Result of FASTA (omim) for pFN21AE4595
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KE4595, 1241 aa
  1>>>pF1KE4595 1241 - 1241 aa - 1241 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0469+/-0.000497; mu= 10.5291+/- 0.031
 mean_var=308.8430+/-63.262, 0's: 0 Z-trim(116.4): 289  B-trim: 33 in 1/58
 Lambda= 0.072980
 statistics sampled from 27134 (27462) to 27134 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.661), E-opt: 0.2 (0.322), width:  16
 Scan time: 17.950

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_004637 (OMIM: 256300,602716) nephrin precursor  (1241) 8359 896.0       0
NP_002933 (OMIM: 602431,610878) roundabout homolog (1378)  461 64.5 5.7e-09
NP_001122401 (OMIM: 602431,610878) roundabout homo (1394)  461 64.5 5.7e-09
XP_016862492 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1401)  461 64.5 5.7e-09
XP_016862489 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1420)  461 64.5 5.8e-09
XP_016862482 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1469)  461 64.5 5.9e-09
XP_016862478 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1534)  461 64.5   6e-09
NP_115499 (OMIM: 607762) kin of IRRE-like protein  ( 633)  382 55.7 1.1e-06
XP_016882837 (OMIM: 607762) PREDICTED: kin of IRRE ( 673)  382 55.7 1.2e-06
XP_011525665 (OMIM: 607762) PREDICTED: kin of IRRE ( 708)  382 55.8 1.2e-06
XP_011525664 (OMIM: 607762) PREDICTED: kin of IRRE ( 708)  382 55.8 1.2e-06
NP_954649 (OMIM: 607762) kin of IRRE-like protein  ( 708)  382 55.8 1.2e-06
XP_016862495 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1379)  377 55.6 2.6e-06
NP_001276968 (OMIM: 602431,610878) roundabout homo (1382)  377 55.6 2.6e-06
XP_016862494 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1396)  377 55.6 2.6e-06
XP_016862493 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1398)  377 55.6 2.6e-06
XP_016862491 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1402)  377 55.6 2.6e-06
XP_016862490 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1403)  377 55.6 2.6e-06
XP_011532287 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1405)  377 55.6 2.6e-06
XP_016862488 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1422)  377 55.7 2.7e-06
XP_016862487 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1424)  377 55.7 2.7e-06
XP_016862486 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1438)  377 55.7 2.7e-06
XP_016862485 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1440)  377 55.7 2.7e-06
XP_016862484 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1442)  377 55.7 2.7e-06
NP_001276969 (OMIM: 602431,610878) roundabout homo (1443)  377 55.7 2.7e-06
XP_016862483 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1445)  377 55.7 2.7e-06
XP_011532286 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1447)  377 55.7 2.7e-06
XP_016862481 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1489)  377 55.7 2.7e-06
XP_016862480 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1496)  377 55.7 2.7e-06
XP_016862479 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1531)  377 55.7 2.8e-06
XP_016862477 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1536)  377 55.7 2.8e-06
XP_011532285 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1538)  377 55.7 2.8e-06
XP_016862476 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1554)  377 55.7 2.8e-06
XP_011532284 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1557)  377 55.7 2.8e-06
XP_016862475 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1576)  377 55.7 2.8e-06
XP_011532283 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roun (1597)  377 55.7 2.8e-06
XP_011508343 (OMIM: 603075,608548) PREDICTED: hemi (3132)  376 56.0 4.5e-06
XP_016857926 (OMIM: 603075,608548) PREDICTED: hemi (4976)  376 56.3   6e-06
XP_011508340 (OMIM: 603075,608548) PREDICTED: hemi (5518)  376 56.4 6.3e-06
NP_114141 (OMIM: 603075,608548) hemicentin-1 precu (5635)  376 56.4 6.4e-06
NP_001155179 (OMIM: 607761,612581) kin of IRRE-lik ( 600)  353 52.6 9.2e-06
XP_016873611 (OMIM: 607313,608630) PREDICTED: roun (1364)  359 53.7 9.6e-06
NP_071765 (OMIM: 607313,608630) roundabout homolog (1386)  359 53.7 9.7e-06
NP_001288026 (OMIM: 607761,612581) kin of IRRE-lik ( 766)  353 52.8 1.1e-05
XP_011541335 (OMIM: 607761,612581) PREDICTED: kin  ( 766)  353 52.8 1.1e-05
XP_011541334 (OMIM: 607761,612581) PREDICTED: kin  ( 772)  353 52.8 1.1e-05
XP_011541333 (OMIM: 607761,612581) PREDICTED: kin  ( 778)  353 52.8 1.1e-05
NP_115920 (OMIM: 607761,612581) kin of IRRE-like p ( 778)  353 52.8 1.1e-05
XP_016873909 (OMIM: 607761,612581) PREDICTED: kin  ( 778)  353 52.8 1.1e-05
XP_011541332 (OMIM: 607761,612581) PREDICTED: kin  ( 784)  353 52.8 1.1e-05


>>NP_004637 (OMIM: 256300,602716) nephrin precursor [Hom  (1241 aa)
 initn: 8359 init1: 8359 opt: 8359  Z-score: 4776.7  bits: 896.0 E(85289):    0
Smith-Waterman score: 8359; 100.0% identity (100.0% similar) in 1241 aa overlap (1-1241:1-1241)

               10        20        30        40        50        60
pF1KE4 MALGTTLRASLLLLGLLTEGLAQLAIPASVPRGFWALPENLTVVEGASVELRCGVSTPGS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MALGTTLRASLLLLGLLTEGLAQLAIPASVPRGFWALPENLTVVEGASVELRCGVSTPGS
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KE4 AVQWAKDGLLLGPDPRIPGFPRYRLEGDPARGEFHLHIEACDLSDDAEYECQVGRSEMGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 AVQWAKDGLLLGPDPRIPGFPRYRLEGDPARGEFHLHIEACDLSDDAEYECQVGRSEMGP
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KE4 ELVSPRVILSILVPPKLLLLTPEAGTMVTWVAGQEYVVNCVSGDAKPAPDITILLSGQTI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ELVSPRVILSILVPPKLLLLTPEAGTMVTWVAGQEYVVNCVSGDAKPAPDITILLSGQTI
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KE4 SDISANVNEGSQQKLFTVEATARVTPRSSDNRQLLVCEASSPALEAPIKASFTVNVLFPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SDISANVNEGSQQKLFTVEATARVTPRSSDNRQLLVCEASSPALEAPIKASFTVNVLFPP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KE4 GPPVIEWPGLDEGHVRAGQSLELPCVARGGNPLATLQWLKNGQPVSTAWGTEHTQAVARS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GPPVIEWPGLDEGHVRAGQSLELPCVARGGNPLATLQWLKNGQPVSTAWGTEHTQAVARS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KE4 VLVMTVRPEDHGAQLSCEAHNSVSAGTQEHGITLQVTFPPSAIIILGSASQTENKNVTLS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VLVMTVRPEDHGAQLSCEAHNSVSAGTQEHGITLQVTFPPSAIIILGSASQTENKNVTLS
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KE4 CVSKSSRPRVLLRWWLGWRQLLPMEETVMDGLHGGHISMSNLTFLARREDNGLTLTCEAF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 CVSKSSRPRVLLRWWLGWRQLLPMEETVMDGLHGGHISMSNLTFLARREDNGLTLTCEAF
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KE4 SEAFTKETFKKSLILNVKYPAQKLWIEGPPEGQKLRAGTRVRLVCLAIGGNPEPSLMWYK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SEAFTKETFKKSLILNVKYPAQKLWIEGPPEGQKLRAGTRVRLVCLAIGGNPEPSLMWYK
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KE4 DSRTVTESRLPQESRRVHLGSVEKSGSTFSRELVLVTGPSDNQAKFTCKAGQLSASTQLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DSRTVTESRLPQESRRVHLGSVEKSGSTFSRELVLVTGPSDNQAKFTCKAGQLSASTQLA
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KE4 VQFPPTNVTILANASALRPGDALNLTCVSVSSNPPVNLSWDKEGERLEGVAAPPRRAPFK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VQFPPTNVTILANASALRPGDALNLTCVSVSSNPPVNLSWDKEGERLEGVAAPPRRAPFK
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KE4 GSAAARSVLLQVSSRDHGQRVTCRAHSAELRETVSSFYRLNVLYRPEFLGEQVLVVTAVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 GSAAARSVLLQVSSRDHGQRVTCRAHSAELRETVSSFYRLNVLYRPEFLGEQVLVVTAVE
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KE4 QGEALLPVSVSANPAPEAFNWTFRGYRLSPAGGPRHRILSSGALHLWNVTRADDGLYQLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 QGEALLPVSVSANPAPEAFNWTFRGYRLSPAGGPRHRILSSGALHLWNVTRADDGLYQLH
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KE4 CQNSEGTAEARLRLDVHYAPTIRALQDPTEVNVGGSVDIVCTVDANPILPGMFNWERLGE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 CQNSEGTAEARLRLDVHYAPTIRALQDPTEVNVGGSVDIVCTVDANPILPGMFNWERLGE
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KE4 DEEDQSLDDMEKISRGPTGRLRIHHAKLAQAGAYQCIVDNGVAPPARRLLRLVVRFAPQV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DEEDQSLDDMEKISRGPTGRLRIHHAKLAQAGAYQCIVDNGVAPPARRLLRLVVRFAPQV
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KE4 EHPTPLTKVAAAGDSTSSATLHCRARGVPNIVFTWTKNGVPLDLQDPRYTEHTYHQGGVH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 EHPTPLTKVAAAGDSTSSATLHCRARGVPNIVFTWTKNGVPLDLQDPRYTEHTYHQGGVH
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KE4 SSLLTIANVSAAQDYALFTCTATNALGSDQTNIQLVSISRPDPPSGLKVVSLTPHSVGLE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SSLLTIANVSAAQDYALFTCTATNALGSDQTNIQLVSISRPDPPSGLKVVSLTPHSVGLE
              910       920       930       940       950       960

