FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2057, 693 aa 1>>>pF1KE2057 693 - 693 aa - 693 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6738+/-0.000473; mu= 17.5989+/- 0.029 mean_var=67.4833+/-13.840, 0's: 0 Z-trim(108.8): 49 B-trim: 0 in 0/49 Lambda= 0.156126 statistics sampled from 16869 (16913) to 16869 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.546), E-opt: 0.2 (0.198), width: 16 Scan time: 10.730 The best scores are: opt bits E(85289) NP_003236 (OMIM: 600238) protein-glutamine gamma-g ( 693) 4600 1045.8 0 XP_016877392 (OMIM: 606776) PREDICTED: protein-glu ( 711) 1824 420.6 1e-116 NP_443187 (OMIM: 606776) protein-glutamine gamma-g ( 710) 1818 419.2 2.7e-116 NP_001241663 (OMIM: 613900,613908) protein-glutami ( 625) 1769 408.2 5e-113 NP_945345 (OMIM: 613900,613908) protein-glutamine ( 706) 1769 408.2 5.6e-113 NP_963925 (OMIM: 603805,609796) protein-glutamine ( 720) 1609 372.1 4e-102 NP_000120 (OMIM: 134570,188050,608446,613225) coag ( 732) 1428 331.4 7.6e-90 NP_945189 (OMIM: 190196) protein-glutamine gamma-g ( 548) 1401 325.2 4e-88 NP_004604 (OMIM: 190196) protein-glutamine gamma-g ( 687) 1401 325.3 4.9e-88 XP_011527330 (OMIM: 190196) PREDICTED: protein-glu ( 687) 1401 325.3 4.9e-88 NP_001310245 (OMIM: 190196) protein-glutamine gamm ( 687) 1401 325.3 4.9e-88 NP_000350 (OMIM: 190195,242300) protein-glutamine ( 817) 1353 314.5 1e-84 NP_001310247 (OMIM: 190196) protein-glutamine gamm ( 627) 1330 309.3 2.9e-83 NP_004236 (OMIM: 603805,609796) protein-glutamine ( 638) 1318 306.6 1.9e-82 XP_011532344 (OMIM: 600585) PREDICTED: protein-glu ( 729) 1276 297.1 1.5e-79 NP_003232 (OMIM: 600585) protein-glutamine gamma-g ( 684) 1275 296.9 1.7e-79 NP_001310246 (OMIM: 190196) protein-glutamine gamm ( 606) 1120 262.0 4.9e-69 XP_011519652 (OMIM: 177070,612690) PREDICTED: eryt ( 721) 975 229.3 3.9e-59 XP_011519651 (OMIM: 177070,612690) PREDICTED: eryt ( 721) 975 229.3 3.9e-59 NP_000110 (OMIM: 177070,612690) erythrocyte membra ( 721) 975 229.3 3.9e-59 XP_011519653 (OMIM: 177070,612690) PREDICTED: eryt ( 721) 975 229.3 3.9e-59 NP_001107606 (OMIM: 177070,612690) erythrocyte mem ( 691) 970 228.2 8.2e-59 XP_011519654 (OMIM: 177070,612690) PREDICTED: eryt ( 709) 833 197.3 1.6e-49 XP_011519656 (OMIM: 177070,612690) PREDICTED: eryt ( 536) 791 187.8 9e-47 XP_005254282 (OMIM: 177070,612690) PREDICTED: eryt ( 656) 674 161.5 9.2e-39 XP_011519655 (OMIM: 177070,612690) PREDICTED: eryt ( 686) 674 161.5 9.6e-39 XP_011520532 (OMIM: 603805,609796) PREDICTED: prot ( 377) 495 121.1 7.8e-27 XP_016878218 (OMIM: 603805,609796) PREDICTED: prot ( 377) 495 121.1 7.8e-27 >>NP_003236 (OMIM: 600238) protein-glutamine gamma-gluta (693 aa) initn: 