FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE2440, 3075 aa 1>>>pF1KE2440 3075 - 3075 aa - 3075 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5042+/-0.00162; mu= 25.0999+/- 0.098 mean_var=302.8791+/-58.951, 0's: 0 Z-trim(104.7): 154 B-trim: 34 in 1/52 Lambda= 0.073695 statistics sampled from 7895 (8021) to 7895 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.569), E-opt: 0.2 (0.246), width: 16 Scan time: 6.140 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS32787.1 LAMA1 gene_id:284217|Hs108|chr18 (3075) 21241 2276.1 0 CCDS5138.1 LAMA2 gene_id:3908|Hs108|chr6 (3122) 7174 780.6 0 CCDS45838.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18 (3277) 1460 173.1 2.6e-41 CCDS42419.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18 (3333) 1460 173.1 2.6e-41 CCDS33502.1 LAMA5 gene_id:3911|Hs108|chr20 (3695) 1432 170.2 2.2e-40 CCDS30625.1 HSPG2 gene_id:3339|Hs108|chr1 (4391) 1129 138.1 1.2e-30 CCDS5750.1 LAMB1 gene_id:3912|Hs108|chr7 (1786) 1004 124.1 7.6e-27 CCDS2789.1 LAMB2 gene_id:3913|Hs108|chr3 (1798) 986 122.2 2.9e-26 CCDS1351.1 LAMC1 gene_id:3915|Hs108|chr1 (1609) 929 116.1 1.8e-24 CCDS34732.1 LAMB4 gene_id:22798|Hs108|chr7 (1761) 872 110.1 1.3e-22 CCDS11880.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18 (1724) 798 102.2 2.9e-20 CCDS44285.1 LAMC2 gene_id:3918|Hs108|chr1 (1111) 773 99.2 1.5e-19 CCDS1352.1 LAMC2 gene_id:3918|Hs108|chr1 (1193) 773 99.3 1.6e-19 CCDS48010.2 MEGF9 gene_id:1955|Hs108|chr9 ( 602) 618 82.3 1e-14 CCDS1516.1 USH2A gene_id:7399|Hs108|chr1 (1546) 594 80.4 9.4e-14 CCDS44180.1 NTNG1 gene_id:22854|Hs108|chr1 ( 539) 586 78.8 1e-13 CCDS31025.1 USH2A gene_id:7399|Hs108|chr1 (5202) 594 81.4 1.7e-13 CCDS59307.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18 (1668) 585 79.5 1.9e-13 CCDS1487.1 LAMB3 gene_id:3914|Hs108|chr1 (1172) 580 78.7 2.3e-13 CCDS34514.1 LAMA4 gene_id:3910|Hs108|chr6 (1816) 554 76.3 1.9e-12 CCDS43491.1 LAMA4 gene_id:3910|Hs108|chr6 (1823) 546 75.5 3.5e-12 CCDS4142.1 MEGF10 gene_id:84466|Hs108|chr5 (1140) 519 72.2 2e-11 CCDS11148.1 NTN1 gene_id:9423|Hs108|chr17 ( 604) 495 69.2 8.9e-11 >>CCDS32787.1 LAMA1 gene_id:284217|Hs108|chr18 (3075 aa) initn: 21241 init1: 21241 opt: 21241 Z-score: 12221.6 bits: 2276.1 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 21241; 99.9% identity (100.0% similar) in 3075 aa overlap (1-3075:1-3075) 10 20 30 40 50 60 pF1KE2 MRGGVLLVLLLCVAAQCRQRGLFPAILNLASNAHISTNATCGEKGPEMFCKLVEHVPGRP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 MRGGVLLVLLLCVAAQCRQRGLFPAILNLASNAHISTNATCGEKGPEMFCKLVEHVPGRP 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 VRNPQCRICDGNSANPRERHPISHAIDGTNNWWQSPSIQNGREYHWVTITLDLRQVFQVA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 VRNPQCRICDGNSANPRERHPISHAIDGTNNWWQSPSIQNGREYHWVTITLDLRQVFQVA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 YVIIKAANAPRPGNWILERSLDGTTFSPWQYYAVSDSECLSRYNITPRRGPPTYRADDEV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 YVIIKAANAPRPGNWILERSLDGTTFSPWQYYAVSDSECLSRYNITPRRGPPTYRADDEV 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE2 ICTSYYSRLVPLEHGEIHTSLINGRPSADDLSPKLLEFTSARYIRLRLQRIRTLNADLMT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 ICTSYYSRLVPLEHGEIHTSLINGRPSADDLSPKLLEFTSARYIRLRLQRIRTLNADLMT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE2 LSHREPKELDPIVTRRYYYSIKDISVGGMCICYGHASSCPWDETTKKLQCQCEHNTCGES :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 LSHREPKELDPIVTRRYYYSIKDISVGGMCICYGHASSCPWDETTKKLQCQCEHNTCGES 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE2 CNRCCPGYHQQPWRPGTVSSGNTCEACNCHNKAKDCYYDESVAKQKKSLNTAGQFRGGGV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 CNRCCPGYHQQPWRPGTVSSGNTCEACNCHNKAKDCYYDESVAKQKKSLNTAGQFRGGGV 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE2 CINCLQNTMGINCETCIDGYYRPHKVSPYEDEPCRPCNCDPVGSLSSVCIKDDLHSDLHN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 CINCLQNTMGINCETCIDGYYRPHKVSPYEDEPCRPCNCDPVGSLSSVCIKDDLHSDLHN 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KE2 GKQPGQCPCKEGYTGEKCDRCQLGYKDYPTCVSCGCNPVGSASDEPCTGPCVCKENVEGK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 GKQPGQCPCKEGYTGEKCDRCQLGYKDYPTCVSCGCNPVGSASDEPCTGPCVCKENVEGK 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KE2 ACDRCKPGFYNLKEKNPRGCSECFCFGVSDVCSSLSWPVGQVNSMSGWLVTDLISPRKIP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 ACDRCKPGFYNLKEKNPRGCSECFCFGVSDVCSSLSWPVGQVNSMSGWLVTDLISPRKIP 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KE2 SQQDALGGRHQVSINNTAVMQRLAPKYYWAAPEAYLGNKLTAFGGFLKYTVSYDIPVETV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 SQQDALGGRHQVSINNTAVMQRLAPKYYWAAPEAYLGNKLTAFGGFLKYTVSYDIPVETV 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KE2 DSNLMSHADVIIKGNGLTLSTQAEGLSLQPYEEYLNVVRLVPENFQDFHSKRQIDRDQLM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 DSNLMSHADVIIKGNGLTLSTQAEGLSLQPYEEYLNVVRLVPENFQDFHSKRQIDRDQLM 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KE2 TVLANVTHLLIRANYNSAKMALYRLESVSLDIASSNAIDLVVAADVEHCECPQGYTGTSC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 TVLANVTHLLIRANYNSAKMALYRLESVSLDIASSNAIDLVVAADVEHCECPQGYTGTSC 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KE2 ESCLSGYYRVDGILFGGICQPCECHGHAAECNVHGVCIACAHNTTGVHCEQCLPGFYGEP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 ESCLSGYYRVDGILFGGICQPCECHGHAAECNVHGVCIACAHNTTGVHCEQCLPGFYGEP 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KE2 SRGTPGDCQPCACPLTIASNNFSPTCHLNDGDEVVCDWCAPGYSGAWCERCADGYYGNPT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 SRGTPGDCQPCACPLTIASNNFSPTCHLNDGDEVVCDWCAPGYSGAWCERCADGYYGNPT 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 pF1KE2 VPGESCVPCDCSGNVDPSEAGHCDSVTGECLKCLGNTDGAHCERCADGFYGDAVTAKNCR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 VPGESCVPCDCSGNVDPSEAGHCDSVTGECLKCLGNTDGAHCERCADGFYGDAVTAKNCR 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 pF1KE2 ACECHVKGSHSAVCHLETGLCDCKPNVTGQQCDQCLHGYYGLDSGHGCRPCNCSVAGSVS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 ACECHVKGSHSAVCHLETGLCDCKPNVTGQQCDQCLHGYYGLDSGHGCRPCNCSVAGSVS 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KE2 DGCTDEGQCHCVPGVAGKRCDRCAHGFYAYQDGSCTPCDCPHTQNTCDPETGECVCPPHT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 DGCTDEGQCHCVPGVAGKRCDRCAHGFYAYQDGSCTPCDCPHTQNTCDPETGECVCPPHT 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KE2 QGVKCEECEDGHWGYDAEVGCQACNCSLVGSTHHRCDVVTGHCQCKSKFGGRACDQCSLG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 QGVKCEECEDGHWGYDAEVGCQACNCSLVGSTHHRCDVVTGHCQCKSKFGGRACDQCSLG 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KE2 YRDFPDCVPCDCDLRGTSGDACNLEQGLCGCVEETGACPCKENVFGPQCNECREGTFALR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 YRDFPDCVPCDCDLRGTSGDACNLEQGLCGCVEETGACPCKENVFGPQCNECREGTFALR 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KE2 ADNPLGCSPCFCSGLSHLCSELEDYVRTPVTLGSDQPLLRVVSQSNLRGTTEGVYYQAPD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 ADNPLGCSPCFCSGLSHLCSELEDYVRTPVTLGSDQPLLRVVSQSNLRGTTEGVYYQAPD 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 pF1KE2 FLLDAATVRQHIRAEPFYWRLPQQFQGDQLMAYGGKLKYSVAFYSLDGVGTSNFEPQVLI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 FLLDAATVRQHIRAEPFYWRLPQQFQGDQLMAYGGKLKYSVAFYSLDGVGTSNFEPQVLI 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 pF1KE2 KGGRIRKQVIYMDAPAPENGVRQEQEVAMRENFWKYFNSVSEKPVTREDFMSVLSDIEYI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 KGGRIRKQVIYMDAPAPENGVRQEQEVAMRENFWKYFNSVSEKPVTREDFMSVLSDIEYI 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 pF1KE2 LIKASYGQGLQQSRISDISMEVGRKAEKLHPEEEVASLLENCVCPPGTVGFSCQDCAPGY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 LIKASYGQGLQQSRISDISMEVGRKAEKLHPEEEVASLLENCVCPPGTVGFSCQDCAPGY 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 pF1KE2 HRGKLPAGSDRGPRPLVAPCVPCSCNNHSDTCDPNTGKCLNCGDNTAGDHCDVCTSGYYG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 HRGKLPAGSDRGPRPLVAPCVPCSCNNHSDTCDPNTGKCLNCGDNTAGDHCDVCTSGYYG 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 pF1KE2 KVTGSASDCALCACPHSPPASFSPTCVLEGDHDFRCDACLLGYEGKHCERCSSSYYGNPQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 KVTGSASDCALCACPHSPPASFSPTCVLEGDHDFRCDACLLGYEGKHCERCSSSYYGNPQ 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 pF1KE2 TPGGSCQKCDCNPHGSVHGDCDRTSGQCVCRLGASGLRCDECEPRHILMETDCVSCDDEC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 TPGGSCQKCDCNPHGSVHGDCDRTSGQCVCRLGASGLRCDECEPRHILMETDCVSCDDEC 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1620 pF1KE2 VGVLLNDLDEIGDAVLSLNLTGIIPVPYGILSNLENTTKYLQESLLKENMQKDLGKIKLE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 VGVLLNDLDEIGDAVLSLNLTGIIPVPYGILSNLENTTKYLQESLLKENMQKDLGKIKLE 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 pF1KE2 GVAEETDNLQKKLTRMLASTQKVNRATERIFKESQDLAIAIERLQMSITEIMEKTTLNQT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 GVAEETDNLQKKLTRMLASTQKVNRATERIFKESQDLAIAIERLQMSITEIMEKTTLNQT 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1740 pF1KE2 LVEDFLLPNSTLQNMQQNGTSLLEIMQIRDFTQLHQNATLELKAAEDLLSQIQENYQKPL : :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 LDEDFLLPNSTLQNMQQNGTSLLEIMQIRDFTQLHQNATLELKAAEDLLSQIQENYQKPL 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1800 pF1KE2 EELEVLKEAASHVLSKHNNELKAAEALVREAEAKMQESNHLLLMVNANLREFSDKKLHVQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 EELEVLKEAASHVLSKHNNELKAAEALVREAEAKMQESNHLLLMVNANLREFSDKKLHVQ 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1850 1860 pF1KE2 EEQNLTSELIVQGRGLIDAAAAQTDAVQDALEHLEDHQDKLLLWSAKIRHHIDDLVMHMS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 EEQNLTSELIVQGRGLIDAAAAQTDAVQDALEHLEDHQDKLLLWSAKIRHHIDDLVMHMS 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1920 pF1KE2 QRNAVDLVYRAEDHAAEFQRLADVLYSGLENIRNVSLNATSAAYVHYNIQSLIEESEELA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 QRNAVDLVYRAEDHAAEFQRLADVLYSGLENIRNVSLNATSAAYVHYNIQSLIEESEELA 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1930 1940 1950 1960 1970 1980 pF1KE2 RDAHRTVTETSLLSESLVSNGKAAVQRSSRFLKEGNNLSRKLPGIALELSELRNKTNRFQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 RDAHRTVTETSLLSESLVSNGKAAVQRSSRFLKEGNNLSRKLPGIALELSELRNKTNRFQ 1930 1940 1950 1960 1970 1980 1990 2000 2010 2020 2030 2040 pF1KE2 ENAVEITRQTNESLLILRAIPEGIRDKGAKTKELATSASQSAVSTLRDVAGLSQELLNTS :::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 ENAVEITRQTNESLLILRAIPKGIRDKGAKTKELATSASQSAVSTLRDVAGLSQELLNTS 1990 2000 2010 2020 2030 2040 2050 2060 2070 2080 2090 2100 pF1KE2 ASLSRVNTTLRETHQLLQDSTMATLLAGRKVKDVEIQANLLFDRLKPLKMLEENLSRNLS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 ASLSRVNTTLRETHQLLQDSTMATLLAGRKVKDVEIQANLLFDRLKPLKMLEENLSRNLS 2050 2060 2070 2080 2090 2100 2110 2120 2130 2140 2150 2160 pF1KE2 EIKLLISQARKQAASIKVAVSADRDCIRAYQPQISSTNYNTLTLNVKTQEPDNLLFYLGS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 EIKLLISQARKQAASIKVAVSADRDCIRAYQPQISSTNYNTLTLNVKTQEPDNLLFYLGS 2110 2120 2130 2140 2150 2160 2170 2180 2190 2200 2210 2220 pF1KE2 STASDFLAVEMRRGRVAFLWDLGSGSTRLEFPDFPIDDNRWHSIHVARFGNIGSLSVKEM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 STASDFLAVEMRRGRVAFLWDLGSGSTRLEFPDFPIDDNRWHSIHVARFGNIGSLSVKEM 2170 2180 2190 2200 2210 2220 2230 2240 2250 2260 2270 2280 pF1KE2 SSNQKSPTKTSKSPGTANVLDVNNSTLMFVGGLGGQIKKSPAVKVTHFKGCLGEAFLNGK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 SSNQKSPTKTSKSPGTANVLDVNNSTLMFVGGLGGQIKKSPAVKVTHFKGCLGEAFLNGK 2230 2240 2250 2260 2270 2280 2290 2300 2310 2320 2330 2340 pF1KE2 SIGLWNYIEREGKCRGCFGSSQNEDPSFHFDGSGYSVVEKSLPATVTQIIMLFNTFSPNG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 SIGLWNYIEREGKCRGCFGSSQNEDPSFHFDGSGYSVVEKSLPATVTQIIMLFNTFSPNG 2290 2300 2310 2320 2330 2340 2350 2360 2370 2380 2390 2400 pF1KE2 LLLYLGSYGTKDFLSIELFRGRVKVMTDLGSGPITLLTDRRYNNGTWYKIAFQRNRKQGV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 