  : :: ..:..::::::::. ::::::::::::
CCDS46 GRCINQTEGDLPL-NYTIVNNKSQCESLNLTGELYWTKVKVNFDNVGAGYLALLQVATFK
             1370       1380      1390      1400      1410         

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pF1KE2 GWMDIMYAAVDSREVNMQPKWEDNVYMYLYFVIFIIFGGFFTLNLFVGVIIDNFNQQKKK
       :::::::::::::  . ::.:: :.:::.:::::::::.:::::::.:::::::::::::
CCDS46 GWMDIMYAAVDSRGYEEQPQWEYNLYMYIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKK
    1420      1430      1440      1450      1460      1470         

      1430      1440      1450      1460      1470      1480       
pF1KE2 LGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPLNKFQGFVFDIVTRQAFDITIMVLIC
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::.::::.::: :::
CCDS46 LGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPLNKYQGFIFDIVTKQAFDVTIMFLIC
    1480      1490      1500      1510      1520      1530         

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pF1KE2 LNMITMMVETDDQSEEKTKILGKINQFFVAVFTGECVMKMFALRQYYFTNGWNVFDFIVV
       :::.:::::::::: :: .::.::: .:::.:::::..:. :::.:::::.::.:::.::
CCDS46 LNMVTMMVETDDQSPEKINILAKINLLFVAIFTGECIVKLAALRHYYFTNSWNIFDFVVV
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pF1KE2 VLSIASLIFSAILKSLQSYFSPTLFRVIRLARIGRILRLIRAAKGIRTLLFALMMSLPAL
       .:::.. ..: :..  . .::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS46 ILSIVGTVLSDIIQ--KYFFSPTLFRVIRLARIGRILRLIRGAKGIRTLLFALMMSLPAL
    1600      1610        1620      1630      1640      1650       

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pF1KE2 FNIGLLLFLVMFIYSIFGMSSFPHVRWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLL
       :::::::::::::::::::..: .:.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FNIGLLLFLVMFIYSIFGMANFAYVKWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLL
      1660      1670      1680      1690      1700      1710       

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pF1KE2 SPILNTGPPYCDPNLPNSNGTRGDCGSPAVGIIFFTTYIIISFLIVVNMYIAVILENFNV
       :::::::::::::.::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::::.:::::.:
CCDS46 SPILNTGPPYCDPTLPNSNGSRGDCGSPAVGILFFTTYIIISFLIVVNMYIAIILENFSV
      1720      1730      1740      1750      1760      1770       

      1730      1740      1750      1760      1770      1780       
pF1KE2 ATEESTEPLSEDDFDMFYETWEKFDPEATQFITFSALSDFADTLSGPLRIPKPNRNILIQ
       ::::::::::::::::::: :::::::::::: .:.::::::.:: :::: :::.  ::.
CCDS46 ATEESTEPLSEDDFDMFYEIWEKFDPEATQFIEYSVLSDFADALSEPLRIAKPNQISLIN
      1780      1790      1800      1810      1820      1830       

      1790      1800      1810      1820      1830      1840       
pF1KE2 MDLPLVPGDKIHCLDILFAFTKNVLGESGELDSLKANMEEKFMATNLSKSSYEPIATTLR
       ::::.: ::.:::.:::::::: :::::::.:.:: .:::::::.: :: :::::.::::
CCDS46 MDLPMVSGDRIHCMDILFAFTKRVLGESGEMDALKIQMEEKFMAANPSKISYEPITTTLR
      1840      1850      1860      1870      1880      1890       

      1850      1860      1870      1880           1890       1900 
pF1KE2 WKQEDISATVIQKAYRSYVLHRSMALSNTPCVPRA-----EEEAASLPD-EGFVAFTANE
        :.:..:: :::.:.: ..:.::.  ..     .:     ::.:   :. ::..:.. .:
CCDS46 RKHEEVSAMVIQRAFRRHLLQRSLKHASFLFRQQAGSGLSEEDA---PEREGLIAYVMSE
      1900      1910      1920      1930      1940         1950    

               1910      1920      1930      1940      1950        
pF1KE2 NC---VLPDKSETASATSFPPSYESVTRGLSDRVNMRTSSSIQNEDEATSMELIAPGP  
       :    . : .: . :.:::::::.::::. :: ...: :.  ..:: :            
CCDS46 NFSRPLGPPSSSSISSTSFPPSYDSVTRATSDNLQVRGSDYSHSEDLADFPPSPDRDRES
         1960      1970      1980      1990      2000      2010    

CCDS46 IV
         

>>CCDS46796.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3               (2016 aa)
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                           :. :::..: ::  :.   .:. ::   .:: :::::::.
CCDS46 MANFLLPRGTSSFRRFTRESLAAIEKRMAEKQARGSTTLQES-REGLPEEEAPRPQLDLQ
               10        20        30        40         50         

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CCDS46 ASKKLPDLYGNPPQELIGEPLEDLDPFYSTQKTFIVLNKGKTIFRFSATNALYVLSPFHP
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pF1KE2 IRRTAIKVSVHSWFSLFITVTILVNCVCMTRTDLP---EKIEYVFTVIYTFEALIKILAR
       :::.:.:. ::: :...:  :::.::: :.. : :   . .::.::.:::::.:.:::::
CCDS46 IRRAAVKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMAQHDPPPWTKYVEYTFTAIYTFESLVKILAR
     120       130       140       150       160       170         

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pF1KE2 GFCLNEFTYLRDPWNWLDFSVITLAYVGTAIDLRGISGLRTFRVLRALKTVSVIPGLKVI
       ::::. ::.::::::::::::: .::.   .:: ..:.::::::::::::.::: :::.:
CCDS46 GFCLHAFTFLRDPWNWLDFSVIIMAYTTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVISGLKTI
     180       190       200       210       220       230         

         240       250       260       270       280       290     
pF1KE2 VGALIHSVKKLADVTILTIFCLSVFALVGLQLFKGNLKNKCVKNDMAVNETTNYSSH---
       :::::.:::::::: .::.::::::::.::::: :::..:::.:  :.:  :: : .   
CCDS46 VGALIQSVKKLADVMVLTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRHKCVRNFTALN-GTNGSVEADG
     240       250       260       270       280        290        

                      300       310       320       330       340  
pF1KE2 ----------RKPDIYINKRGTSDPLLCGNGSDSGHCPDGYICLKTSDNPDFNYTSFDSF
                   :. :. : :::: :::::.::.: ::.:: :::...::: .:::::::
CCDS46 LVWESLDLYLSDPENYLLKNGTSDVLLCGNSSDAGTCPEGYRCLKAGENPDHGYTSFDSF
      300       310       320       330       340       350        

            350       360       370       380       390       400  
pF1KE2 AWAFLSLFRLMTQDSWERLYQQTLRTSGKIYMIFFVLVIFLGSFYLVNLILAVVTMAYEE
       :::::.:::::::: ::::::::::..::::::::.::::::::::::::::::.:::::
CCDS46 AWAFLALFRLMTQDCWERLYQQTLRSAGKIYMIFFMLVIFLGSFYLVNLILAVVAMAYEE
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pF1KE2 QNQATTDEIEAKEKKFQEALEMLRKEQEVLAALGIDTTSLHSHNGSPLTSKNASERRHRI
       :::::  : : :::.::::.:::.::.:.:.  :.::.:  : . :::.  :. ::: . 
CCDS46 QNQATIAETEEKEKRFQEAMEMLKKEHEALTIRGVDTVSRSSLEMSPLAPVNSHERRSKR
      420       430       440       450       460       470        

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pF1KE2 KPRVSEGSTE--DNKSPRSDPYN-QRRMSFLGLASG------KRRASHGSVFHFRSPGRD
       . :.: :. :  ... :.::  .  : :. :.:. :      : :.:.::.: ::   ::
CCDS46 RKRMSSGTEECGEDRLPKSDSEDGPRAMNHLSLTRGLSRTSMKPRSSRGSIFTFRR--RD
      480       490       500       510       520       530        

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pF1KE2 ISLPEGVTDD-GVFPGDHESHRGSLL----LGGGAGQQGPLPRSPLP-------QPSNPD
       ..     .:: .   :. :::. :::    :   ..:  : : .  :       . :. :
CCDS46 LGSEADFADDENSTAGESESHHTSLLVPWPLRRTSAQGQPSPGTSAPGHALHGKKNSTVD
        540       550       560       570       580       590      

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pF1KE2 SRH-------GEDEHQPPPTSELAPGAVD------VSAFDAGQKKTFLS----AEYLDEP
                 :. :   : .  : :  ..      . . . :  . . :    .. ..::
CCDS46 CNGVVSLLGAGDPEATSPGSHLLRPVMLEHPPDTTTPSEEPGGPQMLTSQAPCVDGFEEP
        600       610       620       630       640       650      

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pF1KE2 FRAQRAMSVVSIITSVLEELEESEQKCPPCLTSLSQKYLIWDCCPMWVKLKTILFGLVTD
          :::.:.::..::.:::::::..::::: . :.:.::::.:::.:...:  .  .: :
CCDS46 GARQRALSAVSVLTSALEELEESRHKCPPCWNRLAQRYLIWECCPLWMSIKQGVKLVVMD
        660       670       680       690       700       710      

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pF1KE2 PFAELTITLCIVVNTIFMAMEHHGMSPTFEAMLQIGNIVFTIFFTAEMVFKIIAFDPYYY
       ::..::::.:::.::.:::.::..:.  :: :::.::.::: .:::::.:::::.:::::
CCDS46 PFTDLTITMCIVLNTLFMALEHYNMTSEFEEMLQVGNLVFTGIFTAEMTFKIIALDPYYY
        720       730       740       750       760       770      

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pF1KE2 FQKKWNIFDCIIVTVSLLELGVAKKGSLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSV
       ::. ::::: ::: .::.:::... ..:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FQQGWNIFDSIIVILSLMELGLSRMSNLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSV
        780       790       800       810       820       830      

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pF1KE2 GALGNLTIILAIIVFVFALVGKQLLGENYRNNRKNISAPHEDWPRWHMHDFFHSFLIVFR
       :::::::..::::::.::.:: ::.:.:: . : . :.     ::::: ::::.:::.::
CCDS46 GALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKNYSELRDSDSGL---LPRWHMMDFFHAFLIIFR
        840       850       860       870          880       890   

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pF1KE2 ILCGEWIENMWACMEVGQKSICLILFLTVMVLGNLVVLNLFIALLLNSFSADNLTAPEDD
       ::::::::.:: ::::. .:.::..:: :::.:::::::::.::::.::::::::::..:
CCDS46 ILCGEWIETMWDCMEVSGQSLCLLVFLLVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLTAPDED
           900       910       920       930       940       950   

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pF1KE2 GEVNNLQVALARIQV---FGHRTKQALCSFFSRSCPFPQPKA---EPEL--VVKLPLSSS
        :.::::.::::::    : .::   .:  . :. :  .: :   . .:   .  : :  
CCDS46 REMNNLQLALARIQRGLRFVKRTTWDFCCGLLRQRP-QKPAALAAQGQLPSCIATPYSPP
           960       970       980        990      1000      1010  

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pF1KE2 KAENHIAANTARGSS--GGLQAPRG-PRDEHSDFIANPTVWVSVPIAEGESDLDDLEDD-
         :.. .  : . .    : :  .: : : .      :   : :::: .::: :: :.: 
CCDS46 PPETEKVPPTRKETRFEEGEQPGQGTPGDPE------P---VCVPIAVAESDTDDQEEDE
           1020      1030      1040               1050      1060   

               1020      1030      1040      1050      1060        
pF1KE2 ----GGEDAQSFQQEVIPKGQQEQLQQVERCGDHLTPRSPGTGTSSEDLAPSLGETWKDE
           : :. .: :::  : .   .     :  ....  . . . .: . : .  . :: :
CCDS46 ENSLGTEEESSKQQESQPVSGGPEAPPDSRTWSQVSATASSEAEASASQA-DWRQQWKAE
          1070      1080      1090      1100      1110       1120  

     1070       1080      1090      1100      1110      1120       
pF1KE2 SVPQVPAEG-VDDTSSSEGSTVDCLDPEEILRKIPELADDLEEPDDCFTEGCIRHCPCCK
         ::.:. : . . : :::::.:  .  :.:..::.:..:...:.:::::::.:.:::: 
CCDS46 --PQAPGCGETPEDSCSEGSTADMTNTAELLEQIPDLGQDVKDPEDCFTEGCVRRCPCCA
             1130      1140      1150      1160      1170      1180

      1130      1140      1150      1160      1170      1180       
pF1KE2 LDTTKSPWDVGWQVRKTCYRIVEHSWFESFIIFMILLSSGSLAFEDYYLDQKPTVKALLE
       .:::..:  : :..:::::.::::::::.:::::::::::.::::: ::... :.:.:::
CCDS46 VDTTQAPGKVWWRLRKTCYHIVEHSWFETFIIFMILLSSGALAFEDIYLEERKTIKVLLE
             1190      1200      1210      1220      1230      1240

