Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1155
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1155, 506 aa
1>>>pF1KE1155 506 - 506 aa - 506 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1922+/-0.00106; mu= 9.6483+/- 0.064
mean_var=116.6276+/-23.302, 0's: 0 Z-trim(107.0): 46 B-trim: 53 in 1/50
Lambda= 0.118761
statistics sampled from 9257 (9301) to 9257 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.657), E-opt: 0.2 (0.286), width: 16
Scan time: 3.350
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32493.1 CDYL2 gene_id:124359|Hs108|chr16 ( 506) 3371 588.9 4.6e-168
CCDS47364.1 CDYL gene_id:9425|Hs108|chr6 ( 412) 1334 239.8 4.4e-63
CCDS4491.2 CDYL gene_id:9425|Hs108|chr6 ( 544) 1334 239.9 5.6e-63
CCDS35473.1 CDY2B gene_id:203611|Hs108|chrY ( 541) 1111 201.6 1.8e-51
CCDS14789.1 CDY2A gene_id:9426|Hs108|chrY ( 541) 1111 201.6 1.8e-51
CCDS14802.1 CDY1 gene_id:9085|Hs108|chrY ( 540) 1109 201.3 2.2e-51
CCDS35487.1 CDY1B gene_id:253175|Hs108|chrY ( 540) 1109 201.3 2.2e-51
CCDS14801.1 CDY1 gene_id:9085|Hs108|chrY ( 554) 1082 196.7 5.7e-50
CCDS35486.1 CDY1B gene_id:253175|Hs108|chrY ( 554) 1082 196.7 5.7e-50
CCDS4490.1 ECI2 gene_id:10455|Hs108|chr6 ( 364) 594 113.0 5.8e-25
CCDS43420.2 ECI2 gene_id:10455|Hs108|chr6 ( 394) 594 113.0 6.2e-25
>>CCDS32493.1 CDYL2 gene_id:124359|Hs108|chr16 (506 aa)
initn: 3371 init1: 3371 opt: 3371 Z-score: 3130.8 bits: 588.9 E(32554): 4.6e-168
Smith-Waterman score: 3371; 100.0% identity (100.0% similar) in 506 aa overlap (1-506:1-506)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MASGDLYEVERIVDKRKNKKGKWEYLIRWKGYGSTEDTWEPEHHLLHCEEFIDEFNGLHM
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CCDS32 MASGDLYEVERIVDKRKNKKGKWEYLIRWKGYGSTEDTWEPEHHLLHCEEFIDEFNGLHM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 SKDKRIKSGKQSSTSKLLRDSRGPSVEKLSHRPSDPGKSKGTSHKRKRINPPLAKPKKGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SKDKRIKSGKQSSTSKLLRDSRGPSVEKLSHRPSDPGKSKGTSHKRKRINPPLAKPKKGY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 SGKPSSGGDRATKTVSYRTTPSGLQIMPLKKSQNGMENGDAGSEKDERHFGNGSHQPGLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SGKPSSGGDRATKTVSYRTTPSGLQIMPLKKSQNGMENGDAGSEKDERHFGNGSHQPGLD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LNDHVGEQDMGECDVNHATLAENGLGSALTNGGLNLHSPVKRKLEAEKDYVFDKRLRYSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LNDHVGEQDMGECDVNHATLAENGLGSALTNGGLNLHSPVKRKLEAEKDYVFDKRLRYSV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RQNESNCRFRDIVVRKEEGFTHILLSSQTSDNNALTPEIMKEVRRALCNAATDDSKLLLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RQNESNCRFRDIVVRKEEGFTHILLSSQTSDNNALTPEIMKEVRRALCNAATDDSKLLLL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 SAVGSVFCSGLDYSYLIGRLSSDRRKESTRIAEAIRDFVKAFIQFKKPIVVAINGPALGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SAVGSVFCSGLDYSYLIGRLSSDRRKESTRIAEAIRDFVKAFIQFKKPIVVAINGPALGL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 GASILPLCDIVWASEKAWFQTPYATIRLTPAGCSSYTFPQILGVALANEMLFCGRKLTAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GASILPLCDIVWASEKAWFQTPYATIRLTPAGCSSYTFPQILGVALANEMLFCGRKLTAQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 EACSRGLVSQVFWPTTFSQEVMLRVKEMASCSAVVLEESKCLVRSFLKSVLEDVNEKECL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EACSRGLVSQVFWPTTFSQEVMLRVKEMASCSAVVLEESKCLVRSFLKSVLEDVNEKECL
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KE1 MLKQLWSSSKGLDSLFSYLQDKIYEV
::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MLKQLWSSSKGLDSLFSYLQDKIYEV
490 500
>>CCDS47364.1 CDYL gene_id:9425|Hs108|chr6 (412 aa)
initn: 1338 init1: 1309 opt: 1334 Z-score: 1246.0 bits: 239.8 E(32554): 4.4e-63
Smith-Waterman score: 1350; 55.4% identity (78.5% similar) in 395 aa overlap (135-505:17-411)
110 120 130 140 150
pF1KE1 KRKRINPPLAKPKKGYSGKPSSGGDRATKTVSYRTTPSGLQ------IMPLKKSQNGMEN
:. ::. .:.: . :....:.
