Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6469
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6469, 530 aa
1>>>pF1KE6469 530 - 530 aa - 530 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0926+/-0.00119; mu= 13.5601+/- 0.070
mean_var=65.9298+/-12.653, 0's: 0 Z-trim(100.4): 38 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.157955
statistics sampled from 6068 (6097) to 6068 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.538), E-opt: 0.2 (0.187), width: 16
Scan time: 2.480
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32617.1 CCT6B gene_id:10693|Hs108|chr17 ( 530) 3350 773.0 0
CCDS5523.1 CCT6A gene_id:908|Hs108|chr7 ( 531) 2959 683.8 1.3e-196
CCDS54105.1 CCT6B gene_id:10693|Hs108|chr17 ( 485) 2688 622.1 4.5e-178
CCDS34640.1 CCT6A gene_id:908|Hs108|chr7 ( 486) 2330 540.5 1.6e-153
CCDS54106.1 CCT6B gene_id:10693|Hs108|chr17 ( 493) 1860 433.4 2.9e-121
CCDS1140.2 CCT3 gene_id:7203|Hs108|chr1 ( 545) 890 212.4 1.1e-54
CCDS3877.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 541) 847 202.6 9.8e-52
CCDS82988.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 520) 840 201.0 2.9e-51
CCDS77996.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 503) 836 200.1 5.2e-51
CCDS33206.1 CCT4 gene_id:10575|Hs108|chr2 ( 539) 815 195.3 1.5e-49
CCDS30888.1 CCT3 gene_id:7203|Hs108|chr1 ( 507) 755 181.6 1.9e-45
CCDS5269.1 TCP1 gene_id:6950|Hs108|chr6 ( 556) 741 178.4 1.9e-44
CCDS46336.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 543) 670 162.2 1.4e-39
CCDS82989.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 486) 638 154.9 1.9e-37
CCDS82990.1 CCT5 gene_id:22948|Hs108|chr5 ( 448) 634 154.0 3.3e-37
CCDS58711.1 CCT4 gene_id:10575|Hs108|chr2 ( 509) 626 152.2 1.3e-36
CCDS8991.1 CCT2 gene_id:10576|Hs108|chr12 ( 535) 614 149.5 9.3e-36
CCDS54367.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 499) 610 148.6 1.6e-35
CCDS55843.1 CCT2 gene_id:10576|Hs108|chr12 ( 488) 542 133.1 7.4e-31
CCDS54366.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 456) 519 127.8 2.6e-29
CCDS68181.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 ( 529) 512 126.2 9.2e-29
CCDS33528.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 ( 548) 512 126.2 9.5e-29
CCDS68180.1 CCT8 gene_id:10694|Hs108|chr21 ( 475) 495 122.3 1.2e-27
CCDS43522.1 TCP1 gene_id:6950|Hs108|chr6 ( 401) 487 120.5 3.6e-27
CCDS42696.1 CCT7 gene_id:10574|Hs108|chr2 ( 339) 404 101.6 1.5e-21
>>CCDS32617.1 CCT6B gene_id:10693|Hs108|chr17 (530 aa)
initn: 3350 init1: 3350 opt: 3350 Z-score: 4125.1 bits: 773.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3350; 99.6% identity (100.0% similar) in 530 aa overlap (1-530:1-530)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAAIKAVNSKAEVARAQAALAVNICAARGLQDVLRTNLGPKGTMKMLASGAGDIKLTKDG
::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS32 MAAIKAVNSKAEVARARAALAVNICAARGLQDVLRTNLGPKGTMKMLVSGAGDIKLTKDG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 NVLLDEMQIQHPTASLIAKVATAQDDVTGDGTTSNVLIIGELLKQADLYISEGLHPRIIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NVLLDEMQIQHPTASLIAKVATAQDDVTGDGTTSNVLIIGELLKQADLYISEGLHPRIIA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 EGFEAAKIKALEVLEEVKVTKEMKRKILLDVARTSLQTKVHAELADVLTEVVVDSVLAVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EGFEAAKIKALEVLEEVKVTKEMKRKILLDVARTSLQTKVHAELADVLTEVVVDSVLAVR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 