Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE3277
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE3277, 692 aa
1>>>pF1KE3277 692 - 692 aa - 692 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7838+/-0.00108; mu= 8.0314+/- 0.063
mean_var=222.2889+/-50.474, 0's: 0 Z-trim(110.0): 705 B-trim: 133 in 1/49
Lambda= 0.086023
statistics sampled from 10452 (11279) to 10452 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.695), E-opt: 0.2 (0.346), width: 16
Scan time: 4.010
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32597.1 NEK8 gene_id:284086|Hs108|chr17 ( 692) 4636 589.3 6.4e-168
CCDS31979.1 NEK5 gene_id:341676|Hs108|chr13 ( 708) 814 114.9 4e-25
CCDS56348.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1189) 808 114.5 9.4e-25
CCDS56349.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1214) 808 114.5 9.6e-25
CCDS56350.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1242) 808 114.5 9.7e-25
CCDS47162.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1258) 808 114.5 9.8e-25
CCDS56351.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1286) 808 114.5 9.9e-25
CCDS2863.1 NEK4 gene_id:6787|Hs108|chr3 ( 841) 752 107.3 9.2e-23
CCDS9839.1 NEK9 gene_id:91754|Hs108|chr14 ( 979) 717 103.1 2.1e-21
CCDS73576.1 NEK3 gene_id:4752|Hs108|chr13 ( 506) 631 92.1 2.2e-18
CCDS1394.1 NEK7 gene_id:140609|Hs108|chr1 ( 302) 597 87.6 2.9e-17
CCDS6854.1 NEK6 gene_id:10783|Hs108|chr9 ( 313) 592 87.0 4.5e-17
CCDS55338.1 NEK6 gene_id:10783|Hs108|chr9 ( 331) 592 87.0 4.7e-17
CCDS55339.1 NEK6 gene_id:10783|Hs108|chr9 ( 338) 592 87.0 4.8e-17
CCDS48015.1 NEK6 gene_id:10783|Hs108|chr9 ( 347) 592 87.1 4.9e-17
CCDS46915.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3 ( 470) 579 85.6 1.8e-16
CCDS82836.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3 ( 482) 579 85.6 1.8e-16
CCDS54639.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3 ( 599) 579 85.7 2.1e-16
CCDS3069.1 NEK11 gene_id:79858|Hs108|chr3 ( 645) 579 85.7 2.2e-16
CCDS58750.1 STK36 gene_id:27148|Hs108|chr2 (1294) 525 79.4 3.7e-14
CCDS2421.1 STK36 gene_id:27148|Hs108|chr2 (1315) 525 79.4 3.8e-14
CCDS54593.1 NEK4 gene_id:6787|Hs108|chr3 ( 752) 497 75.6 2.9e-13
CCDS53651.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 709) 484 74.0 8.5e-13
CCDS53650.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 719) 484 74.0 8.6e-13
CCDS8051.2 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 724) 484 74.0 8.6e-13
CCDS41665.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 745) 484 74.0 8.8e-13
CCDS53649.1 MARK2 gene_id:2011|Hs108|chr11 ( 788) 484 74.0 9.1e-13
CCDS82645.1 LOC102724428 gene_id:102724428|Hs108|c ( 783) 481 73.7 1.2e-12
CCDS33575.1 SIK1 gene_id:150094|Hs108|chr21 ( 783) 481 73.7 1.2e-12
CCDS73034.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 780) 477 73.2 1.7e-12
CCDS31029.2 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 795) 477 73.2 1.7e-12
CCDS73033.1 MARK1 gene_id:4139|Hs108|chr1 ( 796) 477 73.2 1.7e-12
CCDS55947.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 713) 476 73.0 1.7e-12
CCDS41993.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 729) 476 73.0 1.7e-12
CCDS45166.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 744) 476 73.0 1.7e-12