LLLYLGSYGTKDFLSIELFRGRVKVMTDLGSGPITLLTDRRYNNGTWYKIAFQRNRKQGV 2350 2360 2370 2380 2390 2400 2410 2420 2430 2440 2450 2460 pF1KE2 LAVIDAYNTSNKETKQGETPGASSDLNRLDKDPIYVGGLPRSRVVRRGVTTKSFVGCIKN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 LAVIDAYNTSNKETKQGETPGASSDLNRLDKDPIYVGGLPRSRVVRRGVTTKSFVGCIKN 2410 2420 2430 2440 2450 2460 2470 2480 2490 2500 2510 2520 pF1KE2 LEISRSTFDLLRNSYGVRKGCLLEPIRSVSFLKGGYIELPPKSLSPESEWLVTFATTNSS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 LEISRSTFDLLRNSYGVRKGCLLEPIRSVSFLKGGYIELPPKSLSPESEWLVTFATTNSS 2470 2480 2490 2500 2510 2520 2530 2540 2550 2560 2570 2580 pF1KE2 GIILAALGGDVEKRGDREEAHVPFFSVMLIGGNIEVHVNPGDGTGLRKALLHAPTGTCSD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 GIILAALGGDVEKRGDREEAHVPFFSVMLIGGNIEVHVNPGDGTGLRKALLHAPTGTCSD 2530 2540 2550 2560 2570 2580 2590 2600 2610 2620 2630 2640 pF1KE2 GQAHSISLVRNRRIITVQLDENNPVEMKLGTLVESRTINVSNLYVGGIPEGEGTSLLTMR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 GQAHSISLVRNRRIITVQLDENNPVEMKLGTLVESRTINVSNLYVGGIPEGEGTSLLTMR 2590 2600 2610 2620 2630 2640 2650 2660 2670 2680 2690 2700 pF1KE2 RSFHGCIKNLIFNLELLDFNSAVGHEQVDLDTCWLSERPKLAPDAEDSKLLPEPRAFPEQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 RSFHGCIKNLIFNLELLDFNSAVGHEQVDLDTCWLSERPKLAPDAEDSKLLPEPRAFPEQ 2650 2660 2670 2680 2690 2700 2710 2720 2730 2740 2750 2760 pF1KE2 CVVDAALEYVPGAHQFGLTQNSHFILPFNQSAVRKKLSVELSIRTFASSGLIYYMAHQNQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 CVVDAALEYVPGAHQFGLTQNSHFILPFNQSAVRKKLSVELSIRTFASSGLIYYMAHQNQ 2710 2720 2730 2740 2750 2760 2770 2780 2790 2800 2810 2820 pF1KE2 ADYAVLQLHGGRLHFMFDLGKGRTKVSHPALLSDGKWHTVKTDYVKRKGFITVDGRESPM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 ADYAVLQLHGGRLHFMFDLGKGRTKVSHPALLSDGKWHTVKTDYVKRKGFITVDGRESPM 2770 2780 2790 2800 2810 2820 2830 2840 2850 2860 2870 2880 pF1KE2 VTVVGDGTMLDVEGLFYLGGLPSQYQARKIGNITHSIPACIGDVTVNSKQLDKDSPVSAF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 VTVVGDGTMLDVEGLFYLGGLPSQYQARKIGNITHSIPACIGDVTVNSKQLDKDSPVSAF 2830 2840 2850 2860 2870 2880 2890 2900 2910 2920 2930 2940 pF1KE2 TVNRCYAVAQEGTYFDGSGYAALVKEGYKVQSDVNITLEFRTSSQNGVLLGISTAKVDAI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 TVNRCYAVAQEGTYFDGSGYAALVKEGYKVQSDVNITLEFRTSSQNGVLLGISTAKVDAI 2890 2900 2910 2920 2930 2940 2950 2960 2970 2980 2990 3000 pF1KE2 GLELVDGKVLFHVNNGAGRITAAYEPKTATVLCDGKWHTLQANKSKHRITLIVDGNAVGA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 GLELVDGKVLFHVNNGAGRITAAYEPKTATVLCDGKWHTLQANKSKHRITLIVDGNAVGA 2950 2960 2970 2980 2990 3000 3010 3020 3030 3040 3050 3060 pF1KE2 ESPHTQSTSVDTNNPIYVGGYPAGVKQKCLRSQTSFRGCLRKLALIKSPQVQSFDFSRAF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 ESPHTQSTSVDTNNPIYVGGYPAGVKQKCLRSQTSFRGCLRKLALIKSPQVQSFDFSRAF 3010 3020 3030 3040 3050 3060 3070 pF1KE2 ELHGVFLHSCPGTES ::::::::::::::: CCDS32 ELHGVFLHSCPGTES 3070 >>CCDS5138.1 LAMA2 gene_id:3908|Hs108|chr6 (3122 aa) initn: 6677 init1: 2247 opt: 7174 Z-score: 4138.6 bits: 780.6 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 9928; 46.0% identity (72.1% similar) in 3132 aa overlap (4-3071:6-3120) 10 20 30 40 pF1KE2 MRGGVLLVLLLC-----VAAQ----------CRQRGLFPAILNLASNAHISTNATCGE ::::.::: : :: .:::::::.::::::: :.::::::: CCDS51 MPGAAGVLLLLLLSGGLGGVQAQRPQQQRQSQAHQQRGLFPAVLNLASNALITTNATCGE 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KE2 KGPEMFCKLVEHVPGRPVRNPQCRICDGNSANPRERHPISHAIDGTNNWWQSPSIQNGRE :::::.:::::::::.::::::::::. ::.:: .::::..:::: :.:::::::.:: : CCDS51 KGPEMYCKLVEHVPGQPVRNPQCRICNQNSSNPNQRHPITNAIDGKNTWWQSPSIKNGIE 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 YHWVTITLDLRQVFQVAYVIIKAANAPRPGNWILERSLDGTTFSPWQYYAVSDSECLSRY ::.:::::::.::::.::::.::::.::::::::::::: . ..::::.::.:.:::. : CCDS51 YHYVTITLDLQQVFQIAYVIVKAANSPRPGNWILERSLDDVEYKPWQYHAVTDTECLTLY 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 NITPRRGPPTYRADDEVICTSYYSRLVPLEHGEIHTSLINGRPSADDLSPKLLEFTSARY :: :: :::.: ::::::::.::.. :::.:::: ::::::::::: ::.::::::::: CCDS51 NIYPRTGPPSYAKDDEVICTSFYSKIHPLENGEIHISLINGRPSADDPSPELLEFTSARY 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 IRLRLQRIRTLNADLMTLSHREPKELDPIVTRRYYYSIKDISVGGMCICYGHASSCPWDE ::::.::::::::::: ..:..:.:.:::::::::::.::::::::::::::: .:: : CCDS51 IRLRFQRIRTLNADLMMFAHKDPREIDPIVTRRYYYSVKDISVGGMCICYGHARACPLDP 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KE2 TTKKLQCQCEHNTCGESCNRCCPGYHQQPWRPGTVSSGNTCEACNCHNKAKDCYYDESVA .:.: .:.:::::::.::..::::.::.::: :: . . :::::::.::..:::::.:: CCDS51 ATNKSRCECEHNTCGDSCDQCCPGFHQKPWRAGTFLTKTECEACNCHGKAEECYYDENVA 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KE2 KQKKSLNTAGQFRGGGVCINCLQNTMGINCETCIDGYYRPHKVSPYEDEPCRPCNCDPVG ... ::: :.. :::::::: ::: ::::::: ::..::. ::: .::.::.:::.: CCDS51 RRNLSLNIRGKYIGGGVCINCTQNTAGINCETCTDGFFRPKGVSPNYPRPCQPCHCDPIG 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 SLSSVCIKDDLHSDLHNGKQPGQCPCKEGYTGEKCDRCQLGYKDYPTCVSCGCNPVGSAS ::. ::.::. :. . : ::.: :: :. : .:::: :: :: : .:.:. .:: . CCDS51 SLNEVCVKDEKHA--RRGLAPGSCHCKTGFGGVSCDRCARGYTGYPDCKACNCSGLGSKN 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 pF1KE2 DEPCTGPCVCKENVEGKACDRCKPGFYNLKEKNPRGCSECFCFGVSDVCSSLSWPVGQVN ..:: :::.::::::: :.::: ::.::.: : .::.:::: :::. :.: : :... CCDS51 EDPCFGPCICKENVEGGDCSRCKSGFFNLQEDNWKGCDECFCSGVSNRCQSSYWTYGKIQ 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 580 pF1KE2 SMSGWLVTDLISPRKIPSQQDALGGRHQVSINNTAVMQRLAPKYYWAAPEAYLGNKLTAF .:::: .::: . .. ::: : . .:.::.:. . : : .:::.:: :::::: : CCDS51 DMSGWYLTDLPGRIRVAPQQDDLDSPQQISISNAEARQALPHSYYWSAPAPYLGNKLPAV 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 pF1KE2 GGFLKYTVSYDIPVETVDSNLMSHADVIIKGNGLTLSTQAEGLSLQPYEEYLNVVRLVPE :: : .:.:::. : :.. . . .:..:: :..:: . . :.: ::. ::. : : CCDS51 GGQLTFTISYDLEEEEEDTERVLQLMIILEGNDLSISTAQDEVYLHPSEEHTNVLLLKEE 600 610 620 630 640 650 650 660 670 680 690 700 pF1KE2 NFQDFHSKRQIDRDQLMTVLANVTHLLIRANYNSAKMALYRLESVSLDIASSNAIDLVVA .: .. . : ..::::::. ..:.. .:. . :..:: ::.:. : : : .: CCDS51 SFTIHGTHFPVRRKEFMTVLANLKRVLLQITYSFGMDAIFRLSSVNLESAVSYPTDGSIA 660 670 680 690 700 710 710 720 730 740 750 760 pF1KE2 ADVEHCECPQGYTGTSCESCLSGYYRVDGILFGGICQPCECHGHAAECN-VHGVCIACAH : :: :.:: ::::.::::: . ::.: .:::::.::.: ::: :. : : :. : CCDS51 AAVEVCQCPPGYTGSSCESCWPRHRRVNGTIFGGICEPCQCFGHAESCDDVTGECLNCKD 720 730 740 750 760 770 770 780 790 800 810 820 pF1KE2 NTTGVHCEQCLPGFYGEPSRGTPGDCQPCACPLTIASNNFSPTCHLNDGDEVVCDWCAPG .: : .:..:::::::::..:: :::::::::.: ::::::::::. . ..:: : : CCDS51 HTGGPYCDKCLPGFYGEPTKGTSEDCQPCACPLNIPSNNFSPTCHLDRSLGLICDGCPVG 780 790 800 810 820 830 830 840 850 860 870 880 pF1KE2 YSGAWCERCADGYYGNPTVPGESCVPCDCSGNVDPSEAGHCDSVTGECLKCLGNTDGAHC :.: :::::.::.:.:.::: :: ::.:. :.: : : :::..: :: : .: : .: CCDS51 YTGPRCERCAEGYFGQPSVPGGSCQPCQCNDNLDFSIPGSCDSLSGSCLICKPGTTGRYC 840 850 860 870 880 890 890 900 910 920 930 940 pF1KE2 ERCADGFYGDAVTAKNCRACECHVKGSHSAVCHLETGLCDCKPNVTGQQCDQCLHGYYGL : ::::..:::: ::::. :.:.. :: : ::: .:: :.:. :: ::.::.: : .:: CCDS51 ELCADGYFGDAVDAKNCQPCRCNAGGSFSEVCHSQTGQCECRANVQGQRCDKCKAGTFGL 900 910 920 930 940 950 950 960 970 980 990 1000 pF1KE2 DSGHGCRPCNCSVAGSVSDGCTDEGQCHCVPGVAGKRCDRCAHGFYAYQDGSCTPCDCPH .:..:: ::::. :: : : . ::: : :::.::.:::::::.. .:.:.:: :.: : CCDS51 QSARGCVPCNCNSFGSKSFDCEESGQCWCQPGVTGKKCDRCAHGYFNFQEGGCTACECSH 960 970 980 990 1000 1010 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KE2 TQNTCDPETGECVCPPHTQGVKCEECEDGHWGYDAEVGCQACNCSLVGSTHHRCDVVTGH :.:::.::.:.:::.: : :: .: . ::.. .::.::::: ::: .:.: ::. CCDS51 LGNNCDPKTGRCICPPNTIGEKCSKCAPNTWGHSITTGCKACNCSTVGSLDFQCNVNTGQ 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KE2 CQCKSKFGGRACDQCSLGYRDFPDCVPCDCDLRGTSGDACNLEQGLCGCVEETGACPCKE :.:. ::.: : .:: :. ..: : ::: : ::.. .:. : :.: ..:: : :: CCDS51 CNCHPKFSGAKCTECSRGHWNYPRCNLCDCFLPGTDATTCDSETKKCSCSDQTGQCTCKV 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KE2 NVFGPQCNECREGTFALRADNPLGCSPCFCSGLSHLCSELEDYVRTPVTLGSDQPLLRVV :: : .:..:: : :.: : :::::: :.: : . ::: . .:: ::: ..: .: .: CCDS51 NVEGIHCDRCRPGKFGLDAKNPLGCSSCYCFGTTTQCSEAKGLIRTWVTLKAEQTILPLV 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KE2 SQSNLRGTTEGVYYQAPDFLLDAATVRQHIRAEPFYWRLPQQFQGDQLMAYGGKLKYSVA ... . ::.:. .: :... .:. .. :::::.::.::.: .::::::::::.. CCDS51 DEALQHTTTKGIVFQHPEIVAHMDLMREDLHLEPFYWKLPEQFEGKKLMAYGGKLKYAIY 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KE2 FYSLDGVGTSNFEPQVLIKGGR-IRKQVIYMDAPAPENGVRQEQEVAMRENFWKYF--NS : . . .: :...:::.:.:: . ..: :: : ..:. : :. :::. . CCDS51 FEAREETGFSTYNPQVIIRGGTPTHARIIVRHMAAPLIGQLTRHEIEMTEKEWKYYGDDP 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1300 1310 1320 1330 1340 1350 pF1KE2 VSEKPVTREDFMSVLSDIEYILIKASYGQGLQQSRISDISMEV---GRKAEKLHPEEEVA .. ::::::...: ::.::::::.::. ..:::::.::::: :: . : : CCDS51 RVHRTVTREDFLDILYDIHYILIKATYGNFMRQSRISEISMEVAEQGRGTTMTPP----A 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1360 1370 1380 1390 1400 1410 pF1KE2 SLLENCVCPPGTVGFSCQDCAPGYHRGKLPAGSDRGPRPLVAPCVPCSCNNHSDTCDPNT .:.:.: :: : :.::. : ::..: . :. : : : .. ::::.::.::. :::.: CCDS51 DLIEKCDCPLGYSGLSCEACLPGFYRLRSQPGG-RTPGPTLGTCVPCQCNGHSSLCDPET 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1420 1430 1440 1450 1460 1470 pF1KE2 GKCLNCGDNTAGDHCDVCTSGYYGKVTGSASDCALCACPH-SPPASFSPTCVLEGDHDFR . : :: .:::: :. :. :::: : : .:: :::: : .:::.:: :: :.: CCDS51 SICQNCQHHTAGDFCERCALGYYGIVKGLPNDCQQCACPLISSSNNFSPSCVAEGLDDYR 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1480 1490 1500 1510 1520 1530 pF1KE2 CDACLLGYEGKHCERCSSSYYGNPQTPGGSCQKCDCNPHGSVHGDCDRTSGQCVCRLGAS : :: ::::..::::. .: :.: .::::::.:.:.:.::. :: ..: :.:: ::. CCDS51 CTACPRGYEGQYCERCAPGYTGSPGNPGGSCQECECDPYGSLPVPCDPVTGFCTCRPGAT 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1540 1550 1560 1570 1580 1590 pF1KE2 GLRCDECEPRHILMETDCVSCDDECVGVLLNDLDEIGDAVLSLNLTGIIPVPYGILSNLE : .:: :. : .:: : :::.:.::.:: .. . :.:.:::: .:.:: .: .:: CCDS51 GRKCDGCKHWHAREGWECVFCGDECTGLLLGDLARLEQMVMSINLTGPLPAPYKMLYGLE 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1600 1610 1620 1630 1640 1650 pF1KE2 NTTKYLQESLLKENMQKDLGKI---KLEGVAEETDNLQKKLTRMLASTQKVNRATERIFK : :. :.. : . . : .. .:. .. : ..: . :.. :. ..... .:: CCDS51 NMTQELKHLLSPQRAPERLIQLAEGNLNTLVTEMNELLTRATKVTADGEQTGQDAERTNT 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1660 1670 1680 1690 1700 1710 pF1KE2 ESQDLAIAIERLQMSITEIMEKTT-LNQTL-VEDFLLPNSTLQNMQQNGTSLLEIMQIRD ....:. :..: . . ::. ::.:: ..: . . .:...:.. .... .. .. CCDS51 RAKSLGEFIKELARDAEAVNEKAIKLNETLGTRDEAF-ERNLEGLQKEIDQMIKELRRKN 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1720 1730 1740 1750 1760 1770 pF1KE2 FTQLHQNATLELKAAEDLLSQIQENYQKPLEELEVLKEAASHVLSKHNNELKAAEALVRE . .. : :: ::: ::..... . . : : ... . :. ..:.. : :.:: CCDS51 LETQKEIAEDELVAAEALLKKVKKLFGESRGENEEMEKDLREKLADYKNKVDDAWDLLRE 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1780 1790 1800 1810 1820 1830 pF1KE2 AEAKMQESNHLLLMVNANLREFSDKKLHVQEEQNLTSELIVQGRGLIDAAAAQTDAVQDA : :..:.:.:. . . :. . :: :. . . . .: ..: : .: ... CCDS51 ATDKIREANRLFAVNQKNMTALEKKKEAVESGKRQIENTLKEGNDILDEANRLADEINSI 1800 1810 1820 1830 1840 1850 1840 1850 1860 1870 1880 1890 pF1KE2 LEHLEDHQDKLLLWSAKIRHHIDDLVMHMSQRNAVDLVYRAEDHAAEFQRLADVLYSGLE ....:: : :: : .. .:::: .....:. .. : .::.:::... . :: . :. CCDS51 IDYVEDIQTKLPPMSEELNDKIDDLSQEIKDRKLAEKVSQAESHAAQLNDSSAVLDGILD 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1900 1910 1920 1930 1940 pF1KE2 NIRNVSLNATSAAYVHYNIQSLIEESEELARDAHRTVTETSLLSES----LVSNGKAAVQ . .:.:.:::.: .. ::.. :.:.:..:..:. . :.. :. . : ..:. .: CCDS51 EAKNISFNATAAFKAYSNIKDYIDEAEKVAKEAKDLAHEATKLATGPRGLLKEDAKGCLQ 1920 1930 1940 1950 1960 1970 1950 1960 1970 1980 1990 2000 pF1KE2 RSSRFLKEGNNLSRKLPGIALELSELRNKTNRFQENAVEITRQTNESLLILRAIPEGIRD .: :.:.:...:. . .:. :... . . .. : :..: : :::. CCDS51 KSFRILNEAKKLANDVKENEDHLNGLKTRIENADARNGDLLRTLNDTLGKLSAIPNDTAA 1980 1990 2000 2010 2020 2030 2010 2020 2030 