              970       980       990      1000      1010      1020
pF1KE4 WKPGFDGGLPQRFCIRYEALGTPGFHYVDVVPPQATTFTLTGLQPSTRYRVWLLASNALG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 WKPGFDGGLPQRFCIRYEALGTPGFHYVDVVPPQATTFTLTGLQPSTRYRVWLLASNALG
              970       980       990      1000      1010      1020

             1030      1040      1050      1060      1070      1080
pF1KE4 DSGLADKGTQLPITTPGLHQPSGEPEDQLPTEPPSGPSGLPLLPVLFALGGLLLLSNASC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 DSGLADKGTQLPITTPGLHQPSGEPEDQLPTEPPSGPSGLPLLPVLFALGGLLLLSNASC
             1030      1040      1050      1060      1070      1080

             1090      1100      1110      1120      1130      1140
pF1KE4 VGGVLWQRRLRRLAEGISEKTEAGSEEDRVRNEYEESQWTGERDTQSSTVSTTEAEPYYR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 VGGVLWQRRLRRLAEGISEKTEAGSEEDRVRNEYEESQWTGERDTQSSTVSTTEAEPYYR
             1090      1100      1110      1120      1130      1140

             1150      1160      1170      1180      1190      1200
pF1KE4 SLRDFSPQLPPTQEEVSYSRGFTGEDEDMAFPGHLYDEVERTYPPSGAWGPLYDEVQMGP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 SLRDFSPQLPPTQEEVSYSRGFTGEDEDMAFPGHLYDEVERTYPPSGAWGPLYDEVQMGP
             1150      1160      1170      1180      1190      1200

             1210      1220      1230      1240 
pF1KE4 WDLHWPEDTYQDPRGIYDQVAGDLDTLEPDSLPFELRGHLV
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 WDLHWPEDTYQDPRGIYDQVAGDLDTLEPDSLPFELRGHLV
             1210      1220      1230      1240 

>>NP_002933 (OMIM: 602431,610878) roundabout homolog 2 i  (1378 aa)
 initn: 255 init1: 106 opt: 461  Z-score: 282.1  bits: 64.5 E(85289): 5.7e-09
Smith-Waterman score: 500; 25.7% identity (52.1% similar) in 639 aa overlap (450-1052:37-633)

     420       430       440       450       460       470         
pF1KE4 FSEAFTKETFKKSLILNVKYPAQKLWIEGPPEGQKLRAGTRVRLVCLAIGGNPEPSLMWY
                                     :    .  :  . : : :  : : :.. ::
NP_002 TQLLLCGFLYVRVDGSRLRQEDFPPRIVEHPSDVIVSKGEPTTLNCKA-EGRPTPTIEWY
         10        20        30        40        50         60     

     480       490       500       510       520       530         
pF1KE4 KDSRTVTESRLPQESRRVHLGSVEKSGSTFSRELVLVTGPSDNQAKFTCKA----GQL--
       ::.. :  ..   .:.:. :     ::: :  ..:     . ......: :    :.   
NP_002 KDGERVETDKDDPRSHRMLL----PSGSLFFLRIVHGRRSKPDEGSYVCVARNYLGEAVS
          70        80            90       100       110       120 

            540            550       560       570       580       
pF1KE4 -SASTQLAV---QF--PPTNVTILANASALRPGDALNLTCVSVSSNPPVNLSWDKEGERL
        .:: ..:.   .:   ::.:.. :.  :.       : :    ..:  .. : :.  :.
NP_002 RNASLEVALLRDDFRQNPTDVVVAAGEPAI-------LECQPPRGHPEPTIYWKKDKVRI
             130       140       150              160       170    

       590       600       610       620       630       640       
pF1KE4 EGVAAPPRRAPFKGSAAARSVLLQVSSRDHGQRVTCRAHSAELRETVSSFYRLNVLYRPE
       .      .:  ..:.    ..... . .. .   :: . .  . :  :.  .:.:. :: 
NP_002 DD---KEERISIRGG----KLMISNTRKSDAGMYTC-VGTNMVGERDSDPAELTVFERPT
             180           190       200        210       220      

       650       660       670       680       690       700       
pF1KE4 FLGEQVLVVTAVEQGEALLPVSVSANPAPEAFNWTFRGYRLSPAGGPRHRILSSGALHLW
       :: . .  :. .:.  . .  .:...: : .  :      : : :  :. : .. .:.. 
NP_002 FLRRPINQVV-LEEEAVEFRCQVQGDPQPTV-RWKKDDADL-PRG--RYDIKDDYTLRIK
        230        240       250        260          270       280 

       710       720       730       740       750       760       
pF1KE4 NVTRADDGLYQLHCQNSEGTAEARLRLDVHYAPTIRALQDPTEVNVGGSVDIVCTVDANP
       ..  .:.: :.   .:  :  ::   : :.  : . .      :  : .: . : . .::
NP_002 KTMSTDEGTYMCIAENRVGKMEASATLTVRAPPQFVVRPRDQIVAQGRTVTFPCETKGNP
             290       300       310       320       330       340 

       770       780          790       800       810           820
pF1KE4 ILPGMFNWERLGEDE---EDQSLDDMEKISRGPTGRLRIHHAKLAQAGAYQC----IVDN
         :..: :.. : ..    .:  .   . : .::: : : . . ..:: : :    .. .
NP_002 -QPAVF-WQKEGSQNLLFPNQPQQPNSRCSVSPTGDLTITNIQRSDAGYYICQALTVAGS
               350       360       370       380       390         