RPGYPIDLFMVEIMEMKHKLGTDTKLIQGLVLDHGARHPDMKKRVEDAFILICNVSLEYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RPGYPIDLFMVEIMEMKHKLGTDTKLIQGLVLDHGARHPDMKKRVEDAFILICNVSLEYE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 KTEVNSGFFYKTAEEKEKLVKAERKFIEDRVQKIIDLKDKVCAQSNKGFVVINQKGIDPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KTEVNSGFFYKTAEEKEKLVKAERKFIEDRVQKIIDLKDKVCAQSNKGFVVINQKGIDPF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 SLDSLAKHGIVALRRAKRRNMERLSLACGGMAVNSFEDLTVDCLGHAGLVYEYTLGEEKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SLDSLAKHGIVALRRAKRRNMERLSLACGGMAVNSFEDLTVDCLGHAGLVYEYTLGEEKF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 TFIEECVNPCSVTLLVKGPNKHTLTQVKDAIRDGLRAIKNAIEDGCMVPGAGAIEVAMAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TFIEECVNPCSVTLLVKGPNKHTLTQVKDAIRDGLRAIKNAIEDGCMVPGAGAIEVAMAE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 ALVTYKNSIKGRARLGVQAFADALLIIPKVLAQNAGYDPQETLVKVQAEHVESKQLVGVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ALVTYKNSIKGRARLGVQAFADALLIIPKVLAQNAGYDPQETLVKVQAEHVESKQLVGVD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE6 LNTGEPMVAADAGVWDNYCVKKQLLHSCTVIATNILLVDEIMRAGMSSLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LNTGEPMVAADAGVWDNYCVKKQLLHSCTVIATNILLVDEIMRAGMSSLK
490 500 510 520 530
>>CCDS5523.1 CCT6A gene_id:908|Hs108|chr7 (531 aa)
initn: 2959 init1: 2959 opt: 2959 Z-score: 3643.5 bits: 683.8 E(32554): 1.3e-196
Smith-Waterman score: 2959; 85.8% identity (95.8% similar) in 530 aa overlap (1-530:1-530)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAAIKAVNSKAEVARAQAALAVNICAARGLQDVLRTNLGPKGTMKMLASGAGDIKLTKDG
:::.:..: ::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS55 MAAVKTLNPKAEVARAQAALAVNISAARGLQDVLRTNLGPKGTMKMLVSGAGDIKLTKDG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 NVLLDEMQIQHPTASLIAKVATAQDDVTGDGTTSNVLIIGELLKQADLYISEGLHPRIIA
:::: :::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS55 NVLLHEMQIQHPTASLIAKVATAQDDITGDGTTSNVLIIGELLKQADLYISEGLHPRIIT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 EGFEAAKIKALEVLEEVKVTKEMKRKILLDVARTSLQTKVHAELADVLTEVVVDSVLAVR
::::::: :::. ::::::..:: :. :.:::::::.:::::::::::::.::::.::..
CCDS55 EGFEAAKEKALQFLEEVKVSREMDRETLIDVARTSLRTKVHAELADVLTEAVVDSILAIK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 RPGYPIDLFMVEIMEMKHKLGTDTKLIQGLVLDHGARHPDMKKRVEDAFILICNVSLEYE
. ::::::.:::::::: :::.::.::::::::::::::::::::.:: ::::::::
CCDS55 KQDEPIDLFMIEIMEMKHKSETDTSLIRGLVLDHGARHPDMKKRVEDAYILTCNVSLEYE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 KTEVNSGFFYKTAEEKEKLVKAERKFIEDRVQKIIDLKDKVCAQSNKGFVVINQKGIDPF
:::::::::::.:::.:::::::::::::::.:::.:: :::..:.::::::::::::::
CCDS55 KTEVNSGFFYKSAEEREKLVKAERKFIEDRVKKIIELKRKVCGDSDKGFVVINQKGIDPF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 SLDSLAKHGIVALRRAKRRNMERLSLACGGMAVNSFEDLTVDCLGHAGLVYEYTLGEEKF
:::.:.:.::::::::::::::::.:::::.:.:::.::. :::::::::::::::::::
CCDS55 SLDALSKEGIVALRRAKRRNMERLTLACGGVALNSFDDLSPDCLGHAGLVYEYTLGEEKF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 TFIEECVNPCSVTLLVKGPNKHTLTQVKDAIRDGLRAIKNAIEDGCMVPGAGAIEVAMAE
::::.: :: :::::.::::::::::.:::.::::::.::::.:::.::::::.::::::
CCDS55 TFIEKCNNPRSVTLLIKGPNKHTLTQIKDAVRDGLRAVKNAIDDGCVVPGAGAVEVAMAE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 ALVTYKNSIKGRARLGVQAFADALLIIPKVLAQNAGYDPQETLVKVQAEHVESKQLVGVD