2040 2050 2060 pF1KE2 KGAKTKELATSASQSAVSTLRDVAGLSQELLNTSASLSRVNTTLRETHQLLQDSTMATLL : .:. : .:...: ..: ... : :.: . . . ... .. .:. ...: . .. CCDS51 KLQAVKDKARQANDTAKDVLAQITELHQNLDGLKKNYNKLADSVAKTNAVVKDPSKNKII 2040 2050 2060 2070 2080 2090 2070 2080 2090 2100 2110 2120 pF1KE2 AGRK--VKDVEIQANLLFDRLKPLKMLEENLSRNLSEIKLLISQARKQAASIKVAVSADR : ::..: .:. :.:.:::.: ::.::..:.:::: ::.:::::: ::::.::. CCDS51 ADADATVKNLEQEADRLIDKLKPIKELEDNLKKNISEIKELINQARKQANSIKVSVSSGG 2100 2110 2120 2130 2140 2150 2130 2140 2150 2160 2170 2180 pF1KE2 DCIRAYQPQISSTNYNTLTLNVKTQEPDNLLFYLGSSTASDFLAVEMRRGRVAFLWDLGS ::::.:.:.:.. .::....:::: :::::::::. ::::.:::.:.:.::::.:: CCDS51 DCIRTYKPEIKKGSYNNIVVNVKTAVADNLLFYLGSAKFIDFLAIEMRKGKVSFLWDVGS 2160 2170 2180 2190 2200 2210 2190 2200 2210 2220 2230 2240 pF1KE2 GSTRLEFPDFPIDDNRWHSIHVARFGNIGSLSVKEMSSNQKS--P-TKTSKSPGTANVLD : :.:.::. :::. :. : ..: : :..::. ... . : : :. : :: ..:: CCDS51 GVGRVEYPDLTIDDSYWYRIVASRTGRNGTISVRALDGPKASIVPSTHHSTSPPGYTILD 2220 2230 2240 2250 2260 2270 2250 2260 2270 2280 2290 2300 pF1KE2 VNNSTLMFVGGLGGQIKKSPAVKVTHFKGCLGEAFLNGKSIGLWNYIEREGKCRGCFGSS :. ....::::: :..::. ::.: : ::.::.....: :::::. :.:: :.:: : CCDS51 VDANAMLFVGGLTGKLKKADAVRVITFTGCMGETYFDNKPIGLWNFREKEGDCKGCTVSP 2280 2290 2300 2310 2320 2330 2310 2320 2330 2340 2350 pF1KE2 QNEDP--SFHFDGSGYSVVEKSL---PATVTQIIMLFNTFSPNGLLLYLGSYGTKDFLSI : :: ...::: ::..: . . : ... ... : ::: ..::.::.. .::.:. CCDS51 QVEDSEGTIQFDGEGYALVSRPIRWYP-NISTVMFKFRTFSSSALLMYLATRDLRDFMSV 2340 2350 2360 2370 2380 2390 2360 2370 2380 2390 2400 2410 pF1KE2 ELFRGRVKVMTDLGSGPITLLTDRRYNNGTWYKIAFQRNRKQGVLAVIDAYNTSNKETKQ :: :..:: ::::: ...... .:.: : .....: .::. ....: .:...:. CCDS51 ELTDGHIKVSYDLGSGMASVVSNQNHNDGKWKSFTLSRIQKQANISIVDI-DTNQEENIA 2400 2410 2420 2430 2440 2450 2420 2430 2440 2450 2460 2470 pF1KE2 GETPGASSDLNRLDKDPIYVGGLPRSRVV----RRGVTTKSFVGCIKNLEISRSTFDLLR . : . :. : :: :::: : . : :. :.. ::.:..::::. ...: CCDS51 TSSSGNNFGLDLKADDKIYFGGLPTLRNLSMKARPEVNLKKYSGCLKDIEISRTPYNILS 2460 2470 2480 2490 2500 2510 2480 2490 2500 2510 2520 2530 pF1KE2 NS--YGVRKGCLLEPIRSVSFLKGGYIELPPKSLSPESEWLVTFATTNSSGIILAALGGD . :: ::: :: . .::: : :..:: : .. .: ..:.: : ::::: . :: CCDS51 SPDYVGVTKGCSLENVYTVSFPKPGFVELSPVPIDVGTEINLSFSTKNESGIILLGSGGT 2520 2530 2540 2550 2560 2570 2540 2550 2560 2570 2580 pF1KE2 -VEKRGDREEAHVPFFSVMLIGGNIEVHVNPGDGTGLRKALLHAPTGTCSDGQAHSISLV . : :... .....: : .:::.. : : .:: ... . ::. ::. . CCDS51 PAPPRRKRRQTGQAYYAILLNRGRLEVHLSTGART-MRKIVIRPEPNLFHDGREHSVHVE 2580 2590 2600 2610 2620 2590 2600 2610 2620 2630 2640 pF1KE2 RNRRIITVQLDENNPVEMKLGTLVESRTINVSNLYVGGIPEGEGTSLLTMRRSFHGCIKN :.: :.:::.::: ..: :: . :.:..:.::: : : : :.::: : CCDS51 RTRGIFTVQVDENRRYMQNL--TVE-QPIEVKKLFVGGAPPEFQPSPLRNIPPFEGCIWN 2630 2640 2650 2660 2670 2680 2650 2660 2670 2680 2690 2700 pF1KE2 LIFNLELLDFNSAVGHEQVDLDTCW---LSERPKLAPDAEDSKLLPEPR---AFPEQ--- :..: .:: :. ...:. : : : : :: . ::: ::: CCDS51 LVINSVPMDFARPVSFKNADIGRCAHQKLREDEDGAAPAE-IVIQPEPVPTPAFPTPTPV 2690 2700 2710 2720 2730 2740 2710 2720 2730 2740 2750 pF1KE2 -----CVVDAALEYVPGAHQFGLTQNSHFILPFNQSAVRKKLSVELSIRTFASSGLIYYM :.... . :..::::..:::. . :... :...:..:: .:: : :::..:: CCDS51 LTHGPCAAESEPALLIGSKQFGLSRNSHIAIAFDDTKVKNRLTIELEVRTEAESGLLFYM 2750 2760 2770 2780 2790 2800 2760 2770 2780 2790 2800 2810 pF1KE2 AHQNQADYAVLQLHGGRLHFMFDLGKGRTKVSHPALLSDGKWHTVKTDYVKRKGFITVDG :. :.::.:..::..: .: .:::.: :.. :. ..::.:: .: :..:.. ::: CCDS51 ARINHADFATVQLRNGLPYFSYDLGSGDTHTMIPTKINDGQWHKIKIMRSKQEGILYVDG 2810 2820 2830 2840 2850 2860 2820 2830 2840 2850 2860 2870 pF1KE2 RESPMVTVVGDGTMLDVEGLFYLGGLPSQYQARKIGNITHSIPACIGDVTVNSKQLDKDS . .. . .::: :..:.:::: .: .:.:: .:.:: .:. .. . : .. CCDS51 ASNRTISP-KKADILDVVGMLYVGGLPINYTTRRIGPVTYSIDGCVRNLHMAEAPADLEQ 2870 2880 2890 2900 2910 2920 2880 2890 2900 2910 2920 2930 pF1KE2 PVSAFTVNRCYAVAQEGTYFDGSGYAALVKEGYKVQSDVNITLEFRTSSQNGVLLGISTA :.:.: :. :.: ::.::::::.:.: : :.:: :. . .::::.. .:::::::. CCDS51 PTSSFHVGTCFANAQRGTYFDGTGFAKAVG-GFKVGLDLLVEFEFRTTTTTGVLLGISSQ 2930 2940 2950 2960 2970 2980 2940 2950 2960 2970 2980 2990 pF1KE2 KVDAIGLELVDGKVLFHVNNGAGRITAAYEPKTATVLCDGKWHTLQANKSKHRITLIVDG :.:..:.:..: :..:::.:::::.::.:. . ::::.:: . ::: :::: : ::: CCDS51 KMDGMGIEMIDEKLMFHVDNGAGRFTAVYDAGVPGHLCDGQWHKVTANKIKHRIELTVDG 2990 3000 3010 3020 3030 3040 3000 3010 3020 3030 3040 3050 pF1KE2 NAVGAESPHTQSTSVDTNNPIYVGGYPAGVKQKCLRSQTSFRGCLRKLALIK-SPQVQSF : : :.::. :::.:::.:..:::.: .:: : .. ::::.:.: : : . . CCDS51 NQVEAQSPNPASTSADTNDPVFVGGFPDDLKQFGLTTSIPFRGCIRSLKLTKGTGKPLEV 3050 3060 3070 3080 3090 3100 3060 3070 pF1KE2 DFSRAFELHGVFLHSCPGTES .:..:.::.:: ::: CCDS51 NFAKALELRGVQPVSCPAN 3110 3120 >>CCDS45838.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18 (3277 aa) initn: 2237 init1: 731 opt: 1460 Z-score: 855.2 bits: 173.1 E(32554): 2.6e-41 Smith-Waterman score: 3478; 27.6% identity (53.1% similar) in 3335 aa overlap (5-2924:25-3134) 10 20 30 pF1KE2 MRGGVLLVLLLCVAAQCRQRG------LFPAILNLASNAH :: :: : .: :. : : :. .::: :. CCDS45 MAAAARPRGRALGPVLPPTPLLLLVLRVLPAC-GATARDPGAAAGLSLHPTYFNLAEAAR 10 20 30 40 50 40 50 60 70 80 pF1KE2 ISTNATCGEKGP-------EMFCKLV--EHVPG--RPVRNPQCRICDGNSANPRERHPIS : ..:::::.:: :..:::: .:: . ... : : :: .::. ::.. CCDS45 IWATATCGERGPGEGRPQPELYCKLVGGPTAPGSGHTIQGQFCDYC--NSEDPRKAHPVT 60 70 80 90 100 110 90 100 110 120 130 140 pF1KE2 HAIDGTNNWWQSPSIQNGREYHWVTITLDLRQVFQVAYVIIKAANAPRPGNWILERSLD- .::::.. ::::: ...: .:. :..:::: :.:.:::..:: ::.::: :.::::.: CCDS45 NAIDGSERWWQSPPLSSGTQYNRVNLTLDLGQLFHVAYILIKFANSPRPDLWVLERSVDF 120 130 140 150 160 170 150 160 170 180 190 200 pF1KE2 GTTFSPWQYYAVSDSECLSRYNITPRRGPPTYRADDEVICTSYYSRLVPLEHGEIHTSLI :.:.:::::.: : .::.... :.. . ::.:.:.. :::.::::.::. .::: CCDS45 GSTYSPWQYFAHSKVDCLKEFG---REANMAVTRDDDVLCVTEYSRIVPLENGEVVVSLI 180 190 200 210 220 230 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 NGRPSADDL--SPKLLEFTSARYIRLRLQRIRTLNADLMTLSHREPKELDPIVTRRYYYS ::::.: .. : : :::.: ::::. : :: . :.. ..: :: :::::::: CCDS45 NGRPGAKNFTFSHTLREFTKATNIRLRFLRTNTLLGHLISKAQR-----DPTVTRRYYYS 240 250 260 270 280 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 IKDISVGGMCICYGHASSCPWDETTKKLQCQCEHNTCGESCNRCCPGYHQQPWRPGTVSS :::::.::.:.: ::: : .. : ..:.:.:.::::.:.::: ::.:. :::.. . CCDS45 IKDISIGGQCVCNGHAEVCNINNPEKLFRCECQHHTCGETCDRCCTGYNQRRWRPAAWEQ 290 300 310 320 330 340 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 GNTCEACNCHNKAKDCYYDESVAKQKKSLNTAGQFRGGGVCINCLQNTMGINCETCIDGY .. :::::::..:..:::: .: .:. :::: : . :::::::: .:: :.::: : :: CCDS45 SHECEACNCHGHASNCYYDPDVERQQASLNTQGIYAGGGVCINCQHNTAGVNCEQCAKGY 350 360 370 380 390 400 390 400 410 420 pF1KE2 YRPHKVSPYEDEPCRPCNCDPV-------GSLSSVCIKDDLHSD--------LHN----- :::. : . : ::.::: :: : : ..:.: .: CCDS45 YRPYGVPVDAPDGCIPCSCDPEHADGCEQGSGRCHC-KPNFHGDNCEKCAIGYYNFPFCL 410 420 430 440 450 460 430 440 pF1KE2 ----------------------------GKQP------GQCPCKEGYTGEKCDRCQLGYK : : :.: :. : : .:: :. :. CCDS45 RIPIFPVSTPSSEDPVAGDIKGCDCNLEGVLPEICDAHGRCLCRPGVEGPRCDTCRSGFY 470 480 490 500 510 520 450 460 470 pF1KE2 DYPTCVSCGCNPVGS-----------------------------ASDEP-CTG------P ..: : .: :. .:: : : : : : : CCDS45 SFPICQACWCSALGSYQMPCSSVTGQCECRPGVTGQRCDRCLSGAYDFPHCQGSSSACDP 530 540 550 560 570 580 480 490 500 pF1KE2 ----------CVCKENVEGKACDRCKPGFYNLKEKNPRGCSECFCF-------------- : :: .::: .:.::: ..:: ..:: ::::: : CCDS45 AGTINSNLGYCQCKLHVEGPTCSRCKLLYWNLDKENPSGCSECKCHKAGTVSGTGECRQG 590 600 610 620 630 640 510 520 530 540 pF1KE2 -----------GVS-DVCSSLSWPVGQVN---------SMSGWLVTDLISPRKI-PSQQD : : :.: . . . . : ...: : . .: . .. CCDS45 DGDCHCKSHVGGDSCDTCEDGYFALEKSNYFGCQGCQCDIGGALSSMCSGPSGVCQCREH 650 660 670 680 690 700 550 560 570 pF1KE2 ALGGRHQVSINNTAV-----MQR-------------------LA-PKYYWA--APEAYLG ..: : :: :. :: :.. : : . . CCDS45 VVGKVCQRPENNYYFPDLHHMKYEIEDGSTPNGRDLRFGFDPLAFPEFSWRGYAQMTSVQ 710 720 730 740 750 760 580 590 600 610 pF1KE2 N--KLT-----AFGGFLKYTVSYDIP-VETVDSNLMSH-------------------ADV : ..: . :.... . : : .:.:.... . : : CCDS45 NDVRITLNVGKSSGSLFRVILRYVNPGTEAVSGHITIYPSWGAAQSKEIIFLPSKEPAFV 770 780 790 800 810 820 620 630 640 pF1KE2 IIKGNGLT-----------LSTQAEG-----LSLQPYEEYLNVVRLVP------------ . :::.. .::: : : : . : : .: CCDS45 TVPGNGFADPFSITPGIWVACIKAEGVLLDYLVLLPRDYYEASVLQLPVTEPCAYAGPPQ 830 840 850 860 870 880 650 660 pF1KE2 EN---FQDF--------------H----------SKRQ--------ID---RD---QLMT :: .: . : . :: .: :. .: CCDS45 ENCLLYQHLPVTRFPCTLACEARHFLLDGEPRPVAVRQPTPAHPVMVDLSGREVELHLRL 890 900 910 920 930 940 670 680 690 700 710 720 pF1KE2 VLANVTHLLIRANYNSAKMALYRLESVSLDIASSNAIDLVVAADVEHCECPQGYTGTSCE . .: : .. ..:.. :. :.... ::.. :.:..:. : .:. . :. CCDS45 RIPQVGHYVVVVEYSTEAAQLF---VVDVNVKSSGS---VLAGQVNIYSC--NYS-VLCR 950 960 970 980 990 730 740 750 760 770 pF1KE2 SCLSGYYRVDGILFGGICQPCECHGHAAECNVHGVCIACAHNTTG------VHCEQCLPG : . .. .. . .:: :. .: ::: .. .. ::: CCDS45 SAVIDHMSRIAMYELLADADIQLKGHMARFLLHQVCIIPIEEFSAEYVRPQVHCIASYGR 1000 1010 1020 1030 1040 1050 780 790 800 810 820 830 pF1KE2 FYGEPSR--GTPGDCQPCACPLTIASNNFSPTCHLNDGDEVVCDWCAPGYSGAWCERCAD : .. . . . : : : . :. : :: . . : :: . . . CCDS45 FVNQSATCVSLAHETPPTALILDVLSG--RPFPHLPQQSSPSVD-VLPGVTLKAPQNQVT 1060 1070 1080 1090 1100 1110 840 850 860 pF1KE2 --------GYY---------GNPTVPGESCVPCD--CSGNVDPSEAGH---C-DSVT--G : : ..:: :.. : .:. : : : :.: : CCDS45 LRGRVPHLGRYVFVIHFYQAAHPTFPAQVSVDGGWPRAGSFHASFCPHVLGCRDQVIAEG 1120 1130 1140 1150 1160 1170 870 880 890 900 910 pF1KE2 ECLKCLGNTDGAHCERCADG-----FYGDAVTAKNCRACECHVKGSHSAV-----CHLET . ... . : . .: .: :.: : :. ... : .. CCDS45 QIEFDISEPEVAATVKVPEGKSLVLVRVLVVPAENYDYQILHKKSMDKSLEFITNCGKNS 1180 1190 1200 1210 1220 1230 920 930 940 950 960 970 pF1KE2 GLCDCKPNVTGQQCDQCLHGYYGLDSGHGCRPCNCSVAGSVSDGCTDEG-QCHCVPGVAG : :..... : . .. .. .: ::.: .:... :. :: :: : :.: : CCDS45 FYLD--PQTASRFCKNSARSLVAF-YHKGALPCECHPTGATGPHCSPEGGQCPCQPNVIG 1240 1250 1260 1270 1280 1290 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KE2 KRCDRCAHGFYAYQDGSCTPCDCPHTQNTCDPETGECVCPPHTQGVKCEECEDGHWGYDA ..: ::: : :.. : ::.: . :. ::.: :::.: .:: :: ... CCDS45 RQCTRCATGHYGFP--RCKPCSCG--RRLCEEMTGQCRCPPRTVRPQCEVCETHSFSFHP 1300 1310 1320 1330 1340 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KE2 EVGCQACNCSLVGSTHH---RCDVVTGHCQCKSKFGGRACDQCSLGYRDFPDCVPCDCDL .::..:::: :. . .:: .:.:.:: .. :: ::.:. :. ::.::::.:. CCDS45 MAGCEGCNCSRRGTIEAAMPECDRDSGQCRCKPRITGRQCDRCASGFYRFPECVPCNCNR 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KE2 RGTSGDACNLEQGLCGCVEETGACPCKENVFGPQCNECREGTFALRADNPLGCSPCFCSG :: : :.: :::: ::::: : .:: ::::.: : : ::. ::: : CCDS45 DGT-------EPGVCD--PGTGACLCKENVEGTECNVCREGSFHLDPANLKGCTSCFCFG 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KE2 LSHLC-SELEDYVRTPVTLGSDQPLLRVVSQSNLRGT-TEGVYYQAPDFLLDAATVRQHI ... : : . .. :: :..... .. . . : .. :. ::. : CCDS45 VNNQCHSSHKRRTKFVDMLGWH---LETADRVDIPVSFNPGSNSMVADLQELPATI--HS 1470 1480 1490 1500 1510 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KE2 RAEPFYWRLPQQFQGDQLMAYGGKLKYSVAFYSLDG-VGTSNFEPQVLIKGGRIRKQVIY . : : .. ::.. .::: : :.. ..: : . . .:.: . : .. ..:: CCDS45 AS----WVAPTSYLGDKVSSYGGYLTYQAKSFGLPGDMVLLEKKPDVQLTGQHM--SIIY 1520 1530 1540 1550 1560 1280 1290 1300 1310 1320 1330 pF1KE2 MDAPAPENGVRQEQEVAMRENFWKYFNSVSEKPVTREDFMSVLSDIEYILIKASYGQGLQ .. .:. .. .: . :. ... . :. ::.::..:.::: . . :.. : : CCDS45 EETNTPRPDRLHHGRVHVVEGNFRH--ASSRAPVSREELMTVLSRLADVRIQGLYFTETQ 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1340 1350 1360 1370 1380 1390 pF1KE2 QSRISDISMEVGRKAEKLHPEEEVASLLENCVCPPGTVGFSCQDCAPGYHRGKLPAGSDR . .:....: . . ..: .: :.:::. .: ::: :.:::.: . . : CCDS45 RLTLSEVGLEEASDT----GSGRIALAVEICACPPAYAGDSCQGCSPGYYRDHKGLYTGR 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1400 1410 1420 1430 1440 1450 pF1KE2 GPRPLVAPCVPCSCNNHSDTCDPNTGKCLNCGDNTAGDHCDVCTSGYYGK-VTGSASDCA ::::.::.::. :. ..: :.:: ::::.::. : ::::. : :: : CCDS45 --------CVPCNCNGHSNQCQDGSGICVNCQHNTAGEHCERCQEGYYGNAVHGS---CR 1690 1700 1710 1720 1730 1460 1470 1480 1490 1500 1510 pF1KE2 