Result of FASTA (omim) for
pFN21AE3528
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3528, 912 aa
1>>>pF1KE3528 912 - 912 aa - 912 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6437+/-0.000474; mu= 15.1103+/- 0.029
mean_var=119.2673+/-24.264, 0's: 0 Z-trim(112.5): 184 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.117439
statistics sampled from 21227 (21448) to 21227 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.611), E-opt: 0.2 (0.251), width: 16
Scan time: 13.710
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_065954 (OMIM: 609546) ubiquitin carboxyl-termin ( 922) 6045 1036.5 0
NP_114113 (OMIM: 300309) ubiquitin carboxyl-termin ( 913) 1700 300.3 2.9e-80
XP_016885381 (OMIM: 300309) PREDICTED: ubiquitin c ( 913) 1700 300.3 2.9e-80
XP_016878211 (OMIM: 603158) PREDICTED: ubiquitin c ( 928) 311 65.0 2e-09
XP_016878210 (OMIM: 603158) PREDICTED: ubiquitin c ( 928) 311 65.0 2e-09
NP_001269978 (OMIM: 603158) ubiquitin carboxyl-ter (1012) 311 65.0 2.2e-09
XP_006720825 (OMIM: 603158) PREDICTED: ubiquitin c (1089) 311 65.0 2.3e-09
XP_016878207 (OMIM: 603158) PREDICTED: ubiquitin c (1089) 311 65.0 2.3e-09
XP_016878209 (OMIM: 603158) PREDICTED: ubiquitin c (1089) 311 65.0 2.3e-09
XP_016878208 (OMIM: 603158) PREDICTED: ubiquitin c (1089) 311 65.0 2.3e-09
XP_011520495 (OMIM: 603158) PREDICTED: ubiquitin c (1118) 311 65.0 2.3e-09
NP_005145 (OMIM: 603158) ubiquitin carboxyl-termin (1118) 311 65.0 2.3e-09
NP_001122082 (OMIM: 603158) ubiquitin carboxyl-ter (1118) 311 65.0 2.3e-09
XP_006720824 (OMIM: 603158) PREDICTED: ubiquitin c (1118) 311 65.0 2.3e-09
XP_016861124 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c ( 871) 239 52.7 9e-06
XP_005264888 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1268) 239 52.9 1.2e-05
XP_016861123 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1270) 239 52.9 1.2e-05
XP_016861122 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1281) 239 52.9 1.2e-05
XP_016861121 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1283) 239 52.9 1.2e-05
XP_016861120 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1283) 239 52.9 1.2e-05
XP_016861119 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1285) 239 52.9 1.2e-05
XP_016861118 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1303) 239 52.9 1.2e-05
XP_016861117 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1305) 239 52.9 1.2e-05
XP_016861116 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1307) 239 52.9 1.2e-05
XP_016861115 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1318) 239 52.9 1.2e-05
NP_006668 (OMIM: 614471) ubiquitin carboxyl-termin (1318) 239 52.9 1.2e-05
XP_016861114 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1320) 239 52.9 1.2e-05
XP_005264887 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1322) 239 52.9 1.2e-05
XP_016861113 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1332) 239 52.9 1.3e-05
XP_006713015 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1367) 239 52.9 1.3e-05
XP_006713014 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1368) 239 52.9 1.3e-05
XP_016861112 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1369) 239 52.9 1.3e-05
XP_006713013 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1369) 239 52.9 1.3e-05
XP_016861110 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1371) 239 52.9 1.3e-05
XP_016861111 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1371) 239 52.9 1.3e-05
NP_001186091 (OMIM: 614471) ubiquitin carboxyl-ter (1372) 239 52.9 1.3e-05
XP_006713012 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1373) 239 52.9 1.3e-05
XP_016861109 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1381) 239 52.9 1.3e-05
XP_006713011 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1382) 239 52.9 1.3e-05
XP_016861108 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1383) 239 52.9 1.3e-05
XP_016861107 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1384) 239 52.9 1.3e-05
NP_001186090 (OMIM: 614471) ubiquitin carboxyl-ter (1384) 239 52.9 1.3e-05
XP_005264886 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1386) 239 52.9 1.3e-05
XP_006713016 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1404) 239 52.9 1.3e-05
XP_006713010 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1405) 239 52.9 1.3e-05
XP_016861106 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1406) 239 52.9 1.3e-05
XP_005264884 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1408) 239 52.9 1.3e-05
XP_016861105 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1418) 239 52.9 1.3e-05
NP_001186089 (OMIM: 614471) ubiquitin carboxyl-ter (1419) 239 52.9 1.3e-05
XP_016861104 (OMIM: 614471) PREDICTED: ubiquitin c (1420) 239 52.9 1.3e-05
>>NP_065954 (OMIM: 609546) ubiquitin carboxyl-terminal h (922 aa)