CCDS47 MDLAKSGIKILVPKSPVKSRTAVDGFQSESPEKLDPVEQGQEDTVA
10 20 30 40
160 170 180 190 200
pF1KE1 GDAGSEKDERHF-GNGSHQPGLDLNDHVGE---QDMGECDVNHAT-LAENGLGS-----A
....:: . : :... . .. : : . :: :: :: :. :
CCDS47 PEVAAEKPVGALLGPGAERARMGSRPRIHPLVPQVPGPVTAAMATGLAVNGKGTSPFMDA
50 60 70 80 90 100
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 LT-NGGLNLHSPV------KRK-LEAEKDYVFDKRLRYSVRQNESNCRFRDIVVRKEEGF
:: :: :... : ::: .. ..: ::::::.::::.:: :.:::::::..::
CCDS47 LTANGTTNIQTSVTGVTASKRKFIDDRRDQPFDKRLRFSVRQTESAYRYRDIVVRKQDGF
110 120 130 140 150 160
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 THILLSSQTSDNNALTPEIMKEVRRALCNAATDDSKLLLLSAVGSVFCSGLDYSYLIGRL
::::::...:.::.:.::.:.::. :: .::.:::::.:::::::::: :::. :.: ::
CCDS47 THILLSTKSSENNSLNPEVMREVQSALSTAAADDSKLVLLSAVGSVFCCGLDFIYFIRRL
170 180 190 200 210 220
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 SSDRRKESTRIAEAIRDFVKAFIQFKKPIVVAINGPALGLGASILPLCDIVWASEKAWFQ
..::..:::..:::::.::..::::::::.::.::::.:::::::::::.:::.::::::
CCDS47 TDDRKRESTKMAEAIRNFVNTFIQFKKPIIVAVNGPAIGLGASILPLCDVVWANEKAWFQ
230 240 250 260 270 280
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 TPYATIRLTPAGCSSYTFPQILGVALANEMLFCGRKLTAQEACSRGLVSQVFWPTTFSQE
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CCDS47 TPYTTFGQSPDGCSTVMFPKIMGGASANEMLLSGRKLTAQEACGKGLVSQVFWPGTFTQE
290 300 310 320 330 340
450 460 470 480 490 500
pF1KE1 VMLRVKEMASCSAVVLEESKCLVRSFLKSVLEDVNEKECLMLKQLWSSSKGLDSLFSYLQ
::.:.::.:::. ::::::: ::: .: ::..::.:: .::..:.:..:.::...:::
CCDS47 VMVRIKELASCNPVVLEESKALVRCNMKMELEQANERECEVLKKIWGSAQGMDSMLKYLQ
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 DKIYEV
:: :
CCDS47 RKIDEF
410
>>CCDS4491.2 CDYL gene_id:9425|Hs108|chr6 (544 aa)
initn: 1651 init1: 1309 opt: 1334 Z-score: 1244.1 bits: 239.9 E(32554): 5.6e-63
Smith-Waterman score: 1637; 51.6% identity (73.9% similar) in 537 aa overlap (7-505:7-543)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MASGDLYEVERIVDKRKNKKGKWEYLIRWKGYGSTEDTWEPEHHLLHCEEFIDEFNGLHM
:::::::::::::::: :::.::::: : .::::::.::..:::.: .:: :
CCDS44 MASEELYEVERIVDKRKNKKGKTEYLVRWKGYDSEDDTWEPEQHLVNCEEYIHDFNRRHT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100
pF1KE1 SKDKRIKSGKQSSTS-----KLLRDSRGPSVEKLSHRPSDPGK---SKGT-----SHKRK
:.:. . . :: : . : . . : : . :: ::.. :.: .