LCACPHSPPASFSPTCVLEGDHDFRCDACLLGYEGKHCERCSSSYYGNPQTPGGSCQKCD : :::. ::. ::..: : :: .: :: : .::::. .:.:::: ::::: :. CCDS45 ACPCPHT--NSFATGCVVNGG-DVRC-SCKAGYTGTQCERCAPGYFGNPQKFGGSCQPCS 1740 1750 1760 1770 1780 1520 1530 1540 1550 1560 1570 pF1KE2 CNPHGSVHGDCDRTSGQCVCRLGASGLRCDECEPRHILMETDCVSCDDECVGVLLNDLDE :: .:.. :.: .:.:. . ::. .: .::. :: .::::: CCDS45 CNSNGQL-GSCHPLTGDCINQ-----------EPKDSSPAEECDDCDS-CVMTLLNDLAT 1790 1800 1810 1820 1830 1580 1590 1600 1610 1620 pF1KE2 IGDAV--LSLNLTGIIPVPYGILS---NLENTTKYLQESLLKENMQKDLGKIKLEGVAEE .:. . .. .: :. . :.: ..:. .: :...::. . :.::. .: CCDS45 MGEQLRLVKSQLQGL-SASAGLLEQMRHMETQAKDLRNQLLNYRSAISNHGSKIEGLERE 1840 1850 1860 1870 1880 1890 1630 1640 1650 1660 1670 1680 pF1KE2 TDNLQKKLTRMLASTQKVNRATERIFKESQDLAIAIERLQMSITEIMEKTTLNQTLVEDF .:.... . ..: :: ...: : ..: .: :. : CCDS45 LTDLNQEFETLQEKAQ-VNS------RKAQTLNNNVNRATQSAKEL------------DV 1900 1910 1920 1930 1690 1700 1710 1720 1730 1740 pF1KE2 LLPNSTLQNMQQNGTSLLEIMQIRDFTQLHQNATLELKAAEDLLSQIQENYQKPLEELEV . : ...:... . .:: . . ::. . : :... ....: :. : .:.. CCDS45 KIKN-VIRNVHM-------LNRIRTWQKTHQGENNGL--ANSIRDSLNE-YEAKLSDLRA 1940 1950 1960 1970 1980 1750 1760 1770 1780 1790 1800 pF1KE2 LKEAASHVLSKHNNELKAAEALVREAEAKMQESNHLLLMVNANLREFSDKKLHVQEEQNL .:. : : ...:.. ::... : .. ...:... :. . . : CCDS45 --------------RLQEAAAQAKQANGLNQENERALGAIQRQVKEINS--LQSDFTKYL 1990 2000 2010 2020 1810 1820 1830 1840 1850 1860 pF1KE2 TSELIVQGRGLIDAAAAQTDAVQDALEHLEDHQDKLLLWSAKIRHHIDDLVMHMSQRNA- :. :.. ::. . . .:. . . .:: . :....: : ..: :.: CCDS45 TTA---------DSSLLQTNIALQLMEKSQKEYEKLAASLNEARQELSDKVRELS-RSAG 2030 2040 2050 2060 2070 1870 1880 1890 1900 1910 pF1KE2 -VDLVYRAEDHAAEFQRLADVLYSGLENI-RNVSLN-----ATSAAYVHYNIQSLIEESE ..:: .:: :: .:.:: . ::.: ::.: . :..:: .. :: . :. .: CCDS45 KTSLVEEAEKHARSLQELA----KQLEEIKRNASGDELVRCAVDAATAYENILNAIKAAE 2080 2090 2100 2110 2120 2130 1920 1930 1940 1950 1960 1970 pF1KE2 ELARDAHRTVTETSL---LSESLVSNGKAAVQRSSRFLKEGNNLSRKLPGIALELSELRN . : : ...:..: ..:.: ..:. . :...:.:.. ..:: .:. CCDS45 DAANRAA-SASESALQTVIKEDLPRKAKTLSSNSDKLLNEAKMTQKKLK------QEVSP 2140 2150 2160 2170 2180 1980 1990 2000 2010 2020 2030 pF1KE2 KTNRFQE--NAVEITRQT-NESLLILRAIPEGIRDKGAKTKELATSASQSAVSTLRDVAG : .:. : : . ... . .: :: .::. .: . :...: : :.. CCDS45 ALNNLQQTLNIVTVQKEVIDTNLTTLRDGLHGIQ-RG--DIDAMISSAKSMVRKANDITD 2190 2200 2210 2220 2230 2240 2040 2050 2060 2070 2080 pF1KE2 LSQELLNT-SASLSRVNTTLRETH-----QLLQDSTMATLLAGRKVKDVEIQANLLFDRL . :: .... :.. : .:. . : :. .. :. :. . . . ..: CCDS45 EVLDGLNPIQTDVERIKDTYGRTQNEDFKKALTDADNSVNKLTNKLPDLWRKIESINQQL 2250 2260 2270 2280 2290 2300 2090 2100 2110 2120 2130 2140 pF1KE2 KPLKMLEENLSRNLSEIKLLISQARKQAASIKVAVSAD-RDCIRAYQPQISSTNYNTLTL :: :.: :...:. ::.::: :... : . . .. ... :. . .: CCDS45 LPLG----NISDNMDRIRELIQQARDAASKVAVPMRFNGKSGVEVRLPNDLEDLKGYTSL 2310 2320 2330 2340 2350 2360 2150 2160 2170 2180 2190 pF1KE2 NVKTQEPDN---------LLFYLGSSTAS-DFLAVEMRRGRVAFLWDLGSGSTRLEFPD- .. :.:.. ...:::.. :: :.... . :... ...::. ..:. . CCDS45 SLFLQRPNSRENGGTENMFVMYLGNKDASRDYIGMAVVDGQLTCVYNLGDREAELQVDQI 2370 2380 2390 2400 2410 2420 2200 2210 2220 2230 2240 pF1KE2 FPIDDNRWHSIHVARFGNIGSLSVKEMSSNQKSPTKTSKSPGTANVLDVNNSTLM----- . .... . ..: : ... ... .. . .. ..::. .. :..::. CCDS45 LTKSETKEAVMDRVKFQRIYQFA--RLNYTKGATSSKPETPGVYDMDGRNSNTLLNLDPE 2430 2440 2450 2460 2470 2250 2260 2270 2280 2290 2300 pF1KE2 ----FVGGLGGQIKKSPAVKVTHFKGCLGEAFLNGKSIGLWNYIEREG----KCRGCFGS .::: ..: .. .:::. :: . ..:.:. . . . . : CCDS45 NVVFYVGGYPPDFKLPSRLSFPPYKGCIELDDLNENVLSLYNFKKTFNLNTTEVEPCRRR 2480 2490 2500 2510 2520 2530 2310 2320 2330 2340 2350 2360 pF1KE2 SQNEDPSFHFDGSGYSVVEKSLPATVTQIIMLFNTFSPNGLLLYLGSYGTKDFLSIELFR ... : .. :.:.::. : . : . . . ..: :::.. . : . :.:... CCDS45 KEESDKNY-FEGTGYARVPTQPHAPIPTFGQTIQTTVDRGLLFF-AENGDR-FISLNIED 2540 2550 2560 2570 2580 2590 2370 2380 2390 2400 2410 pF1KE2 GRVKVMTDLGSG-PITLLTDRRYNNGTWYKIAFQRNRKQGVLAV-IDAYNTSNKETKQGE :.. : :.: : . ::: ..: .. .. : . . .:. :: .:: CCDS45 GKLMVRYKLNSELPKERGVGDAINNGRDHSIQIKIGKLQKRMWINVDVQNT----IIDGE 2600 2610 2620 2630 2640 2650 2420 2430 2440 2450 2460 2470 pF1KE2 TPGASSDLNRLDKDPIYVGGLPRSRVVRRGVTTKSFVGCIKNLEISRSTFDLLRNSYGVR . .: . :.::.: . : ...: .: ::.:::. . .. : .. :: CCDS45 V---------FDFSTYYLGGIPIAIRERFNISTPAFRGCMKNLKKTSGVVRL-NDTVGVT 2660 2670 2680 2690 2700 2480 2490 2500 2510 2520 2530 pF1KE2 KGCLLEP--IRSVSFLKGGYIELPPKSLSPESEWLVTFA--TTNSSGIILAALGGDVEKR : : . .::.:: .:: . . .: : .. ..:. : . :::.: : .. CCDS45 KKCSEDWKLVRSASFSRGGQLSFTDLGLPPTDHLQASFGFQTFQPSGILL-----D-HQT 2710 2720 2730 2740 2750 2540 2550 2560 2570 2580 2590 pF1KE2 GDREEAHVPFFSVMLIGGNIEVHVNPGDGTGLRKALLHAPTGTCSDGQAHSISLVRN--- :. ..: : : ::. .. . : ....: : :: : .:.. . CCDS45 WTRN------LQVTLEDGYIELSTSDSGGP-----IFKSPQ-TYMDGLLHYVSVISDNSG 2760 2770 2780 2790 2800 2600 2610 2620 2630 2640 pF1KE2 -RRIITVQLDENNPVEMKLGTLVESRTINVSNLYVGGIPEGEGTSLLTMRRSFHGCIKN- : .: :: .:. .: . :: ..: .:: .:.:::.: CCDS45 LRLLIDDQLLRNSK---RLKHISSSR----QSLRLGG-------------SNFEGCISNV 2810 2820 2830 2840 2650 2660 2670 2680 2690 pF1KE2 ----LIFNLELLDFNSAVGHEQVDLDTCWLSERPKL-----------APDAEDSKLLPE- : .. :.::..: ...:.: : :.. : : . . ..:: . CCDS45 FVQRLSLSPEVLDLTSNSLKRDVSLGGCSLNKPPFLMLLKGSTRFNKTKTFRINQLLQDT 2850 2860 2870 2880 2890 2900 2700 2710 2720 2730 2740 pF1KE2 PRAFPEQCVV-DAALEYVP------GAHQFGLTQNSHFILPFNQSAVRKKLSVELSIRTF : : :.. : . : .: :: ::: .::... . : .. . . ....: CCDS45 PVASPRSVKVWQDACSPLPKTQANHGALQFGDIPTSHLLFKLPQELLKPRSQFAVDMQTT 2910 2920 2930 2940 2950 2960 2750 2760 2770 2780 2790 2800 pF1KE2 ASSGLIYYMAHQNQADYAVLQLHGGRLHFMFDLGKGRTKVSHPALLSDGKWHTVKTDYVK .: ::... . .:. . .: : ::: : . . ... .::::::: . CCDS45 SSRGLVFHTGTKNS--FMALYLSKGRLVFALGTDGKKLRIKSKEKCNDGKWHTVVFGHDG 2970 2980 2990 3000 3010 3020 2810 2820 2830 2840 2850 2860 pF1KE2 RKGFITVDGRESPMVTVVGDGTMLDVEGLFYLGGLPSQYQARKIGNITHSIPACIGDVTV .:: ..::: .. .. :..:. .... :::. :: .. . :.:. .:. . . CCDS45 EKGRLVVDGLRAREGSLPGNSTI-SIRAPVYLGSPPS---GKPKSLPTNSFVGCLKNFQL 3030 3040 3050 3060 3070 2870 2880 2890 2900 2910 2920 pF1KE2 NSKQLDKDSPVSAFTVNRCYAVAQE-GTYFDGSGYAALVKEGYKVQSDVNITLEFRTSSQ .:: : .: :.: :. : . : : ::. : ... .. . . .... .: : CCDS45 DSKPLY--TPSSSFGVSSCLGGPLEKGIYFSEEGGHVVLAHSVLLGPEFKLVFSIRPRSL 3080 3090 3100 3110 3120 3130 2930 2940 2950 2960 2970 2980 pF1KE2 NGVLLGISTAKVDAIGLELVDGKVLFHVNNGAGRITAAYEPKTATVLCDGKWHTLQANKS CCDS45 TGILIHIGSQPGKHLCVYLEAGKVTASMDSGAGGTSTSVTPKQSLCDGQWHSVAVTIKQH 3140 3150 3160 3170 3180 3190 >>CCDS42419.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18 (3333 aa) initn: 2237 init1: 731 opt: 1460 Z-score: 855.1 bits: 173.1 E(32554): 2.6e-41 Smith-Waterman score: 3516; 27.6% identity (53.7% similar) in 3287 aa overlap (5-2869:25-3136) 10 20 30 pF1KE2 MRGGVLLVLLLCVAAQCRQRG------LFPAILNLASNAH :: :: : .: :. : : :. .::: :. CCDS42 MAAAARPRGRALGPVLPPTPLLLLVLRVLPAC-GATARDPGAAAGLSLHPTYFNLAEAAR 10 20 30 40 50 40 50 60 70 80 pF1KE2 ISTNATCGEKGP-------EMFCKLV--EHVPG--RPVRNPQCRICDGNSANPRERHPIS : ..:::::.:: :..:::: .:: . ... : : :: .::. ::.. CCDS42 IWATATCGERGPGEGRPQPELYCKLVGGPTAPGSGHTIQGQFCDYC--NSEDPRKAHPVT 60 70 80 90 100 110 90 100 110 120 130 140 pF1KE2 HAIDGTNNWWQSPSIQNGREYHWVTITLDLRQVFQVAYVIIKAANAPRPGNWILERSLD- .::::.. ::::: ...: .:. :..:::: :.:.:::..:: ::.::: :.::::.: CCDS42 NAIDGSERWWQSPPLSSGTQYNRVNLTLDLGQLFHVAYILIKFANSPRPDLWVLERSVDF 120 130 140 150 160 170 150 160 170 180 190 200 pF1KE2 GTTFSPWQYYAVSDSECLSRYNITPRRGPPTYRADDEVICTSYYSRLVPLEHGEIHTSLI :.:.:::::.: : .::.... :.. . ::.:.:.. :::.::::.::. .::: CCDS42 GSTYSPWQYFAHSKVDCLKEFG---REANMAVTRDDDVLCVTEYSRIVPLENGEVVVSLI 180 190 200 210 220 230 210 220 230 240 250 260 pF1KE2 NGRPSADDL--SPKLLEFTSARYIRLRLQRIRTLNADLMTLSHREPKELDPIVTRRYYYS ::::.: .. : : :::.: ::::. : :: . :.. ..: :: :::::::: CCDS42 NGRPGAKNFTFSHTLREFTKATNIRLRFLRTNTLLGHLISKAQR-----DPTVTRRYYYS 240 250 260 270 280 270 280 290 300 310 320 pF1KE2 IKDISVGGMCICYGHASSCPWDETTKKLQCQCEHNTCGESCNRCCPGYHQQPWRPGTVSS :::::.::.:.: ::: : .. : ..:.:.:.::::.:.::: ::.:. :::.. . CCDS42 IKDISIGGQCVCNGHAEVCNINNPEKLFRCECQHHTCGETCDRCCTGYNQRRWRPAAWEQ 290 300 310 320 330 340 330 340 350 360 370 380 pF1KE2 GNTCEACNCHNKAKDCYYDESVAKQKKSLNTAGQFRGGGVCINCLQNTMGINCETCIDGY .. :::::::..:..:::: .: .:. :::: : . :::::::: .:: :.::: : :: CCDS42 SHECEACNCHGHASNCYYDPDVERQQASLNTQGIYAGGGVCINCQHNTAGVNCEQCAKGY 350 360 370 380 390 400 390 400 410 420 pF1KE2 YRPHKVSPYEDEPCRPCNCDPV-------GSLSSVCIKDDLHSD--------LHN----- :::. : . : ::.::: :: : : ..:.: .: CCDS42 YRPYGVPVDAPDGCIPCSCDPEHADGCEQGSGRCHC-KPNFHGDNCEKCAIGYYNFPFCL 410 420 430 440 450 460 430 440 pF1KE2 ----------------------------GKQP------GQCPCKEGYTGEKCDRCQLGYK : : :.: :. : : .:: :. :. CCDS42 RIPIFPVSTPSSEDPVAGDIKGCDCNLEGVLPEICDAHGRCLCRPGVEGPRCDTCRSGFY 470 480 490 500 510 520 450 460 470 pF1KE2 DYPTCVSCGCNPVGS-----------------------------ASDEP-CTG------P ..: : .: :. .:: : : : : : : CCDS42 SFPICQACWCSALGSYQMPCSSVTGQCECRPGVTGQRCDRCLSGAYDFPHCQGSSSACDP 530 540 550 560 570 580 480 490 500 pF1KE2 ----------CVCKENVEGKACDRCKPGFYNLKEKNPRGCSECFCF-------------- : :: .::: .:.::: ..:: ..:: ::::: : CCDS42 AGTINSNLGYCQCKLHVEGPTCSRCKLLYWNLDKENPSGCSECKCHKAGTVSGTGECRQG 590 600 610 620 630 640 510 520 530 540 pF1KE2 -----------GVS-DVCSSLSWPVGQVN---------SMSGWLVTDLISPRKIPSQQDA : : :.: . . . . : ...: : . .: . . .. CCDS42 DGDCHCKSHVGGDSCDTCEDGYFALEKSNYFGCQGCQCDIGGALSSMCSGPSGVCQCREH 650 660 670 680 690 700 550 560 570 pF1KE2 LGGR--------------HQVS--INNTAV---------MQRLA-PKYYWA--APEAYLG . :. :... :.. .. .. :: :.. : : . . CCDS42 VVGKVCQRPENNYYFPDLHHMKYEIEDGSTPNGRDLRFGFDPLAFPEFSWRGYAQMTSVQ 710 720 730 740 750 760 580 590 600 610 pF1KE2 N--KLT-----AFGGFLKYTVSYDIP-VETVDSNLMSH-------------------ADV : ..: . :.... . : : .:.:.... . : : CCDS42 NDVRITLNVGKSSGSLFRVILRYVNPGTEAVSGHITIYPSWGAAQSKEIIFLPSKEPAFV 770 780 790 800 810 820 620 630 640 pF1KE2 IIKGNGLT-----------LSTQAEG-----LSLQPYEEYLNVVRLVP------------ . :::.. .::: : : : . : : .: CCDS42 TVPGNGFADPFSITPGIWVACIKAEGVLLDYLVLLPRDYYEASVLQLPVTEPCAYAGPPQ 830 840 850 860 870 880 650 660 pF1KE2 EN---FQDFHSKR--------------------------------QID---RD---QLMT :: .: . : ..: :. .: CCDS42 ENCLLYQHLPVTRFPCTLACEARHFLLDGEPRPVAVRQPTPAHPVMVDLSGREVELHLRL 890 900 910 920 930 940 670 680 690 700 710 720 pF1KE2 VLANVTHLLIRANYNSAKMALYRLESVSLDIASSNAIDLVVAADVEHCECPQGYTGTSCE . .: : .. ..:.. :. :.... ::.. :.:..:. : .:. . :. CCDS42 RIPQVGHYVVVVEYSTEAAQLF---VVDVNVKSSGS---VLAGQVNIYSC--NYS-VLCR 950 960 970 980 990 730 740 750 760 770 pF1KE2 SCLSGYYRVDGILFGGICQPCECHGHAAECNVHGVCIACAHNTTG------VHCEQCLPG : . .. .. . .:: :. .: ::: .. .. ::: CCDS42 SAVIDHMSRIAMYELLADADIQLKGHMARFLLHQVCIIPIEEFSAEYVRPQVHCIASYGR 1000 1010 1020 1030 1040 1050 780 790 800 810 820 830 pF1KE2 FYGEPSR--GTPGDCQPCACPLTIASNNFSPTCHLNDGDEVVCDWCAPGYSGAWCERCAD : .. . . . : : : . :. : :: . . : :: . . . CCDS42 FVNQSATCVSLAHETPPTALILDVLSGR--PFPHLPQQSSPSVD-VLPGVTLKAPQNQVT 1060 1070 1080 1090 1100 1110 840 850 860 pF1KE2 --------GYY---------GNPTVPGESCVPCD--CSGNVDPSEAGH---C-DSVT--G : : ..:: :.. : .:. : : : :.: : CCDS42 LRGRVPHLGRYVFVIHFYQAAHPTFPAQVSVDGGWPRAGSFHASFCPHVLGCRDQVIAEG 1120 1130 1140 1150 1160 1170 870 880 890 900 910 pF1KE2 ECLKCLGNTDGAHCERCADG-----FYGDAVTAKNCRACECHVKGSHSAV-----CHLET . ... . : . .: .: :.: : :. ... : .. CCDS42 QIEFDISEPEVAATVKVPEGKSLVLVRVLVVPAENYDYQILHKKSMDKSLEFITNCGKNS 1180 1190 1200 1210 1220 1230 920 930 940 950 960 970 pF1KE2 GLCDCKPNVTGQQCDQCLHGYYGLDSGHGCRPCNCSVAGSVSDGCTDEG-QCHCVPGVAG : :..... : . .. .. .: ::.: .:... :. :: :: : :.: : CCDS42 FYLD--PQTASRFCKNSARSLVAF-YHKGALPCECHPTGATGPHCSPEGGQCPCQPNVIG 1240 1250 1260 1270 1280 1290 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KE2 KRCDRCAHGFYAYQDGSCTPCDCPHTQNTCDPETGECVCPPHTQGVKCEECEDGHWGYDA ..: ::: : :.. : ::.: . :. ::.: :::.: .:: :: ... CCDS42 RQCTRCATGHYGFP--RCKPCSCG--RRLCEEMTGQCRCPPRTVRPQCEVCETHSFSFHP 1300 1310 1320 1330 1340 1040 1050 1060 1070 1080 1090 pF1KE2 EVGCQACNCSLVGSTHH---RCDVVTGHCQCKSKFGGRACDQCSLGYRDFPDCVPCDCDL .::..:::: :. . .:: .:.:.:: .. :: ::.:. :. ::.::::.:. CCDS42 MAGCEGCNCSRRGTIEAAMPECDRDSGQCRCKPRITGRQCDRCASGFYRFPECVPCNCNR 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1100 1110 1120 1130 1140 1150 pF1KE2 RGTSGDACNLEQGLCGCVEETGACPCKENVFGPQCNECREGTFALRADNPLGCSPCFCSG :: : :.: :::: ::::: : .:: ::::.: : : ::. ::: : CCDS42 DGT-------EPGVCD--PGTGACLCKENVEGTECNVCREGSFHLDPANLKGCTSCFCFG 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1160 1170 1180 1190 1200 1210 pF1KE2 LSHLC-SELEDYVRTPVTLGSDQPLLRVVSQSNLRGT-TEGVYYQAPDFLLDAATVRQHI ... : : . .. :: :..... .. . . : .. :. ::. : CCDS42 VNNQCHSSHKRRTKFVDMLGWH---LETADRVDIPVSFNPGSNSMVADLQELPATI--HS 1470 1480 1490 1500 1510 1220 1230 1240 1250 1260 1270 pF1KE2 RAEPFYWRLPQQFQGDQLMAYGGKLKYSVAFYSLDG-VGTSNFEPQVLIKGGRIRKQVIY . : : .. ::.. .::: : :.. ..: : . . .:.: . : .. ..:: CCDS42 AS----WVAPTSYLGDKVSSYGGYLTYQAKSFGLPGDMVLLEKKPDVQLTGQHM--SIIY 1520 1530 1540 1550 1560 1280 1290 1300 1310 1320 1330 pF1KE2 MDAPAPENGVRQEQEVAMRENFWKYFNSVSEKPVTREDFMSVLSDIEYILIKASYGQGLQ .. .:. .. .: . :. .. .. :. ::.::..:.::: . . :.. : : CCDS42 EETNTPRPDRLHHGRVHVVEG--NFRHASSRAPVSREELMTVLSRLADVRIQGLYFTETQ 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1340 1350 1360 1370 1380 1390 pF1KE2 QSRISDISMEVGRKAEKLHPEEEVASLLENCVCPPGTVGFSCQDCAPGYHRGKLPAGSDR . .:....: . . ..: .: :.:::. .: ::: :.:::.: . . : CCDS42 RLTLSEVGLEEASDT----GSGRIALAVEICACPPAYAGDSCQGCSPGYYRDHKGLYTGR 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1400 1410 1420 1430 1440 1450 pF1KE2 GPRPLVAPCVPCSCNNHSDTCDPNTGKCLNCGDNTAGDHCDVCTSGYYGK-VTGSASDCA ::::.::.::. :. ..: :.:: ::::.::. : ::::. : :: : CCDS42 --------CVPCNCNGHSNQCQDGSGICVNCQHNTAGEHCERCQEGYYGNAVHGS---CR 1690 1700 1710 1720 1730 1460 1470 1480 1490 1500 1510 pF1KE2 LCACPHSPPASFSPTCVLEGDHDFRCDACLLGYEGKHCERCSSSYYGNPQTPGGSCQKCD : :::. ::. ::..: : :: .: :: : .::::. .:.:::: ::::: :. CCDS42 ACPCPHT--NSFATGCVVNGG-DVRC-SCKAGYTGTQCERCAPGYFGNPQKFGGSCQPCS 1740 1750 1760 1770 1780 1520 1530 1540 1550 1560 1570 pF1KE2 CNPHGSVHGDCDRTSGQCVCRLGASGLRCDECEPRHILMETDCVSCDDECVGVLLNDLDE :: .:.. :.: .:.:. . ::. .: .::. :: .::::: CCDS42 CNSNGQL-GSCHPLTGDCINQ-----------EPKDSSPAEECDDCDS-CVMTLLNDLAT 1790 1800 1810 1820 1830 1580 1590 1600 1610 1620 pF1KE2 IGDAV--LSLNLTGIIPVPYGILS---NLENTTKYLQESLLKENMQKDLGKIKLEGVAEE .:. . .. .: :. . :.: ..:. .: :...::. . :.::. .: CCDS42 MGEQLRLVKSQLQGL-SASAGLLEQMRHMETQAKDLRNQLLNYRSAISNHGSKIEGLERE 1840 1850 1860 1870 1880 1890 1630 1640 1650 1660 1670 pF1KE2 -TD------NLQKKLTRMLASTQKVNRATERIFKESQDLAIAIERLQMSITEIMEKTTLN :: .::.: ..: .: ..: . ...: . :. . .. .... .. CCDS42 LTDLNQEFETLQEKAQVNSRKAQTLNNNVNRATQSAKELDVKIKNVIRNVHILLKQ--IS 1900 1910 1920 1930 1940 1950 1680 1690 1700 1710 1720 1730 pF1KE2 QTLVEDFLLPNSTLQNMQQNGTSLLEIMQIRDFTQLHQNATLELKAAEDLLSQIQENYQK : : .:.. .. .. ... .. :.: . ..: . . .. ::..:. ..:: CCDS42 GTDGEGNNVPSGDFSREWAEAQRMMRELRNRNFGKHLREAEADKRESQLLLNRIR-TWQK 1960 1970 1980 1990 2000 2010 1740 1750 1760 1770 1780 1790 pF1KE2 PLE-ELEVLKEAASHVLSKHNNELKAAEALVREAEAKMQESNHLLLMVNANLREFSDKKL . : . : .. :.... .:. .: ..:: :. ...: : . : : .. . CCDS42 THQGENNGLANSIRDSLNEYEAKLSDLRARLQEAAAQAKQANGL---NQENERALGAIQR 2020 2030 2040 2050 2060 1800 1810 1820 1830 1840 1850 pF1KE2 HVQEEQNLTSELIVQGRGLIDAAAAQTDAVQDALEHLEDHQDKLLLWSAKIRHHIDDLVM .:.: ..: :.. .. :.. ::. . . .:. . . .:: . :....: : CCDS42 QVKEINSLQSDF-TKYLTTADSSLLQTNIALQLMEKSQKEYEKLAASLNEARQELSDKVR 2070 2080 2090 2100 2110 2120 1860 1870 1880 1890 1900 pF1KE2 HMSQRNA--VDLVYRAEDHAAEFQRLADVLYSGLENI-RNVSLN-----ATSAAYVHYNI ..: :.: ..:: .:: :: .:.:: . ::.: ::.: . :..:: .. :: CCDS42 ELS-RSAGKTSLVEEAEKHARSLQELA----KQLEEIKRNASGDELVRCAVDAATAYENI 2130 2140 2150 2160 2170 2180 1910 1920 1930 1940 1950 1960 pF1KE2 QSLIEESEELARDAHRTVTETSL---LSESLVSNGKAAVQRSSRFLKEGNNLSRKLPGIA . :. .:. : : ...:..: ..:.: ..:. . :...:.:.. ..:: CCDS42 LNAIKAAEDAANRAA-SASESALQTVIKEDLPRKAKTLSSNSDKLLNEAKMTQKKLK--- 2190 2200 2210 2220 2230 1970 1980 1990 2000 2010 2020 pF1KE2 LELSELRNKTNRFQE--NAVEITRQT-NESLLILRAIPEGIRDKGAKTKELATSASQSAV .:. : .:. : : . ... . .: :: .::. .: . :...: : CCDS42 ---QEVSPALNNLQQTLNIVTVQKEVIDTNLTTLRDGLHGIQ-RG--DIDAMISSAKSMV 2240 2250 2260 2270 2280 2290 2030 2040 2050 2060 2070 pF1KE2 STLRDVAGLSQELLNT-SASLSRVNTTLRETH-----QLLQDSTMATLLAGRKVKDVEIQ :.. . :: .... :.. : .:. . : :. .. :. :. . CCDS42 RKANDITDEVLDGLNPIQTDVERIKDTYGRTQNEDFKKALTDADNSVNKLTNKLPDLWRK 2300 2310 2320 2330 2340 2350 2080 2090 2100 2110 2120 2130 pF1KE2 ANLLFDRLKPLKMLEENLSRNLSEIKLLISQARKQAASIKVAVSAD-RDCIRAYQPQISS . . ..: :: :.: :...:. ::.::: :... : . . .. ... :. CCDS42 IESINQQLLPLG----NISDNMDRIRELIQQARDAASKVAVPMRFNGKSGVEVRLPNDLE 2360 2370 2380 2390 2400 2140 2150 2160 2170 2180 pF1KE2 TNYNTLTLNVKTQEPDN---------LLFYLGSSTAS-DFLAVEMRRGRVAFLWDLGSGS . .:.. :.:.. ...:::.. :: :.... . :... ...::. CCDS42 DLKGYTSLSLFLQRPNSRENGGTENMFVMYLGNKDASRDYIGMAVVDGQLTCVYNLGDRE 2410 2420 2430 2440 2450 2460 2190 2200 2210 2220 2230 2240 pF1KE2 TRLEFPD-FPIDDNRWHSIHVARFGNIGSLSVKEMSSNQKSPTKTSKSPGTANVLDVNNS ..:. . . .... . ..: : ... ... .. . .. ..::. .. :.. CCDS42 AELQVDQILTKSETKEAVMDRVKFQRIYQFA--RLNYTKGATSSKPETPGVYDMDGRNSN 2470 2480 2490 2500 2510 2520 2250 2260 2270 2280 2290 pF1KE2 TLM---------FVGGLGGQIKKSPAVKVTHFKGCLGEAFLNGKSIGLWNYIEREG---- ::. .::: ..: .. .:::. :: . ..:.:. . . CCDS42 TLLNLDPENVVFYVGGYPPDFKLPSRLSFPPYKGCIELDDLNENVLSLYNFKKTFNLNTT 2530 2540 2550 2560 2570 2580 2300 2310 2320 2330 2340 2350 pF1KE2 KCRGCFGSSQNEDPSFHFDGSGYSVVEKSLPATVTQIIMLFNTFSPNGLLLYLGSYGTKD . . : ... : .. :.:.::. : . : . . . ..: :::.. . : . CCDS42 EVEPCRRRKEESDKNY-FEGTGYARVPTQPHAPIPTFGQTIQTTVDRGLLFF-AENGDR- 2590 2600 2610 2620 2630 2640 2360 2370 2380 2390 2400 2410 pF1KE2 FLSIELFRGRVKVMTDLGSG-PITLLTDRRYNNGTWYKIAFQRNRKQGVLAV-IDAYNTS :.:... :.. : :.: : . ::: ..: .. .. : . . .:. :: CCDS42 FISLNIEDGKLMVRYKLNSELPKERGVGDAINNGRDHSIQIKIGKLQKRMWINVDVQNT- 2650 2660 2670 2680 2690 2700 2420 2430 2440 2450 2460 2470 pF1KE2 NKETKQGETPGASSDLNRLDKDPIYVGGLPRSRVVRRGVTTKSFVGCIKNLEISRSTFDL .::. .: . :.::.: . : ...: .: ::.:::. . .. : CCDS42 ---IIDGEV---------FDFSTYYLGGIPIAIRERFNISTPAFRGCMKNLKKTSGVVRL 2710 2720 2730 2740 2750 2480 2490 2500 2510 2520 pF1KE2 LRNSYGVRKGCLLEP--IRSVSFLKGGYIELPPKSLSPESEWLVTFA--TTNSSGIILAA .. :: : : . .::.:: .:: . . .: : .. ..:. : . :::.: CCDS42 -NDTVGVTKKCSEDWKLVRSASFSRGGQLSFTDLGLPPTDHLQASFGFQTFQPSGILLD- 2760 2770 2780 2790 2800 2530 2540 2550 2560 2570 2580 pF1KE2 LGGDVEKRGDREEAHVPFFSVMLIGGNIEVHVNPGDGTGLRKALLHAPTGTCSDGQAHSI .. :. ..: : : ::. .. . : ....: : :: : . CCDS42 -----HQTWTRN------LQVTLEDGYIELSTSDSGGP-----IFKSPQ-TYMDGLLHYV 2810 2820 2830 2840 2850 2590 2600 2610 2620 2630 2640 pF1KE2 SLVRN----RRIITVQLDENNPVEMKLGTLVESRTINVSNLYVGGIPEGEGTSLLTMRRS :.. . : .: :: .:. .: . :: ..: .:: . CCDS42 SVISDNSGLRLLIDDQLLRNSK---RLKHISSSR----QSLRLGG-------------SN 2860 2870 2880 2890 2650 2660 2670 2680 pF1KE2 FHGCIKN-----LIFNLELLDFNSAVGHEQVDLDTCWLSERPKL-----------APDAE :.:::.: : .. :.::..: ...:.: : :.. : : . . CCDS42 FEGCISNVFVQRLSLSPEVLDLTSNSLKRDVSLGGCSLNKPPFLMLLKGSTRFNKTKTFR 2900 2910 2920 2930 2940 2950 2690 2700 2710 2720 2730 pF1KE2 DSKLLPE-PRAFPEQCVV-DAALEYVP------GAHQFGLTQNSHFILPFNQSAVRKKLS ..:: . : : :.. : . : .: :: ::: .::... . : .. . . CCDS42 INQLLQDTPVASPRSVKVWQDACSPLPKTQANHGALQFGDIPTSHLLFKLPQELLKPRSQ 2960 2970 2980 2990 3000 3010 2740 2750 2760 2770 2780 2790 pF1KE2 VELSIRTFASSGLIYYMAHQNQADYAVLQLHGGRLHFMFDLGKGRTKVSHPALLSDGKWH ....: .: ::... . .: .. .: : ::: : . . ... .::::: CCDS42 FAVDMQTTSSRGLVFHTGTKN--SFMALYLSKGRLVFALGTDGKKLRIKSKEKCNDGKWH 3020 3030 3040 3050 3060 2800 2810 2820 2830 2840 2850 pF1KE2 TVKTDYVKRKGFITVDGRESPMVTVVGDGTMLDVEGLFYLGGLPSQYQARKIGNITHSIP :: . .:: ..::: .. .. :..:. .... :::. :: .. . :.:. CCDS42 TVVFGHDGEKGRLVVDGLRAREGSLPGNSTI-SIRAPVYLGSPPS---GKPKSLPTNSFV 3070 3080 3090 3100 3110 3120 2860 2870 2880 2890 2900 2910 pF1KE2 ACIGDVTVNSKQLDKDSPVSAFTVNRCYAVAQEGTYFDGSGYAALVKEGYKVQSDVNITL .:. . ..:: CCDS42 GCLKNFQLDSKPLYTPSSSFGVSSCLGGPLEKGIYFSEEGGHVVLAHSVLLGPEFKLVFS 3130 3140 3150 3160 3170 3180 >>CCDS33502.1 LAMA5 gene_id:3911|Hs108|chr20 (3695 aa) initn: 2083 init1: 520 opt: 1432 Z-score: 838.6 bits: 170.2 E(32554): 2.2e-40 Smith-Waterman score: 2701; 25.5% identity (47.8% similar) in 3207 aa overlap (5-2499:22-3135) 10 20 30 pF1KE2 MRGGVLLV-LLLCVAAQCRQRG-----LFPAILNLASNAHIST .::: : : ::. :... : : .::: .:.:.. CCDS33 MAKRLCAGSALCVRGPRGPAPLLLVGLALLGAARAREEAGGGFSLHPPYFNLAEGARIAA 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 pF1KE2 NATCGEKGP---------EMFCKLVEHV-----PGRPVRNPQCRICDGNSANPRERHPIS .:::::..: ...:::: :.. .:. : :: ..:: . :: : CCDS33 SATCGEEAPARGSPRPTEDLYCKLVGGPVAGGDPNQTIRGQYCDIC--TAANSNKAHPAS 70 80 90 100 110 90 100 110 120 130 140 pF1KE2 HAIDGTNNWWQSPSIQNGREYHWVTITLDLRQVFQVAYVIIKAANAPRPGNWILERSLD- .:::::. ::::: .. : ::. :..:::: :::.::::.:: ::.::: :.::::.: CCDS33 NAIDGTERWWQSPPLSRGLEYNEVNVTLDLGQVFHVAYVLIKFANSPRPDLWVLERSMDF 120 130 140 150 160 170 150 160 170 180 190 pF1KE2 GTTFSPWQYYAVSDSECLSRYNITPRRGPPTYRA---DDEVICTSYYSRLVPLEHGEIHT : :..:::..: : .:: :. :: : . :: .:::. :::.::::.::: . CCDS33 GRTYQPWQFFASSKRDCLERF------GPQTLERITRDDAAICTTEYSRIVPLENGEIVV 180 190 200 210 220 230 200 210 220 230 240 250 pF1KE2 SLINGRPSADDLS--PKLLEFTSARYIRLRLQRIRTLNADLMTLSHREPKELDPIVTRRY ::.::::.: ..: : : :::.: .:::. : :: . :: . : :: ::::: CCDS33 SLVNGRPGAMNFSYSPLLREFTKATNVRLRFLRTNTLLGHLMGKALR-----DPTVTRRY 240 250 260 270 280 260 270 280 290 300 310 pF1KE2 YYSIKDISVGGMCICYGHASSCPWDETTK--KLQCQCEHNTCGESCNRCCPGYHQQPWRP ::::::::.:: :.:.:::..: . : .::: :.::::: .:.:::::..::::.: CCDS33 YYSIKDISIGGRCVCHGHADACDAKDPTDPFRLQCTCQHNTCGGTCDRCCPGFNQQPWKP 290 300 310 320 330 340 320 330 340 350 360 370 pF1KE2 GTVSSGNTCEACNCHNKAKDCYYDESVAKQKKSLNTAGQFRGGGVCINCLQNTMGINCET .:..:.: :..:::...: ::::: : ... : . : ..::::::.: ..: :.::: CCDS33 ATANSANECQSCNCYGHATDCYYDPEVDRRRASQSLDGTYQGGGVCIDCQHHTTGVNCER 350 360 370 380 390 400 380 390 pF1KE2 CIDGYYR--------PHKV------SPYEDEPC---------RP---------------- :. :.:: :: : . : : :: CCDS33 CLPGFYRSPNHPLDSPHVCRRCNCESDFTDGTCEDLTGRCYCRPNFSGERCDVCAEGFTG 410 420 430 440 450 460 400 410 pF1KE2 --------------------------CNCDPVGSLSSVCIKDD-------------LHSD :.:. .:. ...: :: : . CCDS33 FPSCYPTPSSSNDTREQVLPAGQIVNCDCSAAGTQGNACRKDPRVGRCLCKPNFQGTHCE 470 480 490 500 510 520 420 430 440 450 pF1KE2 LHN------GKQP-----------------GQCPCKEGYTGEKCDRCQLGYKDYPTCVSC : : :: ::: :. :. : :::: :: .: : : CCDS33 LCAPGFYGPGCQPCQCSSPGVADDRCDPDTGQCRCRVGFEGATCDRCAPGYFHFPLCQLC 530 540 550 560 570 580 460 pF1KE2 GCNPVGS---ASDE---------------------------------------------- ::.:.:. . :: CCDS33 GCSPAGTLPEGCDEAGRCLCQPEFAGPHCDRCRPGYHGFPNCQACTCDPRGALDQLCGAG 590 600 610 620 630 640 pF1KE2 ----------------------------PC-------------------------TG--- :: :: CCDS33 GLCRCRPGYTGTACQECSPGFHGFPSCVPCHCSAEGSLHAACDPRSGQCSCRPRVTGLRC 650 660 670 680 690 700 470 480 490 pF1KE2 -----------------------------------PCVCKENVEGKACDRCKPGFYNLKE ::.:. .::: .::::::::..:. CCDS33 DTCVPGAYNFPYCEAGSCHPAGLAPVDPALPEAQVPCMCRAHVEGPSCDRCKPGFWGLSP 710 720 730 740 750 760 500 510 520 530 540 pF1KE2 KNPRGCSECFC------FGVSDV------CSSLSWPVGQV--NSMSGWLVTDLISPRKIP .::.::..: : ::.. : ::. . .:.. : . CCDS33 SNPEGCTRCSCDLRGTLGGVAECQPGTGQCFCKPHVCGQACASCKDGFFGLDQADYFGCR 770 780 790 800 810 820 550 560 570 pF1KE2 SQQDALGGRHQVSINNTAVMQRLAPK------------YYW-------------AAPEAY : . .:: : . . . : :. .: :.::.. CCDS33 SCRCDIGGALGQSCEPRTGVCRCRPNTQGPTCSEPARDHYLPDLHHLRLELEEAATPEGH 830 840 850 860 870 880 580 590 600 610 pF1KE2 ---LGNKLTAFGGFLKYTVSYDIPVET--------------------VDSNLMS-HADVI .: . : .: . ::. :. . :: . : CCDS33 AVRFGFNPLEFENFSWRGYAQMAPVQPRIVARLNLTSPDLFWLVFRYVNRGAMSVSGRVS 890 900 910 920 930 940 620 630 640 650 660 pF1KE2 IKGNGLTLS-----TQAEGLSLQPYEE--YLNVV-RLVPENFQDFHSKRQIDRDQLMTVL .. .: . . .:.. ... : : ...: : : : .. : . :: CCDS33 VREEGRSATCANCTAQSQPVAFPPSTEPAFITVPQRGFGEPFV-LNPGTWALRVEAEGVL 950 960 