FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6004, 314 aa 1>>>pF1KE6004 314 - 314 aa - 314 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7396+/-0.00118; mu= 13.4960+/- 0.068 mean_var=190.1538+/-67.459, 0's: 0 Z-trim(103.1): 380 B-trim: 395 in 1/47 Lambda= 0.093008 statistics sampled from 6778 (7243) to 6778 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.562), E-opt: 0.2 (0.222), width: 16 Scan time: 2.020 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS32895.1 OR2Z1 gene_id:284383|Hs108|chr19 ( 314) 2056 289.2 2.7e-78 CCDS31100.1 OR2T8 gene_id:343172|Hs108|chr1 ( 312) 1088 159.3 3.5e-39 CCDS31123.1 OR2T35 gene_id:403244|Hs108|chr1 ( 323) 1079 158.2 8.1e-39 CCDS31109.1 OR2T33 gene_id:391195|Hs108|chr1 ( 320) 1076 157.7 1.1e-38 CCDS58992.1 OR2V1 gene_id:26693|Hs108|chr5 ( 315) 1075 157.6 1.2e-38 CCDS31124.1 OR2T27 gene_id:403239|Hs108|chr1 ( 317) 1070 156.9 1.9e-38 CCDS31116.1 OR2T2 gene_id:401992|Hs108|chr1 ( 324) 1068 156.7 2.3e-38 CCDS31413.1 OR2AG2 gene_id:338755|Hs108|chr11 ( 316) 1066 156.4 2.7e-38 CCDS31110.1 OR2T12 gene_id:127064|Hs108|chr1 ( 320) 1055 154.9 7.5e-38 CCDS4461.1 OR2V2 gene_id:285659|Hs108|chr5 ( 315) 1049 154.1 1.3e-37 CCDS31414.1 OR2AG1 gene_id:144125|Hs108|chr11 ( 316) 1033 152.0 5.8e-37 CCDS31115.1 OR2T1 gene_id:26696|Hs108|chr1 ( 369) 1032 151.9 6.9e-37 CCDS31108.1 OR2M4 gene_id:26245|Hs108|chr1 ( 311) 1031 151.7 6.9e-37 CCDS31111.1 OR2M7 gene_id:391196|Hs108|chr1 ( 312) 1030 151.6 7.6e-37 CCDS31105.1 OR2M5 gene_id:127059|Hs108|chr1 ( 312) 1030 151.6 7.6e-37 CCDS31106.1 OR2M2 gene_id:391194|Hs108|chr1 ( 347) 1017 149.9 2.7e-36 CCDS31107.1 OR2M3 gene_id:127062|Hs108|chr1 ( 312) 1008 148.6 5.9e-36 CCDS31104.1 OR2L3 gene_id:391192|Hs108|chr1 ( 312) 1006 148.3 7.1e-36 CCDS31103.1 OR2L2 gene_id:26246|Hs108|chr1 ( 312) 989 146.1 3.4e-35 CCDS31102.1 OR2AK2 gene_id:391191|Hs108|chr1 ( 335) 987 145.8 4.3e-35 CCDS31114.1 OR2T6 gene_id:254879|Hs108|chr1 ( 308) 981 145.0 7.2e-35 CCDS31113.1 OR2T4 gene_id:127074|Hs108|chr1 ( 348) 975 144.2 1.3e-34 CCDS31118.1 OR2T5 gene_id:401993|Hs108|chr1 ( 315) 967 143.1 2.7e-34 CCDS55695.1 OR2T29 gene_id:343563|Hs108|chr1 ( 315) 967 143.1 2.7e-34 CCDS58068.1 OR2L5 gene_id:81466|Hs108|chr1 ( 312) 959 142.0 5.6e-34 CCDS31121.1 OR2T10 gene_id:127069|Hs108|chr1 ( 312) 957 141.8 6.8e-34 CCDS34696.1 OR2AE1 gene_id:81392|Hs108|chr7 ( 323) 950 140.8 1.3e-33 CCDS1637.1 OR2L13 gene_id:284521|Hs108|chr1 ( 312) 942 139.7 2.7e-33 CCDS31117.1 OR2T3 gene_id:343173|Hs108|chr1 ( 318) 932 138.4 7e-33 CCDS31120.1 OR2T34 gene_id:127068|Hs108|chr1 ( 318) 931 138.3 7.7e-33 CCDS31417.1 OR2D3 gene_id:120775|Hs108|chr11 ( 330) 903 134.6 1.1e-31 CCDS56515.1 OR2A42 gene_id:402317|Hs108|chr7 ( 310) 900 134.1 1.4e-31 CCDS43673.1 OR2A1 gene_id:346528|Hs108|chr7 ( 310) 900 134.1 1.4e-31 CCDS31093.1 OR2G3 gene_id:81469|Hs108|chr1 ( 309) 896 133.6 2e-31 CCDS43434.1 OR2J2 gene_id:26707|Hs108|chr6 ( 312) 887 132.4 4.5e-31 CCDS31119.1 OR2G6 gene_id:391211|Hs108|chr1 ( 316) 886 132.2 5e-31 CCDS43668.1 OR2A5 