              830       840       850       860       870       880
pF1KE4 GVAPPARRLLRLVVRFAPQVEHPTPLTKVAAAGDSTSSATLHCRARGVPNIVFTWTKNGV
        .:    ..  ...   : .    : ... :. :.:  : :.:.: : :  :..: :.: 
NP_002 ILAKAQLEVTDVLTDRPPPIILQGPANQTLAV-DGT--ALLKCKATGDPLPVISWLKEGF
     400       410       420       430          440       450      

              890       900       910       920       930          
pF1KE4 PLDLQDPRYTEHTYHQGGVHSSLLTIANVSAAQDYALFTCTATNALGSDQTNIQL-----
        .  .::: :    .::      : : :.  . : . .::.::.. :  . .  :     
NP_002 TFPGRDPRAT--IQEQG-----TLQIKNLRIS-DTGTYTCVATSSSGETSWSAVLDVTES
        460         470            480        490       500        

          940              950       960       970       980       
pF1KE4 -VSISR-------PDPPSGLKVVSLTPHSVGLEWKPGFDGGLPQRFCIRYEALGTPGFHY
        ..::.       : :::  .:...: .:: : :.::  : ::    :  ::..    . 
NP_002 GATISKNYDLSDLPGPPSKPQVTDVTKNSVTLSWQPGTPGTLPASAYI-IEAFSQSVSNS
      510       520       530       540       550        560       

       990        1000      1010      1020      1030       1040    
pF1KE4 VDVVPP--QATTFTLTGLQPSTRYRVWLLASNALGDSGLADKGTQL-PITTPGLHQPS-G
        ..:    ..: .:. ::.:.:   ..:.   :.. .::.: . .  :. :  .  :. :
NP_002 WQTVANHVKTTLYTVRGLRPNT---IYLFMVRAINPQGLSDPSPMSDPVRTQDISPPAQG
       570       580          590       600       610       620    

          1050      1060      1070      1080      1090      1100   
pF1KE4 EPEDQLPTEPPSGPSGLPLLPVLFALGGLLLLSNASCVGGVLWQRRLRRLAEGISEKTEA
         . :.  :                                                   
NP_002 VDHRQVQKELGDVLVRLHNPVVLTPTTVQVTWTVDRQPQFIQGYRVMYRQTSGLQATSSW
          630       640       650       660       670       680    

>>NP_001122401 (OMIM: 602431,610878) roundabout homolog   (1394 aa)
 initn: 221 init1: 106 opt: 461  Z-score: 282.0  bits: 64.5 E(85289): 5.7e-09
Smith-Waterman score: 500; 25.7% identity (52.1% similar) in 639 aa overlap (450-1052:53-649)

     420       430       440       450       460       470         
pF1KE4 FSEAFTKETFKKSLILNVKYPAQKLWIEGPPEGQKLRAGTRVRLVCLAIGGNPEPSLMWY
                                     :    .  :  . : : :  : : :.. ::
NP_001 TVVFWGHQGNGQGQGSRLRQEDFPPRIVEHPSDVIVSKGEPTTLNCKA-EGRPTPTIEWY
             30        40        50        60        70         80 

     480       490       500       510       520       530         
pF1KE4 KDSRTVTESRLPQESRRVHLGSVEKSGSTFSRELVLVTGPSDNQAKFTCKA----GQL--
       ::.. :  ..   .:.:. :     ::: :  ..:     . ......: :    :.   
NP_001 KDGERVETDKDDPRSHRMLL----PSGSLFFLRIVHGRRSKPDEGSYVCVARNYLGEAVS
              90       100           110       120       130       

            540            550       560       570       580       
pF1KE4 -SASTQLAV---QF--PPTNVTILANASALRPGDALNLTCVSVSSNPPVNLSWDKEGERL
        .:: ..:.   .:   ::.:.. :.  :.       : :    ..:  .. : :.  :.
NP_001 RNASLEVALLRDDFRQNPTDVVVAAGEPAI-------LECQPPRGHPEPTIYWKKDKVRI
       140       150       160              170       180       190

       590       600       610       620       630       640       
pF1KE4 EGVAAPPRRAPFKGSAAARSVLLQVSSRDHGQRVTCRAHSAELRETVSSFYRLNVLYRPE
       .      .:  ..:.    ..... . .. .   :: . .  . :  :.  .:.:. :: 
NP_001 DD---KEERISIRGG----KLMISNTRKSDAGMYTC-VGTNMVGERDSDPAELTVFERPT
                 200           210        220       230       240  

       650       660       670       680       690       700       
pF1KE4 FLGEQVLVVTAVEQGEALLPVSVSANPAPEAFNWTFRGYRLSPAGGPRHRILSSGALHLW
       :: . .  :. .:.  . .  .:...: : .  :      : : :  :. : .. .:.. 
NP_001 FLRRPINQVV-LEEEAVEFRCQVQGDPQPTV-RWKKDDADL-PRG--RYDIKDDYTLRIK
            250        260       270        280          290       

       710       720       730       740       750       760       
pF1KE4 NVTRADDGLYQLHCQNSEGTAEARLRLDVHYAPTIRALQDPTEVNVGGSVDIVCTVDANP
       ..  .:.: :.   .:  :  ::   : :.  : . .      :  : .: . : . .::
NP_001 KTMSTDEGTYMCIAENRVGKMEASATLTVRAPPQFVVRPRDQIVAQGRTVTFPCETKGNP
       300       310       320       330       340       350       

       770       780          790       800       810           820
pF1KE4 ILPGMFNWERLGEDE---EDQSLDDMEKISRGPTGRLRIHHAKLAQAGAYQC----IVDN
         :..: :.. : ..    .:  .   . : .::: : : . . ..:: : :    .. .
NP_001 -QPAVF-WQKEGSQNLLFPNQPQQPNSRCSVSPTGDLTITNIQRSDAGYYICQALTVAGS
        360        370       380       390       400       410     

              830       840       850       860       870       880
pF1KE4 GVAPPARRLLRLVVRFAPQVEHPTPLTKVAAAGDSTSSATLHCRARGVPNIVFTWTKNGV
        .:    ..  ...   : .    : ... :. :.:  : :.:.: : :  :..: :.: 
NP_001 ILAKAQLEVTDVLTDRPPPIILQGPANQTLAV-DGT--ALLKCKATGDPLPVISWLKEGF
         420       430       440        450         460       470  

              890       900       910       920       930          
pF1KE4 PLDLQDPRYTEHTYHQGGVHSSLLTIANVSAAQDYALFTCTATNALGSDQTNIQL-----
        .  .::: :    .::      : : :.  . : . .::.::.. :  . .  :     
NP_001 TFPGRDPRAT--IQEQG-----TLQIKNLRIS-DTGTYTCVATSSSGETSWSAVLDVTES
            480              490        500       510       520    

          940              950       960       970       980       
pF1KE4 -VSISR-------PDPPSGLKVVSLTPHSVGLEWKPGFDGGLPQRFCIRYEALGTPGFHY
        ..::.       : :::  .:...: .:: : :.::  : ::    :  ::..    . 
NP_001 GATISKNYDLSDLPGPPSKPQVTDVTKNSVTLSWQPGTPGTLPASAYI-IEAFSQSVSNS
          530       540       550       560       570        580   

       990        1000      1010      1020      1030       1040    
pF1KE4 VDVVPP--QATTFTLTGLQPSTRYRVWLLASNALGDSGLADKGTQL-PITTPGLHQPS-G
        ..:    ..: .:. ::.:.:   ..:.   :.. .::.: . .  :. :  .  :. :
NP_001 WQTVANHVKTTLYTVRGLRPNT---IYLFMVRAINPQGLSDPSPMSDPVRTQDISPPAQG
           590       600          610       620       630       640

