FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3411, 315 aa 1>>>pF1KE3411 315 - 315 aa - 315 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7782+/-0.00133; mu= 2.5429+/- 0.075 mean_var=253.9868+/-60.234, 0's: 0 Z-trim(106.1): 691 B-trim: 75 in 1/49 Lambda= 0.080476 statistics sampled from 7963 (8775) to 7963 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.651), E-opt: 0.2 (0.27), width: 16 Scan time: 2.370 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS33184.1 CDKL4 gene_id:344387|Hs108|chr2 ( 315) 2129 261.0 8.6e-70 CCDS9699.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 358) 1534 192.0 5.8e-49 CCDS73637.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 276) 1423 179.0 3.8e-45 CCDS3570.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 ( 493) 1212 154.8 1.3e-37 CCDS82933.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 ( 570) 1212 154.9 1.4e-37 CCDS47265.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 ( 455) 1012 131.5 1.2e-30 CCDS47264.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 ( 592) 1012 131.7 1.4e-30 CCDS83458.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX ( 960) 947 124.4 3.5e-28 CCDS14186.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX (1030) 947 124.4 3.7e-28 CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17 ( 305) 751 101.0 1.2e-21 CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10 ( 297) 723 97.7 1.1e-20 CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 ( 298) 723 97.7 1.2e-20 CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7 ( 292) 713 96.6 2.5e-20 CCDS3999.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5 ( 346) 675 92.3 6e-19 CCDS35060.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9 ( 346) 671 91.8 8.3e-19 CCDS75398.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 583) 635 87.9 2.1e-17 CCDS4516.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 623) 635 87.9 2.2e-17 CCDS75399.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 648) 635 87.9 2.2e-17 CCDS4949.1 ICK gene_id:22858|Hs108|chr6 ( 632) 634 87.8 2.4e-17 CCDS10984.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16 ( 360) 628 86.8 2.7e-17 CCDS6409.2 MAPK15 gene_id:225689|Hs108|chr8 ( 544) 629 87.2 3.2e-17 CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 624 86.6 4.7e-17 CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 624 86.6 4.7e-17 CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 496) 620 86.1 6.3e-17 CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 502) 620 86.1 6.3e-17 CCDS55408.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 570) 620 86.1 6.9e-17 CCDS44300.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 474) 615 85.5 9.2e-17 CCDS1454.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 504) 615 85.5 9.5e-17 CCDS75627.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 423) 600 83.7 2.9e-16 CCDS5619.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 451) 600 83.7 3e-16 CCDS75626.