Result of FASTA (omim) for
pFN21AE3978
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3978, 392 aa
1>>>pF1KE3978 392 - 392 aa - 392 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2037+/-0.00038; mu= 17.3577+/- 0.024
mean_var=73.9323+/-15.600, 0's: 0 Z-trim(113.4): 329 B-trim: 2000 in 2/49
Lambda= 0.149162
statistics sampled from 22327 (22732) to 22327 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.651), E-opt: 0.2 (0.267), width: 16
Scan time: 7.100
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001007227 (OMIM: 602650) speckle-type POZ prote ( 374) 1932 425.3 1.2e-118
NP_001007228 (OMIM: 602650) speckle-type POZ prote ( 374) 1932 425.3 1.2e-118
XP_016880693 (OMIM: 602650) PREDICTED: speckle-typ ( 374) 1932 425.3 1.2e-118
NP_001007229 (OMIM: 602650) speckle-type POZ prote ( 374) 1932 425.3 1.2e-118
XP_005257780 (OMIM: 602650) PREDICTED: speckle-typ ( 374) 1932 425.3 1.2e-118
NP_001007230 (OMIM: 602650) speckle-type POZ prote ( 374) 1932 425.3 1.2e-118
NP_003554 (OMIM: 602650) speckle-type POZ protein ( 374) 1932 425.3 1.2e-118
NP_001007231 (OMIM: 602650) speckle-type POZ prote ( 374) 1932 425.3 1.2e-118
XP_005257781 (OMIM: 602650) PREDICTED: speckle-typ ( 374) 1932 425.3 1.2e-118
XP_016867929 (OMIM: 611119,612943,617055) PREDICTE ( 325) 262 65.9 1.6e-10
XP_016867930 (OMIM: 611119,612943,617055) PREDICTE ( 303) 259 65.2 2.4e-10
NP_001026880 (OMIM: 611119,612943,617055) kelch-li ( 586) 262 66.1 2.5e-10
XP_011512584 (OMIM: 611237) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 387) 259 65.3 2.9e-10
XP_016865716 (OMIM: 611237) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 387) 259 65.3 2.9e-10
XP_011512583 (OMIM: 611237) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 391) 259 65.3 2.9e-10
XP_011512582 (OMIM: 611237) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 401) 259 65.3 3e-10
XP_016867928 (OMIM: 611119,612943,617055) PREDICTE ( 564) 259 65.4 3.9e-10
NP_001092742 (OMIM: 611237) BTB/POZ domain-contain ( 612) 259 65.4 4.1e-10
XP_011512581 (OMIM: 611237) PREDICTED: BTB/POZ dom ( 612) 259 65.4 4.1e-10
NP_443125 (OMIM: 611237) BTB/POZ domain-containing ( 612) 259 65.4 4.1e-10
NP_061334 (OMIM: 611119,612943,617055) kelch-like ( 538) 248 63.0 1.9e-09
NP_001311238 (OMIM: 616262) kelch-like protein 21 ( 500) 245 62.3 2.8e-09
NP_055666 (OMIM: 616262) kelch-like protein 21 iso ( 597) 245 62.4 3.3e-09
XP_011511576 (OMIM: 614214) PREDICTED: kelch-like ( 327) 238 60.7 5.8e-09
NP_569713 (OMIM: 614214) kelch-like protein 6 [Hom ( 621) 238 60.9 9.6e-09
NP_006758 (OMIM: 600574,615670,616564) leucine-zip ( 840) 233 59.9 2.5e-08
XP_011529874 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 633) 229 59.0 3.7e-08
XP_016863164 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 415) 224 57.8 5.6e-08
NP_001165899 (OMIM: 611119,612943,617055) kelch-li ( 166) 219 56.4 5.8e-08
XP_016863163 (OMIM: 605774) PREDICTED: kelch-like ( 555) 224 57.9 7.1e-08
NP_009177 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 isof ( 593) 224 57.9 7.4e-08
NP_001154993 (OMIM: 605774) kelch-like protein 2 i ( 597) 224 57.9 7.5e-08
