FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2442, 1956 aa 1>>>pF1KE2442 1956 - 1956 aa - 1956 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7190+/-0.00111; mu= 13.2276+/- 0.066 mean_var=129.3274+/-26.576, 0's: 0 Z-trim(107.4): 107 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.112779 statistics sampled from 9467 (9574) to 9467 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.631), E-opt: 0.2 (0.294), width: 16 Scan time: 5.410 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS33736.1 SCN10A gene_id:6336|Hs108|chr3 (1956) 13035 2133.7 0 CCDS46799.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (2016) 6011 990.8 0 CCDS46796.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (2016) 6011 990.8 0 CCDS46797.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (2015) 6003 989.5 0 CCDS54569.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (1962) 5399 891.2 0 CCDS46440.1 SCN3A gene_id:6328|Hs108|chr2 (1951) 4732 782.7 0 CCDS54570.1 SCN5A 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CCDS46 MANFLLPRGTSSFRRFTRESLAAIEKRMAEKQARGSTTLQES-REGLPEEEAPRPQLDLQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 ACNQLPKFYGELPAELIGEPLEDLDPFYSTHRTFMVLNKGRTISRFSATRALWLFSPFNL : ..:: .::. : ::::::::::::::::..::.:::::.:: ::::: ::...:::. CCDS46 ASKKLPDLYGNPPQELIGEPLEDLDPFYSTQKTFIVLNKGKTIFRFSATNALYVLSPFHP 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 IRRTAIKVSVHSWFSLFITVTILVNCVCMTRTDLP---EKIEYVFTVIYTFEALIKILAR :::.:.:. ::: :...: :::.::: :.. : : . .::.::.:::::.:.::::: CCDS46 IRRAAVKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMAQHDPPPWTKYVEYTFTAIYTFESLVKILAR 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 GFCLNEFTYLRDPWNWLDFSVITLAYVGTAIDLRGISGLRTFRVLRALKTVSVIPGLKVI ::::. ::.::::::::::::: .:::. : : ..:.::::::::::::.:::::::.: CCDS46 GFCLHAFTFLRDPWNWLDFSVIIMAYVSENIKLGNLSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 VGALIHSVKKLADVTILTIFCLSVFALVGLQLFKGNLKNKCVKNDMAVNETTNYSSH--- :::::.:::::::: .::.::::::::.::::: :::..:::.: :.: :: : . CCDS46 VGALIQSVKKLADVMVLTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRHKCVRNFTALN-GTNGSVEADG 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 ----------RKPDIYINKRGTSDPLLCGNGSDSGHCPDGYICLKTSDNPDFNYTSFDSF :. :. : :::: :::::.::.: ::.:: :::...::: .::::::: CCDS46 LVWESLDLYLSDPENYLLKNGTSDVLLCGNSSDAGTCPEGYRCLKAGENPDHGYTSFDSF 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 AWAFLSLFRLMTQDSWERLYQQTLRTSGKIYMIFFVLVIFLGSFYLVNLILAVVTMAYEE :::::.:::::::: ::::::::::..::::::::.::::::::::::::::::.::::: CCDS46 AWAFLALFRLMTQDCWERLYQQTLRSAGKIYMIFFMLVIFLGSFYLVNLILAVVAMAYEE 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 QNQATTDEIEAKEKKFQEALEMLRKEQEVLAALGIDTTSLHSHNGSPLTSKNASERRHRI ::::: : : :::.::::.:::.::.:.:. :.::.: : . :::. :. ::: . 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pF1KE2 GEVNNLQVALARIQV---FGHRTKQALCSFFSRSCPFPQPKA---EPEL--VVKLPLSSS :.::::.:::::: : .:: .: . :. : .: : . .: . : : CCDS46 REMNNLQLALARIQRGLRFVKRTTWDFCCGLLRQRP-QKPAALAAQGQLPSCIATPYSPP 960 970 980 990 1000 1010 960 970 980 990 1000 1010 pF1KE2 KAENHIAANTARGSS--GGLQAPRG-PRDEHSDFIANPTVWVSVPIAEGESDLDDLEDD- :.. . : . . : : .: : : . : : :::: .::: :: :.: CCDS46 PPETEKVPPTRKETRFEEGEQPGQGTPGDPE------P---VCVPIAVAESDTDDQEEDE 1020 1030 1040 1050 1060 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KE2 ----GGEDAQSFQQEVIPKGQQEQLQQVERCGDHLTPRSPGTGTSSEDLAPSLGETWKDE : :. .: ::: : . . : .... . . . .: . : . . :: : CCDS46 ENSLGTEEESSKQQESQPVSGGPEAPPDSRTWSQVSATASSEAEASASQA-DWRQQWKAE 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KE2 SVPQVPAEG-VDDTSSSEGSTVDCLDPEEILRKIPELADDLEEPDDCFTEGCIRHCPCCK ::.:. : . . : :::::.: . :.:..::.:..:...:.:::::::.:.:::: CCDS46 --PQAPGCGETPEDSCSEGSTADMTNTAELLEQIPDLGQDVKDPEDCFTEGCVRRCPCCA 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KE2 LDTTKSPWDVGWQVRKTCYRIVEHSWFESFIIFMILLSSGSLAFEDYYLDQKPTVKALLE .:::..: : :..:::::.::::::::.:::::::::::.::::: ::... :.:.::: CCDS46 VDTTQAPGKVWWRLRKTCYHIVEHSWFETFIIFMILLSSGALAFEDIYLEERKTIKVLLE 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KE2 YTDRVFTFIFVFEMLLKWVAYGFKKYFTNAWCWLDFLIVNISLISLTAKILEYSEVAPIK :.:..::..::.:::::::::::::::::::::::::::..::.::.:. : ..:..::: CCDS46 YADKMFTYVFVLEMLLKWVAYGFKKYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLVANTLGFAEMGPIK 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KE2 ALRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVDALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKF .:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 SLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKF 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1310 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KE2 WRCINYTDGEFSLVPLSIVNNKSDCKIQNSTGSFFWVNVKVNFDNVAMGYLALLQVATFK :::: :.:.. : .::::::.:. : :: ..:..::::::::. :::::::::::: CCDS46 GRCINQTEGDLPL-NYTIVNNKSQCESLNLTGELYWTKVKVNFDNVGAGYLALLQVATFK 1370 1380 1390 1400 1410 1370 1380 1390 1400 1410 1420 pF1KE2 GWMDIMYAAVDSREVNMQPKWEDNVYMYLYFVIFIIFGGFFTLNLFVGVIIDNFNQQKKK ::::::::::::: . ::.:: :.:::.:::::::::.:::::::.::::::::::::: CCDS46 GWMDIMYAAVDSRGYEEQPQWEYNLYMYIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKK 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1430 1440 1450 1460 1470 1480 pF1KE2 LGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPLNKFQGFVFDIVTRQAFDITIMVLIC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::.::::.::: ::: CCDS46 LGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPLNKYQGFIFDIVTKQAFDVTIMFLIC 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1490 1500 1510 1520 1530 1540 pF1KE2 LNMITMMVETDDQSEEKTKILGKINQFFVAVFTGECVMKMFALRQYYFTNGWNVFDFIVV :::.:::::::::: :: .::.::: .:::.:::::..:. :::.:::::.::.:::.:: CCDS46 LNMVTMMVETDDQSPEKINILAKINLLFVAIFTGECIVKLAALRHYYFTNSWNIFDFVVV 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1550 1560 1570 1580 1590 1600 pF1KE2 VLSIASLIFSAILKSLQSYFSPTLFRVIRLARIGRILRLIRAAKGIRTLLFALMMSLPAL .:::.. ..: :.. . .::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::: CCDS46 ILSIVGTVLSDIIQ--KYFFSPTLFRVIRLARIGRILRLIRGAKGIRTLLFALMMSLPAL 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1610 1620 1630 1640 1650 1660 pF1KE2 FNIGLLLFLVMFIYSIFGMSSFPHVRWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLL :::::::::::::::::::..: .:.:::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 FNIGLLLFLVMFIYSIFGMANFAYVKWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLL 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1670 1680 1690 1700 1710 1720 pF1KE2 SPILNTGPPYCDPNLPNSNGTRGDCGSPAVGIIFFTTYIIISFLIVVNMYIAVILENFNV :::::::::::::.::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::::.:::::.: CCDS46 SPILNTGPPYCDPTLPNSNGSRGDCGSPAVGILFFTTYIIISFLIVVNMYIAIILENFSV 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1730 1740 1750 1760 1770 1780 pF1KE2 ATEESTEPLSEDDFDMFYETWEKFDPEATQFITFSALSDFADTLSGPLRIPKPNRNILIQ ::::::::::::::::::: :::::::::::: .:.::::::.:: :::: :::. ::. CCDS46 ATEESTEPLSEDDFDMFYEIWEKFDPEATQFIEYSVLSDFADALSEPLRIAKPNQISLIN 1780 1790 1800 1810 1820 1830 1790 1800 1810 1820 1830 1840 pF1KE2 MDLPLVPGDKIHCLDILFAFTKNVLGESGELDSLKANMEEKFMATNLSKSSYEPIATTLR ::::.: ::.:::.:::::::: :::::::.:.:: .:::::::.: :: :::::.:::: CCDS46 MDLPMVSGDRIHCMDILFAFTKRVLGESGEMDALKIQMEEKFMAANPSKISYEPITTTLR 1840 1850 1860 1870 1880 1890 1850 1860 1870 1880 1890 1900 pF1KE2 WKQEDISATVIQKAYRSYVLHRSMALSNTPCVPRA-----EEEAASLPD-EGFVAFTANE :.:..:: :::.:.: ..:.::. .. .: ::.: :. ::..:.. .: CCDS46 RKHEEVSAMVIQRAFRRHLLQRSLKHASFLFRQQAGSGLSEEDA---PEREGLIAYVMSE 1900 1910 1920 1930 1940 1950 1910 1920 1930 1940 1950 pF1KE2 NC---VLPDKSETASATSFPPSYESVTRGLSDRVNMRTSSSIQNEDEATSMELIAPGP : . : .: . :.:::::::.::::. :: ...: :. ..:: : CCDS46 NFSRPLGPPSSSSISSTSFPPSYDSVTRATSDNLQVRGSDYSHSEDLADFPPSPDRDRES 1960 1970 1980 1990 2000 2010 CCDS46 IV >>CCDS46796.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (2016 aa) initn: 6962 init1: 1963 opt: 6011 Z-score: 5282.0 bits: 990.8 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 7957; 62.7% identity (80.5% similar) in 2008 aa overlap (21-1946:21-2002) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MEFPIGSLETNNFRRFTPESLVEIEKQIAAKQ--GTKKAREKHREQKDQEEKPRPQLDLK :. :::..: :: :. .:. :: .:: :::::::. CCDS46 MANFLLPRGTSSFRRFTRESLAAIEKRMAEKQARGSTTLQES-REGLPEEEAPRPQLDLQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 ACNQLPKFYGELPAELIGEPLEDLDPFYSTHRTFMVLNKGRTISRFSATRALWLFSPFNL : ..:: .::. : ::::::::::::::::..::.:::::.:: ::::: ::...:::. CCDS46 ASKKLPDLYGNPPQELIGEPLEDLDPFYSTQKTFIVLNKGKTIFRFSATNALYVLSPFHP 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 IRRTAIKVSVHSWFSLFITVTILVNCVCMTRTDLP---EKIEYVFTVIYTFEALIKILAR :::.:.:. ::: :...: :::.::: :.. : : . .::.::.:::::.:.::::: CCDS46 IRRAAVKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMAQHDPPPWTKYVEYTFTAIYTFESLVKILAR 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 GFCLNEFTYLRDPWNWLDFSVITLAYVGTAIDLRGISGLRTFRVLRALKTVSVIPGLKVI ::::. ::.::::::::::::: .::. .:: ..:.::::::::::::.::: :::.: CCDS46 GFCLHAFTFLRDPWNWLDFSVIIMAYTTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVISGLKTI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 VGALIHSVKKLADVTILTIFCLSVFALVGLQLFKGNLKNKCVKNDMAVNETTNYSSH--- :::::.:::::::: .::.::::::::.::::: :::..:::.: :.: :: : . CCDS46 VGALIQSVKKLADVMVLTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRHKCVRNFTALN-GTNGSVEADG 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 ----------RKPDIYINKRGTSDPLLCGNGSDSGHCPDGYICLKTSDNPDFNYTSFDSF :. :. : :::: :::::.::.: ::.:: :::...::: .::::::: CCDS46 LVWESLDLYLSDPENYLLKNGTSDVLLCGNSSDAGTCPEGYRCLKAGENPDHGYTSFDSF 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 AWAFLSLFRLMTQDSWERLYQQTLRTSGKIYMIFFVLVIFLGSFYLVNLILAVVTMAYEE :::::.:::::::: ::::::::::..::::::::.::::::::::::::::::.::::: CCDS46 AWAFLALFRLMTQDCWERLYQQTLRSAGKIYMIFFMLVIFLGSFYLVNLILAVVAMAYEE 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 QNQATTDEIEAKEKKFQEALEMLRKEQEVLAALGIDTTSLHSHNGSPLTSKNASERRHRI ::::: : : :::.::::.:::.::.:.:. :.::.: : . :::. :. ::: . 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CCDS46 -PQAPGCGETPEDSCSEGSTADMTNTAELLEQIPDLGQDVKDPEDCFTEGCVRRCPCCAV 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KE2 DTTKSPWDVGWQVRKTCYRIVEHSWFESFIIFMILLSSGSLAFEDYYLDQKPTVKALLEY :::..: : :..:::::.::::::::.:::::::::::.::::: ::... :.:.:::: CCDS46 DTTQAPGKVWWRLRKTCYHIVEHSWFETFIIFMILLSSGALAFEDIYLEERKTIKVLLEY 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KE2 TDRVFTFIFVFEMLLKWVAYGFKKYFTNAWCWLDFLIVNISLISLTAKILEYSEVAPIKA .:..::..::.:::::::::::::::::::::::::::..::.::.:. : ..:..:::. 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CCDS46 NMVTMMVETDDQSPEKINILAKINLLFVAIFTGECIVKLAALRHYYFTNSWNIFDFVVVI 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1550 1560 1570 1580 1590 1600 pF1KE2 LSIASLIFSAILKSLQSYFSPTLFRVIRLARIGRILRLIRAAKGIRTLLFALMMSLPALF :::.. ..: :.. . .::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::: CCDS46 LSIVGTVLSDIIQ--KYFFSPTLFRVIRLARIGRILRLIRGAKGIRTLLFALMMSLPALF 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1610 1620 1630 1640 1650 1660 pF1KE2 NIGLLLFLVMFIYSIFGMSSFPHVRWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLS ::::::::::::::::::..: .:.::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS46 NIGLLLFLVMFIYSIFGMANFAYVKWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLS 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1670 1680 1690 1700 1710 1720 pF1KE2 PILNTGPPYCDPNLPNSNGTRGDCGSPAVGIIFFTTYIIISFLIVVNMYIAVILENFNVA ::::::::::::.::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::::.:::::.:: CCDS46 PILNTGPPYCDPTLPNSNGSRGDCGSPAVGILFFTTYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVA 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1730 1740 1750 1760 1770 1780 pF1KE2 TEESTEPLSEDDFDMFYETWEKFDPEATQFITFSALSDFADTLSGPLRIPKPNRNILIQM :::::::::::::::::: :::::::::::: .:.::::::.:: :::: :::. ::.: CCDS46 TEESTEPLSEDDFDMFYEIWEKFDPEATQFIEYSVLSDFADALSEPLRIAKPNQISLINM 1780 1790 1800 1810 1820 1830 1790 1800 1810 1820 1830 1840 pF1KE2 DLPLVPGDKIHCLDILFAFTKNVLGESGELDSLKANMEEKFMATNLSKSSYEPIATTLRW :::.: ::.:::.:::::::: :::::::.:.:: .:::::::.: :: :::::.:::: CCDS46 DLPMVSGDRIHCMDILFAFTKRVLGESGEMDALKIQMEEKFMAANPSKISYEPITTTLRR 1840 1850 1860 1870 1880 1890 1850 1860 1870 1880 1890 1900 pF1KE2 KQEDISATVIQKAYRSYVLHRSMALSNTPCVPRA-----EEEAASLPD-EGFVAFTANEN :.:..:: :::.:.: ..:.::. .. .: ::.: :. ::..:.. .:: CCDS46 KHEEVSAMVIQRAFRRHLLQRSLKHASFLFRQQAGSGLSEEDA---PEREGLIAYVMSEN 1900 1910 1920 1930 1940 1950 1910 1920 1930 1940 1950 pF1KE2 C---VLPDKSETASATSFPPSYESVTRGLSDRVNMRTSSSIQNEDEATSMELIAPGP . : .: . :.:::::::.::::. :: ...: :. ..:: : CCDS46 FSRPLGPPSSSSISSTSFPPSYDSVTRATSDNLQVRGSDYSHSEDLADFPPSPDRDRESI 1960 1970 1980 1990 2000 2010 CCDS46 V >>CCDS54569.