FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3528, 912 aa 1>>>pF1KE3528 912 - 912 aa - 912 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6449+/-0.00113; mu= 14.5292+/- 0.068 mean_var=98.4839+/-19.291, 0's: 0 Z-trim(105.2): 86 B-trim: 28 in 1/49 Lambda= 0.129238 statistics sampled from 8232 (8319) to 8232 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.619), E-opt: 0.2 (0.256), width: 16 Scan time: 3.520 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS33124.1 USP29 gene_id:57663|Hs108|chr19 ( 922) 6045 1138.4 0 CCDS14635.1 USP26 gene_id:83844|Hs108|chrX ( 913) 1700 328.3 4.1e-89 CCDS2418.1 USP37 gene_id:57695|Hs108|chr2 ( 979) 1498 290.6 9.4e-78 CCDS61632.1 USP8 gene_id:9101|Hs108|chr15 (1012) 311 69.3 4.1e-11 CCDS10137.1 USP8 gene_id:9101|Hs108|chr15 (1118) 311 69.3 4.4e-11 >>CCDS33124.1 USP29 gene_id:57663|Hs108|chr19 (922 aa) initn: 6045 init1: 6045 opt: 6045 Z-score: 6091.6 bits: 1138.4 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6045; 100.0% identity (100.0% similar) in 912 aa overlap (1-912:1-912) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MISLKVCGFIQIWSQKTGMTKLKEALIETVQRQKEIKLVVTFKSGKFIRIFQLSNNIRSV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 MISLKVCGFIQIWSQKTGMTKLKEALIETVQRQKEIKLVVTFKSGKFIRIFQLSNNIRSV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 VLRHCKKRQSHLRLTLKNNVFLFIDKLSYRDAKQLNMFLDIIHQNKSQQPMKSDDDWSVF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 VLRHCKKRQSHLRLTLKNNVFLFIDKLSYRDAKQLNMFLDIIHQNKSQQPMKSDDDWSVF 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 ESRNMLKEIDKTSFYSICNKPSYQKMPLFMSKSPTHVKKGILENQGGKGQNTLSSDVQTN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 ESRNMLKEIDKTSFYSICNKPSYQKMPLFMSKSPTHVKKGILENQGGKGQNTLSSDVQTN 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 EDILKEDNPVPNKKYKTDSLKYIQSNRKNPSSLEDLEKDRDLKLGPSFNTNCNGNPNLDE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 EDILKEDNPVPNKKYKTDSLKYIQSNRKNPSSLEDLEKDRDLKLGPSFNTNCNGNPNLDE 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 TVLATQTLNAKNGLTSPLEPEHSQGDPRCNKAQVPLDSHSQQLQQGFPNLGNTCYMNAVL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 TVLATQTLNAKNGLTSPLEPEHSQGDPRCNKAQVPLDSHSQQLQQGFPNLGNTCYMNAVL 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 QSLFAIPSFADDLLTQGVPWEYIPFEALIMTLTQLLALKDFCSTKIKRELLGNVKKVISA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 QSLFAIPSFADDLLTQGVPWEYIPFEALIMTLTQLLALKDFCSTKIKRELLGNVKKVISA 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 VAEIFSGNMQNDAHEFLGQCLDQLKEDMEKLNATLNTGKECGDENSSPQMHVGSAATKVF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 VAEIFSGNMQNDAHEFLGQCLDQLKEDMEKLNATLNTGKECGDENSSPQMHVGSAATKVF 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 VCPVVANFEFELQLSLICKACGHAVLKVEPNNYLSINLHQETKPLPLSIQNSLDLFFKEE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 