      1190      1200      1210      1220      1230      1240       
pF1KE2 YTDRVFTFIFVFEMLLKWVAYGFKKYFTNAWCWLDFLIVNISLISLTAKILEYSEVAPIK
       :.:..::..::.:::::::::::::::::::::::::::..::.::.:. : ..:..:::
CCDS46 YADKMFTYVFVLEMLLKWVAYGFKKYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLVANTLGFAEMGPIK
             1250      1260      1270      1280      1290      1300

      1250      1260      1270      1280      1290      1300       
pF1KE2 ALRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVDALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKF
       .:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKF
             1310      1320      1330      1340      1350      1360

      1310      1320      1330      1340      1350      1360       
pF1KE2 WRCINYTDGEFSLVPLSIVNNKSDCKIQNSTGSFFWVNVKVNFDNVAMGYLALLQVATFK
        :::: :.:.. :   .::::::.:.  : :: ..:..::::::::. ::::::::::::
CCDS46 GRCINQTEGDLPL-NYTIVNNKSQCESLNLTGELYWTKVKVNFDNVGAGYLALLQVATFK
             1370       1380      1390      1400      1410         

      1370      1380      1390      1400      1410      1420       
pF1KE2 GWMDIMYAAVDSREVNMQPKWEDNVYMYLYFVIFIIFGGFFTLNLFVGVIIDNFNQQKKK
       :::::::::::::  . ::.:: :.:::.:::::::::.:::::::.:::::::::::::
CCDS46 GWMDIMYAAVDSRGYEEQPQWEYNLYMYIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKK
    1420      1430      1440      1450      1460      1470         

      1430      1440      1450      1460      1470      1480       
pF1KE2 LGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPLNKFQGFVFDIVTRQAFDITIMVLIC
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::.::::.::: :::
CCDS46 LGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPLNKYQGFIFDIVTKQAFDVTIMFLIC
    1480      1490      1500      1510      1520      1530         

      1490      1500      1510      1520      1530      1540       
pF1KE2 LNMITMMVETDDQSEEKTKILGKINQFFVAVFTGECVMKMFALRQYYFTNGWNVFDFIVV
       :::.:::::::::: :: .::.::: .:::.:::::..:. :::.:::::.::.:::.::
CCDS46 LNMVTMMVETDDQSPEKINILAKINLLFVAIFTGECIVKLAALRHYYFTNSWNIFDFVVV
    1540      1550      1560      1570      1580      1590         

      1550      1560      1570      1580      1590      1600       
pF1KE2 VLSIASLIFSAILKSLQSYFSPTLFRVIRLARIGRILRLIRAAKGIRTLLFALMMSLPAL
       .:::.. ..: :..  . .::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS46 ILSIVGTVLSDIIQ--KYFFSPTLFRVIRLARIGRILRLIRGAKGIRTLLFALMMSLPAL
    1600      1610        1620      1630      1640      1650       

      1610      1620      1630      1640      1650      1660       
pF1KE2 FNIGLLLFLVMFIYSIFGMSSFPHVRWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLL
       :::::::::::::::::::..: .:.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FNIGLLLFLVMFIYSIFGMANFAYVKWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLL
      1660      1670      1680      1690      1700      1710       

      1670      1680      1690      1700      1710      1720       
pF1KE2 SPILNTGPPYCDPNLPNSNGTRGDCGSPAVGIIFFTTYIIISFLIVVNMYIAVILENFNV
       :::::::::::::.::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::::.:::::.:
CCDS46 SPILNTGPPYCDPTLPNSNGSRGDCGSPAVGILFFTTYIIISFLIVVNMYIAIILENFSV
      1720      1730      1740      1750      1760      1770       

      1730      1740      1750      1760      1770      1780       
pF1KE2 ATEESTEPLSEDDFDMFYETWEKFDPEATQFITFSALSDFADTLSGPLRIPKPNRNILIQ
       ::::::::::::::::::: :::::::::::: .:.::::::.:: :::: :::.  ::.
CCDS46 ATEESTEPLSEDDFDMFYEIWEKFDPEATQFIEYSVLSDFADALSEPLRIAKPNQISLIN
      1780      1790      1800      1810      1820      1830       

      1790      1800      1810      1820      1830      1840       
pF1KE2 MDLPLVPGDKIHCLDILFAFTKNVLGESGELDSLKANMEEKFMATNLSKSSYEPIATTLR
       ::::.: ::.:::.:::::::: :::::::.:.:: .:::::::.: :: :::::.::::
CCDS46 MDLPMVSGDRIHCMDILFAFTKRVLGESGEMDALKIQMEEKFMAANPSKISYEPITTTLR
      1840      1850      1860      1870      1880      1890       

      1850      1860      1870      1880           1890       1900 
pF1KE2 WKQEDISATVIQKAYRSYVLHRSMALSNTPCVPRA-----EEEAASLPD-EGFVAFTANE
        :.:..:: :::.:.: ..:.::.  ..     .:     ::.:   :. ::..:.. .:
CCDS46 RKHEEVSAMVIQRAFRRHLLQRSLKHASFLFRQQAGSGLSEEDA---PEREGLIAYVMSE
      1900      1910      1920      1930      1940         1950    

               1910      1920      1930      1940      1950        
pF1KE2 NC---VLPDKSETASATSFPPSYESVTRGLSDRVNMRTSSSIQNEDEATSMELIAPGP  
       :    . : .: . :.:::::::.::::. :: ...: :.  ..:: :            
CCDS46 NFSRPLGPPSSSSISSTSFPPSYDSVTRATSDNLQVRGSDYSHSEDLADFPPSPDRDRES
         1960      1970      1980      1990      2000      2010    

CCDS46 IV
         

>>CCDS46797.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3               (2015 aa)
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pF1KE2 MEFPIGSLETNNFRRFTPESLVEIEKQIAAKQ--GTKKAREKHREQKDQEEKPRPQLDLK
                           :. :::..: ::  :.   .:. ::   .:: :::::::.
CCDS46 MANFLLPRGTSSFRRFTRESLAAIEKRMAEKQARGSTTLQES-REGLPEEEAPRPQLDLQ
               10        20        30        40         50         

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       : ..:: .::. : ::::::::::::::::..::.:::::.:: ::::: ::...:::. 
CCDS46 ASKKLPDLYGNPPQELIGEPLEDLDPFYSTQKTFIVLNKGKTIFRFSATNALYVLSPFHP
      60        70        80        90       100       110         

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pF1KE2 IRRTAIKVSVHSWFSLFITVTILVNCVCMTRTDLP---EKIEYVFTVIYTFEALIKILAR
       :::.:.:. ::: :...:  :::.::: :.. : :   . .::.::.:::::.:.:::::
CCDS46 IRRAAVKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMAQHDPPPWTKYVEYTFTAIYTFESLVKILAR
     120       130       140       150       160       170         

         180       190       200       210       220       230     
pF1KE2 GFCLNEFTYLRDPWNWLDFSVITLAYVGTAIDLRGISGLRTFRVLRALKTVSVIPGLKVI
       ::::. ::.::::::::::::: .::.   .:: ..:.::::::::::::.::: :::.:
CCDS46 GFCLHAFTFLRDPWNWLDFSVIIMAYTTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVISGLKTI
     180       190       200       210       220       230         

         240       250       260       270       280       290     
pF1KE2 VGALIHSVKKLADVTILTIFCLSVFALVGLQLFKGNLKNKCVKNDMAVNETTNYSSH---
       :::::.:::::::: .::.::::::::.::::: :::..:::.:  :.:  :: : .   
CCDS46 VGALIQSVKKLADVMVLTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRHKCVRNFTALN-GTNGSVEADG
     240       250       260       270       280        290        

                      300       310       320       330       340  
pF1KE2 ----------RKPDIYINKRGTSDPLLCGNGSDSGHCPDGYICLKTSDNPDFNYTSFDSF
                   :. :. : :::: :::::.::.: ::.:: :::...::: .:::::::
CCDS46 LVWESLDLYLSDPENYLLKNGTSDVLLCGNSSDAGTCPEGYRCLKAGENPDHGYTSFDSF
      300       310       320       330       340       350        

            350       360       370       380       390       400  
pF1KE2 AWAFLSLFRLMTQDSWERLYQQTLRTSGKIYMIFFVLVIFLGSFYLVNLILAVVTMAYEE
       :::::.:::::::: ::::::::::..::::::::.::::::::::::::::::.:::::
CCDS46 AWAFLALFRLMTQDCWERLYQQTLRSAGKIYMIFFMLVIFLGSFYLVNLILAVVAMAYEE
      360       370       380       390       400       410        

            410       420       430       440       450       460  
pF1KE2 QNQATTDEIEAKEKKFQEALEMLRKEQEVLAALGIDTTSLHSHNGSPLTSKNASERRHRI
       :::::  : : :::.::::.:::.::.:.:.  :.::.:  : . :::.  :. ::: . 
CCDS46 QNQATIAETEEKEKRFQEAMEMLKKEHEALTIRGVDTVSRSSLEMSPLAPVNSHERRSKR
      420       430       440       450       460       470        

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pF1KE2 KPRVSEGSTE--DNKSPRSDPYN-QRRMSFLGLASG------KRRASHGSVFHFRSPGRD
       . :.: :. :  ... :.::  .  : :. :.:. :      : :.:.::.: ::   ::
CCDS46 RKRMSSGTEECGEDRLPKSDSEDGPRAMNHLSLTRGLSRTSMKPRSSRGSIFTFRR--RD
      480       490       500       510       520       530        

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       ..     .:: .   :. :::. :::    :   ..:  : : .  :       . :. :
CCDS46 LGSEADFADDENSTAGESESHHTSLLVPWPLRRTSAQGQPSPGTSAPGHALHGKKNSTVD
        540       550       560       570       580       590      

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                 :. :   : .  : :  ..      . . . :  . . :    .. ..::
CCDS46 CNGVVSLLGAGDPEATSPGSHLLRPVMLEHPPDTTTPSEEPGGPQMLTSQAPCVDGFEEP
        600       610       620       630       640       650      

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pF1KE2 FRAQRAMSVVSIITSVLEELEESEQKCPPCLTSLSQKYLIWDCCPMWVKLKTILFGLVTD
          :::.:.::..::.:::::::..::::: . :.:.::::.:::.:...:  .  .: :
CCDS46 GARQRALSAVSVLTSALEELEESRHKCPPCWNRLAQRYLIWECCPLWMSIKQGVKLVVMD
        660       670       680       690       700       710      

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pF1KE2 PFAELTITLCIVVNTIFMAMEHHGMSPTFEAMLQIGNIVFTIFFTAEMVFKIIAFDPYYY
       ::..::::.:::.::.:::.::..:.  :: :::.::.::: .:::::.:::::.:::::
CCDS46 PFTDLTITMCIVLNTLFMALEHYNMTSEFEEMLQVGNLVFTGIFTAEMTFKIIALDPYYY
        720       730       740       750       760       770      

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pF1KE2 FQKKWNIFDCIIVTVSLLELGVAKKGSLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSV
       ::. ::::: ::: .::.:::... ..:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 FQQGWNIFDSIIVILSLMELGLSRMSNLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSV
        780       790       800       810       820       830      

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       :::::::..::::::.::.:: ::.:.:: . : . :.     ::::: ::::.:::.::
CCDS46 GALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKNYSELRDSDSGL---LPRWHMMDFFHAFLIIFR
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pF1KE2 ILCGEWIENMWACMEVGQKSICLILFLTVMVLGNLVVLNLFIALLLNSFSADNLTAPEDD
       ::::::::.:: ::::. .:.::..:: :::.:::::::::.::::.::::::::::..:
CCDS46 ILCGEWIETMWDCMEVSGQSLCLLVFLLVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLTAPDED
           900       910       920       930       940       950   

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pF1KE2 GEVNNLQVALARIQV---FGHRTKQALCSFFSRSCPFPQPKA---EPEL--VVKLPLSSS
        :.::::.::::::    : .::   .:  . :. :  .: :   . .:   .  : :  
CCDS46 REMNNLQLALARIQRGLRFVKRTTWDFCCGLLRQRP-QKPAALAAQGQLPSCIATPYSPP
           960       970       980        990      1000      1010  

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pF1KE2 KAENHIAANTARGSS--GGLQAPRG-PRDEHSDFIANPTVWVSVPIAEGESDLDDLEDDG
         :.. .  : . .    : :  .: : : .      :   : :::: .::: :: :.: 
CCDS46 PPETEKVPPTRKETRFEEGEQPGQGTPGDPE------P---VCVPIAVAESDTDDQEEDE
           1020      1030      1040               1050      1060   

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pF1KE2 ----GEDAQSFQQEVIPKGQQEQLQQVERCGDHLTPRSPGTGTSSEDLAPSLGETWKDES
           : . .: .::  : .   .     :  ....  . . . .: . : .  . :: : 
CCDS46 ENSLGTEEESSKQESQPVSGGPEAPPDSRTWSQVSATASSEAEASASQA-DWRQQWKAE-
          1070      1080      1090      1100      1110       1120  

