FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB4854, 1226 aa 1>>>pF1KB4854 1226 - 1226 aa - 1226 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.2377+/-0.000999; mu= -3.6602+/- 0.061 mean_var=280.4619+/-57.004, 0's: 0 Z-trim(113.9): 48 B-trim: 37 in 1/52 Lambda= 0.076584 statistics sampled from 14412 (14452) to 14412 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.739), E-opt: 0.2 (0.444), width: 16 Scan time: 4.510 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS42723.1 AFF3 gene_id:3899|Hs108|chr2 (1226) 8159 915.6 0 CCDS33258.1 AFF3 gene_id:3899|Hs108|chr2 (1251) 8034 901.8 0 CCDS54775.1 AFF1 gene_id:4299|Hs108|chr4 (1218) 1312 159.1 6.4e-38 CCDS3616.1 AFF1 gene_id:4299|Hs108|chr4 (1210) 1307 158.5 9.3e-38 CCDS4164.1 AFF4 gene_id:27125|Hs108|chr5 (1163) 1142 140.3 2.8e-32 CCDS76040.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX (1276) 1005 125.1 1.1e-27 CCDS55521.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX ( 952) 771 99.2 5.1e-20 CCDS78510.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX (1276) 771 99.3 6.6e-20 CCDS14684.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX (1311) 771 99.3 6.7e-20 >>CCDS42723.1 AFF3 gene_id:3899|Hs108|chr2 (1226 aa) initn: 8159 init1: 8159 opt: 8159 Z-score: 4882.7 bits: 915.6 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 8159; 99.9% identity (100.0% similar) in 1226 aa overlap (1-1226:1-1226) 10 20 30 40 50 60 pF1KB4 MDSFDLALLQEWDLESLCVYEPDRNALRRKERERRNQETQQDDGTFNSSYSLFSEPYKTN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 MDSFDLALLQEWDLESLCVYEPDRNALRRKERERRNQETQQDDGTFNSSYSLFSEPYKTN 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB4 KGDELSNRIQNTLGNYDEMKDFLTDRSNQSHLVGVPKPGVPQTPVNKIDEHFVADSRAQN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 KGDELSNRIQNTLGNYDEMKDFLTDRSNQSHLVGVPKPGVPQTPVNKIDEHFVADSRAQN 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB4 QPSSICSTTTSTPAAVPVQQSKRGTMGWQKAGHPPSDGQQRATQQGSLRTLLGDGVGRQQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 QPSSICSTTTSTPAAVPVQQSKRGTMGWQKAGHPPSDGQQRATQQGSLRTLLGDGVGRQQ 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB4 PRAKQVCNVEVGLQTQERPPAMAAKHSSSGHCVQNFPPSLASKPSLVQQKPTAYVRPMDG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 PRAKQVCNVEVGLQTQERPPAMAAKHSSSGHCVQNFPPSLASKPSLVQQKPTAYVRPMDG 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB4 QDQAPDESPKLKSSSETSVHCTSYRGVPASKPEPARAKAKLSKFSIPKQGEESRSGETNS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 QDQAPDESPKLKSSSETSVHCTSYRGVPASKPEPARAKAKLSKFSIPKQGEESRSGETNS 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB4 CVEEIIREMTWLPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPNKDSQLVSSGHNNPKKGDAEPESPDNGT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 CVEEIIREMTWLPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPNKDSQLVSSGHNNPKKGDAEPESPDNGT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB4 SNTSMLEDDLKLSSDEEENEQQAAQRTALRALSDSAVVQQPNCRTSVPSSKGSSSSSSSG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 SNTSMLEDDLKLSSDEEENEQQAAQRTALRALSDSAVVQQPNCRTSVPSSKGSSSSSSSG 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB4 SSSSSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSKPPHFSSPEAEPASSNKWQLDKWLNKVNPHKP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 SSSSSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSKPPHFSSPEAEPASSNKWQLDKWLNKVNPHKP 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB4 PILIQNESHGSESSQYYNPVKEDVQDCGKVPDVCQPSLREKEIKSTCKEEQRPRTANKAP :::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 PILIQNESHGSESNQYYNPVKEDVQDCGKVPDVCQPSLREKEIKSTCKEEQRPRTANKAP 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KB4 GSKGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPAVPCAPAENAPAPARRSAGKKPTRRTERTSAGDGA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 GSKGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPAVPCAPAENAPAPARRSAGKKPTRRTERTSAGDGA 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KB4 NCHRPEEPAAADALGTSVVVPPEPTKTRPCGNNRASHRKELRSSVTCEKRRTRGLSRIVP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 NCHRPEEPAAADALGTSVVVPPEPTKTRPCGNNRASHRKELRSSVTCEKRRTRGLSRIVP 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KB4 KSKEFIETESSSSSSSSDSDLESEQEEYPLSKAQTVAASASSGNDQRLKEAAANGGSGPR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 KSKEFIETESSSSSSSSDSDLESEQEEYPLSKAQTVAASASSGNDQRLKEAAANGGSGPR 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KB4 APVGSINARTTSDIAKELEEQFYTLVPFGRNELLSPLKDSDEIRSLWVKIDLTLLSRIPE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 APVGSINARTTSDIAKELEEQFYTLVPFGRNELLSPLKDSDEIRSLWVKIDLTLLSRIPE 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KB4 HLPQEPGVLSAPATKDSESAPPSHTSDTPAEKALPKSKRKRKCDNEDDYREIKKSQGEKD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 HLPQEPGVLSAPATKDSESAPPSHTSDTPAEKALPKSKRKRKCDNEDDYREIKKSQGEKD 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 pF1KB4 SSSRLATSTSNTLSANHCNMNINSVAIPINKNEKMLRSPISPLSDASKHKYTSEDLTSSS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 SSSRLATSTSNTLSANHCNMNINSVAIPINKNEKMLRSPISPLSDASKHKYTSEDLTSSS 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 pF1KB4 RPNGNSLFTSASSSKKPKADSQLQPHGGDLTKAAHNNSENIPLHKSRPQTKPWSPGSNGH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 RPNGNSLFTSASSSKKPKADSQLQPHGGDLTKAAHNNSENIPLHKSRPQTKPWSPGSNGH 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KB4 RDCKRQKLVFDDMPRSADYFMQEAKRMKHKADAMVEKFGKALNYAEAALSFIECGNAMEQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 RDCKRQKLVFDDMPRSADYFMQEAKRMKHKADAMVEKFGKALNYAEAALSFIECGNAMEQ 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KB4 GPMESKSPYTMYSETVELIRYAMRLKTHSGPNATPEDKQLAALCYRCLALLYWRMFRLKR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 GPMESKSPYTMYSETVELIRYAMRLKTHSGPNATPEDKQLAALCYRCLALLYWRMFRLKR 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KB4 DHAVKYSKALIDYFKNSSKAAQAPSPWGASGKSTGTPSPMSPNPSPASSVGSQGSLSNAS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 DHAVKYSKALIDYFKNSSKAAQAPSPWGASGKSTGTPSPMSPNPSPASSVGSQGSLSNAS 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KB4 ALSPSTIVSIPQRIHQMAANHVSITNSILHSYDYWEMADNLAKENREFFNDLDLLMGPVT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS42 