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 469) 600 83.7 3e-16 CCDS2350.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 384) 593 82.8 4.7e-16 CCDS58746.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 400) 593 82.8 4.8e-16 CCDS58747.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 429) 593 82.8 5.1e-16 CCDS4816.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 360) 576 80.8 1.8e-15 CCDS4815.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 360) 568 79.9 3.4e-15 CCDS72682.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 748) 564 79.8 7.4e-15 CCDS44043.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 770) 564 79.8 7.5e-15 CCDS81254.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 779) 564 79.8 7.6e-15 CCDS44042.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 780) 564 79.8 7.6e-15 CCDS72684.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 782) 564 79.8 7.6e-15 CCDS81253.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 783) 564 79.8 7.6e-15 CCDS72683.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 795) 564 79.8 7.7e-15 CCDS5628.1 CDK6 gene_id:1021|Hs108|chr7 ( 326) 542 76.8 2.6e-14 CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22 ( 360) 538 76.4 3.8e-14 CCDS14089.1 MAPK12 gene_id:6300|Hs108|chr22 ( 367) 538 76.4 3.8e-14 CCDS14090.1 MAPK11 gene_id:5600|Hs108|chr22 ( 364) 533 75.8 5.7e-14 CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 357) 529 75.3 7.8e-14 CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 379) 529 75.4 8.1e-14 CCDS4817.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 307) 526 74.9 9e-14 >>CCDS33184.1 CDKL4 gene_id:344387|Hs108|chr2 (315 aa) initn: 2129 init1: 2129 opt: 2129 Z-score: 1366.4 bits: 261.0 E(32554): 8.6e-70 Smith-Waterman score: 2129; 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CCDS96 HNKPTRKTLRKSRKHHCFTETSKLQYLPQLTGSSILPALDNKKYYCDTKKLNYRFPNI 310 320 330 340 350 >>CCDS73637.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 (276 aa) initn: 849 init1: 849 opt: 1423 Z-score: 924.1 bits: 179.0 E(32554): 3.8e-45 Smith-Waterman score: 1423; 74.1% identity (90.6% similar) in 266 aa overlap (1-265:2-267) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MEKYEKLAKTGEGSYGVVFKCRNKTSGQVVAVKKFVESEDDPVVKKIALREIRMLKQLK ::::::..: :::::::::::::. .::.::.:::.:::::::.::::::::::::::: CCDS73 MMEKYEKIGKIGEGSYGVVFKCRNRDTGQIVAIKKFLESEDDPVIKKIALREIRMLKQLK 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 HPNLVNLIEVFRRKRKMHLVFEYCDHTLLNELERNPNGVADGVIKSVLWQTLQALNFCHI :::::::.:::::::..::::::::::.:.::.: :: . ..::. ::::::.:::: CCDS73 HPNLVNLLEVFRRKRRLHLVFEYCDHTVLHELDRYQRGVPEHLVKSITWQTLQAVNFCHK 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 HNCIHRDIKPENILITKQGIIKICDFGFAQILI-PGDAYTDYVATRWYRAPELLVGDTQY :::::::.:::::::::...::.::::::..: :.: :::::::::::.:::::::::: CCDS73 HNCIHRDVKPENILITKHSVIKLCDFGFARLLTGPSDYYTDYVATRWYRSPELLVGDTQY 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 GSSVDIWAIGCVFAELLTGQPLWPGKSDVDQLYLIIRTLGKLIPRHQSIFKSNGFFHGIS : ::.:::::::::::.: ::::::::::::::: .::: ::::::..:..: .: :.. 