CCDS44 EKQKESTLTRTNRTSPNNARKQISRSTNSNFSKTSPKALVIGKDHESKNSQLFAASQKFR
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 RINPPLAKPKKGYSGKPSSGGDRATKT-VSYRTTPSGLQ------IMPLKKSQNGMENGD
. . : . .:... :. . :. :. ::. .:.: . :....:. .
CCDS44 KNTAPSLSSRKNMDLAKSGIKILVPKSPVKSRTAVDGFQSESPEKLDPVEQGQEDTVAPE
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210
pF1KE1 AGSEKDERHF-GNGSHQPGLDLNDHVGE---QDMGECDVNHAT-LAENGLGS-----ALT
...:: . : :... . .. : : . :: :: :: :. :::
CCDS44 VAAEKPVGALLGPGAERARMGSRPRIHPLVPQVPGPVTAAMATGLAVNGKGTSPFMDALT
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260
pF1KE1 -NGGLNLHSPV------KRK-LEAEKDYVFDKRLRYSVRQNESNCRFRDIVVRKEEGFTH
:: :... : ::: .. ..: ::::::.::::.:: :.:::::::..::::
CCDS44 ANGTTNIQTSVTGVTASKRKFIDDRRDQPFDKRLRFSVRQTESAYRYRDIVVRKQDGFTH
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 ILLSSQTSDNNALTPEIMKEVRRALCNAATDDSKLLLLSAVGSVFCSGLDYSYLIGRLSS
::::...:.::.:.::.:.::. :: .::.:::::.:::::::::: :::. :.: ::..
CCDS44 ILLSTKSSENNSLNPEVMREVQSALSTAAADDSKLVLLSAVGSVFCCGLDFIYFIRRLTD
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 DRRKESTRIAEAIRDFVKAFIQFKKPIVVAINGPALGLGASILPLCDIVWASEKAWFQTP
::..:::..:::::.::..::::::::.::.::::.:::::::::::.:::.::::::::
CCDS44 DRKRESTKMAEAIRNFVNTFIQFKKPIIVAVNGPAIGLGASILPLCDVVWANEKAWFQTP
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 YATIRLTPAGCSSYTFPQILGVALANEMLFCGRKLTAQEACSRGLVSQVFWPTTFSQEVM
:.:. .: :::. ::.:.: : :::::. ::::::::::..::::::::: ::.::::
CCDS44 YTTFGQSPDGCSTVMFPKIMGGASANEMLLSGRKLTAQEACGKGLVSQVFWPGTFTQEVM
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KE1 LRVKEMASCSAVVLEESKCLVRSFLKSVLEDVNEKECLMLKQLWSSSKGLDSLFSYLQDK
.:.::.:::. ::::::: ::: .: ::..::.:: .::..:.:..:.::...::: :
CCDS44 VRIKELASCNPVVLEESKALVRCNMKMELEQANERECEVLKKIWGSAQGMDSMLKYLQRK
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 IYEV
: :
CCDS44 IDEF
>>CCDS35473.1 CDY2B gene_id:203611|Hs108|chrY (541 aa)
initn: 1290 init1: 1068 opt: 1111 Z-score: 1037.7 bits: 201.6 E(32554): 1.8e-51
Smith-Waterman score: 1332; 41.6% identity (69.9% similar) in 538 aa overlap (7-505:6-540)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MASGDLYEVERIVDKRKNKKGKWEYLIRWKGYGSTEDTWEPEHHLLHCEEFIDEFNGLHM
.::: :::::..:.:. .::.::::: . .::::::.::..::. . .:: .
