FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3477, 1604 aa 1>>>pF1KE3477 1604 - 1604 aa - 1604 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4695+/-0.00116; mu= 13.5378+/- 0.069 mean_var=131.9365+/-26.121, 0's: 0 Z-trim(106.2): 112 B-trim: 0 in 0/51 Lambda= 0.111659 statistics sampled from 8713 (8830) to 8713 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.622), E-opt: 0.2 (0.271), width: 16 Scan time: 5.010 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS32697.1 USP32 gene_id:84669|Hs108|chr17 (1604) 10957 1778.0 0 CCDS11069.2 USP6 gene_id:9098|Hs108|chr17 (1406) 5835 952.9 0 CCDS8963.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12 ( 952) 1124 193.9 2.1e-48 CCDS58251.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12 ( 981) 1111 191.8 9.4e-48 CCDS2794.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3 ( 916) 960 167.5 1.9e-40 CCDS14277.1 USP11 gene_id:8237|Hs108|chrX ( 963) 938 163.9 2.3e-39 CCDS2793.1 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CCDS89 TEGWNKLVSWY-TLMEGQEPIARK----VVEQGMFVKHCKVEVYLTELKLCENG---NMN 100 110 120 130 140 630 640 650 660 670 680 pF1KE3 NVPSPNAPLKRVLAYTGCFSRMQTIKEIHEYLSQRLRIKEE-DMRLWLYNSENYLTLLDD :: . .: ::. .:: :.. . . . : .: . ::: : . :. CCDS89 NVVT-----RR-------FSKADTIDTIEKEIRKIFSIPDEKETRLWNKYMSNTFEPLNK 150 160 170 180 190 690 700 710 720 pF1KE3 EDHKLEYLKIQDEQHLVIEVRNKDMSWPEEMSF--IANSS---------KIDRHKVP--- : .. . . : :::: .:.: .::. : . ::. : .. : CCDS89 PDSTIQDAGLYQGQVLVIEQKNEDGTWPRGPSTPNVKNSNYCLPSYTAYKNYDYSEPGRN 200 210 220 230 240 250 730 740 750 760 770 780 pF1KE3 -TEKGATGLSNLGNTCFMNSSIQCVSNTQPLTQYFISGRHLYELNRTNPIGMKGHMAKCY . : :::::::::::::.:::.::: :::.::.. .. ::: ::.::.:..:: : CCDS89 NEQPGLCGLSNLGNTCFMNSAIQCLSNTPPLTEYFLNDKYQEELNFDNPLGMRGEIAKSY 260 270 280 290 300 310 790 800 810 820 830 840 pF1KE3 GDLVQELWSGTQKNVAPLKLRWTIAKYAPRFNGFQQQDSQELLAFLLDGLHEDLNRVHEK ..:....::: . :.: .. ....::.:.:.:::: :::::::::::::::::...: CCDS89 AELIKQMWSGKFSYVTPRAFKTQVGRFAPQFSGYQQQDCQELLAFLLDGLHEDLNRIRKK 320 330 340 350 360 370 850 860 870 880 890 900 pF1KE3 PYVELKDSDGRPDWEVAAEAWDNHLRRNRSIVVDLFHGQLRSQVKCKTCGHISVRFDPFN ::..:::.::::: :: :::.:::.:: ::.::.::: ..: . : :..::: :::: CCDS89 PYIQLKDADGRPDKVVAEEAWENHLKRNDSIIVDIFHGLFKSTLVCPECAKISVTFDPFC 380 390 400 410 420 430 910 920 930 940 950 960 pF1KE3 FLSLPLPMDSYMHLEITVIKLDGTT-PVRYGLRLNMDEKYTGLKKQLSDLCGLNSEQILL .:.::::: . ::. ....: : :..: . . . : :: : :. ...... CCDS89 YLTLPLPMKKERTLEVYLVRMDPLTKPMQYKVVVPKIGNILDLCTALSALSGIPADKMIV 440 450 460 470 480 490 970 980 990 1000 1010 pF1KE3 AEVHGSNI-KNFPQDNQKVRLSVSGFLCAFEIPVP--------VSPISASSPTQTDFSSS ..... . . : .:.. . . .::: . . :. . . . CCDS89 TDIYNHRFHRIFAMDENLSSIMERDDIYVFEININRTEDTEHVIIPVCLREKFRHSSYTH 500 510 520 530 540 550 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KE3 PSTNEMFTLTTNGDLPRPIFIPNGMPNTVV--PCGTEKNFTNGM-VNGHMPSLPDSPFTG . . .: .:: . . : .. : : :. ..: . :. ..: CCDS89 HTGSSLFGQPFLMAVPRNN-TEDKLYNLLLLRMCRYVKISTETEETEGSLHCCKDQNING 560 570 580 590 600 610 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KE3 Y-IIAVHRKMMRTELYFLSSQKNRPSLFGMPLIVPCTVHTRKKDLYDAVWIQVSRLASPL ..:.. .:. ... . : . : : .. ... :.: . . . : CCDS89 NGPNGIHEEGSPSEME--TDEPDDESSQDQEL--PSENENSQSE--DSVGGD-NDSENGL 620 630 640 650 660 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KE3 PPQEASNHAQDCDDSMGYQYPFTLRVVQKDGNSCAWCPWY-RFC-RGCKIDCGEDRAFIG ... . . . . :. . . : : . :: : ..: .:.:. CCDS89 CTEDTCKGQLTGHKKRLFTFQFN-NLGNTDINYIKDDTRHIRFDDRQLRLD---ERSFL- 670 680 690 700 710 720 1200 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KE3 NAYIAVDWDPTALHLRYQTSQERVVDEHESVEQSRRAQAEP-INLDSCLRAFTSEEELGE :.:::: . .. . . ..::::: . .: ..: .:.. ::..:.:: CCDS89 ----ALDWDPDLKKRYFDENAAEDFEKHESVEY--KPPKKPFVKLKDCIELFTTKEKLGA 730 740 750 760 770 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KE3 NEMYYCSKCKTHCLATKKLDLWRLPPILIIHLKRFQFVNGRWIKSQ--KIVKFPRESFDP .. .:: .:: : :::::::: :::.:..:::::.. .:..... .: :: ...: CCDS89 EDPWYCPNCKEHQQATKKLDLWSLPPVLVVHLKRFSY--SRYMRDKLDTLVDFPINDLDM 780 790 800 810 820 830 1310 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KE3 SAFLVPRDPALCQHKPLTPQGDELSEPRILAREVKKVDAQSSAGEEDVLLSKSPSSLSAN : ::. . . :.. CCDS89 SEFLINPNAGPCRYNLIAVSNHYGGMGGGHYTAFAKNKDDGKWYYFDDSSVSTASEDQIV 840 850 860 870 880 890 >>CCDS58251.1 USP15 gene_id:9958|Hs108|chr12 (981 aa) initn: 1396 init1: 863 opt: 1111 Z-score: 970.8 bits: 191.8 E(32554): 9.4e-48 Smith-Waterman score: 1168; 29.5% identity (55.9% similar) in 853 aa overlap (534-1322:64-875) 510 520 530 540 550 560 pF1KE3 CLLGANGNILLHLNPQKPGAIDNQPLVTQEPVKATSLTLEGGRLKRTPQLIHGRDYEMVP :. ..: .: . .:: :: ..: CCDS58 DSRWFKQWKKYVGFDSWDKYQMGDQNVYPGPIDNSGLLKDGDAQSLKEHLIDELDYILLP 40 50 60 70 80 90 570 580 590 600 610 620 pF1KE3 EPVWRALYHWYGANLALPRPVIKNSKTDIPELELFPRYLLFLRQQPATRTQQSNIWVNMG : : :: . . .:. .. . : .: .. . ... ::. CCDS58 TEGWNKLVSWY-TLMEGQEPIARK----VVEQGMFVKHCKVEVYLTELKLCENG---NMN 100 110 120 130 140 630 640 650 660 670 680 pF1KE3 NVPSPNAPLKRVLAYTGCFSRMQTIKEIHEYLSQRLRIKEE-DMRLWLYNSENYLTLLDD :: . .: ::. .:: :.. . . . : .: . ::: : . :. CCDS58 NVVT-----RR-------FSKADTIDTIEKEIRKIFSIPDEKETRLWNKYMSNTFEPLNK 150 160 170 180 190 690 700 710 720 pF1KE3 EDHKLEYLKIQDEQHLVIEVRNKDMSWPEEMSF--------------IANSS-------- : .. . . : :::: .:.: .::. : :. :: CCDS58 PDSTIQDAGLYQGQVLVIEQKNEDGTWPRGPSTPKSPGASNFSTLPKISPSSLSNNYNNM 200 210 220 230 240 250 730 740 750 pF1KE3 -----KIDRHKVPT-----------------EKGATGLSNLGNTCFMNSSIQCVSNTQPL : . . .:. . : :::::::::::::.:::.::: :: CCDS58 NNRNVKNSNYCLPSYTAYKNYDYSEPGRNNEQPGLCGLSNLGNTCFMNSAIQCLSNTPPL 260 270 280 290 300 310 760 770 780 790 800 810 pF1KE3 TQYFISGRHLYELNRTNPIGMKGHMAKCYGDLVQELWSGTQKNVAPLKLRWTIAKYAPRF :.::.. .. ::: ::.::.:..:: :..:....::: . :.: .. ....::.: CCDS58 