initn: 6045 init1: 6045 opt: 6045 Z-score: 5540.6 bits: 1036.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6045; 100.0% identity (100.0% similar) in 912 aa overlap (1-912:1-912)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MISLKVCGFIQIWSQKTGMTKLKEALIETVQRQKEIKLVVTFKSGKFIRIFQLSNNIRSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MISLKVCGFIQIWSQKTGMTKLKEALIETVQRQKEIKLVVTFKSGKFIRIFQLSNNIRSV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 VLRHCKKRQSHLRLTLKNNVFLFIDKLSYRDAKQLNMFLDIIHQNKSQQPMKSDDDWSVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 VLRHCKKRQSHLRLTLKNNVFLFIDKLSYRDAKQLNMFLDIIHQNKSQQPMKSDDDWSVF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 ESRNMLKEIDKTSFYSICNKPSYQKMPLFMSKSPTHVKKGILENQGGKGQNTLSSDVQTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 ESRNMLKEIDKTSFYSICNKPSYQKMPLFMSKSPTHVKKGILENQGGKGQNTLSSDVQTN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 EDILKEDNPVPNKKYKTDSLKYIQSNRKNPSSLEDLEKDRDLKLGPSFNTNCNGNPNLDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 EDILKEDNPVPNKKYKTDSLKYIQSNRKNPSSLEDLEKDRDLKLGPSFNTNCNGNPNLDE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 TVLATQTLNAKNGLTSPLEPEHSQGDPRCNKAQVPLDSHSQQLQQGFPNLGNTCYMNAVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 TVLATQTLNAKNGLTSPLEPEHSQGDPRCNKAQVPLDSHSQQLQQGFPNLGNTCYMNAVL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 QSLFAIPSFADDLLTQGVPWEYIPFEALIMTLTQLLALKDFCSTKIKRELLGNVKKVISA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 QSLFAIPSFADDLLTQGVPWEYIPFEALIMTLTQLLALKDFCSTKIKRELLGNVKKVISA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 VAEIFSGNMQNDAHEFLGQCLDQLKEDMEKLNATLNTGKECGDENSSPQMHVGSAATKVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 VAEIFSGNMQNDAHEFLGQCLDQLKEDMEKLNATLNTGKECGDENSSPQMHVGSAATKVF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 VCPVVANFEFELQLSLICKACGHAVLKVEPNNYLSINLHQETKPLPLSIQNSLDLFFKEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 VCPVVANFEFELQLSLICKACGHAVLKVEPNNYLSINLHQETKPLPLSIQNSLDLFFKEE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 ELEYNCQMCKQKSCVARHTFSRLSRVLIIHLKRYSFNNAWLLVKNNEQVYIPKSLSLSSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 ELEYNCQMCKQKSCVARHTFSRLSRVLIIHLKRYSFNNAWLLVKNNEQVYIPKSLSLSSY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 CNESTKPPLPLSSSAPVGKCEVLEVSQEMISEINSPLTPSMKLTSESSDSLVLPVEPDKN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 CNESTKPPLPLSSSAPVGKCEVLEVSQEMISEINSPLTPSMKLTSESSDSLVLPVEPDKN
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 ADLQRFQRDCGDASQEQHQRDLENGSALESELVHFRDRAIGEKELPVADSLMDQGDISLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 ADLQRFQRDCGDASQEQHQRDLENGSALESELVHFRDRAIGEKELPVADSLMDQGDISLP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE3 VMYEDGGKLISSPDTRLVEVHLQEVPQHPELQKYEKTNTFVEFNFDSVTESTNGFYDCKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 VMYEDGGKLISSPDTRLVEVHLQEVPQHPELQKYEKTNTFVEFNFDSVTESTNGFYDCKE
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE3 NRIPEGSQGMAEQLQQCIEESIIDEFLQQAPPPGVRKLDAQEHTEETLNQSTELRLQKAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 NRIPEGSQGMAEQLQQCIEESIIDEFLQQAPPPGVRKLDAQEHTEETLNQSTELRLQKAD
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE3 LNHLGALGSDNPGNKNILDAENTRGEAKELTRNVKMGDPLQAYRLISVVSHIGSSPNSGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 LNHLGALGSDNPGNKNILDAENTRGEAKELTRNVKMGDPLQAYRLISVVSHIGSSPNSGH
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE3 YISDVYDFQKQAWFTYNDLCVSEISETKMQEARLHSGYIFFYMHNGIFEELLRKAENSRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 YISDVYDFQKQAWFTYNDLCVSEISETKMQEARLHSGYIFFYMHNGIFEELLRKAENSRL
850 860 870 880 890 900
910
pF1KE3 PSTQAGVIPQGE
::::::::::::
NP_065 PSTQAGVIPQGEYEGDSLYRPA
910 920
>>NP_114113 (OMIM: 300309) ubiquitin carboxyl-terminal h (913 aa)
initn: 2104 init1: 1067 opt: 1700 Z-score: 1562.1 bits: 300.3 E(85289): 2.9e-80
Smith-Waterman score: 2409; 46.6% identity (70.9% similar) in 920 aa overlap (1-904:1-905)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MISLKVCGFIQIWSQKTGMTKLKEALIETVQRQKEIKLVVTFKSGKFIRIFQLSNNIRSV
: .: . ::.:: . :::..: :::.::.:.:.:. .::. :::::. :.::.::..:
NP_114 MAALFLRGFVQIGNCKTGISKSKEAFIEAVERKKKDRLVLYFKSGKY-STFRLSDNIQNV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 VLRHCKKRQSHLRLTLKNNVFLFIDKLSYRDAKQLNMFLDIIHQNKSQQPMKSDDDWSVF
::. . :.::.:::.:: :::. :: ::.::..::: .:::. : :.. :::
NP_114 VLKSYRGNQNHLHLTLQNNNGLFIEGLSSTDAEQLKIFLDRVHQNEVQPPVRPGKGGSVF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160
pF1KE3 ESRNMLKEIDKTSFYSICNKPS--------------YQKMPLFMSKSPTHVKKGILENQG
: .. :::.::::... .: : :.:::. :: : . . :::
NP_114 SSTTQ-KEINKTSFHKVDEKSSSKSFEIAKGSGTGVLQRMPLLTSKL-TLTCGELSENQH
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 GKGQNTLSSDVQTNEDILKEDNPVPNKKYKTDSLKYIQSNRKNPSSLEDLEKDRDLKLGP
: . :::. . ::..:::.: : :: :.: . .. ::.. .:..::... :.