          1050      1060      1070      1080      1090      1100   
pF1KE4 EPEDQLPTEPPSGPSGLPLLPVLFALGGLLLLSNASCVGGVLWQRRLRRLAEGISEKTEA
         . :.  :                                                   
NP_001 VDHRQVQKELGDVLVRLHNPVVLTPTTVQVTWTVDRQPQFIQGYRVMYRQTSGLQATSSW
              650       660       670       680       690       700

>>XP_016862492 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roundabo  (1401 aa)
 initn: 255 init1: 106 opt: 461  Z-score: 282.0  bits: 64.5 E(85289): 5.7e-09
Smith-Waterman score: 500; 25.7% identity (52.1% similar) in 639 aa overlap (450-1052:60-656)

     420       430       440       450       460       470         
pF1KE4 FSEAFTKETFKKSLILNVKYPAQKLWIEGPPEGQKLRAGTRVRLVCLAIGGNPEPSLMWY
                                     :    .  :  . : : :  : : :.. ::
XP_016 KLTRTPWKGKPWKGGSRLRQEDFPPRIVEHPSDVIVSKGEPTTLNCKA-EGRPTPTIEWY
      30        40        50        60        70         80        

     480       490       500       510       520       530         
pF1KE4 KDSRTVTESRLPQESRRVHLGSVEKSGSTFSRELVLVTGPSDNQAKFTCKA----GQL--
       ::.. :  ..   .:.:. :     ::: :  ..:     . ......: :    :.   
XP_016 KDGERVETDKDDPRSHRMLL----PSGSLFFLRIVHGRRSKPDEGSYVCVARNYLGEAVS
       90       100           110       120       130       140    

            540            550       560       570       580       
pF1KE4 -SASTQLAV---QF--PPTNVTILANASALRPGDALNLTCVSVSSNPPVNLSWDKEGERL
        .:: ..:.   .:   ::.:.. :.  :.       : :    ..:  .. : :.  :.
XP_016 RNASLEVALLRDDFRQNPTDVVVAAGEPAI-------LECQPPRGHPEPTIYWKKDKVRI
          150       160       170              180       190       

       590       600       610       620       630       640       
pF1KE4 EGVAAPPRRAPFKGSAAARSVLLQVSSRDHGQRVTCRAHSAELRETVSSFYRLNVLYRPE
       .      .:  ..:.    ..... . .. .   :: . .  . :  :.  .:.:. :: 
XP_016 DD---KEERISIRGG----KLMISNTRKSDAGMYTC-VGTNMVGERDSDPAELTVFERPT
          200           210       220        230       240         

       650       660       670       680       690       700       
pF1KE4 FLGEQVLVVTAVEQGEALLPVSVSANPAPEAFNWTFRGYRLSPAGGPRHRILSSGALHLW
       :: . .  :. .:.  . .  .:...: : .  :      : : :  :. : .. .:.. 
XP_016 FLRRPINQVV-LEEEAVEFRCQVQGDPQPTV-RWKKDDADL-PRG--RYDIKDDYTLRIK
     250        260       270        280        290         300    

       710       720       730       740       750       760       
pF1KE4 NVTRADDGLYQLHCQNSEGTAEARLRLDVHYAPTIRALQDPTEVNVGGSVDIVCTVDANP
       ..  .:.: :.   .:  :  ::   : :.  : . .      :  : .: . : . .::
XP_016 KTMSTDEGTYMCIAENRVGKMEASATLTVRAPPQFVVRPRDQIVAQGRTVTFPCETKGNP
          310       320       330       340       350       360    

       770       780          790       800       810           820
pF1KE4 ILPGMFNWERLGEDE---EDQSLDDMEKISRGPTGRLRIHHAKLAQAGAYQC----IVDN
         :..: :.. : ..    .:  .   . : .::: : : . . ..:: : :    .. .
XP_016 -QPAVF-WQKEGSQNLLFPNQPQQPNSRCSVSPTGDLTITNIQRSDAGYYICQALTVAGS
            370       380       390       400       410       420  

              830       840       850       860       870       880
pF1KE4 GVAPPARRLLRLVVRFAPQVEHPTPLTKVAAAGDSTSSATLHCRARGVPNIVFTWTKNGV
        .:    ..  ...   : .    : ... :. :.:  : :.:.: : :  :..: :.: 
XP_016 ILAKAQLEVTDVLTDRPPPIILQGPANQTLAV-DGT--ALLKCKATGDPLPVISWLKEGF
            430       440       450          460       470         

              890       900       910       920       930          
pF1KE4 PLDLQDPRYTEHTYHQGGVHSSLLTIANVSAAQDYALFTCTATNALGSDQTNIQL-----
        .  .::: :    .::      : : :.  . : . .::.::.. :  . .  :     
XP_016 TFPGRDPRAT--IQEQG-----TLQIKNLRIS-DTGTYTCVATSSSGETSWSAVLDVTES
     480         490            500        510       520       530 

          940              950       960       970       980       
pF1KE4 -VSISR-------PDPPSGLKVVSLTPHSVGLEWKPGFDGGLPQRFCIRYEALGTPGFHY
        ..::.       : :::  .:...: .:: : :.::  : ::    :  ::..    . 
XP_016 GATISKNYDLSDLPGPPSKPQVTDVTKNSVTLSWQPGTPGTLPASAYI-IEAFSQSVSNS
             540       550       560       570        580       590

       990        1000      1010      1020      1030       1040    
pF1KE4 VDVVPP--QATTFTLTGLQPSTRYRVWLLASNALGDSGLADKGTQL-PITTPGLHQPS-G
        ..:    ..: .:. ::.:.:   ..:.   :.. .::.: . .  :. :  .  :. :
XP_016 WQTVANHVKTTLYTVRGLRPNT---IYLFMVRAINPQGLSDPSPMSDPVRTQDISPPAQG
              600       610          620       630       640       

          1050      1060      1070      1080      1090      1100   
pF1KE4 EPEDQLPTEPPSGPSGLPLLPVLFALGGLLLLSNASCVGGVLWQRRLRRLAEGISEKTEA
         . :.  :                                                   
XP_016 VDHRQVQKELGDVLVRLHNPVVLTPTTVQVTWTVDRQPQFIQGYRVMYRQTSGLQATSSW
       650       660       670       680       690       700       

>>XP_016862489 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roundabo  (1420 aa)
 initn: 221 init1: 106 opt: 461  Z-score: 281.9  bits: 64.5 E(85289): 5.8e-09
Smith-Waterman score: 500; 25.7% identity (52.1% similar) in 639 aa overlap (450-1052:37-633)

     420       430       440       450       460       470         
pF1KE4 FSEAFTKETFKKSLILNVKYPAQKLWIEGPPEGQKLRAGTRVRLVCLAIGGNPEPSLMWY
                                     :    .  :  . : : :  : : :.. ::
XP_016 TQLLLCGFLYVRVDGSRLRQEDFPPRIVEHPSDVIVSKGEPTTLNCKA-EGRPTPTIEWY
         10        20        30        40        50         60     

     480       490       500       510       520       530         
pF1KE4 KDSRTVTESRLPQESRRVHLGSVEKSGSTFSRELVLVTGPSDNQAKFTCKA----GQL--
       ::.. :  ..   .:.:. :     ::: :  ..:     . ......: :    :.   
XP_016 KDGERVETDKDDPRSHRMLL----PSGSLFFLRIVHGRRSKPDEGSYVCVARNYLGEAVS
          70        80            90       100       110       120 

            540            550       560       570       580       
pF1KE4 -SASTQLAV---QF--PPTNVTILANASALRPGDALNLTCVSVSSNPPVNLSWDKEGERL
        .:: ..:.   .:   ::.:.. :.  :.       : :    ..:  .. : :.  :.
XP_016 RNASLEVALLRDDFRQNPTDVVVAAGEPAI-------LECQPPRGHPEPTIYWKKDKVRI
             130       140       150              160       170    