CCDS35 MASQEFEVEAIVDKRQDKNGNTQYLVRWKGYDKQDDTWEPEQHLMNCEKCVHDFNRRQT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE1 SKDKRIK---SGKQSSTSKLLRDSRGPSVEKLSHRPSDPGKSKGTSHKRKRINPPLAKPK
:.:.. ... :.. : ::. ... .. :. : .: :.:.. .: :
CCDS35 EKQKKLTWTTTSRIFSNNARRRTSRSTKANYSKNSPKTPVTDK---HHRSKNCKLFAASK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 KGYSGKPSSGGDRATKTVSYRTTPSGLQIMPL--KKSQNG---MENGD--AGSEKDERHF
. :. .: . . : . :. ::. .: .:. : :....: :
CCDS35 NVRRKAASTLSDTKNMEIINSTIETLAPDSPFDHKKTVSGFQKLEKLDPIAADQQDTVVF
120 130 140 150 160 170
180 190 200
pF1KE1 GNGSHQPGLDLNDHVGEQDMG----------ECDVNHATLAENGLGSAL-----------
. : .: : .. : ... .. : . :::
CCDS35 KVTEGKLLRDPLSHPGAEQTGIQNKTQMHPLMSQMSGSVTASMATGSATRKGIVVLIDPL
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 -TNGGLNLHSPVKRKLEAEKDYV-------FDKRLRYSVRQNESNCRFRDIVVRKEEGFT
.:: ..:. : : .... . : :......: .:: .:::::.::.:::
CCDS35 AANGTTDMHTSVPRVKGGQRNITDDSRGQPFIKKMHFTIRLTESAITYRDIVVKKEDGFT
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 HILLSSQTSDNNALTPEIMKEVRRALCNAATDDSKLLLLSAVGSVFCSGLDYSYLIGRLS
.:.::......:::. :..::. :: .::.:::::.:.::.::::: :::..:.. .:
CCDS35 QIVLSTRSTEKNALNTEVIKEMVNALNSAAADDSKLVLFSAAGSVFCCGLDFGYFVRHLR
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 SDRRKESTRIAEAIRDFVKAFIQFKKPIVVAINGPALGLGASILPLCDIVWASEKAWFQT
.:: : .....:..::..::::::::::..::::.:::::::::::.:::.:::::::
CCDS35 NDRNTASLEMVDTIKNFVNTFIQFKKPIVVSVNGPAIGLGASILPLCDLVWANEKAWFQT
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 PYATIRLTPAGCSSYTFPQILGVALANEMLFCGRKLTAQEACSRGLVSQVFWPTTFSQEV
::.:. .: :::: :::...: : :::::. ::::::.:::..::::::: ::.:::
CCDS35 PYTTFGQSPDGCSSITFPKMMGKASANEMLIAGRKLTAREACAKGLVSQVFLTGTFTQEV
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KE1 MLRVKEMASCSAVVLEESKCLVRSFLKSVLEDVNEKECLMLKQLWSSSKGLDSLFSYLQD
:...::.:: .:.:::: : ::: .: ::..::.:: .:...:::..:..:...:...
CCDS35 MIQIKELASYNAIVLEECKALVRCNIKLELEQANERECEVLRKIWSSAQGIESMLKYVEN
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 KIYEV
:: :
CCDS35 KIDEF
540
>>CCDS14789.1 CDY2A gene_id:9426|Hs108|chrY (541 aa)
initn: 1290 init1: 1068 opt: 1111 Z-score: 1037.7 bits: 201.6 E(32554): 1.8e-51
Smith-Waterman score: 1332; 41.6% identity (69.9% similar) in 538 aa overlap (7-505:6-540)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MASGDLYEVERIVDKRKNKKGKWEYLIRWKGYGSTEDTWEPEHHLLHCEEFIDEFNGLHM
.::: :::::..:.:. .::.::::: . .::::::.::..::. . .:: .