gene_id:393046|Hs108|chr7 ( 311) 884 132.0 6e-31 CCDS34358.1 OR2B3 gene_id:442184|Hs108|chr6 ( 313) 883 131.8 6.6e-31 CCDS4641.1 OR2B2 gene_id:81697|Hs108|chr6 ( 357) 877 131.1 1.2e-30 CCDS34365.1 OR2H2 gene_id:7932|Hs108|chr6 ( 312) 875 130.8 1.4e-30 CCDS35088.1 OR13C4 gene_id:138804|Hs108|chr9 ( 318) 873 130.5 1.7e-30 CCDS1634.2 OR2C3 gene_id:81472|Hs108|chr1 ( 320) 871 130.2 2e-30 CCDS31416.1 OR2D2 gene_id:120776|Hs108|chr11 ( 308) 870 130.1 2.2e-30 CCDS43433.1 OR2J3 gene_id:442186|Hs108|chr6 ( 311) 865 129.4 3.5e-30 CCDS4642.1 OR2B6 gene_id:26212|Hs108|chr6 ( 313) 864 129.3 3.9e-30 CCDS43670.1 OR2A12 gene_id:346525|Hs108|chr7 ( 310) 862 129.0 4.6e-30 CCDS4656.1 OR2W1 gene_id:26692|Hs108|chr6 ( 320) 854 128.0 9.9e-30 CCDS10502.1 OR2C1 gene_id:4993|Hs108|chr16 ( 312) 852 127.7 1.2e-29 CCDS34364.1 OR10C1 gene_id:442194|Hs108|chr6 ( 312) 851 127.5 1.3e-29 CCDS43666.1 OR2F2 gene_id:135948|Hs108|chr7 ( 317) 849 127.3 1.6e-29 >>CCDS32895.1 OR2Z1 gene_id:284383|Hs108|chr19 (314 aa) initn: 2056 init1: 2056 opt: 2056 Z-score: 1519.0 bits: 289.2 E(32554): 2.7e-78 Smith-Waterman score: 2056; 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CCDS58 CEVQALLKLACADTSLFDTLLFACCVFMLLLPFSIIMASYACILGAVLRIRSAQAWKKAL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 TTCSSHITVVGLFYGAAVFMYMVPCAYHSPQQDNVVSLFYSLVTPTLNPLIYSLRNPEVW .:::::.:.: ::::::.:::. : :..:..:.:.:.::...:: :::::::::: :: CCDS58 ATCSSHLTAVTLFYGAAMFMYLRPRRYRAPSHDKVASIFYTVLTPMLNPLIYSLRNGEVM 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE6 MALVKVLSRAGLRQMC :: : :.: CCDS58 GALRKGLDRCRIGSQH 300 310 >>CCDS31124.1 OR2T27 gene_id:403239|Hs108|chr1 (317 aa) initn: 1103 init1: 1057 opt: 1070 Z-score: 803.9 bits: 156.9 E(32554): 1.9e-38 Smith-Waterman score: 1070; 53.2% identity (79.9% similar) in 308 aa overlap (1-307:1-307) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MGDVNQSVASDFILVGLFSHSGSRQLLFSLVAVMFVIGLLGNTVLLFLIRVDSRLHTPMY : . : :: .::::.::::.. :::.:. ..:. .. .:.: ..::..::::::::: CCDS31 MEQSNYSVYADFILLGLFSNARFPWLLFALILLVFLTSIASNVVKIILIHIDSRLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 FLLSQLSLFDIGCPMVTIPKMASDFLRGEGATSYGGGAAQIF-FLTLMGVAEGVLLVLMS :::::::: :: . .::: : . .. : :..: .:: : .::: : :: :: ::: CCDS31 FLLSQLSLRDILYISTIVPKMLVDQVMSQRAISFAGCTAQHFLYLTLAG-AEFFLLGLMS 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 YDRYVAVCQPLQYPVLMRRQVCLLMMGSSWVVGVLNASIQTSITLHFPYCASRIVDHFFC ::::::.:.::.::::: :..: :.....:. : ... . : .:..::.:::: ..:::: CCDS31 YDRYVAICNPLHYPVLMSRKICWLIVAAAWLGGSIDGFLLTPVTMQFPFCASREINHFFC 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 EVPALLKLSCADTCAYEMALSTSGVLILMLPLSLIATSYGHVLQAVLSMRSEEARHKAVT ::::::::::.:: ::: :. . ...:..:.:.:. :: ..: .: : :.: :::. 