NP_001244123 (OMIM: 605775,614495) kelch-like prot ( 555) 222 57.4 9.5e-08
NP_059111 (OMIM: 605775,614495) kelch-like protein ( 587) 222 57.5 1e-07
XP_006715820 (OMIM: 611119,612943,617055) PREDICTE ( 338) 219 56.6 1e-07
XP_006715816 (OMIM: 611119,612943,617055) PREDICTE ( 599) 219 56.8 1.6e-07
XP_006715818 (OMIM: 611119,612943,617055) PREDICTE ( 577) 216 56.2 2.4e-07
XP_006715817 (OMIM: 611119,612943,617055) PREDICTE ( 577) 216 56.2 2.4e-07
NP_001243504 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex ( 589) 216 56.2 2.4e-07
XP_011541998 (OMIM: 605173) PREDICTED: ectoderm-ne ( 589) 216 56.2 2.4e-07
XP_011541999 (OMIM: 605173) PREDICTED: ectoderm-ne ( 589) 216 56.2 2.4e-07
NP_003624 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex pr ( 589) 216 56.2 2.4e-07
NP_001243503 (OMIM: 605173) ectoderm-neural cortex ( 589) 216 56.2 2.4e-07
NP_115894 (OMIM: 616607) kelch repeat and BTB doma ( 601) 211 55.1 5.2e-07
XP_005247610 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 210 54.9 6.1e-07
XP_005247611 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 210 54.9 6.1e-07
XP_016862149 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 210 54.9 6.1e-07
XP_011511240 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 210 54.9 6.1e-07
NP_060114 (OMIM: 611295) kelch-like protein 24 [Ho ( 600) 210 54.9 6.1e-07
XP_005247609 (OMIM: 611295) PREDICTED: kelch-like ( 600) 210 54.9 6.1e-07
>>NP_001007227 (OMIM: 602650) speckle-type POZ protein [ (374 aa)
initn: 2177 init1: 1932 opt: 1932 Z-score: 2251.2 bits: 425.3 E(85289): 1.2e-118
Smith-Waterman score: 2144; 80.6% identity (91.6% similar) in 392 aa overlap (1-392:1-374)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MSREPTPPLPGDMSTGPIAESWCYTQVKVVKFSYMWTINNFSFCREEMGEVLKSSTFSSG
::: :.:: :..::.::.::::::::.::::::::::::::::::::::::.::::::::
NP_001 MSRVPSPPPPAEMSSGPVAESWCYTQIKVVKFSYMWTINNFSFCREEMGEVIKSSTFSSG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 PSDKMKWCLRVNPKGLDDESKDYLSLYLLLVSCPKSEVRAKFKFSLLNAKREETKAMESQ
.::.::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::: :::::::::
NP_001 ANDKLKWCLRVNPKGLDEESKDYLSLYLLLVSCPKSEVRAKFKFSILNAKGEETKAMESQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RAYRFVQGKDWGFKKFIRRDFLLDEANGLLPDDKLTLFCEVSVVQDSVNISGHTNTNTLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::... : .:
NP_001 RAYRFVQGKDWGFKKFIRRDFLLDEANGLLPDDKLTLFCEVSVVQDSVNISGQNTMNMVK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 VPECRLAEDLGNLWENTRFTDCSFFVRGQEFKAHKSVLAARSPVFNAMFEHEMEESKKNR
:::::::..::.::::.::::: . : ::::.:::..::::::::.::::::::::::::
NP_001 VPECRLADELGGLWENSRFTDCCLCVAGQEFQAHKAILAARSPVFSAMFEHEMEESKKNR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 VEINDLDPEVFKEMMRFIYTGRAPNLDKMADNLLAAADKYALERLKVMCEEALCSNLSVE
:::::..:::::::: :::::.:::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::
NP_001 VEINDVEPEVFKEMMCFIYTGKAPNLDKMADDLLAAADKYALERLKVMCEDALCSNLSVE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 NVADTLVLADLHSAEQLKAQAIDFINRCSVLRQLGCKDGKNWNSNQATDIMETSGWKSMI
:.:. :.:::::::.:::.::.:::: .:.:..::::::::.
