FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE9393, 1251 aa 1>>>pF1KE9393 1251 - 1251 aa - 1251 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.2717+/- 0.001; mu= -3.7589+/- 0.061 mean_var=282.1997+/-57.126, 0's: 0 Z-trim(113.7): 47 B-trim: 39 in 1/52 Lambda= 0.076348 statistics sampled from 14306 (14346) to 14306 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.737), E-opt: 0.2 (0.441), width: 16 Scan time: 4.460 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS33258.1 AFF3 gene_id:3899|Hs108|chr2 (1251) 8322 930.8 0 CCDS42723.1 AFF3 gene_id:3899|Hs108|chr2 (1226) 8034 899.1 0 CCDS54775.1 AFF1 gene_id:4299|Hs108|chr4 (1218) 1317 159.2 5.9e-38 CCDS3616.1 AFF1 gene_id:4299|Hs108|chr4 (1210) 1312 158.7 8.5e-38 CCDS4164.1 AFF4 gene_id:27125|Hs108|chr5 (1163) 1142 139.9 3.6e-32 CCDS76040.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX (1276) 1005 124.9 1.4e-27 CCDS55521.1 AFF2 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CCDS54 FPPPSLPSKSVAMQQKPTAYVRPMDGQDQAPSESPELKPLPE------DYRQQTFEKTDL 290 300 310 320 330 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 PARAKAKLSKFSIPKQG-EESRSGETNSCVEEIIREMT--WLPPLSAIQAPGKVEPTKFP . :::::.:...:.:. :.. :.:.. :::::..::: : :::.::..:. .::.::: CCDS54 KVPAKAKLTKLKMPSQSVEQTYSNEVH-CVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFP 340 350 360 370 380 390 360 370 380 390 400 410 pF1KE9 FPNKDSQLVSSGHNNPKKGDAEPESPDNGTSNTS-MLEDDLKLSSDEEENEQQAAQRTAL ::.:::: ::: .: :. :. .. .:. ..:: ::::::.::..:. . .:. .. CCDS54 FPTKDSQHVSSVTQNQKQYDTSSKTHSNSQQGTSSMLEDDLQLSDSEDSDSEQTPEKPP- 400 410 420 430 440 450 420 430 440 450 460 470 pF1KE9 RALSDSAVVQQPNCRTSVPSSKGSSSSSSSGSSSSSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSK :.:: :. :.: .:. :::. : :.:::.:: ::::.:::::.:: .. CCDS54 ---SSSA---PPSAPQSLPEPVASAHSSSA-ESESTSDSDSS--SDSESESSSSDSEENE 460 470 480 490 500 480 490 500 510 520 530 pF1KE9 PPHFSSPEAEPASSNKWQLDKWLNKVN-PHKPPILIQNESHGSESSQYYNPVKEDVQDCG : . .:: :: ..::::::.::.::. : :: .: .:.. : .. .. : CCDS54 PLETPAPEPEPPTTNKWQLDNWLTKVSQPAAPP-------EGPRSTE---PPRRHPESKG 510 520 530 540 550 540 550 560 570 580 590 pF1KE9 KVPDVCQPSLREKEIKSTCKEEQRPRTANKAPGSKGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPAV- . . : .: .: :. :....::: ..:: :: :. CCDS54 S-----SDSATSQE-HSESKDPP-PKSSSKAP-------RAPPE---------APHPGKR 560 570 580 590 600 610 620 630 640 pF1KE9 PC--APAENAPAPARRSAGKKPTRRTERTSA--GDGANCHRPEEPAAADALGTSVVVPPE : .::.. : : :...: : .. ..:: :. .. . .::. :. . . CCDS54 SCQKSPAQQEP-PQRQTVGTKQPKKPVKASARAGSRTSLQGEREPGLLP-YGSRDQTSKD 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 pF1KE9 PTKTRPCGNNRASHRKELRSSVTCEKRRTRGLSRIVPKSKEFIETESSSSSSSSDSDLES :.. : ::. .: . .: ... . : . :: . :. ..:. . CCDS54 KPKVKTKGRPRAAASNEPKPAVPPSSEKKKHKSSLPAPSKAL-----SGPEPAKDNVEDR 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 pF1KE9 EQEEYPLSKAQTVAASASSGNDQRLKEAAANGGSGPRAPVGSINARTTSDIAKELEEQFY :.. : : . :.: ..::: :. : .: ...: .. CCDS54 