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CCDS31 LRRVLGKYILLAHSTL 310 >>CCDS31110.1 OR2T12 gene_id:127064|Hs108|chr1 (320 aa) initn: 1054 init1: 1054 opt: 1055 Z-score: 793.0 bits: 154.9 E(32554): 7.5e-38 Smith-Waterman score: 1055; 52.3% identity (80.0% similar) in 300 aa overlap (6-305:4-303) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MGDVNQSVASDFILVGLFSHSGSRQLLFSLVAVMFVIGLLGNTVLLFLIRVDSRLHTPMY .... ::::.:::.:. ..:.:: .. . . .:..:.....::. : ::: ::: CCDS31 MEMRNTTPDFILLGLFNHTRAHQVLFMMLLATVLTSLFSNALMILLIHWDHRLHRPMY 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 FLLSQLSLFDIGCPMVTIPKMASDFLRGEGATSYGGGAAQIFFLTLMGVAEGVLLVLMSY ::::::::.:. .:.::::.:.: :. : : .: ..::::: .: .: ::. :.: CCDS31 FLLSQLSLMDMMLVSTTVPKMAADYLTGNKAISRAGCGVQIFFLPTLGGGECFLLAAMAY 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 DRYVAVCQPLQYPVLMRRQVCLLMMGSSWVVGVLNASIQTSITLHFPYCASRIVDHFFCE :::.:::.::.::.:: :.:: : :::..:. .. .:. :: ::::... .:::::: CCDS31 DRYAAVCHPLRYPTLMSWQLCLRMTMSSWLLGAADGLLQAVATLSFPYCGAHEIDHFFCE 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 VPALLKLSCADTCAYEMALSTSGVLILMLPLSLIATSYGHVLQAVLSMRSEEARHKAVTT .:.:..:.:::: ..: :. ::.:..:.::: .::: .: ::: ::: :::.:: .: CCDS31 APVLVRLACADTSVFENAMYICCVLMLLVPFSLILSSYGLILAAVLLMRSTEARKKAFAT 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE6 CSSHITVVGLFYGAAVFMYMVPCAYHSPQQDNVVSLFYSLVTPTLNPLIYSLRNPEVWMA ::::..::::::::..: :: : ...: ..:.::: ::.. :: :::::::.:: :: : CCDS31 CSSHVAVVGLFYGAGIFTYMRPKSHRSTNHDKVVSAFYTMFTPLLNPLIYSVRNSEVKEA 240 250 260 270 280 290 310 pF1KE6 LVKVLSRAGLRQMC : . : CCDS31 LKRWLGTCVNLKHQQNEAHRSR 300 310 320 >>CCDS4461.1 OR2V2 gene_id:285659|Hs108|chr5 (315 aa) initn: 1060 init1: 1041 opt: 1049 Z-score: 788.7 bits: 154.1 E(32554): 1.3e-37 Smith-Waterman score: 1049; 51.5% identity (82.6% similar) in 305 aa overlap (4-307:5-308) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MGDVNQSVASDFILVGLFSHSGSRQLLFSLVAVMFVIGLLGNTVLLFLIRVDSRLHTPM :::: .. :.:.:.:::: . .:::.: ..:...: ::..:.::: .: .::::: CCDS44 METWVNQSYTDGFFLLGIFSHSTADLVLFSVVMAVFTVALCGNVLLIFLIYMDPHLHTPM 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 YFLLSQLSLFDIGCPMVTIPKMASDFLRGEGATSYGGGAAQI-FFLTLMGVAEGVLLVLM ::.::::::.:. ...::::..:: :. . :. : . :: .:. :.: .::.:: :: CCDS44 YFFLSQLSLMDLMLVCTNVPKMAANFLSGRKSISFVGCGIQIGLFVCLVG-SEGLLLGLM 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 SYDRYVAVCQPLQYPVLMRRQVCLLMMGSSWVVGVLNASIQTSITLHFPYCASRIVDHFF .::::::. .::.::.:: ..::: . ::::. :.... :: ....::::. : :.::: CCDS44 AYDRYVAISHPLHYPILMNQRVCLQITGSSWAFGIIDGLIQMVVVMNFPYCGLRKVNHFF 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 CEVPALLKLSCADTCAYEMALSTSGVLILMLPLSLIATSYGHVLQAVLSMRSEEARHKAV ::. .::::.:.:: .: .. . :..:..:.:.:..::.:.: .::.:.: .: .::. CCDS44 CEMLSLLKLACVDTSLFEKVIFACCVFMLLFPFSIIVASYAHILGTVLQMHSAQAWKKAL 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 TTCSSHITVVGLFYGAAVFMYMVPCAYHSPQQDNVVSLFYSLVTPTLNPLIYSLRNPEVW .:::::.:.: ::::::.:.:. : :..:..:.:.:.::...:: :::::::::: :: CCDS44 ATCSSHLTAVTLFYGAAMFIYLRPRHYRAPSHDKVASIFYTVLTPMLNPLIYSLRNREVM 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE6 MALVKVLSRAGLRQMC :: : :.: CCDS44 GALRKGLDRCRIGSQH 300 310 314 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 08:39:18 2016 done: Tue Nov 8 08:39:18 2016 Total Scan time: 2.020 Total Display time: 0.010 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]