FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE3972, 436 aa 1>>>pF1KE3972 436 - 436 aa - 436 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6169+/-0.000898; mu= 15.8235+/- 0.054 mean_var=79.4083+/-16.035, 0's: 0 Z-trim(107.3): 63 B-trim: 46 in 1/47 Lambda= 0.143927 statistics sampled from 9439 (9501) to 9439 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.66), E-opt: 0.2 (0.292), width: 16 Scan time: 2.940 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS32640.1 FBXL20 gene_id:84961|Hs108|chr17 ( 436) 2974 627.3 9e-180 CCDS2658.1 FBXL2 gene_id:25827|Hs108|chr3 ( 423) 2372 502.3 3.7e-142 CCDS54116.1 FBXL20 gene_id:84961|Hs108|chr17 ( 404) 1935 411.5 7.5e-115 CCDS54560.1 FBXL2 gene_id:25827|Hs108|chr3 ( 355) 1215 262.0 6.8e-70 CCDS47678.1 FBXL13 gene_id:222235|Hs108|chr7 ( 690) 576 129.5 1e-29 CCDS64129.1 FBXL7 gene_id:23194|Hs108|chr5 ( 444) 520 117.8 2.3e-26 CCDS54833.1 FBXL7 gene_id:23194|Hs108|chr5 ( 491) 520 117.8 2.4e-26 CCDS5726.1 FBXL13 gene_id:222235|Hs108|chr7 ( 735) 454 104.2 4.5e-22 CCDS10421.1 FBXL16 gene_id:146330|Hs108|chr16 ( 479) 445 102.2 1.2e-21 CCDS75649.1 FBXL13 gene_id:222235|Hs108|chr7 ( 707) 410 95.0 2.5e-19 CCDS54886.1 FBXL17 gene_id:64839|Hs108|chr5 ( 701) 331 78.6 2.1e-14 CCDS8509.1 FBXL14 gene_id:144699|Hs108|chr12 ( 418) 319 76.0 7.9e-14 CCDS44858.1 AMN1 gene_id:196394|Hs108|chr12 ( 258) 299 71.7 9.5e-13 CCDS61089.1 AMN1 gene_id:196394|Hs108|chr12 ( 240) 298 71.5 1e-12 CCDS5041.1 FBXL4 gene_id:26235|Hs108|chr6 ( 621) 273 66.6 8.1e-11 >>CCDS32640.1 FBXL20 gene_id:84961|Hs108|chr17 (436 aa) initn: 2974 init1: 2974 opt: 2974 Z-score: 3340.9 bits: 627.3 E(32554): 9e-180 Smith-Waterman score: 2974; 100.0% identity (100.0% similar) in 436 aa overlap (1-436:1-436) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MRRDVNGVTKSRFEMFSNSDEAVINKKLPKELLLRIFSFLDVVTLCRCAQVSRAWNVLAL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 MRRDVNGVTKSRFEMFSNSDEAVINKKLPKELLLRIFSFLDVVTLCRCAQVSRAWNVLAL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 DGSNWQRIDLFDFQRDIEGRVVENISKRCGGFLRKLSLRGCLGVGDNALRTFAQNCRNIE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 DGSNWQRIDLFDFQRDIEGRVVENISKRCGGFLRKLSLRGCLGVGDNALRTFAQNCRNIE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 VLNLNGCTKTTDATCTSLSKFCSKLRHLDLASCTSITNMSLKALSEGCPLLEQLNISWCD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 VLNLNGCTKTTDATCTSLSKFCSKLRHLDLASCTSITNMSLKALSEGCPLLEQLNISWCD 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 QVTKDGIQALVRGCGGLKALFLKGCTQLEDEALKYIGAHCPELVTLNLQTCLQITDEGLI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 