CCDS45165.1 MARK3 gene_id:4140|Hs108|chr14 ( 753) 476 73.0 1.8e-12
CCDS55682.1 NEK2 gene_id:4751|Hs108|chr1 ( 384) 468 71.7 2.2e-12
CCDS73024.1 NEK2 gene_id:4751|Hs108|chr1 ( 388) 468 71.7 2.2e-12
CCDS12658.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 ( 688) 472 72.5 2.3e-12
CCDS1500.1 NEK2 gene_id:4751|Hs108|chr1 ( 445) 468 71.8 2.5e-12
CCDS56097.1 MARK4 gene_id:57787|Hs108|chr19 ( 752) 472 72.5 2.5e-12
CCDS3735.1 PLK4 gene_id:10733|Hs108|chr4 ( 970) 472 72.7 2.9e-12
CCDS31892.1 NUAK1 gene_id:9891|Hs108|chr12 ( 661) 469 72.1 2.9e-12
CCDS7336.1 CAMK2G gene_id:818|Hs108|chr10 ( 495) 465 71.5 3.4e-12
CCDS7337.1 CAMK2G gene_id:818|Hs108|chr10 ( 527) 465 71.5 3.6e-12
CCDS73153.1 CAMK2G gene_id:818|Hs108|chr10 ( 539) 465 71.5 3.6e-12
CCDS7338.1 CAMK2G gene_id:818|Hs108|chr10 ( 556) 465 71.5 3.7e-12
CCDS1453.2 NUAK2 gene_id:81788|Hs108|chr1 ( 672) 460 71.0 6.4e-12
CCDS60974.1 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1261) 464 71.8 7e-12
CCDS8379.2 SIK3 gene_id:23387|Hs108|chr11 (1321) 464 71.8 7.2e-12
>>CCDS32597.1 NEK8 gene_id:284086|Hs108|chr17 (692 aa)
initn: 4636 init1: 4636 opt: 4636 Z-score: 3128.2 bits: 589.3 E(32554): 6.4e-168
Smith-Waterman score: 4636; 100.0% identity (100.0% similar) in 692 aa overlap (1-692:1-692)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MEKYERIRVVGRGAFGIVHLCLRKADQKLVIIKQIPVEQMTKEERQAAQNECQVLKLLNH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MEKYERIRVVGRGAFGIVHLCLRKADQKLVIIKQIPVEQMTKEERQAAQNECQVLKLLNH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 PNVIEYYENFLEDKALMIAMEYAPGGTLAEFIQKRCNSLLEEETILHFFVQILLALHHVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PNVIEYYENFLEDKALMIAMEYAPGGTLAEFIQKRCNSLLEEETILHFFVQILLALHHVH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE3 THLILHRDLKTQNILLDKHRMVVKIGDFGISKILSSKSKAYTVVGTPCYISPELCEGKPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 THLILHRDLKTQNILLDKHRMVVKIGDFGISKILSSKSKAYTVVGTPCYISPELCEGKPY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE3 NQKSDIWALGCVLYELASLKRAFEAANLPALVLKIMSGTFAPISDRYSPELRQLVLSLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NQKSDIWALGCVLYELASLKRAFEAANLPALVLKIMSGTFAPISDRYSPELRQLVLSLLS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE3 LEPAQRPPLSHIMAQPLCIRALLNLHTDVGSVRMRRAEKSVAPSNTGSRTTSVRCRGIPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LEPAQRPPLSHIMAQPLCIRALLNLHTDVGSVRMRRAEKSVAPSNTGSRTTSVRCRGIPR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE3 GPVRPAIPPPLSSVYAWGGGLGTPLRLPMLNTEVVQVAAGRTQKAGVTRSGRLILWEAPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GPVRPAIPPPLSSVYAWGGGLGTPLRLPMLNTEVVQVAAGRTQKAGVTRSGRLILWEAPP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE3 LGAGGGSLLPGAVEQPQPQFISRFLEGQSGVTIKHVACGDFFTACLTDRGIIMTFGSGSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LGAGGGSLLPGAVEQPQPQFISRFLEGQSGVTIKHVACGDFFTACLTDRGIIMTFGSGSN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE3 GCLGHGSLTDISQPTIVEALLGYEMVQVACGASHVLALSTERELFAWGRGDSGRLGLGTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GCLGHGSLTDISQPTIVEALLGYEMVQVACGASHVLALSTERELFAWGRGDSGRLGLGTR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE3 ESHSCPQQVPMPPGQEAQRVVCGIDSSMILTVPGQALACGSNRFNKLGLDHLSLGEEPVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 