FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6074, 323 aa 1>>>pF1KE6074 323 - 323 aa - 323 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8729+/-0.000603; mu= 12.9891+/- 0.037 mean_var=111.4577+/-29.060, 0's: 0 Z-trim(105.8): 381 B-trim: 1751 in 2/48 Lambda= 0.121484 statistics sampled from 13431 (13935) to 13431 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.476), E-opt: 0.2 (0.163), width: 16 Scan time: 5.000 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 990 185.4 1.3e-46 NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [H ( 314) 863 163.1 6.7e-40 NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 860 162.6 9.7e-40 XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 312) 847 160.3 4.7e-39 NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 847 160.3 4.7e-39 XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 847 160.3 4.8e-39 NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 831 157.5 3.3e-38 XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 831 157.5 3.3e-38 XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 831 157.5 3.3e-38 NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 819 155.4 1.4e-37 NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 809 153.7 4.7e-37 NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 766 146.1 8.7e-35 NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 763 145.6 1.3e-34 NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 756 144.4 3e-34 NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 756 144.4 3e-34 NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 754 144.0 3.8e-34 NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 753 143.9 4.3e-34 NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 749 143.2 7.2e-34 NP_009091 (OMIM: 600578) olfactory receptor 2H2 [H ( 312) 725 138.9 1.3e-32 XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 715 137.2 4.2e-32 NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 595 116.2 9.4e-26 NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 502 99.9 7.6e-21 NP_005949 (OMIM: 600665) melatonin receptor type 1 ( 350) 222 50.8 4.8e-06 NP_000530 (OMIM: 136880,180380,610445,613731) rhod ( 348) 217 50.0 8.8e-06 NP_000667 (OMIM: 600446) adenosine receptor A2b [H ( 332) 215 49.6 1.1e-05 NP_003958 (OMIM: 607405) trace amine-associated re ( 337) 209 48.5 2.3e-05 NP_004215 (OMIM: 300207) melatonin-related recepto ( 617) 210 49.0 3.1e-05 NP_004221 (OMIM: 605111,610419,610419) sphingosine ( 353) 205 47.9 3.8e-05 NP_004239 (OMIM: 600895) prolactin-releasing pepti ( 370) 204 47.7 4.4e-05 NP_005903 (OMIM: 155541,601665) melanocortin recep ( 332) 203 47.5 4.6e-05 XP_011541141 (OMIM: 125853,600804) PREDICTED: mela ( 362) 198 46.6 9.1e-05 NP_005950 (OMIM: 125853,600804) melatonin receptor ( 362) 198 46.6 9.1e-05 NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 197 46.6 0.00012 XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 197 46.6 0.00013 NP_005217 (OMIM: 601965) sphingosine 1-phosphate r ( 378) 195 46.1 0.00013 NP_001391 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphate r ( 382) 194 46.0 0.00015 NP_001307659 (OMIM: 601974) sphingosine 1-phosphat ( 382) 194 46.0 0.00015 NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 192 45.6 0.00018 NP_057658 (OMIM: 126450,159900) D(2) dopamine rece ( 414) 193 45.8 0.00018 XP_016872785 (OMIM: 126450,159900) PREDICTED: D(2) ( 443) 193 45.9 0.00019 NP_000786 (OMIM: 126450,159900) D(2) dopamine rece ( 443) 193 45.9 0.00019 NP_001699 (OMIM: 190900,613522) short-wave-sensiti ( 348) 187 44.7 0.00034 NP_001050 (OMIM: 162332,614840) neuromedin-K recep ( 465) 185 44.5 0.00053 NP_000668 (OMIM: 600445) adenosine receptor A3 iso ( 318) 180 43.4 0.00074 