TPEHFAL-----VPLTESQG--------PPHSGSGSRTS-GCRQAV----VVQEDSRKDR 710 720 730 740 770 780 790 800 810 820 pF1KE9 TLVPFGRNELLSPLKDSDEIRSLWVKIDLTLLSRIPEHLPQEPGVLSAPATKDSESAPPS .:. ..:::::.:. .:: ::: : :::::: : :: : : .. ::. CCDS54 LPLPLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMVKITLDLLSRIP----QPPGKGSRQ-RKAEDKQPPA 750 760 770 780 790 800 830 840 850 860 870 880 pF1KE9 ---HTSDTPAEKALPKSKRKRKCDNEDDYREIKKSQGEKDSSSRLATSTSNTLSANHCNM :.:. . . : .::: . : : . :: . ::. .:. ..:.:. : . CCDS54 GKKHSSEKRSSDSSSKLAKKRKGEAERDC-DNKKIRLEKEIKSQSSSSSSS-----HKES 810 820 830 840 850 890 900 910 920 930 940 pF1KE9 NINSVAIPINKNEKMLRSPISPLSDASKHKYTSEDLTSSSRPN---GNSLFTSASSSKKP . .. . : ... : : :.:..:. : .. : : : :.. ::::.:. CCDS54 SKTKPSRPSSQSSKKEMLPPPPVSSSSQ-KPAKPALKRSRREADTCGQDPPKSASSTKSN 860 870 880 890 900 910 950 960 970 980 990 1000 pF1KE9 KADSQLQPHGGDLTKAAHNNSENIPLHKSRPQTKPWSPGSNGHRDCKRQKLVFDDMPRSA . ::.. . :.....::. . . : ::. . .. :: ..: CCDS54 HKDSSIPKQRRVEGKGSRSSSEHKGSSGDTANPFPVPSLPNGNSKPGKPQVKFDK--QQA 920 930 940 950 960 970 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KE9 DYFMQEAKRMKHKADAMVEKFGKALNYAEAALSFIECGNAMEQGPMESKSPYTMYSETVE : :.:::.::.::. :... :::..: ::.::::::: : :. . ::: :..:::::. CCDS54 DLHMREAKKMKQKAELMTDRVGKAFKYLEAVLSFIECGIATESESQSSKSAYSVYSETVD 980 990 1000 1010 1020 1030 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KE9 LIRYAMRLKTHSGPNATPEDKQLAALCYRCLALLYWRMFRLKRDHAVKYSKALIDYFKNS ::.. : ::. : .: ..: .:.::.:: ..: ::: :.: :.:::..: .:..: CCDS54 LIKFIMSLKSFSDATAPTQEKIFAVLCMRCQSILNMAMFRCKKDIAIKYSRTLNKHFESS 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KE9 SKAAQAPSPWGASGKSTGTPSPMSPNPSPASSVGSQGSLSNASALSPSTIVSIPQRIHQM ::.:::::: ..:::::::.:: ::::::::::.: ..... . .. .: : :..: CCDS54 SKVAQAPSP--CIARSTGTPSPLSPMPSPASSVGSQSSAGSVGSSGVAATISTPVTIQNM 1100 1110 1120 1130 1140 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KE9 AANHVSITNSILHSYDYWEMADNLAKENREFFNDLDLLMGPVTLHSSMEHLVQYSQQGLH ....:.::. .: ..: ::.:. :...:.::: :. . ..:.::. ::.:..::.. CCDS54 TSSYVTITSHVLTAFDLWEQAEALTRKNKEFFARLSTNVCTLALNSSLVDLVHYTRQGFQ 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1250 pF1KE9 WLRNSAHLS :. CCDS54 QLQELTKTP 1210 >>CCDS3616.1 AFF1 gene_id:4299|Hs108|chr4 (1210 aa) initn: 1560 init1: 485 opt: 1312 Z-score: 792.0 bits: 158.7 E(32554): 8.5e-38 Smith-Waterman score: 1942; 35.0% identity (60.2% similar) in 1293 aa overlap (43-1245:6-1204) 20 30 40 50 60 70 pF1KE9 DLESLWGEDILNQRNDSLVVEFQSSASRCRSVYEPDRNALRRKERERRNQETQQDDGTFN :.:. ::: :: .:.::::::..:. .: CCDS36 MAAQSSLYNDDRNLLRIREKERRNQEAHQEKEAFP 10 20 30 80 90 100 110 120 pF1KE9 SSYSLFSEPYKTNKGDELSNRIQNTLGNYDEMKDFLTDRSNQSHL------VGVPK-PGV . ::.::::: ::::::.:::: ::::.:.:.::. .:. .: .: :: : . CCDS36 EKIPLFGEPYKTAKGDELSSRIQNMLGNYEEVKEFLSTKSHTHRLDASENRLGKPKYPLI 40 50 60 70 80 90 130 140 150 pF1KE9 P--------------------QTP------VNKIDEHF-VADSRAQNQPSSICSTTTSTP : .:: :..:... .:. :.. .:: . . . . : CCDS36 PDKGSSIPSSSFHTSVHHQSIHTPASGPLSVGNISHNPKMAQPRTEPMPS-LHAKSCGPP 