ESHSCPQQVPMPPGQEAQRVVCGIDSSMILTVPGQALACGSNRFNKLGLDHLSLGEEPVP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE3 HQQVEEALSFTLLGSAPLDQEPLLSIDLGTAHSAAVTASGDCYTFGSNQHGQLGTNTRRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 HQQVEEALSFTLLGSAPLDQEPLLSIDLGTAHSAAVTASGDCYTFGSNQHGQLGTNTRRG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE3 SRAPCKVQGLEGIKMAMVACGDAFTVAIGAESEVYSWGKGARGRLGRRDEDAGLPRPVQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SRAPCKVQGLEGIKMAMVACGDAFTVAIGAESEVYSWGKGARGRLGRRDEDAGLPRPVQL
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KE3 DETHPYTVTSVSCCHGNTLLAVRSVTDEPVPP
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DETHPYTVTSVSCCHGNTLLAVRSVTDEPVPP
670 680 690
>>CCDS31979.1 NEK5 gene_id:341676|Hs108|chr13 (708 aa)
initn: 831 init1: 456 opt: 814 Z-score: 564.6 bits: 114.9 E(32554): 4e-25
Smith-Waterman score: 814; 46.5% identity (79.5% similar) in 258 aa overlap (1-257:1-258)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MEKYERIRVVGRGAFGIVHLCLRKADQKLVIIKQIPVEQMTKEERQAAQNECQVLKLLNH
:.::. :...:.:::: ..: :.:.: .::.: :.: .:..:...: .:. ..:
CCDS31 MDKYDVIKAIGQGAFGKAYLAKGKSDSKHCVIKEINFEKMPIQEKEASKKEVILLEKMKH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 PNVIEYYENFLEDKALMIAMEYAPGGTLAEFIQKRCNSLLEEETILHFFVQILLALHHVH
::.. ....: :. :.:.::: :: : . :... . :. :. :: .:::: :.:.:.:
CCDS31 PNIVAFFNSFQENGRLFIVMEYCDGGDLMKRINRQRGVLFSEDQILGWFVQISLGLKHIH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE3 THLILHRDLKTQNILLDKHRMVVKIGDFGISKILSSKSK-AYTVVGTPCYISPELCEGKP
. :::::.:.:::.:.:. ::.:.:::::...:... . : : .::: :.:::.:..::
CCDS31 DRKILHRDIKAQNIFLSKNGMVAKLGDFGIARVLNNSMELARTCIGTPYYLSPEICQNKP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 YNQKSDIWALGCVLYELASLKRAFEAANLPALVLKIMSGTFAPISDRYSPELRQLVLSLL
::.:.:::.:::::::: .::. ::. :: ::::: .. ::::: .: ::..:. .:.
CCDS31 YNNKTDIWSLGCVLYELCTLKHPFEGNNLQQLVLKICQAHFAPISPGFSRELHSLISQLF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 SLEPAQRPPLSHIMAQPLCIRALLNLHTDVGSVRMRRAEKSVAPSNTGSRTTSVRCRGIP
.. : .:: .. :. .:.
CCDS31 QVSPRDRPSINSILKRPFLENLIPKYLTPEVIQEEFSHMLICRAGAPASRHAGKVVQKCK
250 260 270 280 290 300
>>CCDS56348.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1189 aa)
initn: 742 init1: 742 opt: 808 Z-score: 557.9 bits: 114.5 E(32554): 9.4e-25
Smith-Waterman score: 808; 48.4% identity (77.3% similar) in 256 aa overlap (1-255:1-255)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MEKYERIRVVGRGAFGIVHLCLRKADQKLVIIKQIPVEQMTKEERQAAQNECQVLKLLNH
:::: :.. .:.:.:: . : : . .::.: . .:...::. .. : :: ..:
CCDS56 MEKYVRLQKIGEGSFGKAILVKSTEDGRQYVIKEINISRMSSKEREESRREVAVLANMKH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 PNVIEYYENFLEDKALMIAMEYAPGGTLAEFIQKRCNSLLEEETILHFFVQILLALHHVH
::...: :.: :. .:.:.:.: :: : . :. . . :..:. :: .:::: :::.:::
CCDS56 PNIVQYRESFEENGSLYIVMDYCEGGDLFKRINAQKGVLFQEDQILDWFVQICLALKHVH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE3 THLILHRDLKTQNILLDKHRMVVKIGDFGISKILSSKSK-AYTVVGTPCYISPELCEGKP
. :::::.:.:::.: : .:..:::::...:.: . : : .::: :.:::.::.::
CCDS56 DRKILHRDIKSQNIFLTKDG-TVQLGDFGIARVLNSTVELARTCIGTPYYLSPEICENKP
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 YNQKSDIWALGCVLYELASLKRAFEAANLPALVLKIMSGTFAPISDRYSPELRQLVLSLL
::.:::::::::::::: .::.::::... :::::.::.: :.: .:: .::.:: .:.
