FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5489, 343 aa 1>>>pF1KE5489 343 - 343 aa - 343 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2292+/-0.00143; mu= 11.1627+/- 0.083 mean_var=176.0905+/-60.151, 0's: 0 Z-trim(101.4): 453 B-trim: 426 in 1/47 Lambda= 0.096651 statistics sampled from 5933 (6487) to 5933 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.522), E-opt: 0.2 (0.199), width: 16 Scan time: 1.900 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 2221 323.1 2.1e-88 CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 1342 200.5 1.7e-51 CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 1280 191.8 6.4e-49 CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 1277 191.4 8.5e-49 CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 1273 190.8 1.2e-48 CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 1270 190.4 1.7e-48 CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 1261 189.1 3.9e-48 CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 ( 305) 1226 184.3 1.2e-46 CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 1222 183.7 1.7e-46 CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 ( 305) 1212 182.3 4.5e-46 CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 1203 181.1 1.1e-45 CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 1193 179.7 2.9e-45 CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 1176 177.3 1.5e-44 CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 1176 177.3 1.5e-44 CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 ( 312) 1176 177.3 1.5e-44 CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 ( 312) 1173 176.9 2e-44 CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 ( 312) 1145 173.0 3e-43 CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 1139 172.1 5.3e-43 CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 1138 172.0 5.8e-43 CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 1119 169.4 3.7e-42 CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 1091 165.4 5.4e-41 CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 1087 164.9 8e-41 CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 1069 162.4 4.6e-40 CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 1063 161.5 8.1e-40 CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 1061 161.3 9.9e-40 CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 1061 161.4 1.1e-39 CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 1058 160.9 1.4e-39 CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 ( 311) 1057 160.7 1.5e-39 CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 1055 160.4 1.8e-39 CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 1055 160.4 1.8e-39 CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 1053 160.1 2.1e-39 CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 1047 159.3 4e-39 CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 1043 158.8 5.6e-39 CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 1039 158.2 8.3e-39 CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 1038 158.1 9.1e-39 CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 1034 157.5 1.3e-38 CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 ( 311) 1030 156.9 2e-38 CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 ( 315) 1025 156.3 3.2e-38 CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 1022 155.8 4.3e-38 CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 ( 309) 1017 155.1 6.9e-38 CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 ( 309) 1009 154.0 1.5e-37 CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 982 150.3 2.1e-36 CCDS31499.1 OR4A16 gene_id:81327|Hs108|chr11 ( 328) 982 150.3 2.1e-36 CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 979 149.8 2.7e-36 CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 977 149.5 3.3e-36 CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 ( 312) 970 148.6 6.5e-36 CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 957 146.8 2.3e-35 CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14 ( 310) 897 138.4 7.6e-33 CCDS32046.1 OR10G3 gene_id:26533|Hs108|chr14 ( 313) 878 135.8 4.8e-32 CCDS31703.1 OR10G9 gene_id:219870|Hs108|chr11 ( 311) 872 134.9 8.5e-32 >>CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 (343 aa) initn: 2221 init1: 2221 opt: 2221 Z-score: 1700.5 bits: 323.1 E(32554): 2.1e-88 Smith-Waterman score: 2221; 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CCDS32 