FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB0482, 1024 aa 1>>>pF1KB0482 1024 - 1024 aa - 1024 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5261+/-0.00057; mu= 14.7557+/- 0.035 mean_var=89.8357+/-18.837, 0's: 0 Z-trim(107.7): 190 B-trim: 453 in 1/55 Lambda= 0.135316 statistics sampled from 15573 (15792) to 15573 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.515), E-opt: 0.2 (0.185), width: 16 Scan time: 14.090 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001186067 (OMIM: 606831,616050,616115) NLR fami (1024) 6709 1321.3 0 NP_001186068 (OMIM: 606831,616050,616115) NLR fami (1024) 6709 1321.3 0 NP_067032 (OMIM: 606831,616050,616115) NLR family (1024) 6709 1321.3 0 XP_016860108 (OMIM: 606831,616050,616115) PREDICTE ( 788) 5134 1013.8 0 NP_001289433 (OMIM: 606831,616050,616115) NLR fami ( 359) 1763 355.6 2.9e-97 NP_075043 (OMIM: 600355) baculoviral IAP repeat-co (1241) 648 138.1 2.9e-31 NP_004527 (OMIM: 600355) baculoviral IAP repeat-co (1403) 648 138.1 3.3e-31 XP_016864979 (OMIM: 600355) PREDICTED: baculoviral (1015) 643 137.1 4.8e-31 XP_011541715 (OMIM: 600355) PREDICTED: baculoviral (1015) 643 137.1 4.8e-31 XP_011521563 (OMIM: 186580,266600,605956,607507,60 ( 793) 162 43.1 0.0072 XP_011521562 (OMIM: 186580,266600,605956,607507,60 ( 793) 162 43.1 0.0072 XP_006721306 (OMIM: 186580,266600,605956,607507,60 ( 793) 162 43.1 0.0072 XP_016879025 (OMIM: 186580,266600,605956,607507,60 ( 818) 162 43.1 0.0074 XP_016879026 (OMIM: 186580,266600,605956,607507,60 ( 818) 162 43.1 0.0074 XP_016879027 (OMIM: 186580,266600,605956,607507,60 ( 818) 162 43.1 0.0074 XP_011521561 (OMIM: 186580,266600,605956,607507,60 ( 818) 162 43.1 0.0074 XP_016879024 (OMIM: 186580,266600,605956,607507,60 ( 849) 162 43.1 0.0076 XP_006721305 (OMIM: 186580,266600,605956,607507,60 ( 985) 162 43.2 0.0087 NP_001280486 (OMIM: 186580,266600,605956,607507,60 (1013) 162 43.2 0.0089 XP_005256141 (OMIM: 186580,266600,605956,607507,60 (1013) 162 43.2 0.0089 NP_071445 (OMIM: 186580,266600,605956,607507,60946 (1040) 162 43.2 0.0091 >>NP_001186067 (OMIM: 606831,616050,616115) NLR family C (1024 aa) initn: 6709 init1: 6709 opt: 6709 Z-score: 7078.2 bits: 1321.3 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 6709; 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