       590       600       610       620       630       640       
pF1KE4 EGVAAPPRRAPFKGSAAARSVLLQVSSRDHGQRVTCRAHSAELRETVSSFYRLNVLYRPE
       .      .:  ..:.    ..... . .. .   :: . .  . :  :.  .:.:. :: 
XP_016 DD---KEERISIRGG----KLMISNTRKSDAGMYTC-VGTNMVGERDSDPAELTVFERPT
             180           190       200        210       220      

       650       660       670       680       690       700       
pF1KE4 FLGEQVLVVTAVEQGEALLPVSVSANPAPEAFNWTFRGYRLSPAGGPRHRILSSGALHLW
       :: . .  :. .:.  . .  .:...: : .  :      : : :  :. : .. .:.. 
XP_016 FLRRPINQVV-LEEEAVEFRCQVQGDPQPTV-RWKKDDADL-PRG--RYDIKDDYTLRIK
        230        240       250        260          270       280 

       710       720       730       740       750       760       
pF1KE4 NVTRADDGLYQLHCQNSEGTAEARLRLDVHYAPTIRALQDPTEVNVGGSVDIVCTVDANP
       ..  .:.: :.   .:  :  ::   : :.  : . .      :  : .: . : . .::
XP_016 KTMSTDEGTYMCIAENRVGKMEASATLTVRAPPQFVVRPRDQIVAQGRTVTFPCETKGNP
             290       300       310       320       330       340 

       770       780          790       800       810           820
pF1KE4 ILPGMFNWERLGEDE---EDQSLDDMEKISRGPTGRLRIHHAKLAQAGAYQC----IVDN
         :..: :.. : ..    .:  .   . : .::: : : . . ..:: : :    .. .
XP_016 -QPAVF-WQKEGSQNLLFPNQPQQPNSRCSVSPTGDLTITNIQRSDAGYYICQALTVAGS
               350       360       370       380       390         

              830       840       850       860       870       880
pF1KE4 GVAPPARRLLRLVVRFAPQVEHPTPLTKVAAAGDSTSSATLHCRARGVPNIVFTWTKNGV
        .:    ..  ...   : .    : ... :. :.:  : :.:.: : :  :..: :.: 
XP_016 ILAKAQLEVTDVLTDRPPPIILQGPANQTLAV-DGT--ALLKCKATGDPLPVISWLKEGF
     400       410       420       430          440       450      

              890       900       910       920       930          
pF1KE4 PLDLQDPRYTEHTYHQGGVHSSLLTIANVSAAQDYALFTCTATNALGSDQTNIQL-----
        .  .::: :    .::      : : :.  . : . .::.::.. :  . .  :     
XP_016 TFPGRDPRAT--IQEQG-----TLQIKNLRIS-DTGTYTCVATSSSGETSWSAVLDVTES
        460         470            480        490       500        

          940              950       960       970       980       
pF1KE4 -VSISR-------PDPPSGLKVVSLTPHSVGLEWKPGFDGGLPQRFCIRYEALGTPGFHY
        ..::.       : :::  .:...: .:: : :.::  : ::    :  ::..    . 
XP_016 GATISKNYDLSDLPGPPSKPQVTDVTKNSVTLSWQPGTPGTLPASAYI-IEAFSQSVSNS
      510       520       530       540       550        560       

       990        1000      1010      1020      1030       1040    
pF1KE4 VDVVPP--QATTFTLTGLQPSTRYRVWLLASNALGDSGLADKGTQL-PITTPGLHQPS-G
        ..:    ..: .:. ::.:.:   ..:.   :.. .::.: . .  :. :  .  :. :
XP_016 WQTVANHVKTTLYTVRGLRPNT---IYLFMVRAINPQGLSDPSPMSDPVRTQDISPPAQG
       570       580          590       600       610       620    

          1050      1060      1070      1080      1090      1100   
pF1KE4 EPEDQLPTEPPSGPSGLPLLPVLFALGGLLLLSNASCVGGVLWQRRLRRLAEGISEKTEA
         . :.  :                                                   
XP_016 VDHRQVQKELGDVLVRLHNPVVLTPTTVQVTWTVDRQPQFIQGYRVMYRQTSGLQATSSW
          630       640       650       660       670       680    

>>XP_016862482 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roundabo  (1469 aa)
 initn: 221 init1: 106 opt: 461  Z-score: 281.8  bits: 64.5 E(85289): 5.9e-09
Smith-Waterman score: 500; 25.7% identity (52.1% similar) in 639 aa overlap (450-1052:37-633)

     420       430       440       450       460       470         
pF1KE4 FSEAFTKETFKKSLILNVKYPAQKLWIEGPPEGQKLRAGTRVRLVCLAIGGNPEPSLMWY
                                     :    .  :  . : : :  : : :.. ::
XP_016 TQLLLCGFLYVRVDGSRLRQEDFPPRIVEHPSDVIVSKGEPTTLNCKA-EGRPTPTIEWY
         10        20        30        40        50         60     

     480       490       500       510       520       530         
pF1KE4 KDSRTVTESRLPQESRRVHLGSVEKSGSTFSRELVLVTGPSDNQAKFTCKA----GQL--
       ::.. :  ..   .:.:. :     ::: :  ..:     . ......: :    :.   
XP_016 KDGERVETDKDDPRSHRMLL----PSGSLFFLRIVHGRRSKPDEGSYVCVARNYLGEAVS
          70        80            90       100       110       120 

            540            550       560       570       580       
pF1KE4 -SASTQLAV---QF--PPTNVTILANASALRPGDALNLTCVSVSSNPPVNLSWDKEGERL
        .:: ..:.   .:   ::.:.. :.  :.       : :    ..:  .. : :.  :.
XP_016 RNASLEVALLRDDFRQNPTDVVVAAGEPAI-------LECQPPRGHPEPTIYWKKDKVRI
             130       140       150              160       170    

       590       600       610       620       630       640       
pF1KE4 EGVAAPPRRAPFKGSAAARSVLLQVSSRDHGQRVTCRAHSAELRETVSSFYRLNVLYRPE
       .      .:  ..:.    ..... . .. .   :: . .  . :  :.  .:.:. :: 
XP_016 DD---KEERISIRGG----KLMISNTRKSDAGMYTC-VGTNMVGERDSDPAELTVFERPT
             180           190       200        210       220      

       650       660       670       680       690       700       
pF1KE4 FLGEQVLVVTAVEQGEALLPVSVSANPAPEAFNWTFRGYRLSPAGGPRHRILSSGALHLW
       :: . .  :. .:.  . .  .:...: : .  :      : : :  :. : .. .:.. 
XP_016 FLRRPINQVV-LEEEAVEFRCQVQGDPQPTV-RWKKDDADL-PRG--RYDIKDDYTLRIK
        230        240       250        260          270       280 

       710       720       730       740       750       760       
pF1KE4 NVTRADDGLYQLHCQNSEGTAEARLRLDVHYAPTIRALQDPTEVNVGGSVDIVCTVDANP
       ..  .:.: :.   .:  :  ::   : :.  : . .      :  : .: . : . .::
XP_016 KTMSTDEGTYMCIAENRVGKMEASATLTVRAPPQFVVRPRDQIVAQGRTVTFPCETKGNP
             290       300       310       320       330       340 

       770       780          790       800       810           820
pF1KE4 ILPGMFNWERLGEDE---EDQSLDDMEKISRGPTGRLRIHHAKLAQAGAYQC----IVDN
         :..: :.. : ..    .:  .   . : .::: : : . . ..:: : :    .. .
XP_016 -QPAVF-WQKEGSQNLLFPNQPQQPNSRCSVSPTGDLTITNIQRSDAGYYICQALTVAGS
               350       360       370       380       390         