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 pF1KE9 AAVPVQQSKRGTMGW----QKAGHPPSDGQQRATQQGSL-RTLLGDGVGRQQPRAKQVCN . . :.. : :. .: : .::.. :. : . :. .. .: . . CCDS36 DSQHLTQDRLGQEGFGSSHHKKGDRRADGDHCASVTDSAPERELSPLISLPSP-VPPLSP 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE9 VEVGLQTQERPPAMAAKHSSS----GHC-----------------------------VQN .. . :: : . . :.:: :.: :. CCDS36 IHSNQQTLPRTQGSSKVHGSSNNSKGYCPAKSPKDLAVKVHDKETPQDSLVAPAQPPSQT 220 230 240 250 260 270 250 260 270 280 290 pF1KE9 FPP-SLASKPSLVQQKPTAYVRPMDGQDQAPDESPKLKSSSETSVHCTSYRGVPASKPE- ::: :: :: .::::::::::::::::::.:::.:: : .:: : . CCDS36 FPPPSLPSKSVAMQQKPTAYVRPMDGQDQAPSESPELKPLPE------DYRQQTFEKTDL 280 290 300 310 320 300 310 320 330 340 350 pF1KE9 PARAKAKLSKFSIPKQG-EESRSGETNSCVEEIIREMT--WLPPLSAIQAPGKVEPTKFP . :::::.:...:.:. :.. :.:.. :::::..::: : :::.::..:. .::.::: CCDS36 KVPAKAKLTKLKMPSQSVEQTYSNEVH-CVEEILKEMTHSWPPPLTAIHTPSTAEPSKFP 330 340 350 360 370 380 360 370 380 390 400 410 pF1KE9 FPNKDSQLVSSGHNNPKKGDAEPESPDNGTSNTS-MLEDDLKLSSDEEENEQQAAQRTAL ::.:::: ::: .: :. :. .. .:. ..:: ::::::.::..:. . .:. .. CCDS36 FPTKDSQHVSSVTQNQKQYDTSSKTHSNSQQGTSSMLEDDLQLSDSEDSDSEQTPEKPP- 390 400 410 420 430 440 420 430 440 450 460 470 pF1KE9 RALSDSAVVQQPNCRTSVPSSKGSSSSSSSGSSSSSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSK :.:: :. :.: .:. :::. : :.:::.:: ::::.:::::.:: .. CCDS36 ---SSSA---PPSAPQSLPEPVASAHSSSA-ESESTSDSDSS--SDSESESSSSDSEENE 450 460 470 480 490 480 490 500 510 520 530 pF1KE9 PPHFSSPEAEPASSNKWQLDKWLNKVN-PHKPPILIQNESHGSESSQYYNPVKEDVQDCG : . .:: :: ..::::::.::.::. : :: .: .:.. : .. .. : CCDS36 PLETPAPEPEPPTTNKWQLDNWLTKVSQPAAPP-------EGPRSTE---PPRRHPESKG 500 510 520 530 540 540 550 560 570 580 590 pF1KE9 KVPDVCQPSLREKEIKSTCKEEQRPRTANKAPGSKGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPAV- . . : .: .: :. :....::: ..:: :: :. CCDS36 S-----SDSATSQE-HSESKDPP-PKSSSKAP-------RAPPE---------APHPGKR 550 560 570 580 600 610 620 630 640 pF1KE9 PC--APAENAPAPARRSAGKKPTRRTERTSA--GDGANCHRPEEPAAADALGTSVVVPPE : .::.. : : :...: : .. ..:: :. .. . .::. :. . . CCDS36 SCQKSPAQQEP-PQRQTVGTKQPKKPVKASARAGSRTSLQGEREPGLLP-YGSRDQTSKD 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 pF1KE9 PTKTRPCGNNRASHRKELRSSVTCEKRRTRGLSRIVPKSKEFIETESSSSSSSSDSDLES :.. : ::. .: . .: ... . : . :: . :. ..:. . CCDS36 KPKVKTKGRPRAAASNEPKPAVPPSSEKKKHKSSLPAPSKAL-----SGPEPAKDNVEDR 650 660 670 680 690 710 720 730 740 750 760 pF1KE9 EQEEYPLSKAQTVAASASSGNDQRLKEAAANGGSGPRAPVGSINARTTSDIAKELEEQFY :.. : : . :.: ..::: :. : .: ...: .. CCDS36 TPEHFAL-----VPLTESQG--------PPHSGSGSRTS-GCRQAV----VVQEDSRKDR 700 710 720 730 770 780 790 800 810 820 pF1KE9 TLVPFGRNELLSPLKDSDEIRSLWVKIDLTLLSRIPEHLPQEPGVLSAPATKDSESAPPS .:. ..:::::.:. .:: ::: : :::::: : :: : : .. ::. CCDS36 LPLPLRDTKLLSPLRDTPPPQSLMVKITLDLLSRIP----QPPGKGSRQ-RKAEDKQPPA 740 750 760 770 780 790 830 840 850 860 870 880 pF1KE9 ---HTSDTPAEKALPKSKRKRKCDNEDDYREIKKSQGEKDSSSRLATSTSNTLSANHCNM :.:. . . : .::: . : : . :: . ::. .:. ..:.:. : . CCDS36 GKKHSSEKRSSDSSSKLAKKRKGEAERDC-DNKKIRLEKEIKSQSSSSSSS-----HKES 800 810 820 830 840 890 900 910 920 930 940 pF1KE9 NINSVAIPINKNEKMLRSPISPLSDASKHKYTSEDLTSSSRPN---GNSLFTSASSSKKP . .. . : ... : : :.:..:. : .. : : : :.. ::::.:. CCDS36 SKTKPSRPSSQSSKKEMLPPPPVSSSSQ-KPAKPALKRSRREADTCGQDPPKSASSTKSN 850 860 870 880 890 900 950 960 970 980 990 1000 pF1KE9 KADSQLQPHGGDLTKAAHNNSENIPLHKSRPQTKPWSPGSNGHRDCKRQKLVFDDMPRSA . ::.. . :.....::. . . : ::. . .. :: ..: CCDS36 HKDSSIPKQRRVEGKGSRSSSEHKGSSGDTANPFPVPSLPNGNSKPGKPQVKFDK--QQA 910 920 930 940 950 960 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KE9 DYFMQEAKRMKHKADAMVEKFGKALNYAEAALSFIECGNAMEQGPMESKSPYTMYSETVE : :.:::.::.::. :... :::..: ::.::::::: : :. . ::: :..:::::. CCDS36 DLHMREAKKMKQKAELMTDRVGKAFKYLEAVLSFIECGIATESESQSSKSAYSVYSETVD 970 980 990 1000 1010 1020 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KE9 LIRYAMRLKTHSGPNATPEDKQLAALCYRCLALLYWRMFRLKRDHAVKYSKALIDYFKNS ::.. : ::. : .: ..: .:.::.:: ..: ::: :.: :.:::..: .:..: CCDS36 LIKFIMSLKSFSDATAPTQEKIFAVLCMRCQSILNMAMFRCKKDIAIKYSRTLNKHFESS 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KE9 SKAAQAPSPWGASGKSTGTPSPMSPNPSPASSVGSQGSLSNASALSPSTIVSIPQRIHQM ::.:::::: :: ::::::.:: ::::::::::.: ..... . .. .: : :..: CCDS36 SKVAQAPSPCIAS---TGTPSPLSPMPSPASSVGSQSSAGSVGSSGVAATISTPVTIQNM 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KE9 AANHVSITNSILHSYDYWEMADNLAKENREFFNDLDLLMGPVTLHSSMEHLVQYSQQGLH ....:.::. .: ..: ::.:. :...:.::: :. . ..:.::. ::.:..::.. CCDS36 TSSYVTITSHVLTAFDLWEQAEALTRKNKEFFARLSTNVCTLALNSSLVDLVHYTRQGFQ 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1250 pF1KE9 WLRNSAHLS :. CCDS36 QLQELTKTP 1210 >>CCDS4164.1 AFF4 gene_id:27125|Hs108|chr5 (1163 aa) initn: 1566 init1: 573 opt: 1142 Z-score: 691.1 bits: 139.9 E(32554): 3.6e-32 Smith-Waterman score: 2251; 37.7% identity (63.8% similar) in 1269 aa overlap (48-1250:5-1161) 20 30 40 50 60 70 pF1KE9 WGEDILNQRNDSLVVEFQSSASRCRSVYEPDRNALRRKERERRNQETQQDDGTFNSSYSL :::.:: ::::::::: :: . .: : : CCDS41 MNREDRNVLRMKERERRNQEIQQGEDAFPPSSPL 10 20 30 80 90 100 110 120 130 pF1KE9 FSEPYK-TNKGDELSNRIQNTLGNYDEMKDFLTDRSNQSHLVGVPKPGVPQTPVNKIDEH :.:::: :.: :.::.:::. ::::::::::. ::: . ::..::: :: . .: . . CCDS41 FAEPYKVTSKEDKLSSRIQSMLGNYDEMKDFIGDRSIPK-LVAIPKPTVPPSADEKSNPN 40 50 60 70 80 90 140 150 160 pF1KE9 FV------------------ADSRAQNQPSSI----------CSTTTSTPAAVPVQQSKR : : : .:.: : :. .:. . :. : CCDS41 FFEQRHGGSHQSSKWTPVGPAPSTSQSQKRSSGLQSGHSSQRTSAGSSSGTNSSGQRHDR 100 110 120 130 140 150 170 180 190 200 210 pF1KE9 ------GTMGWQKAGHPPSDGQQRATQQG------SL-----RTLLGDGVGRQQPRAKQV :. . .:. : ...:... : :: :. .: .... :.:. CCDS41 ESYNNSGSSSRKKGQHGSEHSKSRSSSPGKPQAVSSLNSSHSRSHGNDHHSKEHQRSKSP 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KE9 CNVEVGLQTQERPPAMAAKHSSSGHCVQNFPPSLASKPSLVQQKPTAYVRPMDGQDQAPD . ... .. : : ::. : .:.::::: :: . . :::::::::::::.. CCDS41 RDPDANWDSPSRVP-----FSSGQHSTQSFPPSLMSKSNSMLQKPTAYVRPMDGQESM-- 220 