970 980 990 1000 670 680 690 700 710 pF1KE2 ANVTHLLIRANYNSAKMALYRLESVSLDIASSNAIDLVV------------AADVEH-CE . . :: : :..: . : :. . ..... : . :: .: :. CCDS33 LDYVVLLPSAYYEAALLQLRVTEACTYRPSAQQSGDNCLLYTHLPLDGFPSAAGLEALCR 1010 1020 1030 1040 1050 1060 720 730 pF1KE2 --------CPQGY-----------TGTSCESCLS------GYYRV-------DGILFGGI :: ::.. . :. : : . :. :. CCDS33 QDNSLPRPCPTEQLSPSHPPLITCTGSDVDVQLQVAVPQPGRYALVVEYANEDARQEVGV 1070 1080 1090 1100 1110 1120 740 750 pF1KE2 C---------------QPCE----CHGHA-------------AECNV-----------HG .:: :.: : .: .: :: CCDS33 AVHTPQRAPQQGLLSLHPCLYSTLCRGTARDTQDHLAVFHLDSEASVRLTAEQARFFLHG 1130 1140 1150 1160 1170 1180 760 770 780 790 pF1KE2 VC---------------IAC--AHNTTGVHCEQCLPGFYGEPSRGTP-GDCQ----PCAC : ..: .:.. : . :::. . .: . ::: : . CCDS33 VTLVPIEEFSPEFVEPRVSCISSHGAFGPNSAACLPSRFPKPPQPIILRDCQVIPLPPGL 1190 1200 1210 1220 1230 1240 800 810 820 830 840 pF1KE2 PLTIASN---NFSPTCHLN------DGDEVVCDWCAPGYSGAWCERCAD-GYYG---NPT ::: :.. .::. : : : . .. . : :. . CCDS33 PLTHAQDLTPAMSPAGPRPRPPTAVDPDAEPTLLREPQATVVFTTHVPTLGRYAFLLHGY 1250 1260 1270 1280 1290 1300 850 860 870 880 pF1KE2 VPGESCVPCDCSGNVDPSEAGH-----CDSVTGEC---LKCLGNT--DGAHCE-----RC :.. : . :. :: : : : . : :.. : .: : : CCDS33 QPAHPTFPVEVLINAGRVWQGHANASFCPHGYG-CRTLVVCEGQALLDVTHSELTVTVRV 1310 1320 1330 1340 1350 1360 890 900 910 920 930 pF1KE2 ADG--FYGDAVTA--KNCRAC----ECHVKGSHSAVCHLETGLCDCKPNVTGQQCDQCLH : .. : : . .: . : . :.. . : . .:. .. : . CCDS33 PKGRWLWLDYVLVVPENVYSFGYLREEPLDKSYDFISHCAAQGYHISPSSSSLFCRNAAA 1370 1380 1390 1400 1410 1420 940 950 960 970 980 990 pF1KE2 GYYGLDSGHGCRPCNCSVAGSVSDGCTDEG-QCHCVPGVAGKRCDRCAHGFYAYQDGSCT . .: ..: :::.: .:... : : :: : : :. :.::: :.... . : CCDS33 SL-SLFYNNGARPCGCHEVGATGPTCEPFGGQCPCHAHVIGRDCSRCATGYWGFPN--CR 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1000 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KE2 PCDCPHTQNTCDPETGECVCPPHTQGVKCEECEDGHWGYDAEVGCQACNCSLVGS---TH :::: :: ::.:.:::.: : :. .: :::. :::: : : CCDS33 PCDC--GARLCDELTGQCICPPRTIPPDCLLCQPQTFGCHPLVGCEECNCSGPGIQELTD 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KE2 HRCDVVTGHCQCKSKFGGRACDQCSLGYRDFPDCVPCDCDLRGTSGDACNLEQGLCGCVE ::. .:.:.:. . :: :: :: :.. .: : :::: ::. .:. CCDS33 PTCDTDSGQCKCRPNVTGRRCDTCSPGFHGYPRCRPCDCHEAGTAPGVCD---------P 1550 1560 1570 1580 1590 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KE2 ETGACPCKENVFGPQCNECREGTFALRADNPLGCSPCFCSGLSHLCSELEDYVRTPVTLG :: : ::::: ::.:..: :::.: : :: ::. ::: : .. : .:.: . CCDS33 LTGQCYCKENVQGPKCDQCSLGTFSLDAANPKGCTRCFCFGATERCRS-SSYTRQEFVDM 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1180 1190 1200 1210 1220 1230 pF1KE2 SDQPLLRVVSQSNLRGTTEGVYYQAPDFLLDAATVRQHIRAEP-FYWRLPQQFQGDQLMA :: . : . :. . :. .: . : : .::. : .. ::.. . CCDS33 EGWVLLSTDRQVVPHERQPGTEMLRADLRHVPEAVPE---AFPELYWQAPPSYLGDRVSS 1660 1670 1680 1690 1700 1240 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KE2 YGGKLKYSVAFYSLDGVGTSNFE--PQVLIKGGRIRKQVIYMDAPAPENGVRQEQEVAMR ::: :.: . . : .: :.:...:... .. ... : : .. .. . CCDS33 YGGTLRYELHSETQRGDVFVPMESRPDVVLQGNQM--SITFLEPAYPTPGHVHRGQLQLV 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1300 1310 1320 1330 1340 1350 pF1KE2 ENFWKYFNSVSEKPVTREDFMSVLSDIEYILIKASYGQGLQQSRISDISMEVGRKAEKLH :. .. .. ... :.::..: ::...: . :.: ..: . . ...::. : CCDS33 EG--NFRHTETRNTVSREELMMVLASLEQLQIRALFSQISSAVFLRRVALEVASPA---- 1770 1780 1790 1800 1810 1360 1370 1380 1390 1400 1410 pF1KE2 PEEEVASLLENCVCPPGTVGFSCQDCAPGYHRGKLPAGSDRGPRPLVAPCVPCSCNNHSD . .:: .: :.:: . : :::.::::..: .: ... ::::.:..::: CCDS33 GQGALASNVELCLCPASYRGDSCQECAPGFYRDV------KG--LFLGRCVPCQCHGHSD 1820 1830 1840 1850 1860 1870 1420 1430 1440 1450 1460 pF1KE2 TCDPNTGKCLNCGDNTAGDHCDVCTSGYYGKVTGSASDCALCACPHSPPAS-FSPTCVLE : :..: :..: :: : ::. : .:. .. .. :. : :: : :.. :. :::. CCDS33 RCLPGSGVCVDCQHNTEGAHCERCQAGFVSSRDDPSAPCVSCPCPLSVPSNNFAEGCVLR 1880 1890 1900 1910 1920 1930 1470 1480 1490 1500 1510 pF1KE2 GDHDFRCDACLLGYEGKHCERCSSSYYGNPQTPGGSCQKCDCNPHGS------------- : . .: : :: : ::::. ...::: . :.::: :::. .:. CCDS33 GGRT-QC-LCKPGYAGASCERCAPGFFGNPLVLGSSCQPCDCSGNGDPNLLFSDCDPLTG 1940 1950 1960 1970 1980 1520 1530 pF1KE2 --------------------------VHGDCDRT-------------SGQCVCRLGASGL . :.: : ::.:.:. :..: CCDS33 ACRGCLRHTTGPRCEICAPGFYGNALLPGNCTRCDCTPCGTEACDPHSGHCLCKAGVTGR 1990 2000 2010 2020 2030 2040 1540 pF1KE2 RCDECEPRHI-------------------------------------------------L :::.:. :. : CCDS33 RCDRCQEGHFGFDGCGGCRPCACGPAAEGSECHPQSGQCHCRPGTMGPQCRECAPGYWGL 2050 2060 2070 2080 2090 2100 1550 pF1KE2 METDCVSCD-------------------------------------------------DE : : :. :. CCDS33 PEQGCRRCQCPGGRCDPHTGRCNCPPGLSGERCDTCSQQHQVPVPGGPVGHSIHCEVCDH 2110 2120 2130 2140 2150 2160 1560 1570 1580 1590 1600 1610 pF1KE2 CVGVLLNDLDEIGDAVLSLN--LTGIIP--VPYGILSNLENTTKYLQESLLKENMQKDLG :: .::.::.. : . ... : :: . .. : :. . :: .: . . CCDS33 CVVLLLDDLERAGALLPAIHEQLRGINASSMAWARLHRLNASIADLQSQLRSPLGPRHET 2170 2180 2190 2200 2210 2220 1620 1630 1640 1650 1660 pF1KE2 KIKLEGVAEETDNLQKKLTRM----LASTQKVNR---ATERIFKESQDLAIAIERLQMSI .:: . ... .: . :. ... ..... .:: . ... : ::. .. .. CCDS33 AQQLEVLEQQSTSLGQDARRLGGQAVGTRDQASQLLAGTEATLGHAKTLLAAIRAVDRTL 2230 2240 2250 2260 2270 2280 1670 1680 1690 1700 1710 1720 pF1KE2 TEIMEKTTLNQTLVEDFLLPNSTLQNMQQNGTSLLEI------MQIRDFTQLHQNATLEL .:.: .: . : :.. . .: .: :. :. ::. . : :: CCDS33 SELMSQTG-------HLGLANASAPSGEQLLRTLAEVERLLWEMRARDLGAPQAAAEAEL 2290 2300 2310 2320 2330 2340 1730 1740 1750 1760 1770 1780 pF1KE2 KAAEDLLSQIQENYQKPLEELEVLKEAASHVLSKHNNEL-KAAEALVREAEAKMQESNHL ::. ::...::. .. :: ..: . :..:. : ::: : ..: .:...: CCDS33 AAAQRLLARVQEQLSSLWEENQALATQTRDRLAQHEAGLMDLREALNRAVDAT-REAQEL 2350 2360 2370 2380 2390 2400 1790 1800 1810 1820 1830 1840 pF1KE2 LLMVNANLREFSDKKLHVQEEQNLTSELIVQGRGLIDAAAAQTDAVQDALEHLEDHQDKL :. .: .. : :..:.:. . . .. . :: .: :. :.. ...: CCDS33 ----NSRNQERLEEAL--QRKQELSRDNATL-QATLHAARDTLASVFRLLHSLDQAKEEL 2410 2420 2430 2440 2450 1850 1860 1870 1880 1890 pF1KE2 LLWSAKIRHHIDDLVMHMSQRNAVD----LVYRAEDHAAEFQRLADVLYSGLENIRNVSL .:.. :...:. . . :: :: :: .. .:: : : . .. . : CCDS33 ERLAASLDGARTPLLQRMQTFSPAGSKLRLVEAAEAHAQQLGQLALNLSSIILDVNQDRL 2460 2470 2480 2490 2500 2510 1900 1910 1920 1930 1940 1950 pF1KE2 N--ATSAAYVHYNIQSLIEESEELARDAHRTVTET--SLLSESLVSNGKAAVQRSSRF-- . : :. .. : . .. .:. : .: . . .: ... ..::. .. . :. . CCDS33 TQRAIEASNAYSRILQAVQAAEDAAGQALQQADHTWATVVRQGLVDRAQQLLANSTALEE 2520 2530 2540 2550 2560 2570 1960 1970 1980 1990 2000 pF1KE2 --LKEGNNLSRKLPGIALELSELRNKTNRFQENAVEITRQTNESLLILRAIPEGIRDKGA :.: . :. : ::. .. . . : ... .: :. ...: . . . : : CCDS33 AMLQEQQRLG--LVWAALQGARTQLRDVRAKKDQLEAHIQAAQAMLAMDT--DETSKKIA 2580 2590 2600 2610 2620 2630 2010 2020 2030 2040 2050 2060 pF1KE2 KTKELATSASQSAVSTLRDVAGLSQELLNTSASLSRVNTTLRETHQLLQDSTMATLLAGR ..: .:. :...:. . .. ...... ... :: :: .:.: ::. CCDS33 HAKAVAAEAQDTATRVQSQLQAMQENVERWQGQYE----GLRG-----QDLGQAVLDAGH 2640 2650 2660 2670 2680 2070 2080 2090 2100 2110 2120 pF1KE2 KVKDVEIQANLLFDRLKPLKM-----LEENLSRNLSEIKLLISQARKQAASIKVAVSAD- .:. .: :. .:. :. :: ...... ::.::: :...:: .. . CCDS33 SVSTLEKTLPQLLAKLSILENRGVHNASLALSASIGRVRELIAQARGAASKVKVPMKFNG 2690 2700 2710 2720 2730 2740 2130 2140 2150 2160 2170 pF1KE2 RDCIRAYQPQ--ISSTNYNTLTLNVKTQEP-------DNLLFYLGSSTAS-DFLAVEMRR :. .. :. . . :..: . .. :: : ...:.:: :. :...: .: CCDS33 RSGVQLRTPRDLADLAAYTALKFYLQGPEPEPGQGTEDRFVMYMGSRQATGDYMGVSLRD 2750 2760 2770 2780 2790 2800 2180 2190 2200 2210 2220 2230 pF1KE2 GRVAFLWDLGSGSTRLEFPDFPIDDNRWHSIHVARFGNIGSLSVKEMSSNQKSPTKTSKS .: ....:: .. . : : . .. .. . : ..: .:: . . . . CCDS33 KKVHWVYQLGEAGPAVLSIDEDIGE-QFAAVSLDRTLQFGHMSVTVERQMIQETKGDTVA 2810 2820 2830 2840 2850 2860 2240 2250 2260 2270 2280 2290 pF1KE2 PGTANVLDVNNSTLMF-VGGLGGQIKKSPAVKVTHFKGCLGEAFLNGKSIGLWNYIEREG ::. ..:.. . ..: ::: . . : .. ..::. :: . ..:.:. :: CCDS33 PGAEGLLNLRPDDFVFYVGGYPSTFTPPPLLRFPGYRGCIEMDTLNEEVVSLYNF-ERTF 2870 2880 2890 2900 2910 2300 2310 2320 2330 2340 pF1KE2 KC-----RGCFGSSQNEDPSF----HFDGSGYSVVE-KSLPATVTQIIMLFNTFSPNGLL . : : :... :: . ..::.:.. . : .:. .. . . : .:.: CCDS33 QLDTAVDRPCARSKSTGDPWLTDGSYLDGTGFARISFDSQISTTKRFEQELRLVSYSGVL 2920 2930 2940 2950 2960 2970 2350 2360 2370 2380 2390 pF1KE2 LYLGSYGTKDFLSIELFRGRVKVMTDLGSG---PITLLTDRRYNNGTW-YKIAFQRNRKQ ..: . . .:: . . .: . .. :.:.: . : .... .. . . .. CCDS33 FFLKQQS--QFLCLAVQEGSLVLLYDFGAGLKKAVPLQPPPPLTSASKAIQVFLLGGSRK 2980 2990 3000 3010 3020 3030 2400 2410 2420 2430 2440 2450 pF1KE2 GVLAVIDAYNTSNKETKQGETPGASSDLNRLDKDPIYVGGLPRSRV---VRRGVTTKSFV ::. .. .. . : ..::. : :.::.: ... .:: : . : CCDS33 RVLVRVERATVYSVE--------QDNDLEL--ADAYYLGGVPPDQLPPSLRRLFPTGGSV 3040 3050 3060 3070 3080 2460 2470 2480 2490 2500 2510 pF1KE2 -GCIKNLEISRSTFDLLR-NSYGVRKGCLLEPI--RSVSFLKGGYIELPPKSLSPESEWL ::.:... . :: : :. :: :: . . :...: :...: CCDS33 RGCVKGIKALGKYVDLKRLNTTGVSAGCTADLLVGRAMTFHGHGFLRLALSNVAPLTGNV 3090 3100 3110 3120 3130 3140 2520 2530 2540 2550 2560 2570 pF1KE2 VTFATTNSSGIILAALGGDVEKRGDREEAHVPFFSVMLIGGNIEVHVNPGDGTGLRKALL CCDS33 YSGFGFHSAQDSALLYYRASPDGLCQVSLQQGRVSLQLLRTEVKTQAGFADGAPHYVAFY 3150 3160 3170 3180 3190 3200 >>CCDS30625.1 HSPG2 gene_id:3339|Hs108|chr1 (4391 aa) initn: 1095 init1: 412 opt: 1129 Z-score: 663.9 bits: 138.1 E(32554): 1.2e-30 Smith-Waterman score: 1603; 28.7% identity (48.6% similar) in 1155 aa overlap (373-1506:792-1668) 350 360 370 380 390 pF1KE2 AKQKKSLNTAGQFRGGGVCINCLQNTMGINCETCIDGYYRPHKVSPYEDEPCRPCNC--- :. : :.. . :::: : CCDS30 SGCNCNGHASSCDPVYGHCLNCQHNTEGPQCNKCKAGFF--GDAMKATATSCRPCPCPYI 770 780 790 800 810 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 DPVGSLSSVCIKDDLHSDLHNGKQPGQCP-CKEGYTGEKCDRCQLGYKDYPTCVSCGCNP : .:..:. : .:. . : : ::::..:. : ::. : . : : CCDS30 DASRRFSDTCFLDT------DGQ--ATCDACAPGYTGRRCESCAPGYEGNPIQPGGKCRP 820 830 840 850 860 870 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 VGSA---SDE----PCTGP-CVCKENVEGKACDRCKPGFYNLKEKNPRGCSECFCFGVSD :.. :: .: : ::.:: :. :..: : ..:. .:: :: .:::.::: CCDS30 VNQEIVRCDERGSMGTSGEACRCKNNVVGRLCNECADGSFHLSTRNPDGCLKCFCMGVSR 880 890 900 910 920 930 520 530 540 550 560 pF1KE2 VCSSLSWPVGQVNSMS---GWLVTDLISPRKIPSQQDALGGRHQVSINNTAVMQRLAPKY :.: :: .:... : : . .: . . . .... . .. .. . :. : CCDS30 HCTSSSWSRAQLHGASEEPGHF--SLTNAASTHTTNEGIFSPTPGELGFSSFHRLLSGPY 940 950 960 970 980 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 YWAAPEAYLGNKLTAFGGFLKYTVSYDIPVETVDSNLMSHADVIIKGNGLTLSTQAEGLS .:. : .::.:.:..:: :..::. . .. : .. :...::.. : .. . CCDS30 FWSLPSRFLGDKVTSYGGELRFTVTQR--SQPGSTPLHGQPLVVLQGNNIILEHHV-AQE 990 1000 1010 1020 1030 1040 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 LQPYEEYLNVVRLVPENFQDFHSKRQIDRDQLMTVLANVTHLLIRANYNSAKMALYRLES .: . .: . . .: . . :..:. .::.. :::::.: . . : :. . CCDS30 PSPGQPSTFIVPFREQAWQR-PDGQPATREHLLMALAGIDTLLIRASY-AQQPAESRVSG 1050 1060 1070 1080 1090 1100 690 700 710 720 730 740 pF1KE2 VSLDIASSNAIDLVVAADVEHCECPQGYTGTSCESCLSGYYRVDGILFGGICQPCECHGH .:.:.: . : .::.: :: :: : ::..: .:: :. . :. : :. : :::: CCDS30 ISMDVAVPEETGQDPALEVEQCSCPPGYRGPSCQDCDTGYTRTPSGLYLGTCERCSCHGH 1110 1120 1130 1140 1150 1160 750 760 770 780 790 800 pF1KE2 AAECNVH-GVCIACAHNTTGVHCEQCLPGFYGEPSRGTPGDCQPCACPLTIASNNFSPTC . :. . :.: .: :.: : .:::: ::.::. .:::: ::: : : :... . :: CCDS30 SEACEPETGACQGCQHHTEGPRCEQCQPGYYGDAQRGTPQDCQLCPCYGDPAAGQAAHTC 1170 1180 1190 1200 1210 1220 810 820 830 840 850 860 pF1KE2 HLNDGDEVVCDWCAPGYSGAWCERCADGYYGNPTVPGESCVPCDCSGNVDPSEAGHCDSV :. . .:: :.::.:: ::::: ::::::. CCDS30 FLDTDGHPTCDACSPGHSGRHCERCAPGYYGNPS-------------------------- 1230 1240 1250 870 880 890 900 910 920 pF1KE2 TGECLKCLGNTDGAHCERCADGFYGDAVTAKNCRACECHVKGSHSAVCHLETGLCDCKPN .: :.: CCDS30 -----------QGQPCQR------------------------------------------ 1260 930 940 950 960 970 980 pF1KE2 VTGQQCDQCLHGYYGLDSGHGCRPCNCSVAGSVSDGCTDEGQCHCVPGVAGKRCDRCAHG :: ::: CCDS30 ----------------DSQ--------------------------VPG------------ 1270 990 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE2 