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (1962 aa) initn: 6822 init1: 1735 opt: 5399 Z-score: 4744.0 bits: 891.2 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 7899; 62.6% identity (79.8% similar) in 2013 aa overlap (10-1946:10-1948) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MEFPIGSLETNNFRRFTPESLVEIEKQIAAKQ--GTKKAREKHREQKDQEEKPRPQLDLK :..::::: :::. :::..: :: :. .:. :: .:: :::::::. CCDS54 MANFLLPRGTSSFRRFTRESLAAIEKRMAEKQARGSTTLQES-REGLPEEEAPRPQLDLQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 ACNQLPKFYGELPAELIGEPLEDLDPFYSTHRTFMVLNKGRTISRFSATRALWLFSPFNL : ..:: .::. : ::::::::::::::::..::.:::::.:: ::::: ::...:::. CCDS54 ASKKLPDLYGNPPQELIGEPLEDLDPFYSTQKTFIVLNKGKTIFRFSATNALYVLSPFHP 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 IRRTAIKVSVHSWFSLFITVTILVNCVCMTRTDLP---EKIEYVFTVIYTFEALIKILAR :::.:.:. ::: :...: :::.::: :.. : : . .::.::.:::::.:.::::: CCDS54 IRRAAVKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMAQHDPPPWTKYVEYTFTAIYTFESLVKILAR 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 GFCLNEFTYLRDPWNWLDFSVITLAYVGTAIDLRGISGLRTFRVLRALKTVSVIPGLKVI ::::. ::.::::::::::::: .:::. : : ..:.::::::::::::.:::::::.: CCDS54 GFCLHAFTFLRDPWNWLDFSVIIMAYVSENIKLGNLSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 VGALIHSVKKLADVTILTIFCLSVFALVGLQLFKGNLKNKCVKNDMAVNETTNYSSH--- :::::.:::::::: .::.::::::::.::::: :::..:::.: :.: :: : . CCDS54 VGALIQSVKKLADVMVLTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRHKCVRNFTALN-GTNGSVEADG 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 ----------RKPDIYINKRGTSDPLLCGNGSDSGHCPDGYICLKTSDNPDFNYTSFDSF :. :. : :::: :::::.::.: ::.:: :::...::: .::::::: CCDS54 LVWESLDLYLSDPENYLLKNGTSDVLLCGNSSDAGTCPEGYRCLKAGENPDHGYTSFDSF 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 AWAFLSLFRLMTQDSWERLYQQTLRTSGKIYMIFFVLVIFLGSFYLVNLILAVVTMAYEE :::::.:::::::: ::::::::::..::::::::.::::::::::::::::::.::::: CCDS54 AWAFLALFRLMTQDCWERLYQQTLRSAGKIYMIFFMLVIFLGSFYLVNLILAVVAMAYEE 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 QNQATTDEIEAKEKKFQEALEMLRKEQEVLAALGIDTTSLHSHNGSPLTSKNASERRHRI ::::: : : :::.::::.:::.::.:.:. :.::.: : . :::. :. ::: . CCDS54 QNQATIAETEEKEKRFQEAMEMLKKEHEALTIRGVDTVSRSSLEMSPLAPVNSHERRSKR 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 pF1KE2 KPRVSEGSTE--DNKSPRSDPYN-QRRMSFLGLASG------KRRASHGSVFHFRSPGRD . :.: :. : ... :.:: . : :. :.:. : : :.:.::.: :: :: CCDS54 RKRMSSGTEECGEDRLPKSDSEDGPRAMNHLSLTRGLSRTSMKPRSSRGSIFTFRR--RD 480 490 500 510 520 530 520 530 540 550 560 pF1KE2 ISLPEGVTDD-GVFPGDHESHRGSLL----LGGGAGQQGPLPRSPLP-------QPSNPD .. .:: . :. :::. ::: : ..: : : . : . :. : CCDS54 LGSEADFADDENSTAGESESHHTSLLVPWPLRRTSAQGQPSPGTSAPGHALHGKKNSTVD 540 550 560 570 580 590 570 580 590 600 pF1KE2 SRH-------GEDEHQPPPTSELAPGAVD------VSAFDAGQKKTFLS----AEYLDEP :. : : . : : .. . . . : . . : .. ..:: CCDS54 CNGVVSLLGAGDPEATSPGSHLLRPVMLEHPPDTTTPSEEPGGPQMLTSQAPCVDGFEEP 600 610 620 630 640 650 610 620 630 640 650 660 pF1KE2 FRAQRAMSVVSIITSVLEELEESEQKCPPCLTSLSQKYLIWDCCPMWVKLKTILFGLVTD :::.:.::..::.:::::::..::::: . :.:.::::.:::.:...: . .: : CCDS54 GARQRALSAVSVLTSALEELEESRHKCPPCWNRLAQRYLIWECCPLWMSIKQGVKLVVMD 660 670 680 690 700 710 670 680 690 700 710 720 pF1KE2 PFAELTITLCIVVNTIFMAMEHHGMSPTFEAMLQIGNIVFTIFFTAEMVFKIIAFDPYYY ::..::::.:::.::.:::.::..:. :: :::.::.::: .:::::.:::::.::::: CCDS54 PFTDLTITMCIVLNTLFMALEHYNMTSEFEEMLQVGNLVFTGIFTAEMTFKIIALDPYYY 720 730 740 750 760 770 730 740 750 760 770 780 pF1KE2 FQKKWNIFDCIIVTVSLLELGVAKKGSLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSV ::. ::::: ::: .::.:::... ..::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 FQQGWNIFDSIIVILSLMELGLSRMSNLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSV 780 790 800 810 820 830 790 800 810 820 830 840 pF1KE2 GALGNLTIILAIIVFVFALVGKQLLGENYRNNRKNISAPHEDWPRWHMHDFFHSFLIVFR :::::::..::::::.::.:: ::.:.:: . : . :. ::::: ::::.:::.:: CCDS54 GALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKNYSELRDSDSG---LLPRWHMMDFFHAFLIIFR 840 850 860 870 880 890 850 860 870 880 890 900 pF1KE2 ILCGEWIENMWACMEVGQKSICLILFLTVMVLGNLVVLNLFIALLLNSFSADNLTAPEDD ::::::::.:: ::::. .:.::..:: :::.:::::::::.::::.::::::::::..: CCDS54 ILCGEWIETMWDCMEVSGQSLCLLVFLLVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLTAPDED 900 910 920 930 940 950 910 920 930 940 950 pF1KE2 GEVNNLQVALARIQV---FGHRTKQALCSFFSRSCPFPQPKA---EPEL--VVKLPLSSS :.::::.:::::: : .:: .: . :. : .: : . .: . : : CCDS54 REMNNLQLALARIQRGLRFVKRTTWDFCCGLLRQRP-QKPAALAAQGQLPSCIATPYSPP 960 970 980 990 1000 1010 960 970 980 990 1000 1010 pF1KE2 KAENHIAANTARGSS--GGLQAPRG-PRDEHSDFIANPTVWVSVPIAEGESDLDDLEDDG :.. . : . . : : .: : : . : : :::: .::: :: :.: CCDS54 PPETEKVPPTRKETRFEEGEQPGQGTPGDPE------P---VCVPIAVAESDTDDQEED- 1020 1030 1040 1050 1060 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KE2 GEDAQSFQQEVIPKGQQEQLQQVERCGDHLTPRSPGTGTSSEDLAPSLGETWKDESVPQV .:. ::: ..:: :. CCDS54 ----------------EEN---------------------------SLGT--EEESSKQT 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KE2 PAEGVDDTSSSEGSTVDCLDPEEILRKIPELADDLEEPDDCFTEGCIRHCPCCKLDTTKS : . : :::::.: . :.:..::.:..:...:.:::::::.:.:::: .:::.. CCDS54 PED-----SCSEGSTADMTNTAELLEQIPDLGQDVKDPEDCFTEGCVRRCPCCAVDTTQA 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KE2 PWDVGWQVRKTCYRIVEHSWFESFIIFMILLSSGSLAFEDYYLDQKPTVKALLEYTDRVF : : :..:::::.::::::::.:::::::::::.::::: ::... :.:.::::.:..: CCDS54 PGKVWWRLRKTCYHIVEHSWFETFIIFMILLSSGALAFEDIYLEERKTIKVLLEYADKMF 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KE2 TFIFVFEMLLKWVAYGFKKYFTNAWCWLDFLIVNISLISLTAKILEYSEVAPIKALRTLR :..::.:::::::::::::::::::::::::::..::.::.:. : ..:..:::.::::: CCDS54 TYVFVLEMLLKWVAYGFKKYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLVANTLGFAEMGPIKSLRTLR 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KE2 ALRPLRALSRFEGMRVVVDALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFWRCINY ::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::: CCDS54 ALRPLRALSRFEGMRVVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFGRCINQ 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 pF1KE2 TDGEFSLVPLSIVNNKSDCKIQNSTGSFFWVNVKVNFDNVAMGYLALLQVATFKGWMDIM :.:.. : .::::::.:. : :: ..:..::::::::. :::::::::::::::::: CCDS54 TEGDLPL-NYTIVNNKSQCESLNLTGELYWTKVKVNFDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIM 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 pF1KE2 YAAVDSREVNMQPKWEDNVYMYLYFVIFIIFGGFFTLNLFVGVIIDNFNQQKKKLGGQDI ::::::: . ::.:: :.:::.:::::::::.:::::::.::::::::::::::::::: CCDS54 YAAVDSRGYEEQPQWEYNLYMYIYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKLGGQDI 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 pF1KE2 FMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPLNKFQGFVFDIVTRQAFDITIMVLICLNMITM :::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::.::::.::: ::::::.:: CCDS54 FMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPLNKYQGFIFDIVTKQAFDVTIMFLICLNMVTM 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1550 pF1KE2 MVETDDQSEEKTKILGKINQFFVAVFTGECVMKMFALRQYYFTNGWNVFDFIVVVLSIAS :::::::: :: .::.::: .:::.:::::..:. :::.:::::.::.:::.::.:::.. CCDS54 MVETDDQSPEKINILAKINLLFVAIFTGECIVKLAALRHYYFTNSWNIFDFVVVILSIVG 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1610 pF1KE2 LIFSAILKSLQSYFSPTLFRVIRLARIGRILRLIRAAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLL ..: :.. . .::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::: CCDS54 TVLSDIIQ--KYFFSPTLFRVIRLARIGRILRLIRGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLL 1560 1570 1580 1590 1600 1620 1630 1640 1650 1660 1670 pF1KE2 LFLVMFIYSIFGMSSFPHVRWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLSPILNT :::::::::::::..: .:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 LFLVMFIYSIFGMANFAYVKWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLSPILNT 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1680 1690 1700 1710 1720 1730 pF1KE2 GPPYCDPNLPNSNGTRGDCGSPAVGIIFFTTYIIISFLIVVNMYIAVILENFNVATEEST :::::::.::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::::.:::::.::::::: CCDS54 GPPYCDPTLPNSNGSRGDCGSPAVGILFFTTYIIISFLIVVNMYIAIILENFSVATEEST 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1740 1750 1760 1770 1780 1790 pF1KE2 EPLSEDDFDMFYETWEKFDPEATQFITFSALSDFADTLSGPLRIPKPNRNILIQMDLPLV ::::::::::::: :::::::::::: .:.::::::.:: :::: :::. ::.::::.: CCDS54 EPLSEDDFDMFYEIWEKFDPEATQFIEYSVLSDFADALSEPLRIAKPNQISLINMDLPMV 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1800 1810 1820 1830 1840 1850 pF1KE2 PGDKIHCLDILFAFTKNVLGESGELDSLKANMEEKFMATNLSKSSYEPIATTLRWKQEDI ::.:::.:::::::: :::::::.:.:: .:::::::.: :: :::::.:::: :.:.. CCDS54 SGDRIHCMDILFAFTKRVLGESGEMDALKIQMEEKFMAANPSKISYEPITTTLRRKHEEV 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1860 1870 1880 1890 1900 pF1KE2 SATVIQKAYRSYVLHRSMALSNTPCVPRA-----EEEAASLPD-EGFVAFTANENC---V :: :::.:.: ..:.::. .. .: ::.: :. ::..:.. .:: . CCDS54 SAMVIQRAFRRHLLQRSLKHASFLFRQQAGSGLSEEDA---PEREGLIAYVMSENFSRPL 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1930 1940 1950 pF1KE2 LPDKSETASATSFPPSYESVTRGLSDRVNMRTSSSIQNEDEATSMELIAPGP : .: . :.:::::::.::::. :: ...: :. ..:: : CCDS54 GPPSSSSISSTSFPPSYDSVTRATSDNLQVRGSDYSHSEDLADFPPSPDRDRESIV 1910 1920 1930 1940 1950 1960 >>CCDS46440.1 SCN3A gene_id:6328|Hs108|chr2 (1951 aa) initn: 6361 init1: 1165 opt: 4732 Z-score: 4157.5 bits: 782.7 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 7054; 56.8% identity (77.9% similar) in 2009 aa overlap (12-1926:13-1926) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MEFPIGSLETNNFRRFTPESLVEIEKQIAAKQGTKKAREKHREQKDQEEKPRPQLDLKA .:: :: :::. :::. : ... : .:. ..:.:.::.:. ::.: CCDS46 MAQALLVPPGPESFRLFTRESLAAIEKRAAEEKAKKPKKEQ---DNDDENKPKPNSDLEA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 CNQLPKFYGELPAELIGEPLEDLDPFYSTHRTFMVLNKGRTISRFSATRALWLFSPFNLI ..:: .::..: :...::::::::.: ...::.:.:::..: ::::: ::....:.: . CCDS46 GKNLPFIYGDIPPEMVSEPLEDLDPYYINKKTFIVMNKGKAIFRFSATSALYILTPLNPV 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 RRTAIKVSVHSWFSLFITVTILVNCVCMTRTDLPE---KIEYVFTVIYTFEALIKILARG :. :::. ::: ::..: :::.::: :: .. :. ..::.:: :::::.:::::::: CCDS46 RKIAIKILVHSLFSMLIMCTILTNCVFMTLSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKILARG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 FCLNEFTYLRDPWNWLDFSVITLAYVGTAIDLRGISGLRTFRVLRALKTVSVIPGLKVIV :::..::.:::::::::::::..::: ..: ..:.::::::::::::.:::::::.:: CCDS46 FCLEDFTFLRDPWNWLDFSVIVMAYVTEFVSLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIV 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 GALIHSVKKLADVTILTIFCLSVFALVGLQLFKGNLKNKCVK---NDMAVN-ETTNY--S ::::.:::::.:: :::.::::::::.::::: :::.:::.. .: : . .::.: . CCDS46 GALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCLQWPPSDSAFETNTTSYFNG 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 SHRKPDIYINKR--------------------GTSDPLLCGNGSDSGHCPDGYICLKTSD . . ..: : .::::::::::.:.::.::::.:.. CCDS46 TMDSNGTFVNVTMSTFNWKDYIGDDSHFYVLDGQKDPLLCGNGSDAGQCPEGYICVKAGR 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 NPDFNYTSFDSFAWAFLSLFRLMTQDSWERLYQQTLRTSGKIYMIFFVLVIFLGSFYLVN ::...:::::.:.::::::::::::: :: ::: :::..:: :::::::::::::::::: CCDS46 NPNYGYTSFDTFSWAFLSLFRLMTQDYWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFLGSFYLVN 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 440 pF1KE2 LILAVVTMAYEEQNQATTDEIEAKEKKFQEALEMLRKEQEVLAALGIDTTSLHSHNG--- ::::::.:::::::::: .: : :: .::. ::.:.:.:: :.. ... .. .: CCDS46 LILAVVAMAYEEQNQATLEEAEQKEAEFQQMLEQLKKQQEEAQAVAAASAASRDFSGIGG 420 430 440 450 460 470 450 460 470 480 pF1KE2 -----------SPLTSKNASERRHRIKPRVS----EGSTEDNKS--PRSDPYNQ-RRMSF : :.::.:.: :.: : : . ::... ... :.:. .. .: :: CCDS46 LGELLESSSEASKLSSKSAKEWRNRRKKRRQREHLEGNNKGERDSFPKSESEDSVKRSSF 480 490 500 510 520 530 490 500 510 520 pF1KE2 L----G--LASGK-------------------RRASHGSVFHFRSPGRDISLPEGVTDD- : : :.: : :: :. :.: ::. ..:.. . .:: CCDS46 LFSMDGNRLTSDKKFCSPHQSLLSIRGSLFSPRRNSKTSIFSFRGRAKDVGSENDFADDE 540 550 560 570 580 590 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 -GVFPGDHESHRGSLLLGGGAGQQGPLPRSPLPQPSNPDSRHGEDEHQPPPTSELAPGAV ..: : ::.: ::.. :. :::: ... :.: CCDS46 HSTFE-DSESRRDSLFV---------------PH------RHGERRNSNGTTTETEVRKR 600 610 620 630 590 600 610 620 630 640 pF1KE2 DVSAFDAGQKKTFLSAEYLDEPFRAQRAMSVVSIITSVLEELEESEQKCPPCLTSLSQKY .:... .: :.:.. :::.:..::.:...::::::.:::::: ... . CCDS46 RLSSYQ-------ISMEMLEDSSGRQRAVSIASILTNTMEELEESRQKCPPCWYRFANVF 640 650 660 670 680 650 660 670 680 690 700 pF1KE2 LIWDCCPMWVKLKTILFGLVTDPFAELTITLCIVVNTIFMAMEHHGMSPTFEAMLQIGNI :::::: :.:.: .. .: :::..:.::.:::.::.::::::. :. : ..: .::. CCDS46 LIWDCCDAWLKVKHLVNLIVMDPFVDLAITICIVLNTLFMAMEHYPMTEQFSSVLTVGNL 690 700 710 720 730 740 710 720 730 740 750 760 pF1KE2 VFTIFFTAEMVFKIIAFDPYYYFQKKWNIFDCIIVTVSLLELGVAKKGSLSVLRSFRLLR ::: .::::::.::::.:::::::. ::::: :::..::.:::... .::::::::::: CCDS46 VFTGIFTAEMVLKIIAMDPYYYFQEGWNIFDGIIVSLSLMELGLSNVEGLSVLRSFRLLR 750 760 770 780 790 800 770 780 790 800 810 820 pF1KE2 VFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSVGALGNLTIILAIIVFVFALVGKQLLGENYRNNRKNISA :::::::::::: ::::::::::::::::..::::::.::.:: ::.:..:.. .:. CCDS46 VFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKSYKECVCKIN- 810 820 830 840 850 860 830 840 850 860 870 880 pF1KE2 PHEDWPRWHMHDFFHSFLIVFRILCGEWIENMWACMEVGQKSICLILFLTVMVLGNLVVL :::::.:::::::::::.:::::::.:: ::::. ...:::.:. :::.:::::: CCDS46 DDCTLPRWHMNDFFHSFLIVFRVLCGEWIETMWDCMEVAGQTMCLIVFMLVMVIGNLVVL 870 880 890 900 910 920 890 900 910 920 930 940 pF1KE2 NLFIALLLNSFSADNLTAPEDDGEVNNLQVALARIQVFGHRTKQALCSFFSRSCPFPQPK :::.::::.:::.:::.: .::.:.::::.:..:.: .:. . :... : .:: CCDS46 NLFLALLLSSFSSDNLAATDDDNEMNNLQIAVGRMQKGIDYVKNKMRECFQKAF-FRKPK 930 940 950 960 970 980 950 