::. .: :.::::.::::::::::::::::::::.:.: ::::::.:::: :: ::::::
CCDS55 ALIKHKPSVKGRAQLGVQAFADALLIIPKVLAQNSGFDLQETLVKIQAEHSESGQLVGVD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE6 LNTGEPMVAADAGVWDNYCVKKQLLHSCTVIATNILLVDEIMRAGMSSLK
::::::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LNTGEPMVAAEVGVWDNYCVKKQLLHSCTVIATNILLVDEIMRAGMSSLKG
490 500 510 520 530
>>CCDS54105.1 CCT6B gene_id:10693|Hs108|chr17 (485 aa)
initn: 2676 init1: 2676 opt: 2688 Z-score: 3310.4 bits: 622.1 E(32554): 4.5e-178
Smith-Waterman score: 2977; 91.1% identity (91.5% similar) in 530 aa overlap (1-530:1-485)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAAIKAVNSKAEVARAQAALAVNICAARGLQDVLRTNLGPKGTMKMLASGAGDIKLTKDG
::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS54 MAAIKAVNSKAEVARARAALAVNICAARGLQDVLRTNLGPKGTMKMLVSGAGDIKLTKDG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 NVLLDEMQIQHPTASLIAKVATAQDDVTGDGTTSNVLIIGELLKQADLYISEGLHPRIIA
::::::: ::::::::
CCDS54 NVLLDEM---------------------------------------------GLHPRIIA
70
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 EGFEAAKIKALEVLEEVKVTKEMKRKILLDVARTSLQTKVHAELADVLTEVVVDSVLAVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EGFEAAKIKALEVLEEVKVTKEMKRKILLDVARTSLQTKVHAELADVLTEVVVDSVLAVR
80 90 100 110 120 130
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 RPGYPIDLFMVEIMEMKHKLGTDTKLIQGLVLDHGARHPDMKKRVEDAFILICNVSLEYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RPGYPIDLFMVEIMEMKHKLGTDTKLIQGLVLDHGARHPDMKKRVEDAFILICNVSLEYE
140 150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 KTEVNSGFFYKTAEEKEKLVKAERKFIEDRVQKIIDLKDKVCAQSNKGFVVINQKGIDPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KTEVNSGFFYKTAEEKEKLVKAERKFIEDRVQKIIDLKDKVCAQSNKGFVVINQKGIDPF
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 SLDSLAKHGIVALRRAKRRNMERLSLACGGMAVNSFEDLTVDCLGHAGLVYEYTLGEEKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SLDSLAKHGIVALRRAKRRNMERLSLACGGMAVNSFEDLTVDCLGHAGLVYEYTLGEEKF
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 TFIEECVNPCSVTLLVKGPNKHTLTQVKDAIRDGLRAIKNAIEDGCMVPGAGAIEVAMAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TFIEECVNPCSVTLLVKGPNKHTLTQVKDAIRDGLRAIKNAIEDGCMVPGAGAIEVAMAE
320 330 340 350 360 370
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 ALVTYKNSIKGRARLGVQAFADALLIIPKVLAQNAGYDPQETLVKVQAEHVESKQLVGVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ALVTYKNSIKGRARLGVQAFADALLIIPKVLAQNAGYDPQETLVKVQAEHVESKQLVGVD
380 390 400 410 420 430
490 500 510 520 530
pF1KE6 LNTGEPMVAADAGVWDNYCVKKQLLHSCTVIATNILLVDEIMRAGMSSLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LNTGEPMVAADAGVWDNYCVKKQLLHSCTVIATNILLVDEIMRAGMSSLK
440 450 460 470 480
>>CCDS34640.1 CCT6A gene_id:908|Hs108|chr7 (486 aa)
initn: 2319 init1: 2319 opt: 2330 Z-score: 2869.5 bits: 540.5 E(32554): 1.6e-153
Smith-Waterman score: 2587; 77.5% identity (87.4% similar) in 530 aa overlap (1-530:1-485)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAAIKAVNSKAEVARAQAALAVNICAARGLQDVLRTNLGPKGTMKMLASGAGDIKLTKDG
:::.:..: ::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS34 MAAVKTLNPKAEVARAQAALAVNISAARGLQDVLRTNLGPKGTMKMLVSGAGDIKLTKDG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 NVLLDEMQIQHPTASLIAKVATAQDDVTGDGTTSNVLIIGELLKQADLYISEGLHPRIIA
:::: :: :::::::.