CCDS56 YNNKSDIWALGCVLYELCTLKHAFEAGSMKNLVLKIISGSFPPVSLHYSYDLRSLVSQLF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 SLEPAQRPPLSHIMAQPLCIRALLNLHTDVGSVRMRRAEKSVAPSNTGSRTTSVRCRGIP
. .: .:: .. :. .
CCDS56 KRNPRDRPSVNSILEKGFIAKRIEKFLSPQLIAEEFCLKTFSKFGSQPIPAKRPASGQNS
240 250 260 270 280 290
>>CCDS56349.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1214 aa)
initn: 742 init1: 742 opt: 808 Z-score: 557.7 bits: 114.5 E(32554): 9.6e-25
Smith-Waterman score: 808; 48.4% identity (77.3% similar) in 256 aa overlap (1-255:1-255)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MEKYERIRVVGRGAFGIVHLCLRKADQKLVIIKQIPVEQMTKEERQAAQNECQVLKLLNH
:::: :.. .:.:.:: . : : . .::.: . .:...::. .. : :: ..:
CCDS56 MEKYVRLQKIGEGSFGKAILVKSTEDGRQYVIKEINISRMSSKEREESRREVAVLANMKH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 PNVIEYYENFLEDKALMIAMEYAPGGTLAEFIQKRCNSLLEEETILHFFVQILLALHHVH
::...: :.: :. .:.:.:.: :: : . :. . . :..:. :: .:::: :::.:::
CCDS56 PNIVQYRESFEENGSLYIVMDYCEGGDLFKRINAQKGVLFQEDQILDWFVQICLALKHVH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE3 THLILHRDLKTQNILLDKHRMVVKIGDFGISKILSSKSK-AYTVVGTPCYISPELCEGKP
. :::::.:.:::.: : .:..:::::...:.: . : : .::: :.:::.::.::
CCDS56 DRKILHRDIKSQNIFLTKDG-TVQLGDFGIARVLNSTVELARTCIGTPYYLSPEICENKP
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 YNQKSDIWALGCVLYELASLKRAFEAANLPALVLKIMSGTFAPISDRYSPELRQLVLSLL
::.:::::::::::::: .::.::::... :::::.::.: :.: .:: .::.:: .:.
CCDS56 YNNKSDIWALGCVLYELCTLKHAFEAGSMKNLVLKIISGSFPPVSLHYSYDLRSLVSQLF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 SLEPAQRPPLSHIMAQPLCIRALLNLHTDVGSVRMRRAEKSVAPSNTGSRTTSVRCRGIP
. .: .:: .. :. .
CCDS56 KRNPRDRPSVNSILEKGFIAKRIEKFLSPQLIAEEFCLKTFSKFGSQPIPAKRPASGQNS
240 250 260 270 280 290
>>CCDS56350.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1242 aa)
initn: 742 init1: 742 opt: 808 Z-score: 557.6 bits: 114.5 E(32554): 9.7e-25
Smith-Waterman score: 808; 48.4% identity (77.3% similar) in 256 aa overlap (1-255:1-255)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MEKYERIRVVGRGAFGIVHLCLRKADQKLVIIKQIPVEQMTKEERQAAQNECQVLKLLNH
:::: :.. .:.:.:: . : : . .::.: . .:...::. .. : :: ..:
CCDS56 MEKYVRLQKIGEGSFGKAILVKSTEDGRQYVIKEINISRMSSKEREESRREVAVLANMKH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 PNVIEYYENFLEDKALMIAMEYAPGGTLAEFIQKRCNSLLEEETILHFFVQILLALHHVH
::...: :.: :. .:.:.:.: :: : . :. . . :..:. :: .:::: :::.:::
CCDS56 PNIVQYRESFEENGSLYIVMDYCEGGDLFKRINAQKGVLFQEDQILDWFVQICLALKHVH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE3 THLILHRDLKTQNILLDKHRMVVKIGDFGISKILSSKSK-AYTVVGTPCYISPELCEGKP
. :::::.:.:::.: : .:..:::::...:.: . : : .::: :.:::.::.::
CCDS56 DRKILHRDIKSQNIFLTKDG-TVQLGDFGIARVLNSTVELARTCIGTPYYLSPEICENKP
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 YNQKSDIWALGCVLYELASLKRAFEAANLPALVLKIMSGTFAPISDRYSPELRQLVLSLL
::.:::::::::::::: .::.::::... :::::.::.: :.: .:: .::.:: .:.