960 970 980 pF1KE2 A---------EPELVVKLPLSSSKAENHI--AANTARGSSGGLQAPRGPRDEHS--DFIA . . . . . :: :.. . .:. : . : .. . ::.. .:: CCDS46 VIEIHEGNKIDSCMSNNTGIEISKELNYLRDGNGTTSGVGTGSSVEKYVIDENDYMSFIN 990 1000 1010 1020 1030 1040 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE2 NPTVWVSVPIAEGESDLDDLEDDGGEDAQSFQQEVIPKGQQEQLQQVERCGDHLTPRSPG ::.. :.:::: ::::...: ... :..: .:.. CCDS46 NPSLTVTVPIAVGESDFENL------NTEEFSSE-------SELEE-------------- 1050 1060 1070 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KE2 TGTSSEDLAPSLGETWKDESVPQVPAEGVDDTSSSEGSTVDCLDPEEILRKIPELADDLE :.: : . :::::::::: . :.: . : .::. CCDS46 ---SKEKL---------------------NATSSSEGSTVDVVLPREGEQAETEPEEDLK 1080 1090 1100 1110 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KE2 EPDDCFTEGCIRHCPCCKLDTTKSPWDVGWQVRKTCYRIVEHSWFESFIIFMILLSSGSL :. :::::::.. : :...: .. . :..::::: ::::.:::.::.::::::::.: CCDS46 -PEACFTEGCIKKFPFCQVSTEEGKGKIWWNLRKTCYSIVEHNWFETFIVFMILLSSGAL 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KE2 AFEDYYLDQKPTVKALLEYTDRVFTFIFVFEMLLKWVAYGFKKYFTNAWCWLDFLIVNIS :::: :..:. :.:..:::.:.:::.::..:::::::::::. ::::::::::::::..: CCDS46 AFEDIYIEQRKTIKTMLEYADKVFTYIFILEMLLKWVAYGFQTYFTNAWCWLDFLIVDVS 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1230 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KE2 LISLTAKILEYSEVAPIKALRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVDALVGAIPSIMNVLLVCL :.::.:. : :::.. ::.:::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::: CCDS46 LVSLVANALGYSELGAIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALVGAIPSIMNVLLVCL 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1290 1300 1310 1320 1330 1340 pF1KE2 IFWLIFSIMGVNLFAGKFWRCINYTDGEFSLVPLSIVNNKSDCKIQNSTGSFFWVNVKVN ::::::::::::::::::..:.:.: : .. .: ::: :::. .. . : ::::: CCDS46 IFWLIFSIMGVNLFAGKFYHCVNMTTG--NMFDISDVNNLSDCQALGKQAR--WKNVKVN 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1350 1360 1370 1380 1390 1400 pF1KE2 FDNVAMGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSREVNMQPKWEDNVYMYLYFVIFIIFGGFFT ::::. :::::::::::::::::::::::::.:..:: .:.:.:::::::::::::.::: CCDS46 FDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSRDVKLQPVYEENLYMYLYFVIFIIFGSFFT 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1410 1420 1430 1440 1450 1460 pF1KE2 LNLFVGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPLNKFQGFV ::::.:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::.: CCDS46 LNLFIGVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPANKFQGMV 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1470 1480 1490 1500 1510 1520 pF1KE2 FDIVTRQAFDITIMVLICLNMITMMVETDDQSEEKTKILGKINQFFVAVFTGECVMKMFA ::.::::.:::.::.::::::.:::::::::.. : .:..:: :...:::: :.:. . CCDS46 FDFVTRQVFDISIMILICLNMVTMMVETDDQGKYMTLVLSRINLVFIVLFTGEFVLKLVS 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1530 1540 1550 1560 1570 1580 pF1KE2 LRQYYFTNGWNVFDFIVVVLSIASLIFSAILKSLQSYF-SPTLFRVIRLARIGRILRLIR ::.:::: :::.:::.::.:::...... . ...:: ::::::::::::::::::::. CCDS46 LRHYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLAEM---IEKYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLIK 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1640 pF1KE2 AAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYSIFGMSSFPHVRWEAGIDDMFNFQTFA .::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::.: .:. ::::::::::.::. CCDS46 GAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYAIFGMSNFAYVKKEAGIDDMFNFETFG 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1700 pF1KE2 NSMLCLFQITTSAGWDGLLSPILNTGPPYCDPNL--PNSNGTRGDCGSPAVGIIFFTTYI :::.:::::::::::::::.::::..:: :::. :.:. ..::::.:.:::.::..:: CCDS46 NSMICLFQITTSAGWDGLLAPILNSAPPDCDPDTIHPGSS-VKGDCGNPSVGIFFFVSYI 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1760 pF1KE2 IISFLIVVNMYIAVILENFNVATEESTEPLSEDDFDMFYETWEKFDPEATQFITFSALSD :::::.:::::::::::::.::::::.::::::::.::::.::::::.::::: :: ::: CCDS46 IISFLVVVNMYIAVILENFSVATEESAEPLSEDDFEMFYEVWEKFDPDATQFIEFSKLSD 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1810 1820 pF1KE2 FADTLSGPLRIPKPNRNILIQMDLPLVPGDKIHCLDILFAFTKNVLGESGELDSLKANME :: .:. :: : :::. :: ::::.: ::.:::::::::::: :::::::.:.:. .:: CCDS46 FAAALDPPLLIAKPNKVQLIAMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGESGEMDALRIQME 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1870 1880 pF1KE2 EKFMATNLSKSSYEPIATTLRWKQEDISATVIQKAYRSYVLHRSMALSNTPCVPRAEEEA ..:::.: :: :::::.:::. :::..::..::. .: :.:.. . .. .: . CCDS46 DRFMASNPSKVSYEPITTTLKRKQEEVSAAIIQRNFRCYLLKQRLKNISSNYNKEAIKGR 1830 1840 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1930 1940 pF1KE2 ASLP-DEGFVAFTANENCVLPDKSETASATSFPPSYESVTRGLSDRVNMRTSSSIQNEDE .:: . .. : : . :.:.. .:.:. ::::.:::. CCDS46 IDLPIKQDMIIDKLNGNST-PEKTDGSSSTTSPPSYDSVTKPDKEKFEKDKPEKESKGKE 1890 1900 1910 1920 1930 1940 1950 pF1KE2 ATSMELIAPGP CCDS46 VRENQK 1950 >>CCDS54570.1 SCN5A gene_id:6331|Hs108|chr3 (1983 aa) initn: 6516 init1: 2162 opt: 3990 Z-score: 3504.9 bits: 662.0 E(32554): 6.6e-189 Smith-Waterman score: 7718; 61.7% identity (79.0% similar) in 2007 aa overlap (21-1946:21-1969) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MEFPIGSLETNNFRRFTPESLVEIEKQIAAKQ--GTKKAREKHREQKDQEEKPRPQLDLK :. :::..: :: :. .:. :: .:: :::::::. CCDS54 MANFLLPRGTSSFRRFTRESLAAIEKRMAEKQARGSTTLQES-REGLPEEEAPRPQLDLQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 ACNQLPKFYGELPAELIGEPLEDLDPFYSTHRTFMVLNKGRTISRFSATRALWLFSPFNL : ..:: .::. : ::::::::::::::::..::.:::::.:: ::::: ::...:::. CCDS54 ASKKLPDLYGNPPQELIGEPLEDLDPFYSTQKTFIVLNKGKTIFRFSATNALYVLSPFHP 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 IRRTAIKVSVHSWFSLFITVTILVNCVCMTRTDLP---EKIEYVFTVIYTFEALIKILAR :::.:.:. ::: :...: :::.::: :.. : : . .::.::.:::::.:.::::: CCDS54 IRRAAVKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMAQHDPPPWTKYVEYTFTAIYTFESLVKILAR 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 GFCLNEFTYLRDPWNWLDFSVITLAYVGTAIDLRGISGLRTFRVLRALKTVSVIPGLKVI ::::. ::.::::::::::::: .:::. : : ..:.::::::::::::.:::::::.: CCDS54 GFCLHAFTFLRDPWNWLDFSVIIMAYVSENIKLGNLSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 VGALIHSVKKLADVTILTIFCLSVFALVGLQLFKGNLKNKCVKNDMAVNETTNYSSH--- :::::.:::::::: .::.::::::::.::::: :::..:::.: :.: :: : . CCDS54 VGALIQSVKKLADVMVLTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRHKCVRNFTALN-GTNGSVEADG 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 ----------RKPDIYINKRGTSDPLLCGNGSDSGHCPDGYICLKTSDNPDFNYTSFDSF :. :. : :::: :::::.::.: ::.:: :::...::: .::::::: CCDS54 LVWESLDLYLSDPENYLLKNGTSDVLLCGNSSDAGTCPEGYRCLKAGENPDHGYTSFDSF 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 