NP_114 KKRKRMLSSSSEMNEEFLKENNSVEYKKSKADCSRCVSYNREKQLKLKELEENKKLECES
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 SFNTNCNGNPNLDETVLATQTLNAKNGLTSPLEPEHSQGDPRCNKAQVPLDSHSQQLQQG
: : .::: ::. : :.:. : :. :. .:.: . .: .. .. ... .:
NP_114 SCIMNATGNPYLDDIGL-LQALTEKMVLVFLLQQGYSDGYTKWDKLKLFFELFPEKICHG
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 FPNLGNTCYMNAVLQSLFAIPSFADDLLTQGVPWEYIPFEALIMTLTQLLALKDFCSTKI
.::::::::::::::::..:::::::::.:. :: ::..:: : :..:: .:: . .:
NP_114 LPNLGNTCYMNAVLQSLLSIPSFADDLLNQSFPWGKIPLNALTMCLARLLFFKDTYNIEI
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 KRELLGNVKKVISAVAEIFSGNMQNDAHEFLGQCLDQLKEDMEKLNATLNTGKECGDENS
:. :: :.::.:::.:::: :: ::::::::..::::::..:::::. . .: :..:
NP_114 KEMLLLNLKKAISAAAEIFHGNAQNDAHEFLAHCLDQLKDNMEKLNTIWKPKSEFGEDNF
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 SPQMHVGSAATKVFVCPVVANFEFELQLSLICKACGHAVLKVEPNNYLSINLHQETKPLP
:. . . :. : :::..:::.:: :. :::::...::.: :::::::: :. : :
NP_114 PKQVFADDPDTSGFSCPVITNFELELLHSIACKACGQVILKTELNNYLSINLPQRIKAHP
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE3 LSIQNSLDLFFKEEELEYNCQMCKQKSCVARHTFSRLSRVLIIHLKRYSFNNAWLLVKNN
:::...:::: :::::.: :..:. :. :.:::: :.::.::::::.:. : ::.
NP_114 SSIQSTFDLFFGAEELEYKCAKCEHKTSVGVHSFSRLPRILIVHLKRYSLNEFCALKKND
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE3 EQVYIPKSLSLSSYCNESTKPPLPLSSSAPVGKCEVLEVSQEMISEINSPLTPSMKLTSE
..: : : :..::.:::.:.:::::: .. . ..:.: ..: : . .. : :.:
NP_114 QEVIISKYLKVSSHCNEGTRPPLPLSEDGEITDFQLLKVIRKMTS---GNISVSWPATKE
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KE3 SSDSLVLPVEPDKNADLQRFQRDCGDASQEQHQRDL-ENGSALESELVHFRDRAIGEKEL
:.: :. . ::... .. : ::..:.:. : .:.. : : :. :::. :::
NP_114 SKDILAPHIGSDKESEQKKGQTVFKGASRRQQQKYLGKNSKPNELESVYSGDRAFIEKE-
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KE3 PVADSLMDQGDISLPVMYEDGGKLISSPDTRLVEVHLQEVPQHPELQKYEKTNTFVEFNF
:.: . : :: ... ::: ::: : : .: .: ::..:. .:: ::. :: :
NP_114 PLAHLMTYLEDTSLCQFHKAGGKPASSPGTPLSKVDFQTVPENPKRKKYVKTSKFVA--F
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KE3 DSVTESTNGFYDCKENRIPEGSQGMAEQLQQCIEESIIDEFLQQAPPPGVRKLDAQEHTE
: . . :. .:. :. :::: : ..:: ::: : .. ::: : . : .: ::.
NP_114 DRIINPTKDLYEDKNIRIPERFQKVSEQTQQCDGMRICEQAPQQALPQSFPKPGTQGHTK
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KE3 ETLNQSTELRLQKADLNHLGALGSD-NPGNKNILDAENTRGEAKELTRNVKMGDPLQAYR
. : . :.: :::.. : : ::::. :: ::.::: . ...::: :: :: ..::
NP_114 NLL-RPTKLNLQKSNRNSLLALGSNKNPRNKDILD--KIKSKAKETKRNDDKGD--HTYR
780 790 800 810 820
830 840 850 860 870 880
pF1KE3 LISVVSHIGSSPNSGHYISDVYDFQKQAWFTYNDLCVSEISETKMQEARLHSGYIFFYMH
:::::::.:.. .::::: :.:::.:: ::::.:. : :.:..::: : .::::::::
NP_114 LISVVSHLGKTLKSGHYICDAYDFEKQIWFTYDDMRVLGIQEAQMQEDRRCTGYIFFYMH
830 840 850 860 870 880
890 900 910
pF1KE3 NGIFEELLRKAENSRLPSTQAGVIPQGE
: ::::.:.. ::..: : .