TEYFLNDKYQEELNFDNPLGMRGEIAKSYAELIKQMWSGKFSYVTPRAFKTQVGRFAPQF 320 330 340 350 360 370 820 830 840 850 860 870 pF1KE3 NGFQQQDSQELLAFLLDGLHEDLNRVHEKPYVELKDSDGRPDWEVAAEAWDNHLRRNRSI .:.:::: :::::::::::::::::...:::..:::.::::: :: :::.:::.:: :: CCDS58 SGYQQQDCQELLAFLLDGLHEDLNRIRKKPYIQLKDADGRPDKVVAEEAWENHLKRNDSI 380 390 400 410 420 430 880 890 900 910 920 930 pF1KE3 VVDLFHGQLRSQVKCKTCGHISVRFDPFNFLSLPLPMDSYMHLEITVIKLDGTT-PVRYG .::.::: ..: . : :..::: :::: .:.::::: . ::. ....: : :..: CCDS58 IVDIFHGLFKSTLVCPECAKISVTFDPFCYLTLPLPMKKERTLEVYLVRMDPLTKPMQYK 440 450 460 470 480 490 940 950 960 970 980 990 pF1KE3 LRLNMDEKYTGLKKQLSDLCGLNSEQILLAEVHGSNI-KNFPQDNQKVRLSVSGFLCAFE . . . : :: : :. ........... . . : .:.. . . .:: CCDS58 VVVPKIGNILDLCTALSALSGIPADKMIVTDIYNHRFHRIFAMDENLSSIMERDDIYVFE 500 510 520 530 540 550 1000 1010 1020 1030 1040 pF1KE3 IPVP--------VSPISASSPTQTDFSSSPSTNEMFTLTTNGDLPRPIFIPNGMPNTVV- : . . :. . . . . . .: .:: . . : .. CCDS58 ININRTEDTEHVIIPVCLREKFRHSSYTHHTGSSLFGQPFLMAVPRNN-TEDKLYNLLLL 560 570 580 590 600 610 1050 1060 1070 1080 1090 1100 pF1KE3 -PCGTEKNFTNGM-VNGHMPSLPDSPFTGY-IIAVHRKMMRTELYFLSSQKNRPSLFGMP : : :. ..: . :. ..: ..:.. .:. ... . : . CCDS58 RMCRYVKISTETEETEGSLHCCKDQNINGNGPNGIHEEGSPSEME--TDEPDDESSQDQE 620 630 640 650 660 670 1110 1120 1130 1140 1150 1160 pF1KE3 LIVPCTVHTRKKDLYDAVWIQVSRLASPLPPQEASNHAQDCDDSMGYQYPFTLRVVQKDG : : .. ... :.: . . . : ... . . . . :. . . : CCDS58 L--PSENENSQSE--DSVGGD-NDSENGLCTEDTCKGQLTGHKKRLFTFQFN-NLGNTDI 680 690 700 710 720 1170 1180 1190 1200 1210 1220 pF1KE3 NSCAWCPWY-RFC-RGCKIDCGEDRAFIGNAYIAVDWDPTALHLRYQTSQERVVDEHESV : . :: : ..: .:.:. :.:::: . .. . . ..:::: CCDS58 NYIKDDTRHIRFDDRQLRLD---ERSFL-----ALDWDPDLKKRYFDENAAEDFEKHESV 730 740 750 760 770 1230 1240 1250 1260 1270 1280 pF1KE3 EQSRRAQAEP-INLDSCLRAFTSEEELGENEMYYCSKCKTHCLATKKLDLWRLPPILIIH : . .: ..: .:.. ::..:.:: .. .:: .:: : :::::::: :::.:..: CCDS58 EY--KPPKKPFVKLKDCIELFTTKEKLGAEDPWYCPNCKEHQQATKKLDLWSLPPVLVVH 780 790 800 810 820 830 1290 1300 1310 1320 1330 pF1KE3 LKRFQFVNGRWIKSQ--KIVKFPRESFDPSAFLVPRDPALCQHKPLTPQGDELSEPRILA ::::.. .:..... .: :: ...: : ::. . . :.. CCDS58 LKRFSY--SRYMRDKLDTLVDFPINDLDMSEFLINPNAGPCRYNLIAVSNHYGGMGGGHY 840 850 860 870 880 890 1340 1350 1360 1370 1380 1390 pF1KE3 REVKKVDAQSSAGEEDVLLSKSPSSLSANIISSPKGSPSSSRKSGTSCPSSKNSSPNSSP CCDS58 TAFAKNKDDGKWYYFDDSSVSTASEDQIVSKAAYVLFYQRQDTFSGTGFFPLDRETKGAS 900 910 920 930 940 950 >>CCDS2794.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3 (916 aa) initn: 1531 init1: 826 opt: 960 Z-score: 839.8 bits: 167.5 E(32554): 1.9e-40 Smith-Waterman score: 1223; 29.9% identity (56.6% similar) in 911 aa overlap (521-1390:66-900) 500 510 520 530 540 550 pF1KE3 FARQHNTSDNNNQCLLGANGNILLHLNPQKPGAIDNQPLVTQEPVKATSLTLEGGRLKRT :: :::. : . .: :. ::. CCDS27 LIDSRWFKQWKKYVGFDSWDMYNVGEHNLFPGPIDNSGLFS-DP--------ESQTLKE- 40 50 60 70 80 560 570 580 590 600 610 pF1KE3 