AWAFLSLFRLMTQDSWERLYQQTLRTSGKIYMIFFVLVIFLGSFYLVNLILAVVTMAYEE :::::.:::::::: ::::::::::..::::::::.::::::::::::::::::.::::: CCDS54 AWAFLALFRLMTQDCWERLYQQTLRSAGKIYMIFFMLVIFLGSFYLVNLILAVVAMAYEE 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 QNQATTDEIEAKEKKFQEALEMLRKEQEVLAALGIDTTSLHSHNGSPLTSKNASERRHRI ::::: : : :::.::::.:::.::.:.:. :.::.: : . :::. :. ::: . CCDS54 QNQATIAETEEKEKRFQEAMEMLKKEHEALTIRGVDTVSRSSLEMSPLAPVNSHERRSKR 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 pF1KE2 KPRVSEGSTE--DNKSPRSDPYN-QRRMSFLGLASG------KRRASHGSVFHFRSPGRD . :.: :. : ... :.:: . : :. :.:. : : :.:.::.: :: :: CCDS54 RKRMSSGTEECGEDRLPKSDSEDGPRAMNHLSLTRGLSRTSMKPRSSRGSIFTFRR--RD 480 490 500 510 520 530 520 530 540 550 560 pF1KE2 ISLPEGVTDD-GVFPGDHESHRGSLL----LGGGAGQQGPLPRSPLP-------QPSNPD .. .:: . :. :::. ::: : ..: : : . : . :. : CCDS54 LGSEADFADDENSTAGESESHHTSLLVPWPLRRTSAQGQPSPGTSAPGHALHGKKNSTVD 540 550 560 570 580 590 570 580 590 600 pF1KE2 SRH-------GEDEHQPPPTSELAPGAVD------VSAFDAGQKKTFLS----AEYLDEP :. : : . : : .. . . . : . . : .. ..:: CCDS54 CNGVVSLLGAGDPEATSPGSHLLRPVMLEHPPDTTTPSEEPGGPQMLTSQAPCVDGFEEP 600 610 620 630 640 650 610 620 630 640 650 660 pF1KE2 FRAQRAMSVVSIITSVLEELEESEQKCPPCLTSLSQKYLIWDCCPMWVKLKTILFGLVTD :::.:.::..::.:::::::..::::: . :.:.::::.:::.:...: . .: : CCDS54 GARQRALSAVSVLTSALEELEESRHKCPPCWNRLAQRYLIWECCPLWMSIKQGVKLVVMD 660 670 680 690 700 710 670 680 690 700 710 720 pF1KE2 PFAELTITLCIVVNTIFMAMEHHGMSPTFEAMLQIGNIVFTIFFTAEMVFKIIAFDPYYY ::..::::.:::.::.:::.::..:. :: :::.::.::: .:::::.:::::.::::: CCDS54 PFTDLTITMCIVLNTLFMALEHYNMTSEFEEMLQVGNLVFTGIFTAEMTFKIIALDPYYY 720 730 740 750 760 770 730 740 750 760 770 780 pF1KE2 FQKKWNIFDCIIVTVSLLELGVAKKGSLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSV ::. ::::: ::: .::.:::... ..::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS54 FQQGWNIFDSIIVILSLMELGLSRMSNLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSV 780 790 800 810 820 830 790 800 810 820 830 840 pF1KE2 GALGNLTIILAIIVFVFALVGKQLLGENYRNNRKNISAPHEDWPRWHMHDFFHSFLIVFR :::::::..::::::.::.:: ::.:.:: . : . :. ::::: ::::.:::.:: CCDS54 GALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKNYSELRDSDSGL---LPRWHMMDFFHAFLIIFR 840 850 860 870 880 890 850 860 870 880 890 900 pF1KE2 ILCGEWIENMWACMEVGQKSICLILFLTVMVLGNLVVLNLFIALLLNSFSADNLTAPEDD ::::::::.:: ::::. .:.::..:: :::.:::::::::.::::.::::::::::..: CCDS54 ILCGEWIETMWDCMEVSGQSLCLLVFLLVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSADNLTAPDED 900 910 920 930 940 950 910 920 930 940 950 pF1KE2 GEVNNLQVALARIQV---FGHRTKQALCSFFSRSCPFPQPKA---EPEL--VVKLPLSSS :.::::.:::::: : .:: .: . :. : .: : . .: . : : CCDS54 REMNNLQLALARIQRGLRFVKRTTWDFCCGLLRQRP-QKPAALAAQGQLPSCIATPYSPP 960 970 980 990 1000 1010 960 970 980 990 1000 1010 pF1KE2 KAENHIAANTARGSS--GGLQAPRG-PRDEHSDFIANPTVWVSVPIAEGESDLDDLEDDG :.. . : . . : : .: : : . : : :::: .::: :: :.: CCDS54 PPETEKVPPTRKETRFEEGEQPGQGTPGDPE------P---VCVPIAVAESDTDDQEEDE 1020 1030 1040 1050 1060 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KE2 ----GEDAQSFQQEVIPKGQQEQLQQVERCGDHLTPRSPGTGTSSEDLAPSLGETWKDES : . .: .:: : . . : .... . . . .: . : . . :: : CCDS54 ENSLGTEEESSKQESQPVSGGPEAPPDSRTWSQVSATASSEAEASASQA-DWRQQWKAE- 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KE2 VPQVPAEG-VDDTSSSEGSTVDCLDPEEILRKIPELADDLEEPDDCFTEGCIRHCPCCKL ::.:. : . . : :::::.: . :.:..::.:..:...:.:::::::.:.:::: . CCDS54 -PQAPGCGETPEDSCSEGSTADMTNTAELLEQIPDLGQDVKDPEDCFTEGCVRRCPCCAV 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KE2 DTTKSPWDVGWQVRKTCYRIVEHSWFESFIIFMILLSSGSLAFEDYYLDQKPTVKALLEY :::..: : :..:::::.::::::::.:::::::::::.::::: ::... :.:.:::: CCDS54 DTTQAPGKVWWRLRKTCYHIVEHSWFETFIIFMILLSSGALAFEDIYLEERKTIKVLLEY 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KE2 TDRVFTFIFVFEMLLKWVAYGFKKYFTNAWCWLDFLIVNISLISLTAKILEYSEVAPIKA .:..::..::.:::::::::::::::::::::::::::..::.::.:. : ..:..:::. 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CCDS33 GALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCLQWPPDNSSFEINITSFFNN 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 pF1KE2 ----NYSSHRKP------DIYINKR-------GTSDPLLCGNGSDSGHCPDGYICLKTSD : .. . : ::. . : .: :::::.::.:.::.::::.:.. 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CCDS33 HSTFE-DNDSRRDSLFVPHRHGERRHSNVSQASRASRVLPILPMNGKMHSAVDCNGVVSL 600 610 620 630 640 650 580 590 600 610 620 pF1KE2 --PPPT----SELAP-GAVDVSAFDAGQKKTF-LSAEYLDEPFRAQRAMSVVSIITSVLE : : ..: : :.. . . ..... .: . :..: :::::..::.:...: CCDS33 VGGPSTLTSAGQLLPEGTTTETEIRKRRSSSYHVSMDLLEDPTSRQRAMSIASILTNTME 660 670 680 690 700 710 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 ELEESEQKCPPCLTSLSQKYLIWDCCPMWVKLKTILFGLVTDPFAELTITLCIVVNTIFM :::::.:::::: .... :::::: :.:.: .. .: :::..:.::.:::.::.:: CCDS33 ELEESRQKCPPCWYKFANMCLIWDCCKPWLKVKHLVNLVVMDPFVDLAITICIVLNTLFM 720 730 740 750 760 770 690 700 710 720 730 740 pF1KE2 AMEHHGMSPTFEAMLQIGNIVFTIFFTAEMVFKIIAFDPYYYFQKKWNIFDCIIVTVSLL ::::. :. : ..:..::.::: .::::: .::::.:::::::. ::::: .::..::. 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CCDS33 FVKRKIREFIQKAFVRKQ-KALDEIKPLEDLNNKKDSCISNHTTIEIGKDLNYLKDGNGT 1020 1030 1040 1050 1060 1070 980 990 1000 1010 1020 pF1KE2 SGGL--QAPRGPRDE--HSDFIANPTVWVSVPIAEGESDLDDLEDDGGEDAQSFQQEVIP ..:. .. . :: . .:: ::.. :.:::: ::::...: ... :..: CCDS33 TSGIGSSVEKYVVDESDYMSFINNPSLTVTVPIAVGESDFENL------NTEEFSSE--- 1080 1090 1100 1110 1120 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KE2 KGQQEQLQQVERCGDHLTPRSPGTGTSSEDLAPSLGETWKDESVPQVPAEGVDDTSSSEG :. : : .. :::::: CCDS33 ----------------------------SDMEES--------------KEKLNATSSSEG 1130 1140 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KE2 STVDCLDPEEILRKIPELA-DDLEEPDDCFTEGCIRHCPCCKLDTTKSPWDVGWQVRKTC :::: : : . ::. .. ::. :::: :.:. ::... .. . :..:::: CCDS33 STVDIGAPAE--GEQPEVEPEESLEPEACFTEDCVRKFKCCQISIEEGKGKLWWNLRKTC 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KE2 YRIVEHSWFESFIIFMILLSSGSLAFEDYYLDQKPTVKALLEYTDRVFTFIFVFEMLLKW :.::::.:::.::.::::::::.::::: :..:. :.:..:::.:.:::.::..:::::: CCDS33 YKIVEHNWFETFIVFMILLSSGALAFEDIYIEQRKTIKTMLEYADKVFTYIFILEMLLKW 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KE2 VAYGFKKYFTNAWCWLDFLIVNISLISLTAKILEYSEVAPIKALRTLRALRPLRALSRFE :::::. ::::::::::::::..::.::::. : :::.. ::.::::::::::::::::: CCDS33 VAYGFQVYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLTANALGYSELGAIKSLRTLRALRPLRALSRFE 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KE2 GMRVVVDALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFWRCINYTDGEFSLVPLSI ::::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::..::::: :: . .:. 