              830       840       850       860       870       880
pF1KE4 GVAPPARRLLRLVVRFAPQVEHPTPLTKVAAAGDSTSSATLHCRARGVPNIVFTWTKNGV
        .:    ..  ...   : .    : ... :. :.:  : :.:.: : :  :..: :.: 
XP_016 ILAKAQLEVTDVLTDRPPPIILQGPANQTLAV-DGT--ALLKCKATGDPLPVISWLKEGF
     400       410       420       430          440       450      

              890       900       910       920       930          
pF1KE4 PLDLQDPRYTEHTYHQGGVHSSLLTIANVSAAQDYALFTCTATNALGSDQTNIQL-----
        .  .::: :    .::      : : :.  . : . .::.::.. :  . .  :     
XP_016 TFPGRDPRAT--IQEQG-----TLQIKNLRIS-DTGTYTCVATSSSGETSWSAVLDVTES
        460         470            480        490       500        

          940              950       960       970       980       
pF1KE4 -VSISR-------PDPPSGLKVVSLTPHSVGLEWKPGFDGGLPQRFCIRYEALGTPGFHY
        ..::.       : :::  .:...: .:: : :.::  : ::    :  ::..    . 
XP_016 GATISKNYDLSDLPGPPSKPQVTDVTKNSVTLSWQPGTPGTLPASAYI-IEAFSQSVSNS
      510       520       530       540       550        560       

       990        1000      1010      1020      1030       1040    
pF1KE4 VDVVPP--QATTFTLTGLQPSTRYRVWLLASNALGDSGLADKGTQL-PITTPGLHQPS-G
        ..:    ..: .:. ::.:.:   ..:.   :.. .::.: . .  :. :  .  :. :
XP_016 WQTVANHVKTTLYTVRGLRPNT---IYLFMVRAINPQGLSDPSPMSDPVRTQDISPPAQG
       570       580          590       600       610       620    

          1050      1060      1070      1080      1090      1100   
pF1KE4 EPEDQLPTEPPSGPSGLPLLPVLFALGGLLLLSNASCVGGVLWQRRLRRLAEGISEKTEA
         . :.  :                                                   
XP_016 VDHRQVQKELGDVLVRLHNPVVLTPTTVQVTWTVDRQPQFIQGYRVMYRQTSGLQATSSW
          630       640       650       660       670       680    

>>XP_016862478 (OMIM: 602431,610878) PREDICTED: roundabo  (1534 aa)
 initn: 221 init1: 106 opt: 461  Z-score: 281.6  bits: 64.5 E(85289): 6e-09
Smith-Waterman score: 500; 25.7% identity (52.1% similar) in 639 aa overlap (450-1052:60-656)

     420       430       440       450       460       470         
pF1KE4 FSEAFTKETFKKSLILNVKYPAQKLWIEGPPEGQKLRAGTRVRLVCLAIGGNPEPSLMWY
                                     :    .  :  . : : :  : : :.. ::
XP_016 KLTRTPWKGKPWKGGSRLRQEDFPPRIVEHPSDVIVSKGEPTTLNCKA-EGRPTPTIEWY
      30        40        50        60        70         80        

     480       490       500       510       520       530         
pF1KE4 KDSRTVTESRLPQESRRVHLGSVEKSGSTFSRELVLVTGPSDNQAKFTCKA----GQL--
       ::.. :  ..   .:.:. :     ::: :  ..:     . ......: :    :.   
XP_016 KDGERVETDKDDPRSHRMLL----PSGSLFFLRIVHGRRSKPDEGSYVCVARNYLGEAVS
       90       100           110       120       130       140    

            540            550       560       570       580       
pF1KE4 -SASTQLAV---QF--PPTNVTILANASALRPGDALNLTCVSVSSNPPVNLSWDKEGERL
        .:: ..:.   .:   ::.:.. :.  :.       : :    ..:  .. : :.  :.
XP_016 RNASLEVALLRDDFRQNPTDVVVAAGEPAI-------LECQPPRGHPEPTIYWKKDKVRI
          150       160       170              180       190       

       590       600       610       620       630       640       
pF1KE4 EGVAAPPRRAPFKGSAAARSVLLQVSSRDHGQRVTCRAHSAELRETVSSFYRLNVLYRPE
       .      .:  ..:.    ..... . .. .   :: . .  . :  :.  .:.:. :: 
XP_016 DD---KEERISIRGG----KLMISNTRKSDAGMYTC-VGTNMVGERDSDPAELTVFERPT
          200           210       220        230       240         

       650       660       670       680       690       700       
pF1KE4 FLGEQVLVVTAVEQGEALLPVSVSANPAPEAFNWTFRGYRLSPAGGPRHRILSSGALHLW
       :: . .  :. .:.  . .  .:...: : .  :      : : :  :. : .. .:.. 
XP_016 FLRRPINQVV-LEEEAVEFRCQVQGDPQPTV-RWKKDDADL-PRG--RYDIKDDYTLRIK
     250        260       270        280        290         300    

       710       720       730       740       750       760       
pF1KE4 NVTRADDGLYQLHCQNSEGTAEARLRLDVHYAPTIRALQDPTEVNVGGSVDIVCTVDANP
       ..  .:.: :.   .:  :  ::   : :.  : . .      :  : .: . : . .::
XP_016 KTMSTDEGTYMCIAENRVGKMEASATLTVRAPPQFVVRPRDQIVAQGRTVTFPCETKGNP
          310       320       330       340       350       360    

       770       780          790       800       810           820
pF1KE4 ILPGMFNWERLGEDE---EDQSLDDMEKISRGPTGRLRIHHAKLAQAGAYQC----IVDN
         :..: :.. : ..    .:  .   . : .::: : : . . ..:: : :    .. .
XP_016 -QPAVF-WQKEGSQNLLFPNQPQQPNSRCSVSPTGDLTITNIQRSDAGYYICQALTVAGS
            370       380       390       400       410       420  

              830       840       850       860       870       880
pF1KE4 GVAPPARRLLRLVVRFAPQVEHPTPLTKVAAAGDSTSSATLHCRARGVPNIVFTWTKNGV
        .:    ..  ...   : .    : ... :. :.:  : :.:.: : :  :..: :.: 
XP_016 ILAKAQLEVTDVLTDRPPPIILQGPANQTLAV-DGT--ALLKCKATGDPLPVISWLKEGF
            430       440       450          460       470         

              890       900       910       920       930          
pF1KE4 PLDLQDPRYTEHTYHQGGVHSSLLTIANVSAAQDYALFTCTATNALGSDQTNIQL-----
        .  .::: :    .::      : : :.  . : . .::.::.. :  . .  :     
XP_016 TFPGRDPRAT--IQEQG-----TLQIKNLRIS-DTGTYTCVATSSSGETSWSAVLDVTES
     480         490            500        510       520       530 

          940              950       960       970       980       
pF1KE4 -VSISR-------PDPPSGLKVVSLTPHSVGLEWKPGFDGGLPQRFCIRYEALGTPGFHY
        ..::.       : :::  .:...: .:: : :.::  : ::    :  ::..    . 
XP_016 GATISKNYDLSDLPGPPSKPQVTDVTKNSVTLSWQPGTPGTLPASAYI-IEAFSQSVSNS
             540       550       560       570        580       590

       990        1000      1010      1020      1030       1040    
pF1KE4 VDVVPP--QATTFTLTGLQPSTRYRVWLLASNALGDSGLADKGTQL-PITTPGLHQPS-G
        ..:    ..: .:. ::.:.:   ..:.   :.. .::.: . .  :. :  .  :. :
XP_016 WQTVANHVKTTLYTVRGLRPNT---IYLFMVRAINPQGLSDPSPMSDPVRTQDISPPAQG
              600       610          620       630       640       