NP_001 NAAEILILADLHSADQLKTQAVDFINY------------------HASDVLETSGWKSMV
310 320 330 340
370 380 390
pF1KE3 QSHPHLVAEAFRALASAQCPQFGIPRKRLKQS
:::::::::.:.::::::: .: ::::::::
NP_001 VSHPHLVAEAYRSLASAQCPFLGPPRKRLKQS
350 360 370
>>NP_001007228 (OMIM: 602650) speckle-type POZ protein [ (374 aa)
initn: 2177 init1: 1932 opt: 1932 Z-score: 2251.2 bits: 425.3 E(85289): 1.2e-118
Smith-Waterman score: 2144; 80.6% identity (91.6% similar) in 392 aa overlap (1-392:1-374)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MSREPTPPLPGDMSTGPIAESWCYTQVKVVKFSYMWTINNFSFCREEMGEVLKSSTFSSG
::: :.:: :..::.::.::::::::.::::::::::::::::::::::::.::::::::
NP_001 MSRVPSPPPPAEMSSGPVAESWCYTQIKVVKFSYMWTINNFSFCREEMGEVIKSSTFSSG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 PSDKMKWCLRVNPKGLDDESKDYLSLYLLLVSCPKSEVRAKFKFSLLNAKREETKAMESQ
.::.::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::: :::::::::
NP_001 ANDKLKWCLRVNPKGLDEESKDYLSLYLLLVSCPKSEVRAKFKFSILNAKGEETKAMESQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RAYRFVQGKDWGFKKFIRRDFLLDEANGLLPDDKLTLFCEVSVVQDSVNISGHTNTNTLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::... : .:
NP_001 RAYRFVQGKDWGFKKFIRRDFLLDEANGLLPDDKLTLFCEVSVVQDSVNISGQNTMNMVK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 VPECRLAEDLGNLWENTRFTDCSFFVRGQEFKAHKSVLAARSPVFNAMFEHEMEESKKNR
:::::::..::.::::.::::: . : ::::.:::..::::::::.::::::::::::::
NP_001 VPECRLADELGGLWENSRFTDCCLCVAGQEFQAHKAILAARSPVFSAMFEHEMEESKKNR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 VEINDLDPEVFKEMMRFIYTGRAPNLDKMADNLLAAADKYALERLKVMCEEALCSNLSVE
:::::..:::::::: :::::.:::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::
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pF1KE3 NVADTLVLADLHSAEQLKAQAIDFINRCSVLRQLGCKDGKNWNSNQATDIMETSGWKSMI
:.:. :.:::::::.:::.::.:::: .:.:..::::::::.
NP_001 NAAEILILADLHSADQLKTQAVDFINY------------------HASDVLETSGWKSMV
310 320 330 340
370 380 390
pF1KE3 QSHPHLVAEAFRALASAQCPQFGIPRKRLKQS
:::::::::.:.::::::: .: ::::::::
NP_001 VSHPHLVAEAYRSLASAQCPFLGPPRKRLKQS
350 360 370
>>XP_016880693 (OMIM: 602650) PREDICTED: speckle-type PO (374 aa)
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Smith-Waterman score: 2144; 80.6% identity (91.6% similar) in 392 aa overlap (1-392:1-374)
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pF1KE3 MSREPTPPLPGDMSTGPIAESWCYTQVKVVKFSYMWTINNFSFCREEMGEVLKSSTFSSG
::: :.:: :..::.::.::::::::.::::::::::::::::::::::::.::::::::
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pF1KE3 PSDKMKWCLRVNPKGLDDESKDYLSLYLLLVSCPKSEVRAKFKFSLLNAKREETKAMESQ
.::.::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::: :::::::::
XP_016 ANDKLKWCLRVNPKGLDEESKDYLSLYLLLVSCPKSEVRAKFKFSILNAKGEETKAMESQ
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pF1KE3 RAYRFVQGKDWGFKKFIRRDFLLDEANGLLPDDKLTLFCEVSVVQDSVNISGHTNTNTLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::... : .:
XP_016 RAYRFVQGKDWGFKKFIRRDFLLDEANGLLPDDKLTLFCEVSVVQDSVNISGQNTMNMVK
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pF1KE3 VPECRLAEDLGNLWENTRFTDCSFFVRGQEFKAHKSVLAARSPVFNAMFEHEMEESKKNR
:::::::..::.::::.::::: . : ::::.:::..::::::::.::::::::::::::
XP_016 VPECRLADELGGLWENSRFTDCCLCVAGQEFQAHKAILAARSPVFSAMFEHEMEESKKNR
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pF1KE3 VEINDLDPEVFKEMMRFIYTGRAPNLDKMADNLLAAADKYALERLKVMCEEALCSNLSVE
:::::..:::::::: :::::.:::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::
XP_016 VEINDVEPEVFKEMMCFIYTGKAPNLDKMADDLLAAADKYALERLKVMCEDALCSNLSVE
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pF1KE3 NVADTLVLADLHSAEQLKAQAIDFINRCSVLRQLGCKDGKNWNSNQATDIMETSGWKSMI
:.:. :.:::::::.:::.::.:::: .:.:..::::::::.
