Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE6380
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE6380, 317 aa
1>>>pF1KE6380 317 - 317 aa - 317 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2389+/-0.00085; mu= 11.6643+/- 0.051
mean_var=85.2253+/-17.020, 0's: 0 Z-trim(108.0): 23 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.138928
statistics sampled from 9909 (9923) to 9909 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.685), E-opt: 0.2 (0.305), width: 16
Scan time: 2.040
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32324.1 RLBP1 gene_id:6017|Hs108|chr15 ( 317) 2098 430.1 1.1e-120
CCDS6176.1 CLVS1 gene_id:157807|Hs108|chr8 ( 354) 689 147.7 1.2e-35
CCDS34525.1 CLVS2 gene_id:134829|Hs108|chr6 ( 327) 670 143.9 1.6e-34
CCDS13332.2 TTPAL gene_id:79183|Hs108|chr20 ( 342) 533 116.5 3.1e-26
CCDS6178.1 TTPA gene_id:7274|Hs108|chr8 ( 278) 441 98.0 9.1e-21
CCDS10280.1 PTPN9 gene_id:5780|Hs108|chr15 ( 593) 296 69.1 9.9e-12
>>CCDS32324.1 RLBP1 gene_id:6017|Hs108|chr15 (317 aa)
initn: 2098 init1: 2098 opt: 2098 Z-score: 2280.3 bits: 430.1 E(32554): 1.1e-120
Smith-Waterman score: 2098; 100.0% identity (100.0% similar) in 317 aa overlap (1-317:1-317)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MSEGVGTFRMVPEEEQELRAQLEQLTTKDHGPVFGPCSQLPRHTLQKAKDELNEREETRE
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CCDS32 MSEGVGTFRMVPEEEQELRAQLEQLTTKDHGPVFGPCSQLPRHTLQKAKDELNEREETRE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 EAVRELQEMVQAQAASGEELAVAVAERVQEKDSGFFLRFIRARKFNVGRAYELLRGYVNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 EAVRELQEMVQAQAASGEELAVAVAERVQEKDSGFFLRFIRARKFNVGRAYELLRGYVNF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 RLQYPELFDSLSPEAVRCTIEAGYPGVLSSRDKYGRVVMLFNIENWQSQEITFDEILQAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 RLQYPELFDSLSPEAVRCTIEAGYPGVLSSRDKYGRVVMLFNIENWQSQEITFDEILQAY
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 CFILEKLLENEETQINGFCIIENFKGFTMQQAASLRTSDLRKMVDMLQDSFPARFKAIHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CFILEKLLENEETQINGFCIIENFKGFTMQQAASLRTSDLRKMVDMLQDSFPARFKAIHF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 IHQPWYFTTTYNVVKPFLKSKLLERVFVHGDDLSGFYQEIDENILPSDFGGTLPKYDGKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 IHQPWYFTTTYNVVKPFLKSKLLERVFVHGDDLSGFYQEIDENILPSDFGGTLPKYDGKA
250 260 270 280 290 300
310
pF1KE6 VAEQLFGPQAQAENTAF
:::::::::::::::::
CCDS32 VAEQLFGPQAQAENTAF
310
>>CCDS6176.1 CLVS1 gene_id:157807|Hs108|chr8 (354 aa)
initn: 704 init1: 569 opt: 689 Z-score: 753.3 bits: 147.7 E(32554): 1.2e-35
Smith-Waterman score: 689; 39.2% identity (71.6% similar) in 278 aa overlap (40-314:30-296)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MVPEEEQELRAQLEQLTTKDHGPVFGPCSQLPRHTLQKAKDELNEREETREEAVRELQEM
: .:..::. :::: .. .. ......:
CCDS61 MGPVSLLPKYQKLNTWNGDLAKMTHLQAGLSPETIEKARLELNENPDVLHQDIQQVRDM
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 VQAQAASGEELAVAVAERVQEKDSGFFLRFIRARKFNVGRAYELLRGYVNFRLQYPELFD
. .. : . :..:.:::.:::::. . :..:: : ..: ..:
CCDS61 IITRPDIG----------FLRTDDAFILRFLRARKFHQADAFRLLAQYFQYRQLNLDMFK