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CCDS33 TNILYWINLVFIVLFTGECVLKLISLRYYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLAELI---E 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1570 1580 1590 1600 1610 1620 pF1KE2 SYF-SPTLFRVIRLARIGRILRLIRAAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYSI .:: ::::::::::::::::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::.: CCDS33 KYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYAI 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1630 1640 1650 1660 1670 1680 pF1KE2 FGMSSFPHVRWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLSPILNTGPPYCDPNL- ::::.: .:. :.::::::::.::.:::.:::::::::::::::.::::.::: :::. CCDS33 FGMSNFAYVKREVGIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLAPILNSGPPDCDPDKD 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1690 1700 1710 1720 1730 1740 pF1KE2 -PNSNGTRGDCGSPAVGIIFFTTYIIISFLIVVNMYIAVILENFNVATEESTEPLSEDDF :.:. ..::::.:.:::.::..:::::::.:::::::::::::.::::::.:::::::: CCDS33 HPGSS-VKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFLVVVNMYIAVILENFSVATEESAEPLSEDDF 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1750 1760 1770 1780 1790 1800 pF1KE2 DMFYETWEKFDPEATQFITFSALSDFADTLSGPLRIPKPNRNILIQMDLPLVPGDKIHCL .::::.::::::.::::: :. ::::::.:. :: : :::. :: ::::.: ::.:::: CCDS33 EMFYEVWEKFDPDATQFIEFAKLSDFADALDPPLLIAKPNKVQLIAMDLPMVSGDRIHCL 1800 1810 1820 1830 1840 1850 1810 1820 1830 1840 1850 1860 pF1KE2 DILFAFTKNVLGESGELDSLKANMEEKFMATNLSKSSYEPIATTLRWKQEDISATVIQKA :::::::: :::::::.:.:. .:::.:::.: :: :::::.:::. :::..:: .::.: CCDS33 DILFAFTKRVLGESGEMDALRIQMEERFMASNPSKVSYEPITTTLKRKQEEVSAIIIQRA 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1870 1880 1890 1900 1910 1920 pF1KE2 YRSYVLHRSMA-LSNTPCVPRAEEEAASLPDEGFVAFTANENCVLPDKSETASATSFPPS :: :.:.... .:. ...: .. : . ::: . :.:.. . .:. ::: CCDS33 YRRYLLKQKVKKVSSIYKKDKGKECDGTPIKEDTLIDKLNENST-PEKTDMTPSTTSPPS 1920 1930 1940 1950 1960 1970 1930 1940 1950 pF1KE2 YESVTRGLSDRVNMRTSSSIQNEDEATSMELIAPGP :.:::. ... . : ..::.. .. CCDS33 YDSVTKPEKEKFEKDKS---EKEDKGKDIRESKK 1980 1990 2000 >>CCDS33314.1 SCN2A gene_id:6326|Hs108|chr2 (2005 aa) initn: 6555 init1: 1197 opt: 3986 Z-score: 3501.3 bits: 661.3 E(32554): 1e-188 Smith-Waterman score: 7058; 56.2% identity (77.1% similar) in 2045 aa overlap (24-1949:25-2000) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MEFPIGSLETNNFRRFTPESLVEIEKQIAAKQGTKKAREKHREQKDQEEKPRPQLDLKA ::..:: ... . .: :...:.:. :.:. ::.: CCDS33 MAQSVLVPPGPDSFRFFTRESLAAIEQRIAEEKAKRPKQE--RKDEDDENGPKPNSDLEA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 CNQLPKFYGELPAELIGEPLEDLDPFYSTHRTFMVLNKGRTISRFSATRALWLFSPFNLI ..:: .::..: :... :::::::.: ...::.:::::..::::::: ::....::: : CCDS33 GKSLPFIYGDIPPEMVSVPLEDLDPYYINKKTFIVLNKGKAISRFSATPALYILTPFNPI 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 RRTAIKVSVHSWFSLFITVTILVNCVCMTRTDLPE---KIEYVFTVIYTFEALIKILARG :. :::. ::: :...: :::.::: :: .. :. ..::.:: :::::.:::::::: CCDS33 RKLAIKILVHSLFNMLIMCTILTNCVFMTMSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKILARG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 FCLNEFTYLRDPWNWLDFSVITLAYVGTAIDLRGISGLRTFRVLRALKTVSVIPGLKVIV :::..::.::::::::::.:::.::: .:: ..:.::::::::::::.:::::::.:: CCDS33 FCLEDFTFLRDPWNWLDFTVITFAYVTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIV 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 GALIHSVKKLADVTILTIFCLSVFALVGLQLFKGNLKNKCVK-----NDMAVNETT---- ::::.:::::.:: :::.::::::::.::::: :::.:::.. ... .: :. CCDS33 GALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCLQWPPDNSSFEINITSFFNN 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 pF1KE2 ----NYSSHRKP------DIYINKR-------GTSDPLLCGNGSDSGHCPDGYICLKTSD : .. . : ::. . : .: :::::.::.:.::.::::.:.. CCDS33 SLDGNGTTFNRTVSIFNWDEYIEDKSHFYFLEGQNDALLCGNSSDAGQCPEGYICVKAGR 300 310 320 330 340 350 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 NPDFNYTSFDSFAWAFLSLFRLMTQDSWERLYQQTLRTSGKIYMIFFVLVIFLGSFYLVN ::...:::::.:.::::::::::::: :: ::: :::..:: ::::::::::::::::.: CCDS33 NPNYGYTSFDTFSWAFLSLFRLMTQDFWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFLGSFYLIN 360 370 380 390 400 410 400 410 420 430 pF1KE2 LILAVVTMAYEEQNQATTDEIEAKEKKFQEALEMLRKEQEVLAAL--------------- ::::::.:::::::::: .: : :: .::. ::.:.:.:: : CCDS33 LILAVVAMAYEEQNQATLEEAEQKEAEFQQMLEQLKKQQEEAQAAAAAASAESRDFSGAG 420 430 440 450 460 470 440 450 460 470 pF1KE2 GIDTTSLHSHNGSPLTSKNASE-RRHRIKPRVSEGSTEDNKSPR---------------- :: . : : .: :.::. .: . .: : . .: : :..:. : CCDS33 GIGVFSESSSVASKLSSKSEKELKNRRKKKKQKEQSGEEEKNDRVRKSESEDSIRRKGFR 480 490 500 510 520 530 480 490 500 510 520 pF1KE2 --------------SDPYNQRRMSFLGLASGKRRASHGSVFHFRSPGRDISLPEGVTDD- :.:. : .:. : . :: :..:.: ::. ..::. . .:: CCDS33 FSLEGSRLTYEKRFSSPH-QSLLSIRGSLFSPRRNSRASLFSFRGRAKDIGSENDFADDE 540 550 560 570 580 590 530 540 550 560 570 pF1KE2 -GVFPGDHESHRGSLLLGGGAGQ-------QGPLPRSPLP-QPSNPDSRHGEDEHQ---- ..: :..:.: ::.. :. :. :: : : . . : . CCDS33 HSTFE-DNDSRRDSLFVPHRHGERRHSNVSQASRASRVLPILPMNGKMHSAVDCNGVVSL 600 610 620 630 640 650 580 590 600 610 620 pF1KE2 --PPPT----SELAP-GAVDVSAFDAGQKKTF-LSAEYLDEPFRAQRAMSVVSIITSVLE : : ..: : :.. . . ..... .: . :..: :::::..::.:...: CCDS33 VGGPSTLTSAGQLLPEGTTTETEIRKRRSSSYHVSMDLLEDPTSRQRAMSIASILTNTME 660 670 680 690 700 710 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 ELEESEQKCPPCLTSLSQKYLIWDCCPMWVKLKTILFGLVTDPFAELTITLCIVVNTIFM :::::.:::::: .... :::::: :.:.: .. .: :::..:.::.:::.::.:: CCDS33 ELEESRQKCPPCWYKFANMCLIWDCCKPWLKVKHLVNLVVMDPFVDLAITICIVLNTLFM 720 730 740 750 760 770 690 700 710 720 730 740 pF1KE2 AMEHHGMSPTFEAMLQIGNIVFTIFFTAEMVFKIIAFDPYYYFQKKWNIFDCIIVTVSLL ::::. :. : ..:..::.::: .::::: .::::.:::::::. ::::: .::..::. CCDS33 AMEHYPMTEQFSSVLSVGNLVFTGIFTAEMFLKIIAMDPYYYFQEGWNIFDGFIVSLSLM 780 790 800 810 820 830 750 760 770 780 790 800 pF1KE2 ELGVAKKGSLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNTLIKIIGNSVGALGNLTIILAIIVFVFA :::.:. .::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::..::::::.:: CCDS33 ELGLANVEGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFA 840 850 860 870 880 890 810 820 830 840 850 860 pF1KE2 LVGKQLLGENYRNNRKNISAPHEDWPRWHMHDFFHSFLIVFRILCGEWIENMWACMEVGQ .:: ::.:..:.. .:: : :::::::::::::::::.:::::::.:: ::::. CCDS33 VVGMQLFGKSYKECVCKISNDCE-LPRWHMHDFFHSFLIVFRVLCGEWIETMWDCMEVAG 900 910 920 930 940 950 870 880 890 900 910 920 pF1KE2 KSICLILFLTVMVLGNLVVLNLFIALLLNSFSADNLTAPEDDGEVNNLQVALARIQVFGH ...:: .:. :::.:::::::::.::::.:::.:::.: .::.:.::::.:..:.: CCDS33 QTMCLTVFMMVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSSDNLAATDDDNEMNNLQIAVGRMQKGID 960 970 980 990 1000 1010 930 940 950 960 970 