XP_016 NAAEILILADLHSADQLKTQAVDFINY------------------HASDVLETSGWKSMV
310 320 330 340
370 380 390
pF1KE3 QSHPHLVAEAFRALASAQCPQFGIPRKRLKQS
:::::::::.:.::::::: .: ::::::::
XP_016 VSHPHLVAEAYRSLASAQCPFLGPPRKRLKQS
350 360 370
>>NP_001007229 (OMIM: 602650) speckle-type POZ protein [ (374 aa)
initn: 2177 init1: 1932 opt: 1932 Z-score: 2251.2 bits: 425.3 E(85289): 1.2e-118
Smith-Waterman score: 2144; 80.6% identity (91.6% similar) in 392 aa overlap (1-392:1-374)
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pF1KE3 MSREPTPPLPGDMSTGPIAESWCYTQVKVVKFSYMWTINNFSFCREEMGEVLKSSTFSSG
::: :.:: :..::.::.::::::::.::::::::::::::::::::::::.::::::::
NP_001 MSRVPSPPPPAEMSSGPVAESWCYTQIKVVKFSYMWTINNFSFCREEMGEVIKSSTFSSG
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pF1KE3 PSDKMKWCLRVNPKGLDDESKDYLSLYLLLVSCPKSEVRAKFKFSLLNAKREETKAMESQ
.::.::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::: :::::::::
NP_001 ANDKLKWCLRVNPKGLDEESKDYLSLYLLLVSCPKSEVRAKFKFSILNAKGEETKAMESQ
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pF1KE3 RAYRFVQGKDWGFKKFIRRDFLLDEANGLLPDDKLTLFCEVSVVQDSVNISGHTNTNTLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::... : .:
NP_001 RAYRFVQGKDWGFKKFIRRDFLLDEANGLLPDDKLTLFCEVSVVQDSVNISGQNTMNMVK
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pF1KE3 VPECRLAEDLGNLWENTRFTDCSFFVRGQEFKAHKSVLAARSPVFNAMFEHEMEESKKNR
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NP_001 VPECRLADELGGLWENSRFTDCCLCVAGQEFQAHKAILAARSPVFSAMFEHEMEESKKNR
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NP_001 VEINDVEPEVFKEMMCFIYTGKAPNLDKMADDLLAAADKYALERLKVMCEDALCSNLSVE
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pF1KE3 NVADTLVLADLHSAEQLKAQAIDFINRCSVLRQLGCKDGKNWNSNQATDIMETSGWKSMI
:.:. :.:::::::.:::.::.:::: .:.:..::::::::.
NP_001 NAAEILILADLHSADQLKTQAVDFINY------------------HASDVLETSGWKSMV
310 320 330 340
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pF1KE3 QSHPHLVAEAFRALASAQCPQFGIPRKRLKQS
:::::::::.:.::::::: .: ::::::::
NP_001 VSHPHLVAEAYRSLASAQCPFLGPPRKRLKQS
350 360 370
>>XP_005257780 (OMIM: 602650) PREDICTED: speckle-type PO (374 aa)
initn: 2177 init1: 1932 opt: 1932 Z-score: 2251.2 bits: 425.3 E(85289): 1.2e-118
Smith-Waterman score: 2144; 80.6% identity (91.6% similar) in 392 aa overlap (1-392:1-374)
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pF1KE3 MSREPTPPLPGDMSTGPIAESWCYTQVKVVKFSYMWTINNFSFCREEMGEVLKSSTFSSG
::: :.:: :..::.::.::::::::.::::::::::::::::::::::::.::::::::
XP_005 MSRVPSPPPPAEMSSGPVAESWCYTQIKVVKFSYMWTINNFSFCREEMGEVIKSSTFSSG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 PSDKMKWCLRVNPKGLDDESKDYLSLYLLLVSCPKSEVRAKFKFSLLNAKREETKAMESQ
.::.::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::: :::::::::
XP_005 ANDKLKWCLRVNPKGLDEESKDYLSLYLLLVSCPKSEVRAKFKFSILNAKGEETKAMESQ
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pF1KE3 RAYRFVQGKDWGFKKFIRRDFLLDEANGLLPDDKLTLFCEVSVVQDSVNISGHTNTNTLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::... : .:
XP_005 RAYRFVQGKDWGFKKFIRRDFLLDEANGLLPDDKLTLFCEVSVVQDSVNISGQNTMNMVK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 VPECRLAEDLGNLWENTRFTDCSFFVRGQEFKAHKSVLAARSPVFNAMFEHEMEESKKNR
:::::::..::.::::.::::: . : ::::.:::..::::::::.::::::::::::::
XP_005 VPECRLADELGGLWENSRFTDCCLCVAGQEFQAHKAILAARSPVFSAMFEHEMEESKKNR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 VEINDLDPEVFKEMMRFIYTGRAPNLDKMADNLLAAADKYALERLKVMCEEALCSNLSVE
:::::..:::::::: :::::.:::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::
XP_005 VEINDVEPEVFKEMMCFIYTGKAPNLDKMADDLLAAADKYALERLKVMCEDALCSNLSVE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 NVADTLVLADLHSAEQLKAQAIDFINRCSVLRQLGCKDGKNWNSNQATDIMETSGWKSMI
:.:. :.:::::::.:::.::.:::: .:.:..::::::::.