CCDS14 MASQEFEVEAIVDKRQDKNGNTQYLVRWKGYDKQDDTWEPEQHLMNCEKCVHDFNRRQT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE1 SKDKRIK---SGKQSSTSKLLRDSRGPSVEKLSHRPSDPGKSKGTSHKRKRINPPLAKPK
:.:.. ... :.. : ::. ... .. :. : .: :.:.. .: :
CCDS14 EKQKKLTWTTTSRIFSNNARRRTSRSTKANYSKNSPKTPVTDK---HHRSKNCKLFAASK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 KGYSGKPSSGGDRATKTVSYRTTPSGLQIMPL--KKSQNG---MENGD--AGSEKDERHF
. :. .: . . : . :. ::. .: .:. : :....: :
CCDS14 NVRRKAASTLSDTKNMEIINSTIETLAPDSPFDHKKTVSGFQKLEKLDPIAADQQDTVVF
120 130 140 150 160 170
180 190 200
pF1KE1 GNGSHQPGLDLNDHVGEQDMG----------ECDVNHATLAENGLGSAL-----------
. : .: : .. : ... .. : . :::
CCDS14 KVTEGKLLRDPLSHPGAEQTGIQNKTQMHPLMSQMSGSVTASMATGSATRKGIVVLIDPL
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 -TNGGLNLHSPVKRKLEAEKDYV-------FDKRLRYSVRQNESNCRFRDIVVRKEEGFT
.:: ..:. : : .... . : :......: .:: .:::::.::.:::
CCDS14 AANGTTDMHTSVPRVKGGQRNITDDSRGQPFIKKMHFTIRLTESAITYRDIVVKKEDGFT
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 HILLSSQTSDNNALTPEIMKEVRRALCNAATDDSKLLLLSAVGSVFCSGLDYSYLIGRLS
.:.::......:::. :..::. :: .::.:::::.:.::.::::: :::..:.. .:
CCDS14 QIVLSTRSTEKNALNTEVIKEMVNALNSAAADDSKLVLFSAAGSVFCCGLDFGYFVRHLR
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 SDRRKESTRIAEAIRDFVKAFIQFKKPIVVAINGPALGLGASILPLCDIVWASEKAWFQT
.:: : .....:..::..::::::::::..::::.:::::::::::.:::.:::::::
CCDS14 NDRNTASLEMVDTIKNFVNTFIQFKKPIVVSVNGPAIGLGASILPLCDLVWANEKAWFQT
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 PYATIRLTPAGCSSYTFPQILGVALANEMLFCGRKLTAQEACSRGLVSQVFWPTTFSQEV
::.:. .: :::: :::...: : :::::. ::::::.:::..::::::: ::.:::
CCDS14 PYTTFGQSPDGCSSITFPKMMGKASANEMLIAGRKLTAREACAKGLVSQVFLTGTFTQEV
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KE1 MLRVKEMASCSAVVLEESKCLVRSFLKSVLEDVNEKECLMLKQLWSSSKGLDSLFSYLQD
:...::.:: .:.:::: : ::: .: ::..::.:: .:...:::..:..:...:...
CCDS14 MIQIKELASYNAIVLEECKALVRCNIKLELEQANERECEVLRKIWSSAQGIESMLKYVEN
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 KIYEV
:: :
CCDS14 KIDEF
540
>>CCDS14802.1 CDY1 gene_id:9085|Hs108|chrY (540 aa)
initn: 1298 init1: 1061 opt: 1109 Z-score: 1035.8 bits: 201.3 E(32554): 2.2e-51
Smith-Waterman score: 1325; 41.5% identity (70.2% similar) in 537 aa overlap (7-505:6-539)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MASGDLYEVERIVDKRKNKKGKWEYLIRWKGYGSTEDTWEPEHHLLHCEEFIDEFNGLHM
.::: :::::..:.:. .::.::::: . .::::::.::..::. . .:: .
CCDS14 MASQEFEVEAIVDKRQDKNGNTQYLVRWKGYDKQDDTWEPEQHLMNCEKCVHDFNRRQT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE1 SKDKRIK---SGKQSSTSKLLRDSRGPSVEKLSHRPSDPGKSKGTSHKRKRINPPLAKPK
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CCDS44 PKIMSPAKATEMLIFGKKLTAGEACAQGLVTEVFPDSTFQKEVWTRLKAFAKLPPNALRI
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CCDS44 SKEVIRKREREKLHAVNAEECNVLQGRWLSDECTNAVVNFLSRKSKL
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18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]