    1070       1080      1090      1100      1110      1120        
pF1KE2 VPQVPAEG-VDDTSSSEGSTVDCLDPEEILRKIPELADDLEEPDDCFTEGCIRHCPCCKL
        ::.:. : . . : :::::.:  .  :.:..::.:..:...:.:::::::.:.:::: .
CCDS46 -PQAPGCGETPEDSCSEGSTADMTNTAELLEQIPDLGQDVKDPEDCFTEGCVRRCPCCAV
             1130      1140      1150      1160      1170      1180

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pF1KE2 DTTKSPWDVGWQVRKTCYRIVEHSWFESFIIFMILLSSGSLAFEDYYLDQKPTVKALLEY
       :::..:  : :..:::::.::::::::.:::::::::::.::::: ::... :.:.::::
CCDS46 DTTQAPGKVWWRLRKTCYHIVEHSWFETFIIFMILLSSGALAFEDIYLEERKTIKVLLEY
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pF1KE2 TDRVFTFIFVFEMLLKWVAYGFKKYFTNAWCWLDFLIVNISLISLTAKILEYSEVAPIKA
       .:..::..::.:::::::::::::::::::::::::::..::.::.:. : ..:..:::.
CCDS46 ADKMFTYVFVLEMLLKWVAYGFKKYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLVANTLGFAEMGPIKS
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       :::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::: 
CCDS46 LRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFG
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       :::: :.:.. :   .::::::.:.  : :: ..:..::::::::. :::::::::::::
CCDS46 RCINQTEGDLPL-NYTIVNNKSQCESLNLTGELYWTKVKVNFDNVGAGYLALLQVATFKG
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       ::::::::::::  . ::.:: :.:::.:::::::::.:::::::.::::::::::::::
CCDS46 WMDIMYAAVDSRGYEEQPQWEYNLYMYIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKL
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::.::::.::: ::::
CCDS46 GGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPLNKYQGFIFDIVTKQAFDVTIMFLICL
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       ::.:::::::::: :: .::.::: .:::.:::::..:. :::.:::::.::.:::.::.
CCDS46 NMVTMMVETDDQSPEKINILAKINLLFVAIFTGECIVKLAALRHYYFTNSWNIFDFVVVI
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pF1KE2 LSIASLIFSAILKSLQSYFSPTLFRVIRLARIGRILRLIRAAKGIRTLLFALMMSLPALF
       :::.. ..: :..  . .::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS46 LSIVGTVLSDIIQ--KYFFSPTLFRVIRLARIGRILRLIRGAKGIRTLLFALMMSLPALF
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pF1KE2 NIGLLLFLVMFIYSIFGMSSFPHVRWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLS
       ::::::::::::::::::..: .:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 NIGLLLFLVMFIYSIFGMANFAYVKWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLS
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pF1KE2 PILNTGPPYCDPNLPNSNGTRGDCGSPAVGIIFFTTYIIISFLIVVNMYIAVILENFNVA
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CCDS46 PILNTGPPYCDPTLPNSNGSRGDCGSPAVGILFFTTYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVA
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pF1KE2 TEESTEPLSEDDFDMFYETWEKFDPEATQFITFSALSDFADTLSGPLRIPKPNRNILIQM
       :::::::::::::::::: :::::::::::: .:.::::::.:: :::: :::.  ::.:
CCDS46 TEESTEPLSEDDFDMFYEIWEKFDPEATQFIEYSVLSDFADALSEPLRIAKPNQISLINM
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pF1KE2 DLPLVPGDKIHCLDILFAFTKNVLGESGELDSLKANMEEKFMATNLSKSSYEPIATTLRW
       :::.: ::.:::.:::::::: :::::::.:.:: .:::::::.: :: :::::.:::: 
CCDS46 DLPMVSGDRIHCMDILFAFTKRVLGESGEMDALKIQMEEKFMAANPSKISYEPITTTLRR
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pF1KE2 KQEDISATVIQKAYRSYVLHRSMALSNTPCVPRA-----EEEAASLPD-EGFVAFTANEN
       :.:..:: :::.:.: ..:.::.  ..     .:     ::.:   :. ::..:.. .::
CCDS46 KHEEVSAMVIQRAFRRHLLQRSLKHASFLFRQQAGSGLSEEDA---PEREGLIAYVMSEN
      1900      1910      1920      1930      1940         1950    

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pF1KE2 C---VLPDKSETASATSFPPSYESVTRGLSDRVNMRTSSSIQNEDEATSMELIAPGP   
           . : .: . :.:::::::.::::. :: ...: :.  ..:: :             
CCDS46 FSRPLGPPSSSSISSTSFPPSYDSVTRATSDNLQVRGSDYSHSEDLADFPPSPDRDRESI
         1960      1970      1980      1990      2000      2010    

CCDS46 V
        

>>CCDS54569.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3               (1962 aa)
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CCDS54 IRRAAVKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMAQHDPPPWTKYVEYTFTAIYTFESLVKILAR
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       ::::. ::.::::::::::::: .:::.  : : ..:.::::::::::::.:::::::.:
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       :::::.:::::::: .::.::::::::.::::: :::..:::.:  :.:  :: : .   
CCDS54 VGALIQSVKKLADVMVLTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRHKCVRNFTALN-GTNGSVEADG
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pF1KE2 ----------RKPDIYINKRGTSDPLLCGNGSDSGHCPDGYICLKTSDNPDFNYTSFDSF
                   :. :. : :::: :::::.::.: ::.:: :::...::: .:::::::
CCDS54 LVWESLDLYLSDPENYLLKNGTSDVLLCGNSSDAGTCPEGYRCLKAGENPDHGYTSFDSF
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       :::::.:::::::: ::::::::::..::::::::.::::::::::::::::::.:::::
CCDS54 AWAFLALFRLMTQDCWERLYQQTLRSAGKIYMIFFMLVIFLGSFYLVNLILAVVAMAYEE
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CCDS54 QNQATIAETEEKEKRFQEAMEMLKKEHEALTIRGVDTVSRSSLEMSPLAPVNSHERRSKR
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CCDS54 RKRMSSGTEECGEDRLPKSDSEDGPRAMNHLSLTRGLSRTSMKPRSSRGSIFTFRR--RD
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       ..     .:: .   :. :::. :::    :   ..:  : : .  :       . :. :
CCDS54 LGSEADFADDENSTAGESESHHTSLLVPWPLRRTSAQGQPSPGTSAPGHALHGKKNSTVD
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pF1KE2 SRH-------GEDEHQPPPTSELAPGAVD------VSAFDAGQKKTFLS----AEYLDEP
                 :. :   : .  : :  ..      . . . :  . . :    .. ..::
CCDS54 CNGVVSLLGAGDPEATSPGSHLLRPVMLEHPPDTTTPSEEPGGPQMLTSQAPCVDGFEEP
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pF1KE2 FRAQRAMSVVSIITSVLEELEESEQKCPPCLTSLSQKYLIWDCCPMWVKLKTILFGLVTD
          :::.:.::..::.:::::::..::::: . :.:.::::.:::.:...:  .  .: :
CCDS54 GARQRALSAVSVLTSALEELEESRHKCPPCWNRLAQRYLIWECCPLWMSIKQGVKLVVMD
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pF1KE2 PFAELTITLCIVVNTIFMAMEHHGMSPTFEAMLQIGNIVFTIFFTAEMVFKIIAFDPYYY
       ::..::::.:::.::.:::.::..:.  :: :::.::.::: .:::::.:::::.:::::
CCDS54 PFTDLTITMCIVLNTLFMALEHYNMTSEFEEMLQVGNLVFTGIFTAEMTFKIIALDPYYY
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pF1KE2 FQKKWNIFDCIIVTVSLLELGVAKKGSLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSV
       ::. ::::: ::: .::.:::... ..:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FQQGWNIFDSIIVILSLMELGLSRMSNLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSV
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CCDS54 GALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKNYSELRDSDSG---LLPRWHMMDFFHAFLIIFR
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pF1KE2 ILCGEWIENMWACMEVGQKSICLILFLTVMVLGNLVVLNLFIALLLNSFSADNLTAPEDD
       ::::::::.:: ::::. .:.::..:: :::.:::::::::.::::.::::::::::..:
CCDS54 ILCGEWIETMWDCMEVSGQSLCLLVFLLVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLTAPDED
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pF1KE2 GEVNNLQVALARIQV---FGHRTKQALCSFFSRSCPFPQPKA---EPEL--VVKLPLSSS
        :.::::.::::::    : .::   .:  . :. :  .: :   . .:   .  : :  
CCDS54 REMNNLQLALARIQRGLRFVKRTTWDFCCGLLRQRP-QKPAALAAQGQLPSCIATPYSPP
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pF1KE2 KAENHIAANTARGSS--GGLQAPRG-PRDEHSDFIANPTVWVSVPIAEGESDLDDLEDDG
         :.. .  : . .    : :  .: : : .      :   : :::: .::: :: :.: 
CCDS54 PPETEKVPPTRKETRFEEGEQPGQGTPGDPE------P---VCVPIAVAESDTDDQEED-
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pF1KE2 GEDAQSFQQEVIPKGQQEQLQQVERCGDHLTPRSPGTGTSSEDLAPSLGETWKDESVPQV
                       .:.                           :::   ..::  :.
CCDS54 ----------------EEN---------------------------SLGT--EEESSKQT
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pF1KE2 PAEGVDDTSSSEGSTVDCLDPEEILRKIPELADDLEEPDDCFTEGCIRHCPCCKLDTTKS
       : .     : :::::.:  .  :.:..::.:..:...:.:::::::.:.:::: .:::..
CCDS54 PED-----SCSEGSTADMTNTAELLEQIPDLGQDVKDPEDCFTEGCVRRCPCCAVDTTQA
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pF1KE2 PWDVGWQVRKTCYRIVEHSWFESFIIFMILLSSGSLAFEDYYLDQKPTVKALLEYTDRVF
       :  : :..:::::.::::::::.:::::::::::.::::: ::... :.:.::::.:..:
CCDS54 PGKVWWRLRKTCYHIVEHSWFETFIIFMILLSSGALAFEDIYLEERKTIKVLLEYADKMF
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       :..::.:::::::::::::::::::::::::::..::.::.:. : ..:..:::.:::::
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       ::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::: 
CCDS54 ALRPLRALSRFEGMRVVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFGRCINQ
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       :.:.. :   .::::::.:.  : :: ..:..::::::::. ::::::::::::::::::
CCDS54 TEGDLPL-NYTIVNNKSQCESLNLTGELYWTKVKVNFDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIM
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       :::::::  . ::.:: :.:::.:::::::::.:::::::.:::::::::::::::::::
CCDS54 YAAVDSRGYEEQPQWEYNLYMYIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKLGGQDI
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       :::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::.::::.::: ::::::.::
CCDS54 FMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPLNKYQGFIFDIVTKQAFDVTIMFLICLNMVTM
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       :::::::: :: .::.::: .:::.:::::..:. :::.:::::.::.:::.::.:::..
CCDS54 MVETDDQSPEKINILAKINLLFVAIFTGECIVKLAALRHYYFTNSWNIFDFVVVILSIVG
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        ..: :..  . .::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TVLSDIIQ--KYFFSPTLFRVIRLARIGRILRLIRGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLL
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       :::::::::::::..: .:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LFLVMFIYSIFGMANFAYVKWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLSPILNT
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       :::::::.::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::::.:::::.:::::::
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pF1KE2 EPLSEDDFDMFYETWEKFDPEATQFITFSALSDFADTLSGPLRIPKPNRNILIQMDLPLV
       ::::::::::::: :::::::::::: .:.::::::.:: :::: :::.  ::.::::.:
CCDS54 EPLSEDDFDMFYEIWEKFDPEATQFIEYSVLSDFADALSEPLRIAKPNQISLINMDLPMV
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pF1KE2 PGDKIHCLDILFAFTKNVLGESGELDSLKANMEEKFMATNLSKSSYEPIATTLRWKQEDI
        ::.:::.:::::::: :::::::.:.:: .:::::::.: :: :::::.:::: :.:..
CCDS54 SGDRIHCMDILFAFTKRVLGESGEMDALKIQMEEKFMAANPSKISYEPITTTLRRKHEEV
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pF1KE2 SATVIQKAYRSYVLHRSMALSNTPCVPRA-----EEEAASLPD-EGFVAFTANENC---V
       :: :::.:.: ..:.::.  ..     .:     ::.:   :. ::..:.. .::    .
CCDS54 SAMVIQRAFRRHLLQRSLKHASFLFRQQAGSGLSEEDA---PEREGLIAYVMSENFSRPL
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pF1KE2 LPDKSETASATSFPPSYESVTRGLSDRVNMRTSSSIQNEDEATSMELIAPGP    
        : .: . :.:::::::.::::. :: ...: :.  ..:: :              
CCDS54 GPPSSSSISSTSFPPSYDSVTRATSDNLQVRGSDYSHSEDLADFPPSPDRDRESIV
       1910      1920      1930      1940      1950      1960  