PQLIHGRDYEMVPEPVWRALYHWYGANLALPRPVIKNSKTDIPELELFPRYLLFLRQQPA .:: :: .:: .: : .::: . .:.... . : :: .. CCDS27 -HLIDELDYVLVPTEAWNKLLNWYGC-VEGQQPIVRK----VVEHGLFVKH--------- 90 100 110 120 130 620 630 640 650 660 pF1KE3 TRTQQSNIWVNMGNVPSPNAPLKRVLAYTGC-FSRMQTIKEIHEYLSQRLRIK-EEDMRL ... . ... . .:. :. : ::. .:: :.. . . . : :.. :: CCDS27 CKVEVYLLELKLCENSDPTNVLS-------CHFSKADTIATIEKEMRKLFNIPAERETRL 140 150 160 170 180 670 680 690 700 710 720 pF1KE3 WLYNSENYLTLLDDEDHKLEYLKIQDEQHLVIEVRNKDMSWPEEMSFIAN----SSKIDR : : :. :. .. . . : :::: .:.: .::.. .. .: :.. . CCDS27 WNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQNEDGTWPRQ-TLQSNGSGFSASYNC 190 200 210 220 230 240 730 740 750 760 770 780 pF1KE3 HKVPT---EKGATGLSNLGNTCFMNSSIQCVSNTQPLTQYFISGRHLYELNRTNPIGMKG .. :. . : ::.::::::::::..::.::: :::.::.. .. :.:: ::.:::: CCDS27 QEPPSSHIQPGLCGLGNLGNTCFMNSALQCLSNTAPLTDYFLKDEYEAEINRDNPLGMKG 250 260 270 280 290 300 790 800 810 820 830 840 pF1KE3 HMAKCYGDLVQELWSGTQKNVAPLKLRWTIAKYAPRFNGFQQQDSQELLAFLLDGLHEDL ..:. :..:....::: . .::: .. ....::.:.:.:::::::::::::::::::: CCDS27 EIAEAYAELIKQMWSGRDAHVAPRMFKTQVGRFAPQFSGYQQQDSQELLAFLLDGLHEDL 310 320 330 340 350 360 850 860 870 880 890 900 pF1KE3 NRVHEKPYVELKDSDGRPDWEVAAEAWDNHLRRNRSIVVDLFHGQLRSQVKCKTCGHISV :::..:::.::::..:::: :: :::.:: :: :..:: ::: ..: . : :...:: CCDS27 NRVKKKPYLELKDANGRPDAVVAKEAWENHRLRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPECAKVSV 370 380 390 400 410 420 910 920 930 940 950 960 pF1KE3 RFDPFNFLSLPLPMDSYMHLEITVIKLDG-TTPVRYGLRLNMDEKYTGLKKQLSDLCGLN :::: .:.::::. . .:. .. : :..: . . . . : . :: : :. CCDS27 TFDPFCYLTLPLPLKKDRVMEVFLVPADPHCRPTQYRVTVPLMGAVSDLCEALSRLSGIA 430 440 450 460 470 480 970 980 990 1000 pF1KE3 SEQILLAEVHGSNI-KNF----------PQDNQKVR----LSVSGFLCAFEIPVPVSPIS .:....:.:.. . : : :.:. : ::.: :. .:: CCDS27 AENMVVADVYNHRFHKIFQMDEGLNHIMPRDDIFVYEVCSTSVDGSECV-TLPVYFRE-R 490 500 510 520 530 540 1010 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KE3 ASSPTQTDFSSSPSTNEMFTLTTNGDLPRPIFIPNGMPNTVVPCGTEKNFTNGMVNGHMP : : ::. :.. .. ..:. . ... ..: : . ... . .. CCDS27 KSRP-----SSTSSASALYGQPLLLSVPKHKLTLESLYQAV--CDRISRYVKQPLPDEFG 550 560 570 580 590 1070 1080 1090 1100 1110 1120 pF1KE3 SLPDSPFTGYIIAVHRKMMRTELYFLSSQKNRPSLFGMPLIVPCTVHTRKKDLYDAVWIQ : : : : . . . . . :.. : . . . : CCDS27 SSPLEP--GACNGSRNSCEGEDEEEMEHQEE-----GKEQLSETEGSGEDEPGND----- 600 610 620 630 640 1130 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KE3 VSRLASPLPPQEASNHAQDCDDSMGYQYPFTLRVVQKDGNSCAWCPWYRFCRGCKIDCGE : . . ..: : . ::. .:.. :.. . : :. CCDS27 ------PSETTQKKIKGQPCPKRL-----FTFSLVNSYGTADI--------NSLAAD-GK 650 660 670 680 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KE3 DRAFIGNAYIAVDWDPTALHLRYQTSQERVVDEHESVEQSRRAQAEPINLDSCLRAFTSE . . . .:.::: . .: :. .. .. ..: :. : .. . . : .:.. ::. CCDS27 LLKLNSRSTLAMDWDSETRRLYYDEQESEAYEKHVSMLQPQKKKKTTVALRDCIELFTTM 690 700 