XP_005 NAAEILILADLHSADQLKTQAVDFINY------------------HASDVLETSGWKSMV
310 320 330 340
370 380 390
pF1KE3 QSHPHLVAEAFRALASAQCPQFGIPRKRLKQS
:::::::::.:.::::::: .: ::::::::
XP_005 VSHPHLVAEAYRSLASAQCPFLGPPRKRLKQS
350 360 370
>>NP_001007230 (OMIM: 602650) speckle-type POZ protein [ (374 aa)
initn: 2177 init1: 1932 opt: 1932 Z-score: 2251.2 bits: 425.3 E(85289): 1.2e-118
Smith-Waterman score: 2144; 80.6% identity (91.6% similar) in 392 aa overlap (1-392:1-374)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MSREPTPPLPGDMSTGPIAESWCYTQVKVVKFSYMWTINNFSFCREEMGEVLKSSTFSSG
::: :.:: :..::.::.::::::::.::::::::::::::::::::::::.::::::::
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10 20 30 40 50 60
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.::.::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::: :::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::... : .:
NP_001 RAYRFVQGKDWGFKKFIRRDFLLDEANGLLPDDKLTLFCEVSVVQDSVNISGQNTMNMVK
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:::::::..::.::::.::::: . : ::::.:::..::::::::.::::::::::::::
NP_001 VPECRLADELGGLWENSRFTDCCLCVAGQEFQAHKAILAARSPVFSAMFEHEMEESKKNR
190 200 210 220 230 240
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pF1KE3 VEINDLDPEVFKEMMRFIYTGRAPNLDKMADNLLAAADKYALERLKVMCEEALCSNLSVE
:::::..:::::::: :::::.:::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::
NP_001 VEINDVEPEVFKEMMCFIYTGKAPNLDKMADDLLAAADKYALERLKVMCEDALCSNLSVE
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pF1KE3 NVADTLVLADLHSAEQLKAQAIDFINRCSVLRQLGCKDGKNWNSNQATDIMETSGWKSMI
:.:. :.:::::::.:::.::.:::: .:.:..::::::::.
NP_001 NAAEILILADLHSADQLKTQAVDFINY------------------HASDVLETSGWKSMV
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370 380 390
pF1KE3 QSHPHLVAEAFRALASAQCPQFGIPRKRLKQS
:::::::::.:.::::::: .: ::::::::
NP_001 VSHPHLVAEAYRSLASAQCPFLGPPRKRLKQS
350 360 370
>>NP_003554 (OMIM: 602650) speckle-type POZ protein [Hom (374 aa)
initn: 2177 init1: 1932 opt: 1932 Z-score: 2251.2 bits: 425.3 E(85289): 1.2e-118
Smith-Waterman score: 2144; 80.6% identity (91.6% similar) in 392 aa overlap (1-392:1-374)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MSREPTPPLPGDMSTGPIAESWCYTQVKVVKFSYMWTINNFSFCREEMGEVLKSSTFSSG
::: :.:: :..::.::.::::::::.::::::::::::::::::::::::.::::::::
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.::.::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::: :::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::... : .:
NP_003 RAYRFVQGKDWGFKKFIRRDFLLDEANGLLPDDKLTLFCEVSVVQDSVNISGQNTMNMVK
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pF1KE3 VPECRLAEDLGNLWENTRFTDCSFFVRGQEFKAHKSVLAARSPVFNAMFEHEMEESKKNR
:::::::..::.::::.::::: . : ::::.:::..::::::::.::::::::::::::
NP_003 VPECRLADELGGLWENSRFTDCCLCVAGQEFQAHKAILAARSPVFSAMFEHEMEESKKNR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 VEINDLDPEVFKEMMRFIYTGRAPNLDKMADNLLAAADKYALERLKVMCEEALCSNLSVE
:::::..:::::::: :::::.:::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::
NP_003 VEINDVEPEVFKEMMCFIYTGKAPNLDKMADDLLAAADKYALERLKVMCEDALCSNLSVE
250 260 270 280 290 300
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pF1KE3 NVADTLVLADLHSAEQLKAQAIDFINRCSVLRQLGCKDGKNWNSNQATDIMETSGWKSMI
:.:. :.:::::::.:::.::.:::: .:.:..::::::::.