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SLS---PEAVRCTIEAGYPGVLSSRDKYGRVVMLFNIENWQSQEITFDEILQAYCFILEK
... : : :. :.:::: .::.::: ..:. ::.... .: .::.: . ::
CCDS61 NFKADDPGIKRALID-GFPGVLENRDHYGRKILLLFAANWDQSRNSFTDILRAILLSLEV
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LLENEETQINGFCIIENFKGFTMQQAASLRTSDLRKMVDMLQDSFPARFKAIHFIHQPWY
:.:. : ::::: .: ....:...::..: : :. .. ::::::::: ..::..::::
CCDS61 LIEDPELQINGFILIIDWSNFSFKQASKLTPSILKLAIEGLQDSFPARFGGVHFVNQPWY
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 FTTTYNVVKPFLKSKLLERVFVHGDDLSGFYQEIDENILPSDFGGTLPKYDGKAVAEQLF
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CCDS61 IHALYTLIKPFLKDKTRKRIFLHGNNLNSLHQLIHPEFLPSEFGGTLPPYDMGTWARTLL
230 240 250 260 270 280
310
pF1KE6 GPQAQAENTAF
::. . ::
CCDS61 GPDYSDENDYTHTSYNAMHVKHTSSNLERECSPKLMKRSQSVVEAGTLKHEEKGENENTQ
290 300 310 320 330 340
>>CCDS34525.1 CLVS2 gene_id:134829|Hs108|chr6 (327 aa)
initn: 660 init1: 526 opt: 670 Z-score: 733.3 bits: 143.9 E(32554): 1.6e-34
Smith-Waterman score: 670; 39.4% identity (71.7% similar) in 269 aa overlap (40-306:8-266)
10 20 30 40 50 60
pF1KE6 MVPEEEQELRAQLEQLTTKDHGPVFGPCSQLPRHTLQKAKDELNEREETREEAVRELQEM
: .::.::. :::: .: .. ..:...:
CCDS34 MTHLQAGLSPETLEKARLELNENPDTLHQDIQEVRDM
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 VQAQAASGEELAVAVAERVQEKDSGFFLRFIRARKFNVGRAYELLRGYVNFRLQYPELFD
: .. : . :..:.:::.:::::. .:..:: : ..: : ..:
CCDS34 VITRPDIG----------FLRTDDAFILRFLRARKFHHFEAFRLLAQYFEYRQQNLDMFK
40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 SL--SPEAVRCTIEAGYPGVLSSRDKYGRVVMLFNIENWQSQEITFDEILQAYCFILEKL
:. . ... ... :.:: :.. :.::: .... ::.... :. .::.: . :: .
CCDS34 SFKATDPGIKQALKDGFPGGLANLDHYGRKILVLFAANWDQSRYTLVDILRAILLSLEAM
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 LENEETQINGFCIIENFKGFTMQQAASLRTSDLRKMVDMLQDSFPARFKAIHFIHQPWYF
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CCDS34 IEDPELQVNGFVLIIDWSNFTFKQASKLTPSMLRLAIEGLQDSFPARFGGIHFVNQPWYI
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 TTTYNVVKPFLKSKLLERVFVHGDDLSGFYQEIDENILPSDFGGTLPKYDGKAVAEQLFG
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CCDS34 HALYTVIRPFLKEKTRKRIFLHGNNLNSLHQLIHPEILPSEFGGMLPPYDMGTWARTLLD
210 220 230 240 250 260
310
pF1KE6 PQAQAENTAF
CCDS34 HEYDDDSEYNVDSYSMPVKEVEKELSPKSMKRSQSVVDPTVLKRMDKNEEENMQPLLSLD
270 280 290 300 310 320
>>CCDS13332.2 TTPAL gene_id:79183|Hs108|chr20 (342 aa)
initn: 553 init1: 532 opt: 533 Z-score: 584.6 bits: 116.5 E(32554): 3.1e-26
Smith-Waterman score: 576; 33.7% identity (67.0% similar) in 291 aa overlap (13-297:3-282)
10 20 30 40 50
pF1KE6 MSEGVGTFRMVPEEEQELRAQ--LEQLTTKDHGPVFGP----CSQLPRHTLQKAKDELNE
:: . ::.. . .:. .. : : :: : . . ::..::.:
CCDS13 MSEESDSLRTSPSVASLSENELPPPPEPPGYVCS-LTEDLVTKAREELQE
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE6 REETREEAVRELQEMVQAQAASGEELAVAVAERVQEKDSGFFLRFIRARKFNVGRAYELL
. : : . :. :..::. . . :.... :..:.:::.:::::. :: .::
CCDS13 KPEWRLRDVQALRDMVRKEYPN---LSTSL-------DDAFLLRFLRARKFDYDRALQLL
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KE6 RGYVNFRLQYPELFDSLSPEAVRCTIEAGYPGVLSSRDKYGRVVMLFNIENWQSQEITFD
.: . : ..::.:..:.: :.. .. .:. :: : : :. . . : .. .