CCDS56 YNNKSDIWALGCVLYELCTLKHAFEAGSMKNLVLKIISGSFPPVSLHYSYDLRSLVSQLF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 SLEPAQRPPLSHIMAQPLCIRALLNLHTDVGSVRMRRAEKSVAPSNTGSRTTSVRCRGIP
. .: .:: .. :. .
CCDS56 KRNPRDRPSVNSILEKGFIAKRIEKFLSPQLIAEEFCLKTFSKFGSQPIPAKRPASGQNS
240 250 260 270 280 290
>>CCDS47162.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1258 aa)
initn: 742 init1: 742 opt: 808 Z-score: 557.6 bits: 114.5 E(32554): 9.8e-25
Smith-Waterman score: 808; 48.4% identity (77.3% similar) in 256 aa overlap (1-255:1-255)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MEKYERIRVVGRGAFGIVHLCLRKADQKLVIIKQIPVEQMTKEERQAAQNECQVLKLLNH
:::: :.. .:.:.:: . : : . .::.: . .:...::. .. : :: ..:
CCDS47 MEKYVRLQKIGEGSFGKAILVKSTEDGRQYVIKEINISRMSSKEREESRREVAVLANMKH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 PNVIEYYENFLEDKALMIAMEYAPGGTLAEFIQKRCNSLLEEETILHFFVQILLALHHVH
::...: :.: :. .:.:.:.: :: : . :. . . :..:. :: .:::: :::.:::
CCDS47 PNIVQYRESFEENGSLYIVMDYCEGGDLFKRINAQKGVLFQEDQILDWFVQICLALKHVH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE3 THLILHRDLKTQNILLDKHRMVVKIGDFGISKILSSKSK-AYTVVGTPCYISPELCEGKP
. :::::.:.:::.: : .:..:::::...:.: . : : .::: :.:::.::.::
CCDS47 DRKILHRDIKSQNIFLTKDG-TVQLGDFGIARVLNSTVELARTCIGTPYYLSPEICENKP
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 YNQKSDIWALGCVLYELASLKRAFEAANLPALVLKIMSGTFAPISDRYSPELRQLVLSLL
::.:::::::::::::: .::.::::... :::::.::.: :.: .:: .::.:: .:.
CCDS47 YNNKSDIWALGCVLYELCTLKHAFEAGSMKNLVLKIISGSFPPVSLHYSYDLRSLVSQLF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 SLEPAQRPPLSHIMAQPLCIRALLNLHTDVGSVRMRRAEKSVAPSNTGSRTTSVRCRGIP
. .: .:: .. :. .
CCDS47 KRNPRDRPSVNSILEKGFIAKRIEKFLSPQLIAEEFCLKTFSKFGSQPIPAKRPASGQNS
240 250 260 270 280 290
>>CCDS56351.1 NEK1 gene_id:4750|Hs108|chr4 (1286 aa)
initn: 742 init1: 742 opt: 808 Z-score: 557.4 bits: 114.5 E(32554): 9.9e-25
Smith-Waterman score: 808; 48.4% identity (77.3% similar) in 256 aa overlap (1-255:1-255)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MEKYERIRVVGRGAFGIVHLCLRKADQKLVIIKQIPVEQMTKEERQAAQNECQVLKLLNH
:::: :.. .:.:.:: . : : . .::.: . .:...::. .. : :: ..:
CCDS56 MEKYVRLQKIGEGSFGKAILVKSTEDGRQYVIKEINISRMSSKEREESRREVAVLANMKH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 PNVIEYYENFLEDKALMIAMEYAPGGTLAEFIQKRCNSLLEEETILHFFVQILLALHHVH
::...: :.: :. .:.:.:.: :: : . :. . . :..:. :: .:::: :::.:::
CCDS56 PNIVQYRESFEENGSLYIVMDYCEGGDLFKRINAQKGVLFQEDQILDWFVQICLALKHVH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE3 THLILHRDLKTQNILLDKHRMVVKIGDFGISKILSSKSK-AYTVVGTPCYISPELCEGKP
. :::::.:.:::.: : .:..:::::...:.: . : : .::: :.:::.::.::
CCDS56 DRKILHRDIKSQNIFLTKDG-TVQLGDFGIARVLNSTVELARTCIGTPYYLSPEICENKP
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 YNQKSDIWALGCVLYELASLKRAFEAANLPALVLKIMSGTFAPISDRYSPELRQLVLSLL
::.:::::::::::::: .::.::::... :::::.::.: :.: .:: .::.:: .:.