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CCDS35 KAVDVWAIGCLVTEMFMGEPLFPGDSDIDQLYHIMMCLGNLIPRHQELFNKNPVFAGVRL 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 PEPEDMETLEEKFSDVHPVALNFMKGCLKMNPDDRLTCSQLLESSYF--DSF-----QEA :: .. : ::... . :.... : ::...:: : :..::. ..: :.: :: CCDS35 PEIKEREPLERRYPKLSEVVIDLAKKCLHIDPDKRPFCAELLHHDFFQMDGFAERFSQEL 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE3 QIK--RKARNEGRNRRRQQVLPLKS :.: . ::: . ... : CCDS35 QLKVQKDARNVSLSKKSQNRKKEKEKDDSLVEERKTLVVQDTNADPKIKDYKLFKIKGSK 310 320 330 340 350 360 >>CCDS82933.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 (570 aa) initn: 1195 init1: 663 opt: 1212 Z-score: 788.2 bits: 154.9 E(32554): 1.4e-37 Smith-Waterman score: 1218; 53.8% identity (82.1% similar) in 318 aa overlap (1-308:1-318) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MEKYEKLAKTGEGSYGVVFKCRNKTSGQVVAVKKFVESEDDPVVKKIALREIRMLKQLKH :::::.:. .::::::.:.::::: .:..::.:::.::.:: .:::::.:::..::::.: CCDS82 MEKYENLGLVGEGSYGMVMKCRNKDTGRIVAIKKFLESDDDKMVKKIAMREIKLLKQLRH 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 PNLVNLIEVFRRKRKMHLVFEYCDHTLLNELERNPNGVADGVIKSVLWQTLQALNFCHIH :::::.:: ..:.. .::::. :::.:..:: :::. :... :.: .....::: : CCDS82 ENLVNLLEVCKKKKRWYLVFEFVDHTILDDLELFPNGLDYQVVQKYLFQIINGIGFCHSH 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 NCIHRDIKPENILITKQGIIKICDFGFAQILI-PGDAYTDYVATRWYRAPELLVGDTQYG : :::::::::::....:..:.::::::. : ::..:::::::::::::::::::..:: CCDS82 NIIHRDIKPENILVSQSGVVKLCDFGFARTLAAPGEVYTDYVATRWYRAPELLVGDVKYG 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 SSVDIWAIGCVFAELLTGQPLWPGKSDVDQLYLIIRTLGKLIPRHQSIFKSNGFFHGISI ..::.:::::. .:.. :.::.:: ::.:::: :. ::.:::::: .:..: : :. . CCDS82 KAVDVWAIGCLVTEMFMGEPLFPGDSDIDQLYHIMMCLGNLIPRHQELFNKNPVFAGVRL 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 PEPEDMETLEEKFSDVHPVALNFMKGCLKMNPDDRLTCSQLLESSYF--DSF-----QEA :: .. : ::... . :.... : ::...:: : :..::. ..: :.: :: CCDS82 PEIKEREPLERRYPKLSEVVIDLAKKCLHIDPDKRPFCAELLHHDFFQMDGFAERFSQEL 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE3 QIK--RKARNEGRNRRRQQVLPLKS :.: . ::: . ... : CCDS82 QLKVQKDARNVSLSKKSQNRKKEKEKDDSLVEERKTLVVQDTNADPKIKDYKLFKIKGSK 310 320 330 340 350 360 >>CCDS47265.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 (455 aa) initn: 455 init1: 455 opt: 1012 Z-score: 663.8 bits: 131.5 E(32554): 1.2e-30 Smith-Waterman score: 1012; 48.5% identity (79.6% similar) in 309 aa overlap (1-303:1-308) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MEKYEKLAKTGEGSYGVVFKCRNKTSGQVVAVKKFVESEDDPVVKKIALREIRMLKQLKH :: :: :.:.::::::.:.::..:..::.::.: : : .. : .:::.:::..:::..: CCDS47 MEMYETLGKVGEGSYGTVMKCKHKNTGQIVAIKIFYERPEQSV-NKIAMREIKFLKQFHH 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 PNLVNLIEVFRRKRKMHLVFEYCDHTLLNELERNPNGVADGVIKSVLWQTLQALNFCHIH ::::::::::.:.:.:::::. :::.:.::.. .:. . ... :.: :.:... : . CCDS47 