CCDS13 VNYHSCRRSWPEVFNNLKPSALKDVLASGFLTVLPHTDPRGCHVVCIRPDRWIPSNYPIT
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE6 EILQAYCFILEKLLENEETQINGFCIIENFKGFTMQQAASLRTSDLRKMVDMLQDSFPAR
: ..: . ::::...::::.::. :. ..:: ....:. . .:.. .:::.:: :
CCDS13 ENIRAIYLTLEKLIQSEETQVNGIVILADYKGVSLSKASHFGPFIAKKVIGILQDGFPIR
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE6 FKAIHFIHQPWYFTTTYNVVKPFLKSKLLERVFVHGDDLSGFYQEIDENILPSDFGGTLP
.::.: ...: : . ..::::: :. .: :.::.::.... .. ..:::...:::
CCDS13 IKAVHVVNEPRIFKGIFAIIKPFLKEKIANRFFLHGSDLNSLHTNLPRSILPKEYGGTAG
220 230 240 250 260 270
300 310
pF1KE6 KYDGKAVAEQLFGPQAQAENTAF
. :
CCDS13 ELDTATWNAVLLASEDDFVKEFCQPVPACDSILGQTLLPEGLTSDAQCDDSLRAVKSQLY
280 290 300 310 320 330
>>CCDS6178.1 TTPA gene_id:7274|Hs108|chr8 (278 aa)
initn: 437 init1: 437 opt: 441 Z-score: 486.3 bits: 98.0 E(32554): 9.1e-21
Smith-Waterman score: 441; 32.7% identity (66.8% similar) in 226 aa overlap (66-291:24-247)
40 50 60 70 80 90
pF1KE6 PCSQLPRHTLQKAKDELNEREETREEAVRELQEMVQAQAASGEELAVAVAERVQEKDSGF
:: . : ..: .: .: . :: :
CCDS61 MAEARSQPSAGPQLNALPDHSPLLQPGLAALRRRAREAGVPLAP-LPLTDS-F
10 20 30 40 50
100 110 120 130 140 150
pF1KE6 FLRFIRARKFNVGRAYELLRGYVNFRLQYPELFDSLSPEAVRCTIEAGYPGVLSSRDKYG
.:::.::: :.. :..::..: ..: . ::. .: :... ..::: ::: ::: :
CCDS61 LLRFLRARDFDLDLAWRLLKNYYKWRAECPEISADLHPRSIIGLLKAGYHGVLRSRDPTG
60 70 80 90 100 110
160 170 180 190 200 210
pF1KE6 RVVMLFNIENWQSQEITFDEILQAYCFILEKLLENEETQINGFCIIENFKGFTMQQAASL
:... : .:. . .: ..... . : .... ::: ::. : ...:. ...: ..
CCDS61 SKVLIYRIAHWDPKVFTAYDVFRVSLITSELIVQEVETQRNGIKAIFDLEGWQFSHAFQI
120 130 140 150 160 170
220 230 240 250 260 270
pF1KE6 RTSDLRKMVDMLQDSFPARFKAIHFIHQPWYFTTTYNVVKPFLKSKLLERVFVHGDDLSG
: .:.. .: :::: . ..::.:..: : ......:::: :. ::. .::.. .
CCDS61 TPSVAKKIAAVLTDSFPLKVRGIHLINEPVIFHAVFSMIKPFLTEKIKERIHMHGNNYKQ
180 190 200 210 220 230
280 290 300 310
pF1KE6 FYQEIDENILPSDFGGTLPKYDGKAVAEQLFGPQAQAENTAF
. .::: ..::
CCDS61 SLLQHFPDILPLEYGGEEFSMEDICQEWTNFIMKSEDYLSSISESIQ
240 250 260 270
>>CCDS10280.1 PTPN9 gene_id:5780|Hs108|chr15 (593 aa)
initn: 328 init1: 161 opt: 296 Z-score: 324.1 bits: 69.1 E(32554): 9.9e-12
Smith-Waterman score: 296; 29.1% identity (62.8% similar) in 223 aa overlap (97-317:48-261)
70 80 90 100 110 120
pF1KE6 QEMVQAQAASGEELAVAVAERVQEKDSGFFLRFIRARKFNVGRAYELLRGYVNFRLQYPE
..:. ::::.: :: ::...: . : . :
CCDS10 EEEQATKQFLEEINKWTVQYNVSPLSWNVAVKFLMARKFDVLRAIELFHSYRETRRK--E
20 30 40 50 60 70
130 140 150 160 170 180
pF1KE6 LFDSLSP--EAVRCTIEAGYPGVLSSRDKYGRVVMLFNIENWQSQEITFDEILQAYCFIL
. .:.: : .: : .: .:. :: : . ::. . . .. . .::: ..:
CCDS10 GIVKLKPHEEPLRSEILSGKFTILNVRDPTGASIALFTARLHHPHKSVQHVVLQALFYLL
80 90 100 110 120 130
190 200 210 220 230 240
pF1KE6 EKLLENEETQINGFCIIENFKGFTMQQAASLRTSDLRKMVDMLQDSFPARFKAIHFIHQP
.. ... ::: ::. .: .. : .. :... . .:....:. .::::.: . .. :
CCDS10 DRAVDSFETQRNGLVFIYDMCG---SNYANFELDLGKKVLNLLKGAFPARLKKVLIVGAP
140 150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KE6 WYFTTTYNVVKPFLKSKLLERVFVHGDDLSGFYQEIDENILPSDFGGTLPKYDGKAVAEQ
.: . :.... .::.:. ::. . : :.. .. :: ..:: . : : . :
CCDS10 IWFRVPYSIISLLLKDKVRERIQIL--KTSEVTQHLPRECLPENLGGYV-KIDLATWNFQ
200 210 220 230 240
310
pF1KE6 LFGPQAQAENTAF
: ::.... :
CCDS10 -FLPQVNGHPDPFDEIILFSLPPALDWDSVHVPGPHAMTIQELVDYVNARQKQGIYEEYE
250 260 270 280 290 300
317 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 12:44:50 2016 done: Tue Nov 8 12:44:51 2016
Total Scan time: 2.040 Total Display time: -0.010
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]