FYAYQDGSCTPCDCPHTQNTCDPETGECVCPPHTQGVKCEECEDGHWGYDAEVGCQACNC : : .:::. CCDS30 ----------PIGC-----NCDPQ------------------------------------ 1280 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KE2 SLVGSTHHRCDVVTGHCQCKSKFGGRACDQCSLGYRDFPDCVPCDCDLRGTSGDACNLEQ ::. .::.. :.::::.. CCDS30 ---GSVSSQCDAA-GQCQCKAQ-------------------------------------- 1290 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KE2 GLCGCVEETGACPCKENVFGPQCNECREGTFALRADNPLGCSPCFCSGLSHLCSE---LE : : :..:: : : :.:: :: :::: :... :. . CCDS30 -----------------VEGLTCSHCRPHHFHLSASNPDGCLPCFCMGITQQCASSAYTR 1300 1310 1320 1330 1340 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KE2 DYVRTPVTLGSDQPLLRVVSQSNLRGTTEGVYYQAPDFLLDAATVRQHIRAEPFYWRLPQ . : . :. : . : : : : : : . .:. . .. : :::.::. CCDS30 HLISTHFAPGDFQGFALVNPQRNSRLTGEFTVEPVPEGAQLSFGNFAQLGHESFYWQLPE 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1230 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KE2 QFQGDQLMAYGGKLKYSVAFYSLDGVGTSNFEPQVLIKGGRIRKQVIYMDAPAPENGVRQ .:::.. ::::::.:... :. :. .:.: : :. : .. . :: .. :. CCDS30 TYQGDKVAAYGGKLRYTLS-YTAGPQGSPLSDPDVQITGNNI---MLVASQPALQGPERR 1410 1420 1430 1440 1450 1290 1300 1310 1320 1330 1340 pF1KE2 EQEVAMRENFWKYFNSVSEKPVTREDFMSVLSDIEYILIKASYGQGLQQSRISDISMEVG :. .::.::. .. .:.::: .. .:.:.. .::.:.... . :: .:.::. CCDS30 SYEIMFREEFWRRPDG---QPATREHLLMALADLDELLIRATFSSVPLAASISAVSLEVA 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1350 1360 1370 1380 1390 1400 pF1KE2 RKAEKLHPEEEVASLLENCVCPPGTVGFSCQDCAPGYHRGKLPAGSDRGPRPLVAPCVPC . . . .:. : .:.: :::: .:.::::::::: : : .. : : CCDS30 QPGPSNRPR---ALEVEECRCPPGYIGLSCQDCAPGYTR--------TGSGLYLGHCELC 1520 1530 1540 1550 1560 1410 1420 1430 1440 1450 1460 pF1KE2 SCNNHSDTCDPNTGKCLNCGDNTAGDHCDVCTSGYYGKVT-GSASDCALCACPHSPPAS- ::.::: : :.:: : .: :.::. :..:. :::: .: :. :: :::: . : . CCDS30 ECNGHSDLCHPETGACSQCQHNAAGEFCELCAPGYYGDATAGTPEDCQPCACPLTNPENM 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1470 1480 1490 1500 1510 1520 pF1KE2 FSPTCVLEGDHDFRCDACLLGYEGKHCERCSSSYYGNPQTPGGSCQKCDCNPHGSVHGDC :: :: : .:: :: :: :..::.:. .: :::.. ::.: CCDS30 FSRTCESLGAGGYRCTACEPGYTGQYCEQCGPGYVGNPSVQGGQCLPETNQAPLVVEVHP 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1530 1540 1550 1560 1570 1580 pF1KE2 DRTSGQCVCRLGASGLRCDECEPRHILMETDCVSCDDECVGVLLNDLDEIGDAVLSLNLT CCDS30 ARSIVPQGGSHSLRCQVSGSPPHYFYWSREDGRPVPSGTQQRHQGSELHFPSVQPSDAGV 1690 1700 1710 1720 1730 1740 >>CCDS5750.1 LAMB1 gene_id:3912|Hs108|chr7 (1786 aa) initn: 1152 init1: 338 opt: 1004 Z-score: 595.4 bits: 124.1 E(32554): 7.6e-27 Smith-Waterman score: 1839; 28.2% identity (52.5% similar) in 1434 aa overlap (92-1423:111-1431) 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 RNPQCRICDGNSANPRERHPISHAIDGTNNWWQSPSIQNGREYHWVTITLDLRQVFQVAY :::: .:: : ::: :::. :. .. CCDS57 SQDPYHETLNPDSHLIENVVTTFAPNRLKIWWQS---ENGVEN--VTIQLDLEAEFHFTH 90 100 110 120 130 130 140 150 160 170 pF1KE2 VIIKAANAPRPGNWILERSLD-GTTFSPWQYYAVSDSECLSRY-NITPRRGPPTYRADDE .:. . .. ::. ..::: : : :.. ..:.: .: . . .:. :: .. :. CCDS57 LIM-TFKTFRPAAMLIERSSDFGKTWGVYRYFAY---DCEASFPGIS--TGP--MKKVDD 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE2 VICTSYYSRLVPLEHGE-IHTSLINGRPSADDLSPKLLEFTSARYIRLRLQRIRTLNADL .:: : :: . : .:: : .: . : ::.. .. . .:... ...::. .: CCDS57 IICDSRYSDIEPSTEGEVIFRALDPAFKIEDPYSPRIQNLLKITNLRIKFVKLHTLGDNL 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 MTLSHREPKELDPIVTRRYYYSIKDISVGGMCICYGHASSC-PWDETTKKLQ------CQ . :. : .: .:::.. :. : : :.:::::: : : : ..... :. CCDS57 LD-SRMEIRE-------KYYYAVYDMVVRGNCFCYGHASECAPVDGFNEEVEGMVHGHCM 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 CEHNTCGESCNRCCPGYHQQPWRPGTVSSGNTCEACNCHNKAKDCYYDESVAKQKKSLNT :.::: : .:. : ::. ::::. ..:.:. :::.... .:..: .: ... CCDS57 CRHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRNSNACKKCNCNEHSISCHFDMAVYLATGNVS- 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 AGQFRGGGVCINCLQNTMGINCETCIDGYYRPHKVSPYEDEPCRPCNCDPVGSLS-SVCI :::: .: .:::: ::: : ::. . . . . :. :.:::.:: . ..: CCDS57 ------GGVCDDCQHNTMGRNCEQCKPFYYQHPERDIRDPNFCERCTCDPAGSQNEGIC- 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 pF1KE2 KDDLHSDLHNGKQPGQCPCKEGYTGEKCDRCQLGYKDYPT-----CVSCGCNPVGSA-SD : ..:. .: ::: :: . ::.:: :. :. : . : ::.:::.:. . CCDS57 --DSYTDFSTGLIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKEGFYDLSSEDPFGCKSCACNPLGTIPGG 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 pF1KE2 EPC---TGPCVCKENVEGKACDRCKPGFYNLKEKNPRGCSEC----------FCFGVSDV .:: :: : ::. : :. ::.: : ..:.. . :: : ::. : CCDS57 NPCDSETGHCYCKRLVTGQHCDQCLPEHWGLSN-DLDGCRPCDCDLGGALNNSCFAESGQ 470 480 490 500 510 520 520 530 540 550 560 570 pF1KE2 CSSLSWPVG-QVNSMSGWLVTDLISPRKIPSQQDALGGRHQVSINNTAVMQRLAPKYYWA :: .: : : . .. ... :: ::: . .: :.. : CCDS57 CSCRPHMIGRQCNEVEPGYYFATLDHYLYEAEEANLGP--GVSIVERQYIQDRIPSWTGA 530 540 550 560 570 580 580 590 600 610 620 pF1KE2 A----PEAYLGNKLTAFGGFLKYTVSYDIPVETVDSNLMSH---ADVIIKGNGLTLSTQA . :: : : : . :.. ::: .. . .: .: : . .. : ... CCDS57 GFVRVPE---GAYLEFFIDNIPYSMEYDILIR-YEPQLPDHWEKAVITVQRPGRIPTSSR 590 600 610 620 630 640 630 640 650 660 670 pF1KE2 EG----------LSLQPYEEYLNVVRLVPENFQDFHSKRQIDRDQLMTVLANVTHLLIRA : .::.: .:. . : : :. .. : .: .. . ... CCDS57 CGNTIPDDDNQVVSLSPGSRYVVLPR--PVCFE--KGTNYTVRLELPQYTSSDSD--VES 650 660 670 680 690 680 690 700 710 720 pF1KE2 NYNSAKMALYRLESVSLDIAS-SNAIDLVVAADV------EHC-ECPQGYTGTS-CESCL :. . :::: . ... : ::. .. .: : .. . : . : CCDS57 PYTLIDSLVLMPYCKSLDIFTVGGSGDGVVTNSAWETFQRYRCLENSRSVVKTPMTDVCR 700 710 720 730 740 750 730 740 750 760 770 780 pF1KE2 SGYYRVDGILF--GGICQPCECHGH-AAECNVHGVCIACAHNTTGVHCEQCLPGFYGEPS . . ....: : :. :. .: .. :. .: : :..: :..: :: .: CCDS57 NIIFSISALLHQTGLACE-CDPQGSLSSVCDPNGGQCQCRPNVVGRTCNRCAPGTFGF-- 760 770 780 790 800 810 790 800 810 820 830 840 pF1KE2 RGTPGDCQPCACPLTIASNNFSPTCHLNDGDEVVCDWCAPGYSGAWCERCADGYYGNPTV : :. :.:: : : . : : :. :. : : : . :.:: :..: : CCDS57 -G-PSGCKPCECHLQGSVNAF---CNPVTGQ---CH-CFQGVYARQCDRCLPGHWGFP-- 820 830 840 850 860 850 860 870 880 890 pF1KE2 PGESCVPCDCSGNVDPSEAGHCDSVTGECLKCLGNTDGAHCERCADGFYGDAV--TAKNC :: ::.:.:..: :: ::::::.: : : .:::: :.::: . .. .: CCDS57 ---SCQPCQCNGHAD-----DCDPVTGECLNCQDYTMGHNCERCLAGYYGDPIIGSGDHC 870 880 890 900 910 900 910 920 930 940 pF1KE2 RACECHVKGSHSA-----VCHLETGL----CDCKPNVTGQQCDQCLHGYYGLDS--GHGC : : : : :. :. . : : :. :..::.: ::.: : : .: CCDS57 RPCPCP-DGPDSGRQFARSCYQDPVTLQLACVCDPGYIGSRCDDCASGYFGNPSEVGGSC 920 930 940 950 960 970 950 960 970 980 990 1000 pF1KE2 RPCNCSVAGSVSD--GCTDE-GQC-HCVPGVAGKRCDRCAHGFY--AYQDGSCTPCDC-- .::.: ...: .: : :.: .:. . :..:. : :.: : :. .: : : CCDS57 QPCQCHNNIDTTDPEACDKETGRCLKCLYHTEGEHCQFCRFGYYGDALQQ-DCRKCVCNY 980 990 1000 1010 1020 1030 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KE2 -----PHTQNT---CDPETGECVCPPHTQGVKCEECEDGHWGYDAEVGCQACNCSLVGST : ... :: ::.:.: :.. : .:..: . : . .::. :::. . : CCDS57 LGTVQEHCNGSDCQCDKATGQCLCLPNVIGQNCDRCAPNTWQLASGTGCDPCNCNAAHSF 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1060 1070 1080 1090 1100 1110 pF1KE2 HHRCDVVTGHCQCKSKFGGRACDQCSLGYRDFPD--CVPCDCDLRGTSGDACNLEQGLCG :. ::.::: ::::.:..:. . :: : :::: :: :. CCDS57 GPSCNEFTGQCQCMPGFGGRTCSECQELFWGDPDVECRACDCDPRGIETPQCD------- 1100 1110 1120 1130 1140 1120 1130 1140 1150 1160 1170 pF1KE2 CVEETGACPCKENVFGPQCNECREGTFALRADNPLGCSPCFCSGLSHLCSELEDYVRTPV . :: : : :.: ::.:..: .: .. : :.:: : : : : . . . CCDS57 --QSTGQCVCVEGVEGPRCDKCTRGYSGVFPD----CTPC------HQCFALWDVIIAEL 1150 1160 1170 1180 1190 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KE2 TLGSDQPLLRVVSQSNLRGTTEGVYYQAPDFLLDAAT-----VRQHIRAEPFYWRLPQQF : . . .:. .. .. :. : : .. : . .. . : :::. . . : CCDS57 T-NRTHRFLEKAKALKISGVI-GPYRETVDSVERKVSEIKDILAQSPAAEPLK-NIGNLF 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1230 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KE2 Q-GDQLMAYGGKLKYSVAFYSLDGVGTSNFEPQVLIKGGRIRKQVIYMDAPAPENGVRQE . ...:. .. .: : .. :: . : .. .. .: . : . .. CCDS57 EEAEKLIKDVTEMMAQVEVKLSDTTSQSNSTAKEL---DSLQTEAESLDNTVKE--LAEQ 1260 1270 1280 1290 1300 1290 1300 1310 1320 1330 1340 pF1KE2 QEVAMRENFWKYFNSVS---EKPVTREDFMSVLSDIEYILIKASYGQGLQQSRISDISME : .. ..:.. . . :. ... . .. : .:...:. :. :: CCDS57 LEFIKNSDIRGALDSITKYFQMSLEAEERVNASTTEPNSTVEQS---ALMRDRVEDVMME 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1350 1360 1370 1380 1390 1400 pF1KE2 VGRKAEKLHPEEEVASLLENCVCPPGTVGFSCQDCAPGYHRGKLPAGSDRGPRPLVAPCV :... . .:: : ::.. . .. .: ... :. : : : CCDS57 --RESQFKEKQEEQARLLDELAGKLQSLDLSAA--------AEMTCGTPPG-----ASCS 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 pF1KE2 PCSCNNHSDTCDPNTGKCLN--CGDNTAGDHCDVCTSGYYGKVTGSASDCALCACPHSPP :.. . : . :: . :: CCDS57 ETECGGPNCRTDEGERKCGGPGCGGLVTVAHNAWQKAMDLDQDVLSALAEVEQLSKMVSE 1410 1420 1430 1440 1450 1460 >>CCDS2789.1 LAMB2 gene_id:3913|Hs108|chr3 (1798 aa) initn: 923 init1: 359 opt: 986 Z-score: 585.0 bits: 122.2 E(32554): 2.9e-26 Smith-Waterman score: 1733; 30.1% identity (52.6% similar) in 1108 aa overlap (92-1044:123-1193) 70 80 90 100 110 120 pF1KE2 RNPQCRICDGNSANPRERHPISHAIDGTNNWWQSPSIQNGREYHWVTITLDLRQVFQVAY :::: .:: ::: :::. :. .. CCDS27 SRRPFSARDNPHSHRIQNVVTSFAPQRRAAWWQS---ENG--IPAVTIQLDLEAEFHFTH 100 110 120 130 140 130 140 150 160 170 180 pF1KE2 VIIKAANAPRPGNWILERSLD-GTTFSPWQYYAVSDSECLSRYNITPRRGPPTYRADDEV .:. . .. ::. ..::: : : : :. : . .: . . .: .:: : :.: CCDS27 LIM-TFKTFRPAAMLVERSADFGRT---WHVYRYFSYDCGADFPGVPL-APP--RHWDDV 150 160 170 180 190 200 190 200 210 220 230 pF1KE2 ICTSYYSRLVPLEHGE-IHTSLINGRPSADDLSPKLLEFTSARYIRLRLQRIRTLNADLM .: : ::.. : .:: :. : . : : : .. .. . .:. : :..::. .:. CCDS27 VCESRYSEIEPSTEGEVIYRVLDPAIPIPDPYSSRIQNLLKITNLRVNLTRLHTLGDNLL 210 220 230 240 250 260 240 250 260 270 280 290 pF1KE2 TLSHREPKELDPIVTRRYYYSIKDISVGGMCICYGHASSC-PWDETTKKLQ------CQC .:: .: .:::.. .. : : :.:::::: : : . . . : : CCDS27 D-PRREIRE-------KYYYALYELVVRGNCFCYGHASECAPAPGAPAHAEGMVHGACIC 270 280 290 300 310 300 310 320 330 340 350 pF1KE2 EHNTCGESCNRCCPGYHQQPWRPGTVSSGNTCEACNCHNKAKDCYYDESVAKQKKSLNTA .::: : .:..: :.. ::::. . ...:. :.::.....:..: .: . ... CCDS27 KHNTRGLNCEQCQDFYRDLPWRPAEDGHSHACRKCECHGHTHSCHFDMAVYLASGNVS-- 320 330 340 350 360 370 360 370 380 390 400 410 pF1KE2 GQFRGGGVCINCLQNTMGINCETCIDGYYRPHKVSPYEDEPCRPCNCDPVGSLSS-VCIK :::: .: .:: : .:: : .:: . . :: :.:::.:: .. : CCDS27 -----GGVCDGCQHNTAGRHCELCRPFFYRDPTKDLRDPAVCRSCDCDPMGSQDGGRC-- 380 390 400 410 420 420 430 440 450 460 pF1KE2 DDLHSDLHNGKQPGQCPCKEGYTGEKCDRCQLGY-----KDYPTCVSCGCNPVGSA-SDE : :.: : ::: ::: .: .:..:. :. .: : : :: :.. .. CCDS27 -DSHDDPALGLVSGQCRCKEHVVGTRCQQCRDGFFGLSISDRLGCRRCQCNARGTVPGST 430 440 450 460 470 480 470 480 490 500 pF1KE2 PC---TGPCVCKENVEGKACDRCKPGFYNLKEK---------------NPR---GCSECF :: .: : ::. : :..:::: :: ..:.. .:. : ..: CCDS27 PCDPNSGSCYCKRLVTGRGCDRCLPGHWGLSHDLLGCRPCDCDVGGALDPQCDEGTGQCH 490 500 510 520 530 540 510 520 530 540 550 pF1KE2 C--FGVSDVCSS------------LSWPVGQVNSMSGWLVTDLISPRKIPSQQDALGGRH : :. : . : : . .. .. .: :..: . :: . : CCDS27 CRQHMVGRRCEQVQPGYFRPFLDHLIWEAEDTRGQVLDVVERLVTPGETPSWTGSGFVRL 550 560 570 580 590 600 560 570 580 590 pF1KE2 Q---------VSINNTA---VMQRLAPKY--YWAAPEAYLGNKLTAFGGFLKYTV-SYDI : .:. .. .. :: :. :: : . : ... .. . CCDS27 QEGQTLEFLVASVPKAMDYDLLLRLEPQVPEQWAELELIVQRP----GPVPAHSLCGHLV 610 620 630 640 650 600 610 620 630 pF1KE2 PVET-VDSNLMSHADVIIKGN------GLTLSTQAE----GLSLQPYEEY------LNVV : . ....:. :: .: : :.. . . . : : :: : .. . CCDS27 PKDDRIQGTLQPHARYLIFPNPVCLEPGISYKLHLKLVRTGGSAQPETPYSGPGLLIDSL 660 670 680 690 700 710 640 650 660 670 680 690 pF1KE2 RLVP-----ENFQDFHSKRQIDRDQLMTVLANVTHLLIRANYNSAKMALYRLESVSLDIA :.: : :. . ..:. . . :. .. . .. : :.: : CCDS27 VLLPRVLVLEMFSG-GDAAALERQATFERYQCHEEGLVPSKTSPSEACAPLLISLSTLIY 720 730 740 750 760 770 700 710 720 730 pF1KE2 SS------NAIDLVVAADVEH---CECPQGYTGTSCESCLSGYYRV------------DG .. : . . : : : : .: :. : ::: .: CCDS27 NGALPCQCNPQGSLSSECNPHGGQCLCKPGVVGRRCDLCAPGYYGFGPTGCQACQCSHEG 780 790 800 810 820 830 740 750 760 