NP_003 NAAEILILADLHSADQLKTQAVDFINY------------------HASDVLETSGWKSMV
310 320 330 340
370 380 390
pF1KE3 QSHPHLVAEAFRALASAQCPQFGIPRKRLKQS
:::::::::.:.::::::: .: ::::::::
NP_003 VSHPHLVAEAYRSLASAQCPFLGPPRKRLKQS
350 360 370
>>NP_001007231 (OMIM: 602650) speckle-type POZ protein [ (374 aa)
initn: 2177 init1: 1932 opt: 1932 Z-score: 2251.2 bits: 425.3 E(85289): 1.2e-118
Smith-Waterman score: 2144; 80.6% identity (91.6% similar) in 392 aa overlap (1-392:1-374)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MSREPTPPLPGDMSTGPIAESWCYTQVKVVKFSYMWTINNFSFCREEMGEVLKSSTFSSG
::: :.:: :..::.::.::::::::.::::::::::::::::::::::::.::::::::
NP_001 MSRVPSPPPPAEMSSGPVAESWCYTQIKVVKFSYMWTINNFSFCREEMGEVIKSSTFSSG
10 20 30 40 50 60
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pF1KE3 PSDKMKWCLRVNPKGLDDESKDYLSLYLLLVSCPKSEVRAKFKFSLLNAKREETKAMESQ
.::.::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::: :::::::::
NP_001 ANDKLKWCLRVNPKGLDEESKDYLSLYLLLVSCPKSEVRAKFKFSILNAKGEETKAMESQ
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pF1KE3 RAYRFVQGKDWGFKKFIRRDFLLDEANGLLPDDKLTLFCEVSVVQDSVNISGHTNTNTLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::... : .:
NP_001 RAYRFVQGKDWGFKKFIRRDFLLDEANGLLPDDKLTLFCEVSVVQDSVNISGQNTMNMVK
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pF1KE3 VPECRLAEDLGNLWENTRFTDCSFFVRGQEFKAHKSVLAARSPVFNAMFEHEMEESKKNR
:::::::..::.::::.::::: . : ::::.:::..::::::::.::::::::::::::
NP_001 VPECRLADELGGLWENSRFTDCCLCVAGQEFQAHKAILAARSPVFSAMFEHEMEESKKNR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 VEINDLDPEVFKEMMRFIYTGRAPNLDKMADNLLAAADKYALERLKVMCEEALCSNLSVE
:::::..:::::::: :::::.:::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::
NP_001 VEINDVEPEVFKEMMCFIYTGKAPNLDKMADDLLAAADKYALERLKVMCEDALCSNLSVE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 NVADTLVLADLHSAEQLKAQAIDFINRCSVLRQLGCKDGKNWNSNQATDIMETSGWKSMI
:.:. :.:::::::.:::.::.:::: .:.:..::::::::.