CCDS34 NVLLHEM---------------------------------------------GLHPRIIT
70
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 EGFEAAKIKALEVLEEVKVTKEMKRKILLDVARTSLQTKVHAELADVLTEVVVDSVLAVR
::::::: :::. ::::::..:: :. :.:::::::.:::::::::::::.::::.::..
CCDS34 EGFEAAKEKALQFLEEVKVSREMDRETLIDVARTSLRTKVHAELADVLTEAVVDSILAIK
80 90 100 110 120 130
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 RPGYPIDLFMVEIMEMKHKLGTDTKLIQGLVLDHGARHPDMKKRVEDAFILICNVSLEYE
. ::::::.:::::::: :::.::.::::::::::::::::::::.:: ::::::::
CCDS34 KQDEPIDLFMIEIMEMKHKSETDTSLIRGLVLDHGARHPDMKKRVEDAYILTCNVSLEYE
140 150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 KTEVNSGFFYKTAEEKEKLVKAERKFIEDRVQKIIDLKDKVCAQSNKGFVVINQKGIDPF
:::::::::::.:::.:::::::::::::::.:::.:: :::..:.::::::::::::::
CCDS34 KTEVNSGFFYKSAEEREKLVKAERKFIEDRVKKIIELKRKVCGDSDKGFVVINQKGIDPF
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 SLDSLAKHGIVALRRAKRRNMERLSLACGGMAVNSFEDLTVDCLGHAGLVYEYTLGEEKF
:::.:.:.::::::::::::::::.:::::.:.:::.::. :::::::::::::::::::
CCDS34 SLDALSKEGIVALRRAKRRNMERLTLACGGVALNSFDDLSPDCLGHAGLVYEYTLGEEKF
260 270 280 290 300 310
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 TFIEECVNPCSVTLLVKGPNKHTLTQVKDAIRDGLRAIKNAIEDGCMVPGAGAIEVAMAE
::::.: :: :::::.::::::::::.:::.::::::.::::.:::.::::::.::::::
CCDS34 TFIEKCNNPRSVTLLIKGPNKHTLTQIKDAVRDGLRAVKNAIDDGCVVPGAGAVEVAMAE
320 330 340 350 360 370
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 ALVTYKNSIKGRARLGVQAFADALLIIPKVLAQNAGYDPQETLVKVQAEHVESKQLVGVD
::. .: :.::::.::::::::::::::::::::.:.: ::::::.:::: :: ::::::
CCDS34 ALIKHKPSVKGRAQLGVQAFADALLIIPKVLAQNSGFDLQETLVKIQAEHSESGQLVGVD
380 390 400 410 420 430
490 500 510 520 530
pF1KE6 LNTGEPMVAADAGVWDNYCVKKQLLHSCTVIATNILLVDEIMRAGMSSLK
::::::::::..::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LNTGEPMVAAEVGVWDNYCVKKQLLHSCTVIATNILLVDEIMRAGMSSLKG
440 450 460 470 480
>>CCDS54106.1 CCT6B gene_id:10693|Hs108|chr17 (493 aa)
initn: 1860 init1: 1860 opt: 1860 Z-score: 2290.6 bits: 433.4 E(32554): 2.9e-121
Smith-Waterman score: 3021; 92.6% identity (93.0% similar) in 530 aa overlap (1-530:1-493)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAAIKAVNSKAEVARAQAALAVNICAARGLQDVLRTNLGPKGTMKMLASGAGDIKLTKDG
::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::