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pF1KE2 RRTAIKVSVHSWFSLFITVTILVNCVCMTRTDLPE---KIEYVFTVIYTFEALIKILARG
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CCDS46 RKIAIKILVHSLFSMLIMCTILTNCVFMTLSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKILARG
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pF1KE2 FCLNEFTYLRDPWNWLDFSVITLAYVGTAIDLRGISGLRTFRVLRALKTVSVIPGLKVIV
       :::..::.:::::::::::::..:::   ..: ..:.::::::::::::.:::::::.::
CCDS46 FCLEDFTFLRDPWNWLDFSVIVMAYVTEFVSLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIV
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CCDS46 GALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCLQWPPSDSAFETNTTSYFNG
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pF1KE2 SHRKPDIYINKR--------------------GTSDPLLCGNGSDSGHCPDGYICLKTSD
       .  .   ..:                      : .::::::::::.:.::.::::.:.. 
CCDS46 TMDSNGTFVNVTMSTFNWKDYIGDDSHFYVLDGQKDPLLCGNGSDAGQCPEGYICVKAGR
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       ::...:::::.:.::::::::::::: :: ::: :::..:: ::::::::::::::::::
CCDS46 NPNYGYTSFDTFSWAFLSLFRLMTQDYWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFLGSFYLVN
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CCDS46 LGELLESSSEASKLSSKSAKEWRNRRKKRRQREHLEGNNKGERDSFPKSESEDSVKRSSF
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        .:...       .: :.:..    :::.:..::.:...::::::.::::::   ... .
CCDS46 RLSSYQ-------ISMEMLEDSSGRQRAVSIASILTNTMEELEESRQKCPPCWYRFANVF
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CCDS46 LIWDCCDAWLKVKHLVNLIVMDPFVDLAITICIVLNTLFMAMEHYPMTEQFSSVLTVGNL
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pF1KE2 VFTIFFTAEMVFKIIAFDPYYYFQKKWNIFDCIIVTVSLLELGVAKKGSLSVLRSFRLLR
       ::: .::::::.::::.:::::::. ::::: :::..::.:::...  .:::::::::::
CCDS46 VFTGIFTAEMVLKIIAMDPYYYFQEGWNIFDGIIVSLSLMELGLSNVEGLSVLRSFRLLR
      750       760       770       780       790       800        

            770       780       790       800       810       820  
pF1KE2 VFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSVGALGNLTIILAIIVFVFALVGKQLLGENYRNNRKNISA
       :::::::::::: ::::::::::::::::..::::::.::.:: ::.:..:..   .:. 
CCDS46 VFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKSYKECVCKIN-
      810       820       830       840       850       860        

            830       840       850       860       870       880  
pF1KE2 PHEDWPRWHMHDFFHSFLIVFRILCGEWIENMWACMEVGQKSICLILFLTVMVLGNLVVL
            :::::.:::::::::::.:::::::.:: ::::. ...:::.:. :::.::::::
CCDS46 DDCTLPRWHMNDFFHSFLIVFRVLCGEWIETMWDCMEVAGQTMCLIVFMLVMVIGNLVVL
       870       880       890       900       910       920       

            890       900       910       920       930       940  
pF1KE2 NLFIALLLNSFSADNLTAPEDDGEVNNLQVALARIQVFGHRTKQALCSFFSRSCPFPQPK
       :::.::::.:::.:::.: .::.:.::::.:..:.:     .:. .   :...  : .::
CCDS46 NLFLALLLSSFSSDNLAATDDDNEMNNLQIAVGRMQKGIDYVKNKMRECFQKAF-FRKPK
       930       940       950       960       970       980       

                     950       960         970       980           
pF1KE2 A---------EPELVVKLPLSSSKAENHI--AANTARGSSGGLQAPRGPRDEHS--DFIA
       .         .  .  .  .  ::  :..  . .:. : . : .. .   ::..  .:: 
CCDS46 VIEIHEGNKIDSCMSNNTGIEISKELNYLRDGNGTTSGVGTGSSVEKYVIDENDYMSFIN
        990      1000      1010      1020      1030      1040      

     990      1000      1010      1020      1030      1040         
pF1KE2 NPTVWVSVPIAEGESDLDDLEDDGGEDAQSFQQEVIPKGQQEQLQQVERCGDHLTPRSPG
       ::.. :.:::: ::::...:      ... :..:        .:..              
CCDS46 NPSLTVTVPIAVGESDFENL------NTEEFSSE-------SELEE--------------
       1050      1060            1070                              

    1050      1060      1070      1080      1090      1100         
pF1KE2 TGTSSEDLAPSLGETWKDESVPQVPAEGVDDTSSSEGSTVDCLDPEEILRKIPELADDLE
          :.: :                     . :::::::::: . :.:  .   :  .::.
CCDS46 ---SKEKL---------------------NATSSSEGSTVDVVLPREGEQAETEPEEDLK
       1080                           1090      1100      1110     

    1110      1120      1130      1140      1150      1160         
pF1KE2 EPDDCFTEGCIRHCPCCKLDTTKSPWDVGWQVRKTCYRIVEHSWFESFIIFMILLSSGSL
        :. :::::::.. : :...: ..   . :..::::: ::::.:::.::.::::::::.:
CCDS46 -PEACFTEGCIKKFPFCQVSTEEGKGKIWWNLRKTCYSIVEHNWFETFIVFMILLSSGAL
         1120      1130      1140      1150      1160      1170    

    1170      1180      1190      1200      1210      1220         
pF1KE2 AFEDYYLDQKPTVKALLEYTDRVFTFIFVFEMLLKWVAYGFKKYFTNAWCWLDFLIVNIS
       :::: :..:. :.:..:::.:.:::.::..:::::::::::. ::::::::::::::..:
CCDS46 AFEDIYIEQRKTIKTMLEYADKVFTYIFILEMLLKWVAYGFQTYFTNAWCWLDFLIVDVS
         1180      1190      1200      1210      1220      1230    

    1230      1240      1250      1260      1270      1280         
pF1KE2 LISLTAKILEYSEVAPIKALRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVDALVGAIPSIMNVLLVCL
       :.::.:. : :::.. ::.:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS46 LVSLVANALGYSELGAIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALVGAIPSIMNVLLVCL
         1240      1250      1260      1270      1280      1290    

    1290      1300      1310      1320      1330      1340         
pF1KE2 IFWLIFSIMGVNLFAGKFWRCINYTDGEFSLVPLSIVNNKSDCKIQNSTGSFFWVNVKVN
       ::::::::::::::::::..:.:.: :  ..  .: ::: :::.  .. .   : :::::
CCDS46 IFWLIFSIMGVNLFAGKFYHCVNMTTG--NMFDISDVNNLSDCQALGKQAR--WKNVKVN
         1300      1310      1320        1330      1340        1350

    1350      1360      1370      1380      1390      1400         
pF1KE2 FDNVAMGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSREVNMQPKWEDNVYMYLYFVIFIIFGGFFT
       ::::. :::::::::::::::::::::::::.:..:: .:.:.:::::::::::::.:::
CCDS46 FDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSRDVKLQPVYEENLYMYLYFVIFIIFGSFFT
             1360      1370      1380      1390      1400      1410

    1410      1420      1430      1440      1450      1460         
pF1KE2 LNLFVGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPLNKFQGFV
       ::::.:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::.:
CCDS46 LNLFIGVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPANKFQGMV
             1420      1430      1440      1450      1460      1470

    1470      1480      1490      1500      1510      1520         
pF1KE2 FDIVTRQAFDITIMVLICLNMITMMVETDDQSEEKTKILGKINQFFVAVFTGECVMKMFA
       ::.::::.:::.::.::::::.:::::::::..  : .:..::  :...:::: :.:. .
CCDS46 FDFVTRQVFDISIMILICLNMVTMMVETDDQGKYMTLVLSRINLVFIVLFTGEFVLKLVS
             1480      1490      1500      1510      1520      1530

    1530      1540      1550      1560       1570      1580        
pF1KE2 LRQYYFTNGWNVFDFIVVVLSIASLIFSAILKSLQSYF-SPTLFRVIRLARIGRILRLIR
       ::.:::: :::.:::.::.:::...... .   ...:: ::::::::::::::::::::.
CCDS46 LRHYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLAEM---IEKYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLIK
             1540      1550      1560         1570      1580       

     1590      1600      1610      1620      1630      1640        
pF1KE2 AAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYSIFGMSSFPHVRWEAGIDDMFNFQTFA
       .::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.: .:. ::::::::::.::.
CCDS46 GAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYAIFGMSNFAYVKKEAGIDDMFNFETFG
      1590      1600      1610      1620      1630      1640       

     1650      1660      1670      1680        1690      1700      
pF1KE2 NSMLCLFQITTSAGWDGLLSPILNTGPPYCDPNL--PNSNGTRGDCGSPAVGIIFFTTYI
       :::.:::::::::::::::.::::..:: :::.   :.:. ..::::.:.:::.::..::
CCDS46 NSMICLFQITTSAGWDGLLAPILNSAPPDCDPDTIHPGSS-VKGDCGNPSVGIFFFVSYI
      1650      1660      1670      1680       1690      1700      

       1710      1720      1730      1740      1750      1760      
pF1KE2 IISFLIVVNMYIAVILENFNVATEESTEPLSEDDFDMFYETWEKFDPEATQFITFSALSD
       :::::.:::::::::::::.::::::.::::::::.::::.::::::.::::: :: :::
CCDS46 IISFLVVVNMYIAVILENFSVATEESAEPLSEDDFEMFYEVWEKFDPDATQFIEFSKLSD
       1710      1720      1730      1740      1750      1760      

       1770      1780      1790      1800      1810      1820      
pF1KE2 FADTLSGPLRIPKPNRNILIQMDLPLVPGDKIHCLDILFAFTKNVLGESGELDSLKANME
       :: .:. :: : :::.  :: ::::.: ::.:::::::::::: :::::::.:.:. .::
CCDS46 FAAALDPPLLIAKPNKVQLIAMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGESGEMDALRIQME
       1770      1780      1790      1800      1810      1820      

       1830      1840      1850      1860      1870      1880      
pF1KE2 EKFMATNLSKSSYEPIATTLRWKQEDISATVIQKAYRSYVLHRSMALSNTPCVPRAEEEA
       ..:::.: :: :::::.:::. :::..::..::. .: :.:.. .   ..    .: .  
CCDS46 DRFMASNPSKVSYEPITTTLKRKQEEVSAAIIQRNFRCYLLKQRLKNISSNYNKEAIKGR
       1830      1840      1850      1860      1870      1880      

       1890       1900      1910      1920      1930      1940     
pF1KE2 ASLP-DEGFVAFTANENCVLPDKSETASATSFPPSYESVTRGLSDRVNMRTSSSIQNEDE
        .::  . ..    : : . :.:.. .:.:. ::::.:::.                   
CCDS46 IDLPIKQDMIIDKLNGNST-PEKTDGSSSTTSPPSYDSVTKPDKEKFEKDKPEKESKGKE
       1890      1900       1910      1920      1930      1940     

        1950      
pF1KE2 ATSMELIAPGP
                  
CCDS46 VRENQK     
        1950      

>>CCDS54570.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3               (1983 aa)
 initn: 6516 init1: 2162 opt: 3990  Z-score: 3504.9  bits: 662.0 E(32554): 6.6e-189
Smith-Waterman score: 7718; 61.7% identity (79.0% similar) in 2007 aa overlap (21-1946:21-1969)

               10        20        30          40        50        
pF1KE2 MEFPIGSLETNNFRRFTPESLVEIEKQIAAKQ--GTKKAREKHREQKDQEEKPRPQLDLK
                           :. :::..: ::  :.   .:. ::   .:: :::::::.
CCDS54 MANFLLPRGTSSFRRFTRESLAAIEKRMAEKQARGSTTLQES-REGLPEEEAPRPQLDLQ
               10        20        30        40         50         

       60        70        80        90       100       110        
pF1KE2 ACNQLPKFYGELPAELIGEPLEDLDPFYSTHRTFMVLNKGRTISRFSATRALWLFSPFNL
       : ..:: .::. : ::::::::::::::::..::.:::::.:: ::::: ::...:::. 
CCDS54 ASKKLPDLYGNPPQELIGEPLEDLDPFYSTQKTFIVLNKGKTIFRFSATNALYVLSPFHP
      60        70        80        90       100       110         

      120       130       140       150          160       170     
pF1KE2 IRRTAIKVSVHSWFSLFITVTILVNCVCMTRTDLP---EKIEYVFTVIYTFEALIKILAR
       :::.:.:. ::: :...:  :::.::: :.. : :   . .::.::.:::::.:.:::::
CCDS54 IRRAAVKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMAQHDPPPWTKYVEYTFTAIYTFESLVKILAR
     120       130       140       150       160       170         