NP_001 NAAEILILADLHSADQLKTQAVDFINY------------------HASDVLETSGWKSMV
310 320 330 340
370 380 390
pF1KE3 QSHPHLVAEAFRALASAQCPQFGIPRKRLKQS
:::::::::.:.::::::: .: ::::::::
NP_001 VSHPHLVAEAYRSLASAQCPFLGPPRKRLKQS
350 360 370
>>XP_005257781 (OMIM: 602650) PREDICTED: speckle-type PO (374 aa)
initn: 2177 init1: 1932 opt: 1932 Z-score: 2251.2 bits: 425.3 E(85289): 1.2e-118
Smith-Waterman score: 2144; 80.6% identity (91.6% similar) in 392 aa overlap (1-392:1-374)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MSREPTPPLPGDMSTGPIAESWCYTQVKVVKFSYMWTINNFSFCREEMGEVLKSSTFSSG
::: :.:: :..::.::.::::::::.::::::::::::::::::::::::.::::::::
XP_005 MSRVPSPPPPAEMSSGPVAESWCYTQIKVVKFSYMWTINNFSFCREEMGEVIKSSTFSSG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 PSDKMKWCLRVNPKGLDDESKDYLSLYLLLVSCPKSEVRAKFKFSLLNAKREETKAMESQ
.::.::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:::: :::::::::
XP_005 ANDKLKWCLRVNPKGLDEESKDYLSLYLLLVSCPKSEVRAKFKFSILNAKGEETKAMESQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 RAYRFVQGKDWGFKKFIRRDFLLDEANGLLPDDKLTLFCEVSVVQDSVNISGHTNTNTLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::... : .:
XP_005 RAYRFVQGKDWGFKKFIRRDFLLDEANGLLPDDKLTLFCEVSVVQDSVNISGQNTMNMVK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 VPECRLAEDLGNLWENTRFTDCSFFVRGQEFKAHKSVLAARSPVFNAMFEHEMEESKKNR
:::::::..::.::::.::::: . : ::::.:::..::::::::.::::::::::::::
XP_005 VPECRLADELGGLWENSRFTDCCLCVAGQEFQAHKAILAARSPVFSAMFEHEMEESKKNR
190 200 210 220 230 240
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pF1KE3 VEINDLDPEVFKEMMRFIYTGRAPNLDKMADNLLAAADKYALERLKVMCEEALCSNLSVE
:::::..:::::::: :::::.:::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::
XP_005 VEINDVEPEVFKEMMCFIYTGKAPNLDKMADDLLAAADKYALERLKVMCEDALCSNLSVE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 NVADTLVLADLHSAEQLKAQAIDFINRCSVLRQLGCKDGKNWNSNQATDIMETSGWKSMI
:.:. :.:::::::.:::.::.:::: .:.:..::::::::.
XP_005 NAAEILILADLHSADQLKTQAVDFINY------------------HASDVLETSGWKSMV
310 320 330 340
370 380 390
pF1KE3 QSHPHLVAEAFRALASAQCPQFGIPRKRLKQS
:::::::::.:.::::::: .: ::::::::
XP_005 VSHPHLVAEAYRSLASAQCPFLGPPRKRLKQS
350 360 370
>>XP_016867929 (OMIM: 611119,612943,617055) PREDICTED: k (325 aa)
initn: 244 init1: 244 opt: 262 Z-score: 309.8 bits: 65.9 E(85289): 1.6e-10
Smith-Waterman score: 262; 34.1% identity (68.1% similar) in 138 aa overlap (190-327:34-171)
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 EVSVVQDSVNISGHTNTNTLKVPECRLAEDLGNLWENTRFTDCSFFVRGQEFKAHKSVLA
..:. .. . : ..:. ... ::. :::
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pF1KE3 ARSPVFNAMFEHEMEESKKNRVEINDLDPEVFKEMMRFIYTGRAPNLDKMADNLLAAADK
: : :: :: .: :::. .::..: .:........: ::.: .. ...:: ::..
XP_016 AASHFFNLMFTTNMLESKSFEVELKDAEPDIIEQLVEFAYTARISVNSNNVQSLLDAANQ
70 80 90 100 110 120
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pF1KE3 YALERLKVMCEEALCSNLSVENVADTLVLADLHSAEQLKAQAIDFINRCSVLRQLGCKDG
: .: .: :: . : .... : :::. . .::: : :::..
XP_016 YQIEPVKKMCVDFLKEQVDASNCLGISVLAECLDCPELKATADDFIHQHFTEVYKTDEFL
130 140 150 160 170 180
340 350 360 370 380 390
pF1KE3 KNWNSNQATDIMETSGWKSMIQSHPHLVAEAFRALASAQCPQFGIPRKRLKQS
XP_016 QLDVKRVTHLLNQDTLTVRAEDQVYDAAVRWLKYDEPNRQPFMVDILAKVRFPLISKNFL
190 200 210 220 230 240
392 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 08:24:21 2016 done: Sun Nov 6 08:24:22 2016
Total Scan time: 7.100 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]