ALSPSTIVSIPQRIHQMAANHVSITNSILHSYDYWEMADNLAKENREFFNDLDLLMGPVT 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KB4 LHSSMEHLVQYSQQGLHWLRNSAHLS :::::::::::::::::::::::::: CCDS42 LHSSMEHLVQYSQQGLHWLRNSAHLS 1210 1220 >>CCDS33258.1 AFF3 gene_id:3899|Hs108|chr2 (1251 aa) initn: 8132 init1: 8033 opt: 8034 Z-score: 4807.9 bits: 901.8 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 8089; 97.9% identity (98.0% similar) in 1251 aa overlap (1-1226:1-1251) 10 20 30 pF1KB4 MDSFDLALLQEWDLESL-----------------------C--VYEPDRNALRRKERERR ::::::::::::::::: : ::::::::::::::::: CCDS33 MDSFDLALLQEWDLESLWGEDILNQRNDSLVVEFQSSASRCRSVYEPDRNALRRKERERR 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KB4 NQETQQDDGTFNSSYSLFSEPYKTNKGDELSNRIQNTLGNYDEMKDFLTDRSNQSHLVGV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 NQETQQDDGTFNSSYSLFSEPYKTNKGDELSNRIQNTLGNYDEMKDFLTDRSNQSHLVGV 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KB4 PKPGVPQTPVNKIDEHFVADSRAQNQPSSICSTTTSTPAAVPVQQSKRGTMGWQKAGHPP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 PKPGVPQTPVNKIDEHFVADSRAQNQPSSICSTTTSTPAAVPVQQSKRGTMGWQKAGHPP 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KB4 SDGQQRATQQGSLRTLLGDGVGRQQPRAKQVCNVEVGLQTQERPPAMAAKHSSSGHCVQN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 SDGQQRATQQGSLRTLLGDGVGRQQPRAKQVCNVEVGLQTQERPPAMAAKHSSSGHCVQN 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KB4 FPPSLASKPSLVQQKPTAYVRPMDGQDQAPDESPKLKSSSETSVHCTSYRGVPASKPEPA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 FPPSLASKPSLVQQKPTAYVRPMDGQDQAPDESPKLKSSSETSVHCTSYRGVPASKPEPA 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KB4 RAKAKLSKFSIPKQGEESRSGETNSCVEEIIREMTWLPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPNKD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 RAKAKLSKFSIPKQGEESRSGETNSCVEEIIREMTWLPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPNKD 310 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 390 pF1KB4 SQLVSSGHNNPKKGDAEPESPDNGTSNTSMLEDDLKLSSDEEENEQQAAQRTALRALSDS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 SQLVSSGHNNPKKGDAEPESPDNGTSNTSMLEDDLKLSSDEEENEQQAAQRTALRALSDS 370 380 390 400 410 420 400 410 420 430 440 450 pF1KB4 AVVQQPNCRTSVPSSKGSSSSSSSGSSSSSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSKPPHFSS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 AVVQQPNCRTSVPSSKGSSSSSSSGSSSSSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSKPPHFSS 430 440 450 460 470 480 460 470 480 490 500 510 pF1KB4 PEAEPASSNKWQLDKWLNKVNPHKPPILIQNESHGSESSQYYNPVKEDVQDCGKVPDVCQ ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::: CCDS33 PEAEPASSNKWQLDKWLNKVNPHKPPILIQNESHGSESNQYYNPVKEDVQDCGKVPDVCQ 490 500 510 520 530 540 520 530 540 550 560 570 pF1KB4 PSLREKEIKSTCKEEQRPRTANKAPGSKGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPAVPCAPAENA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 PSLREKEIKSTCKEEQRPRTANKAPGSKGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPAVPCAPAENA 550 560 570 580 590 600 580 590 600 610 620 630 pF1KB4 PAPARRSAGKKPTRRTERTSAGDGANCHRPEEPAAADALGTSVVVPPEPTKTRPCGNNRA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 PAPARRSAGKKPTRRTERTSAGDGANCHRPEEPAAADALGTSVVVPPEPTKTRPCGNNRA 610 620 630 640 650 660 640 650 660 670 680 690 pF1KB4 SHRKELRSSVTCEKRRTRGLSRIVPKSKEFIETESSSSSSSSDSDLESEQEEYPLSKAQT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 SHRKELRSSVTCEKRRTRGLSRIVPKSKEFIETESSSSSSSSDSDLESEQEEYPLSKAQT 670 680 690 700 710 720 700 710 720 730 740 750 pF1KB4 VAASASSGNDQRLKEAAANGGSGPRAPVGSINARTTSDIAKELEEQFYTLVPFGRNELLS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 VAASASSGNDQRLKEAAANGGSGPRAPVGSINARTTSDIAKELEEQFYTLVPFGRNELLS 730 740 750 760 770 780 760 770 780 790 800 810 pF1KB4 PLKDSDEIRSLWVKIDLTLLSRIPEHLPQEPGVLSAPATKDSESAPPSHTSDTPAEKALP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 PLKDSDEIRSLWVKIDLTLLSRIPEHLPQEPGVLSAPATKDSESAPPSHTSDTPAEKALP 790 800 810 820 830 840 820 830 840 850 860 870 pF1KB4 KSKRKRKCDNEDDYREIKKSQGEKDSSSRLATSTSNTLSANHCNMNINSVAIPINKNEKM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 KSKRKRKCDNEDDYREIKKSQGEKDSSSRLATSTSNTLSANHCNMNINSVAIPINKNEKM 850 860 870 880 890 900 880 890 900 910 920 930 pF1KB4 LRSPISPLSDASKHKYTSEDLTSSSRPNGNSLFTSASSSKKPKADSQLQPHGGDLTKAAH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 LRSPISPLSDASKHKYTSEDLTSSSRPNGNSLFTSASSSKKPKADSQLQPHGGDLTKAAH 910 920 930 940 950 960 940 950 960 970 980 990 pF1KB4 NNSENIPLHKSRPQTKPWSPGSNGHRDCKRQKLVFDDMPRSADYFMQEAKRMKHKADAMV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 NNSENIPLHKSRPQTKPWSPGSNGHRDCKRQKLVFDDMPRSADYFMQEAKRMKHKADAMV 970 980 990 1000 1010 1020 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KB4 EKFGKALNYAEAALSFIECGNAMEQGPMESKSPYTMYSETVELIRYAMRLKTHSGPNATP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 EKFGKALNYAEAALSFIECGNAMEQGPMESKSPYTMYSETVELIRYAMRLKTHSGPNATP 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KB4 EDKQLAALCYRCLALLYWRMFRLKRDHAVKYSKALIDYFKNSSKAAQAPSPWGASGKSTG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 EDKQLAALCYRCLALLYWRMFRLKRDHAVKYSKALIDYFKNSSKAAQAPSPWGASGKSTG 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KB4 TPSPMSPNPSPASSVGSQGSLSNASALSPSTIVSIPQRIHQMAANHVSITNSILHSYDYW :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 TPSPMSPNPSPASSVGSQGSLSNASALSPSTIVSIPQRIHQMAANHVSITNSILHSYDYW 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KB4 EMADNLAKENREFFNDLDLLMGPVTLHSSMEHLVQYSQQGLHWLRNSAHLS ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 EMADNLAKENREFFNDLDLLMGPVTLHSSMEHLVQYSQQGLHWLRNSAHLS 1210 1220 1230 1240 1250 >>CCDS54775.1 AFF1 gene_id:4299|Hs108|chr4 (1218 aa) initn: 1524 init1: 449 opt: 1312 Z-score: 794.3 bits: 159.1 E(32554): 6.4e-38 Smith-Waterman score: 1942; 34.8% identity (60.3% similar) in 1292 aa overlap (19-1220:14-1212) 10 20 30 40 50 60 pF1KB4 MDSFDLALLQEWDLESLCVYEPDRNALRRKERERRNQETQQDDGTFNSSYSLFSEPYKTN .:. ::: :: .:.::::::..:. .: . ::.::::: CCDS54 MAFTERVNSSGNSLYNDDRNLLRIREKERRNQEAHQEKEAFPEKIPLFGEPYKTA 10 20 30 40 50 70 80 90 100 pF1KB4 KGDELSNRIQNTLGNYDEMKDFLTDRSNQSHL------VGVPK-PGVP------------ ::::::.:::: ::::.:.:.::. .:. .: .: :: : .: CCDS54 