          1050      1060      1070      1080      1090      1100   
pF1KE4 EPEDQLPTEPPSGPSGLPLLPVLFALGGLLLLSNASCVGGVLWQRRLRRLAEGISEKTEA
         . :.  :                                                   
XP_016 VDHRQVQKELGDVLVRLHNPVVLTPTTVQVTWTVDRQPQFIQGYRVMYRQTSGLQATSSW
       650       660       670       680       690       700       

>>NP_115499 (OMIM: 607762) kin of IRRE-like protein 2 is  (633 aa)
 initn: 357 init1: 216 opt: 382  Z-score: 240.7  bits: 55.7 E(85289): 1.1e-06
Smith-Waterman score: 492; 26.2% identity (54.3% similar) in 644 aa overlap (34-646:26-612)

            10        20        30        40        50        60   
pF1KE4 GTTLRASLLLLGLLTEGLAQLAIPASVPRGFWALPENLTVVEGASVELRCGVSTPGSAVQ
                                     :   ::.:.:. :  ..: :....  . ::
NP_115      MLRMRVPALLVLLFCFRGRAGPSPHFLQQPEDLVVLLGEEARLPCALGAYWGLVQ
                    10        20        30        40        50     

            70        80        90       100       110       120   
pF1KE4 WAKDGLLLGPDPRIPGFPRYRLEGDPARGEFHLHIEACDLSDDAEYECQVGRSEMGPELV
       :.:.:: :: .  .::. :: . :. : :.  :::.  .: :.: ::::.  .. :  : 
NP_115 WTKSGLALGGQRDLPGWSRYWISGNAANGQHDLHIRPVELEDEASYECQA--TQAG--LR
          60        70        80        90       100           110 

           130       140         150       160        170          
pF1KE4 SPRVILSILVPPKLLLLTPEA--GTMVTWVAGQEYVVNCVS-GDAKPAPDIT-----ILL
       :  . : .::::.    .:..  :  :. :::    ..: : :::.:.:..      .::
NP_115 SRPAQLHVLVPPE----APQVLGGPSVSLVAGVPANLTCRSRGDARPTPELLWFRDGVLL
             120           130       140       150       160       

         180       190       200       210       220       230     
pF1KE4 SGQTISDISANVNEGSQQKLFTVEATARVTPRSSDNRQLLVCEASSPALEAPIKASFTVN
       .: :.   .. ..::.     .::.:  .:: : :.   .::.: : :: .   ...:..
NP_115 DGATFH--QTLLKEGTPG---SVESTLTLTPFSHDDGATFVCRARSQALPTGRDTAITLS
       170         180          190       200       210       220  

         240       250       260       270       280       290     
pF1KE4 VLFPPGPPVIEWPGLDEGHVRAGQSLELPCVARGGNPLATLQWLKNGQPVSTAWGTEHTQ
       . .::   .   :      :. :... . : : .  :..  .: :.:.::  : : .  .
NP_115 LQYPPEVTLSASPHT----VQEGEKVIFLCQATAQPPVTGYRWAKGGSPVLGARGPR-LE
            230           240       250       260       270        

         300       310       320       330       340       350     
pF1KE4 AVARSVLVMTVRPEDHGAQLSCEAHNSVSAGTQEHGITLQVTFPPSAIIILGSASQTENK
       .:: . ..  ..:      .:::. :.:  :. ... .:.: : :        .:   ..
NP_115 VVADASFL--TEP------VSCEVSNAV--GSANRSTALDVLFGPILQAKPEPVSVDVGE
       280               290         300       310       320       

         360        370         380       390       400       410  
pF1KE4 NVTLSCVSKSSR-PRVLLRWWL--GWRQLLPMEETVMDGLHGGHISMSNLTFLARREDNG
       ....::. ...  :::    :   :  :.:    :    :.   ..  .    . : . :
NP_115 DASFSCAWRGNPLPRVT---WTRRGGAQVLGSGAT----LRLPSVGPEDAGDYVCRAEAG
       330       340          350           360       370       380

            420       430       440       450       460       470  
pF1KE4 LTLTCEAFSEAFTKETFKKSLILNVKYPAQKLWIEGPPEGQKLRAGTRVRLVCLAIGGNP
       :.    . .::  . : .   .... . :  . ..::           .:: ::... .:
NP_115 LSGLRGGAAEA--RLTVNAPPVVTALHSAPAF-LRGP-----------ARLQCLVFA-SP
              390         400       410                   420      

             480                490       500       510       520  
pF1KE4 EP-SLMWYKD---------SRTVTESRLPQESRRVHLGSVEKSGSTFSRELVLVTGPSDN
        : ...:  :         .: ..:. .:    :  ::      . .:   .  :  :: 
NP_115 APDAVVWSWDEGFLEAGSQGRFLVET-FPAPESRGGLGP-----GLISVLHISGTQESDF
         430       440       450        460            470         

            530           540        550       560           570   
pF1KE4 QAKFTCKA----GQLSASTQLAVQ-FPPTNVTILANASALRPGDALNLT----CVSVSSN
       . .:.:.:    :. .:...:. . . :: : :.:...:      . .:    :    :.
NP_115 SRSFNCSARNRLGEGGAQASLGRRDLLPT-VRIVAGVAAATTTLLMVITGVALCCWRHSK
     480       490       500        510       520       530        

           580       590        600       610       620       630  
pF1KE4 PPVNLSWDKEGERLEGVA-APPRRAPFKGSAAARSVLLQVSSRDHGQRVTCRAHSAELRE
         ...: .:.  :. : . .   :.: .  ...:     .   ::.. :  .  . : ..
NP_115 ASASFSEQKNLMRIPGSSDGSSSRGPEEEETGSREDRGPIVHTDHSDLVLEEEGTLETKD
      540       550       560       570       580       590        

            640       650       660       670       680       690  
pF1KE4 TVSSFYRLNVLYRPEFLGEQVLVVTAVEQGEALLPVSVSANPAPEAFNWTFRGYRLSPAG
        ....:..  .  :                                              
NP_115 PTNGYYKVRGVSPPASPDSRVTSFQWKSPGISNLP                         
      600       610       620       630                            

>>XP_016882837 (OMIM: 607762) PREDICTED: kin of IRRE-lik  (673 aa)
 initn: 327 init1: 216 opt: 382  Z-score: 240.4  bits: 55.7 E(85289): 1.2e-06
Smith-Waterman score: 458; 31.2% identity (59.8% similar) in 346 aa overlap (34-370:26-343)

            10        20        30        40        50        60   
pF1KE4 GTTLRASLLLLGLLTEGLAQLAIPASVPRGFWALPENLTVVEGASVELRCGVSTPGSAVQ
                                     :   ::.:.:. :  ..: :....  . ::
XP_016      MLRMRVPALLVLLFCFRGRAGPSPHFLQQPEDLVVLLGEEARLPCALGAYWGLVQ
                    10        20        30        40        50     

            70        80        90       100       110       120   
pF1KE4 WAKDGLLLGPDPRIPGFPRYRLEGDPARGEFHLHIEACDLSDDAEYECQVGRSEMGPELV
       :.:.:: :: .  .::. :: . :. : :.  :::.  .: :.: ::::.  .. :  : 
XP_016 WTKSGLALGGQRDLPGWSRYWISGNAANGQHDLHIRPVELEDEASYECQA--TQAG--LR
          60        70        80        90       100           110 

           130       140         150       160        170          
pF1KE4 SPRVILSILVPPKLLLLTPEA--GTMVTWVAGQEYVVNCVS-GDAKPAPDIT-----ILL
       :  . : .::::.    .:..  :  :. :::    ..: : :::.:.:..      .::
XP_016 SRPAQLHVLVPPE----APQVLGGPSVSLVAGVPANLTCRSRGDARPTPELLWFRDGVLL
             120           130       140       150       160       