710 720 730 740 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KE3 EELGENEMYYCSKCKTHCLATKKLDLWRLPPILIIHLKRFQFVNGRWI-KSQKIVKFPRE : :::.. .:: .:: : ::::.::: :: ::..:::::.. : : : . .:.:: . CCDS27 ETLGEHDPWYCPNCKKHQQATKKFDLWSLPKILVVHLKRFSY-NRYWRDKLDTVVEFPIR 750 760 770 780 790 800 1310 1320 1330 1340 1350 pF1KE3 SFDPSAFL--VPRDPALCQHKPLTPQGDELSEPRILAREVKKV--------DAQSSAGEE ... : :. . : . . .. . .. . : .:. :.. : . : CCDS27 GLNMSEFVCNLSARPYVYDLIAVSNHYGAMGVGHYTAYAKNKLNGKWYYFDDSNVSLASE 810 820 830 840 850 860 1360 1370 1380 1390 1400 pF1KE3 DVLLSKSPSSL-----SANIISSPKGSPSSSRKSGTSCPSSKNSSPNSSPRTLGRSKGRL : ...:. : . .. ..:. : :.: .:: ::: CCDS27 DQIVTKAAYVLFYQRRDDEFYKTPSLSSSGSSDGGTR-PSSSQQGFGDDEACSMDTN 870 880 890 900 910 1410 1420 1430 1440 1450 1460 pF1KE3 RLPQIGSKNKLSSSKENLDASKENGAGQICELADALSRGHVLGGSQPELVTPQDHEVALA >>CCDS14277.1 USP11 gene_id:8237|Hs108|chrX (963 aa) initn: 1311 init1: 789 opt: 938 Z-score: 820.3 bits: 163.9 E(32554): 2.3e-39 Smith-Waterman score: 1234; 31.8% identity (57.1% similar) in 821 aa overlap (521-1316:128-863) 500 510 520 530 540 550 pF1KE3 FARQHNTSDNNNQCLLGANGNILLHLNPQKPGAIDNQPLVTQEPVKATSLTLEGGRLKRT :: :.: : :. .. :::. CCDS14 AGESWFLVEKHWYKQWEAYVQGGDQDSSTFPGCINNATLF-QDEIN--------WRLKEG 100 110 120 130 140 560 570 580 590 600 pF1KE3 PQLIHGRDYEMVPEPVWRALYHWYGANLALPRPVIKNSKTDIPEL---ELFPRYLLFLRQ :..:.:: ..: .:. : ::: : .: :. . ..:.. :..: ::..:. CCDS14 --LVEGEDYVLLPAAAWHYLVSWYG--LEHGQPPIERKVIELPNIQKVEVYPVELLLVRH 150 160 170 180 190 200 610 620 630 640 650 660 pF1KE3 QPATRTQQSNIWVNMGNVPSPNAPLKRVLAYTGCFSRMQTIKEIHEYLSQRLRIK-EEDM . ..:. ..: ::. ..: . . .:. .. .:: CCDS14 N------------DLGK------------SHTVQFSHTDSIGLVLRTARERFLVEPQEDT 210 220 230 240 670 680 690 700 710 720 pF1KE3 RLWLYNSENYLTLLDDEDHKLEYLKIQDEQHLVIEVRNKDMSWPE-EMSFIANSSKIDRH ::: :::. : : : . .. : ...:.:.:: .:: .. . :. . . . CCDS14 RLWAKNSEGSLDRLYDTHITVLDAALETGQLIIMETRKKDGTWPSAQLHVMNNNMSEEDE 250 260 270 280 290 300 730 740 750 760 770 780 pF1KE3 KVPTEKGATGLSNLGNTCFMNSSIQCVSNTQPLTQYFISGRHLYELNRTNPIGMKGHMAK . : ::.::::::::::..::.::. ::.::... .: ::: ::.::::..:. CCDS14 DFKGQPGICGLTNLGNTCFMNSALQCLSNVPQLTEYFLNNCYLEELNFRNPLGMKGEIAE 310 320 330 340 350 360 790 800 810 820 830 840 pF1KE3 CYGDLVQELWSGTQKNVAPLKLRWTIAKYAPRFNGFQQQDSQELLAFLLDGLHEDLNRVH :.:::.. ::: .....: .. ....: .: :.::.::::::.:::::::::::::. CCDS14 AYADLVKQAWSGHHRSIVPHVFKNKVGHFASQFLGYQQHDSQELLSFLLDGLHEDLNRVK 370 380 390 400 410 420 850 860 870 880 890 900 pF1KE3 EKPYVELKDSDGRPDWEVAAEAWDNHLRRNRSIVVDLFHGQLRSQVKCKTCGHISVRFDP .: :::: :. :::: ::: :::.:: ::: :..:: ::: ..: . : ::..:: ::: CCDS14 KKEYVELCDAAGRPDQEVAQEAWQNHKRRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPDCGNVSVTFDP 430 440 450 460 470 480 910 920 930 940 950 960 pF1KE3 FNFLSLPLPMDSYMHLEITVIKLDGTT-PVRYGLRLNMDEKYTGLKKQLSDLCGLNSEQI : .::.:::.. ::. : .: : .. : . : . : :: :.. :.. CCDS14 