KGDELSSRIQNMLGNYEEVKEFLSTKSHTHRLDASENRLGKPKYPLIPDKGSSIPSSSFH 60 70 80 90 100 110 110 120 130 140 pF1KB4 --------QTP------VNKIDEHF-VADSRAQNQPSSICSTTTSTPAAVPVQQSKRGTM .:: :..:... .:. :.. .:: . . . . : . . :.. : CCDS54 TSVHHQSIHTPASGPLSVGNISHNPKMAQPRTEPMPS-LHAKSCGPPDSQHLTQDRLGQE 120 130 140 150 160 170 150 160 170 180 190 200 pF1KB4 GW----QKAGHPPSDGQQRATQQGSL-RTLLGDGVGRQQPRAKQVCNVEVGLQTQERPPA :. .: : .::.. :. : . :. .. .: . . .. . :: : . CCDS54 GFGSSHHKKGDRRADGDHCASVTDSAPERELSPLISLPSP-VPPLSPIHSNQQTLPRTQG 180 190 200 210 220 230 210 220 pF1KB4 MAAKHSSS----GHC-----------------------------VQNFPP-SLASKPSLV . :.:: :.: :.::: :: :: . CCDS54 SSKVHGSSNNSKGYCPAKSPKDLAVKVHDKETPQDSLVAPAQPPSQTFPPPSLPSKSVAM 240 250 260 270 280 290 230 240 250 260 270 280 pF1KB4 QQKPTAYVRPMDGQDQAPDESPKLKSSSETSVHCTSYRGVPASKPE-PARAKAKLSKFSI ::::::::::::::::::.:::.:: : .:: : . . :::::.:... CCDS54 QQKPTAYVRPMDGQDQAPSESPELKPLPE------DYRQQTFEKTDLKVPAKAKLTKLKM 300 310 320 330 340 290 300 310 320 330 340 pF1KB4 PKQG-EESRSGETNSCVEEIIREMT--WLPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPNKDSQLVSSGH :.:. :.. :.:.. :::::..::: : :::.::..:. .::.:::::.:::: ::: CCDS54 PSQSVEQTYSNEVH-CVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFPFPTKDSQHVSSVT 350 360 370 380 390 400 350 360 370 380 390 400 pF1KB4 NNPKKGDAEPESPDNGTSNTS-MLEDDLKLSSDEEENEQQAAQRTALRALSDSAVVQQPN .: :. :. .. .:. ..:: ::::::.::..:. . .:. .. :.:: :. CCDS54 QNQKQYDTSSKTHSNSQQGTSSMLEDDLQLSDSEDSDSEQTPEKPP----SSSA---PPS 410 420 430 440 450 410 420 430 440 450 460 pF1KB4 CRTSVPSSKGSSSSSSSGSSSSSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSKPPHFSSPEAEPAS :.: .:. :::. : :.:::.::: :::.:::::.:: ..: . .:: :: . CCDS54 APQSLPEPV-ASAHSSSAESESTSDSDSSS--DSESESSSSDSEENEPLETPAPEPEPPT 460 470 480 490 500 510 470 480 490 500 510 520 pF1KB4 SNKWQLDKWLNKVN-PHKPPILIQNESHGSESSQYYNPVKEDVQDCGKVPDVCQPSLREK .::::::.::.::. : :: .: .:.. : .. .. :. . : . CCDS54 TNKWQLDNWLTKVSQPAAPP-------EGPRSTE---PPRRHPESKGS-----SDSATSQ 520 530 540 550 560 530 540 550 560 570 pF1KB4 EIKSTCKEEQRPRTANKAPGSKGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPAV-PC--APAENAPAP : .: :. :....::: ..:: : : :. : .::.. : : CCDS54 E-HSESKDPP-PKSSSKAP-------RAPPEA---------PHPGKRSCQKSPAQQEP-P 570 580 590 600 580 590 600 610 620 630 pF1KB4 ARRSAGKKPTRRTERTSA--GDGANCHRPEEPAAADALGTSVVVPPEPTKTRPCGNNRAS :...: : .. ..:: :. .. . .::. :. . . :.. : ::. CCDS54 QRQTVGTKQPKKPVKASARAGSRTSLQGEREPGLLP-YGSRDQTSKDKPKVKTKGRPRAA 610 620 630 640 650 660 640 650 660 670 680 690 pF1KB4 HRKELRSSVTCEKRRTRGLSRIVPKSKEFIETESSSSSSSSDSDLESEQEEYPLSKAQTV .: . .: ... . : . :: . :. ..:. . :.. : : CCDS54 ASNEPKPAVPPSSEKKKHKSSLPAPSKAL-----SGPEPAKDNVEDRTPEHFAL-----V 670 680 690 700 710 700 710 720 730 740 750 pF1KB4 AASASSGNDQRLKEAAANGGSGPRAPVGSINARTTSDIAKELEEQFYTLVPFGRNELLSP . :.: ..::: :. : .: ...: .. .:. ..:::: CCDS54 PLTESQG--------PPHSGSGSRTS-GCRQAV----VVQEDSRKDRLPLPLRDTKLLSP 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 pF1KB4 LKDSDEIRSLWVKIDLTLLSRIPEHLPQEPGVLSAPATKDSESAPPS---HTSDTPAEKA :.:. .:: ::: : ::::: :: :: : : .. ::. :.:. . . CCDS54 LRDTPPPQSLMVKITLDLLSRI----PQPPGKGSRQ-RKAEDKQPPAGKKHSSEKRSSDS 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 pF1KB4 LPKSKRKRKCDNEDDYREIKKSQGEKDSSSRLATSTSNTLSANHCNMNINSVAIPINKNE : .::: . : : . :: . ::. .:. ..:.:. : . . .. . : ... CCDS54 SSKLAKKRKGEAERDC-DNKKIRLEKEIKSQSSSSSSS-----HKESSKTKPSRPSSQSS 820 830 840 850 860 880 890 900 910 920 930 pF1KB4 KMLRSPISPLSDASKHKYTSEDLTSSSRPN---GNSLFTSASSSKKPKADSQLQPHGGDL : : :.:..:. : .. : : : :.. ::::.:. . ::.. . CCDS54 KKEMLPPPPVSSSSQ-KPAKPALKRSRREADTCGQDPPKSASSTKSNHKDSSIPKQRRVE 870 880 890 900 910 920 940 950 960 970 980 990 pF1KB4 TKAAHNNSENIPLHKSRPQTKPWSPGSNGHRDCKRQKLVFDDMPRSADYFMQEAKRMKHK :.....::. . . : ::. . .. :: ..:: :.:::.::.: CCDS54 GKGSRSSSEHKGSSGDTANPFPVPSLPNGNSKPGKPQVKFDK--QQADLHMREAKKMKQK 930 940 950 960 970 980 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KB4 ADAMVEKFGKALNYAEAALSFIECGNAMEQGPMESKSPYTMYSETVELIRYAMRLKTHSG :. :... :::..: ::.::::::: : :. . ::: :..:::::.::.. : ::. : CCDS54 AELMTDRVGKAFKYLEAVLSFIECGIATESESQSSKSAYSVYSETVDLIKFIMSLKSFSD 990 1000 1010 1020 1030 1040 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KB4 PNATPEDKQLAALCYRCLALLYWRMFRLKRDHAVKYSKALIDYFKNSSKAAQAPSPWGAS .: ..: .:.::.:: ..: ::: :.: :.:::..: .:..:::.:::::: CCDS54 ATAPTQEKIFAVLCMRCQSILNMAMFRCKKDIAIKYSRTLNKHFESSSKVAQAPSP--CI 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KB4 GKSTGTPSPMSPNPSPASSVGSQGSLSNASALSPSTIVSIPQRIHQMAANHVSITNSILH ..:::::::.:: ::::::::::.: ..... . .. .: : :..:....:.::. .: CCDS54 ARSTGTPSPLSPMPSPASSVGSQSSAGSVGSSGVAATISTPVTIQNMTSSYVTITSHVLT 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KB4 SYDYWEMADNLAKENREFFNDLDLLMGPVTLHSSMEHLVQYSQQGLHWLRNSAHLS ..: ::.:. :...:.::: :. . ..:.::. ::.:..::.. :. CCDS54 AFDLWEQAEALTRKNKEFFARLSTNVCTLALNSSLVDLVHYTRQGFQQLQELTKTP 1170 1180 1190 1200 1210 >>CCDS3616.1 AFF1 gene_id:4299|Hs108|chr4 (1210 aa) initn: 1560 init1: 485 opt: 1307 Z-score: 791.3 bits: 158.5 E(32554): 9.3e-38 Smith-Waterman score: 1937; 34.9% identity (60.2% similar) in 1292 aa overlap (19-1220:7-1204) 10 20 30 40 50 60 pF1KB4 MDSFDLALLQEWDLESLCVYEPDRNALRRKERERRNQETQQDDGTFNSSYSLFSEPYKTN .:. ::: :: .:.::::::..:. .: . ::.::::: CCDS36 MAAQSSLYNDDRNLLRIREKERRNQEAHQEKEAFPEKIPLFGEPYKTA 10 20 30 40 70 80 90 100 pF1KB4 KGDELSNRIQNTLGNYDEMKDFLTDRSNQSHL------VGVPK-PGVP------------ ::::::.:::: ::::.:.:.::. .:. .: .: :: : .: CCDS36 KGDELSSRIQNMLGNYEEVKEFLSTKSHTHRLDASENRLGKPKYPLIPDKGSSIPSSSFH 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 pF1KB4 --------QTP------VNKIDEHF-VADSRAQNQPSSICSTTTSTPAAVPVQQSKRGTM .:: :..:... .:. :.. .:: . . . . : . . :.. : CCDS36 TSVHHQSIHTPASGPLSVGNISHNPKMAQPRTEPMPS-LHAKSCGPPDSQHLTQDRLGQE 110 120 130 140 150 160 150 160 170 180 190 200 pF1KB4 GW----QKAGHPPSDGQQRATQQGSL-RTLLGDGVGRQQPRAKQVCNVEVGLQTQERPPA :. .: : .::.. :. : . :. .. .: . . .. . :: : . CCDS36 GFGSSHHKKGDRRADGDHCASVTDSAPERELSPLISLPSP-VPPLSPIHSNQQTLPRTQG 170 180 190 200 210 220 210 220 pF1KB4 MAAKHSSS----GHC-----------------------------VQNFPP-SLASKPSLV . :.:: :.: :.::: :: :: . CCDS36 SSKVHGSSNNSKGYCPAKSPKDLAVKVHDKETPQDSLVAPAQPPSQTFPPPSLPSKSVAM 230 240 250 260 270 280 230 240 250 