NP_114 NEIFEEMLKREENAQLNSKEVEETLQKE
890 900 910
>>XP_016885381 (OMIM: 300309) PREDICTED: ubiquitin carbo (913 aa)
initn: 2104 init1: 1067 opt: 1700 Z-score: 1562.1 bits: 300.3 E(85289): 2.9e-80
Smith-Waterman score: 2409; 46.6% identity (70.9% similar) in 920 aa overlap (1-904:1-905)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MISLKVCGFIQIWSQKTGMTKLKEALIETVQRQKEIKLVVTFKSGKFIRIFQLSNNIRSV
: .: . ::.:: . :::..: :::.::.:.:.:. .::. :::::. :.::.::..:
XP_016 MAALFLRGFVQIGNCKTGISKSKEAFIEAVERKKKDRLVLYFKSGKY-STFRLSDNIQNV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 VLRHCKKRQSHLRLTLKNNVFLFIDKLSYRDAKQLNMFLDIIHQNKSQQPMKSDDDWSVF
::. . :.::.:::.:: :::. :: ::.::..::: .:::. : :.. :::
XP_016 VLKSYRGNQNHLHLTLQNNNGLFIEGLSSTDAEQLKIFLDRVHQNEVQPPVRPGKGGSVF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160
pF1KE3 ESRNMLKEIDKTSFYSICNKPS--------------YQKMPLFMSKSPTHVKKGILENQG
: .. :::.::::... .: : :.:::. :: : . . :::
XP_016 SSTTQ-KEINKTSFHKVDEKSSSKSFEIAKGSGTGVLQRMPLLTSKL-TLTCGELSENQH
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE3 GKGQNTLSSDVQTNEDILKEDNPVPNKKYKTDSLKYIQSNRKNPSSLEDLEKDRDLKLGP
: . :::. . ::..:::.: : :: :.: . .. ::.. .:..::... :.
XP_016 KKRKRMLSSSSEMNEEFLKENNSVEYKKSKADCSRCVSYNREKQLKLKELEENKKLECES
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE3 SFNTNCNGNPNLDETVLATQTLNAKNGLTSPLEPEHSQGDPRCNKAQVPLDSHSQQLQQG
: : .::: ::. : :.:. : :. :. .:.: . .: .. .. ... .:
XP_016 SCIMNATGNPYLDDIGL-LQALTEKMVLVFLLQQGYSDGYTKWDKLKLFFELFPEKICHG
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE3 FPNLGNTCYMNAVLQSLFAIPSFADDLLTQGVPWEYIPFEALIMTLTQLLALKDFCSTKI
.::::::::::::::::..:::::::::.:. :: ::..:: : :..:: .:: . .:
XP_016 LPNLGNTCYMNAVLQSLLSIPSFADDLLNQSFPWGKIPLNALTMCLARLLFFKDTYNIEI
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE3 KRELLGNVKKVISAVAEIFSGNMQNDAHEFLGQCLDQLKEDMEKLNATLNTGKECGDENS
:. :: :.::.:::.:::: :: ::::::::..::::::..:::::. . .: :..:
XP_016 KEMLLLNLKKAISAAAEIFHGNAQNDAHEFLAHCLDQLKDNMEKLNTIWKPKSEFGEDNF
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 SPQMHVGSAATKVFVCPVVANFEFELQLSLICKACGHAVLKVEPNNYLSINLHQETKPLP
:. . . :. : :::..:::.:: :. :::::...::.: :::::::: :. : :
XP_016 PKQVFADDPDTSGFSCPVITNFELELLHSIACKACGQVILKTELNNYLSINLPQRIKAHP
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE3 LSIQNSLDLFFKEEELEYNCQMCKQKSCVARHTFSRLSRVLIIHLKRYSFNNAWLLVKNN
:::...:::: :::::.: :..:. :. :.:::: :.::.::::::.:. : ::.
XP_016 SSIQSTFDLFFGAEELEYKCAKCEHKTSVGVHSFSRLPRILIVHLKRYSLNEFCALKKND
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE3 EQVYIPKSLSLSSYCNESTKPPLPLSSSAPVGKCEVLEVSQEMISEINSPLTPSMKLTSE
..: : : :..::.:::.:.:::::: .. . ..:.: ..: : . .. : :.:
XP_016 QEVIISKYLKVSSHCNEGTRPPLPLSEDGEITDFQLLKVIRKMTS---GNISVSWPATKE
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KE3 SSDSLVLPVEPDKNADLQRFQRDCGDASQEQHQRDL-ENGSALESELVHFRDRAIGEKEL
:.: :. . ::... .. : ::..:.:. : .:.. : : :. :::. :::
XP_016 SKDILAPHIGSDKESEQKKGQTVFKGASRRQQQKYLGKNSKPNELESVYSGDRAFIEKE-
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KE3 PVADSLMDQGDISLPVMYEDGGKLISSPDTRLVEVHLQEVPQHPELQKYEKTNTFVEFNF
:.: . : :: ... ::: ::: : : .: .: ::..:. .:: ::. :: :
XP_016 PLAHLMTYLEDTSLCQFHKAGGKPASSPGTPLSKVDFQTVPENPKRKKYVKTSKFVA--F
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KE3 DSVTESTNGFYDCKENRIPEGSQGMAEQLQQCIEESIIDEFLQQAPPPGVRKLDAQEHTE
: . . :. .:. :. :::: : ..:: ::: : .. ::: : . : .: ::.