pF1KE2 RTKQALCSFFSRSCPFPQPKAEPELVVKLPLSSSK---AENHIAANTAR---------GS .:. . :.... : :: :. :...: :: . . .. :. CCDS33 FVKRKIREFIQKAFVRKQ-KALDEIKPLEDLNNKKDSCISNHTTIEIGKDLNYLKDGNGT 1020 1030 1040 1050 1060 1070 980 990 1000 1010 1020 pF1KE2 SGGL--QAPRGPRDE--HSDFIANPTVWVSVPIAEGESDLDDLEDDGGEDAQSFQQEVIP ..:. .. . :: . .:: ::.. :.:::: ::::...: ... :..: CCDS33 TSGIGSSVEKYVVDESDYMSFINNPSLTVTVPIAVGESDFENL------NTEEFSSE--- 1080 1090 1100 1110 1120 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KE2 KGQQEQLQQVERCGDHLTPRSPGTGTSSEDLAPSLGETWKDESVPQVPAEGVDDTSSSEG :. : : .. :::::: CCDS33 ----------------------------SDMEES--------------KEKLNATSSSEG 1130 1140 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KE2 STVDCLDPEEILRKIPELA-DDLEEPDDCFTEGCIRHCPCCKLDTTKSPWDVGWQVRKTC :::: : : . ::. .. ::. :::: :.:. ::... .. . :..:::: CCDS33 STVDIGAPAE--GEQPEVEPEESLEPEACFTEDCVRKFKCCQISIEEGKGKLWWNLRKTC 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KE2 YRIVEHSWFESFIIFMILLSSGSLAFEDYYLDQKPTVKALLEYTDRVFTFIFVFEMLLKW :.::::.:::.::.::::::::.::::: :..:. :.:..:::.:.:::.::..:::::: CCDS33 YKIVEHNWFETFIVFMILLSSGALAFEDIYIEQRKTIKTMLEYADKVFTYIFILEMLLKW 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KE2 VAYGFKKYFTNAWCWLDFLIVNISLISLTAKILEYSEVAPIKALRTLRALRPLRALSRFE :::::. ::::::::::::::..::.::::. : :::.. ::.::::::::::::::::: CCDS33 VAYGFQVYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLTANALGYSELGAIKSLRTLRALRPLRALSRFE 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KE2 GMRVVVDALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFWRCINYTDGEFSLVPLSI ::::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::..::::: :: . .:. CCDS33 GMRVVVNALLGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFYHCINYTTGE--MFDVSV 1330 1340 1350 1360 1370 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KE2 VNNKSDCK-IQNSTGSFFWVNVKVNFDNVAMGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSREVNM ::: :.:: . .:. . : :::::::::..:::.:::::::::::::::::::::.:.. CCDS33 VNNYSECKALIESNQTARWKNVKVNFDNVGLGYLSLLQVATFKGWMDIMYAAVDSRNVEL 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1390 1400 1410 1420 1430 1440 pF1KE2 QPKWEDNVYMYLYFVIFIIFGGFFTLNLFVGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEEQKKYYN :::.:::.:::::::::::::.:::::::.:::::::::::::.:::::::::::::::: CCDS33 QPKYEDNLYMYLYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQKKYYN 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1450 1460 1470 1480 1490 1500 pF1KE2 AMKKLGSKKPQKPIPRPLNKFQGFVFDIVTRQAFDITIMVLICLNMITMMVETDDQSEEK ::::::::::::::::: :::::.:::.::.:.:::.::.::::::.::::::::::.: CCDS33 AMKKLGSKKPQKPIPRPANKFQGMVFDFVTKQVFDISIMILICLNMVTMMVETDDQSQEM 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1510 1520 1530 1540 1550 1560 pF1KE2 TKILGKINQFFVAVFTGECVMKMFALRQYYFTNGWNVFDFIVVVLSIASLIFSAILKSLQ :.:: :: :...::::::.:...:: :::: :::.:::.::.:::...... .. . CCDS33 TNILYWINLVFIVLFTGECVLKLISLRYYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLAELI---E 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1570 1580 1590 1600 1610 1620 pF1KE2 SYF-SPTLFRVIRLARIGRILRLIRAAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYSI .:: ::::::::::::::::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::.: CCDS33 KYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYAI 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1630 1640 1650 1660 1670 1680 pF1KE2 FGMSSFPHVRWEAGIDDMFNFQTFANSMLCLFQITTSAGWDGLLSPILNTGPPYCDPNL- ::::.: .:. :.::::::::.::.:::.:::::::::::::::.::::.::: :::. CCDS33 FGMSNFAYVKREVGIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLAPILNSGPPDCDPDKD 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1690 1700 1710 1720 1730 1740 pF1KE2 -PNSNGTRGDCGSPAVGIIFFTTYIIISFLIVVNMYIAVILENFNVATEESTEPLSEDDF :.:. ..::::.:.:::.::..:::::::.:::::::::::::.::::::.:::::::: CCDS33 HPGSS-VKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFLVVVNMYIAVILENFSVATEESAEPLSEDDF 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1750 1760 1770 1780 1790 1800 pF1KE2 DMFYETWEKFDPEATQFITFSALSDFADTLSGPLRIPKPNRNILIQMDLPLVPGDKIHCL .::::.::::::.::::: :. ::::::.:. :: : :::. :: ::::.: ::.:::: CCDS33 EMFYEVWEKFDPDATQFIEFAKLSDFADALDPPLLIAKPNKVQLIAMDLPMVSGDRIHCL 1800 1810 1820 1830 1840 1850 1810 1820 1830 1840 1850 1860 pF1KE2 DILFAFTKNVLGESGELDSLKANMEEKFMATNLSKSSYEPIATTLRWKQEDISATVIQKA :::::::: :::::::.:.:. .:::.:::.: :: :::::.:::. :::..:: .::.: CCDS33 DILFAFTKRVLGESGEMDALRIQMEERFMASNPSKVSYEPITTTLKRKQEEVSAIIIQRA 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1870 1880 1890 1900 1910 1920 pF1KE2 YRSYVLHRSMA-LSNTPCVPRAEEEAASLPDEGFVAFTANENCVLPDKSETASATSFPPS :: :.:.... .:. ...: .. : . ::: . :.:.. . .:. ::: CCDS33 YRRYLLKQKVKKVSSIYKKDKGKECDGTPIKEDTLIDKLNENST-PEKTDMTPSTTSPPS 1920 1930 1940 1950 1960 1970 1930 1940 1950 pF1KE2 YESVTRGLSDRVNMRTSSSIQNEDEATSMELIAPGP :.:::. ... . : ..::.. .. CCDS33 YDSVTKPEKEKFEKDKS---EKEDKGKDIRESKK 1980 1990 2000 >>CCDS33312.1 SCN3A gene_id:6328|Hs108|chr2 (2000 aa) initn: 6544 init1: 1165 opt: 3922 Z-score: 3445.1 bits: 650.9 E(32554): 1.4e-185 Smith-Waterman score: 7043; 56.5% identity (77.8% similar) in 2023 aa overlap (19-1926:20-1975) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MEFPIGSLETNNFRRFTPESLVEIEKQIAAKQGTKKAREKHREQKDQEEKPRPQLDLKA :::. :::. ::.. .:: :.....:.:.::.:. ::.: CCDS33 MAQALLVPPGPESFRLFTRESLAAIEKR-AAEEKAKKP--KKEQDNDDENKPKPNSDLEA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 CNQLPKFYGELPAELIGEPLEDLDPFYSTHRTFMVLNKGRTISRFSATRALWLFSPFNLI ..:: .::..: :...::::::::.: ...::.:.:::..: ::::: ::....:.: . CCDS33 GKNLPFIYGDIPPEMVSEPLEDLDPYYINKKTFIVMNKGKAIFRFSATSALYILTPLNPV 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 RRTAIKVSVHSWFSLFITVTILVNCVCMTRTDLPE---KIEYVFTVIYTFEALIKILARG :. :::. ::: ::..: :::.::: :: .. :. ..::.:: :::::.:::::::: CCDS33 RKIAIKILVHSLFSMLIMCTILTNCVFMTLSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKILARG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 FCLNEFTYLRDPWNWLDFSVITLAYVGTAIDLRGISGLRTFRVLRALKTVSVIPGLKVIV :::..::.:::::::::::::..::: .:: ..:.::::::::::::.:::::::.:: CCDS33 FCLEDFTFLRDPWNWLDFSVIVMAYVTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIV 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 GALIHSVKKLADVTILTIFCLSVFALVGLQLFKGNLKNKCVK---NDMAVN-ETTNY--S ::::.:::::.:: :::.::::::::.::::: :::.:::.. .: : . .::.: . CCDS33 GALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCLQWPPSDSAFETNTTSYFNG 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 SHRKPDIYINKR--------------------GTSDPLLCGNGSDSGHCPDGYICLKTSD . . ..: : .::::::::::.:.::.::::.:.. 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