260 270 280 pF1KB4 QQKPTAYVRPMDGQDQAPDESPKLKSSSETSVHCTSYRGVPASKPE-PARAKAKLSKFSI ::::::::::::::::::.:::.:: : .:: : . . :::::.:... CCDS36 QQKPTAYVRPMDGQDQAPSESPELKPLPE------DYRQQTFEKTDLKVPAKAKLTKLKM 290 300 310 320 330 340 290 300 310 320 330 340 pF1KB4 PKQG-EESRSGETNSCVEEIIREMT--WLPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPNKDSQLVSSGH :.:. :.. :.:.. :::::..::: : :::.::..:. .::.:::::.:::: ::: CCDS36 PSQSVEQTYSNEVH-CVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFPFPTKDSQHVSSVT 350 360 370 380 390 350 360 370 380 390 400 pF1KB4 NNPKKGDAEPESPDNGTSNTS-MLEDDLKLSSDEEENEQQAAQRTALRALSDSAVVQQPN .: :. :. .. .:. ..:: ::::::.::..:. . .:. .. :.:: :. CCDS36 QNQKQYDTSSKTHSNSQQGTSSMLEDDLQLSDSEDSDSEQTPEKPP----SSSA---PPS 400 410 420 430 440 450 410 420 430 440 450 460 pF1KB4 CRTSVPSSKGSSSSSSSGSSSSSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSKPPHFSSPEAEPAS :.: .:. :::. : :.:::.::: :::.:::::.:: ..: . .:: :: . CCDS36 APQSLPEPV-ASAHSSSAESESTSDSDSSS--DSESESSSSDSEENEPLETPAPEPEPPT 460 470 480 490 500 470 480 490 500 510 520 pF1KB4 SNKWQLDKWLNKVN-PHKPPILIQNESHGSESSQYYNPVKEDVQDCGKVPDVCQPSLREK .::::::.::.::. : :: .: .:.. : .. .. :. . : . CCDS36 TNKWQLDNWLTKVSQPAAPP-------EGPRSTE---PPRRHPESKGS-----SDSATSQ 510 520 530 540 550 530 540 550 560 570 pF1KB4 EIKSTCKEEQRPRTANKAPGSKGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPAV-PC--APAENAPAP : .: :. :....::: ..:: : : :. : .::.. : : CCDS36 E-HSESKDPP-PKSSSKAP-------RAPPEA---------PHPGKRSCQKSPAQQEP-P 560 570 580 590 580 590 600 610 620 630 pF1KB4 ARRSAGKKPTRRTERTSA--GDGANCHRPEEPAAADALGTSVVVPPEPTKTRPCGNNRAS :...: : .. ..:: :. .. . .::. :. . . :.. : ::. CCDS36 QRQTVGTKQPKKPVKASARAGSRTSLQGEREPGLLP-YGSRDQTSKDKPKVKTKGRPRAA 600 610 620 630 640 650 640 650 660 670 680 690 pF1KB4 HRKELRSSVTCEKRRTRGLSRIVPKSKEFIETESSSSSSSSDSDLESEQEEYPLSKAQTV .: . .: ... . : . :: . :. ..:. . :.. : : CCDS36 ASNEPKPAVPPSSEKKKHKSSLPAPSKAL-----SGPEPAKDNVEDRTPEHFAL-----V 660 670 680 690 700 700 710 720 730 740 750 pF1KB4 AASASSGNDQRLKEAAANGGSGPRAPVGSINARTTSDIAKELEEQFYTLVPFGRNELLSP . :.: ..::: :. : .: ...: .. .:. ..:::: CCDS36 PLTESQG--------PPHSGSGSRTS-GCRQAV----VVQEDSRKDRLPLPLRDTKLLSP 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 pF1KB4 LKDSDEIRSLWVKIDLTLLSRIPEHLPQEPGVLSAPATKDSESAPPS---HTSDTPAEKA :.:. .:: ::: : ::::: :: :: : : .. ::. :.:. . . CCDS36 LRDTPPPQSLMVKITLDLLSRI----PQPPGKGSRQ-RKAEDKQPPAGKKHSSEKRSSDS 760 770 780 790 800 820 830 840 850 860 870 pF1KB4 LPKSKRKRKCDNEDDYREIKKSQGEKDSSSRLATSTSNTLSANHCNMNINSVAIPINKNE : .::: . : : . :: . ::. .:. ..:.:. : . . .. . : ... CCDS36 SSKLAKKRKGEAERDC-DNKKIRLEKEIKSQSSSSSSS-----HKESSKTKPSRPSSQSS 810 820 830 840 850 860 880 890 900 910 920 930 pF1KB4 KMLRSPISPLSDASKHKYTSEDLTSSSRPN---GNSLFTSASSSKKPKADSQLQPHGGDL : : :.:..:. : .. : : : :.. ::::.:. . ::.. . CCDS36 KKEMLPPPPVSSSSQ-KPAKPALKRSRREADTCGQDPPKSASSTKSNHKDSSIPKQRRVE 870 880 890 900 910 940 950 960 970 980 990 pF1KB4 TKAAHNNSENIPLHKSRPQTKPWSPGSNGHRDCKRQKLVFDDMPRSADYFMQEAKRMKHK :.....::. . . : ::. . .. :: ..:: :.:::.::.: CCDS36 GKGSRSSSEHKGSSGDTANPFPVPSLPNGNSKPGKPQVKFDK--QQADLHMREAKKMKQK 920 930 940 950 960 970 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KB4 ADAMVEKFGKALNYAEAALSFIECGNAMEQGPMESKSPYTMYSETVELIRYAMRLKTHSG :. :... :::..: ::.::::::: : :. . ::: :..:::::.::.. : ::. : CCDS36 AELMTDRVGKAFKYLEAVLSFIECGIATESESQSSKSAYSVYSETVDLIKFIMSLKSFSD 980 990 1000 1010 1020 1030 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KB4 PNATPEDKQLAALCYRCLALLYWRMFRLKRDHAVKYSKALIDYFKNSSKAAQAPSPWGAS .: ..: .:.::.:: ..: ::: :.: :.:::..: .:..:::.:::::: :: CCDS36 ATAPTQEKIFAVLCMRCQSILNMAMFRCKKDIAIKYSRTLNKHFESSSKVAQAPSPCIAS 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KB4 GKSTGTPSPMSPNPSPASSVGSQGSLSNASALSPSTIVSIPQRIHQMAANHVSITNSILH ::::::.:: ::::::::::.: ..... . .. .: : :..:....:.::. .: CCDS36 ---TGTPSPLSPMPSPASSVGSQSSAGSVGSSGVAATISTPVTIQNMTSSYVTITSHVLT 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KB4 SYDYWEMADNLAKENREFFNDLDLLMGPVTLHSSMEHLVQYSQQGLHWLRNSAHLS ..: ::.:. :...:.::: :. . ..:.::. ::.:..::.. :. CCDS36 AFDLWEQAEALTRKNKEFFARLSTNVCTLALNSSLVDLVHYTRQGFQQLQELTKTP 1160 1170 1180 1190 1200 1210 >>CCDS4164.1 AFF4 gene_id:27125|Hs108|chr5 (1163 aa) initn: 1566 init1: 573 opt: 1142 Z-score: 693.1 bits: 140.3 E(32554): 2.8e-32 Smith-Waterman score: 2251; 37.7% identity (63.8% similar) in 1269 aa overlap (23-1225:5-1161) 10 20 30 40 50 pF1KB4 MDSFDLALLQEWDLESLCVYEPDRNALRRKERERRNQETQQDDGTFNSSYSLFSEPYK-T :::.:: ::::::::: :: . .: : ::.:::: : CCDS41 MNREDRNVLRMKERERRNQEIQQGEDAFPPSSPLFAEPYKVT 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 pF1KB4 NKGDELSNRIQNTLGNYDEMKDFLTDRSNQSHLVGVPKPGVPQTPVNKIDEHFV------ .: :.::.:::. ::::::::::. ::: . ::..::: :: . .: . .: CCDS41 SKEDKLSSRIQSMLGNYDEMKDFIGDRSIPK-LVAIPKPTVPPSADEKSNPNFFEQRHGG 50 60 70 80 90 100 120 130 140 pF1KB4 ------------ADSRAQNQPSSI----------CSTTTSTPAAVPVQQSKR------GT : : .:.: : :. .:. . :. : :. CCDS41 SHQSSKWTPVGPAPSTSQSQKRSSGLQSGHSSQRTSAGSSSGTNSSGQRHDRESYNNSGS 110 120 130 140 150 160 150 160 170 180 190 pF1KB4 MGWQKAGHPPSDGQQRATQQG------SL-----RTLLGDGVGRQQPRAKQVCNVEVGLQ . .:. : ...:... : :: :. .: .... :.:. . ... . CCDS41 SSRKKGQHGSEHSKSRSSSPGKPQAVSSLNSSHSRSHGNDHHSKEHQRSKSPRDPDANWD 170 180 190 200 210 220 200 210 220 230 240 250 pF1KB4 TQERPPAMAAKHSSSGHCVQNFPPSLASKPSLVQQKPTAYVRPMDGQDQAPDESPKLKSS . : : ::. : .:.::::: :: . . :::::::::::::.. :::.: CCDS41 SPSRVP-----FSSGQHSTQSFPPSLMSKSNSMLQKPTAYVRPMDGQESM---EPKLSSE 230 240 250 260 270 260 270 280 290 300 310 pF1KB4 SETSVHCTSYRGVPASKPEPARAKAKLSKFSIPKQG-EESRSGETNSCVEEIIREMT--W .: . .: .. .:. .::.:.:..::.: . : ::.. :::.::..::: : CCDS41 HYSS----QSHGNSMTELKPS-SKAHLTKLKIPSQPLDASASGDV-SCVDEILKEMTHSW 280 290 300 310 320 320 330 340 350 360 370 pF1KB4 LPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPNKDSQLVSSGHNNPKKGDAEPESPDNGTSNTSMLEDDLK :::.::..: :.::.:::::.:.:: . : .. :. . : . .:: .. :::.:::: CCDS41 PPPLTAIHTPCKTEPSKFPFPTKESQQSNFGTGEQKRYN--PSKTSNGHQSKSMLKDDLK 330 340 350 360 370 380 380 390 400 410 420 430 pF1KB4 LSSDEEENEQQAAQRTALRALSDSAVVQQPNCRTSVPSSKGSSSSSSSGSSSSSSDSESS :::.:. . .: ..: :. : : . : .:.:...: . .::: : :::: CCDS41 LSSSEDSDGEQDCDKTMPRSTPGS------NSEPSHHNSEGADNSRD--DSSSHSGSESS 