         180       190       200       210       220       230     
pF1KE2 GFCLNEFTYLRDPWNWLDFSVITLAYVGTAIDLRGISGLRTFRVLRALKTVSVIPGLKVI
       ::::. ::.::::::::::::: .:::.  : : ..:.::::::::::::.:::::::.:
CCDS54 GFCLHAFTFLRDPWNWLDFSVIIMAYVSENIKLGNLSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTI
     180       190       200       210       220       230         

         240       250       260       270       280       290     
pF1KE2 VGALIHSVKKLADVTILTIFCLSVFALVGLQLFKGNLKNKCVKNDMAVNETTNYSSH---
       :::::.:::::::: .::.::::::::.::::: :::..:::.:  :.:  :: : .   
CCDS54 VGALIQSVKKLADVMVLTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRHKCVRNFTALN-GTNGSVEADG
     240       250       260       270       280        290        

                      300       310       320       330       340  
pF1KE2 ----------RKPDIYINKRGTSDPLLCGNGSDSGHCPDGYICLKTSDNPDFNYTSFDSF
                   :. :. : :::: :::::.::.: ::.:: :::...::: .:::::::
CCDS54 LVWESLDLYLSDPENYLLKNGTSDVLLCGNSSDAGTCPEGYRCLKAGENPDHGYTSFDSF
      300       310       320       330       340       350        

            350       360       370       380       390       400  
pF1KE2 AWAFLSLFRLMTQDSWERLYQQTLRTSGKIYMIFFVLVIFLGSFYLVNLILAVVTMAYEE
       :::::.:::::::: ::::::::::..::::::::.::::::::::::::::::.:::::
CCDS54 AWAFLALFRLMTQDCWERLYQQTLRSAGKIYMIFFMLVIFLGSFYLVNLILAVVAMAYEE
      360       370       380       390       400       410        

            410       420       430       440       450       460  
pF1KE2 QNQATTDEIEAKEKKFQEALEMLRKEQEVLAALGIDTTSLHSHNGSPLTSKNASERRHRI
       :::::  : : :::.::::.:::.::.:.:.  :.::.:  : . :::.  :. ::: . 
CCDS54 QNQATIAETEEKEKRFQEAMEMLKKEHEALTIRGVDTVSRSSLEMSPLAPVNSHERRSKR
      420       430       440       450       460       470        

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pF1KE2 KPRVSEGSTE--DNKSPRSDPYN-QRRMSFLGLASG------KRRASHGSVFHFRSPGRD
       . :.: :. :  ... :.::  .  : :. :.:. :      : :.:.::.: ::   ::
CCDS54 RKRMSSGTEECGEDRLPKSDSEDGPRAMNHLSLTRGLSRTSMKPRSSRGSIFTFRR--RD
      480       490       500       510       520       530        

           520        530           540       550              560 
pF1KE2 ISLPEGVTDD-GVFPGDHESHRGSLL----LGGGAGQQGPLPRSPLP-------QPSNPD
       ..     .:: .   :. :::. :::    :   ..:  : : .  :       . :. :
CCDS54 LGSEADFADDENSTAGESESHHTSLLVPWPLRRTSAQGQPSPGTSAPGHALHGKKNSTVD
        540       550       560       570       580       590      

                    570       580             590           600    
pF1KE2 SRH-------GEDEHQPPPTSELAPGAVD------VSAFDAGQKKTFLS----AEYLDEP
                 :. :   : .  : :  ..      . . . :  . . :    .. ..::
CCDS54 CNGVVSLLGAGDPEATSPGSHLLRPVMLEHPPDTTTPSEEPGGPQMLTSQAPCVDGFEEP
        600       610       620       630       640       650      

          610       620       630       640       650       660    
pF1KE2 FRAQRAMSVVSIITSVLEELEESEQKCPPCLTSLSQKYLIWDCCPMWVKLKTILFGLVTD
          :::.:.::..::.:::::::..::::: . :.:.::::.:::.:...:  .  .: :
CCDS54 GARQRALSAVSVLTSALEELEESRHKCPPCWNRLAQRYLIWECCPLWMSIKQGVKLVVMD
        660       670       680       690       700       710      

          670       680       690       700       710       720    
pF1KE2 PFAELTITLCIVVNTIFMAMEHHGMSPTFEAMLQIGNIVFTIFFTAEMVFKIIAFDPYYY
       ::..::::.:::.::.:::.::..:.  :: :::.::.::: .:::::.:::::.:::::
CCDS54 PFTDLTITMCIVLNTLFMALEHYNMTSEFEEMLQVGNLVFTGIFTAEMTFKIIALDPYYY
        720       730       740       750       760       770      

          730       740       750       760       770       780    
pF1KE2 FQKKWNIFDCIIVTVSLLELGVAKKGSLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSV
       ::. ::::: ::: .::.:::... ..:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 FQQGWNIFDSIIVILSLMELGLSRMSNLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSV
        780       790       800       810       820       830      

          790       800       810       820       830       840    
pF1KE2 GALGNLTIILAIIVFVFALVGKQLLGENYRNNRKNISAPHEDWPRWHMHDFFHSFLIVFR
       :::::::..::::::.::.:: ::.:.:: . : . :.     ::::: ::::.:::.::
CCDS54 GALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKNYSELRDSDSGL---LPRWHMMDFFHAFLIIFR
        840       850       860       870          880       890   

          850       860       870       880       890       900    
pF1KE2 ILCGEWIENMWACMEVGQKSICLILFLTVMVLGNLVVLNLFIALLLNSFSADNLTAPEDD
       ::::::::.:: ::::. .:.::..:: :::.:::::::::.::::.::::::::::..:
CCDS54 ILCGEWIETMWDCMEVSGQSLCLLVFLLVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLTAPDED
           900       910       920       930       940       950   

          910          920       930       940            950      
pF1KE2 GEVNNLQVALARIQV---FGHRTKQALCSFFSRSCPFPQPKA---EPEL--VVKLPLSSS
        :.::::.::::::    : .::   .:  . :. :  .: :   . .:   .  : :  
CCDS54 REMNNLQLALARIQRGLRFVKRTTWDFCCGLLRQRP-QKPAALAAQGQLPSCIATPYSPP
           960       970       980        990      1000      1010  

        960       970          980       990      1000      1010   
pF1KE2 KAENHIAANTARGSS--GGLQAPRG-PRDEHSDFIANPTVWVSVPIAEGESDLDDLEDDG
         :.. .  : . .    : :  .: : : .      :   : :::: .::: :: :.: 
CCDS54 PPETEKVPPTRKETRFEEGEQPGQGTPGDPE------P---VCVPIAVAESDTDDQEEDE
           1020      1030      1040               1050      1060   

              1020      1030      1040      1050      1060         
pF1KE2 ----GEDAQSFQQEVIPKGQQEQLQQVERCGDHLTPRSPGTGTSSEDLAPSLGETWKDES
           : . .: .::  : .   .     :  ....  . . . .: . : .  . :: : 
CCDS54 ENSLGTEEESSKQESQPVSGGPEAPPDSRTWSQVSATASSEAEASASQA-DWRQQWKAE-
          1070      1080      1090      1100      1110       1120  

    1070       1080      1090      1100      1110      1120        
pF1KE2 VPQVPAEG-VDDTSSSEGSTVDCLDPEEILRKIPELADDLEEPDDCFTEGCIRHCPCCKL
        ::.:. : . . : :::::.:  .  :.:..::.:..:...:.:::::::.:.:::: .
CCDS54 -PQAPGCGETPEDSCSEGSTADMTNTAELLEQIPDLGQDVKDPEDCFTEGCVRRCPCCAV
             1130      1140      1150      1160      1170      1180

     1130      1140      1150      1160      1170      1180        
pF1KE2 DTTKSPWDVGWQVRKTCYRIVEHSWFESFIIFMILLSSGSLAFEDYYLDQKPTVKALLEY
       :::..:  : :..:::::.::::::::.:::::::::::.::::: ::... :.:.::::
CCDS54 DTTQAPGKVWWRLRKTCYHIVEHSWFETFIIFMILLSSGALAFEDIYLEERKTIKVLLEY
             1190      1200      1210      1220      1230      1240

     1190      1200      1210      1220      1230      1240        
pF1KE2 TDRVFTFIFVFEMLLKWVAYGFKKYFTNAWCWLDFLIVNISLISLTAKILEYSEVAPIKA
       .:..::..::.:::::::::::::::::::::::::::..::.::.:. : ..:..:::.
CCDS54 ADKMFTYVFVLEMLLKWVAYGFKKYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLVANTLGFAEMGPIKS
             1250      1260      1270      1280      1290      1300

     1250      1260      1270      1280      1290      1300        
pF1KE2 LRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVDALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFW
       :::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::: 
CCDS54 LRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFG
             1310      1320      1330      1340      1350      1360

     1310      1320      1330      1340      1350      1360        
pF1KE2 RCINYTDGEFSLVPLSIVNNKSDCKIQNSTGSFFWVNVKVNFDNVAMGYLALLQVATFKG
       :::: :.:.. :   .::::::.:.  : :: ..:..::::::::. :::::::::::::
CCDS54 RCINQTEGDLPL-NYTIVNNKSQCESLNLTGELYWTKVKVNFDNVGAGYLALLQVATFKG
             1370       1380      1390      1400      1410         

     1370      1380      1390      1400      1410      1420        
pF1KE2 WMDIMYAAVDSREVNMQPKWEDNVYMYLYFVIFIIFGGFFTLNLFVGVIIDNFNQQKKKL
       ::::::::::::  . ::.:: :.:::.:::::::::.:::::::.::::::::::::::
CCDS54 WMDIMYAAVDSRGYEEQPQWEYNLYMYIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKL
    1420      1430      1440      1450      1460      1470         

     1430      1440      1450      1460      1470      1480        
pF1KE2 GGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPLNKFQGFVFDIVTRQAFDITIMVLICL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::.::::.::: ::::
CCDS54 GGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPLNKYQGFIFDIVTKQAFDVTIMFLICL
    1480      1490      1500      1510      1520      1530         

     1490      1500      1510      1520      1530      1540        
pF1KE2 NMITMMVETDDQSEEKTKILGKINQFFVAVFTGECVMKMFALRQYYFTNGWNVFDFIVVV
       ::.:::::::::: :: .::.::: .:::.:::                           
CCDS54 NMVTMMVETDDQSPEKINILAKINLLFVAIFTGT--------------------------
    1540      1550      1560      1570                             

     1550      1560      1570      1580      1590      1600        
pF1KE2 LSIASLIFSAILKSLQSYFSPTLFRVIRLARIGRILRLIRAAKGIRTLLFALMMSLPALF
             ..: :..  . .::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS54 ------VLSDIIQ--KYFFSPTLFRVIRLARIGRILRLIRGAKGIRTLLFALMMSLPALF
                1580        1590      1600      1610      1620     

     1610      1620      1630      1640      1650      1660        
pF1KE2 NIGLLLFLVMFIYSIFGMSSFPHVRWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLS
       ::::::::::::::::::..: .:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NIGLLLFLVMFIYSIFGMANFAYVKWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLS
        1630      1640      1650      1660      1670      1680     

     1670      1680      1690      1700      1710      1720        
pF1KE2 PILNTGPPYCDPNLPNSNGTRGDCGSPAVGIIFFTTYIIISFLIVVNMYIAVILENFNVA
       ::::::::::::.::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::::.:::::.::
CCDS54 PILNTGPPYCDPTLPNSNGSRGDCGSPAVGILFFTTYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVA
        1690      1700      1710      1720      1730      1740     

     1730      1740      1750      1760      1770      1780        
pF1KE2 TEESTEPLSEDDFDMFYETWEKFDPEATQFITFSALSDFADTLSGPLRIPKPNRNILIQM
       :::::::::::::::::: :::::::::::: .:.::::::.:: :::: :::.  ::.:
CCDS54 TEESTEPLSEDDFDMFYEIWEKFDPEATQFIEYSVLSDFADALSEPLRIAKPNQISLINM
        1750      1760      1770      1780      1790      1800     

     1790      1800      1810      1820      1830      1840        
pF1KE2 DLPLVPGDKIHCLDILFAFTKNVLGESGELDSLKANMEEKFMATNLSKSSYEPIATTLRW
       :::.: ::.:::.:::::::: :::::::.:.:: .:::::::.: :: :::::.:::: 
CCDS54 DLPMVSGDRIHCMDILFAFTKRVLGESGEMDALKIQMEEKFMAANPSKISYEPITTTLRR
        1810      1820      1830      1840      1850      1860     

     1850      1860      1870      1880           1890       1900  
pF1KE2 KQEDISATVIQKAYRSYVLHRSMALSNTPCVPRA-----EEEAASLPD-EGFVAFTANEN
       :.:..:: :::.:.: ..:.::.  ..     .:     ::.:   :. ::..:.. .::
CCDS54 KHEEVSAMVIQRAFRRHLLQRSLKHASFLFRQQAGSGLSEEDA---PEREGLIAYVMSEN
        1870      1880      1890      1900         1910      1920  