VCPVVANFEFELQLSLICKACGHAVLKVEPNNYLSINLHQETKPLPLSIQNSLDLFFKEE 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE3 ELEYNCQMCKQKSCVARHTFSRLSRVLIIHLKRYSFNNAWLLVKNNEQVYIPKSLSLSSY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 ELEYNCQMCKQKSCVARHTFSRLSRVLIIHLKRYSFNNAWLLVKNNEQVYIPKSLSLSSY 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE3 CNESTKPPLPLSSSAPVGKCEVLEVSQEMISEINSPLTPSMKLTSESSDSLVLPVEPDKN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 CNESTKPPLPLSSSAPVGKCEVLEVSQEMISEINSPLTPSMKLTSESSDSLVLPVEPDKN 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE3 ADLQRFQRDCGDASQEQHQRDLENGSALESELVHFRDRAIGEKELPVADSLMDQGDISLP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 ADLQRFQRDCGDASQEQHQRDLENGSALESELVHFRDRAIGEKELPVADSLMDQGDISLP 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KE3 VMYEDGGKLISSPDTRLVEVHLQEVPQHPELQKYEKTNTFVEFNFDSVTESTNGFYDCKE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 VMYEDGGKLISSPDTRLVEVHLQEVPQHPELQKYEKTNTFVEFNFDSVTESTNGFYDCKE 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KE3 NRIPEGSQGMAEQLQQCIEESIIDEFLQQAPPPGVRKLDAQEHTEETLNQSTELRLQKAD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 NRIPEGSQGMAEQLQQCIEESIIDEFLQQAPPPGVRKLDAQEHTEETLNQSTELRLQKAD 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KE3 LNHLGALGSDNPGNKNILDAENTRGEAKELTRNVKMGDPLQAYRLISVVSHIGSSPNSGH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 LNHLGALGSDNPGNKNILDAENTRGEAKELTRNVKMGDPLQAYRLISVVSHIGSSPNSGH 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 pF1KE3 YISDVYDFQKQAWFTYNDLCVSEISETKMQEARLHSGYIFFYMHNGIFEELLRKAENSRL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS33 YISDVYDFQKQAWFTYNDLCVSEISETKMQEARLHSGYIFFYMHNGIFEELLRKAENSRL 850 860 870 880 890 900 910 pF1KE3 PSTQAGVIPQGE :::::::::::: CCDS33 PSTQAGVIPQGEYEGDSLYRPA 910 920 >>CCDS14635.1 USP26 gene_id:83844|Hs108|chrX (913 aa) initn: 2104 init1: 1067 opt: 1700 Z-score: 1713.4 bits: 328.3 E(32554): 4.1e-89 Smith-Waterman score: 2409; 46.6% identity (70.9% similar) in 920 aa overlap (1-904:1-905) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MISLKVCGFIQIWSQKTGMTKLKEALIETVQRQKEIKLVVTFKSGKFIRIFQLSNNIRSV : .: . ::.:: . :::..: :::.::.:.:.:. .::. :::::. :.::.::..: CCDS14 MAALFLRGFVQIGNCKTGISKSKEAFIEAVERKKKDRLVLYFKSGKY-STFRLSDNIQNV 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 VLRHCKKRQSHLRLTLKNNVFLFIDKLSYRDAKQLNMFLDIIHQNKSQQPMKSDDDWSVF ::. . :.::.:::.:: :::. :: ::.::..::: .:::. : :.. ::: CCDS14 VLKSYRGNQNHLHLTLQNNNGLFIEGLSSTDAEQLKIFLDRVHQNEVQPPVRPGKGGSVF 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 pF1KE3 ESRNMLKEIDKTSFYSICNKPS--------------YQKMPLFMSKSPTHVKKGILENQG : .. :::.::::... .: : :.:::. :: : . . ::: CCDS14 SSTTQ-KEINKTSFHKVDEKSSSKSFEIAKGSGTGVLQRMPLLTSKL-TLTCGELSENQH 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE3 