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 pF1KB4 SGSDSETESSSSESEGSKPPHFSSPEAEPASSNKWQLDKWLNKVNPHKPPILIQNESHGS ::::::.:::::.::...: . .::: :: .::::::.::::::::: . .:. CCDS41 SGSDSESESSSSDSEANEPSQSASPEPEPPPTNKWQLDNWLNKVNPHKVSPASSVDSNIP 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 pF1KB4 ESSQYYNPVKEDVQDCGK-VPDVCQPSLREKEIKSTCKEEQRPRTANKAPGSKGVKQKSP :. : . .: : :. :. : :: :. . .: .:. : .:::: CCDS41 SSQGYKKEGRE--QGTGNSYTDTSGP----KET-SSATPGRDSKTIQKGSESGRGRQKSP 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 pF1KB4 PAAVAVAVSAAAPPPAVPCAPAENAPAPARRSAGKKPTRRTERTSAGDGANCHRPEEPAA :.. . ::..::: ...:...: . . . : . CCDS41 ---------------------AQSDSTTQRRTVGKKQPKKAEKAAAEEPRGGLKIESETP 560 570 580 620 630 640 650 660 pF1KB4 ADALGTSVVVPPEPTKTRPCGNNRASHRKELRSSV--TCEKRRTRGLSRIVPKSKEFIET .: :..:. : :. :. . . .:: .:: : ::.. .. :. ::.:.::: CCDS41 VD-LASSM--PSSRHKAATKGSRKPNIKKESKSSPRPTAEKKKYKSTSKSSQKSREIIET 590 600 610 620 630 640 670 680 690 700 710 720 pF1KB4 ESSSSSSSSDSDLESEQEEYPLSKAQTVAASASSGNDQRLKEAAANGGSGPRAPVGSINA ..::: ::: :.: : : .:: :. : .. . CCDS41 DTSSS----DSD---ESESLPPS-SQT-----------------------PKYPESNRTP 650 660 670 730 740 750 760 770 780 pF1KB4 RTTSDIAKELEEQFYT---LVPFGRNELLSPLKDSDEIRSLWVKIDLTLLSRIPEHLPQE :.. : :..:. . :. ..::::::.. :. : :::::.::.:: : . CCDS41 VKPSSV--EEEDSFFRQRMFSPMEEKELLSPLSEPDDRYPLIVKIDLNLLTRI----PGK 680 690 700 710 720 790 800 810 820 830 840 pF1KB4 PGVLSAPATKDSESAPPSHTSDTP---AEKALPKSKRKRKCDNEDDYR--EIKKSQGEKD : . : .....: .:: .. .::. :.:::.: :::: : : :: . : : CCDS41 PYKETEPPKGEKKNVPEKHTREAQKQASEKVSNKGKRKHK--NEDDNRASESKKPKTE-D 730 740 750 760 770 780 850 860 870 880 890 pF1KB4 SSSRLATSTSNTLSANHCNMNINSVAIPINKNEKMLRSPISPLSDA---SKHKYTSEDLT ..: .:: :... :.: :.. .: :: .:. . ..: .. .. CCDS41 KNSAGHKPSSNRESSKQ------SAA----KEKDLLPSPAGPVPSKDPKTEHGSRKRTIS 790 800 810 820 830 900 910 920 930 940 950 pF1KB4 SSS--RPNGNSLFTSASSSKKPKADSQLQPHGGDLTKAAHNNSENIPLHKSRPQTKPWSP .:: . ..:: ...:::. .. :. . : ...... .:. : .: . : .: CCDS41 QSSSLKSSSNSNKETSGSSKNSSSTSKQKKTEGKTSSSSKEVKEKAP--SSSSNCPPSAP 840 850 860 870 880 890 960 970 980 990 1000 1010 pF1KB4 GSNGHRDCKRQKLVFDDMPRSADYFMQEAKRMKHKADAMVEKFGKALNYAEAALSFIECG .. . .: :::::: :::...::::..::.:::. ..: ::. : .:..:::::: CCDS41 TLDSSKP-RRTKLVFDDRNYSADHYLQEAKKLKHNADALSDRFEKAVYYLDAVVSFIECG 900 910 920 930 940 950 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KB4 NAMEQGPMESKSPYTMYSETVELIRYAMRLKTHSGPNATPEDKQLAALCYRCLALLYWRM ::.:.. .:::::. ::::::.::.:.:.::.. .:.:: ::.:..:: :: .::: :. CCDS41 NALEKNAQESKSPFPMYSETVDLIKYTMKLKNYLAPDATAADKRLTVLCLRCESLLYLRL 960 970 980 990 1000 1010 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KB4 FRLKRDHAVKYSKALIDYFKNSSKAAQAPSPWGASGKSTGTPSPMSPNPSPASSVGSQGS :.::...:.::::.: ...::: . .::::: : ..:..: :::.::. ::..: . ... CCDS41 FKLKKENALKYSKTLTEHLKNSYNNSQAPSP-GLGSKAVGMPSPVSPKLSPGNSGNYSSG 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KB4 LSNASALSPSTIVSIPQRIHQMAANHVSITNSILHSYDYWEMADNLAKENREFFNDLDLL :.::: . : :.:::.::::::..:..:...:.. . :..:..:.::..::: .:: . CCDS41 ASSASASGSS--VTIPQKIHQMAASYVQVTSNFLYATEIWDQAEQLSKEQKEFFAELDKV 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1200 1210 1220 pF1KB4 MGPVTLHSS-MEHLVQYSQQGLHWLRNSAHLS :::. ...: : ::.:..:::::::..:.: CCDS41 MGPLIFNASIMTDLVRYTRQGLHWLRQDAKLIS 1140 1150 1160 >>CCDS76040.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX (1276 aa) initn: 2297 init1: 660 opt: 1005 Z-score: 610.6 bits: 125.1 E(32554): 1.1e-27 Smith-Waterman score: 2348; 37.5% identity (60.2% similar) in 1331 aa overlap (31-1225:29-1275) 10 20 30 40 50 pF1KB4 MDSFDLALLQEWDLESLCVYEPDRNALRRKERERRNQETQQDDGTFNSSYSLFSEPYK-- : ::::::.::.: :.:...::.:::: CCDS76 MDLFDFFRDWDLEQQCHYEQDRSALKKREWERRNQEVQQEDDLFSSGFDLFGEPYKVA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB4 --TNKGDELSNRIQNTLGNYDEMKDFLTDRSNQSHLVGVPKPGVPQTPVNKIDEHFVADS ::::: :.::.:::::::::::..::..:::.::::.:: .:::.: :: . : .. CCDS76 EYTNKGDALANRVQNTLGNYDEMKNLLTNHSNQNHLVGIPKNSVPQNPNNKNEPSFFPEQ 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KB4 RAQNQPSSICSTTTSTPAAVP---------VQQSKRGTMGWQKAGHPPSD--GQQRATQQ . . : .: :.: : ....... :.. .: :: ..: . : CCDS76 KNRIIPPHQDNTHPSAPMPPPSVVILNSTLIHSNRKSKPEWSRDSHNPSTVLASQASGQP 120 130 140 150 160 170 170 180 190 pF1KB4 GSLRTLLGDG-----------------VGR---QQPRAKQVCNVEVG--------LQT-- ....:: : .:. ..: ::. : . . .:. CCDS76 NKMQTLTQDQSQAKLEDFFVYPAEQPQIGEVEESNPSAKEDSNPNSSGEDAFKEIFQSNS 180 190 200 210 220 230 200 210 220 230 240 pF1KB4 -QERPPAMAAKHS----------SSGHCVQNFPPSLASKPSLVQQKPTAYVRPMDGQDQA .: :. : : ::: ::::::.: : :. ::::::::::::::::: CCDS76 PEESEFAVQAPGSPLVASSLLAPSSGLSVQNFPPGLYCKTSMGQQKPTAYVRPMDGQDQA 240 250 260 270 280 290 250 260 270 280 290 300 pF1KB4 PDESPKLKSSSE--TSVHCTSYRGVPASKPEPARAKAKLSKFSIPKQGEESRSGETNSCV :: :: :: : : .: :. . .:: : .:.:: ::.: . .: : .. ::: CCDS76 PDISPTLKPSIEFENSFGNLSFGTLLDGKPSAASSKTKLPKFTILQTSEVSLPSDP-SCV 300 310 320 330 340 350 310 320 330 340 350 360 pF1KB4 EEIIREMTWLPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPNKDSQLVSSGHNNPKKGDAEPESPDNGTSN :::.:: :: .. : . : .: : . .. CCDS76 EEILRE---------------------------SQHLTPGFTLQKWND--PTT----RAS 360 370 380 370 380 390 400 410 pF1KB4 TSMLEDDLKLSSDEEENEQQAAQRTALRALSDSAVVQQPNCRTS-----VPSSKGSSSSS :.::::::::::::.. : . : : .:.. . :.. . . . . . CCDS76 TKMLEDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTATELYQAVEKAKPRNNPVNPPLATPQPPPAVQ 390 400 410 420 430 440 420 430 440 450 460 470 pF1KB4 SSGSSSSSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSKPPHFSSPEAEPASSNKWQLDKWLNKV-N .::.:.:::.::::: :::.::::...::... :. ..:: :: :.:::::::::::: . CCDS76 ASGGSGSSSESESSSESDSDTESSTTDSESNEAPRVATPEPEPPSTNKWQLDKWLNKVTS 450 460 470 480 490 500 480 490 500 510 520 530 pF1KB4 PHKPPILIQNESHGSESSQYYNPVKEDVQDCGKVP-DVCQ-PSL-REKEIKSTCKEEQRP .: : :::. :. . :. . .. :: .. : :. .:. . : .:. :: CCDS76 QNKSFICGQNETP-METISLPPPIIQPMEVQMKVKTNASQVPAEPKERPLLSLIREKARP 510 520 530 540 550 560 540 550 560 570 580 590 pF1KB4 RTANKAPGSKGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPAVPCAPAENAPAPARRSAGKKPTRRTER : ..: : .:..:.: .. .:. .:. ::: ...:. CCDS76 RPTQKIPETKALKHKLSTTSETVS----------------------QRTIGKKQPKKVEK 570 580 590 600 600 610 620 630 640 650 