230 240 250 260 280 290 300 310 320 330 pF1KE9 ESPKLKSSSETSVHCTSYRGVPASKPEPARAKAKLSKFSIPKQG-EESRSGETNSCVEEI :::.: .: . .: .. .:. .::.:.:..::.: . : ::.. :::.:: CCDS41 -EPKLSSEHYSS----QSHGNSMTELKPS-SKAHLTKLKIPSQPLDASASGDV-SCVDEI 270 280 290 300 310 340 350 360 370 380 pF1KE9 IREMT--WLPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPNKDSQLVSSGHNNPKKGDAEPESPDNGTSNT ..::: : :::.::..: :.::.:::::.:.:: . : .. :. . : . .:: .. CCDS41 LKEMTHSWPPPLTAIHTPCKTEPSKFPFPTKESQQSNFGTGEQKRYN--PSKTSNGHQSK 320 330 340 350 360 370 390 400 410 420 430 440 pF1KE9 SMLEDDLKLSSDEEENEQQAAQRTALRALSDSAVVQQPNCRTSVPSSKGSSSSSSSGSSS :::.:::::::.:. . .: ..: :. : : . : .:.:...: . .:: CCDS41 SMLKDDLKLSSSEDSDGEQDCDKTMPRSTPGS------NSEPSHHNSEGADNSRD--DSS 380 390 400 410 420 450 460 470 480 490 500 pF1KE9 SSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSKPPHFSSPEAEPASSNKWQLDKWLNKVNPHKPPIL : : ::::::::::.:::::.::...: . .::: :: .::::::.::::::::: CCDS41 SHSGSESSSGSDSESESSSSDSEANEPSQSASPEPEPPPTNKWQLDNWLNKVNPHKVSPA 430 440 450 460 470 480 510 520 530 540 550 560 pF1KE9 IQNESHGSESSQYYNPVKEDVQDCGK-VPDVCQPSLREKEIKSTCKEEQRPRTANKAPGS . .:. :. : . .: : :. :. : :: :. . .: .:. : CCDS41 SSVDSNIPSSQGYKKEGRE--QGTGNSYTDTSGP----KET-SSATPGRDSKTIQKGSES 490 500 510 520 530 540 570 580 590 600 610 620 pF1KE9 KGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPAVPCAPAENAPAPARRSAGKKPTRRTERTSAGDGANC .:::: :.. . ::..::: ...:...: . . CCDS41 GRGRQKSP---------------------AQSDSTTQRRTVGKKQPKKAEKAAAEEPRGG 550 560 570 580 630 640 650 660 670 680 pF1KE9 HRPEEPAAADALGTSVVVPPEPTKTRPCGNNRASHRKELRSSV--TCEKRRTRGLSRIVP . : . .: :..:. : :. :. . . .:: .:: : ::.. .. :. CCDS41 LKIESETPVD-LASSM--PSSRHKAATKGSRKPNIKKESKSSPRPTAEKKKYKSTSKSSQ 590 600 610 620 630 690 700 710 720 730 740 pF1KE9 KSKEFIETESSSSSSSSDSDLESEQEEYPLSKAQTVAASASSGNDQRLKEAAANGGSGPR ::.:.:::..::: ::: :.: : : .:: :. CCDS41 KSREIIETDTSSS----DSD---ESESLPPS-SQT-----------------------PK 640 650 660 750 760 770 780 790 800 pF1KE9 APVGSINARTTSDIAKELEEQFYT---LVPFGRNELLSPLKDSDEIRSLWVKIDLTLLSR : .. . :.. : :..:. . :. ..::::::.. :. : :::::.::.: CCDS41 YPESNRTPVKPSSV--EEEDSFFRQRMFSPMEEKELLSPLSEPDDRYPLIVKIDLNLLTR 670 680 690 700 710 720 810 820 830 840 850 pF1KE9 IPEHLPQEPGVLSAPATKDSESAPPSHTSDTP---AEKALPKSKRKRKCDNEDDYR--EI : : .: . : .....: .:: .. .::. :.:::.: :::: : : CCDS41 I----PGKPYKETEPPKGEKKNVPEKHTREAQKQASEKVSNKGKRKHK--NEDDNRASES 730 740 750 760 770 860 870 880 890 900 910 pF1KE9 KKSQGEKDSSSRLATSTSNTLSANHCNMNINSVAIPINKNEKMLRSPISPLSDA---SKH :: . : :..: .:: :... :.: :.. .: :: .:. . ..: CCDS41 KKPKTE-DKNSAGHKPSSNRESSKQ------SAA----KEKDLLPSPAGPVPSKDPKTEH 780 790 800 810 820 920 930 940 950 960 970 pF1KE9 KYTSEDLTSSS--RPNGNSLFTSASSSKKPKADSQLQPHGGDLTKAAHNNSENIPLHKSR .. ...:: . ..:: ...:::. .. :. . : ...... .:. : .: CCDS41 GSRKRTISQSSSLKSSSNSNKETSGSSKNSSSTSKQKKTEGKTSSSSKEVKEKAP--SSS 830 840 850 860 870 880 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KE9 PQTKPWSPGSNGHRDCKRQKLVFDDMPRSADYFMQEAKRMKHKADAMVEKFGKALNYAEA . : .: .. . .: :::::: :::...::::..::.:::. ..: ::. : .: CCDS41 SNCPPSAPTLDSSKP-RRTKLVFDDRNYSADHYLQEAKKLKHNADALSDRFEKAVYYLDA 890 900 910 920 930 940 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KE9 ALSFIECGNAMEQGPMESKSPYTMYSETVELIRYAMRLKTHSGPNATPEDKQLAALCYRC ..::::::::.:.. .:::::. ::::::.::.:.:.::.. .:.:: ::.:..:: :: CCDS41 VVSFIECGNALEKNAQESKSPFPMYSETVDLIKYTMKLKNYLAPDATAADKRLTVLCLRC 950 960 970 980 990 1000 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KE9 LALLYWRMFRLKRDHAVKYSKALIDYFKNSSKAAQAPSPWGASGKSTGTPSPMSPNPSPA .::: :.:.::...:.::::.: ...::: . .::::: : ..:..: :::.::. ::. CCDS41 ESLLYLRLFKLKKENALKYSKTLTEHLKNSYNNSQAPSP-GLGSKAVGMPSPVSPKLSPG 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KE9 SSVGSQGSLSNASALSPSTIVSIPQRIHQMAANHVSITNSILHSYDYWEMADNLAKENRE .: . ... :.::: . : :.:::.::::::..:..:...:.. . :..:..:.::..: CCDS41 NSGNYSSGASSASASGSS--VTIPQKIHQMAASYVQVTSNFLYATEIWDQAEQLSKEQKE 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1220 1230 1240 1250 pF1KE9 FFNDLDLLMGPVTLHSS-MEHLVQYSQQGLHWLRNSAHLS :: .:: .:::. ...: : ::.:..:::::::..:.: CCDS41 FFAELDKVMGPLIFNASIMTDLVRYTRQGLHWLRQDAKLIS 1130 1140 1150 1160 >>CCDS76040.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX (1276 aa) initn: 2251 init1: 660 opt: 1005 Z-score: 608.9 bits: 124.9 E(32554): 1.4e-27 Smith-Waterman score: 2396; 37.6% identity (60.4% similar) in 1342 aa overlap (45-1250:18-1275) 20 30 40 50 60 70 pF1KE9 ESLWGEDILNQRNDSLVVEFQSSASRCRSVYEPDRNALRRKERERRNQETQQDDGTFNSS :: ::.::...: ::::::.::.: :.:. CCDS76 MDLFDFFRDWDLEQQCHYEQDRSALKKREWERRNQEVQQEDDLFSSG 10 20 30 40 80 90 100 110 120 130 pF1KE9 YSLFSEPYK----TNKGDELSNRIQNTLGNYDEMKDFLTDRSNQSHLVGVPKPGVPQTPV ..::.:::: ::::: :.::.:::::::::::..::..:::.::::.:: .:::.: CCDS76 FDLFGEPYKVAEYTNKGDALANRVQNTLGNYDEMKNLLTNHSNQNHLVGIPKNSVPQNPN 50 60 70 80 90 100 140 150 160 170 180 pF1KE9 NKIDEHFVADSRAQNQPSSICSTTTSTPAAVP---------VQQSKRGTMGWQKAGHPPS :: . : ... . : .: :.: : ....... :.. .: :: CCDS76 NKNEPSFFPEQKNRIIPPHQDNTHPSAPMPPPSVVILNSTLIHSNRKSKPEWSRDSHNPS 110 120 130 140 150 160 190 200 210 pF1KE9 D--GQQRATQQGSLRTLLGDG-----------------VGR---QQPRAKQVCNVEVG-- ..: . : ....:: : .:. ..: ::. : . . CCDS76 TVLASQASGQPNKMQTLTQDQSQAKLEDFFVYPAEQPQIGEVEESNPSAKEDSNPNSSGE 170 180 190 200 210 220 220 230 240 250 pF1KE9 ------LQT---QERPPAMAAKHS----------SSGHCVQNFPPSLASKPSLVQQKPTA .:. .: :. : : ::: ::::::.: : :. :::::: CCDS76 DAFKEIFQSNSPEESEFAVQAPGSPLVASSLLAPSSGLSVQNFPPGLYCKTSMGQQKPTA 230 240 250 260 270 280 260 270 280 290 300 310 pF1KE9 YVRPMDGQDQAPDESPKLKSSSE--TSVHCTSYRGVPASKPEPARAKAKLSKFSIPKQGE ::::::::::::: :: :: : : .: :. . .:: : .:.:: ::.: . .: CCDS76 YVRPMDGQDQAPDISPTLKPSIEFENSFGNLSFGTLLDGKPSAASSKTKLPKFTILQTSE 290 300 310 320 330 340 320 330 340 350 360 370 pF1KE9 ESRSGETNSCVEEIIREMTWLPPLSAIQAPGKVEPTKFPFPNKDSQLVSSGHNNPKKGDA : .. ::::::.:: :: .. : . : .: CCDS76 VSLPSDP-SCVEEILRE---------------------------SQHLTPGFTLQKWND- 350 360 370 380 390 400 410 420 430 