CCDS54 MAAIKAVNSKAEVARARAALAVNICAARGLQDVLRTNLGPKGTMKMLVSGAGDIKLTKDG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 NVLLDEMQIQHPTASLIAKVATAQDDVTGDGTTSNVLIIGELLKQADLYISEGLHPRIIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NVLLDEMQIQHPTASLIAKVATAQDDVTGDGTTSNVLIIGELLKQADLYISEGLHPRIIA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 EGFEAAKIKALEVLEEVKVTKEMKRKILLDVARTSLQTKVHAELADVLTEVVVDSVLAVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 EGFEAAKIKALEVLEEVKVTKEMKRKILLDVARTSLQTKVHAELADVLTEVVVDSVLAVR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 RPGYPIDLFMVEIMEMKHKLGTDTKLIQGLVLDHGARHPDMKKRVEDAFILICNVSLEYE
:::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RPGYPIDLFMVEIMEMKHKLGTDTK-----------------------------------
190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 KTEVNSGFFYKTAEEKEKLVKAERKFIEDRVQKIIDLKDKVCAQSNKGFVVINQKGIDPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 --EVNSGFFYKTAEEKEKLVKAERKFIEDRVQKIIDLKDKVCAQSNKGFVVINQKGIDPF
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE6 SLDSLAKHGIVALRRAKRRNMERLSLACGGMAVNSFEDLTVDCLGHAGLVYEYTLGEEKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SLDSLAKHGIVALRRAKRRNMERLSLACGGMAVNSFEDLTVDCLGHAGLVYEYTLGEEKF
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KE6 TFIEECVNPCSVTLLVKGPNKHTLTQVKDAIRDGLRAIKNAIEDGCMVPGAGAIEVAMAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TFIEECVNPCSVTLLVKGPNKHTLTQVKDAIRDGLRAIKNAIEDGCMVPGAGAIEVAMAE
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KE6 ALVTYKNSIKGRARLGVQAFADALLIIPKVLAQNAGYDPQETLVKVQAEHVESKQLVGVD
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CCDS54 ALVTYKNSIKGRARLGVQAFADALLIIPKVLAQNAGYDPQETLVKVQAEHVESKQLVGVD
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530
pF1KE6 LNTGEPMVAADAGVWDNYCVKKQLLHSCTVIATNILLVDEIMRAGMSSLK
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CCDS54 LNTGEPMVAADAGVWDNYCVKKQLLHSCTVIATNILLVDEIMRAGMSSLK
450 460 470 480 490
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10 20 30 40 50
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:.: : .: .:.. :: ::. . :..:: ::::. :::: . : :
CCDS11 MMGHRPVLVLSQNTKRESGRKVQSG---NINAAKTIADIIRTCLGPKSMMKMLLDPMGGI
10 20 30 40 50
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.:.:::..: :.:.:::.:. . ... .::. .:::::: ... ::.:. :. .. . .
CCDS11 VMTNDGNAILREIQVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEMLSVAEHFLEQQM
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 HPRIIAEGFEAAKIKALEVLEEVKVTKEMKRK-ILLDVARTSLQTKVHAELADVLTEVVV
:: .. ... : . .:..... ... . ..:.. .:. ::. .. ... ....
CCDS11 HPTVVISAYRKALDDMISTLKKISIPVDISDSDMMLNIINSSITTKAISRWSSLACNIAL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE6 DSVLAVR--RPGYP-IDLF-MVEIMEMKHKLGTDTKLIQGLVLDHGARHPDMKKRVEDAF
:.: :. . : ::. .... .. . :. ...:..... . :: :.. ...
