FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5960, 312 aa 1>>>pF1KE5960 312 - 312 aa - 312 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2162+/-0.000548; mu= 16.4859+/- 0.034 mean_var=116.0619+/-31.286, 0's: 0 Z-trim(106.9): 288 B-trim: 901 in 1/50 Lambda= 0.119050 statistics sampled from 14617 (14992) to 14617 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.5), E-opt: 0.2 (0.176), width: 16 Scan time: 5.080 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 952 175.4 1.3e-43 NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 831 154.7 2.3e-37 NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 797 148.8 1.3e-35 NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 796 148.6 1.5e-35 NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 794 148.3 1.9e-35 NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 792 148.0 2.4e-35 XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 792 148.0 2.4e-35 XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 792 148.0 2.4e-35 NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 790 147.6 3e-35 NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 775 145.0 1.8e-34 NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 771 144.4 2.9e-34 NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 763 143.0 7.5e-34 XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 761 142.6 9.6e-34 NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 761 142.6 9.6e-34 XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 761 142.7 9.8e-34 XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 757 141.9 1.5e-33 NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 742 139.4 9.5e-33 NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 741 139.2 1e-32 NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 722 135.9 9.9e-32 NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 703 132.7 9.6e-31 NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 538 104.3 3.3e-22 NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 476 93.7 5.3e-19 NP_001727 (OMIM: 113995) C5a anaphylatoxin chemota ( 350) 191 44.8 0.0003 NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 192 45.1 0.00033 XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 192 45.2 0.00035 NP_001028252 (OMIM: 604849) trace amine-associated ( 351) 183 43.4 0.00079 NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 180 42.9 0.0011 NP_055441 (OMIM: 604849) trace amine-associated re ( 306) 179 42.7 0.0012 NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 167 40.7 0.0051 NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 167 40.7 0.0052 NP_000902 (OMIM: 165195) delta-type opioid recepto ( 372) 167 40.7 0.0055 NP_001041695 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 ( 326) 166 40.5 0.0057 NP_000665 (OMIM: 102775) adenosine receptor A1 [Ho ( 326) 166 40.5 0.0057 NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 165 40.3 0.0064 >>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa) initn: 952 init1: 952 opt: 952 Z-score: 904.2 bits: 175.4 E(85289): 1.3e-43 Smith-Waterman score: 952; 46.7% identity (77.7% similar) in 300 aa overlap (5-304:3-302) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MNGMNHSVVSEFVFMGLTNSREIQLLLFVFSLLFYFASMMGNLVIVFTVTMDAHLHSPMY :.. ..:::..:::.. ..: ..:: ...:. ...: ..:: :.: . : :::: NP_001 MENRNNMTEFVLLGLTENPKMQKIIFVVFFVIYIITVVGYVLIVVTITASPSLGSPMY 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 FLLANLSIIDMAFCSITAPKMICDIFKKHKAISFRGCITQIFFSHALGGTEMVLLIAMAF . :: ::.:: . :...:..: . .::: : ::.::.: : .::.: .:: .::. NP_001 LSLAYLSFIDACYSSVNTPNLITHSLYGKKAILFNGCMTQVFGEHFFGGAEGILLTVMAY 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 DRYMAICKPLHYLTIMSPRMCLYFLATSSIIGLIHSLVQLVFVVDLPFCGPNIFDSFYCD :.:.::::::::.:::. .: .... . :..:. .:..:. .:::::::..: :.:: NP_001 DHYVAICKPLHYMTIMNQCVCALLMGVVWMGGFLHATIQILFIFQLPFCGPNVIDHFMCD 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 LPRLLRLACTNTQELEFMVTVNSGLISVGSFVLLVISYIFILFTVWKHSSGGLAKALSTL : :: ::::.:. ::.....:::.: . .:.::..::. :: .. :: . ::::: NP_001 LNPLLNLACTDTHMLELFIAANSGFICLLNFALLLVSYVVILCSLRTHSLEARHKALSTC 