pF1KE9 EPESPDNGTSNTSMLEDDLKLSSDEEENEQQAAQRTALRALSDSAVVQQPNCRTS----- : . ..:.::::::::::::.. : . : : .:.. . :.. CCDS76 -PTT----RASTKMLEDDLKLSSDEDDLEPVKTLTTQCTATELYQAVEKAKPRNNPVNPP 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 pF1KE9 VPSSKGSSSSSSSGSSSSSSDSESSSGSDSETESSSSESEGSKPPHFSSPEAEPASSNKW . . . . ..::.:.:::.::::: :::.::::...::... :. ..:: :: :.::: CCDS76 LATPQPPPAVQASGGSGSSSESESSSESDSDTESSTTDSESNEAPRVATPEPEPPSTNKW 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE9 QLDKWLNKV-NPHKPPILIQNESHGSESSQYYNPVKEDVQDCGKVP-DVCQ-PSL-REKE ::::::::: . .: : :::. :. . :. . .. :: .. : :. .:. CCDS76 QLDKWLNKVTSQNKSFICGQNETP-METISLPPPIIQPMEVQMKVKTNASQVPAEPKERP 500 510 520 530 540 550 550 560 570 580 590 600 pF1KE9 IKSTCKEEQRPRTANKAPGSKGVKQKSPPAAVAVAVSAAAPPPAVPCAPAENAPAPARRS . : .:. ::: ..: : .:..:.: .. .:. .:. CCDS76 LLSLIREKARPRPTQKIPETKALKHKLSTTSETVS----------------------QRT 560 570 580 590 610 620 630 640 650 660 pF1KE9 AGKKPTRRTERTSAGDGANCHRPEEPAAADALGTSVVVPPEPTKTRPCGNNRASHRKELR ::: ...:.... : . .:. ... :: . : .. . ::: : CCDS76 IGKKQPKKVEKNTSTDEFTWPKPNITSSTPKEKESVELHDPPRGRNKATAHKPAPRKEPR 600 610 620 630 640 650 670 680 690 700 710 720 pF1KE9 SSVTC--EKRRTRGLSRIVPKSKEFIETESSSSSSSSDSDLESEQEEYPLSKAQTVAASA .. ::.. :: ..:::::.:::::.::.:.:..: ::: :. 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CCDS76 FPPPLSPLPEDPPRR---RNVSGNNGPFGQDKNIAMTGQITSTKPKRTEGKFCATFKGIS 880 890 900 910 920 930 950 960 pF1KE9 PHGGDLTKAAHNNSENIP------------------------------------------ . :: : : . . .. CCDS76 VNEGDTPKKASSATITVTNTAIATATVTATAIVTTTVTATATATATTTTTTTTISTITST 940 950 960 970 980 990 970 980 990 1000 1010 pF1KE9 -----LHKSRPQTKPWS--PG-SNGHRDCKRQKLVFDDMPRSADYFMQEAKRMKHKADAM . .:. . :. : :.. . .: ::.::: ..:::.:::::..::::::. CCDS76 ITTGLMDSSHLEMTSWAALPLLSSSSTNVRRPKLTFDDSVHNADYYMQEAKKLKHKADAL 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KE9 VEKFGKALNYAEAALSFIECGNAMEQGPMESKSPYTMYSETVELIRYAMRLKTHSGPNAT ::::::.:::.::::: :::::::. :.:.:::::::::::::.:::::::. ..: :. CCDS76 FEKFGKAVNYADAALSFTECGNAMERDPLEAKSPYTMYSETVELLRYAMRLKNFASPLAS 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KE9 PEDKQLAALCYRCLALLYWRMFRLKRDHAVKYSKALIDYFK-NSSKAAQAPSPWGASGKS ::.::.::::::.::: :::.::.:::.:::..:..::: :.::.:: :::: ..::. CCDS76 DGDKKLAVLCYRCLSLLYLRMFKLKKDHAMKYSRSLMEYFKQNASKVAQIPSPWVSNGKN 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KE9 TGTPSPMSPNPSPASSVGSQGSLSNASALSPSTIVSIPQRIHQMAANHVSITNSILHSYD ::::.: : .: ....:. .:. : :.::::::.:::.::.::...:..:. 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CCDS55 KTNASQVPAEPKERPLLSLIREKARPRPTQKIPETKALKHKLSTTSETVS---------- 220 230 240 250 260 600 610 620 630 640 650 pF1KE9 PCAPAENAPAPARRSAGKKPTRRTERTSAGDGANCHRPEEPAAADALGTSVVVPPEPTKT .:. ::: ...:.... : . .:. ... :: . : CCDS55 ------------QRTIGKKQPKKVEKNTSTDEFTWPKPNITSSTPKEKESVELHDPPRGR 270 280 290 300 310 660 670 680 690 700 710 pF1KE9 RPCGNNRASHRKELRSSVTC--EKRRTRGLSRIVPKSKEFIETESSSSSSSSDSDLESEQ .. . ::: : .. ::.. :: ..:::::.:::::.::.:.:..: : CCDS55 NKATAHKPAPRKEPRPNIPLAPEKKKYRGPGKIVPKSREFIETDSSTSDSNTD------Q 320 330 340 350 360 720 730 740 750 760 770 pF1KE9 EEYPLSKAQTVAASASSGNDQRLKEAAANGGSGPRAPVGSINARTTSDIAKELEEQFYTL :: :. :.:: . :: :.: . . : .. ...... :: .. CCDS55 EE-TLQIKVLPPCIISGGNTAKSKEIC--GASLTLSTLMS-SSGSNNNLSISNEEPTFSP 370 380 390 400 410 420 780 790 800 810 820 pF1KE9 VPFGRNELLSPLKDSDEIRSLWVKIDLTLLSRIPEH--LPQEPGVLSAPATKDSESAPPS .: ..:.::::.: .....::::::: ::::.: : : : . : :.. . : CCDS55 IPVMQTEILSPLRDHENLKNLWVKIDLDLLSRVPGHSSLHAAP---AKPDHKETATKPKR 430 440 450 460 470 830 840 850 860 870 880 pF1KE9 HTSDTPAEKALPKSKRKRK-CDNEDDYREIKKSQGEKDSSSRLATSTSNTLSANHCNMNI .:. : .:: ::.:::.: . . : :. : . : : . . : CCDS55 QTAVTAVEKPAPKGKRKHKPIEVAEKIPEKKQRLEEATTICLLPPCISPAPPHKPPNTRE 480 490 500 510 520 530 890 900 910 920 930 940 pF1KE9 NSVAIPIN--KNEKMLRSPISPLSDASKHKYTSEDLTSSSRPNG---NSLFTSASSSKKP :. . : :.::.. :.::: . .. ....... : : : .:. .: :: CCDS55 NNSSRRANRRKEEKLFPPPLSPLPEDPPRR---RNVSGNNGPFGQDKNIAMTGQITSTKP 540 550 560 570 580 590 950 960 pF1KE9 KAD--------SQLQPHGGDLTKAAHNNSENIP--------------------------- : . .. . :: : : . . .. CCDS55 KRTEGKFCATFKGISVNEGDTPKKASSATITVTNTAIATATVTATAIVTTTVTATATATA 600 610 620 630 640 650 970 980 990 1000 pF1KE9 --------------------LHKSRPQTKPWS--PG-SNGHRDCKRQKLVFDDMPRSADY . .:. . :. : :.. . .: ::.::: ..::: CCDS55 TTTTTTTTISTITSTITTGLMDSSHLEMTSWAALPLLSSSSTNVRRPKLTFDDSVHNADY 660 670 680 690 700 710 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KE9 FMQEAKRMKHKADAMVEKFGKALNYAEAALSFIECGNAMEQGPMESKSPYTMYSETVELI .:::::..::::::. ::::::.:::.::::: :::::::. :.:.:::::::::::::. CCDS55 YMQEAKKLKHKADALFEKFGKAVNYADAALSFTECGNAMERDPLEAKSPYTMYSETVELL 720 730 740 750 760 770 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KE9 RYAMRLKTHSGPNATPEDKQLAALCYRCLALLYWRMFRLKRDHAVKYSKALIDYFK-NSS :::::::. ..: :. ::.::.::::::.::: :::.::.:::.:::..:..::: :.: CCDS55 RYAMRLKNFASPLASDGDKKLAVLCYRCLSLLYLRMFKLKKDHAMKYSRSLMEYFKQNAS 780 790 800 810 820 830 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KE9 KAAQAPSPWGASGKSTGTPSPMSPNPSPASSVGSQGSLSNASALSPSTIVSIPQRIHQMA :.:: :::: ..::. ::::.: : .: ....:. .:. : :.::::::.:: CCDS55 KVAQIPSPWVSNGKN--TPSPVSLNN--VSPINAMGNCNNG----P---VTIPQRIHHMA 840 850 860 870 880 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KE9 ANHVSITNSILHSYDYWEMADNLAKENREFFNDLDLLMGPVTLHSSMEHLVQYSQQGLHW :.::.::...:..:..:.:::.:..::.:::.::: ::::.: :::: .::.: .::: : CCDS55 ASHVNITSNVLRGYEHWDMADKLTRENKEFFGDLDTLMGPLTQHSSMTNLVRYVRQGLCW 890 900 910 920 930 940 1250 pF1KE9 LRNSAHLS :: .::: CCDS55 LRIDAHLL 950 >>CCDS78510.1 AFF2 gene_id:2334|Hs108|chrX (1276 aa) initn: 2265 init1: 660 opt: 771 Z-score: 469.6 bits: 99.1 E(32554): 7.8e-20 Smith-Waterman score: 2431; 37.9% identity (61.0% similar) in 1336 aa overlap (45-1250:18-1275) 20 30 40 50 60 70 pF1KE9 ESLWGEDILNQRNDSLVVEFQSSASRCRSVYEPDRNALRRKERERRNQETQQDDGTFNSS :: ::.::...: ::::::.::.: :.:. 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