              1910      1920      1930      1940      1950         
pF1KE2 C---VLPDKSETASATSFPPSYESVTRGLSDRVNMRTSSSIQNEDEATSMELIAPGP   
           . : .: . :.:::::::.::::. :: ...: :.  ..:: :             
CCDS54 FSRPLGPPSSSSISSTSFPPSYDSVTRATSDNLQVRGSDYSHSEDLADFPPSPDRDRESI
           1930      1940      1950      1960      1970      1980  

CCDS54 V
        

>>CCDS33313.1 SCN2A gene_id:6326|Hs108|chr2               (2005 aa)
 initn: 6549 init1: 1197 opt: 3986  Z-score: 3501.3  bits: 661.3 E(32554): 1e-188
Smith-Waterman score: 7052; 56.1% identity (77.1% similar) in 2045 aa overlap (24-1949:25-2000)

                10        20        30        40        50         
pF1KE2  MEFPIGSLETNNFRRFTPESLVEIEKQIAAKQGTKKAREKHREQKDQEEKPRPQLDLKA
                               ::..:: ... .  .:  :...:.:. :.:. ::.:
CCDS33 MAQSVLVPPGPDSFRFFTRESLAAIEQRIAEEKAKRPKQE--RKDEDDENGPKPNSDLEA
               10        20        30        40          50        

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pF1KE2 CNQLPKFYGELPAELIGEPLEDLDPFYSTHRTFMVLNKGRTISRFSATRALWLFSPFNLI
        ..:: .::..: :... :::::::.: ...::.:::::..::::::: ::....::: :
CCDS33 GKSLPFIYGDIPPEMVSVPLEDLDPYYINKKTFIVLNKGKAISRFSATPALYILTPFNPI
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pF1KE2 RRTAIKVSVHSWFSLFITVTILVNCVCMTRTDLPE---KIEYVFTVIYTFEALIKILARG
       :. :::. ::: :...:  :::.::: :: .. :.   ..::.:: :::::.::::::::
CCDS33 RKLAIKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMTMSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKILARG
      120       130       140       150       160       170        

        180       190       200       210       220       230      
pF1KE2 FCLNEFTYLRDPWNWLDFSVITLAYVGTAIDLRGISGLRTFRVLRALKTVSVIPGLKVIV
       :::..::.::::::::::.:::.:::   ..: ..:.::::::::::::.:::::::.::
CCDS33 FCLEDFTFLRDPWNWLDFTVITFAYVTEFVNLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIV
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        240       250       260       270            280           
pF1KE2 GALIHSVKKLADVTILTIFCLSVFALVGLQLFKGNLKNKCVK-----NDMAVNETT----
       ::::.:::::.:: :::.::::::::.::::: :::.:::..     ... .: :.    
CCDS33 GALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCLQWPPDNSSFEINITSFFNN
      240       250       260       270       280       290        

           290             300              310       320       330
pF1KE2 ----NYSSHRKP------DIYINKR-------GTSDPLLCGNGSDSGHCPDGYICLKTSD
           : ..  .       : ::. .       : .: :::::.::.:.::.::::.:.. 
CCDS33 SLDGNGTTFNRTVSIFNWDEYIEDKSHFYFLEGQNDALLCGNSSDAGQCPEGYICVKAGR
      300       310       320       330       340       350        

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pF1KE2 NPDFNYTSFDSFAWAFLSLFRLMTQDSWERLYQQTLRTSGKIYMIFFVLVIFLGSFYLVN
       ::...:::::.:.::::::::::::: :: ::: :::..:: ::::::::::::::::.:
CCDS33 NPNYGYTSFDTFSWAFLSLFRLMTQDFWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFLGSFYLIN
      360       370       380       390       400       410        

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pF1KE2 LILAVVTMAYEEQNQATTDEIEAKEKKFQEALEMLRKEQEVLAAL---------------
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CCDS33 LILAVVAMAYEEQNQATLEEAEQKEAEFQQMLEQLKKQQEEAQAAAAAASAESRDFSGAG
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pF1KE2 GIDTTSLHSHNGSPLTSKNASE-RRHRIKPRVSEGSTEDNKSPR----------------
       :: . :  :  .: :.::. .: . .: : . .: : :..:. :                
CCDS33 GIGVFSESSSVASKLSSKSEKELKNRRKKKKQKEQSGEEEKNDRVRKSESEDSIRRKGFR
      480       490       500       510       520       530        

                    480       490       500       510       520    
pF1KE2 --------------SDPYNQRRMSFLGLASGKRRASHGSVFHFRSPGRDISLPEGVTDD-
                     :.:. :  .:. :   . :: :..:.: ::. ..::.  .  .:: 
CCDS33 FSLEGSRLTYEKRFSSPH-QSLLSIRGSLFSPRRNSRASLFSFRGRAKDIGSENDFADDE
      540       550        560       570       580       590       

            530       540              550        560       570    
pF1KE2 -GVFPGDHESHRGSLLLGGGAGQ-------QGPLPRSPLP-QPSNPDSRHGEDEHQ----
        ..:  :..:.: ::..    :.       :.      ::  : :   . . : .     
CCDS33 HSTFE-DNDSRRDSLFVPHRHGERRHSNVSQASRASRVLPILPMNGKMHSAVDCNGVVSL
       600        610       620       630       640       650      

                     580       590        600       610       620  
pF1KE2 --PPPT----SELAP-GAVDVSAFDAGQKKTF-LSAEYLDEPFRAQRAMSVVSIITSVLE
          : :    ..: : :..  . .   ..... .: . :..:   :::::..::.:...:
CCDS33 VGGPSTLTSAGQLLPEGTTTETEIRKRRSSSYHVSMDLLEDPTSRQRAMSIASILTNTME
        660       670       680       690       700       710      

            630       640       650       660       670       680  
pF1KE2 ELEESEQKCPPCLTSLSQKYLIWDCCPMWVKLKTILFGLVTDPFAELTITLCIVVNTIFM
       :::::.::::::  ....  ::::::  :.:.: ..  .: :::..:.::.:::.::.::
CCDS33 ELEESRQKCPPCWYKFANMCLIWDCCKPWLKVKHLVNLVVMDPFVDLAITICIVLNTLFM
        720       730       740       750       760       770      

            690       700       710       720       730       740  
pF1KE2 AMEHHGMSPTFEAMLQIGNIVFTIFFTAEMVFKIIAFDPYYYFQKKWNIFDCIIVTVSLL
       ::::. :.  : ..:..::.::: .::::: .::::.:::::::. ::::: .::..::.
CCDS33 AMEHYPMTEQFSSVLSVGNLVFTGIFTAEMFLKIIAMDPYYYFQEGWNIFDGFIVSLSLM
        780       790       800       810       820       830      

            750       760       770       780       790       800  
pF1KE2 ELGVAKKGSLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSVGALGNLTIILAIIVFVFA
       :::.:.  .::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::..::::::.::
CCDS33 ELGLANVEGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFA
        840       850       860       870       880       890      

            810       820       830       840       850       860  
pF1KE2 LVGKQLLGENYRNNRKNISAPHEDWPRWHMHDFFHSFLIVFRILCGEWIENMWACMEVGQ
       .:: ::.:..:..   .::   :  :::::::::::::::::.:::::::.:: ::::. 
CCDS33 VVGMQLFGKSYKECVCKISNDCE-LPRWHMHDFFHSFLIVFRVLCGEWIETMWDCMEVAG
        900       910        920       930       940       950     

            870       880       890       900       910       920  
pF1KE2 KSICLILFLTVMVLGNLVVLNLFIALLLNSFSADNLTAPEDDGEVNNLQVALARIQVFGH
       ...:: .:. :::.:::::::::.::::.:::.:::.: .::.:.::::.:..:.:    
CCDS33 QTMCLTVFMMVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSSDNLAATDDDNEMNNLQIAVGRMQKGID
         960       970       980       990      1000      1010     

            930       940       950          960                970
pF1KE2 RTKQALCSFFSRSCPFPQPKAEPELVVKLPLSSSK---AENHIAANTAR---------GS
        .:. .  :....    : ::  :.     :...:     :: . . ..         :.
CCDS33 FVKRKIREFIQKAFVRKQ-KALDEIKPLEDLNNKKDSCISNHTTIEIGKDLNYLKDGNGT
        1020      1030       1040      1050      1060      1070    

                980         990      1000      1010      1020      
pF1KE2 SGGL--QAPRGPRDE--HSDFIANPTVWVSVPIAEGESDLDDLEDDGGEDAQSFQQEVIP
       ..:.  .. .   ::  . .:: ::.. :.:::: ::::...:      ... :..:   
CCDS33 TSGIGSSVEKYVVDESDYMSFINNPSLTVTVPIAVGESDFENL------NTEEFSSE---
         1080      1090      1100      1110            1120        

       1030      1040      1050      1060      1070      1080      
pF1KE2 KGQQEQLQQVERCGDHLTPRSPGTGTSSEDLAPSLGETWKDESVPQVPAEGVDDTSSSEG
                                    :.  :               : .. ::::::
CCDS33 ----------------------------SDMEES--------------KEKLNATSSSEG
                                    1130                    1140   

       1090      1100       1110      1120      1130      1140     
pF1KE2 STVDCLDPEEILRKIPELA-DDLEEPDDCFTEGCIRHCPCCKLDTTKSPWDVGWQVRKTC
       ::::   : :   . ::.  ..  ::. :::: :.:.  ::...  ..   . :..::::
CCDS33 STVDIGAPAE--GEQPEVEPEESLEPEACFTEDCVRKFKCCQISIEEGKGKLWWNLRKTC
          1150        1160      1170      1180      1190      1200 

        1150      1160      1170      1180      1190      1200     
pF1KE2 YRIVEHSWFESFIIFMILLSSGSLAFEDYYLDQKPTVKALLEYTDRVFTFIFVFEMLLKW
       :.::::.:::.::.::::::::.::::: :..:. :.:..:::.:.:::.::..::::::
CCDS33 YKIVEHNWFETFIVFMILLSSGALAFEDIYIEQRKTIKTMLEYADKVFTYIFILEMLLKW
            1210      1220      1230      1240      1250      1260 

        1210      1220      1230      1240      1250      1260     
pF1KE2 VAYGFKKYFTNAWCWLDFLIVNISLISLTAKILEYSEVAPIKALRTLRALRPLRALSRFE
       :::::. ::::::::::::::..::.::::. : :::.. ::.:::::::::::::::::
CCDS33 VAYGFQVYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLTANALGYSELGAIKSLRTLRALRPLRALSRFE
            1270      1280      1290      1300      1310      1320 

        1270      1280      1290      1300      1310      1320     
pF1KE2 GMRVVVDALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFWRCINYTDGEFSLVPLSI
       ::::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::..::::: ::  .  .:.
CCDS33 GMRVVVNALLGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFYHCINYTTGE--MFDVSV
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        1330       1340      1350      1360      1370      1380    
pF1KE2 VNNKSDCK-IQNSTGSFFWVNVKVNFDNVAMGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSREVNM
       ::: :.:: . .:. .  : :::::::::..:::.:::::::::::::::::::::.:..
CCDS33 VNNYSECKALIESNQTARWKNVKVNFDNVGLGYLSLLQVATFKGWMDIMYAAVDSRNVEL
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         1390      1400      1410      1420      1430      1440    
pF1KE2 QPKWEDNVYMYLYFVIFIIFGGFFTLNLFVGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEEQKKYYN
       :::.:::.:::::::::::::.:::::::.:::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS33 QPKYEDNLYMYLYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQKKYYN
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pF1KE2 AMKKLGSKKPQKPIPRPLNKFQGFVFDIVTRQAFDITIMVLICLNMITMMVETDDQSEEK
       ::::::::::::::::: :::::.:::.::.:.:::.::.::::::.::::::::::.: 
CCDS33 AMKKLGSKKPQKPIPRPANKFQGMVFDFVTKQVFDISIMILICLNMVTMMVETDDQSQEM
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pF1KE2 TKILGKINQFFVAVFTGECVMKMFALRQYYFTNGWNVFDFIVVVLSIASLIFSAILKSLQ
       :.::  ::  :...::::::.:...:: :::: :::.:::.::.:::...... ..   .
CCDS33 TNILYWINLVFIVLFTGECVLKLISLRYYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLAELI---E
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pF1KE2 SYF-SPTLFRVIRLARIGRILRLIRAAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYSI
       .:: ::::::::::::::::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS33 KYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYAI
       1620      1630      1640      1650      1660      1670      