ENLVNLIEVFRQKKKIHLVFEFIDHTVLDELQHYCHGLESKRLRKYLFQILRAIDYLHSN 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE3 NCIHRDIKPENILITKQGIIKICDFGFAQILI-PGDAYTDYVATRWYRAPELLVGDTQYG : :::::::::::....:: :.::::::. : ::: :::::::::::::::.. ::.:: CCDS47 NIIHRDIKPENILVSQSGITKLCDFGFARTLAAPGDIYTDYVATRWYRAPELVLKDTSYG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 SSVDIWAIGCVFAELLTGQPLWPGKSDVDQLYLIIRTLGKLIPRHQSIFKSNGFFHGISI . :::::.::.. :. ::.: :..::.: :. :. .:.: :. :.::... .: :. . CCDS47 KPVDIWALGCMIIEMATGNPYLPSSSDLDLLHKIVLKVGNLSPHLQNIFSKSPIFAGVVL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 PEPEDMETLEEKFSDVHPVALNFMKGCLKMNPDDRLTCSQLLESSYF--DSFQEA---QI :. . .. ..:. .. . .....::...: ::.. :.::. :: :.: : .. CCDS47 PQVQHPKNARKKYPKLNGLLADIVHACLQIDPADRISSSDLLHHEYFTRDGFIEKFMPEL 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 KRKARNEGRNRRRQQVLPLKS : : .:.. CCDS47 KAKLLQEAKVNSLIKPKESSKENELRKDERKTVYTNTLLSSSVLGKEIEKEKKPKEIKVR 300 310 320 330 340 350 >>CCDS47264.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 (592 aa) initn: 455 init1: 455 opt: 1012 Z-score: 662.5 bits: 131.7 E(32554): 1.4e-30 Smith-Waterman score: 1012; 48.5% identity (79.6% similar) in 309 aa overlap (1-303:1-308) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MEKYEKLAKTGEGSYGVVFKCRNKTSGQVVAVKKFVESEDDPVVKKIALREIRMLKQLKH :: :: :.:.::::::.:.::..:..::.::.: : : .. : .:::.:::..:::..: CCDS47 MEMYETLGKVGEGSYGTVMKCKHKNTGQIVAIKIFYERPEQSV-NKIAMREIKFLKQFHH 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 PNLVNLIEVFRRKRKMHLVFEYCDHTLLNELERNPNGVADGVIKSVLWQTLQALNFCHIH ::::::::::.:.:.:::::. :::.:.::.. .:. . ... :.: :.:... : . CCDS47 ENLVNLIEVFRQKKKIHLVFEFIDHTVLDELQHYCHGLESKRLRKYLFQILRAIDYLHSN 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KE3 NCIHRDIKPENILITKQGIIKICDFGFAQILI-PGDAYTDYVATRWYRAPELLVGDTQYG : :::::::::::....:: :.::::::. : ::: :::::::::::::::.. ::.:: CCDS47 NIIHRDIKPENILVSQSGITKLCDFGFARTLAAPGDIYTDYVATRWYRAPELVLKDTSYG 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 SSVDIWAIGCVFAELLTGQPLWPGKSDVDQLYLIIRTLGKLIPRHQSIFKSNGFFHGISI . :::::.::.. :. ::.: :..::.: :. :. .:.: :. :.::... .: :. . CCDS47 KPVDIWALGCMIIEMATGNPYLPSSSDLDLLHKIVLKVGNLSPHLQNIFSKSPIFAGVVL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 PEPEDMETLEEKFSDVHPVALNFMKGCLKMNPDDRLTCSQLLESSYF--DSFQEA---QI :. . .. ..:. .. . .....::...: ::.. :.::. :: :.: : .. CCDS47 PQVQHPKNARKKYPKLNGLLADIVHACLQIDPADRISSSDLLHHEYFTRDGFIEKFMPEL 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 KRKARNEGRNRRRQQVLPLKS : : .:.. CCDS47 KAKLLQEAKVNSLIKPKESSKENELRKDERKTVYTNTLLSSSVLGKEIEKEKKPKEIKVR 300 310 320 330 340 350 >>CCDS83458.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX (960 aa) initn: 863 init1: 522 opt: 947 Z-score: 619.3 bits: 124.4 E(32554): 3.5e-28 Smith-Waterman score: 947; 45.4% identity (77.1% similar) in 306 aa overlap (1-303:10-313) 10 20 30 40 50 pF1KE3 MEKYEKLAKTGEGSYGVVFKCRNKTSGQVVAVKKFVESEDDPVVKKIALRE :.:.: :. .:::.::::.:::.: . ..::.::: .::.. ::. .::: CCDS83 MKIPNIGNVMNKFEILGVVGEGAYGVVLKCRHKETHEIVAIKKFKDSEENEEVKETTLRE 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 IRMLKQLKHPNLVNLIEVFRRKRKMHLVFEYCDHTLLNELERNPNGVADGVIKSVLWQTL ..::. ::. :.:.: :.:::. :..::::: ....:. ::. :::: .:: ..: . 