CCDS11 DAVKMVQFEENGRKEIDIKKYARVEKIPGGIIEDSCVLRGVMINKDVTHPRMRRYIKNPR
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE6 ILICNVSLEYEKTEVNSGFFYKTAEEKEKLVKAERKFIEDRVQKIIDLKDKVCAQSNKGF
:.. . ::::.: : .. . :. .... :...:.. . ::.:: :
CCDS11 IVLLDSSLEYKKGESQTDIEITREEDFTRILQMEEEYIQQLCEDIIQLKPDV--------
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pF1KE6 VVINQKGIDPFSLDSLAKHGIVALRRAKRRNMERLSLACGGMAVNSFEDLTVDCLGH-AG
::..:::. .. : . .:.:.::... . .:.. :::. :. :.: : .: ::
CCDS11 -VITEKGISDLAQHYLMRANITAIRRVRKTDNNRIARACGARIVSRPEELREDDVGTGAG
290 300 310 320 330 340
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pF1KE6 LVYEYTLGEEKFTFIEECVNPCSVTLLVKGPNKHTLTQVKDAIRDGLRAIKNAIEDGCMV
:. .:.: :::: .: .: . :.:..: .:. :..:. ..:.... .:.. : .:
CCDS11 LLEIKKIGDEYFTFITDCKDPKACTILLRGASKEILSEVERNLQDAMQVCRNVLLDPQLV
350 360 370 380 390 400
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pF1KE6 PGAGAIEVAMAEALVTYKNSIKGRARLGVQAFADALLIIPKVLAQNAGYDPQETLVKVQA
::.:: :.:.:.::. .... : . .: :.:: .::..: :: : . . :....:
CCDS11 PGGGASEMAVAHALTEKSKAMTGVEQWPYRAVAQALEVIPRTLIQNCGASTIRLLTSLRA
410 420 430 440 450 460
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pF1KE6 EHV-ESKQLVGVDLNTGEPMVAADAGVWDNYCVKKQLLHSCTVIATNILLVDEIMRAGMS
.:. :. . ::. .:: . . :.:. :: : .. . :. .: .:.:.
CCDS11 KHTQENCETWGVNGETGTLVDMKELGIWEPLAVKLQTYKTAVETAVLLLRIDDIVSGHKK
470 480 490 500 510 520
530
pF1KE6 SLK
CCDS11 KGDDQSRQGGAPDAGQE
530 540
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10 20 30 40
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:: .: ::... ...::.:::.: ::..
CCDS38 SMGTLAFDEYGRPFLIIKDQDRKSRLMGLEALKSHIMAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMV
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50 60 70 80 90 100
pF1KE6 SGAGDIKLTKDGNVLLDEMQIQHPTASLIAKVATAQDDVTGDGTTSNVLIIGELLKQADL
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CCDS38 DKDGDVTVTNDGATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQ
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pF1KE6 YISEGLHPRIIAEGFEAAKIKALEVLEEVK--VTKEMK-RKILLDVARTSLQTKVHAELA
...:.:: ::.:.: : :.: :.... : ..: . :...:.:.: .::
CCDS38 LLDRGIHPIRIADGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCH
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170 180 190 200 210
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..:..:..::.: :: .:. :..... :.: :::::.:...:. :
CCDS38 RQMAEIAVNAVLTVADMERR---DVDF---ELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSH
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220 230 240 250 260 270
pF1KE6 PDMKKRVEDAFILICNVSLEYEKTEVNSGFFYKTAEEKEKLVKAERKFIEDRVQKIIDLK
:.: :.:::: : : . .: : ... . ..:. . : : :.. .:. .:.:
CCDS38 PQMPKKVEDAKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQI----
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280 290 300 310 320 330
pF1KE6 DKVCAQSNKGFVVINQKGIDPFSLDSLAKHGIVALRRAKRRNMERLSLACGGMAVNSFED
. . . ..: : :.: . : .... :.: . ..: ...: :: : : .
CCDS38 -----KETGANLAICQWGFDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSE
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340 350 360 370 380 390
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::.. :: :::: : ..: ..:. ::.: : .::....: :: . ..: ...:.:
CCDS38 LTAEKLGFAGLVQEISFGTTKDKMLVIEQCKNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALC
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pF1KE6 AIKNAIEDGCMVPGAGAIEVAMAEALVTYKNSIKGRARLGVQAFADALLIIPKVLAQNAG
.:.: :.:. .: :.:: :.. : :. .. . ...:::::: .:: .:..:.:
CCDS38 VIRNLIRDNRVVYGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSG
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460 470 480 490 500 510
pF1KE6 YDPQETLVKVQAEHV-ESKQLVGVD-LNTGEPMVAADAGVWDNYCVKKQLLHSCTVIATN
..: .:...:.:..: : . .:.: :. : . . : .. ::: . : ..