4600 init1: 4600 opt: 4600 Z-score: 5595.7 bits: 1045.8 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 4600; 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NP_443 LDPTPQQTSSGLFCCGPASVKAIREGDVHLAYDTPFVYAEVNADEVIWLLGDGQAQEILA 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 SVNSHTIGRYISTKAVGSNARMDVTDKYKYPEGSDQERQVFQKA----LGKLKPNTPFAA :. .::. :::: :::. :...:..::::::: .:: ::.:: :: . . :: NP_443 H-NTSSIGKEISTKMVGSDQRQSITSSYKYPEGSPEERAVFMKASRKMLGPQRASLPFLD 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 T-SSMGLETEEQEPSIIGKLKVAGMLAVGKEVNLVLLLKNLSRDTKT-----VTVNMTAW : ::. ..:. . .:..: . :....:.: .. . .:. ..: . : NP_443 LLESGGLR---DQPAQL-QLHLARIPEWGQDLQLLLRIQRVPDSTHPRGPIGLVVRFCAQ 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 TIIYNGTLVHEVWKDSATMSLDPEEEAEHPIKISYAQYEKYLKSDNMIRITAVCKVPDES .....: . :. .. :.:: .:.. :. . :..:.. : ....::.... .: . . NP_443 ALLHGGGTQKPFWRHTVRMNLDFGKETQWPLLLPYSNYRNKLTDEKLIRVSGIAEVEETG 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 pF1KE2 E-VVVERDIILDNPTLTLEVLNEARVRKPVNVQMLFSNPLDEPVRDCVLMVEGSGLLLGN . ..: .:: :. : :..:: ..:.: : . :.. ..: : . .:....:::::. :. NP_443 RSMLVLKDICLEPPHLSIEVSERAEVGKALRVHVTLTNTLMVALSSCTMVLEGSGLINGQ 600 610 620 630 640 650 650 660 670 680 690 pF1KE2 LKIDVPTLGPKEGSRVRFDILPSRSGTKQLLADFSCNKFPAIKAMLSIDVAE . :. :: . ....:. :...: .:: . .: :. ::.. .: NP_443 IAKDLGTLVAGHTLQIQLDLYPTKAGPRQLQVLISSNEVKEIKGYKDIFVTVAGAP 660 670 680 690 700 710 >>NP_001241663 (OMIM: 613900,613908) protein-glutamine g (625 aa) initn: 1403 init1: 971 opt: 1769 Z-score: 2150.2 bits: 408.2 E(85289): 5e-113 Smith-Waterman score: 1964; 50.1% identity (74.1% similar) in 607 aa overlap (1-594:1-606) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MAALGVQSINWQKAFNRQAHHTDKFSSQELILRRGQNFQVLMIMNKGLGSNERLEFIVST ::.. : ...::.. : ::::... ::..::::.:.. . ....: .: : : . : NP_001 MAGIRVTKVDWQRSRNGAAHHTQEYPCPELVVRRGQSFSLTLELSRALDCEEILIFTMET 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 GPYPSESAMTKAVFPLSNGSSG-GWSAVLQASNGNTLTISISSPASAPIGRYTMALQIFS :: ::. ::::: :. : ::.:. .:. .:::.:..:: :: :::: ..... : NP_001 GPRASEALHTKAVFQTSELERGEGWTAAREAQMEKTLTVSLASPPSAVIGRYLLSIRLSS 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 QGGISSVKLGTFILLFNPWLNVDSVFMGNHAEREEYVQEDAGIIFVGSTNRIGMIGWNFG . :. .:: :.:::::: :.::.... ::.::: :.:::: : ..: :::.: NP_001 HRKHSNRRLGEFVLLFNPWCAEDDVFLASEEERQEYVLSDSGIIFRGVEKHIRAQGWNYG 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 QFEEDILSICLSILDRSLNFRRDAATDVASRNDPKYVGRVLSAMINSNDDNGVLAGNWSG :::::::.::::::::: . . . ::::. :..: :: ::.:::.:::.: ::. :.:.: NP_001 QFEEDILNICLSILDRSPGHQNNPATDVSCRHNPIYVTRVISAMVNSNNDRGVVQGQWQG 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 