pF1KB4 TSAGDGANCHRPEEPAAADALGTSVVVPPEPTKTRPCGNNRASHRKELRSSVTC--EKRR ... : . .:. ... :: . : .. . ::: : .. ::.. CCDS76 NTSTDEFTWPKPNITSSTPKEKESVELHDPPRGRNKATAHKPAPRKEPRPNIPLAPEKKK 610 620 630 640 650 660 660 670 680 690 700 710 pF1KB4 TRGLSRIVPKSKEFIETESSSSSSSSDSDLESEQEEYPLSKAQTVAASASSGNDQRLKEA :: ..:::::.:::::.::.:.:..: ::: :. :.:: . :: CCDS76 YRGPGKIVPKSREFIETDSSTSDSNTD------QEE-TLQIKVLPPCIISGGNTAKSKEI 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KB4 AANGGSGPRAPVGSINARTTSDIAKELEEQFYTLVPFGRNELLSPLKDSDEIRSLWVKID :.: . . : .. ...... :: .. .: ..:.::::.: .....:::::: CCDS76 C--GASLTLSTLMS-SSGSNNNLSISNEEPTFSPIPVMQTEILSPLRDHENLKNLWVKID 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 pF1KB4 LTLLSRIPEH--LPQEPGVLSAPATKDSESAPPSHTSDTPAEKALPKSKRKRK-CDNEDD : ::::.: : : : . : :.. . : .:. : .:: ::.:::.: . . CCDS76 LDLLSRVPGHSSLHAAP---AKPDHKETATKPKRQTAVTAVEKPAPKGKRKHKPIEVAEK 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 pF1KB4 YREIKKSQGEKDSSSRLATSTSNTLSANHCNMNINSVAIPIN--KNEKMLRSPISPLSDA : :. : . : : . . : :. . : :.::.. :.::: . CCDS76 IPEKKQRLEEATTICLLPPCISPAPPHKPPNTRENNSSRRANRRKEEKLFPPPLSPLPED 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 pF1KB4 SKHKYTSEDLTSSSRPNG---NSLFTSASSSKKPKAD--------SQLQPHGGDLTKAAH .. ....... : : : .:. .: ::: . .. . :: : : CCDS76 PPRR---RNVSGNNGPFGQDKNIAMTGQITSTKPKRTEGKFCATFKGISVNEGDTPKKAS 890 900 910 920 930 940 940 pF1KB4 NNSENIP-----------------------------------------------LHKSRP . . .. . .:. CCDS76 SATITVTNTAIATATVTATAIVTTTVTATATATATTTTTTTTISTITSTITTGLMDSSHL 950 960 970 980 990 1000 950 960 970 980 990 1000 pF1KB4 QTKPWS--PG-SNGHRDCKRQKLVFDDMPRSADYFMQEAKRMKHKADAMVEKFGKALNYA . :. : :.. . .: ::.::: ..:::.:::::..::::::. ::::::.::: CCDS76 EMTSWAALPLLSSSSTNVRRPKLTFDDSVHNADYYMQEAKKLKHKADALFEKFGKAVNYA 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KB4 EAALSFIECGNAMEQGPMESKSPYTMYSETVELIRYAMRLKTHSGPNATPEDKQLAALCY .::::: :::::::. :.:.:::::::::::::.:::::::. ..: :. ::.::.::: CCDS76 DAALSFTECGNAMERDPLEAKSPYTMYSETVELLRYAMRLKNFASPLASDGDKKLAVLCY 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KB4 RCLALLYWRMFRLKRDHAVKYSKALIDYFK-NSSKAAQAPSPWGASGKSTGTPSPMSPNP :::.::: :::.::.:::.:::..:..::: :.::.:: :::: ..::.: :::.: : CCDS76 RCLSLLYLRMFKLKKDHAMKYSRSLMEYFKQNASKVAQIPSPWVSNGKNT--PSPVSLNN 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KB4 SPASSVGSQGSLSNASALSPSTIVSIPQRIHQMAANHVSITNSILHSYDYWEMADNLAKE .: ....:. .:. : :.::::::.:::.::.::...:..:..:.:::.:..: CCDS76 --VSPINAMGNCNNG----P---VTIPQRIHHMAASHVNITSNVLRGYEHWDMADKLTRE 1190 1200 1210 1220 1230 1190 1200 1210 1220 pF1KB4 NREFFNDLDLLMGPVTLHSSMEHLVQYSQQGLHWLRNSAHLS :.:::.::: ::::.: :::: .::.: .::: ::: .::: CCDS76 NKEFFGDLDTLMGPLTQHSSMTNLVRYVRQGLCWLRIDAHLL 1240 1250 1260 1270 >>CCDS55521.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX (952 aa) initn: 1601 init1: 660 opt: 771 Z-score: 472.9 bits: 99.2 E(32554): 5.1e-20 Smith-Waterman score: 1775; 36.6% identity (61.4% similar) in 997 aa overlap (307-1225:5-951) 280 290 300 310 320 330 pF1KB4 AKAKLSKFSIPKQGEESRSGETNSCVEEIIREMTWLPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPNKDS :. .: . ... .:. ..: CCDS55 MKFKRRHQAFPSFFKMKVSLPSDPSCVEEILRES 10 20 30 340 350 360 370 380 390 pF1KB4 QLVSSGHNNPKKGDAEPESPDNGTSNTSMLEDDLKLSSDEEENEQQAAQRTALRALSDSA : .. : . : .: .. ...: :::::::::::::.. : . : : CCDS55 QHLTPGFTLQKWNDPTTRASTKSVSFKSMLEDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTATELYQ 40 50 60 70 80 90 400 410 420 430 440 450 pF1KB4 VVQQPNCRTS-----VPSSKGSSSSSSSGSSSSSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSKPP .:.. . :.. . . . . ..::.:.:::.::::: :::.::::...::... : CCDS55 AVEKAKPRNNPVNPPLATPQPPPAVQASGGSGSSSESESSSESDSDTESSTTDSESNEAP 100 110 120 130 140 150 460 470 480 490 500 510 pF1KB4 HFSSPEAEPASSNKWQLDKWLNKV-NPHKPPILIQNESHGSESSQYYNPVKEDVQDCGKV . ..:: :: :.:::::::::::: . .: : :::. :. . :. . .. :: CCDS55 RVATPEPEPPSTNKWQLDKWLNKVTSQNKSFICGQNETP-METISLPPPIIQPMEVQMKV 160 170 180 190 200 210 520 530 540 550 560 pF1KB4 P-DVCQ-PSL-REKEIKSTCKEEQRPRTANKAPGSKGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPAV .. : :. .:. . : .:. ::: ..: : .:..:.: .. .:. CCDS55 KTNASQVPAEPKERPLLSLIREKARPRPTQKIPETKALKHKLSTTSETVS---------- 220 230 240 250 260 570 580 590 600 610 620 pF1KB4 PCAPAENAPAPARRSAGKKPTRRTERTSAGDGANCHRPEEPAAADALGTSVVVPPEPTKT .:. ::: ...:.... : . .:. ... :: . : CCDS55 ------------QRTIGKKQPKKVEKNTSTDEFTWPKPNITSSTPKEKESVELHDPPRGR 270 280 290 300 310 630 640 650 660 670 680 pF1KB4 RPCGNNRASHRKELRSSVTC--EKRRTRGLSRIVPKSKEFIETESSSSSSSSDSDLESEQ .. . ::: : .. ::.. :: ..:::::.:::::.::.:.:..: : CCDS55 NKATAHKPAPRKEPRPNIPLAPEKKKYRGPGKIVPKSREFIETDSSTSDSNTD------Q 320 330 340 350 360 690 700 710 720 730 740 pF1KB4 EEYPLSKAQTVAASASSGNDQRLKEAAANGGSGPRAPVGSINARTTSDIAKELEEQFYTL :: :. :.:: . :: :.: . . : .. ...... :: .. CCDS55 EE-TLQIKVLPPCIISGGNTAKSKEIC--GASLTLSTLMS-SSGSNNNLSISNEEPTFSP 370 380 390 400 410 420 750 760 770 780 790 800 pF1KB4 VPFGRNELLSPLKDSDEIRSLWVKIDLTLLSRIPEH--LPQEPGVLSAPATKDSESAPPS .: ..:.::::.: .....::::::: ::::.: : : : . : :.. . : CCDS55 IPVMQTEILSPLRDHENLKNLWVKIDLDLLSRVPGHSSLHAAP---AKPDHKETATKPKR 430 440 450 460 470 810 820 830 840 850 860 pF1KB4 HTSDTPAEKALPKSKRKRK-CDNEDDYREIKKSQGEKDSSSRLATSTSNTLSANHCNMNI .:. : .:: ::.:::.: . . : :. : . : : . . : CCDS55 QTAVTAVEKPAPKGKRKHKPIEVAEKIPEKKQRLEEATTICLLPPCISPAPPHKPPNTRE 480 490 500 510 520 530 870 880 890 900 910 pF1KB4 NSVAIPIN--KNEKMLRSPISPLSDASKHKYTSEDLTSSSRPNG---NSLFTSASSSKKP :. . : :.::.. :.::: . .. ....... : : : .:. .: :: CCDS55 NNSSRRANRRKEEKLFPPPLSPLPEDPPRR---RNVSGNNGPFGQDKNIAMTGQITSTKP 540 550 560 570 580 590 920 930 940 pF1KB4 KAD--------SQLQPHGGDLTKAAHNNSENIP--------------------------- : . .. . :: : : . . .. CCDS55 KRTEGKFCATFKGISVNEGDTPKKASSATITVTNTAIATATVTATAIVTTTVTATATATA 600 610 620 630 640 650 950 960 970 pF1KB4 --------------------LHKSRPQTKPWS--PG-SNGHRDCKRQKLVFDDMPRSADY . .:. . :. : :.. . .: ::.::: ..::: CCDS55 TTTTTTTTISTITSTITTGLMDSSHLEMTSWAALPLLSSSSTNVRRPKLTFDDSVHNADY 660 670 680 690 700 710 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KB4 FMQEAKRMKHKADAMVEKFGKALNYAEAALSFIECGNAMEQGPMESKSPYTMYSETVELI .:::::..::::::. ::::::.:::.::::: :::::::. :.:.:::::::::::::. CCDS55 