CCDS38 MNPIQTMTEVRARQVKEMNPALGIDCLHKGTNDMKQQH-VIETLIGKKQQISLATQMVRM
470 480 490 500 510 520
520 530
pF1KE6 ILLVDEIMRAGMSSLK
:: .:.: . : :
CCDS38 ILKIDDIRKPGESEE
530 540
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10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MAAIKAVNSKAEVARAQAALAVNICAARGLQDVLRTNLGPKGTMKMLASGAGDIKLTKDG
.: ::... ...::.:::.: ::... ::. .:.::
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..:. :...: :.:..... .::: :::::. :.. : ::..:. ...:.:: ::
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.:.: : :.: :.... : ..: . :...:.:.: .:: ..:..:..::
CCDS82 DGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHRQMAEIAVNAVL
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.: :: .:. :..... :.: :::::.:...:. ::.: :.:::: :
CCDS82 TVADMERRD---VDF---ELIKVEGKVGGRLEDTKLIKGVIVDKDFSHPQMPKKVEDAKI
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pF1KE6 LICNVSLEYEKTEVNSGFFYKTAEEKEKLVKAERKFIEDRVQKIIDLKDKVCAQSNKGFV
: . .: : ... . ..:. . : : :.. .:. .:.: . . .: .
CCDS82 AILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKE------TGAN---L
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pF1KE6 VINQKGIDPFSLDSLAKHGIVALRRAKRRNMERLSLACGGMAVNSFEDLTVDCLGHAGLV
.: : :.: . : .... :.: . ..: ...: :: : : .::.. :: ::::
CCDS82 AICQWGFDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLV
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pF1KE6 YEYTLG--EEKFTFIEECVNPCSVTLLVKGPNKHTLTQVKDAIRDGLRAIKNAIEDGCMV
: ..: ..:. ::.: : .::....: :: . ..: ...:.: .:.: :.:. .:
CCDS82 QEISFGTTKDKMLVIEQCKNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVV
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pF1KE6 PGAGAIEVAMAEALVTYKNSIKGRARLGVQAFADALLIIPKVLAQNAGYDPQETLVKVQA
:.:: :.. : :. .. . ...:::::: .:: .:..:.:..: .:...:.:
CCDS82 YGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVRA
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pF1KE6 EHV-ESKQLVGVD-LNTGEPMVAADAGVWDNYCVKKQLLHSCTVIATNILLVDEIMRAGM
..: : . .:.: :. : . . : .. ::: . : .. :: .:.: . :
CCDS82 RQVKEMNPALGIDCLHKGTNDMKQQH-VIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGE
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530
pF1KE6 SSLK
:
CCDS82 SEE
520
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::... ...::.:::.: ::... ::. .:.::
CCDS77 MAAKAVANTMRTSLGPNGLDKMMVDKDGDVTVTNDG
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pF1KE6 NVLLDEMQIQHPTASLIAKVATAQDDVTGDGTTSNVLIIGELLKQADLYISEGLHPRIIA
..:. :...: :.:..... .::: :::::. :.. : ::..:. ...:.:: ::
CCDS77 ATILSMMDVDHQIAKLMVELSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEEAEQLLDRGIHPIRIA
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pF1KE6 EGFEAAKIKALEVLEEVK--VTKEMK-RKILLDVARTSLQTKVHAELADVLTEVVVDSVL
.:.: : :.: :.... : ..: . :...:.:.: .:: ..:..:..::
CCDS77 DGYEQAARVAIEHLDKISDSVLVDIKDTEPLIQTAKTTLGSKVVNSCHRQMAEIAVNAVL
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.: :: .:. :..... :.: :::::.:...:. ::.: :.:::: :
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pF1KE6 LICNVSLEYEKTEVNSGFFYKTAEEKEKLVKAERKFIEDRVQKIIDLKDKVCAQSNKGFV
: . .: : ... . ..:. . : : :.. .:. .:.: . . .: .