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CCDS14 LKMLRTLKQENIVELKEAFRRRGKLYLVFEYVEKNMLELLEEMPNGVPPEKVKSYIYQLI 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 pF1KE3 QALNFCHIHNCIHRDIKPENILITKQGIIKICDFGFAQILIPGDA--YTDYVATRWYRAP .:...:: .. .::::::::.::... ..:.::::::. : :. ::.::::::::.: CCDS14 KAIHWCHKNDIVHRDIKPENLLISHNDVLKLCDFGFARNLSEGNNANYTEYVATRWYRSP 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 ELLVGDTQYGSSVDIWAIGCVFAELLTGQPLWPGKSDVDQLYLIIRTLGKLIPRHQSIFK :::.: . ::.:::.:..::...:: ::::.::.:..:::. : ..:: : .....: CCDS14 ELLLG-APYGKSVDMWSVGCILGELSDGQPLFPGESEIDQLFTIQKVLGPLPSEQMKLFY 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 SNGFFHGISIPEPEDMETLEEKFSDV-HPVALNFMKGCLKMNPDDRLTCSQLLESSYFDS :: :::. .: . ..::... . . : :..::. ::..: :: : :. :.. CCDS14 SNPRFHGLRFPAVNHPQSLERRYLGILNSVLLDLMKNLLKLDPADRYLTEQCLNHPTFQT 240 250 260 270 280 290 290 300 310 pF1KE3 FQEAQIKRKARNEGRNRRRQQVLPLKS :. . .:. : CCDS14 -QRLLDRSPSRSAKRKPYHVESSTLSNRNQAGKSTALQSHHRSNSKDIQNLSVGLPRADE 300 310 320 330 340 350 >>CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17 (305 aa) initn: 702 init1: 278 opt: 751 Z-score: 501.9 bits: 101.0 E(32554): 1.2e-21 Smith-Waterman score: 751; 40.2% identity (71.8% similar) in 301 aa overlap (1-297:1-297) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MEKYEKLAKTGEGSYGVVFKCRNKTSGQVVAVKKFVESEDDPVVKKIALREIRMLKQLKH :. ..:. : :::.::::.: .:. .::.::.::. . . : . :.::: .::.::: CCDS11 MDMFQKVEKIGEGTYGVVYKAKNRETGQLVALKKIRLDLEMEGVPSTAIREISLLKELKH 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 PNLVNLIEVFRRKRKMHLVFEYCDHTLLNELERNPNG-VADGVIKSVLWQTLQALNFCHI ::.: :..: . .::..::::. .. : . .. .:.. . .::: :.: ::...::: CCDS11 PNIVRLLDVVHNERKLYLVFEFLSQDLKKYMDSTPGSELPLHLIKSYLFQLLQGVSFCHS 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE3 HNCIHRDIKPENILITKQGIIKICDFGFAQIL-IPGDAYTDYVATRWYRAPELLVGDTQY : ::::.::.:.::.. : ::. :::.:. . .: .:: :.: ::::::.:.:. : CCDS11 HRVIHRDLKPQNLLINELGAIKLADFGLARAFGVPLRTYTHEVVTLWYRAPEILLGSKFY 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE3 GSSVDIWAIGCVFAELLTGQPLWPGKSDVDQLYLIIRTLGKLIPRHQSIFKSNGF--FHG ..::::.:::.:::..: . :.:: :..:::. :.: :: : ... . . ..: CCDS11 TTAVDIWSIGCIFAEMVTRKALFPGDSEIDQLFRIFRMLGT--PSEDTWPGVTQLPDYKG 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE3 ISIPEPEDMETLEEKFSDVHPVALNFMKGCLKMNPDDRLTCSQLLESSYFDSFQEAQIKR :.:. . ::: ...: . ... :...:..:.: . : ::.: . . : CCDS11 -SFPK-WTRKGLEEIVPNLEPEGRDLLMQLLQYDPSQRITAKTALAHPYFSSPEPSPAAR 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE3 KARNEGRNRRRQQVLPLKS . CCDS11 QYVLQRFRH 300 315 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sun Nov 6 04:42:46 2016 done: Sun Nov 6 04:42:47 2016 Total Scan time: 2.370 Total Display time: 0.030 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]