YMQEAKKLKHKADALFEKFGKAVNYADAALSFTECGNAMERDPLEAKSPYTMYSETVELL 720 730 740 750 760 770 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KB4 RYAMRLKTHSGPNATPEDKQLAALCYRCLALLYWRMFRLKRDHAVKYSKALIDYFK-NSS :::::::. ..: :. ::.::.::::::.::: :::.::.:::.:::..:..::: :.: CCDS55 RYAMRLKNFASPLASDGDKKLAVLCYRCLSLLYLRMFKLKKDHAMKYSRSLMEYFKQNAS 780 790 800 810 820 830 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KB4 KAAQAPSPWGASGKSTGTPSPMSPNPSPASSVGSQGSLSNASALSPSTIVSIPQRIHQMA :.:: :::: ..::. ::::.: : .: ....:. .:. : :.::::::.:: CCDS55 KVAQIPSPWVSNGKN--TPSPVSLNN--VSPINAMGNCNNG----P---VTIPQRIHHMA 840 850 860 870 880 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KB4 ANHVSITNSILHSYDYWEMADNLAKENREFFNDLDLLMGPVTLHSSMEHLVQYSQQGLHW :.::.::...:..:..:.:::.:..::.:::.::: ::::.: :::: .::.: .::: : CCDS55 ASHVNITSNVLRGYEHWDMADKLTRENKEFFGDLDTLMGPLTQHSSMTNLVRYVRQGLCW 890 900 910 920 930 940 1220 pF1KB4 LRNSAHLS :: .::: CCDS55 LRIDAHLL 950 >>CCDS78510.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX (1276 aa) initn: 2311 init1: 660 opt: 771 Z-score: 470.9 bits: 99.3 E(32554): 6.6e-20 Smith-Waterman score: 2383; 37.7% identity (60.8% similar) in 1325 aa overlap (31-1225:29-1275) 10 20 30 40 50 60 pF1KB4 MDSFDLALLQEWDLESLCVYEPDRNALRRKERERRNQETQQDDGTFNSSYSLFSEPYKTN : ::::::.::.: :.:...::.:::::: CCDS78 MDLFDFFRDWDLEQQCHYEQDRSALKKREWERRNQEVQQEDDLFSSGFDLFGEPYKTN 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB4 KGDELSNRIQNTLGNYDEMKDFLTDRSNQSHLVGVPKPGVPQTPVNKIDEHFVADSRAQN ::: :.::.:::::::::::..::..:::.::::.:: .:::.: :: . : ... . CCDS78 KGDALANRVQNTLGNYDEMKNLLTNHSNQNHLVGIPKNSVPQNPNNKNEPSFFPEQKNRI 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 pF1KB4 QPSSICSTTTSTPAAVP---------VQQSKRGTMGWQKAGHPPSD--GQQRATQQGSLR : .: :.: : ....... :.. .: :: ..: . : .... CCDS78 IPPHQDNTHPSAPMPPPSVVILNSTLIHSNRKSKPEWSRDSHNPSTVLASQASGQPNKMQ 120 130 140 150 160 170 170 180 190 pF1KB4 TLLGDG-----------------VGR---QQPRAKQVCNVEVG--------LQT---QER :: : .:. ..: ::. : . . .:. .: CCDS78 TLTQDQSQAKLEDFFVYPAEQPQIGEVEESNPSAKEDSNPNSSGEDAFKEIFQSNSPEES 180 190 200 210 220 230 200 210 220 230 240 pF1KB4 PPAMAAKHS----------SSGHCVQNFPPSLASKPSLVQQKPTAYVRPMDGQDQAPDES :. : : ::: ::::::.: : :. ::::::::::::::::::: : CCDS78 EFAVQAPGSPLVASSLLAPSSGLSVQNFPPGLYCKTSMGQQKPTAYVRPMDGQDQAPDIS 240 250 260 270 280 290 250 260 270 280 290 300 pF1KB4 PKLKSSSE--TSVHCTSYRGVPASKPEPARAKAKLSKFSIPKQGEESRSGETNSCVEEII : :: : : .: :. . .:: : .:.:: ::.: . .: : .. ::::::. CCDS78 PTLKPSIEFENSFGNLSFGTLLDGKPSAASSKTKLPKFTILQTSEVSLPSDP-SCVEEIL 300 310 320 330 340 350 310 320 330 340 350 360 pF1KB4 REMTWLPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPNKDSQLVSSGHNNPKKGDAEPESPDNGTSNTSML :: :: .. : . : .: .. ...: ::: CCDS78 RE---------------------------SQHLTPGFTLQKWNDPTTRASTKSVSFKSML 360 370 380 390 370 380 390 400 410 420 pF1KB4 EDDLKLSSDEEENEQQAAQRTALRALSDSAVVQQPNCRTS-----VPSSKGSSSSSSSGS ::::::::::.. : . : : .:.. . :.. . . . . ..::. CCDS78 EDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTATELYQAVEKAKPRNNPVNPPLATPQPPPAVQASGG 400 410 420 430 440 450 430 440 450 460 470 480 pF1KB4 SSSSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSKPPHFSSPEAEPASSNKWQLDKWLNKV-NPHKP :.:::.::::: :::.::::...::... :. ..:: :: :.:::::::::::: . .: CCDS78 SGSSSESESSSESDSDTESSTTDSESNEAPRVATPEPEPPSTNKWQLDKWLNKVTSQNKS 460 470 480 490 500 510 490 500 510 520 530 pF1KB4 PILIQNESHGSESSQYYNPVKEDVQDCGKVP-DVCQ-PSL-REKEIKSTCKEEQRPRTAN : :::. :. . :. . .. :: .. : :. .:. . : .:. ::: .. CCDS78 FICGQNETP-METISLPPPIIQPMEVQMKVKTNASQVPAEPKERPLLSLIREKARPRPTQ 520 530 540 550 560 540 550 560 570 580 590 pF1KB4 KAPGSKGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPAVPCAPAENAPAPARRSAGKKPTRRTERTSAG : : .:..:.: .. .:. .:. ::: ...:.... CCDS78 KIPETKALKHKLSTTSETVS----------------------QRTIGKKQPKKVEKNTST 570 580 590 600 600 610 620 630 640 650 pF1KB4 DGANCHRPEEPAAADALGTSVVVPPEPTKTRPCGNNRASHRKELRSSVTC--EKRRTRGL : . .:. ... :: . : .. . ::: : .. ::.. :: CCDS78 DEFTWPKPNITSSTPKEKESVELHDPPRGRNKATAHKPAPRKEPRPNIPLAPEKKKYRGP 610 620 630 640 650 660 660 670 680 690 700 710 pF1KB4 SRIVPKSKEFIETESSSSSSSSDSDLESEQEEYPLSKAQTVAASASSGNDQRLKEAAANG ..:::::.:::::.::.:.:..: ::: :. :.:: . :: : CCDS78 GKIVPKSREFIETDSSTSDSNTD------QEE-TLQIKVLPPCIISGGNTAKSKEIC--G 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 pF1KB4 GSGPRAPVGSINARTTSDIAKELEEQFYTLVPFGRNELLSPLKDSDEIRSLWVKIDLTLL .: . . : .. ...... :: .. .: ..:.::::.: .....::::::: :: CCDS78 ASLTLSTLMS-SSGSNNNLSISNEEPTFSPIPVMQTEILSPLRDHENLKNLWVKIDLDLL 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 pF1KB4 SRIPEH--LPQEPGVLSAPATKDSESAPPSHTSDTPAEKALPKSKRKRK-CDNEDDYREI ::.: : : : . : :.. . : .:. : .:: ::.:::.: . . : CCDS78 SRVPGHSSLHAAP---AKPDHKETATKPKRQTAVTAVEKPAPKGKRKHKPIEVAEKIPEK 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 pF1KB4 KKSQGEKDSSSRLATSTSNTLSANHCNMNINSVAIPIN--KNEKMLRSPISPLSDASKHK :. : . : : . . : :. . : :.::.. :.::: . .. CCDS78 KQRLEEATTICLLPPCISPAPPHKPPNTRENNSSRRANRRKEEKLFPPPLSPLPEDPPRR 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 pF1KB4 YTSEDLTSSSRPNG---NSLFTSASSSKKPK-ADSQLQP--HG---GDLTKAAHNNSENI ....... : : : .:. .: ::: ..... .: :: : : . . .. CCDS78 ---RNVSGNNGPFGQDKNIAMTGQITSTKPKRTEGKFCATFKGISEGDTPKKASSATITV 900 910 920 930 940 950 950 pF1KB4 P-----------------------------------------------LHKSRPQTKPWS . .:. . :. CCDS78 TNTAIATATVTATAIVTTTVTATATATATTTTTTTTISTITSTITTGLMDSSHLEMTSWA 960 970 980 990 1000 1010 960 970 980 990 1000 1010 pF1KB4 --PG-SNGHRDCKRQKLVFDDMPRSADYFMQEAKRMKHKADAMVEKFGKALNYAEAALSF : :.. . .: ::.::: ..:::.:::::..::::::. ::::::.:::.::::: CCDS78 ALPLLSSSSTNVRRPKLTFDDSVHNADYYMQEAKKLKHKADALFEKFGKAVNYADAALSF 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KB4 IECGNAMEQGPMESKSPYTMYSETVELIRYAMRLKTHSGPNATPEDKQLAALCYRCLALL :::::::. :.:.:::::::::::::.:::::::. ..: :. ::.::.::::::.:: CCDS78 TECGNAMERDPLEAKSPYTMYSETVELLRYAMRLKNFASPLASDGDKKLAVLCYRCLSLL 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KB4 YWRMFRLKRDHAVKYSKALIDYFK-NSSKAAQAPSPWGASGKSTGTPSPMSPNPSPASSV : :::.::.:::.:::..:..::: :.::.:: :::: ..::.: :::.: : .: . CCDS78 YLRMFKLKKDHAMKYSRSLMEYFKQNASKVAQIPSPWVSNGKNT--PSPVSLNN--VSPI 1140 1150 1160 1170 1180 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KB4 GSQGSLSNASALSPSTIVSIPQRIHQMAANHVSITNSILHSYDYWEMADNLAKENREFFN ...:. .:. : :.::::::.:::.::.::...:..:..:.:::.:..::.:::. CCDS78 NAMGNCNNG----P---VTIPQRIHHMAASHVNITSNVLRGYEHWDMADKLTRENKEFFG 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1200 1210 1220 pF1KB4 DLDLLMGPVTLHSSMEHLVQYSQQGLHWLRNSAHLS ::: ::::.: :::: .::.: .::: ::: .::: CCDS78 DLDTLMGPLTQHSSMTNLVRYVRQGLCWLRIDAHLL 1250 1260 1270 >>CCDS14684.