TFSLLYLAILLGNFLIILTVTSDSRLHTPMYFLLANLSFIDVCVASFATPKMIADFLVER 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 KVISFAGCFTQIFLLHLLGGVEMVLLVSMAFDRYVAICKPLHYMTIMNKKVCVLLVVTSW :.::: .:..:::..::. : :::::::::.::::::::::::::.:...:::.::. :: CCDS32 KTISFDACLAQIFFVHLFTGSEMVLLVSMAYDRYVAICKPLHYMTVMSRRVCVVLVLISW 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 LLGLLHSGFQIPFAVNLPFCGPNVVDSIFCDLPLVTKLACIDIYFVQVVIVANSGIISLS ..:..:. :. :.::::::::: :::.:::::::::::::: : :...:::.::..::: CCDS32 FVGFIHTTSQLAFTVNLPFCGPNKVDSFFCDLPLVTKLACIDTYVVSLLIVADSGFLSLS 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 CFIILLISYSLILITIKNHSPTGQSKARSTLTAHITVVILFFGPCIFIYIWPFGNHSVDK :..:..::..::.:..:.: ....::::::::::::: ::::::::::.:::...:::: CCDS32 SFLLLVVSYTVILVTVRNRSSASMAKARSTLTAHITVVTLFFGPCIFIYVWPFSSYSVDK 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 pF1KE5 FLAVFYTIITPILNPIIYTLRNKEMKISMKKLWRAFVNSREDT :::::::.: ::::.::::::::.: .:.:: CCDS32 VLAVFYTIFTLILNPVIYTLRNKEVKAAMSKLKSRYLKPSQVSVVIRNVLFLETK 300 310 320 330 340 >>CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 (314 aa) initn: 1270 init1: 1270 opt: 1280 Z-score: 991.8 bits: 191.8 E(32554): 6.4e-49 Smith-Waterman score: 1280; 58.0% identity (86.6% similar) in 307 aa overlap (32-338:1-307) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 ALYFSLILHGMSDLFFLSTGHPRASCRMEAMKLLNQSQVSEFILLGLTSSQDVEFLLFAL : . :.: .:::.::::..: ......: . 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CCDS32 FIVLFNSYVIVLVTVKHHSSRGSSKALSTCTAHFIVVFLFFGPCIFIYMWPLSSFLTDKI 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 pF1KE5 LAVFYTIITPILNPIIYTLRNKEMKISMKKLWRAFVNSREDT :.:::::.:: ::::::::::.:.::.:.:: :.: CCDS32 LSVFYTIFTPTLNPIIYTLRNQEVKIAMRKLKNRFLNFNKAMPS 280 290 300 310 >>CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 (311 aa) initn: 1275 init1: 1275 opt: 1277 Z-score: 989.5 bits: 191.4 E(32554): 8.5e-49 Smith-Waterman score: 1277; 58.8% identity (85.7% similar) in 308 aa overlap (32-339:1-308) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 ALYFSLILHGMSDLFFLSTGHPRASCRMEAMKLLNQSQVSEFILLGLTSSQDVEFLLFAL : :.:.::::.::::..: .....::. CCDS32 MAHTNESMVSEFVLLGLSNSWGLQLFFFAI 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 FSVIYVVTVLGNLLIIVTVFNTPNLNTPMYFLLGNLSFVDMTLASFATPKVILNLLKKQK ::..::..::::.:::: . .::.::::::.::::.:. ..:::::...... ..: CCDS32 FSIVYVTSVLGNVLIIVIISFDSHLNSPMYFLLSNLSFIDICQSNFATPKMLVDFFIERK 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 VISFAGCFTQIFLLHLLGGVEMVLLVSMAFDRYVAICKPLHYMTIMNKKVCVLLVVTSWL .::: ::..:::.:: . : ::.:::.::.::..:::::::: ::::...::..: :: CCDS32 TISFEGCMAQIFVLHSFVGSEMMLLVAMAYDRFIAICKPLHYSTIMNRRLCVIFVSISWA 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 LGLLHSGFQIPFAVNLPFCGPNVVDSIFCDLPLVTKLACIDIYFVQVVIVANSGIISLSC .:.::: .. :.:.::::::: :::.::::::: .:::.: : .... ..:::.::::: CCDS32 VGVLHSVSHLAFTVDLPFCGPNEVDSFFCDLPLVIELACMDTYEMEIMTLTNSGLISLSC 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 pF1KE5 FIILLISYSLILITIKNHSPTGQSKARSTLTAHITVVILFFGPCIFIYIWPFGNHSVDKF :. :.:::..::: .. .: .:.::: ::::::::::::::::::..:::::. :::: CCDS32 FLALIISYTIILIGVRCRSSSGSSKALSTLTAHITVVILFFGPCIYFYIWPFSRLPVDKF 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 pF1KE5 LAVFYTIITPILNPIIYTLRNKEMKISMKKLWRAFVNSREDT :.::::. ::.::::::.:::...: .: :: ::: CCDS32 LSVFYTVCTPLLNPIIYSLRNEDVKAAMWKLRNRHVNSWKN 280 290 300 310 >>CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 (310 aa) initn: 1135 init1: 1135 opt: 1273 Z-score: 986.5 bits: 190.8 E(32554): 1.2e-48 Smith-Waterman score: 1273; 61.7% identity (87.2% similar) in 298 aa overlap (36-332:5-302) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 SLILHGMSDLFFLSTGHPRASCRMEAMKLLNQSQVSEFILLGLTSSQDVEFLLFALFSVI : : ::::.: :: .:. .. ..: .: . CCDS32 MDPQNYSLVSEFVLHGLCTSRHLQNFFFIFFFGV 10 20 30 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 YVVTVLGNLLIIVTVFNTPNLNT-PMYFLLGNLSFVDMTLASFATPKVILNLLKKQKVIS ::. .::::::.:::.. : :.. :::::::::.:.:: ::::::::.: ..:. ::.:: CCDS32 YVAIMLGNLLILVTVISDPCLHSSPMYFLLGNLAFLDMWLASFATPKMIRDFLSDQKLIS 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 FAGCFTQIFLLHLLGGVEMVLLVSMAFDRYVAICKPLHYMTIMNKKVCVLLVVTSWLLGL :.::..:::.::. ::.:::::::::.::::::::::::::.:. ..:. ::..::..:. CCDS32 FGGCMAQIFFLHFTGGAEMVLLVSMAYDRYVAICKPLHYMTLMSWQTCIRLVLASWVVGF 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 pF1KE5 LHSGFQIPFAVNLPFCGPNVVDSIFCDLPLVTKLACIDIYFVQVVIVANSGIISLSCFII .:: :. :.::::.:::: :::.::::::: ::::.: : . ......::..:::::.. 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