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pF1KE2 FGMSSFPHVRWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLSPILNTGPPYCDPNL-
       ::::.: .:. :.::::::::.::.:::.:::::::::::::::.::::.::: :::.  
CCDS33 FGMSNFAYVKREVGIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLAPILNSGPPDCDPDKD
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            1690      1700      1710      1720      1730      1740 
pF1KE2 -PNSNGTRGDCGSPAVGIIFFTTYIIISFLIVVNMYIAVILENFNVATEESTEPLSEDDF
        :.:. ..::::.:.:::.::..:::::::.:::::::::::::.::::::.::::::::
CCDS33 HPGSS-VKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFLVVVNMYIAVILENFSVATEESAEPLSEDDF
       1740       1750      1760      1770      1780      1790     

            1750      1760      1770      1780      1790      1800 
pF1KE2 DMFYETWEKFDPEATQFITFSALSDFADTLSGPLRIPKPNRNILIQMDLPLVPGDKIHCL
       .::::.::::::.::::: :. ::::::.:. :: : :::.  :: ::::.: ::.::::
CCDS33 EMFYEVWEKFDPDATQFIEFAKLSDFADALDPPLLIAKPNKVQLIAMDLPMVSGDRIHCL
        1800      1810      1820      1830      1840      1850     

            1810      1820      1830      1840      1850      1860 
pF1KE2 DILFAFTKNVLGESGELDSLKANMEEKFMATNLSKSSYEPIATTLRWKQEDISATVIQKA
       :::::::: :::::::.:.:. .:::.:::.: :: :::::.:::. :::..:: .::.:
CCDS33 DILFAFTKRVLGESGEMDALRIQMEERFMASNPSKVSYEPITTTLKRKQEEVSAIIIQRA
        1860      1870      1880      1890      1900      1910     

            1870       1880      1890      1900      1910      1920
pF1KE2 YRSYVLHRSMA-LSNTPCVPRAEEEAASLPDEGFVAFTANENCVLPDKSETASATSFPPS
       :: :.:....  .:.     ...:  ..   :  .    ::: . :.:.. . .:. :::
CCDS33 YRRYLLKQKVKKVSSIYKKDKGKECDGTPIKEDTLIDKLNENST-PEKTDMTPSTTSPPS
        1920      1930      1940      1950       1960      1970    

             1930      1940      1950      
pF1KE2 YESVTRGLSDRVNMRTSSSIQNEDEATSMELIAPGP
       :.:::.  ... .   :   ..::.. ..       
CCDS33 YDSVTKPEKEKFEKDKS---EKEDKGKDIRESKK  
         1980      1990         2000       

>>CCDS33314.1 SCN2A gene_id:6326|Hs108|chr2               (2005 aa)
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                10        20        30        40        50         
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CCDS33 MAQSVLVPPGPDSFRFFTRESLAAIEQRIAEEKAKRPKQE--RKDEDDENGPKPNSDLEA
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        ..:: .::..: :... :::::::.: ...::.:::::..::::::: ::....::: :
CCDS33 GKSLPFIYGDIPPEMVSVPLEDLDPYYINKKTFIVLNKGKAISRFSATPALYILTPFNPI
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pF1KE2 RRTAIKVSVHSWFSLFITVTILVNCVCMTRTDLPE---KIEYVFTVIYTFEALIKILARG
       :. :::. ::: :...:  :::.::: :: .. :.   ..::.:: :::::.::::::::
CCDS33 RKLAIKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMTMSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKILARG
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pF1KE2 FCLNEFTYLRDPWNWLDFSVITLAYVGTAIDLRGISGLRTFRVLRALKTVSVIPGLKVIV
       :::..::.::::::::::.:::.:::   .:: ..:.::::::::::::.:::::::.::
CCDS33 FCLEDFTFLRDPWNWLDFTVITFAYVTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIV
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pF1KE2 GALIHSVKKLADVTILTIFCLSVFALVGLQLFKGNLKNKCVK-----NDMAVNETT----
       ::::.:::::.:: :::.::::::::.::::: :::.:::..     ... .: :.    
CCDS33 GALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCLQWPPDNSSFEINITSFFNN
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           290             300              310       320       330
pF1KE2 ----NYSSHRKP------DIYINKR-------GTSDPLLCGNGSDSGHCPDGYICLKTSD
           : ..  .       : ::. .       : .: :::::.::.:.::.::::.:.. 
CCDS33 SLDGNGTTFNRTVSIFNWDEYIEDKSHFYFLEGQNDALLCGNSSDAGQCPEGYICVKAGR
      300       310       320       330       340       350        

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pF1KE2 NPDFNYTSFDSFAWAFLSLFRLMTQDSWERLYQQTLRTSGKIYMIFFVLVIFLGSFYLVN
       ::...:::::.:.::::::::::::: :: ::: :::..:: ::::::::::::::::.:
CCDS33 NPNYGYTSFDTFSWAFLSLFRLMTQDFWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFLGSFYLIN
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pF1KE2 LILAVVTMAYEEQNQATTDEIEAKEKKFQEALEMLRKEQEVLAAL---------------
       ::::::.:::::::::: .: : :: .::. ::.:.:.::   :                
CCDS33 LILAVVAMAYEEQNQATLEEAEQKEAEFQQMLEQLKKQQEEAQAAAAAASAESRDFSGAG
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pF1KE2 GIDTTSLHSHNGSPLTSKNASE-RRHRIKPRVSEGSTEDNKSPR----------------
       :: . :  :  .: :.::. .: . .: : . .: : :..:. :                
CCDS33 GIGVFSESSSVASKLSSKSEKELKNRRKKKKQKEQSGEEEKNDRVRKSESEDSIRRKGFR
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pF1KE2 --------------SDPYNQRRMSFLGLASGKRRASHGSVFHFRSPGRDISLPEGVTDD-
                     :.:. :  .:. :   . :: :..:.: ::. ..::.  .  .:: 
CCDS33 FSLEGSRLTYEKRFSSPH-QSLLSIRGSLFSPRRNSRASLFSFRGRAKDIGSENDFADDE
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pF1KE2 -GVFPGDHESHRGSLLLGGGAGQ-------QGPLPRSPLP-QPSNPDSRHGEDEHQ----
        ..:  :..:.: ::..    :.       :.      ::  : :   . . : .     
CCDS33 HSTFE-DNDSRRDSLFVPHRHGERRHSNVSQASRASRVLPILPMNGKMHSAVDCNGVVSL
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pF1KE2 --PPPT----SELAP-GAVDVSAFDAGQKKTF-LSAEYLDEPFRAQRAMSVVSIITSVLE
          : :    ..: : :..  . .   ..... .: . :..:   :::::..::.:...:
CCDS33 VGGPSTLTSAGQLLPEGTTTETEIRKRRSSSYHVSMDLLEDPTSRQRAMSIASILTNTME
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pF1KE2 ELEESEQKCPPCLTSLSQKYLIWDCCPMWVKLKTILFGLVTDPFAELTITLCIVVNTIFM
       :::::.::::::  ....  ::::::  :.:.: ..  .: :::..:.::.:::.::.::
CCDS33 ELEESRQKCPPCWYKFANMCLIWDCCKPWLKVKHLVNLVVMDPFVDLAITICIVLNTLFM
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pF1KE2 AMEHHGMSPTFEAMLQIGNIVFTIFFTAEMVFKIIAFDPYYYFQKKWNIFDCIIVTVSLL
       ::::. :.  : ..:..::.::: .::::: .::::.:::::::. ::::: .::..::.
CCDS33 AMEHYPMTEQFSSVLSVGNLVFTGIFTAEMFLKIIAMDPYYYFQEGWNIFDGFIVSLSLM
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       :::.:.  .::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::..::::::.::
CCDS33 ELGLANVEGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFA
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       .:: ::.:..:..   .::   :  :::::::::::::::::.:::::::.:: ::::. 
CCDS33 VVGMQLFGKSYKECVCKISNDCE-LPRWHMHDFFHSFLIVFRVLCGEWIETMWDCMEVAG
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pF1KE2 KSICLILFLTVMVLGNLVVLNLFIALLLNSFSADNLTAPEDDGEVNNLQVALARIQVFGH
       ...:: .:. :::.:::::::::.::::.:::.:::.: .::.:.::::.:..:.:    
CCDS33 QTMCLTVFMMVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSSDNLAATDDDNEMNNLQIAVGRMQKGID
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pF1KE2 RTKQALCSFFSRSCPFPQPKAEPELVVKLPLSSSK---AENHIAANTAR---------GS
        .:. .  :....    : ::  :.     :...:     :: . . ..         :.
CCDS33 FVKRKIREFIQKAFVRKQ-KALDEIKPLEDLNNKKDSCISNHTTIEIGKDLNYLKDGNGT
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pF1KE2 SGGL--QAPRGPRDE--HSDFIANPTVWVSVPIAEGESDLDDLEDDGGEDAQSFQQEVIP
       ..:.  .. .   ::  . .:: ::.. :.:::: ::::...:      ... :..:   
CCDS33 TSGIGSSVEKYVVDESDYMSFINNPSLTVTVPIAVGESDFENL------NTEEFSSE---
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pF1KE2 KGQQEQLQQVERCGDHLTPRSPGTGTSSEDLAPSLGETWKDESVPQVPAEGVDDTSSSEG
                                    :.  :               : .. ::::::
CCDS33 ----------------------------SDMEES--------------KEKLNATSSSEG
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       ::::   : :   . ::.  ..  ::. :::: :.:.  ::...  ..   . :..::::
CCDS33 STVDIGAPAE--GEQPEVEPEESLEPEACFTEDCVRKFKCCQISIEEGKGKLWWNLRKTC
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pF1KE2 YRIVEHSWFESFIIFMILLSSGSLAFEDYYLDQKPTVKALLEYTDRVFTFIFVFEMLLKW
       :.::::.:::.::.::::::::.::::: :..:. :.:..:::.:.:::.::..::::::
CCDS33 YKIVEHNWFETFIVFMILLSSGALAFEDIYIEQRKTIKTMLEYADKVFTYIFILEMLLKW
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       :::::. ::::::::::::::..::.::::. : :::.. ::.:::::::::::::::::
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       ::::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::..::::: ::  .  .:.
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       ::: :.:: . .:. .  : :::::::::..:::.:::::::::::::::::::::.:..
CCDS33 VNNYSECKALIESNQTARWKNVKVNFDNVGLGYLSLLQVATFKGWMDIMYAAVDSRNVEL
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       :::.:::.:::::::::::::.:::::::.:::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS33 QPKYEDNLYMYLYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQKKYYN
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       ::::::::::::::::: :::::.:::.::.:.:::.::.::::::.::::::::::.: 
CCDS33 AMKKLGSKKPQKPIPRPANKFQGMVFDFVTKQVFDISIMILICLNMVTMMVETDDQSQEM
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       :.::  ::  :...::::::.:...:: :::: :::.:::.::.:::...... ..   .
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       .:: ::::::::::::::::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS33 KYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYAI
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       ::::.: .:. :.::::::::.::.:::.:::::::::::::::.::::.::: :::.  
CCDS33 FGMSNFAYVKREVGIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLAPILNSGPPDCDPDKD
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pF1KE2 -PNSNGTRGDCGSPAVGIIFFTTYIIISFLIVVNMYIAVILENFNVATEESTEPLSEDDF
        :.:. ..::::.:.:::.::..:::::::.:::::::::::::.::::::.::::::::
CCDS33 HPGSS-VKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFLVVVNMYIAVILENFSVATEESAEPLSEDDF
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       .::::.::::::.::::: :. ::::::.:. :: : :::.  :: ::::.: ::.::::
CCDS33 EMFYEVWEKFDPDATQFIEFAKLSDFADALDPPLLIAKPNKVQLIAMDLPMVSGDRIHCL
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       :::::::: :::::::.:.:. .:::.:::.: :: :::::.:::. :::..:: .::.:
CCDS33 DILFAFTKRVLGESGEMDALRIQMEERFMASNPSKVSYEPITTTLKRKQEEVSAIIIQRA
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pF1KE2 YRSYVLHRSMA-LSNTPCVPRAEEEAASLPDEGFVAFTANENCVLPDKSETASATSFPPS
       :: :.:....  .:.     ...:  ..   :  .    ::: . :.:.. . .:. :::
CCDS33 YRRYLLKQKVKKVSSIYKKDKGKECDGTPIKEDTLIDKLNENST-PEKTDMTPSTTSPPS
        1920      1930      1940      1950       1960      1970    

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CCDS33 YDSVTKPEKEKFEKDKS---EKEDKGKDIRESKK  
         1980      1990         2000       

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CCDS33 GKNLPFIYGDIPPEMVSEPLEDLDPYYINKKTFIVMNKGKAIFRFSATSALYILTPLNPV
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CCDS33 RKIAIKILVHSLFSMLIMCTILTNCVFMTLSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKILARG
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CCDS33 FCLEDFTFLRDPWNWLDFSVIVMAYVTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIV
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pF1KE2 GALIHSVKKLADVTILTIFCLSVFALVGLQLFKGNLKNKCVK---NDMAVN-ETTNY--S
       ::::.:::::.:: :::.::::::::.::::: :::.:::..   .: : . .::.:  .
CCDS33 GALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCLQWPPSDSAFETNTTSYFNG
       240       250       260       270       280       290       