XP_016 DRIINPTKDLYEDKNIRIPERFQKVSEQTQQCDGMRICEQAPQQALPQSFPKPGTQGHTK
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KE3 ETLNQSTELRLQKADLNHLGALGSD-NPGNKNILDAENTRGEAKELTRNVKMGDPLQAYR
. : . :.: :::.. : : ::::. :: ::.::: . ...::: :: :: ..::
XP_016 NLL-RPTKLNLQKSNRNSLLALGSNKNPRNKDILD--KIKSKAKETKRNDDKGD--HTYR
780 790 800 810 820
830 840 850 860 870 880
pF1KE3 LISVVSHIGSSPNSGHYISDVYDFQKQAWFTYNDLCVSEISETKMQEARLHSGYIFFYMH
:::::::.:.. .::::: :.:::.:: ::::.:. : :.:..::: : .::::::::
XP_016 LISVVSHLGKTLKSGHYICDAYDFEKQIWFTYDDMRVLGIQEAQMQEDRRCTGYIFFYMH
830 840 850 860 870 880
890 900 910
pF1KE3 NGIFEELLRKAENSRLPSTQAGVIPQGE
: ::::.:.. ::..: : .
XP_016 NEIFEEMLKREENAQLNSKEVEETLQKE
890 900 910
>>XP_016878211 (OMIM: 603158) PREDICTED: ubiquitin carbo (928 aa)
initn: 243 init1: 113 opt: 311 Z-score: 290.1 bits: 65.0 E(85289): 2e-09
Smith-Waterman score: 311; 25.5% identity (53.9% similar) in 345 aa overlap (217-540:515-850)
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 DNPVPNKKYKTDSLKYIQSNRKNPSSLEDLEKDRDLKLGPSFNTNCNGNPNLDETV----
:.::. :: ..:.. ...
XP_016 TVHMYPPEMAPSSAPPSTPPTHKAKPQIPAERDRE----PSKLKRSYSSPDITQAIQEEE
490 500 510 520 530 540
250 260 270 280 290
pF1KE3 ----LATQTLNAKNGLTSPLEPEHSQGDPRCNKAQVPLDSHSQQLQQGFPNLGNTCYMNA
.: :.: .: : . : :. . . :. . : :. :::::::::.
XP_016 KRKPTVTPTVNRENKPTCYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLRNLGNTCYMNS
550 560 570 580 590 600
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 VLQSLFAIPSFADDLLTQGVPWEYIPFEALIMTLTQL-----LALKDFCSTKIKRELLGN
.:: : : .:: .... . : :. .. . .: . . . . .
XP_016 ILQCLCNAPHLAD-YFNRNCYQDDINRSNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTGQYRYISPKD
610 620 630 640 650
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 VKKVISAVAEIFSGNMQNDAHEFLGQCLDQLKEDMEKLNATLNTGKECGD--ENSSPQMH
: .:. . . :.: :.:..:.: .: :.::..: . .: .: .. . :
XP_016 FKITIGKINDQFAGYSQQDSQELLLFLMDGLHEDLNKADNRKRYKEENNDHLDDFKAAEH
660 670 680 690 700 710
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 VGSAATKVFVCPVVANFEFELQLSLICKACGHAVLKVEPNNYLSINLHQETKPLPLSIQN
. . .. .:: :. ... .. : .: . : :::. : . .: ..:.
XP_016 AWQKHKQLNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCHKKSRTFEAFMYLSLPLASTSK---CTLQD
720 730 740 750 760 770
480 490 500 510 520
pF1KE3 SLDLFFKEEELEYN----CQMCK-QKSCVARHTFSRLSRVLIIHLKRYSFNNAWLLVKNN
: :: :::.: : :. :. ... . . . .: ::..::::.:... : : .
XP_016 CLRLFSKEEKLTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRWKQ-KLQ
780 790 800 810 820 830
530 540 550 560 570 580
pF1KE3 EQVYIP-KSLSLSSYCNESTKPPLPLSSSAPVGKCEVLEVSQEMISEINSPLTPSMKLTS
.: .: ..:.::.:
XP_016 TSVDFPLENLDLSQYVIGPKNNLKKYNLFSVSNHYGGLDGGHYTAYCKNAARQRWFKFDD
840 850 860 870 880 890
>>XP_016878210 (OMIM: 603158) PREDICTED: ubiquitin carbo (928 aa)
initn: 243 init1: 113 opt: 311 Z-score: 290.1 bits: 65.0 E(85289): 2e-09
Smith-Waterman score: 311; 25.5% identity (53.9% similar) in 345 aa overlap (217-540:515-850)
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 DNPVPNKKYKTDSLKYIQSNRKNPSSLEDLEKDRDLKLGPSFNTNCNGNPNLDETV----
:.::. :: ..:.. ...
XP_016 TVHMYPPEMAPSSAPPSTPPTHKAKPQIPAERDRE----PSKLKRSYSSPDITQAIQEEE
490 500 510 520 530 540
250 260 270 280 290
pF1KE3 ----LATQTLNAKNGLTSPLEPEHSQGDPRCNKAQVPLDSHSQQLQQGFPNLGNTCYMNA
.: :.: .: : . : :. . . :. . : :. :::::::::.
XP_016 KRKPTVTPTVNRENKPTCYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLRNLGNTCYMNS
550 560 570 580 590 600
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 VLQSLFAIPSFADDLLTQGVPWEYIPFEALIMTLTQL-----LALKDFCSTKIKRELLGN
.:: : : .:: .... . : :. .. . .: . . . . .
XP_016 ILQCLCNAPHLAD-YFNRNCYQDDINRSNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTGQYRYISPKD
610 620 630 640 650
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 VKKVISAVAEIFSGNMQNDAHEFLGQCLDQLKEDMEKLNATLNTGKECGD--ENSSPQMH
: .:. . . :.: :.:..:.: .: :.::..: . .: .: .. . :
XP_016 FKITIGKINDQFAGYSQQDSQELLLFLMDGLHEDLNKADNRKRYKEENNDHLDDFKAAEH
660 670 680 690 700 710
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 VGSAATKVFVCPVVANFEFELQLSLICKACGHAVLKVEPNNYLSINLHQETKPLPLSIQN
. . .. .:: :. ... .. : .: . : :::. : . .: ..:.