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 SAHVTVVILFFGPLMFFYTWPSPTSHLDKYLAIFDAFITPFLNPVIYTFRNKDMKVAMRR .:.::::::: : .: : :. : .:: .::: ..:::.:::.:::..: .:: :.:. NP_001 VSHITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIRK 240 250 260 270 280 290 310 pF1KE5 LCSRLAHFTKIL :::: NP_001 LCSRKDISGDK 300 >>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa) initn: 872 init1: 636 opt: 831 Z-score: 791.9 bits: 154.7 E(85289): 2.3e-37 Smith-Waterman score: 831; 39.6% identity (75.3% similar) in 308 aa overlap (4-307:1-307) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MNGMNHSVVSEFVFMGLTNSREIQLLLFVFSLLFYFASMMGNLVIVFTVTMDAHLHSPMY ::::::.::...:::.. :.: ..:.: :. :.....::..:... .. ::.::: NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAKIYNNTLHTPMY 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KE5 FLLANLSIIDMAFCSITAPKMICDIFKKHKAISFRGCITQIF-FSHALGGTEMVLLIAMA .: .:...:. . :::. .. ....::. ::..:.: :. .::. ::::. .:: NP_001 VFLLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLGA-EMVLFTTMA 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 FDRYMAICKPLHYLTIMSPRMCLYFLATSSIIGLIHSLVQLVFVVDLPFCGPNIFDSFYC .:::.::: :::: :::. .::. .:. :.. .: :. .... : ::::: .: :.: NP_001 YDRYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWVHTALIMRLTFCGPNTIDHFFC 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 DLPRLLRLACTNTQELEFMVTVNSGLISVGSFVLLVISYIFILFTVWK-HSSGGLAKALS ..: :: :.:. .. : :: : . ...:.:.: ::: ::. .. . .. : ::.: NP_001 EIPPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILRIRTVEGKRKAFS 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 TLSAHVTVVILFFGPLMFFYTWP--SPTSHLDKYLAIFDAFITPFLNPVIYTFRNKDMKV : :.:.::: :...:... : : : : . :: .: . ...:: :::..:.:.:..:.. NP_001 TCSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQA 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 AMRRLCSRLAHFTKIL ..:.. . : : NP_001 GIRKVFAFLKH 300 >>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa) initn: 704 init1: 607 opt: 797 Z-score: 760.2 bits: 148.8 E(85289): 1.3e-35 Smith-Waterman score: 797; 37.7% identity (75.0% similar) in 300 aa overlap (5-301:7-306) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MNGMNHSVVSEFVFMGLTNSREIQLLLFVFSLLFYFASMMGNLVIVFTVTMDAHLHSP :...:.::...:. . :.:..::.. : .: ..::. ... . .: ::..: NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 MYFLLANLSIIDMAFCSITAPKMICDIFKKHKAISFRGCITQIFFSHALGGTEMVLLIAM :::.:.:::..:. . : .:::. ......:.::. :: :..: ... :: .: :: NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 AFDRYMAICKPLHYLTIMSPRMCLYFLATSSIIGLIHSLVQLVFVVDLPFCGPNIFDSFY :.:::.:::.:: : ..:: .:. ... : . : . :::. :. : .: :... :. NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 CDLPRLLRLACTNTQELEFMVTVNSGLISVGSFVLLVISYIFILFTVWK-HSSGGLAKAL :::: ::.:.::.: :..... .. . . :....:::.:::..: : .: .: :.. NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 STLSAHVTVVILFFGPLMFFYTWPSP--TSHLDKYLAIFDAFITPFLNPVIYTFRNKDMK :: ..:.: : .. : :.:.:. :: . . :: ...: ... : :::.::..::::.: NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE5 VAMRRLCSRLAHFTKIL : ... NP_006 DAAEKVLRSKVDSS 310 >>NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN1 [H (311 aa) initn: 725 init1: 587 opt: 796 Z-score: 759.3 bits: 148.6 E(85289): 1.5e-35 Smith-Waterman score: 796; 38.0% identity (74.8% similar) in 305 aa overlap (3-304:4-308) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MNGMNHSVVSEFVFMGLTNSREIQLLLFVFSLLFYFASMMGNLVIVFTVTMDAHLHSPM : : . .. :...:... .: .::.. :..:..:. :: .. . ::.:::.:: NP_001 MTGGGNITEITYFILLGFSDFPRIIKVLFTIFLVIYITSLAWNLSLIVLIRMDSHLHTPM 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 YFLLANLSIIDMAFCSITAPKMICDIFKKHKAISFRGCITQIFFSHALGGTEMVLLIAMA ::.:.:::.::. . : :.:::. ........:.: ::: : :. ..: .: :. ::: NP_001 YFFLSNLSFIDVCYISSTVPKMLSNLLQEQQTITFVGCIIQYFIFSTMGLSESCLMTAMA 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 FDRYMAICKPLHYLTIMSPRMCLYFLATSSIIGLIHSLVQLVFVVDLPFCGPNIFDSFYC .::: :::.:: : .:::: .:.... . . :: :: :. ...: ::: :.. :.: NP_001 YDRYAAICNPLLYSSIMSPTLCVWMVLGAYMTGLTASLFQIGALLQLHFCGSNVIRHFFC 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 DLPRLLRLACTNTQELEFMVTVNSGLISVGSFVLLVISYIFILFTVWKHSSG-GLAKALS :.:.:: :.::.: .. :... . .....: ....::: .: ... : .:. : .::.. NP_001 DMPQLLILSCTDTFFVQVMTAILTMFFGIASALVIMISYGYIGISIMKITSAKGRSKAFN 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 TLSAHVTVVILFFGPLMFFYTWPSP--TSHLDKYLAIFDAFITPFLNPVIYTFRNKDMKV : ..:.:.: ::. .: : : .: .:.. ..: . . :.:::.::..:::..: NP_001 TCASHLTAVSLFYTSGIFVYLSSSSGGSSSFDRFASVFYTVVIPMLNPLIYSLRNKEIKD 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE5 AMRRLCSRLAHFTKIL :..:: .: NP_001 ALKRLQKRKCC 310 >>NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory receptor (311 aa) initn: 759 init1: 584 opt: 794 Z-score: 757.5 bits: 148.3 E(85289): 1.9e-35 Smith-Waterman score: 794; 37.5% identity (73.1% similar) in 301 aa overlap (4-301:7-307) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MNGMNHSVVSEFVFMGLTNSREIQLLLFVFSLLFYFASMMGNLVIVFTVTMDAHLHS .: : . :...:..: ......:: :.::. ...::: :.. .:.:::. NP_001 MNDDGKVNASSEGYFILVGFSNWPHLEVVIFVVVLIFYLMTLIGNLFIIILSYLDSHLHT 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 PMYFLLANLSIIDMAFCSITAPKMICDIFKKHKAISFRGCITQIFFSHALGGTEMVLLIA ::::.:.:::..:. . . . :... ... .:.::. ::. :..: ::: :: :::.. NP_001 PMYFFLSNLSFLDLCYTTSSIPQLLVNLWGPEKTISYAGCMIQLYFVLALGTTECVLLVV 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 MAFDRYMAICKPLHYLTIMSPRMCLYFLATSSIIGLIHSLVQLVFVVDLPFCGPNIFDSF :..::: :.:.:::: ..: ::.: . ..: . :. .: .. :. .:.:: : : NP_001 MSYDRYAAVCRPLHYTVLMHPRFCHLLAVASWVSGFTNSALHSSFTFWVPLCGHRQVDHF 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 YCDLPRLLRLACTNTQELEFMVTVNSGLISVGSFVLLVISYIFILFTVWK-HSSGGLAKA .:..: ::::.:..:. :. . ..:... . ..:.. :: :. .. . .:. :: :. NP_001 FCEVPALLRLSCVDTHVNELTLMITSSIFVLIPLILILTSYGAIVRAILRMQSTTGLQKV 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LSTLSAHVTVVILFFGPLMFFYTWPSPTSHLD--KYLAIFDAFITPFLNPVIYTFRNKDM ..: .::. .: ::: : : .: : . : :..:.: . .:: :::.:::.::: . NP_001 FGTCGAHLMAVSLFFIPAMCMYLQPPSGNSQDQGKFIALFYTVVTPSLNPLIYTLRNKVV 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE5 KVAMRRLCSRLAHFTKIL . :..:: NP_001 RGAVKRLMGWE 310 >>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa) initn: 711 init1: 598 opt: 792 Z-score: 755.5 bits: 148.0 E(85289): 2.4e-35 Smith-Waterman score: 792; 39.0% identity (73.7% similar) in 315 aa overlap (1-312:1-315) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MNGMNHSVVSEFVFMGLTNSREIQLLLFVFSLLFYFASMMGNLVIVFTVTMDAHLHSPMY :. :.. ::::...::... . .. :::. :..: ....:: .::. . .:..::.::: NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 FLLANLSIIDMAFCSITAPKMICDIFKKHKAISFRGCITQIFFSHALGGTEMVLLIAMAF :.:.:::..:... . ..:... .. .:::: :..: .:.::: :::: :.::: .::. NP_036 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 DRYMAICKPLHYLTIMSPRMCLYFLATSSIIGLIHSLVQLVFVVDLPFCGPNIFDSFYCD :::.:.: :.: .:: .: . :: . :.: : :: ... .::.: ...: . :. NP_036 DRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISCE 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 LPRLLRLACTNTQELEFMVTVNSGLISVGSFVLLVISYIFILFTVWK-HSSGGLAKALST : ..::::..:. : . :.: .. . : :...::: :. :. : .: : ::. : NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LSAHVTVVILFFGPLMFFYTWP--SPTSHLDKYLAIFDAFITPFLNPVIYTFRNKDMKVA ..:.::: : .: .: : : ::. .: ...: :..::.:::.::..:::..: : NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KE5 MRRLCSRLAHFTKIL ..: ... .:. : NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT 310 >>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa) initn: 711 init1: 598 opt: 792 Z-score: 755.5 bits: 148.0 E(85289): 2.4e-35 Smith-Waterman score: 792; 39.0% identity (73.7% similar) in 315 aa overlap (1-312:1-315) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MNGMNHSVVSEFVFMGLTNSREIQLLLFVFSLLFYFASMMGNLVIVFTVTMDAHLHSPMY :. :.. ::::...::... . .. :::. :..: ....:: .::. . .:..::.::: XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 FLLANLSIIDMAFCSITAPKMICDIFKKHKAISFRGCITQIFFSHALGGTEMVLLIAMAF :.:.:::..:... . ..:... .. .:::: :..: .:.::: :::: :.::: .::. XP_011 FFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 DRYMAICKPLHYLTIMSPRMCLYFLATSSIIGLIHSLVQLVFVVDLPFCGPNIFDSFYCD :::.:.: :.: .:: .: . :: . :.: : :: ... .::.: ...: . :. 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