FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE5906, 310 aa 1>>>pF1KE5906 310 - 310 aa - 310 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5199+/-0.000521; mu= 14.6013+/- 0.032 mean_var=112.1242+/-30.736, 0's: 0 Z-trim(108.5): 315 B-trim: 2008 in 2/46 Lambda= 0.121122 statistics sampled from 16102 (16553) to 16102 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.528), E-opt: 0.2 (0.194), width: 16 Scan time: 5.150 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 990 184.7 2.1e-46 NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 826 156.0 9e-38 NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 822 155.3 1.4e-37 NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 802 151.8 1.7e-36 NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 798 151.1 2.7e-36 XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 798 151.1 2.7e-36 XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 798 151.1 2.7e-36 NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 797 150.9 3e-36 XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 793 150.2 4.9e-36 NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 793 150.2 4.9e-36 XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 793 150.3 5e-36 NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 781 148.1 2.1e-35 NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 779 147.8 2.7e-35 NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 772 146.6 6.3e-35 NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 759 144.3 3e-34 NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 750 142.7 9.2e-34 NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 741 141.2 2.7e-33 NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 736 140.3 4.9e-33 XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 726 138.5 1.6e-32 NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 714 136.4 7e-32 NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 504 99.7 7.9e-21 NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 435 87.7 3.4e-17 NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 222 50.5 5.6e-06 NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 212 48.8 1.9e-05 NP_000721 (OMIM: 118444) cholecystokinin receptor ( 428) 208 48.2 3.6e-05 NP_778237 (OMIM: 608923) trace amine-associated re ( 345) 199 46.5 9.2e-05 NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 182 43.5 0.0007 XP_011508791 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 313) 180 43.1 0.00086 XP_006712259 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 333) 180 43.2 0.0009 XP_006712258 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 370) 180 43.2 0.00097 XP_011508790 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 376) 180 43.2 0.00098 XP_011508789 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 403) 180 43.2 0.001 NP_006047 (OMIM: 604153) neuromedin-U receptor 1 [ ( 426) 180 43.3 0.0011 NP_444508 (OMIM: 606927) trace amine-associated re ( 342) 176 42.5 0.0015 NP_009163 (OMIM: 604525) histamine H3 receptor [Ho ( 445) 177 42.8 0.0016 XP_005260323 (OMIM: 604525) PREDICTED: histamine H ( 453) 177 42.8 0.0016 NP_001050 (OMIM: 162332,614840) neuromedin-K recep ( 465) 176 42.6 0.0018 NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 176 42.6 0.0018 NP_001727 (OMIM: 113995) C5a anaphylatoxin chemota ( 350) 174 42.1 0.0019 NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370) 172 41.8 0.0025 NP_001718 (OMIM: 300107) bombesin receptor subtype ( 399) 171 41.7 0.003 XP_011527129 (OMIM: 162651) PREDICTED: neurotensin ( 336) 170 41.4 0.003 NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 169 41.2 0.0033 XP_016874705 (OMIM: 602927) PREDICTED: probable G- ( 415) 170 41.5 0.0035 XP_011518927 (OMIM: 602927) PREDICTED: probable G- ( 415) 170 41.5 0.0035 NP_002522 (OMIM: 162651) neurotensin receptor type ( 418) 170 41.5 0.0035 NP_005949 (OMIM: 600665) melatonin receptor type 1 ( 350) 169 41.3 0.0035 XP_016874702 (OMIM: 602927) PREDICTED: probable G- ( 434) 170 41.5 0.0036 XP_016874701 (OMIM: 602927) PREDICTED: probable G- ( 434) 170 41.5 0.0036 XP_011518926 (OMIM: 602927) PREDICTED: probable G- ( 434) 170 41.5 0.0036 >>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa) initn: 983 init1: 869 opt: 990 Z-score: 954.0 bits: 184.7 E(85289): 2.1e-46 Smith-Waterman score: 990; 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NP_001 CVSHITVVILFFVPCIFVYMRPAATLPIDKAVAIFYTMITPMLNPLIYTLKNAQMKNAIR 240 250 260 270 280 290 310 pF1KE5 KLQNRRVTFQ :: .:. NP_001 KLCSRKDISGDK 300 >>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa) initn: 616 init1: 476 opt: 826 Z-score: 799.1 bits: 156.0 E(85289): 9e-38 Smith-Waterman score: 826; 40.7% identity (73.3% similar) in 307 aa overlap (4-307:6-311) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MDPQNYSLVSEFVLHGLCTSRHLQNFFFIFFFGVYVAIMLGNLLILVTVISDPCLHSS .::.::.::.: :. : .:: .:..:. .:. :..::. ... . :: :.. NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQT- 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 PMYFLLGNLAFLDMWLASFATPKMIRDFLSDQKLISFGGCMAQIFFLHFTGGAEMVLLVS ::::.:.::.:.:. : .:::. .:::..: ::. :: :..:. . .: .:.. NP_006 PMYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAA 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 MAYDRYVAICKPLHYMTLMSWQTCIRRVLASWVVGFVHSISQVAFTVNLPYCGPNEVDSF ::::::::::.:: : ..:: :.: .. :.. : . :. ...:. : :: : .. : NP_006 MAYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHF 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 FCDLPLVIKLACMDTYVLGIIMISDSGLLSLSCFLLLLISYTVILLAI-RQRAAGSTSKA ::::: ..::.: :: . .. . .. . . ::....::: :::.. . :. .. .:. NP_006 FCDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKT 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 LSTCSAHIMVVTLFFGPCIFVYVRPFSRFS--VDKLLSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNEEM .:::..:. ::.. : .:.: :: .: .::..::::::: :.:::.::.:::... NP_006 FSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDV 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 KAAMKKLQNRRVTFQ : : .:. .: NP_006 KDAAEKVLRSKVDSS 300 310 >>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa) initn: 716 init1: 449 opt: 822 Z-score: 795.4 bits: 155.3 E(85289): 1.4e-37 Smith-Waterman score: 822; 39.9% identity (75.7% similar) in 301 aa overlap (5-302:2-301) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MDPQNYSLVSEFVLHGLCTSRHLQNFFFIFFFGVYVAIMLGNLLILVTVISDPCLHSSPM :.:.:.::.. :: . .::...:.::. ::.. .:::.::... : . ::. :: NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAKIYNNTLHT-PM 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 YFLLGNLAFLDMWLASFATPKMIRDFLSDQKLISFGGCMAQIFFLHFTGGAEMVLLVSMA : .: .:: .:. .. :::. .:.... ::..:::.:.:.. .. ::::::...:: NP_001 YVFLLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLGAEMVLFTTMA 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 YDRYVAICKPLHYMTLMSWQTCIRRVLASWVVGFVHSISQVAFTVNLPYCGPNEVDSFFC :::::::: :::: :.:. . :. . ... ..: ..:. . : .:::: .: ::: NP_001 YDRYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWVHTALIMRLTFCGPNTIDHFFC 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE5 DLPLVIKLACMDTYVLGIIMISDSGLLSLSCFLLLLISYTVILLAI-RQRAAGSTSKALS ..: .. :.: . . ... . :... :.: ::: :..:: : :.. . ::.: NP_001 EIPPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILRIRTVEGKRKAFS 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 TCSAHIMVVTLFFGPCIFVYVRPFSRFSV--DKLLSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNEEMKA :::.:. ::::...: :..:.:: : .. ::.....::. :: :::..:...:.::.: NP_001 TCSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQA 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 AMKKLQNRRVTFQ ...:. NP_001 GIRKVFAFLKH 300 >>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa) initn: 698 init1: 489 opt: 802 Z-score: 776.4 bits: 151.8 E(85289): 1.7e-36 Smith-Waterman score: 802; 43.2% identity (71.4% similar) in 301 aa overlap (5-301:5-304) 10 20 30 40 50 pF1KE5 MDPQNYSLVSEFVLHGLCT-SRHLQNFFFIFFFGVYVAIMLGNLLILVTVISDPCLHSSP :.. .:::.: .. . ..:...:. :. .:.. . :: ::......:: ::: : NP_835 MAIGNWTEISEFILMSFSSLPTEIQSLLFLTFLTIYLVTLKGNSLIILVTLADPMLHS-P 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KE5 MYFLLGNLAFLDMWLASFATPKMIRDFLSDQKLISFGGCMAQIFFLHFTGGAEMVLLVSM :::.: ::.::.. . .:::. .:... ::: :: .:..:. : : :: ::..: NP_835 MYFFLRNLSFLEIGFNLVIVPKMLGTLLAQDTTISFLGCATQMYFFFFFGVAECFLLATM 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KE5 AYDRYVAICKPLHYMTLMSWQTCIRRVLASWVVGFVHSISQVAFTVNLPYCGPNEVDSFF :::::::::.:::: ..:. .: . . ::: :: . :... ..:.:: :.:. :: NP_835 AYDRYVAICSPLHYPVIMNQRTRAKLAAASWFPGFPVATVQTTWLFSFPFCGTNKVNHFF 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE5 CDLPLVIKLACMDTYVLGIIMISDSGLLSLSCFLLLLISYTVILLAI-RQRAAGSTSKAL :: : :.::.: :: .. : : . :. . ::.: ::: : :: . .: . ::. NP_835 CDSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAF 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 STCSAHIMVVTLFFGPCIFVYVRPFSRFSVD--KLLSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNEEMK ::::.:..::.::. ..: : : : . ::::. ::. ::.::::::.::: :.: NP_835 STCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVK 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 AAMKKLQNRRVTFQ :... NP_835 NALSRTFHKVLALRNCIP 300 310 >>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa) initn: 594 init1: 455 opt: 798 Z-score: 772.6 bits: 151.1 E(85289): 2.7e-36 Smith-Waterman score: 798; 42.3% identity (71.8% similar) in 305 aa overlap (1-302:1-304) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MDPQNYSLVSEFVLHGLCTSRHLQNFFFIFFFGVYVAIMLGNLLILVTVISDPCLHSSPM : .: . ::::.: :: .. . .:..:. .::. .::: ::.. . : ::. :: NP_036 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHT-PM 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 YFLLGNLAFLDMWLASFATPKMIRDFLSDQKLISFGGCMAQIFFLHFTGGAEMVLLVSMA ::.: ::...:. :. ..:... ::...: : : .: ::.:: :: :.:::. :: NP_036 YFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMA 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 YDRYVAICKPLHYMTLMSWQTCIRRVLASWVVGFVHSISQVAFTVNLPYCGPNEVDSFFC ::::::.: :.: ..: : : ...::: ::. : :.:.: .::.: . .: . : NP_036 YDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE5 DLPLVIKLACMDTYVLGIIMISDSGLLSLSCFLLLLISYTVILLAI-RQRAAGSTSKALS .: :..:::.:: . .. .: .: .. : :.:.:: :. .: . .. . .::. NP_036 ELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 TCSAHIMVVTLFFGPCIFVYVRPFSRFSV--DKLLSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNEEMKA ::..:. ::.: .: ::.:..: : :: .::.::::.:.::.:::.::.:::.:.:. NP_036 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 AMKKLQNRRVTFQ : .:: NP_036 AWQKLLWKFSGLTSKLAT 300 310 >>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa) initn: 594 init1: 455 opt: 798 Z-score: 772.6 bits: 151.1 E(85289): 2.7e-36 Smith-Waterman score: 798; 42.3% identity (71.8% similar) in 305 aa overlap (1-302:1-304) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MDPQNYSLVSEFVLHGLCTSRHLQNFFFIFFFGVYVAIMLGNLLILVTVISDPCLHSSPM : .: . ::::.: :: .. . .:..:. .::. .::: ::.. . : ::. :: XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHT-PM 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 YFLLGNLAFLDMWLASFATPKMIRDFLSDQKLISFGGCMAQIFFLHFTGGAEMVLLVSMA ::.: ::...:. :. ..:... ::...: : : .: ::.:: :: :.:::. :: XP_011 YFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMA 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 YDRYVAICKPLHYMTLMSWQTCIRRVLASWVVGFVHSISQVAFTVNLPYCGPNEVDSFFC ::::::.: :.: ..: : : ...::: ::. : :.:.: .::.: . .: . : XP_011 YDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE5 DLPLVIKLACMDTYVLGIIMISDSGLLSLSCFLLLLISYTVILLAI-RQRAAGSTSKALS .: :..:::.:: . .. .: .: .. : :.:.:: :. .: . .. . .::. XP_011 ELLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFH 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KE5 TCSAHIMVVTLFFGPCIFVYVRPFSRFSV--DKLLSVFYTIFTPLLNPIIYTLRNEEMKA ::..:. ::.: .: ::.:..: : :: .::.::::.:.::.:::.::.:::.:.:. XP_011 TCASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKG 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 AMKKLQNRRVTFQ : .:: XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT 300 310 >>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa) initn: 594 init1: 455 opt: 798 Z-score: 772.6 bits: 151.1 E(85289): 2.7e-36 Smith-Waterman score: 798; 42.3% identity (71.8% similar) in 305 aa overlap (1-302:1-304) 10 20 30 40 50 60 pF1KE5 MDPQNYSLVSEFVLHGLCTSRHLQNFFFIFFFGVYVAIMLGNLLILVTVISDPCLHSSPM : .: . ::::.: :: .. . .:..:. .::. .::: ::.. . : ::. :: XP_011 MGTDNQTWVSEFILLGLSSDWDTRVSLFVLFLVMYVVTVLGNCLIVLLIRLDSRLHT-PM 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE5 YFLLGNLAFLDMWLASFATPKMIRDFLSDQKLISFGGCMAQIFFLHFTGGAEMVLLVSMA ::.: ::...:. :. ..:... ::...: : : .: ::.:: :: :.:::. :: XP_011 YFFLTNLSLVDVSYATSVVPQLLAHFLAEHKAIPFQSCAAQLFFSLALGGIEFVLLAVMA 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE5 YDRYVAICKPLHYMTLMSWQTCIRRVLASWVVGFVHSISQVAFTVNLPYCGPNEVDSFFC ::::::.: :.: ..: : : ...::: ::. : :.:.: .::.: . .: . : XP_011 YDRYVAVCDALRYSAIMHGGLCARLAITSWVSGFISSPVQTAITFQLPMCRNKFIDHISC 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 pF1KE5 DLPLVIKLACMDTYVLGIIMISDSGLLSLSCFLLLLISYTVILLAI-RQRAAGSTSKALS .: :..:::.:: . .. .: .: .. : :.:.:: :. .: . .. . .::. 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NP_036 TCGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKG 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KE5 AMKKLQNRRVTFQ :.::. .: : NP_036 ALKKVVGRVVFSV 300 310 310 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Tue Nov 8 07:49:03 2016 done: Tue Nov 8 07:49:04 2016 Total Scan time: 5.150 Total Display time: 0.020 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]