GKGQNTLSSDVQTNEDILKEDNPVPNKKYKTDSLKYIQSNRKNPSSLEDLEKDRDLKLGP : . :::. . ::..:::.: : :: :.: . .. ::.. .:..::... :. CCDS14 KKRKRMLSSSSEMNEEFLKENNSVEYKKSKADCSRCVSYNREKQLKLKELEENKKLECES 180 190 200 210 220 230 230 240 250 260 270 280 pF1KE3 SFNTNCNGNPNLDETVLATQTLNAKNGLTSPLEPEHSQGDPRCNKAQVPLDSHSQQLQQG : : .::: ::. : :.:. : :. :. .:.: . .: .. .. ... .: CCDS14 SCIMNATGNPYLDDIGL-LQALTEKMVLVFLLQQGYSDGYTKWDKLKLFFELFPEKICHG 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KE3 FPNLGNTCYMNAVLQSLFAIPSFADDLLTQGVPWEYIPFEALIMTLTQLLALKDFCSTKI .::::::::::::::::..:::::::::.:. :: ::..:: : :..:: .:: . .: CCDS14 LPNLGNTCYMNAVLQSLLSIPSFADDLLNQSFPWGKIPLNALTMCLARLLFFKDTYNIEI 300 310 320 330 340 350 350 360 370 380 390 400 pF1KE3 KRELLGNVKKVISAVAEIFSGNMQNDAHEFLGQCLDQLKEDMEKLNATLNTGKECGDENS :. :: :.::.:::.:::: :: ::::::::..::::::..:::::. . .: :..: CCDS14 KEMLLLNLKKAISAAAEIFHGNAQNDAHEFLAHCLDQLKDNMEKLNTIWKPKSEFGEDNF 360 370 380 390 400 410 410 420 430 440 450 460 pF1KE3 SPQMHVGSAATKVFVCPVVANFEFELQLSLICKACGHAVLKVEPNNYLSINLHQETKPLP :. . . :. : :::..:::.:: :. :::::...::.: :::::::: :. : : CCDS14 PKQVFADDPDTSGFSCPVITNFELELLHSIACKACGQVILKTELNNYLSINLPQRIKAHP 420 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KE3 LSIQNSLDLFFKEEELEYNCQMCKQKSCVARHTFSRLSRVLIIHLKRYSFNNAWLLVKNN :::...:::: :::::.: :..:. :. :.:::: :.::.::::::.:. : ::. CCDS14 SSIQSTFDLFFGAEELEYKCAKCEHKTSVGVHSFSRLPRILIVHLKRYSLNEFCALKKND 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KE3 EQVYIPKSLSLSSYCNESTKPPLPLSSSAPVGKCEVLEVSQEMISEINSPLTPSMKLTSE ..: : : :..::.:::.:.:::::: .. . ..:.: ..: : . .. : :.: CCDS14 QEVIISKYLKVSSHCNEGTRPPLPLSEDGEITDFQLLKVIRKMTS---GNISVSWPATKE 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 pF1KE3 SSDSLVLPVEPDKNADLQRFQRDCGDASQEQHQRDL-ENGSALESELVHFRDRAIGEKEL :.: :. . ::... .. : ::..:.:. : .:.. : : :. :::. ::: CCDS14 SKDILAPHIGSDKESEQKKGQTVFKGASRRQQQKYLGKNSKPNELESVYSGDRAFIEKE- 600 610 620 630 640 650 650 660 670 680 690 700 pF1KE3 PVADSLMDQGDISLPVMYEDGGKLISSPDTRLVEVHLQEVPQHPELQKYEKTNTFVEFNF :.: . : :: ... ::: ::: : : .: .: ::..:. .:: ::. :: : CCDS14 PLAHLMTYLEDTSLCQFHKAGGKPASSPGTPLSKVDFQTVPENPKRKKYVKTSKFVA--F 660 670 680 690 700 710 710 720 730 740 750 760 pF1KE3 DSVTESTNGFYDCKENRIPEGSQGMAEQLQQCIEESIIDEFLQQAPPPGVRKLDAQEHTE : . . :. .:. :. :::: : ..:: ::: : .. ::: : . : .: ::. CCDS14 DRIINPTKDLYEDKNIRIPERFQKVSEQTQQCDGMRICEQAPQQALPQSFPKPGTQGHTK 720 730 740 750 760 770 770 780 790 800 810 820 pF1KE3 ETLNQSTELRLQKADLNHLGALGSD-NPGNKNILDAENTRGEAKELTRNVKMGDPLQAYR . : . :.: :::.. : : ::::. :: ::.::: . ...::: :: :: ..:: CCDS14 NLL-RPTKLNLQKSNRNSLLALGSNKNPRNKDILD--KIKSKAKETKRNDDKGD--HTYR 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 pF1KE3 LISVVSHIGSSPNSGHYISDVYDFQKQAWFTYNDLCVSEISETKMQEARLHSGYIFFYMH :::::::.:.. .::::: :.:::.:: ::::.:. : :.:..::: : .:::::::: CCDS14 