pF1KE2 IL-----------------FG-----------GI--CQPCECHGHAAECNVH-GVCIACA : :: :. :.:: :.::: :::.: :.:..: CCDS27 ALSSLCEKTSGQCLCRTGAFGLRCDRCQRGQWGFPSCRPCVCNGHADECNTHTGACLGCR 840 850 860 870 880 890 770 780 790 800 810 pF1KE2 HNTTGVHCEQCLPGFYGEPSRGTPGDCQPCACPLTIASN-NFSPTCHLND-GDEVVCDWC .: : :::.:. ::.:.: :.:.:: :: .:. .:. .:: .. ....:: : CCDS27 DHTGGEHCERCIAGFHGDPRLPYGGQCRPCPCPEGPGSQRHFATSCHQDEYSQQIVCH-C 900 910 920 930 940 950 820 830 840 850 860 870 pF1KE2 APGYSGAWCERCADGYYGNPTVPGESCVPCDCSGNVDPSEAGHCDSVTGECLKCLGNTDG ::.: :: :: :..:.:. :: : :.::::.:: . :: ::.::.:: .:.: CCDS27 RAGYTGLRCEACAPGHFGDPSRPGGRCQLCECSGNIDPMDPDACDPHTGQCLRCLHHTEG 960 970 980 990 1000 1010 880 890 900 910 920 930 pF1KE2 AHCERCADGFYGDAVTAKNCRACECHVKGSHSAVC------HLE--TGLCDCKPNVTGQQ :: .: ::.:.:. ..:. : :.. :.. : : . .: : : ::: : . CCDS27 PHCAHCKPGFHGQAAR-QSCHRCTCNLLGTNPQQCPSPDQCHCDPSSGQCPCLPNVQGPS 1020 1030 1040 1050 1060 1070 940 950 960 970 980 990 pF1KE2 CDQCLHGYYGLDSGHGCRPCNCSVAGSVSDGCTD-EGQCHCVPGVAGKRCDRCAHGFYAY ::.: ....: :::::.:: : . . . :.. ::::: : .:. :..: . .. CCDS27 CDRCAPNFWNLTSGHGCQPCACHPSRARGPTCNEFTGQCHCRAGFGGRTCSECQELHWGD 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE2 QDGSCTPCDCPHT---QNTCDPETGECVCPPHTQGVKCEECEDGHWG-YDAEVGCQACNC .: ::: : ::.: : : ..::.:..: : : . : :.:: CCDS27 PGLQCHACDCDSRGIDTPQCHRFTGHCSCRPGVSGVRCDQCARGFSGIFPACHPCHACFG 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KE2 SLVGSTHHRCDVVTGHCQCKSKFGGRACDQCSLGYRDFPDCVPCDCDLRGTSGDACNLEQ CCDS27 DWDRVVQDLAARTQRLEQRAQELQQTGVLGAFESSFWHMQEKLGIVQGIVGARNTSAAST 1200 1210 1220 1230 1240 1250 >>CCDS1351.1 LAMC1 gene_id:3915|Hs108|chr1 (1609 aa) initn: 940 init1: 271 opt: 929 Z-score: 552.7 bits: 116.1 E(32554): 1.8e-24 Smith-Waterman score: 2346; 36.6% identity (61.3% similar) in 1067 aa overlap (12-1044:40-1031) 10 20 30 40 pF1KE2 MRGGVLLVLLLCVAAQCRQRGLFPAILNLASNAHISTNATC :. : . .: ..: : :. . .. :: CCDS13 ALRPRGRLWPVLAVLAAAAAAGCAQAAMDECTDEGGRPQRCMPEFVNAAFNVTVVATNTC 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 pF1KE2 GEKGPEMFCKLVEHVPGRPVRNPQCRICDGNSANPRERHPISHAIDGTNN----WWQSPS : :: .: . : : . .:..:: ...:. .: . : .:. :::: . CCDS13 GTP-PEEYC-VQTGVTGV---TKSCHLCD--AGQPHLQHGAAFLTDYNNQADTTWWQSQT 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KE2 IQNGREY-HWVTITLDLRQVFQVAYVIIKAANAPRPGNW-ILERSLDGTTFSPWQYYAVS . : .: ...:: : ..:...:: .: .. :: .. : .:. . . :.:::. : CCDS13 MLAGVQYPSSINLTLHLGKAFDITYVRLKF-HTSRPESFAIYKRTREDGPWIPYQYYSGS 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KE2 DSECLSRYNITPRRGPPTYRADDEVICTSYYSRLVPLEHGEIHTSLINGRPSAD--DLSP : . :. . : : .....::. .: . :: :.. : ..::::: : :: CCDS13 ---CENTYSKANRGFIRTGGDEQQALCTDEFSDISPLTGGNVAFSTLEGRPSAYNFDNSP 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KE2 KLLEFTSARYIRLRLQRIRTLNADLMTLSHREPKELDPIVTRRYYYSIKDISVGGMCICY : :...: ::. :.:. :.. .... :: : . :::.:.:..::: : : CCDS13 VLQEWVTATDIRVTLNRLNTFGDEVFN---------DPKVLKSYYYAISDFAVGGRCKCN 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 GHASSCPWDETTKKLQCQCEHNTCGESCNRCCPGYHQQPWRPGTVSSGNTCEACNCHNKA :::: : .: : : :.:.::: : .:..: : ....::: .:. :.. : :.:.... CCDS13 GHASECMKNEFDK-LVCNCKHNTYGVDCEKCLPFFNDRPWRRATAESASECLPCDCNGRS 290 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 KDCYYDESVAKQKKSLNTAGQFRGGGVCINCLQNTMGINCETCIDGYYRPHKVSPYEDEP ..::.: . . ..:. :: : :: .:: : .:: : ....: ..: CCDS13 QECYFDPELYR------STGH---GGHCTNCQDNTDGAHCERCRENFFRLG-----NNEA 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 pF1KE2 CRPCNCDPVGSLSSVCIKDDLHSDLHNGKQPGQCPCKEGYTGEKCDRCQLGYKDYPT--C : :.:.::::::. : :. :.: :: : :.:::::: :... : CCDS13 CSSCHCSPVGSLSTQC--DSY----------GRCSCKPGVMGDKCDRCQPGFHSLTEAGC 400 410 420 430 440 460 470 480 490 500 pF1KE2 VSCGCNPVGSASDEPC---TGPCVCKENVEGKACDRCKPGFYNLKEKNPRGCSECFCFGV :.:.: :: :: : :: ::::.:::: :.::::::.::. .:::::. ::::: CCDS13 RPCSCDPSGSI-DE-CNIETGRCVCKDNVEGFNCERCKPGFFNLESSNPRGCTPCFCFGH 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 SDVCSSLSWPVG-QVNSMSGWLVTDLISPRKIPSQQDALGGRHQVSIN--NTAVMQRLAP :.::.. :: .: :.:. . : . : :.:. . . : . . ::.. CCDS13 SSVCTN---AVGYSVYSISSTFQIDEDGWR--AEQRDGSEASLEWSSERQDIAVISDSYF 510 520 530 540 550 570 580 590 600 610 620 pF1KE2 KYYWAAPEAYLGNKLTAFGGFLKYTVSYDIPVETVDSNLMSHADVIIKGNGLTLSTQ--A :. :: .::... ..: ..:... :. :. : : :....: :: .:. : CCDS13 PRYFIAPAKFLGKQVLSYG----QNLSFSFRVDRRDTRL-SAEDLVLEGAGLRVSVPLIA 560 570 580 590 600 610 630 640 650 660 670 680 pF1KE2 EGLSLQPYEEYLNVVRLVPENFQDFHSKRQIDRDQLMTVLANVTHLLIRANYNSAKMALY .: : : : .. : . : :. . . ... .: :.: . ::..: : . : : CCDS13 QGNSY-PSETTVKYVFRLHEA-TDYPWRPALTPFEFQKLLNNLTSIKIRGTY-SERSAGY 620 630 640 650 660 690 700 710 720 730 740 pF1KE2 RLESVSLDIASSNAIDLVVAADVEHCECPQGYTGTSCESCLSGYYRVDGILFGGI--CQP :..:.: ::. : :. :: : :: :: : :: ::::: : : : : CCDS13 -LDDVTL--ASARPGPGVPATWVESCTCPVGYGGQFCEMCLSGYRRETPNL-GPYSPCVL 670 680 690 700 710 720 750 760 770 780 790 800 pF1KE2 CECHGHAAECNVH-GVCIACAHNTTGVHCEQCLPGFYGEPSRGTPGDCQPCACPLTIASN : :.::. :. . ::: : ::.: :::.: :.::. . :: .::::: :: .: CCDS13 CACNGHSETCDPETGVC-NCRDNTAGPHCEKCSDGYYGDSTAGTSSDCQPCPCP-GGSSC 730 740 750 760 770 780 810 820 830 840 850 pF1KE2 NFSPTCHLNDGDEVVCDWCAPGYSGAWCERCADGYYGNP---TVPGESCVPCDCSGNVDP : . :::: : : .: :: : :::.:.: . : . : :.:: :.:: CCDS13 AVVPKTK-----EVVCTNCPTGTTGKRCELCDDGYFGDPLGRNGPVRLCRLCQCSDNIDP 790 800 810 820 830 860 870 880 890 900 910 pF1KE2 SEAGHCDSVTGECLKCLGNTDGAHCERCADGFYGDAVT---AKNCRACECHVKGS--HSA . .:.:. .:::::::. :: : .:.:: :::.:. .. : .:.::.:.. :. ... CCDS13 NAVGNCNRLTGECLKCIYNTAGFYCDRCKDGFFGNPLAPNPADKCKACNCNLYGTMKQQS 840 850 860 870 880 890 920 930 940 950 960 970 pF1KE2 VCHLETGLCDCKPNVTGQQCDQCLHGYYGLDSGHGCRPCNCSVAGSVSDGCT-DEGQCHC :. :: :.: :.::::.: : :.:.:.::.::. :.: . ::.. : :::.: CCDS13 SCNPVTGQCECLPHVTGQDCGACDPGFYNLQSGQGCERCDCHALGSTNGQCDIRTGQCEC 900 910 920 930 940 950 980 990 1000 1010 1020 pF1KE2 VPGVAGKRCDRCAHGFYAYQDGSCTPCDCPHTQNT----CDPETGECVCPPHTQGVKCEE ::..:..:.:: . ... .: :::: : ... : . :.: : : .:.. CCDS13 QPGITGQHCERCEVNHFGFGPEGCKPCDC-HPEGSLSLQCK-DDGRCECREGFVGNRCDQ 960 970 980 990 1000 1010 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KE2 CEDGHWGYDAEVGCQACNCSLVGSTHHRCDVVTGHCQCKSKFGGRACDQCSLGYRDFPDC ::.... . ::: : CCDS13 CEENYFYNRSWPGCQECPACYRLVKDKVADHRVKLQELESLIANLGTGDEMVTDQAFEDR 1020 1030 1040 1050 1060 1070 >>CCDS34732.1 LAMB4 gene_id:22798|Hs108|chr7 (1761 aa) initn: 975 init1: 322 opt: 872 Z-score: 519.6 bits: 110.1 E(32554): 1.3e-22 Smith-Waterman score: 1760; 30.3% identity (54.5% similar) in 1203 aa overlap (82-1116:94-1239) 60 70 80 90 100 110 pF1KE2 LVEHVPGRPVRNPQCRICDGNSANPRERHPISHAIDGTNNWWQSPSIQNGREYHWVTITL .: : ..:::: .:: .. :.: : CCDS34 EGEQKCFICDSRFPYDPYDQPNSHTIENVIVSFEPDREKKWWQS---ENGLDH--VSIRL 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 pF1KE2 DLRQVFQVAYVIIKAANAPRPGNWILERSLD-GTTFSPWQYYAVSDSECLSRY-NITPRR ::. .:. ...:. . .. ::. ..::: : : ... ..:.: ..: . . ::: CCDS34 DLEALFRFSHLIL-TFKTFRPAAMLVERSTDYGHNWKVFKYFA---KDCATSFPNITS-- 120 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 220 pF1KE2 GPPTYRADDEVICTSYYSRLVPLEHGEIHTSLINGRPS---ADDLSPKLLEFTSARYIRL : .: ..: : :: . : ::. .... :: . :: . .... .:. CCDS34 GQAQGVGD--IVCDSKYSDIEPSTGGEVVLKVLD--PSFEIENPYSPYIQDLVTLTNLRI 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KE2 RLQRIRTLNADLMTLSHREPKELDPIVTRRYYYSIKDISVGGMCICYGHASSC-PWDETT . ...::. : :..:. :: .:::.. .. : : :.: :::: : : .. CCDS34 NFTKLHTLGDAL--LGRRQNDSLD-----KYYYALYEMIVRGSCFCNGHASECRPMQKMR 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KE2 KKL---------QCQCEHNTCGESCNRCCPGYHQQPWRPGTVSSGNTCEACNCHNKAKDC . :: :.::: : .:.:: ... ::::.. . :.:..:.:..... : CCDS34 GDVFSPPGMVHGQCVCQHNTDGPNCERCKDFFQDAPWRPAADLQDNACRSCSCNSHSSRC 290 300 310 320 330 340 340 350 360 370 380 390 pF1KE2 YYDESVAKQKKSLNTAGQFRGGGVCINCLQNTMGINCETCIDGYYR-PHKV--SPYEDEP ..: .. : ..: .:::: .: .:: : .:. : .:: : :. .:: CCDS34 HFDMTTY-----LASGGL--SGGVCEDCQHNTEGQHCDRCRPLFYRDPLKTISDPYA--- 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 pF1KE2 CRPCNCDPVGSLSS-VCIKDDLHSDLHNGKQPGQCPCKEGYTGEKCDRCQ-----LGYKD : ::.::: :..:. .:.. ::: :. ::: :::. : :::.:. :. : CCDS34 CIPCECDPDGTISGGICVS---HSDPALGSVAGQCLCKENVEGAKCDQCKPNHYGLSATD 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 pF1KE2 YPTCVSCGCNPVGSASDEPC---TGPCVCKENVEGKACDRCKPGFYNLKEKNPRGCSECF : : :::.:: : :: :.: : : :..: :...: . . .::: : CCDS34 PLGCQPCDCNPLGSLPFLTCDVDTGQCLCLSYVTGAHCEECTVGYWGLGN-HLHGCSPCD 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 pF1KE2 C-FG--VSDVCSSLSWPVGQVNSMSGWLVTDLISPRKIPSQQDALGGRHQVSINNTAVMQ : .: :.::: . :: . :: . :. : . . ......: CCDS34 CDIGGAYSNVCSPKN---GQCECRPH--VTGRSCSEPAPGYFFAPLNFYLYEAEEATTLQ 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KE2 RLAP---KYYWAAPEAYL-------GNKLTAFG-GF--------LKYTVS-YDIPVE--- ::: . . .: ... :: .: : :: :...:. .::. CCDS34 GLAPLGSETFGQSPAVHVVLGEPVPGNPVTWTGPGFARVLPGAGLRFAVNNIPFPVDFTI 570 580 590 600 610 620 600 610 620 630 pF1KE2 TVDSNLMSHAD----VIIKGNG-------LTLSTQAEGLSL---------------QPYE .. . .: :: .... : ::... ....: .: CCDS34 AIHYETQSAADWTVQIVVNPPGGSEHCIPKTLQSKPQSFALPAATRIMLLPTPICLEPDV 630 640 650 660 670 680 640 650 660 pF1KE2 EY---------------------LNVVRLVPE--NFQDFHSKRQIDRDQLMT-------- .: .. . :.:. ....: ::...:. :: . CCDS34 QYSIDVYFSQPLQGESHAHSHVLVDSLGLIPQINSLENFCSKQDLDEYQLHNCVEIASAM 690 700 710 720 730 740 670 680 690 700 pF1KE2 ---VLANVTHLLI---RANYNSAKMALYRLESVSLDIASS------NAIDLVV------- :: .. . :: :. ... .: . :. . : . ::: CCDS34 GPQVLPGACERLIISMSAKLHDGAVACKCHPQGSVGSSCSRLGGQCQCKPLVVGRCCDRC 750 760 770 780 790 800 710 720 730 740 pF1KE2 ---AADVEH-----CEC-PQGYTGTSCES----C-----LSGYYRVDGILFG--GI--CQ . :. : :.: ::: : :.. : .:: : : : : :. :. CCDS34 STGSYDLGHHGCHPCHCHPQGSKDTVCDQVTGQCPCHGEVSGR-RCDRCLAGYFGFPSCH 810 820 830 840 850 860 750 760 770 780 790 pF1KE2 PCECHGHAAECNVH-GVCIACAHNTTGVHCEQCLPGFYGEPSRGTPGDCQPCACPLTIAS :: :. : :. . : :. :. ::: .::.:. :.::.:: : : :.:: :: .: CCDS34 PCPCNRFAELCDPETGSCFNCGGFTTGRNCERCIDGYYGNPSSGQP--CRPCLCPDDPSS 870 880 890 900 910 800 810 820 830 840 850 pF1KE2 NN-FSPTCHLND-GDEVVCDWCAPGYSGAWCERCADGYYGNPTVPGESCVPCDCSGNVDP :. :. .:. : ...:.:. : ::.:. : .:. :.:::: . : : :: :..:.: CCDS34 NQYFAHSCYQNLWSSDVICN-CLQGYTGTQCGECSTGFYGNPRISGAPCQPCACNNNIDV 920 930 940 950 960 970 860 870 880 890 900 pF1KE2 SEAGHCDSVTGECLKCLGNTDGAHCERCADGFYGDAVTAKNCRACECHVKG--------- .. :. ::::::.:: ::.::.:. : : ::.:.. ..:: : ::..: CCDS34 TDPESCSRVTGECLRCLHNTQGANCQLCKPGHYGSALN-QTCRRCSCHASGVSPMECPPG 980 990 1000 1010 1020 1030 910 920 930 940 950 960 pF1KE2 SHSAVCHLETGLCDCKPNVTGQQCDQCLHGYYGLDSGHGCRPCNCSVAGSVSDGCTD-EG . . .: :: : : ::::: ::.: ::..: :.::. :.:. : :. : . : CCDS34 GGACLCDPVTGACPCLPNVTGLACDRCADGYWNLVPGRGCQSCDCDPRTSQSSHCDQLTG 1040 1050 1060 1070 1080 1090 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KE2 QCHCVPGVAGKRCDRCAHGFYAYQDGSCTPCDCPH--TQNT-CDPETGECVCPPHTQGVK :: : : .::::..: ...:. : : :::: . ::. :::.:: : : ..: . CCDS34 QCPCKLGYGGKRCSECQENYYGDPPGRCIPCDCNRAGTQKPICDPDTGMCRCREGVSGQR 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KE2 CEECEDGH-WGYDAEVGCQACNCSLVGSTHHRCDVVTGHCQCKSKFGGRACDQCSLGYRD :..: :: . . . :. : . : . .. : .... :. . CCDS34 CDRCARGHSQEFPTCLQCHLC----FDQWDHTISSLSKAVQGLMRLAANMEDK----RET 1160 1170 1180 1190 1200 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KE2 FPDCVPCDCDLRGTSGDACNLEQGLCGCVEETGACPCKENVFGPQCNECREGTFALRADN .: :. :.. :.. ..:. : : .: CCDS34 LP---VCEADFKDLRGNVSEIERILKHPVFPSGKFLKVKDYHDSVRRQIMQLNEQLKAVY 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1150 1160 1170 1180 1190 1200 pF1KE2 PLGCSPCFCSGLSHLCSELEDYVRTPVTLGSDQPLLRVVSQSNLRGTTEGVYYQAPDFLL CCDS34 EFQDLKDTIERAKNEADLLLEDLQEEIDLQSSVLNASIADSSENIKKYYHISSSAEKKIN 1270 1280 1290 1300 1310 1320 3075 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sat Nov 5 21:47:56 2016 done: Sat Nov 5 21:47:58 2016 Total Scan time: 6.140 Total Display time: 2.430 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]