FCYLSVPLPISHKRVLEVFFIPMDPRRKPEQHRLVVPKKGKISDLCVALSKHTGISPERM 490 500 510 520 530 540 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KE3 LLAEVHGSNIKNFPQDNQKVRLSVSGFLCAFEIPVPVSPISASSPTQTDFSSSPSTNEMF ..:.: . : ... :.: : . :. .... CCDS14 MVADVFSHR-----------------FYKLYQLEEPLSSIL----DRDDIFVYEVSGRIE 550 560 570 1030 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KE3 TLT-TNGDLPRPIFIPNGMPNTVVPCGTEKNFTNGMVNGH--MPSLPDSPFTGYIIAVHR .. . :. :... . : .... . :. :: . :.: . :: . CCDS14 AIEGSREDIVVPVYLRERTPAR----DYNNSYYGLMLFGHPLLVSVPRDRFT------WE 580 590 600 610 620 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KE3 KMMRTELYFLSSQKNRPSLFGMPLIVPCTVHTRKKDLYDAVWIQVSRLASPLPPQE--AS .. . .: :: ..:. . :: . : : .: : : .: CCDS14 GLYNVLMYRLSRYVTKPNSDDEDDGDEKEDDEEDKDDVPGPSTGGS-LRDPEPEQAGPSS 630 640 650 660 670 680 1140 1150 1160 1170 1180 pF1KE3 NHAQDC----DDSMGY-QYP--------FTLRVVQKDGNSCAWCPWYRFCRGCKIDCGED . .. : :. .: :.: :::..:...:.: : .. CCDS14 GVTNRCPFLLDNCLGTSQWPPRRRRKQLFTLQTVNSNGTS------DRTTSPEEVH---- 690 700 710 720 730 1190 1200 1210 1220 1230 1240 pF1KE3 RAFIGNAYIAVDWDPTALHLRYQTSQERVVDEHESVEQSRRAQAEPINLDSCLRAFTSEE .. :::.::.: . :. . . .:. : . . :. :. :.. ::. : CCDS14 ----AQPYIAIDWEPEMKKRYYDEVEAEGYVKHDCV--GYVMKKAPVRLQECIELFTTVE 740 750 760 770 780 790 1250 1260 1270 1280 1290 1300 pF1KE3 ELGENEMYYCSKCKTHCLATKKLDLWRLPPILIIHLKRFQFVNGRWIKSQKIVKFPRESF : ... .:: .:: : ::::::::: :: :::::::::.... : . .:.:: ... CCDS14 TLEKENPWYCPSCKQHQLATKKLDLWMLPEILIIHLKRFSYTKFSREKLDTLVEFPIRDL 800 810 820 830 840 850 1310 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KE3 DPSAFLV-PRDPALCQHKPLTPQGDELSEPRILAREVKKVDAQSSAGEEDVLLSKSPSSL : : :.. :.. CCDS14 DFSEFVIQPQNESNPELYKYDLIAVSNHYGGMRDGHYTTFACNKDSGQWHYFDDNSVSPV 860 870 880 890 900 910 >>CCDS2793.1 USP4 gene_id:7375|Hs108|chr3 (963 aa) initn: 1531 init1: 826 opt: 872 Z-score: 762.9 bits: 153.3 E(32554): 3.6e-36 Smith-Waterman score: 1153; 28.9% identity (54.1% similar) in 957 aa overlap (521-1390:66-947) 500 510 520 530 540 550 pF1KE3 FARQHNTSDNNNQCLLGANGNILLHLNPQKPGAIDNQPLVTQEPVKATSLTLEGGRLKRT :: :::. : . .: :. ::. CCDS27 LIDSRWFKQWKKYVGFDSWDMYNVGEHNLFPGPIDNSGLFS-DP--------ESQTLKE- 40 50 60 70 80 560 570 580 590 600 610 pF1KE3 PQLIHGRDYEMVPEPVWRALYHWYGANLALPRPVIKNSKTDIPELELFPRYLLFLRQQPA .:: :: .:: .: : .::: . .:.... . : :: .. CCDS27 -HLIDELDYVLVPTEAWNKLLNWYGC-VEGQQPIVRK----VVEHGLFVKH--------- 90 100 110 120 130 620 630 640 650 660 pF1KE3 TRTQQSNIWVNMGNVPSPNAPLKRVLAYTGC-FSRMQTIKEIHEYLSQRLRIK-EEDMRL ... . ... . .:. :. : ::. .:: :.. . . . : :.. :: CCDS27 CKVEVYLLELKLCENSDPTNVLS-------CHFSKADTIATIEKEMRKLFNIPAERETRL 140 150 160 170 180 670 680 690 700 710 pF1KE3 WLYNSENYLTLLDDEDHKLEYLKIQDEQHLVIEVRNKDMSWPEEM--------------- : : :. :. .. . . : :::: .:.: .::.. CCDS27 WNKYMSNTYEQLSKLDNTVQDAGLYQGQVLVIEPQNEDGTWPRQTLQSKSSTAPSRNFTT 190 200 210 220 230 240 720 730 pF1KE3 --------------SFIAN----------SSKIDR-----------HKVPT---EKGATG :.::: :: ..: .. :. . : : CCDS27 SPKSSASPYSSVSASLIANGDSTSTCGMHSSGVSRGGSGFSASYNCQEPPSSHIQPGLCG 250 260 270 280 290 300 740 750 760 770 780 790 pF1KE3 LSNLGNTCFMNSSIQCVSNTQPLTQYFISGRHLYELNRTNPIGMKGHMAKCYGDLVQELW :.::::::::::..::.::: :::.::.. .. :.:: ::.::::..:. :..:....: CCDS27 LGNLGNTCFMNSALQCLSNTAPLTDYFLKDEYEAEINRDNPLGMKGEIAEAYAELIKQMW 310 320 330 340 350 360 800 810 820 830 840 850 pF1KE3 SGTQKNVAPLKLRWTIAKYAPRFNGFQQQDSQELLAFLLDGLHEDLNRVHEKPYVELKDS :: . .::: .. ....::.:.:.:::::::::::::::::::::::..:::.::::. CCDS27 SGRDAHVAPRMFKTQVGRFAPQFSGYQQQDSQELLAFLLDGLHEDLNRVKKKPYLELKDA 370 380 390 400 410 420 860 870 880 890 900 910 pF1KE3 DGRPDWEVAAEAWDNHLRRNRSIVVDLFHGQLRSQVKCKTCGHISVRFDPFNFLSLPLPM .:::: :: :::.:: :: :..:: ::: ..: . : :...:: :::: .:.::::. CCDS27 NGRPDAVVAKEAWENHRLRNDSVIVDTFHGLFKSTLVCPECAKVSVTFDPFCYLTLPLPL 430 440 450 460 470 480 920 930 940 950 960 970 pF1KE3 DSYMHLEITVIKLDG-TTPVRYGLRLNMDEKYTGLKKQLSDLCGLNSEQILLAEVHGSNI . .:. .. : :..: . . . . : . :: : :. .:....:.:.. . CCDS27 KKDRVMEVFLVPADPHCRPTQYRVTVPLMGAVSDLCEALSRLSGIAAENMVVADVYNHRF 490 500 510 520 530 540 980 990 1000 1010 pF1KE3 -KNF----------PQDNQKVR----LSVSGFLCAFEIPVPVSPISASSPTQTDFSSSPS : : :.:. : ::.: :. .:: : : ::. : CCDS27 HKIFQMDEGLNHIMPRDDIFVYEVCSTSVDGSECV-TLPVYFRE-RKSRP-----SSTSS 550 560 570 580 590 1020 1030 1040 1050 1060 1070 pF1KE3 TNEMFTLTTNGDLPRPIFIPNGMPNTVVPCGTEKNFTNGMVNGHMPSLPDSPFTGYIIAV .. .. ..:. . ... ..: : . ... . .. : : : : . CCDS27 ASALYGQPLLLSVPKHKLTLESLYQAV--CDRISRYVKQPLPDEFGSSPLEP--GACNGS 600 610 620 630 640 650 1080 1090 1100 1110 1120 1130 pF1KE3 HRKMMRTELYFLSSQKNRPSLFGMPLIVPCTVHTRKKDLYDAVWIQVSRLASPLPPQEAS . . . . :.. : . . . : : . . CCDS27 RNSCEGEDEEEMEHQEE-----GKEQLSETEGSGEDEPGND-----------PSETTQKK 660 670 680 690 1140 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KE3 NHAQDCDDSMGYQYPFTLRVVQKDGNSCAWCPWYRFCRGCKIDCGEDRAFIGNAYIAVDW ..: : . ::. .:.. :.. . : :. . . . .:.:: CCDS27 IKGQPCPKRL-----FTFSLVNSYGTADI--------NSLAAD-GKLLKLNSRSTLAMDW 700 710 720 730 740 1200 1210 1220 1230 1240 1250 pF1KE3 DPTALHLRYQTSQERVVDEHESVEQSRRAQAEPINLDSCLRAFTSEEELGENEMYYCSKC : . .: :. .. .. ..: :. : .. . . : .:.. ::. : :::.. .:: .: CCDS27 DSETRRLYYDEQESEAYEKHVSMLQPQKKKKTTVALRDCIELFTTMETLGEHDPWYCPNC 750 760 770 780 790 800 1260 1270 1280 1290 1300 1310 pF1KE3 KTHCLATKKLDLWRLPPILIIHLKRFQFVNGRWI-KSQKIVKFPRESFDPSAFL--VPRD : : ::::.::: :: ::..:::::.. : : : . .:.:: .... : :. . CCDS27 KKHQQATKKFDLWSLPKILVVHLKRFSY-NRYWRDKLDTVVEFPIRGLNMSEFVCNLSAR 810 820 830 840 850 860 1320 1330 1340 1350 1360 pF1KE3 PALCQHKPLTPQGDELSEPRILAREVKKV--------DAQSSAGEEDVLLSKSPSSL--- : . . .. . .. . : .:. :.. : . :: ...:. : CCDS27 PYVYDLIAVSNHYGAMGVGHYTAYAKNKLNGKWYYFDDSNVSLASEDQIVTKAAYVLFYQ 870 880 890 900 910 920 1370 1380 1390 1400 1410 1420 pF1KE3 --SANIISSPKGSPSSSRKSGTSCPSSKNSSPNSSPRTLGRSKGRLRLPQIGSKNKLSSS . .. ..:. : :.: .:: ::: CCDS27 RRDDEFYKTPSLSSSGSSDGGTR-PSSSQQGFGDDEACSMDTN 930 940 950 960 >>CCDS43090.