LISVVSHLGKTLKSGHYICDAYDFEKQIWFTYDDMRVLGIQEAQMQEDRRCTGYIFFYMH 830 840 850 860 870 880 890 900 910 pF1KE3 NGIFEELLRKAENSRLPSTQAGVIPQGE : ::::.:.. ::..: : . CCDS14 NEIFEEMLKREENAQLNSKEVEETLQKE 890 900 910 >>CCDS2418.1 USP37 gene_id:57695|Hs108|chr2 (979 aa) initn: 2103 init1: 592 opt: 1498 Z-score: 1509.4 bits: 290.6 E(32554): 9.4e-78 Smith-Waterman score: 2279; 44.7% identity (69.2% similar) in 951 aa overlap (28-906:28-972) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MISLKVCGFIQIWSQKTGMTKLKEALIETVQRQKEIKLVVTFKSGKFIRIFQLSNNIRSV : :.......::: ...: . ::::::.::..: CCDS24 MSPLKIHGPIRIRSMQTGITKWKEGSFEIVEKENKVSLVVHYNTGGIPRIFQLSHNIKNV 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE3 VLRHCKKRQSHLRLTLKNNVFLFIDKLSYRDAKQLNMFLDIIHQNKSQQPMK-------- ::: .::.: :::..: :: :::. .::... .::: .:::. :: CCDS24 VLRPSGAKQSRLMLTLQDNSFLSIDKVPSKDAEEMRLFLDAVHQNRLPAAMKPSQGSGSF 70 80 90 100 110 120 120 130 140 pF1KE3 -----------------SDDDWSVFESRNMLKEIDKTSFYSICNKPSY------------ : .: .. .:. :. : : .. ..:. CCDS24 GAILGSRTSQKETSRQLSYSDNQASAKRGSLETKDDIPFRKVLGNPGRGSIKTVAGSGIA 130 140 150 160 170 180 150 160 170 180 190 200 pF1KE3 QKMPLFMSKSPTHVKKGILENQGGKGQNTLSSDVQTNEDILKEDNPVPNKKYKTD-SLKY . .: . : : : ...:.:::. : . .:. . ::: ::.. :.: :: : :: CCDS24 RTIPSLTSTS-TPLRSGLLENRTEKRKRMISTGSELNEDYPKENDSSSNNKAMTDPSRKY 190 200 210 220 230 210 220 230 240 250 pF1KE3 IQSNRKNPSSLEDLEKDRDLKLGP----SF-------NTNCNGNPNLDETVLATQTLNAK . :.:.. ::.. :..: : : :: . . .:. :::.: ...:: .:: CCDS24 LTSSREKQLSLKQSEENRTSGLLPLQSSSFYGSRAGSKEHSSGGTNLDRTNVSSQTPSAK 240 250 260 270 280 290 260 270 280 290 300 pF1KE3 NGLTSPLEP-EHSQGDPRCN-------KAQVPLDSHSQQLQQGFPNLGNTCYMNAVLQSL .: .: : ::: : .:::.::.:: ::: ::::::::::.:::: CCDS24 RSLGFLPQPVPLSVKKLRCNQDYTGWNKPRVPLSSHQQQQLQGFSNLGNTCYMNAILQSL 300 310 320 330 340 350 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 FAIPSFADDLLTQGVPWEYIPFEALIMTLTQLLALKDFCSTKIKRELLGNVKKVISAVAE :.. :::.::: ::.::. ::..::: ...::. ::.:... :..:: .::..:::.:: CCDS24 FSLQSFANDLLKQGIPWKKIPLNALIRRFAHLLVKKDICNSETKKDLLKKVKNAISATAE 360 370 380 390 400 410 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 IFSGNMQNDAHEFLGQCLDQLKEDMEKLNATLNTGKECGDENSSPQMHVGSAATKVFVCP ::: :::::::::.:::::::::::::: : .: :.::: :.. .::....:: CCDS24 RFSGYMQNDAHEFLSQCLDQLKEDMEKLNKTWKTEPVSGEENS-PDI----SATRAYTCP 420 430 440 450 460 470 430 440 450 460 470 480 pF1KE3 VVANFEFELQLSLICKACGHAVLKVEPNNYLSINLHQETKPLP-LSIQNSLDLFFKEEEL :..:.:::.: :.::::::. . : : : :::.: .. :::: :::.::::::. ::: CCDS24 VITNLEFEVQHSIICKACGEIIPKREQFNDLSIDLPRRKKPLPPRSIQDSLDLFFRAEEL 480 490 500 510 520 530 490 500 510 520 530 540 pF1KE3 EYNCQMCKQKSCVARHTFSRLSRVLIIHLKRYSFNNAWLLV-KNNEQVYIPKSLSLSSYC ::.:. : : ..:: :.:: ::::.:::::::: : : : ..:: ::. :.:::.: CCDS24 EYSCEKCGGKCALVRHKFNRLPRVLILHLKRYSFNVALSLNNKIGQQVIIPRYLTLSSHC 