CCDS77 AILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKALQKYEKEKFEEMIQQIKE------TGAN---L
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pF1KE6 VINQKGIDPFSLDSLAKHGIVALRRAKRRNMERLSLACGGMAVNSFEDLTVDCLGHAGLV
.: : :.: . : .... :.: . ..: ...: :: : : .::.. :: ::::
CCDS77 AICQWGFDDEANHLLLQNNLPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGFAGLV
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: ..: ..:. ::.: : .::....: :: . ..: ...:.: .:.: :.:. .:
CCDS77 QEISFGTTKDKMLVIEQCKNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSLHDALCVIRNLIRDNRVV
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pF1KE6 PGAGAIEVAMAEALVTYKNSIKGRARLGVQAFADALLIIPKVLAQNAGYDPQETLVKVQA
:.:: :.. : :. .. . ...:::::: .:: .:..:.:..: .:...:.:
CCDS77 YGGGAAEISCALAVSQEADKCPTLEQYAMRAFADALEVIPMALSENSGMNPIQTMTEVRA
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pF1KE6 EHV-ESKQLVGVD-LNTGEPMVAADAGVWDNYCVKKQLLHSCTVIATNILLVDEIMRAGM
..: : . .:.: :. : . . : .. ::: . : .. :: .:.: . :
CCDS77 RQVKEMNPALGIDCLHKGTNDMKQQH-VIETLIGKKQQISLATQMVRMILKIDDIRKPGE
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530
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:
CCDS77 SEE
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CCDS33 PRSGATAGAAGGRGKGAYQDRDKPAQIRFSNISAAKAVADAIRTSLGPKGMDKMIQDGKG
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CCDS33 DVTITNDGATILKQMQVLHPAARMLVELSKAQDIEAGDGTTSVVIIAGSLLDSCTKLLQK
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:.:: ::.:.:. : :..:.: ... :.. :. ::. : :::..:: .. ...:. .
CCDS33 GIHPTIISESFQKALEKGIEILTDMSRPVELSDRETLLNSATTSLNSKVVSQYSSLLSPM
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:..:. : :. .. . .: .:. :: : .:..:::: . . . . ::: :
CCDS33 SVNAVMKVIDPATATSVDLRDIKIVKKLGGTIDDCELVEGLVLTQKVSNSGIT-RVEKAK
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pF1KE6 ILICNVSLEYEKTEVNSGFFYKTAEEKEKLVKAERKFIEDRVQKIIDLKDKVCAQSNKGF
: . . : ::.... . . . ..... :: .: . :..: : :
CCDS33 IGLIQFCLSAPKTDMDNQIVVSDYAQMDRVLREERAYILNLVKQI---KKTGCN------
250 260 270 280 290
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pF1KE6 VVINQKGI--DPFS---LDSLAKHGIVALRRAKRRNMERLSLACGGMAVNSFEDLTVDCL
:.. ::.: : .: : : : :.... .:...: . . : : ....:.: :
CCDS33 VLLIQKSILRDALSDLALHFLNKMKIMVIKDIEREDIEFICKTIGTKPVAHIDQFTADML
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pF1KE6 GHAGLVYEYTL-GEEKFTFIEECVNPC-SVTLLVKGPNKHTLTQVKDAIRDGLRAIKNAI
: : :. : .: : :. : :..: .::..:.: :: .. ... .:.:.: .:. .
CCDS33 GSAELAEEVNLNGSGKLLKITGCASPGKTVTIVVRGSNKLVIEEAERSIHDALCVIRCLV
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pF1KE6 EDGCMVPGAGAIEVAMAEALVTYKNSIKGRARLGVQAFADALLIIPKVLAQNAGYDPQET
. .. :.:: :. .: :. :. ...: :.:::::. .::..::.::: .: :
CCDS33 KKRALIAGGGAPEIELALRLTEYSRTLSGMESYCVRAFADAMEVIPSTLAENAGLNPIST
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..... .:..... .:... : . : . :. . : : . .:: .:...
CCDS33 VTELRNRHAQGEKTAGINVRKGGISNILEELVVQPLLVSVSALTLATETVRSILKIDDVV
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530
pF1KE6 RAGMSSLK
CCDS33 NTR
530 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]