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3 (1318 aa) initn: 982 init1: 668 opt: 686 Z-score: 598.9 bits: 123.4 E(32554): 4.9e-27 Smith-Waterman score: 801; 30.2% identity (54.9% similar) in 705 aa overlap (687-1313:448-1139) 660 670 680 690 700 710 pF1KE3 QRLRIKEEDMRLWLYNSENYLTLLDDEDHKLEYLKIQDEQHLVIEVRNKDMSWPEEMSFI .:.. . : ::. . : : : . 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CCDS43 CPVCAKVSITFDPFLYLPVPLPQKQKVLPVFYFAREPHSKPIKFLVSVSKENSTASEVLD 660 670 680 690 700 710 960 970 980 990 pF1KE3 QLSDLCGLNSEQILLAEVHGSNI-KNFPQDNQKVRLSVSGFLCAFEI------------- .::. .. :.. :::: . . . : ... .: : : ::. CCDS43 SLSQSVHVKPENLRLAEVIKNRFHRVFLPSHSLDTVSPSDTLLCFELLSSELAKERVVVL 720 730 740 750 760 770 1000 1010 1020 1030 pF1KE3 -----P-VPVSPISASSPTQTDFSSSPST-------------NEMFTLTTNGD---LPRP : :: ::: . : .: :.. : : : :: CCDS43 EVQQRPQVPSVPISKCAACQRKQQSEDEKLKRCTRCYRVGYCNQLCQKTHWPDHKGLCRP 780 790 800 810 820 830 1040 1050 1060 1070 1080 pF1KE3 IFIPNGMPNTV-VPCG--TEKNFTNGMVNGHMP---SLPDSPFTGYIIAVHRK------M : :.: : :: . : ... ...:. :. . :: .:.. . . CCDS43 ENI--GYPFLVSVPASRLTYARLAQ-LLEGYARYSVSVFQPPFQPGRMALESQSPGCTTL 840 850 860 870 880 890 1090 1100 1110 1120 1130 1140 pF1KE3 MRT-ELYFLSSQKNRPSLFGMPLIVPCTVHTRKKDLYDAVWIQVSRLASPLPPQEASNHA . : : .:... . . :..: .. :: .: : .:. CCDS43 LSTGSLEAGDSERDPIQPPELQLVTP---MAEGDTGLPRVWAAPDRGPVPSTSGISSEML 900 910 920 930 940 1150 1160 1170 1180 1190 pF1KE3 QDCDDSMGYQYPFTLRVVQKDGNS----------CAWCPWYRFCRGCKIDCGEDRAFI-- . .: . : :: . .. : : . : ::: .. . . CCDS43 ASGPIEVG-SLPAGERVSRPEAAVPGYQHPSEAMNAHTPQF-FIY--KIDSSNREQRLED 950 960 970 980 990 1000 1200 1210 1220 1230 pF1KE3 -GNAYIAVDWDPTALHLRYQTS---QERVV---DEHESVEQ----SRRAQAEPINLDSCL :.. . . : .: : .... :: :. : : .:. .. :.: ..::.:: CCDS43 KGDTPLELG-DDCSLALVWRNNERLQEFVLVASKELECAEDPGSAGEAARAGHFTLDQCL 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1240 1250 1260 1270 1280 1290 pF1KE3 RAFTSEEELGENEMYYCSKCKTHCLATKKLDLWRLPPILIIHLKRFQFVNGRWI-KSQKI :: : :. .: .:: .:: : :.:.: ::::: .::..::::.: . : : . . CCDS43 NLFTRPEVLAPEEAWYCPQCKQHREASKQLLLWRLPNVLIVQLKRFSFRSFIWRDKINDL 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1300 1310 1320 1330 1340 1350 pF1KE3 VKFPRESFDPSAFLVPRDPALCQHKPLTPQGDELSEPRILAREVKKVDAQSSAGEEDVLL :.:: ...: : : . CCDS43 VEFPVRNLDLSKFCIGQKEEQLPSYDLYAVINHYGGMIGGHYTACARLPNDRSSQRSDVG 1130 1140 1150 1160 1170 1180 >>CCDS56256.1 USP19 gene_id:10869|Hs108|chr3 (1372 aa) initn: 982 init1: 668 opt: 686 Z-score: 598.6 bits: 123.4 E(32554): 5e-27 Smith-Waterman score: 801; 30.2% identity (54.9% similar) in 705 aa overlap (687-1313:539-1230) 660 670 680 690 700 710 pF1KE3 QRLRIKEEDMRLWLYNSENYLTLLDDEDHKLEYLKIQDEQHLVIEVRNKDMSWPEEMSFI .:.. . : ::. . : : : . 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