         180       190       200       210       220       230     
pF1KE4 SGQTISDISANVNEGSQQKLFTVEATARVTPRSSDNRQLLVCEASSPALEAPIKASFTVN
       .: :. .  . ..::.     .::.:  .:: : :.   .::.: : :: .   ...:..
XP_016 DGATFHQ--TLLKEGTPG---SVESTLTLTPFSHDDGATFVCRARSQALPTGRDTAITLS
       170         180          190       200       210       220  

         240       250       260       270       280       290     
pF1KE4 VLFPPGPPVIEWPGLDEGHVRAGQSLELPCVARGGNPLATLQWLKNGQPVSTAWGTEHTQ
       . .::   .   :      :. :... . : : .  :..  .: :.:.::  : : .  .
XP_016 LQYPPEVTLSASPHT----VQEGEKVIFLCQATAQPPVTGYRWAKGGSPVLGARGPR-LE
            230           240       250       260       270        

         300       310       320       330       340       350     
pF1KE4 AVARSVLVMTVRPEDHGAQLSCEAHNSVSAGTQEHGITLQVTFPPSAIIILGSASQTENK
       .:: . ..  ..:      .:::. :.:  :. ... .:.: : :        .:   ..
XP_016 VVADASFL--TEP------VSCEVSNAV--GSANRSTALDVLFGPILQAKPEPVSVDVGE
       280               290         300       310       320       

         360        370       380       390       400       410    
pF1KE4 NVTLSCVSKSSR-PRVLLRWWLGWRQLLPMEETVMDGLHGGHISMSNLTFLARREDNGLT
       ....::. ...  :::                                            
XP_016 DASFSCAWRGNPLPRVTWTRRGGAQVLGSGATLRLPSVGPEDAGDYVCRAEAGLSGLRGG
       330       340       350       360       370       380       

>>XP_011525665 (OMIM: 607762) PREDICTED: kin of IRRE-lik  (708 aa)
 initn: 327 init1: 216 opt: 382  Z-score: 240.2  bits: 55.8 E(85289): 1.2e-06
Smith-Waterman score: 494; 26.3% identity (53.9% similar) in 649 aa overlap (34-651:26-617)

            10        20        30        40        50        60   
pF1KE4 GTTLRASLLLLGLLTEGLAQLAIPASVPRGFWALPENLTVVEGASVELRCGVSTPGSAVQ
                                     :   ::.:.:. :  ..: :....  . ::
XP_011      MLRMRVPALLVLLFCFRGRAGPSPHFLQQPEDLVVLLGEEARLPCALGAYWGLVQ
                    10        20        30        40        50     

            70        80        90       100       110       120   
pF1KE4 WAKDGLLLGPDPRIPGFPRYRLEGDPARGEFHLHIEACDLSDDAEYECQVGRSEMGPELV
       :.:.:: :: .  .::. :: . :. : :.  :::.  .: :.: ::::.  .. :  : 
XP_011 WTKSGLALGGQRDLPGWSRYWISGNAANGQHDLHIRPVELEDEASYECQA--TQAG--LR
          60        70        80        90       100           110 

           130       140         150       160        170          
pF1KE4 SPRVILSILVPPKLLLLTPEA--GTMVTWVAGQEYVVNCVS-GDAKPAPDIT-----ILL
       :  . : .::::.    .:..  :  :. :::    ..: : :::.:.:..      .::
XP_011 SRPAQLHVLVPPE----APQVLGGPSVSLVAGVPANLTCRSRGDARPTPELLWFRDGVLL
             120           130       140       150       160       

         180       190       200       210       220       230     
pF1KE4 SGQTISDISANVNEGSQQKLFTVEATARVTPRSSDNRQLLVCEASSPALEAPIKASFTVN
       .: :. .    ..::.     .::.:  .:: : :.   .::.: : :: .   ...:..
XP_011 DGATFHQTL--LKEGTPG---SVESTLTLTPFSHDDGATFVCRARSQALPTGRDTAITLS
       170         180          190       200       210       220  

         240       250       260       270       280       290     
pF1KE4 VLFPPGPPVIEWPGLDEGHVRAGQSLELPCVARGGNPLATLQWLKNGQPVSTAWGTEHTQ
       . .::   .   :      :. :... . : : .  :..  .: :.:.::  : : .  .
XP_011 LQYPPEVTLSASPHT----VQEGEKVIFLCQATAQPPVTGYRWAKGGSPVLGARGPR-LE
            230           240       250       260       270        

         300       310       320       330       340       350     
pF1KE4 AVARSVLVMTVRPEDHGAQLSCEAHNSVSAGTQEHGITLQVTFPPSAIIILGSASQTENK
       .:: . ..  ..:      .:::. :.:  :. ... .:.: : :        .:   ..
XP_011 VVADASFL--TEP------VSCEVSNAV--GSANRSTALDVLFGPILQAKPEPVSVDVGE
       280               290         300       310       320       

         360        370         380       390       400       410  
pF1KE4 NVTLSCVSKSSR-PRVLLRWWL--GWRQLLPMEETVMDGLHGGHISMSNLTFLARREDNG
       ....::. ...  :::    :   :  :.:    :    :.   ..  .    . : . :
XP_011 DASFSCAWRGNPLPRVT---WTRRGGAQVLGSGAT----LRLPSVGPEDAGDYVCRAEAG
       330       340          350           360       370       380

            420       430       440       450       460       470  
pF1KE4 LTLTCEAFSEAFTKETFKKSLILNVKYPAQKLWIEGPPEGQKLRAGTRVRLVCLAIGGNP
       :.    . .::  . : .   .... . :  . ..::           .:: :: . ..:
XP_011 LSGLRGGAAEA--RLTVNAPPVVTALHSAPAF-LRGP-----------ARLQCL-VFASP
              390         400       410                   420      

             480                490       500       510       520  
pF1KE4 EP-SLMWYKD---------SRTVTESRLPQESRRVHLGSVEKSGSTFSRELVLVTGPSDN
        : ...:  :         .: ..:. .:    :  ::      . .:   .  :  :: 
XP_011 APDAVVWSWDEGFLEAGSQGRFLVET-FPAPESRGGLGP-----GLISVLHISGTQESDF
         430       440       450        460            470         

            530           540        550       560           570   
pF1KE4 QAKFTCKA----GQLSASTQLAVQ-FPPTNVTILANASALRPGDALNLT----CVSVSSN
       . .:.:.:    :. .:...:. . . :: : :.:...:      . .:    :    :.
XP_011 SRSFNCSARNRLGEGGAQASLGRRDLLPT-VRIVAGVAAATTTLLMVITGVALCCWRHSK
     480       490       500        510       520       530        

           580       590        600       610       620       630  
pF1KE4 PPVNLSWDKEGERLEGVA-APPRRAPFKGSAAARSVLLQVSSRDHGQRVTCRAHSAELRE
         ...: .:.  :. : . .   :.: .  ...:     .   ::.. :  .  . : ..
XP_011 ASASFSEQKNLMRIPGSSDGSSSRGPEEEETGSREDRGPIVHTDHSDLVLEEEGTLETKD
      540       550       560       570       580       590        

            640       650       660       670       680       690  
pF1KE4 TVSSFYRLNVLYRPEFLGEQVLVVTAVEQGEALLPVSVSANPAPEAFNWTFRGYRLSPAG
        ....:..  .     :::                                         
XP_011 PTNGYYKVRGVSVSLSLGEAPGGGLFLPPPSPLGPPGTPTFYDFNPHLGMVPPCRLYRAR
      600       610       620       630       640       650        




1241 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sat Nov  5 23:43:04 2016 done: Sat Nov  5 23:43:07 2016
 Total Scan time: 17.950 Total Display time:  0.240

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com