              300                           310       320       330
pF1KE2 SHRKPDIYINKR--------------------GTSDPLLCGNGSDSGHCPDGYICLKTSD
       .  .   ..:                      : .::::::::::.:.::.::::.:.. 
CCDS33 TMDSNGTFVNVTMSTFNWKDYIGDDSHFYVLDGQKDPLLCGNGSDAGQCPEGYICVKAGR
       300       310       320       330       340       350       

              340       350       360       370       380       390
pF1KE2 NPDFNYTSFDSFAWAFLSLFRLMTQDSWERLYQQTLRTSGKIYMIFFVLVIFLGSFYLVN
       ::...:::::.:.::::::::::::: :: ::: :::..:: ::::::::::::::::::
CCDS33 NPNYGYTSFDTFSWAFLSLFRLMTQDYWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFLGSFYLVN
       360       370       380       390       400       410       

              400       410       420       430       440          
pF1KE2 LILAVVTMAYEEQNQATTDEIEAKEKKFQEALEMLRKEQEVLAALGIDTTSLHSHNG---
       ::::::.:::::::::: .: : :: .::. ::.:.:.::   :..  ... .. .:   
CCDS33 LILAVVAMAYEEQNQATLEEAEQKEAEFQQMLEQLKKQQEEAQAVAAASAASRDFSGIGG
       420       430       440       450       460       470       

                  450       460           470         480          
pF1KE2 -----------SPLTSKNASERRHRIKPRVS----EGSTEDNKS--PRSDPYNQ-RRMSF
                  : :.::.:.: :.: : : .    ::... ...  :.:.  .. .: ::
CCDS33 LGELLESSSEASKLSSKSAKEWRNRRKKRRQREHLEGNNKGERDSFPKSESEDSVKRSSF
       480       490       500       510       520       530       

     490                                500       510       520    
pF1KE2 L----G--LASGK-------------------RRASHGSVFHFRSPGRDISLPEGVTDD-
       :    :  :.: :                   :: :. :.: ::. ..:..  .  .:: 
CCDS33 LFSMDGNRLTSDKKFCSPHQSLLSIRGSLFSPRRNSKTSIFSFRGRAKDVGSENDFADDE
       540       550       560       570       580       590       

            530       540              550        560       570    
pF1KE2 -GVFPGDHESHRGSLLLGGGAGQ-------QGPLPRSPLPQ-PSNPDSRHGEDEHQ----
        ..:  : ::.: ::..    :.       :. .    .:  :.:   .   : .     
CCDS33 HSTFE-DSESRRDSLFVPHRHGERRNSNVSQASMSSRMVPGLPANGKMHSTVDCNGVVSL
       600        610       620       630       640       650      

                      580       590        600       610       620 
pF1KE2 ---PP----PTSELAP-GAVDVSAFDAGQKKTF-LSAEYLDEPFRAQRAMSVVSIITSVL
          :     ::..: : :..  .     . ... .: :.:..    :::.:..::.:...
CCDS33 VGGPSALTSPTGQLPPEGTTTETEVRKRRLSSYQISMEMLEDSSGRQRAVSIASILTNTM
        660       670       680       690       700       710      

             630       640       650       660       670       680 
pF1KE2 EELEESEQKCPPCLTSLSQKYLIWDCCPMWVKLKTILFGLVTDPFAELTITLCIVVNTIF
       ::::::.::::::   ... .::::::  :.:.: ..  .: :::..:.::.:::.::.:
CCDS33 EELEESRQKCPPCWYRFANVFLIWDCCDAWLKVKHLVNLIVMDPFVDLAITICIVLNTLF
        720       730       740       750       760       770      

             690       700       710       720       730       740 
pF1KE2 MAMEHHGMSPTFEAMLQIGNIVFTIFFTAEMVFKIIAFDPYYYFQKKWNIFDCIIVTVSL
       :::::. :.  : ..: .::.::: .::::::.::::.:::::::. ::::: :::..::
CCDS33 MAMEHYPMTEQFSSVLTVGNLVFTGIFTAEMVLKIIAMDPYYYFQEGWNIFDGIIVSLSL
        780       790       800       810       820       830      

             750       760       770       780       790       800 
pF1KE2 LELGVAKKGSLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSVGALGNLTIILAIIVFVF
       .:::...  .::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::..::::::.:
CCDS33 MELGLSNVEGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIF
        840       850       860       870       880       890      

             810       820       830       840       850       860 
pF1KE2 ALVGKQLLGENYRNNRKNISAPHEDWPRWHMHDFFHSFLIVFRILCGEWIENMWACMEVG
       :.:: ::.:..:..   .:.      :::::.:::::::::::.:::::::.:: ::::.
CCDS33 AVVGMQLFGKSYKECVCKIN-DDCTLPRWHMNDFFHSFLIVFRVLCGEWIETMWDCMEVA
        900       910        920       930       940       950     

             870       880       890       900       910       920 
pF1KE2 QKSICLILFLTVMVLGNLVVLNLFIALLLNSFSADNLTAPEDDGEVNNLQVALARIQVFG
        ...:::.:. :::.:::::::::.::::.:::.:::.: .::.:.::::.:..:.:   
CCDS33 GQTMCLIVFMLVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSSDNLAATDDDNEMNNLQIAVGRMQKGI
         960       970       980       990      1000      1010     

             930       940                950       960         970
pF1KE2 HRTKQALCSFFSRSCPFPQPKA---------EPELVVKLPLSSSKAENHI--AANTARGS
         .:. .   :...  : .::.         .  .  .  .  ::  :..  . .:. : 
CCDS33 DYVKNKMRECFQKAF-FRKPKVIEIHEGNKIDSCMSNNTGIEISKELNYLRDGNGTTSGV
        1020      1030       1040      1050      1060      1070    

              980         990      1000      1010      1020        
pF1KE2 SGGLQAPRGPRDEHS--DFIANPTVWVSVPIAEGESDLDDLEDDGGEDAQSFQQEVIPKG
       . : .. .   ::..  .:: ::.. :.:::: ::::...:      ... :..:     
CCDS33 GTGSSVEKYVIDENDYMSFINNPSLTVTVPIAVGESDFENL------NTEEFSSE-----
         1080      1090      1100      1110            1120        

     1030      1040      1050      1060      1070      1080        
pF1KE2 QQEQLQQVERCGDHLTPRSPGTGTSSEDLAPSLGETWKDESVPQVPAEGVDDTSSSEGST
          .:..                 :.: :                     . ::::::::
CCDS33 --SELEE-----------------SKEKL---------------------NATSSSEGST
                             1130                           1140   

     1090      1100      1110      1120      1130      1140        
pF1KE2 VDCLDPEEILRKIPELADDLEEPDDCFTEGCIRHCPCCKLDTTKSPWDVGWQVRKTCYRI
       :: . :.:  .   :  .::. :. :::::::.. : :...: ..   . :..::::: :
CCDS33 VDVVLPREGEQAETEPEEDLK-PEACFTEGCIKKFPFCQVSTEEGKGKIWWNLRKTCYSI
          1150      1160       1170      1180      1190      1200  

     1150      1160      1170      1180      1190      1200        
pF1KE2 VEHSWFESFIIFMILLSSGSLAFEDYYLDQKPTVKALLEYTDRVFTFIFVFEMLLKWVAY
       :::.:::.::.::::::::.::::: :..:. :.:..:::.:.:::.::..:::::::::
CCDS33 VEHNWFETFIVFMILLSSGALAFEDIYIEQRKTIKTMLEYADKVFTYIFILEMLLKWVAY
           1210      1220      1230      1240      1250      1260  

     1210      1220      1230      1240      1250      1260        
pF1KE2 GFKKYFTNAWCWLDFLIVNISLISLTAKILEYSEVAPIKALRTLRALRPLRALSRFEGMR
       ::. ::::::::::::::..::.::.:. : :::.. ::.::::::::::::::::::::
CCDS33 GFQTYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLVANALGYSELGAIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMR
           1270      1280      1290      1300      1310      1320  

     1270      1280      1290      1300      1310      1320        
pF1KE2 VVVDALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFWRCINYTDGEFSLVPLSIVNN
       :::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::..:.:.: :  ..  .: :::
CCDS33 VVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFYHCVNMTTG--NMFDISDVNN
           1330      1340      1350      1360      1370        1380

     1330      1340      1350      1360      1370      1380        
pF1KE2 KSDCKIQNSTGSFFWVNVKVNFDNVAMGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSREVNMQPKW
        :::.  .. .   : :::::::::. :::::::::::::::::::::::::.:..:: .
CCDS33 LSDCQALGKQAR--WKNVKVNFDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSRDVKLQPVY
             1390        1400      1410      1420      1430        

     1390      1400      1410      1420      1430      1440        
pF1KE2 EDNVYMYLYFVIFIIFGGFFTLNLFVGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEEQKKYYNAMKK
       :.:.:::::::::::::.:::::::.:::::::::::::.::::::::::::::::::::
CCDS33 EENLYMYLYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQKKYYNAMKK
     1440      1450      1460      1470      1480      1490        

     1450      1460      1470      1480      1490      1500        
pF1KE2 LGSKKPQKPIPRPLNKFQGFVFDIVTRQAFDITIMVLICLNMITMMVETDDQSEEKTKIL
       ::::::::::::: :::::.:::.::::.:::.::.::::::.:::::::::..  : .:
CCDS33 LGSKKPQKPIPRPANKFQGMVFDFVTRQVFDISIMILICLNMVTMMVETDDQGKYMTLVL
     1500      1510      1520      1530      1540      1550        

     1510      1520      1530      1540      1550      1560        
pF1KE2 GKINQFFVAVFTGECVMKMFALRQYYFTNGWNVFDFIVVVLSIASLIFSAILKSLQSYF-
       ..::  :...:::: :.:. .::.:::: :::.:::.::.:::...... ..   ..:: 
CCDS33 SRINLVFIVLFTGEFVLKLVSLRHYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLAEMI---EKYFV
     1560      1570      1580      1590      1600      1610        

      1570      1580      1590      1600      1610      1620       
pF1KE2 SPTLFRVIRLARIGRILRLIRAAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYSIFGMS
       ::::::::::::::::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS33 SPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYAIFGMS
        1620      1630      1640      1650      1660      1670     

      1630      1640      1650      1660      1670      1680       
pF1KE2 SFPHVRWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLSPILNTGPPYCDPNL--PNS
       .: .:. ::::::::::.::.:::.:::::::::::::::.::::..:: :::.   :.:
CCDS33 NFAYVKKEAGIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLAPILNSAPPDCDPDTIHPGS
        1680      1690      1700      1710      1720      1730     

        1690      1700      1710      1720      1730      1740     
pF1KE2 NGTRGDCGSPAVGIIFFTTYIIISFLIVVNMYIAVILENFNVATEESTEPLSEDDFDMFY
       . ..::::.:.:::.::..:::::::.:::::::::::::.::::::.::::::::.:::
CCDS33 S-VKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFLVVVNMYIAVILENFSVATEESAEPLSEDDFEMFY
         1740      1750      1760      1770      1780      1790    

        1750      1760      1770      1780      1790      1800     
pF1KE2 ETWEKFDPEATQFITFSALSDFADTLSGPLRIPKPNRNILIQMDLPLVPGDKIHCLDILF
       :.::::::.::::: :: ::::: .:. :: : :::.  :: ::::.: ::.::::::::
CCDS33 EVWEKFDPDATQFIEFSKLSDFAAALDPPLLIAKPNKVQLIAMDLPMVSGDRIHCLDILF
         1800      1810      1820      1830      1840      1850    

        1810      1820      1830      1840      1850      1860     
pF1KE2 AFTKNVLGESGELDSLKANMEEKFMATNLSKSSYEPIATTLRWKQEDISATVIQKAYRSY
       :::: :::::::.:.:. .::..:::.: :: :::::.:::. :::..::..::. .: :
CCDS33 AFTKRVLGESGEMDALRIQMEDRFMASNPSKVSYEPITTTLKRKQEEVSAAIIQRNFRCY
         1860      1870      1880      1890      1900      1910    

        1870      1880      1890       1900      1910      1920    
pF1KE2 VLHRSMALSNTPCVPRAEEEAASLP-DEGFVAFTANENCVLPDKSETASATSFPPSYESV
       .:.. .   ..    .: .   .::  . ..    : : . :.:.. .:.:. ::::.::
CCDS33 LLKQRLKNISSNYNKEAIKGRIDLPIKQDMIIDKLNGNST-PEKTDGSSSTTSPPSYDSV
         1920      1930      1940      1950       1960      1970   

         1930      1940      1950      
pF1KE2 TRGLSDRVNMRTSSSIQNEDEATSMELIAPGP
       :.                              
CCDS33 TKPDKEKFEKDKPEKESKGKEVRENQK     
          1980      1990      2000     




1956 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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