QVTKDGIQALVRGCGGLKALFLKGCTQLEDEALKYIGAHCPELVTLNLQTCLQITDEGLI 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KE3 TICRGCHKLQSLCASGCSNITDAILNALGQNCPRLRILEVARCSQLTDVGFTTLARNCHE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 TICRGCHKLQSLCASGCSNITDAILNALGQNCPRLRILEVARCSQLTDVGFTTLARNCHE 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KE3 LEKMDLEECVQITDSTLIQLSIHCPRLQVLSLSHCELITDDGIRHLGNGACAHDQLEVIE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 LEKMDLEECVQITDSTLIQLSIHCPRLQVLSLSHCELITDDGIRHLGNGACAHDQLEVIE 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KE3 LDNCPLITDASLEHLKSCHSLERIELYDCQQITRAGIKRLRTHLPNIKVHAYFAPVTPPP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS32 LDNCPLITDASLEHLKSCHSLERIELYDCQQITRAGIKRLRTHLPNIKVHAYFAPVTPPP 370 380 390 400 410 420 430 pF1KE3 SVGGSRQRFCRCCIIL :::::::::::::::: CCDS32 SVGGSRQRFCRCCIIL 430 >>CCDS2658.1 FBXL2 gene_id:25827|Hs108|chr3 (423 aa) initn: 2372 init1: 2372 opt: 2372 Z-score: 2665.6 bits: 502.3 E(32554): 3.7e-142 Smith-Waterman score: 2372; 78.2% identity (94.5% similar) in 422 aa overlap (15-436:2-423) 10 20 30 40 50 60 pF1KE3 MRRDVNGVTKSRFEMFSNSDEAVINKKLPKELLLRIFSFLDVVTLCRCAQVSRAWNVLAL .:::.::..::::::::::::::::::.::::::::.:.:::.::: CCDS26 MVFSNNDEGLINKKLPKELLLRIFSFLDIVTLCRCAQISKAWNILAL 10 20 30 40 70 80 90 100 110 120 pF1KE3 DGSNWQRIDLFDFQRDIEGRVVENISKRCGGFLRKLSLRGCLGVGDNALRTFAQNCRNIE :::::::::::.:: :.::::::::::::::::::::::::.::::..:.:::::::::: CCDS26 DGSNWQRIDLFNFQTDVEGRVVENISKRCGGFLRKLSLRGCIGVGDSSLKTFAQNCRNIE 50 60 70 80 90 100 130 140 150 160 170 180 pF1KE3 VLNLNGCTKTTDATCTSLSKFCSKLRHLDLASCTSITNMSLKALSEGCPLLEQLNISWCD :::::::: ::.:: :::.:::::.::::.::.:::: :::..:::: :: ::.:::: CCDS26 HLNLNGCTKITDSTCYSLSRFCSKLKHLDLTSCVSITNSSLKGISEGCRNLEYLNLSWCD 110 120 130 140 150 160 190 200 210 220 230 240 pF1KE3 QVTKDGIQALVRGCGGLKALFLKGCTQLEDEALKYIGAHCPELVTLNLQTCLQITDEGLI :.:::::.:::::: :::::.:.:::::::::::.: .: :::.::::.: .:::::.. 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CCDS47 DNCVKALVEKCSRITSLVFTGAPHISDCTFRALSA-C-KLRKIRFEGNKRVTDASFKFID 370 380 390 400 410 420 300 310 320 330 340 350 pF1KE3 RNCHELEKMDLEECVQITDSTLIQLSIHCPRLQVLSLSHCELITDDGIRHLGNGACAHDQ .: .: .. . .: ::::.: .:: .: ::.:..: : : :.... .: : . CCDS47 KNYPNLSHIYMADCKGITDSSLRSLS-PLKQLTVLNLANCVRIGDMGLKQFLDGP-ASMR 430 440 450 460 470 480 360 370 380 390 400 410 pF1KE3 LEVIELDNCPLITDASLEHL-KSCHSLERIELYDCQQITRAGIKRLRTHLPNIKVHAYFA .. ..:.:: ..:::. .: . : .:. . : .:...: :: CCDS47 IRELNLSNCVRLSDASVMKLSERCPNLNYLSLRNCEHLTAQGIGYIVNIFSLVSIDLSGT 490 500 510 520 530 540 420 430 pF1KE3 PVTPPPSVGGSRQRFCRCCIIL CCDS47 