CCDS56 YNNKSDIWALGCVLYELCTLKHAFEAGSMKNLVLKIISGSFPPVSLHYSYDLRSLVSQLF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 SLEPAQRPPLSHIMAQPLCIRALLNLHTDVGSVRMRRAEKSVAPSNTGSRTTSVRCRGIP
. .: .:: .. :. .
CCDS56 KRNPRDRPSVNSILEKGFIAKRIEKFLSPQLIAEEFCLKTFSKFGSQPIPAKRPASGQNS
240 250 260 270 280 290
>>CCDS2863.1 NEK4 gene_id:6787|Hs108|chr3 (841 aa)
initn: 671 init1: 505 opt: 752 Z-score: 522.1 bits: 107.3 E(32554): 9.2e-23
Smith-Waterman score: 752; 33.3% identity (65.9% similar) in 393 aa overlap (1-381:3-391)
10 20 30 40 50
pF1KE3 MEKYERIRVVGRGAFGIVHLCLRKADQKLVIIKQIPVEQMTKEERQAAQNECQVLKLL
. : .::::.:..: : : .. : : .::.. ... ...::.::..: :.:. :
CCDS28 MPLAAYCYLRVVGKGSYGEVTLVKHRRDGKQYVIKKLNLRNASSRERRAAEQEAQLLSQL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE3 NHPNVIEYYENFLE-DKALMIAMEYAPGGTLAEFIQKRCNSLLEEETILHFFVQILLALH
.:::.. : :.. : :.:.: . :: : . .... ..:: :. ....:::: .::.
CCDS28 KHPNIVTYKESWEGGDGLLYIVMGFCEGGDLYRKLKEQKGQLLPENQVVEWFVQIAMALQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE3 HVHTHLILHRDLKTQNILLDKHRMVVKIGDFGISKILSSKSK-AYTVVGTPCYISPELCE
..: . ::::::::::..: . ..:.::.::...: .. : :..::: :.::::
CCDS28 YLHEKHILHRDLKTQNVFLTR-TNIIKVGDLGIARVLENHCDMASTLIGTPYYMSPELFS
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 GKPYNQKSDIWALGCVLYELASLKRAFEAANLPALVLKIMSGTFAPISDRYSPELRQLVL
.:::: :::.::::: .::.:.::.::.: .. .:: .:. : . :. ::::: .:.
CCDS28 NKPYNYKSDVWALGCCVYEMATLKHAFNAKDMNSLVYRIIEGKLPPMPRDYSPELAELIR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 SLLSLEPAQRPPLSHIMAQPLCIRALLNLHTDVGSVRMRRAEKSVAPSNTGSRTTSVRCR
..:: .: .:: . :. :: :. ... . ..... ..... ... :. ..
CCDS28 TMLSKRPEERPSVRSILRQPY-IKRQISFFLE--ATKIKTSKNNIKNGDSQSKPFATVVS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE3 GIPRGPVRPAIPPPLSS----VYAWGGGLGTPLRLPMLNTEVVQVAA--GRTQKAGVTRS
: .. . : :::: .: : : . : . . . :. ..: : .. .
CCDS28 GEAESNHEVIHPQPLSSEGSQTYIMGEGKCLSQEKPRASGLLKSPASLKAHTCKQDLSNT
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KE3 GRLILWEAPPL----GAGGGSLLPGAVEQPQPQFISRFLEGQSGVTIKHVACGDFFTACL
.: . . . : :. : :.. ::...