540 550 560 570 580 590 550 560 570 580 590 600 pF1KE3 NESTKPPLPLSSSAPVGKCEVLEVSQEMISEINSPLTPSMKLTSESSDSLVLPVEPDKNA .:.::::. :. :: .. . :..:: . : :.:: ::: :.: .:..::.: .. :.. CCDS24 TENTKPPFTLGWSAHMAISRPLKASQMVNSCITSPSTPSKKFTFKSKSSLALCLDSDSED 600 610 620 630 640 650 610 620 630 640 650 pF1KE3 DLQRF----QRDCGDASQEQHQRDLENGSAL------ESELVHFRDRAIGEKELPVADSL .:.: :: : ..::.:.:::. : : .::: . ..:.:: .: CCDS24 ELKRSVALSQRLCEMLGNEQQQEDLEKDSKLCPIEPDKSELENSGFDRMSEEELLAAVLE 660 670 680 690 700 710 660 670 680 690 700 710 pF1KE3 MDQGDISLPVMYEDGGKLISSPDTRLVEVHLQEVPQHPELQKYEKTNTFVEFNFDSVTES ... : : . .:: : ::::: ..: .::.:..:. .. :: .:..:.. : :: CCDS24 ISKRDASPSLSHEDDDKPTSSPDTGFAEDDIQEMPENPDTMETEKPKTITELDPASFTEI 720 730 740 750 760 770 720 730 740 750 760 pF1KE3 TNGFYDCKENRIPEGSQGMAEQLQQC-IEESIIDEFLQQAPPPGVRKLDAQEHTEET-LN :. . :::. :::::: .. ::: .:. .. :::: .... .: :. :. :. CCDS24 TKDCDENKENKTPEGSQGEVDWLQQYDMEREREEQELQQALAQSLQEQEAWEQKEDDDLK 780 790 800 810 820 830 770 780 790 800 810 820 pF1KE3 QSTELRLQKADLNHLGALGSD-NPGNKNILDAENTRGEAKELTRNVKMGDPLQAYRLISV ..::: ::. . . . ::::: . ::....: : :..::.:: ::.. :. ..:::::: CCDS24 RATELSLQEFNNSFVDALGSDEDSGNEDVFDMEYTEAEAEELKRNAETGNLPHSYRLISV 840 850 860 870 880 890 830 840 850 860 870 880 pF1KE3 VSHIGSSPNSGHYISDVYDFQKQAWFTYNDLCVSEISETKMQEARLHSGYIFFYMHNGIF ::::::. .::::::::::..:::::::::: ::.:.:. .: : .:::::::::. :: CCDS24 VSHIGSTSSSGHYISDVYDIKKQAWFTYNDLEVSKIQEAAVQSDRDRSGYIFFYMHKEIF 900 910 920 930 940 950 890 900 910 pF1KE3 EELLRKAENSRLPSTQAGVIPQGE .:::. .::. ::..: CCDS24 DELLETEKNSQSLSTEVGKTTRQAL 960 970 >>CCDS61632.1 USP8 gene_id:9101|Hs108|chr15 (1012 aa) initn: 243 init1: 113 opt: 311 Z-score: 313.0 bits: 69.3 E(32554): 4.1e-11 Smith-Waterman score: 311; 25.5% identity (53.9% similar) in 345 aa overlap (217-540:599-934) 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 DNPVPNKKYKTDSLKYIQSNRKNPSSLEDLEKDRDLKLGPSFNTNCNGNPNLDETV---- :.::. :: ..:.. ... CCDS61 TVHMYPPEMAPSSAPPSTPPTHKAKPQIPAERDRE----PSKLKRSYSSPDITQAIQEEE 570 580 590 600 610 620 250 260 270 280 290 pF1KE3 ----LATQTLNAKNGLTSPLEPEHSQGDPRCNKAQVPLDSHSQQLQQGFPNLGNTCYMNA .: :.: .: : . : :. . . :. . : :. :::::::::. CCDS61 KRKPTVTPTVNRENKPTCYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLRNLGNTCYMNS 630 640 650 660 670 680 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 VLQSLFAIPSFADDLLTQGVPWEYIPFEALIMTLTQL-----LALKDFCSTKIKRELLGN .:: : : .:: .... . : :. .. . .: . . . . . CCDS61 ILQCLCNAPHLAD-YFNRNCYQDDINRSNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTGQYRYISPKD 690 700 710 720 730 740 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 VKKVISAVAEIFSGNMQNDAHEFLGQCLDQLKEDMEKLNATLNTGKECGD--ENSSPQMH : .:. . . :.: :.:..:.: .: :.::..: . .: .: .. . : CCDS61 FKITIGKINDQFAGYSQQDSQELLLFLMDGLHEDLNKADNRKRYKEENNDHLDDFKAAEH 750 760 770 780 790 800 