XP_016 AWQKHKQLNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCHKKSRTFEAFMYLSLPLASTSK---CTLQD
720 730 740 750 760 770
480 490 500 510 520
pF1KE3 SLDLFFKEEELEYN----CQMCK-QKSCVARHTFSRLSRVLIIHLKRYSFNNAWLLVKNN
: :: :::.: : :. :. ... . . . .: ::..::::.:... : : .
XP_016 CLRLFSKEEKLTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRWKQ-KLQ
780 790 800 810 820 830
530 540 550 560 570 580
pF1KE3 EQVYIP-KSLSLSSYCNESTKPPLPLSSSAPVGKCEVLEVSQEMISEINSPLTPSMKLTS
.: .: ..:.::.:
XP_016 TSVDFPLENLDLSQYVIGPKNNLKKYNLFSVSNHYGGLDGGHYTAYCKNAARQRWFKFDD
840 850 860 870 880 890
>>NP_001269978 (OMIM: 603158) ubiquitin carboxyl-termina (1012 aa)
initn: 243 init1: 113 opt: 311 Z-score: 289.6 bits: 65.0 E(85289): 2.2e-09
Smith-Waterman score: 311; 25.5% identity (53.9% similar) in 345 aa overlap (217-540:599-934)
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 DNPVPNKKYKTDSLKYIQSNRKNPSSLEDLEKDRDLKLGPSFNTNCNGNPNLDETV----
:.::. :: ..:.. ...
NP_001 TVHMYPPEMAPSSAPPSTPPTHKAKPQIPAERDRE----PSKLKRSYSSPDITQAIQEEE
570 580 590 600 610 620
250 260 270 280 290
pF1KE3 ----LATQTLNAKNGLTSPLEPEHSQGDPRCNKAQVPLDSHSQQLQQGFPNLGNTCYMNA
.: :.: .: : . : :. . . :. . : :. :::::::::.
NP_001 KRKPTVTPTVNRENKPTCYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLRNLGNTCYMNS
630 640 650 660 670 680
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 VLQSLFAIPSFADDLLTQGVPWEYIPFEALIMTLTQL-----LALKDFCSTKIKRELLGN
.:: : : .:: .... . : :. .. . .: . . . . .
NP_001 ILQCLCNAPHLAD-YFNRNCYQDDINRSNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTGQYRYISPKD
690 700 710 720 730 740
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 VKKVISAVAEIFSGNMQNDAHEFLGQCLDQLKEDMEKLNATLNTGKECGD--ENSSPQMH
: .:. . . :.: :.:..:.: .: :.::..: . .: .: .. . :
NP_001 FKITIGKINDQFAGYSQQDSQELLLFLMDGLHEDLNKADNRKRYKEENNDHLDDFKAAEH
750 760 770 780 790 800
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 VGSAATKVFVCPVVANFEFELQLSLICKACGHAVLKVEPNNYLSINLHQETKPLPLSIQN
. . .. .:: :. ... .. : .: . : :::. : . .: ..:.
NP_001 AWQKHKQLNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCHKKSRTFEAFMYLSLPLASTSK---CTLQD
810 820 830 840 850 860
480 490 500 510 520
pF1KE3 SLDLFFKEEELEYN----CQMCK-QKSCVARHTFSRLSRVLIIHLKRYSFNNAWLLVKNN
: :: :::.: : :. :. ... . . . .: ::..::::.:... : : .
NP_001 CLRLFSKEEKLTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRWKQ-KLQ
870 880 890 900 910
530 540 550 560 570 580
pF1KE3 EQVYIP-KSLSLSSYCNESTKPPLPLSSSAPVGKCEVLEVSQEMISEINSPLTPSMKLTS
.: .: ..:.::.:
NP_001 TSVDFPLENLDLSQYVIGPKNNLKKYNLFSVSNHYGGLDGGHYTAYCKNAARQRWFKFDD
920 930 940 950 960 970
>>XP_006720825 (OMIM: 603158) PREDICTED: ubiquitin carbo (1089 aa)
initn: 243 init1: 113 opt: 311 Z-score: 289.2 bits: 65.0 E(85289): 2.3e-09
Smith-Waterman score: 311; 25.5% identity (53.9% similar) in 345 aa overlap (217-540:676-1011)
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 DNPVPNKKYKTDSLKYIQSNRKNPSSLEDLEKDRDLKLGPSFNTNCNGNPNLDETV----
:.::. :: ..:.. ...
XP_006 TVHMYPPEMAPSSAPPSTPPTHKAKPQIPAERDRE----PSKLKRSYSSPDITQAIQEEE
650 660 670 680 690 700
250 260 270 280 290
pF1KE3 ----LATQTLNAKNGLTSPLEPEHSQGDPRCNKAQVPLDSHSQQLQQGFPNLGNTCYMNA
.: :.: .: : . : :. . . :. . : :. :::::::::.
XP_006 KRKPTVTPTVNRENKPTCYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLRNLGNTCYMNS
710 720 730 740 750 760
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 VLQSLFAIPSFADDLLTQGVPWEYIPFEALIMTLTQL-----LALKDFCSTKIKRELLGN
.:: : : .:: .... . : :. .. . .: . . . . .