TYTGGRDPRSWNGSVEILKNWKKSGFSPVRYGQCWVFAGTLNTALRSLGIPSRVITNFNS : :: .: : ::: ::..: :. ..::.:::::::::.: :.:: ::: .::..:::: NP_001 KYGGGTSPLHWRGSVAILQKWLKGRYKPVKYGQCWVFAGVLCTVLRCLGIATRVVSNFNS 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 AHDTDRNLSVDVYYDPMGNPL-DKGSDSVWNFHVWNEGWFVRSDLGPSYGGWQVLDATPQ :::::.::::: : : .: : : ::.::::::::.::.:.::::::.:::::::::: NP_001 AHDTDQNLSVDKYVDSFGRTLEDLTEDSMWNFHVWNESWFARQDLGPSYNGWQVLDATPQ 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 ERSQGVFQCGPASVIGVREGDVQLNFDMPFIFAEVNADRITWLYDNTTGKQWKNSVNSHT :.:.:::.:::::: ..:::::.: : ::.::::::: ::::. . ... : :.. NP_001 EESEGVFRCGPASVTAIREGDVHLAHDGPFVFAEVNADYITWLWHEDESRERVYS-NTKK 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 IGRYISTKAVGSNARMDVTDKYKYPEGSDQERQVFQKALGKL----KPNTPFAATSSMG- ::: ::::::::..:.:.:: ::::::: .::::..::...: . . . : NP_001 IGRCISTKAVGSDSRVDITDLYKYPEGSRKERQVYSKAVNRLFGVEASGRRIWIRRAGGR 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 ------LETEEQEPSIIGKLKVAGMLAVGKEVNLVLLLKNLSRDTKTVTVNMTAWTIIYN : .::: ::.:: .:... :.: : ::. .. : ::... ::.:. NP_001 CLWRDDLLEPATKPSIAGKFKVLEPPMLGHDLRLALCLANLTSRAQRVRVNLSGATILYT 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 GTLVHEVWKDSATMSLDPEEEAEHPIKISYAQYEKYLKSDNMIRITAVCKVPDESEVVVE : :. ..: .. : :.:: . :: :::..:.. : :. : ..:.: : ...:: NP_001 RKPVAEILHESHAVRLGPQEEKRIPITISYSKYKEDLTEDKKILLAAMCLVTKGEKLLVE 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 pF1KE2 RDIILDNPTLTLEVLNEARVRKPVNVQMLFSNPLDEPVRDCVLMVEGSGLLLGNLKIDVP .:: :.. NP_001 KDITLEDFITIKRAYPGASGEGLSPV 600 610 620 >>NP_945345 (OMIM: 613900,613908) protein-glutamine gamm (706 aa) initn: 1683 init1: 971 opt: 1769 Z-score: 2149.3 bits: 408.2 E(85289): 5.6e-113 Smith-Waterman score: 2244; 50.1% identity (74.0% similar) in 705 aa overlap (1-692:1-703) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MAALGVQSINWQKAFNRQAHHTDKFSSQELILRRGQNFQVLMIMNKGLGSNERLEFIVST ::.. : ...::.. : ::::... ::..::::.:.. . ....: .: : : . : NP_945 MAGIRVTKVDWQRSRNGAAHHTQEYPCPELVVRRGQSFSLTLELSRALDCEEILIFTMET 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 GPYPSESAMTKAVFPLSNGSSG-GWSAVLQASNGNTLTISISSPASAPIGRYTMALQIFS :: ::. ::::: :. : ::.:. .:. .:::.:..:: :: :::: ..... : NP_945 GPRASEALHTKAVFQTSELERGEGWTAAREAQMEKTLTVSLASPPSAVIGRYLLSIRLSS 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 QGGISSVKLGTFILLFNPWLNVDSVFMGNHAEREEYVQEDAGIIFVGSTNRIGMIGWNFG . :. .:: :.:::::: :.::.... ::.::: :.:::: : ..: :::.: NP_945 HRKHSNRRLGEFVLLFNPWCAEDDVFLASEEERQEYVLSDSGIIFRGVEKHIRAQGWNYG 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 QFEEDILSICLSILDRSLNFRRDAATDVASRNDPKYVGRVLSAMINSNDDNGVLAGNWSG :::::::.::::::::: . . . ::::. :..: :: ::.:::.:::.: ::. :.:.: NP_945 QFEEDILNICLSILDRSPGHQNNPATDVSCRHNPIYVTRVISAMVNSNNDRGVVQGQWQG 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 TYTGGRDPRSWNGSVEILKNWKKSGFSPVRYGQCWVFAGTLNTALRSLGIPSRVITNFNS : :: .: : ::: ::..: :. ..::.:::::::::.: :.:: ::: .::..:::: NP_945 KYGGGTSPLHWRGSVAILQKWLKGRYKPVKYGQCWVFAGVLCTVLRCLGIATRVVSNFNS 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 AHDTDRNLSVDVYYDPMGNPL-DKGSDSVWNFHVWNEGWFVRSDLGPSYGGWQVLDATPQ :::::.::::: : : .: : : ::.::::::::.::.:.::::::.:::::::::: NP_945 AHDTDQNLSVDKYVDSFGRTLEDLTEDSMWNFHVWNESWFARQDLGPSYNGWQVLDATPQ 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 ERSQGVFQCGPASVIGVREGDVQLNFDMPFIFAEVNADRITWLYDNTTGKQWKNSVNSHT :.:.:::.:::::: ..:::::.: : ::.::::::: ::::. . ... : :.. NP_945 EESEGVFRCGPASVTAIREGDVHLAHDGPFVFAEVNADYITWLWHEDESRERVYS-NTKK 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KE2 IGRYISTKAVGSNARMDVTDKYKYPEGSDQERQVFQKALGKL----KPNTPFAATSSMG- ::: ::::::::..:.:.:: ::::::: .::::..::...: . . . : NP_945 IGRCISTKAVGSDSRVDITDLYKYPEGSRKERQVYSKAVNRLFGVEASGRRIWIRRAGGR 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 ------LETEEQEPSIIGKLKVAGMLAVGKEVNLVLLLKNLSRDTKTVTVNMTAWTIIYN : .::: ::.:: .:... :.: : ::. .. : ::... ::.:. NP_945 CLWRDDLLEPATKPSIAGKFKVLEPPMLGHDLRLALCLANLTSRAQRVRVNLSGATILYT 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 GTLVHEVWKDSATMSLDPEEEAEHPIKISYAQYEKYLKSDNMIRITAVCKVPDESEVVVE : :. ..: .. : :.:: . :: :::..:.. : :. : ..:.: : ...:: NP_945 RKPVAEILHESHAVRLGPQEEKRIPITISYSKYKEDLTEDKKILLAAMCLVTKGEKLLVE 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 pF1KE2 RDIILDNPTLTLEVLNEARVRKPVNVQMLFSNPLDEPVRDCVLMVEGSGLLLGNLKIDVP .:: :.. .:..::. : : :.:.. ::: : :.::.::::::::: .:.:::: NP_945 KDITLED-FITIKVLGPAMVGVAVTVEVTVVNPLIERVKDCALMVEGSGLLQEQLSIDVP 600 610 620 630 640 650 650 660 670 680 690 pF1KE2 TLGPKEGSRVRFDILPSRSGTKQLLADFSCNKFPAIKAMLSIDVAE :: :.: . :.::: ::.:: .:: .:. .:: ::... . :: NP_945 TLEPQERASVQFDITPSKSGPRQLQVDLVSPHFPDIKGFVIVHVATAK 660 670 680 690 700 >>NP_963925 (OMIM: 603805,609796) protein-glutamine gamm (720 aa) initn: 1783 init1: 821 opt: 1609 Z-score: 1954.4 bits: 372.1 E(85289): 4e-102 Smith-Waterman score: 2067; 44.7% identity (73.2% similar) in 714 aa overlap (4-691:5-716) 10 20 30 40 50 pF1KE2 MAALGVQSINWQKAFNRQAHHTDKFSSQELILRRGQNFQV-LMIMNKGLGSN-ERLEFI : : . :.. : :::.... ..:..:::: :.. :.. :... . . . :. 