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 VGSAATKVFVCPVVANFEFELQLSLICKACGHAVLKVEPNNYLSINLHQETKPLPLSIQN . . .. .:: :. ... .. : .: . : :::. : . .: ..:. CCDS61 AWQKHKQLNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCHKKSRTFEAFMYLSLPLASTSK---CTLQD 810 820 830 840 850 860 480 490 500 510 520 pF1KE3 SLDLFFKEEELEYN----CQMCK-QKSCVARHTFSRLSRVLIIHLKRYSFNNAWLLVKNN : :: :::.: : :. :. ... . . . .: ::..::::.:... : : . CCDS61 CLRLFSKEEKLTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRWKQ-KLQ 870 880 890 900 910 530 540 550 560 570 580 pF1KE3 EQVYIP-KSLSLSSYCNESTKPPLPLSSSAPVGKCEVLEVSQEMISEINSPLTPSMKLTS .: .: ..:.::.: CCDS61 TSVDFPLENLDLSQYVIGPKNNLKKYNLFSVSNHYGGLDGGHYTAYCKNAARQRWFKFDD 920 930 940 950 960 970 >>CCDS10137.1 USP8 gene_id:9101|Hs108|chr15 (1118 aa) initn: 243 init1: 113 opt: 311 Z-score: 312.4 bits: 69.3 E(32554): 4.4e-11 Smith-Waterman score: 311; 25.5% identity (53.9% similar) in 345 aa overlap (217-540:705-1040) 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 DNPVPNKKYKTDSLKYIQSNRKNPSSLEDLEKDRDLKLGPSFNTNCNGNPNLDETV---- :.::. :: ..:.. ... CCDS10 TVHMYPPEMAPSSAPPSTPPTHKAKPQIPAERDRE----PSKLKRSYSSPDITQAIQEEE 680 690 700 710 720 730 250 260 270 280 290 pF1KE3 ----LATQTLNAKNGLTSPLEPEHSQGDPRCNKAQVPLDSHSQQLQQGFPNLGNTCYMNA .: :.: .: : . : :. . . :. . : :. :::::::::. CCDS10 KRKPTVTPTVNRENKPTCYPKAEISRLSASQIRNLNPVFGGSGPALTGLRNLGNTCYMNS 740 750 760 770 780 790 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 VLQSLFAIPSFADDLLTQGVPWEYIPFEALIMTLTQL-----LALKDFCSTKIKRELLGN .:: : : .:: .... . : :. .. . .: . . . . . CCDS10 ILQCLCNAPHLAD-YFNRNCYQDDINRSNLLGHKGEVAEEFGIIMKALWTGQYRYISPKD 800 810 820 830 840 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 VKKVISAVAEIFSGNMQNDAHEFLGQCLDQLKEDMEKLNATLNTGKECGD--ENSSPQMH : .:. . . :.: :.:..:.: .: :.::..: . .: .: .. . : CCDS10 FKITIGKINDQFAGYSQQDSQELLLFLMDGLHEDLNKADNRKRYKEENNDHLDDFKAAEH 850 860 870 880 890 900 420 430 440 450 460 470 pF1KE3 VGSAATKVFVCPVVANFEFELQLSLICKACGHAVLKVEPNNYLSINLHQETKPLPLSIQN . . .. .:: :. ... .. : .: . : :::. : . .: ..:. CCDS10 AWQKHKQLNESIIVALFQGQFKSTVQCLTCHKKSRTFEAFMYLSLPLASTSK---CTLQD 910 920 930 940 950 960 480 490 500 510 520 pF1KE3 SLDLFFKEEELEYN----CQMCK-QKSCVARHTFSRLSRVLIIHLKRYSFNNAWLLVKNN : :: :::.: : :. :. ... . . . .: ::..::::.:... : : . CCDS10 CLRLFSKEEKLTDNNRFYCSHCRARRDSLKKIEIWKLPPVLLVHLKRFSYDGRWKQ-KLQ 970 980 990 1000 1010 1020 530 540 550 560 570 580 pF1KE3 EQVYIP-KSLSLSSYCNESTKPPLPLSSSAPVGKCEVLEVSQEMISEINSPLTPSMKLTS .: .: ..:.::.: CCDS10 TSVDFPLENLDLSQYVIGPKNNLKKYNLFSVSNHYGGLDGGHYTAYCKNAARQRWFKFDD 1030 1040 1050 1060 1070 1080 912 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sat Nov 5 02:09:01 2016 done: Sat Nov 5 02:09:01 2016 Total Scan time: 3.520 Total Display time: 0.100 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]