XP_006 ILQCLCNAPHLAD-YFNRNCYQDDINRSNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTGQYRYISPKD
770 780 790 800 810 820
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 VKKVISAVAEIFSGNMQNDAHEFLGQCLDQLKEDMEKLNATLNTGKECGD--ENSSPQMH
: .:. . . :.: :.:..:.: .: :.::..: . .: .: .. . :
XP_006 FKITIGKINDQFAGYSQQDSQELLLFLMDGLHEDLNKADNRKRYKEENNDHLDDFKAAEH
830 840 850 860 870 880
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 VGSAATKVFVCPVVANFEFELQLSLICKACGHAVLKVEPNNYLSINLHQETKPLPLSIQN
. . .. .:: :. ... .. : .: . : :::. : . .: ..:.
XP_006 AWQKHKQLNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCHKKSRTFEAFMYLSLPLASTSK---CTLQD
890 900 910 920 930
480 490 500 510 520
pF1KE3 SLDLFFKEEELEYN----CQMCK-QKSCVARHTFSRLSRVLIIHLKRYSFNNAWLLVKNN
: :: :::.: : :. :. ... . . . .: ::..::::.:... : : .
XP_006 CLRLFSKEEKLTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRWKQ-KLQ
940 950 960 970 980 990
530 540 550 560 570 580
pF1KE3 EQVYIP-KSLSLSSYCNESTKPPLPLSSSAPVGKCEVLEVSQEMISEINSPLTPSMKLTS
.: .: ..:.::.:
XP_006 TSVDFPLENLDLSQYVIGPKNNLKKYNLFSVSNHYGGLDGGHYTAYCKNAARQRWFKFDD
1000 1010 1020 1030 1040 1050
>>XP_016878207 (OMIM: 603158) PREDICTED: ubiquitin carbo (1089 aa)
initn: 243 init1: 113 opt: 311 Z-score: 289.2 bits: 65.0 E(85289): 2.3e-09
Smith-Waterman score: 311; 25.5% identity (53.9% similar) in 345 aa overlap (217-540:676-1011)
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 DNPVPNKKYKTDSLKYIQSNRKNPSSLEDLEKDRDLKLGPSFNTNCNGNPNLDETV----
:.::. :: ..:.. ...
XP_016 TVHMYPPEMAPSSAPPSTPPTHKAKPQIPAERDRE----PSKLKRSYSSPDITQAIQEEE
650 660 670 680 690 700
250 260 270 280 290
pF1KE3 ----LATQTLNAKNGLTSPLEPEHSQGDPRCNKAQVPLDSHSQQLQQGFPNLGNTCYMNA
.: :.: .: : . : :. . . :. . : :. :::::::::.
XP_016 KRKPTVTPTVNRENKPTCYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLRNLGNTCYMNS
710 720 730 740 750 760
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 VLQSLFAIPSFADDLLTQGVPWEYIPFEALIMTLTQL-----LALKDFCSTKIKRELLGN
.:: : : .:: .... . : :. .. . .: . . . . .
XP_016 ILQCLCNAPHLAD-YFNRNCYQDDINRSNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTGQYRYISPKD
770 780 790 800 810 820
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 VKKVISAVAEIFSGNMQNDAHEFLGQCLDQLKEDMEKLNATLNTGKECGD--ENSSPQMH
: .:. . . :.: :.:..:.: .: :.::..: . .: .: .. . :
XP_016 FKITIGKINDQFAGYSQQDSQELLLFLMDGLHEDLNKADNRKRYKEENNDHLDDFKAAEH
830 840 850 860 870 880
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 VGSAATKVFVCPVVANFEFELQLSLICKACGHAVLKVEPNNYLSINLHQETKPLPLSIQN
. . .. .:: :. ... .. : .: . : :::. : . .: ..:.
XP_016 AWQKHKQLNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCHKKSRTFEAFMYLSLPLASTSK---CTLQD
890 900 910 920 930
480 490 500 510 520
pF1KE3 SLDLFFKEEELEYN----CQMCK-QKSCVARHTFSRLSRVLIIHLKRYSFNNAWLLVKNN
: :: :::.: : :. :. ... . . . .: ::..::::.:... : : .
XP_016 CLRLFSKEEKLTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRWKQ-KLQ
940 950 960 970 980 990
530 540 550 560 570 580
pF1KE3 EQVYIP-KSLSLSSYCNESTKPPLPLSSSAPVGKCEVLEVSQEMISEINSPLTPSMKLTS
.: .: ..:.::.:
XP_016 TSVDFPLENLDLSQYVIGPKNNLKKYNLFSVSNHYGGLDGGHYTAYCKNAARQRWFKFDD
1000 1010 1020 1030 1040 1050
>>XP_016878209 (OMIM: 603158) PREDICTED: ubiquitin carbo (1089 aa)
initn: 243 init1: 113 opt: 311 Z-score: 289.2 bits: 65.0 E(85289): 2.3e-09
Smith-Waterman score: 311; 25.5% identity (53.9% similar) in 345 aa overlap (217-540:676-1011)
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 DNPVPNKKYKTDSLKYIQSNRKNPSSLEDLEKDRDLKLGPSFNTNCNGNPNLDETV----
:.::. :: ..:.. ...