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX (1311 aa) initn: 2297 init1: 660 opt: 771 Z-score: 470.7 bits: 99.3 E(32554): 6.7e-20 Smith-Waterman score: 2363; 37.5% identity (61.2% similar) in 1298 aa overlap (62-1225:64-1310) 40 50 60 70 80 90 pF1KB4 RERRNQETQQDDGTFNSSYSLFSEPYKTNKGDELSNRIQNTLGNYDEMKDFLTDRSNQSH :: :.::.:::::::::::..::..:::.: CCDS14 NQEVQQEDDLFSSGFDLFGEPYKVAEYTNKGDALANRVQNTLGNYDEMKNLLTNHSNQNH 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 pF1KB4 LVGVPKPGVPQTPVNKIDEHFVADSRAQNQPSSICSTTTSTPAAVP---------VQQSK :::.:: .:::.: :: . : ... . : .: :.: : ..... CCDS14 LVGIPKNSVPQNPNNKNEPSFFPEQKNRIIPPHQDNTHPSAPMPPPSVVILNSTLIHSNR 100 110 120 130 140 150 150 160 170 180 pF1KB4 RGTMGWQKAGHPPSD--GQQRATQQGSLRTLLGDG-----------------VGR---QQ .. :.. .: :: ..: . : ....:: : .:. .. CCDS14 KSKPEWSRDSHNPSTVLASQASGQPNKMQTLTQDQSQAKLEDFFVYPAEQPQIGEVEESN 160 170 180 190 200 210 190 200 210 pF1KB4 PRAKQVCNVEVG--------LQT---QERPPAMAAKHS----------SSGHCVQNFPPS : ::. : . . .:. .: :. : : ::: ::::::. CCDS14 PSAKEDSNPNSSGEDAFKEIFQSNSPEESEFAVQAPGSPLVASSLLAPSSGLSVQNFPPG 220 230 240 250 260 270 220 230 240 250 260 270 pF1KB4 LASKPSLVQQKPTAYVRPMDGQDQAPDESPKLKSSSE--TSVHCTSYRGVPASKPEPARA : : :. ::::::::::::::::::: :: :: : : .: :. . .:: : . CCDS14 LYCKTSMGQQKPTAYVRPMDGQDQAPDISPTLKPSIEFENSFGNLSFGTLLDGKPSAASS 280 290 300 310 320 330 280 290 300 310 320 330 pF1KB4 KAKLSKFSIPKQGEESRSGETNSCVEEIIREMT--WLPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPNKD :.:: ::.: . .: : .. ::::::.:::: : ::..... :. : . : .:... CCDS14 KTKLPKFTILQTSEVSLPSDP-SCVEEILREMTHSWPTPLTSMHTAGHSEQSTFSIPGQE 340 350 360 370 380 390 340 350 360 370 380 390 pF1KB4 SQLVSSGHNNPKKGDAEPESPDNGTSNTSMLEDDLKLSSDEEENEQQAAQRTALRALSDS :: .. : . : .: .. ...: :::::::::::::.. : . : : CCDS14 SQHLTPGFTLQKWNDPTTRASTKSVSFKSMLEDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTATELY 400 410 420 430 440 450 400 410 420 430 440 450 pF1KB4 AVVQQPNCRTS-----VPSSKGSSSSSSSGSSSSSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSKP .:.. . :.. . . . . ..::.:.:::.::::: :::.::::...::... CCDS14 QAVEKAKPRNNPVNPPLATPQPPPAVQASGGSGSSSESESSSESDSDTESSTTDSESNEA 460 470 480 490 500 510 460 470 480 490 500 pF1KB4 PHFSSPEAEPASSNKWQLDKWLNKV-NPHKPPILIQNESHGSESSQYYNPVKEDVQDCGK :. ..:: :: :.:::::::::::: . .: : :::. :. . :. . .. : CCDS14 PRVATPEPEPPSTNKWQLDKWLNKVTSQNKSFICGQNETP-METISLPPPIIQPMEVQMK 520 530 540 550 560 570 510 520 530 540 550 560 pF1KB4 VP-DVCQ-PSL-REKEIKSTCKEEQRPRTANKAPGSKGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPA : .. : :. .:. . : .:. ::: ..: : .:..:.: .. .:. CCDS14 VKTNASQVPAEPKERPLLSLIREKARPRPTQKIPETKALKHKLSTTSETVS--------- 580 590 600 610 620 570 580 590 600 610 620 pF1KB4 VPCAPAENAPAPARRSAGKKPTRRTERTSAGDGANCHRPEEPAAADALGTSVVVPPEPTK .:. ::: ...:.... : . .:. ... :: . : CCDS14 -------------QRTIGKKQPKKVEKNTSTDEFTWPKPNITSSTPKEKESVELHDPPRG 630 640 650 660 630 640 650 660 670 680 pF1KB4 TRPCGNNRASHRKELRSSVTC--EKRRTRGLSRIVPKSKEFIETESSSSSSSSDSDLESE .. . ::: : .. ::.. :: ..:::::.:::::.::.:.:..: CCDS14 RNKATAHKPAPRKEPRPNIPLAPEKKKYRGPGKIVPKSREFIETDSSTSDSNTD------ 670 680 690 700 710 720 690 700 710 720 730 740 pF1KB4 QEEYPLSKAQTVAASASSGNDQRLKEAAANGGSGPRAPVGSINARTTSDIAKELEEQFYT ::: :. :.:: . :: :.: . . : .. ...... :: .. CCDS14 QEE-TLQIKVLPPCIISGGNTAKSKEIC--GASLTLSTLMS-SSGSNNNLSISNEEPTFS 730 740 750 760 770 750 760 770 780 790 800 pF1KB4 LVPFGRNELLSPLKDSDEIRSLWVKIDLTLLSRIPEH--LPQEPGVLSAPATKDSESAPP .: ..:.::::.: .....::::::: ::::.: : : : . : :.. . : CCDS14 PIPVMQTEILSPLRDHENLKNLWVKIDLDLLSRVPGHSSLHAAP---AKPDHKETATKPK 780 790 800 810 820 830 810 820 830 840 850 860 pF1KB4 SHTSDTPAEKALPKSKRKRK-CDNEDDYREIKKSQGEKDSSSRLATSTSNTLSANHCNMN .:. : .:: ::.:::.: . . : :. : . : : . . : CCDS14 RQTAVTAVEKPAPKGKRKHKPIEVAEKIPEKKQRLEEATTICLLPPCISPAPPHKPPNTR 840 850 860 870 880 890 870 880 890 900 910 pF1KB4 INSVAIPIN--KNEKMLRSPISPLSDASKHKYTSEDLTSSSRPNG---NSLFTSASSSKK :. . : :.::.. :.::: . .. ....... : : : .:. .: : CCDS14 ENNSSRRANRRKEEKLFPPPLSPLPEDPPRR---RNVSGNNGPFGQDKNIAMTGQITSTK 900 910 920 930 940 950 920 930 940 pF1KB4 PKAD--------SQLQPHGGDLTKAAHNNSENIP-------------------------- :: . .. . :: : : . . .. CCDS14 PKRTEGKFCATFKGISVNEGDTPKKASSATITVTNTAIATATVTATAIVTTTVTATATAT 960 970 980 990 1000 1010 950 960 970 pF1KB4 ---------------------LHKSRPQTKPWS--PG-SNGHRDCKRQKLVFDDMPRSAD . .:. . :. : :.. . .: ::.::: ..:: CCDS14 ATTTTTTTTISTITSTITTGLMDSSHLEMTSWAALPLLSSSSTNVRRPKLTFDDSVHNAD 1020 1030 1040 1050 1060 1070 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KB4 YFMQEAKRMKHKADAMVEKFGKALNYAEAALSFIECGNAMEQGPMESKSPYTMYSETVEL :.:::::..::::::. ::::::.:::.::::: :::::::. :.:.::::::::::::: CCDS14 YYMQEAKKLKHKADALFEKFGKAVNYADAALSFTECGNAMERDPLEAKSPYTMYSETVEL 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KB4 IRYAMRLKTHSGPNATPEDKQLAALCYRCLALLYWRMFRLKRDHAVKYSKALIDYFK-NS .:::::::. ..: :. ::.::.::::::.::: :::.::.:::.:::..:..::: :. CCDS14 LRYAMRLKNFASPLASDGDKKLAVLCYRCLSLLYLRMFKLKKDHAMKYSRSLMEYFKQNA 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KB4 SKAAQAPSPWGASGKSTGTPSPMSPNPSPASSVGSQGSLSNASALSPSTIVSIPQRIHQM ::.:: :::: ..::. ::::.: : .: ....:. .: .: :.::::::.: CCDS14 SKVAQIPSPWVSNGKN--TPSPVSLNN--VSPINAMGNCNN----GP---VTIPQRIHHM 1200 1210 1220 1230 1240 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KB4 AANHVSITNSILHSYDYWEMADNLAKENREFFNDLDLLMGPVTLHSSMEHLVQYSQQGLH ::.::.::...:..:..:.:::.:..::.:::.::: ::::.: :::: .::.: .::: CCDS14 AASHVNITSNVLRGYEHWDMADKLTRENKEFFGDLDTLMGPLTQHSSMTNLVRYVRQGLC 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1220 pF1KB4 WLRNSAHLS ::: .::: CCDS14 WLRIDAHLL 1310 1226 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 02:40:55 2016 done: Tue Nov 8 02:40:56 2016 Total Scan time: 4.510 Total Display time: 0.510 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]