CCDS28 TELATISSVNIDILPAKGRDSVSDGFVQENQPRYLDASNELGGICSISQVEEEMLQDNTK
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE3 TDRGIIMTFGSGSNGCLGHGSLTDISQPTIVEALLGYEMVQVACGASHVLALSTERELFA
CCDS28 SSAQPENLIPMWSSDIVTGEKNEPVKPLQPLIKEQKPKDQSLALSPKLECSGTILAHSNL
420 430 440 450 460 470
>>CCDS9839.1 NEK9 gene_id:91754|Hs108|chr14 (979 aa)
initn: 1016 init1: 595 opt: 717 Z-score: 497.8 bits: 103.1 E(32554): 2.1e-21
Smith-Waterman score: 1406; 36.9% identity (64.9% similar) in 710 aa overlap (4-687:52-729)
10 20 30
pF1KE3 MEKYERIRVVGRGAFGIVHLCLRKADQKLVIIK
: :::.:::::: . : : :..::. :
CCDS98 SGGCGDSSPGPSASQGPRAGGGAAEQEELHYIPIRVLGRGAFGEATLYRRTEDDSLVVWK
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KE3 QIPVEQMTKEERQAAQNECQVLKLLNHPNVIEYYENFLEDKALMIAMEYAPGGTLAEFIQ
.. . .....::. : :: .: ::.: :.: ::..:... .:.: .:: ::.: . :
CCDS98 EVDLTRLSEKERRDALNEIVILALLQHDNIIAYYNHFMDNTTLLIELEYCNGGNLYDKIL
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KE3 KRCNSLLEEETILHFFVQILLALHHVHTHLILHRDLKTQNILLDKHRMVVKIGDFGISKI
.. ..:.::: .. .. ::. :. .: :::::.:: ::.: : .. :.::.:..:
CCDS98 RQKDKLFEEEMVVWYLFQIVSAVSCIHKAGILHRDIKTLNIFLTKANLI-KLGDYGLAKK
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KE3 LSSK-SKAYTVVGTPCYISPELCEGKPYNQKSDIWALGCVLYELASLKRAFEAANLPALV
:.:. : : :.:::: :.:::::.: :: ::::::.:::..:: .:::.:.:.: :
CCDS98 LNSEYSMAETLVGTPYYMSPELCQGVKYNFKSDIWAVGCVIFELLTLKRTFDATNPLNLC
210 220 230 240 250 260
220 230 240 250 260 270
pF1KE3 LKIMSGTFAPISD--RYSPELRQLVLSLLSLEPAQRPPLSHIMAQPLCIRALLNLHTDVG
.::..: : : .:: :: :.: : :. .: ::: .... .:: .:
CCDS98 VKIVQGIRAMEVDSSQYSLELIQMVHSCLDQDPEQRPTADELLDRPL-LRK---------
270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KE3 SVRMRRAEKSVAPSNTGSRTTSVRCRGIPRGPVRPAIPPPLSSVYAWGGGLGTPLRLPML
: :. :..:. :. .. : . ..:. .. : ::.:::: .:: .: ..
CCDS98 --RRREMEEKVTLLNAPTKRP--RSSTVTEAPI-AVVTSRTSEVYVWGGGKSTPQKLDVI
320 330 340 350 360
340 350 360 370 380
pF1KE3 NT--EVVQVAAGRTQKAGVTRSGRLILWEAPPLGAGGGSLLPGAVEQP------QPQFIS
.. . :: :: :. : :: .: : .. ::. : : . . ::. .
CCDS98 KSGCSARQVCAGNTHFAVVTVEKELYTW----VNMQGGTKLHGQLGHGDKASYRQPKHVE
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KE3 RFLEGQSGVTIKHVACGDFFTACLTDRGIIMTFGSGSNGCLGHGSLT--DISQPTIVEAL
. :.:.. :..:.::: ::.:.::.: ...::: ::.: ... .. .: .. .
CCDS98 K-LQGKA---IRQVSCGDDFTVCVTDEGQLYAFGSDYYGCMGVDKVAGPEVLEPMQLNFF
430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KE3 LGYEMVQVACGASHVLALSTERELFAWGRGDSGRLGLGTRESHSCPQQVPMPPGQEAQRV
:. . ::.:: .::..:. ..:...:: :. ::::: ..:.. ::.: .: . :
CCDS98 LSNPVEQVSCGDNHVVVLTRNKEVYSWGCGEYGRLGLDSEEDYYTPQKVDVPKALIIVAV
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550
pF1KE3 VCGIDSSMILTVPGQALACGSNRFNKLGLDHLSLGEEPVPHQQVEEA---LSFTLLGSAP
:: :....:: :..:::: :.::::::.. : . :. .:. :::: .