XP_016 TVHMYPPEMAPSSAPPSTPPTHKAKPQIPAERDRE----PSKLKRSYSSPDITQAIQEEE
650 660 670 680 690 700
250 260 270 280 290
pF1KE3 ----LATQTLNAKNGLTSPLEPEHSQGDPRCNKAQVPLDSHSQQLQQGFPNLGNTCYMNA
.: :.: .: : . : :. . . :. . : :. :::::::::.
XP_016 KRKPTVTPTVNRENKPTCYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLRNLGNTCYMNS
710 720 730 740 750 760
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 VLQSLFAIPSFADDLLTQGVPWEYIPFEALIMTLTQL-----LALKDFCSTKIKRELLGN
.:: : : .:: .... . : :. .. . .: . . . . .
XP_016 ILQCLCNAPHLAD-YFNRNCYQDDINRSNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTGQYRYISPKD
770 780 790 800 810 820
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 VKKVISAVAEIFSGNMQNDAHEFLGQCLDQLKEDMEKLNATLNTGKECGD--ENSSPQMH
: .:. . . :.: :.:..:.: .: :.::..: . .: .: .. . :
XP_016 FKITIGKINDQFAGYSQQDSQELLLFLMDGLHEDLNKADNRKRYKEENNDHLDDFKAAEH
830 840 850 860 870 880
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 VGSAATKVFVCPVVANFEFELQLSLICKACGHAVLKVEPNNYLSINLHQETKPLPLSIQN
. . .. .:: :. ... .. : .: . : :::. : . .: ..:.
XP_016 AWQKHKQLNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCHKKSRTFEAFMYLSLPLASTSK---CTLQD
890 900 910 920 930
480 490 500 510 520
pF1KE3 SLDLFFKEEELEYN----CQMCK-QKSCVARHTFSRLSRVLIIHLKRYSFNNAWLLVKNN
: :: :::.: : :. :. ... . . . .: ::..::::.:... : : .
XP_016 CLRLFSKEEKLTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRWKQ-KLQ
940 950 960 970 980 990
530 540 550 560 570 580
pF1KE3 EQVYIP-KSLSLSSYCNESTKPPLPLSSSAPVGKCEVLEVSQEMISEINSPLTPSMKLTS
.: .: ..:.::.:
XP_016 TSVDFPLENLDLSQYVIGPKNNLKKYNLFSVSNHYGGLDGGHYTAYCKNAARQRWFKFDD
1000 1010 1020 1030 1040 1050
>>XP_016878208 (OMIM: 603158) PREDICTED: ubiquitin carbo (1089 aa)
initn: 243 init1: 113 opt: 311 Z-score: 289.2 bits: 65.0 E(85289): 2.3e-09
Smith-Waterman score: 311; 25.5% identity (53.9% similar) in 345 aa overlap (217-540:676-1011)
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 DNPVPNKKYKTDSLKYIQSNRKNPSSLEDLEKDRDLKLGPSFNTNCNGNPNLDETV----
:.::. :: ..:.. ...
XP_016 TVHMYPPEMAPSSAPPSTPPTHKAKPQIPAERDRE----PSKLKRSYSSPDITQAIQEEE
650 660 670 680 690 700
250 260 270 280 290
pF1KE3 ----LATQTLNAKNGLTSPLEPEHSQGDPRCNKAQVPLDSHSQQLQQGFPNLGNTCYMNA
.: :.: .: : . : :. . . :. . : :. :::::::::.
XP_016 KRKPTVTPTVNRENKPTCYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLRNLGNTCYMNS
710 720 730 740 750 760
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 VLQSLFAIPSFADDLLTQGVPWEYIPFEALIMTLTQL-----LALKDFCSTKIKRELLGN
.:: : : .:: .... . : :. .. . .: . . . . .
XP_016 ILQCLCNAPHLAD-YFNRNCYQDDINRSNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTGQYRYISPKD
770 780 790 800 810 820
360 370 380 390 400 410
pF1KE3 VKKVISAVAEIFSGNMQNDAHEFLGQCLDQLKEDMEKLNATLNTGKECGD--ENSSPQMH
: .:. . . :.: :.:..:.: .: :.::..: . .: .: .. . :
XP_016 FKITIGKINDQFAGYSQQDSQELLLFLMDGLHEDLNKADNRKRYKEENNDHLDDFKAAEH
830 840 850 860 870 880
420 430 440 450 460 470
pF1KE3 VGSAATKVFVCPVVANFEFELQLSLICKACGHAVLKVEPNNYLSINLHQETKPLPLSIQN
. . .. .:: :. ... .. : .: . : :::. : . .: ..:.
XP_016 AWQKHKQLNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCHKKSRTFEAFMYLSLPLASTSK---CTLQD
890 900 910 920 930
480 490 500 510 520
pF1KE3 SLDLFFKEEELEYN----CQMCK-QKSCVARHTFSRLSRVLIIHLKRYSFNNAWLLVKNN
: :: :::.: : :. :. ... . . . .: ::..::::.:... : : .
XP_016 CLRLFSKEEKLTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRWKQ-KLQ
940 950 960 970 980 990
530 540 550 560 570 580
pF1KE3 EQVYIP-KSLSLSSYCNESTKPPLPLSSSAPVGKCEVLEVSQEMISEINSPLTPSMKLTS
.: .: ..:.::.:
XP_016 TSVDFPLENLDLSQYVIGPKNNLKKYNLFSVSNHYGGLDGGHYTAYCKNAARQRWFKFDD
1000 1010 1020 1030 1040 1050
912 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 02:09:01 2016 done: Sat Nov 5 02:09:03 2016
Total Scan time: 13.710 Total Display time: 0.200
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]