DISNEGLNVLSRHKKLKELSVSECYRITDDGIQITDSAMEMLSAKCHYLHILDISGCVLL 550 560 570 580 590 600 >>CCDS64129.1 FBXL7 gene_id:23194|Hs108|chr5 (444 aa) initn: 710 init1: 330 opt: 520 Z-score: 587.0 bits: 117.8 E(32554): 2.3e-26 Smith-Waterman score: 628; 29.6% identity (63.1% similar) in 385 aa overlap (12-378:55-434) 10 20 30 40 pF1KE3 MRRDVNGVTKSRFEMFSNSDEAVINKKLPKELLLRIFSFLD :. ....: :.. :: . ...::::: CCDS64 GSSTSSSSITGETVAMVHSPPPTRLTHPLIRLASRPQKEQASIDR-LPDHSMVQIFSFLP 30 40 50 60 70 80 50 60 70 80 90 pF1KE3 VVTLCRCAQVSRAWNVLALDGSNWQRIDLFDFQRDIEGRVVENISKR-CGG------FLR . :::::.: : : :: : :. : : ... :... ...: : .:. 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CCDS64 RLTDEGLRYLVIYCASIKELSVSDCRFVSDFGLREIAKLESRLRYLSIAHCGRVTDVGIR 270 280 290 300 310 320 270 280 290 300 310 320 pF1KE3 ALGQNCPRLRILEVARCSQLTDVGFTTLARNCHELEKMDLEECVQITDSTLIQLSIHCPR ... : .:: :.. : .:: : ::.:: .:...:. .: ..:. : :...: CCDS64 YVAKYCSKLRYLNARGCEGITDHGVEYLAKNCTKLKSLDIGKCPLVSDTGLECLALNCFN 330 340 350 360 370 380 330 340 350 360 370 380 pF1KE3 LQVLSLSHCELITDDGIRHLGNGACAHDQLEVIELDNCPLITDA---SLEHLKSCHSLER :. :::. :: :: .:.. .. . : .:.......: . ..: .: : : CCDS64 LKRLSLKSCESITGQGLQIVAAN-CF--DLQTLNVQDCEVSVEALRFVKRHCKRCVIEHT 390 400 410 420 430 390 400 410 420 430 pF1KE3 IELYDCQQITRAGIKRLRTHLPNIKVHAYFAPVTPPPSVGGSRQRFCRCCIIL CCDS64 NPAFF 440 >>CCDS54833.1 FBXL7 gene_id:23194|Hs108|chr5 (491 aa) initn: 710 init1: 330 opt: 520 Z-score: 586.3 bits: 117.8 E(32554): 2.4e-26 Smith-Waterman score: 628; 29.6% identity (63.1% similar) in 385 aa overlap (12-378:102-481) 10 20 30 40 pF1KE3 MRRDVNGVTKSRFEMFSNSDEAVINKKLPKELLLRIFSFLD :. ....: :.. :: . ...::::: CCDS54 GSSTSSSSITGETVAMVHSPPPTRLTHPLIRLASRPQKEQASIDR-LPDHSMVQIFSFLP 80 90 100 110 120 130 50 60 70 80 90 pF1KE3 VVTLCRCAQVSRAWNVLALDGSNWQRIDLFDFQRDIEGRVVENISKR-CGG------FLR . :::::.: : : :: : :. : : ... :... ...: : .:. CCDS54 TNQLCRCARVCRRWYNLAWDPRLWRTIRLTGETINVD-RALKVLTRRLCQDTPNVCLMLE 140 150 160 170 180 100 110 120 130 140 150 pF1KE3 KLSLRGCLGVGDNALRTFAQNCRNIEVLNLNGCTKTTDATCTSLSKFCSKLRHLDLASCT ... :: . : .: :.:: : ... :...:: . .. . .. ..: .:.:::...:. CCDS54 TVTVSGCRRLTDRGLYTIAQCCPELRRLEVSGCYNISNEAVFDVVSLCPNLEHLDVSGCS 190 200 210 220 230 240 160 170 180 190 200 pF1KE3 SITNMSL--KALSEGCPLL-EQLNISWCDQ----VTKD-GIQALVRGCGGLKALFLKGCT ..: .:: .: . :: .:..: . :. : .: :..... : : :.:. :. CCDS54 KVTCISLTREASIKLSPLHGKQISIRYLDMTDCFVLEDEGLHTIAAHCTQLTHLYLRRCV 250 260 270 280 290 300 210 220 230 240 250 260 pF1KE3 QLEDEALKYIGAHCPELVTLNLQTCLQITDEGLITICRGCHKLQSLCASGCSNITDAILN .: ::.:.:. .: . :... : ..: :: : . .:. : . :. .::. . 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