CCDS98 QCGCDGTFLLTQSGKVLACGLNEFNKLGLNQCMSG--IINHEAYHEVPYTTSFTL--AKQ
540 550 560 570 580 590
560 570 580 590 600 610
pF1KE3 LDQEPLLSIDLGTAHSAAVTASGDCYTFGSNQHGQLGTNTRRGSRAPCKVQG--LEGIKM
:. . .: : .:.::. : ::: :. ::::... . .: .. : : : ..
CCDS98 LSFYKIRTIAPGKTHTAAIDERGRLLTFGCNKCGQLGVGNYK-KRLGINLLGGPLGGKQV
600 610 620 630 640 650
620 630 640 650 660
pF1KE3 AMVACGDAFTVAIGAESEVYSWGKGARGRLG----RRDEDAGL----PRPVQLDETHPYT
:.::: ::.: ......::.:. :::. .: . . . :::. . :
CCDS98 IRVSCGDEFTIAATDDNHIFAWGNGGNGRLAMTPTERPHGSDICTSWPRPIFGSLHH---
660 670 680 690 700
670 680 690
pF1KE3 VTSVSCCHGNTLLAVRSVTDEPVPP
: ..:: .:.: :..: .
CCDS98 VPDLSCRGWHTILIVEKVLNSKTIRSNSSGLSIGTVFQSSSPGGGGGGGGGEEEDSQQES
710 720 730 740 750 760
>>CCDS73576.1 NEK3 gene_id:4752|Hs108|chr13 (506 aa)
initn: 574 init1: 503 opt: 631 Z-score: 443.6 bits: 92.1 E(32554): 2.2e-18
Smith-Waterman score: 631; 36.8% identity (72.8% similar) in 261 aa overlap (1-260:1-259)
10 20 30 40 50 60
pF1KE3 MEKYERIRVVGRGAFGIVHLCLRKADQKLVIIKQIPVEQMTKEERQAAQNECQVLKLLNH
:. : .:..:.:.:: . : ....... .:.: . . . . : ...: .: ..:
CCDS73 MDDYMVLRMIGEGSFGRALLVQHESSNQMFAMKEIRLPK-SFSNTQNSRKEAVLLAKMKH
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE3 PNVIEYYENFLEDKALMIAMEYAPGGTLAEFIQKRCNSLLEEETILHFFVQILLALHHVH
::.. . :.: . :.:.::: :: : . :... ..:. :. ::..:.:. :...:.:
CCDS73 PNIVAFKESFEAEGHLYIVMEYCDGGDLMQKIKQQKGKLFPEDMILNWFTQMCLGVNHIH
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KE3 THLILHRDLKTQNILLDKHRMVVKIGDFGISKILSSKSK-AYTVVGTPCYISPELCEGKP
. .::::.:..::.: .. : :.:::: ...::. : : :::: :. ::. :. :
CCDS73 KKRVLHRDIKSKNIFLTQNGKV-KLGDFGSARLLSNPMAFACTYVGTPYYVPPEIWENLP
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE3 YNQKSDIWALGCVLYELASLKRAFEAANLPALVLKIMSGTFAPISDRYSPELRQLVLSLL
::.:::::.:::.:::: .::. :.: . :.::. .: ..:. ..:: ::. :: ...
CCDS73 YNNKSDIWSLGCILYELCTLKHPFQANSWKNLILKVCQGCISPLPSHYSYELQFLVKQMF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE3 SLEPAQRPPLSHIMAQPLCIRALLNLHTDVGSVRMRRAEKSVAPSNTGSRTTSVRCRGIP
. .:..:: . .... . :
CCDS73 KRNPSHRPSATTLLSRGIVARLVQKCLPPEIIMEYGEEVLEEIKNSKHNTPRKKTNPSRI
240 250 260 270 280 290
692 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 18:21:16 2016 done: Mon Nov 7 18:21:17 2016
Total Scan time: 4.010 Total Display time: 0.120
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]