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NP_963 VETGPLPDLALGTRAVFSLARHHSPSPWIAWLETNGATSTEVSLCAPPTAAVGRYLLKIH 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE2 IFS-QGGISSVKLGTFILLFNPWLNVDSVFMGNHAEREEYVQEDAGIIFVGSTNRIGMIG : : ::.... .:: :::::::: :.:.. .. .:.:::..: :.:. :: : : NP_963 IDSFQGSVTAYQLGEFILLFNPWCPEDAVYLDSEPQRQEYVMNDYGFIYQGSKNWIRPCP 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 WNFGQFEEDILSICLSILDRSLNFRRDAATDVASRNDPKYVGRVLSAMINSNDDNGVLAG ::.::::. :..:::..::.::.:. : ::: : :..: ::.::. :::::::::::: : NP_963 WNYGQFEDKIIDICLKLLDKSLHFQTDPATDCALRGSPVYVSRVVCAMINSNDDNGVLNG 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 NWSGTYTGGRDPRSWNGSVEILKNWKKSGFSPVRYGQCWVFAGTLNTALRSLGIPSRVIT ::: .:: : .: :.::: :::.:. .: .:::::::::::... :..: ::::.:::: NP_963 NWSENYTDGANPAEWTGSVAILKQWNATGCQPVRYGQCWVFAAVMCTVMRCLGIPTRVIT 250 260 270 280 290 300 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 NFNSAHDTDRNLSVDVYYDPMGNPL-DKGSDSVWNFHVWNEGWFVRSDLGPSYGGWQVLD ::.:.:::: :: .: ::: : : .: .:..:::::::: :..:.:: :.:::::::: NP_963 NFDSGHDTDGNLIIDEYYDNTGRILGNKKKDTIWNFHVWNECWMARKDLPPAYGGWQVLD 310 320 330 340 350 360 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 ATPQERSQGVFQCGPASVIGVREGDVQLNFDMPFIFAEVNADRITWLYDNTTGKQWKNSV ::::: :.::. :::::: ...::.:.::.: ::.:. :::: ..:: .. ::. : NP_963 ATPQEMSNGVYCCGPASVRAIKEGEVDLNYDTPFVFSMVNADCMSWLVQG--GKEQKLHQ 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 NSHTIGRYISTKAVGSNARMDVTDKYKYPEGSDQERQVFQKALGKLK------------- .. ..: .::::.. :. : :.:..::: ::: :::::: ::: ::: NP_963 DTSSVGNFISTKSIQSDERDDITENYKYEEGSLQERQVFLKALQKLKARSFHGSQRGAEL 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 pF1KE2 -PNTP--FAATSSMGLETEEQEPS----IIGKLKVAGMLAVGKEVNLVLLLKNLSRDTKT :. : .. : .:.: .:: . :.:. .:... .::: :.: . : NP_963 QPSRPTSLSQDSPRSLHTPSLRPSDVVQVSLKFKLLDPPNMGQDICFVLLALNMSSQFKD 480 490 500 510 520 530 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 VTVNMTAWTIIYNGTLVHEVWKDSATMSLDPEEEAEHPIKISYAQYEKYLKSDNMIRITA . ::..: .....:. . :.:.: ..:.:.: .: ::::.:: .::..:..:::.: NP_963 LKVNLSAQSLLHDGSPLSPFWQDTAFITLSPKEAKTYPCKISYSQYSQYLSTDKLIRISA 540 550 560 570 580 590 580 590 600 610 620 630 pF1KE2 VCKVPDESE-VVVERDIILDNPTLTLEVLNEARVRKPVNVQMLFSNPLDEPVRDCVLMVE . . . : ..:.. : :. :..:..::. : : .:...:..:::::.: :.:::: :: NP_963 LGEEKSSPEKILVNKIITLSYPSITINVLGAAVVNQPLSIQVIFSNPLSEQVEDCVLTVE 600 610 620 630 640 650 640 650 660 670 680 690 pF1KE2 GSGLLLGNLKIDVPTLGPKEGSRVRFDILPSRSGTKQLLADFSCNKFPAIKAMLSIDVAE ::::. . :. . .: :.. . . .. .: .:: .:. :.. ::: ::.. .. : NP_963 GSGLFKKQQKVFLGVLKPQHQASIILETVPFKSGQRQIQANMRSNKFKDIKGYRNVYVDF 660 670 680 690 700 710 NP_963 AL 720 >>NP_000120 (OMIM: 134570,188050,608446,613225) coagulat (732 aa) initn: 588 init1: 451 opt: 1428 Z-score: 1734.0 bits: 331.4 E(85289): 7.6e-90 Smith-Waterman score: 1429; 34.7% identity (66.6% similar) in 691 aa overlap (16-691:61-726) 10 20 30 40 pF1KE2 MAALGVQSINWQKAFNRQAHHTDKFSSQELILRRGQNFQVLMIMN :. :::::. ...::.::::.: : . .. 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