XP_011527129 (OMIM: 162651) PREDICTED: neurotensin ( 336) 180 43.5 0.00077 NP_000673 (OMIM: 104260,607876) alpha-2B adrenergi ( 450) 181 43.8 0.00084 XP_011521963 (OMIM: 600446) PREDICTED: adenosine r ( 116) 173 41.8 0.00084 NP_002522 (OMIM: 162651) neurotensin receptor type ( 418) 180 43.5 0.0009 NP_036284 (OMIM: 605106) lysophosphatidic acid rec ( 353) 176 42.8 0.0013 XP_011542714 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 308) 175 42.5 0.0013 >>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa) initn: 1013 init1: 983 opt: 990 Z-score: 957.7 bits: 185.4 E(85289): 1.3e-46 Smith-Waterman score: 990; 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NP_001 LCSRKDISGDK 300 >>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa) initn: 840 init1: 636 opt: 863 Z-score: 837.3 bits: 163.1 E(85289): 6.7e-40 Smith-Waterman score: 863; 42.2% identity (74.5% similar) in 306 aa overlap (1-303:1-306) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MDKSNSSVVSEFVLLGLCSSQKLQLFYFCFFSVLYTVIVLGNLLIILTVTSDTSLHSPMY : ..: . ..::::::: .. .::.. : :: :.::. ::::: .:: . :..::.::: NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 FLLGNLSFVDICQASFATPKMIADFLSAHETISFSGCIAQIFFIHLFTGGEMVLLVSMAY :.:.::::::.:... ::::.::.:: ..::::.::. :..:. .. : .:. ::: NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 DRYVAICKPLYYVVIMSRRTCTVLVMISWAVSLVHTLSQLSFTVNLPFCGPNVVDSFFCD :::.:::.:: : .:::: . .. ..:..:.. . . : . .: :: ::. :::: NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 LPRVTKLACLDSYIIEILIVVNSGILSLSTFSLLVSSYIIILVTVW-LKSSAAMAKAFST : . ::.: :. . : . . .:. ..:. ...::: .: ... ..:. . .:::: NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 LASHIAVVILFFGPCIFIYVWPFTISPL--DKFLAIFYTVFTPVLNPIIYTLRNRDMKAA :::....:::.. ::. :. : . : :: ..:::: :.:::.::.::....: : NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA 250 260 270 280 290 300 300 310 320 pF1KE6 VRKIVNHYLRPRRISEMSLVVRTSFH . .... NP_003 LANVISRKRTSSFL 310 >>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa) initn: 864 init1: 623 opt: 860 Z-score: 834.4 bits: 162.6 E(85289): 9.7e-40 Smith-Waterman score: 860; 42.9% identity (73.8% similar) in 301 aa overlap (5-302:7-307) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MDKSNSSVVSEFVLLGLCSSQKLQLFYFCFFSVLYTVIVLGNLLIILTVTSDTSLHSP : ..:.::.:::. . .::. : .: .::..:..::. ..: . : :..: NP_006 MEFTDRNYTLVTEFILLGFPTRPELQIVLFLMFLTLYAIILIGNIGLMLLIRIDPHLQTP 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 MYFLLGNLSFVDICQASFATPKMIADFLSAHETISFSGCIAQIFFIHLFTGGEMVLLVSM :::.:.::::::.: : .:::...::: ...::. :: :..:. :. : .:..: NP_006 MYFFLSNLSFVDLCYFSDIVPKMLVNFLSENKSISYYGCALQFYFFCTFADTESFILAAM 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 AYDRYVAICKPLYYVVIMSRRTCTVLVMISWAVSLVHTLSQLSFTVNLPFCGPNVVDSFF :::::::::.:: :.:.::: : :...:. . . .: . ::. : .: ::.. :: NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 CDLPRVTKLACLDSYIIEILIVVNSGILSLSTFSLLVSSYIIILVTVW-LKSSAAMAKAF :::: . ::.: :. : : :. . .. . . : ... ::..::..: ..: .. :.: NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSGRKKTF 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 STLASHIAVVILFFGPCIFIYVWP-FTISP-LDKFLAIFYTVFTPVLNPIIYTLRNRDMK :: :::.. : .. : .::: : . :: ::....:::.: :::::.::.:::.:.: NP_006 STCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSPNTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNKDVK 250 260 270 280 290 300 300 310 320 pF1KE6 AAVRKIVNHYLRPRRISEMSLVVRTSFH :..:.. NP_006 DAAEKVLRSKVDSS 310 >>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa) initn: 834 init1: 647 opt: 847 Z-score: 822.2 bits: 160.3 E(85289): 4.7e-39 Smith-Waterman score: 847; 42.3% identity (74.4% similar) in 305 aa overlap (1-302:1-305) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MDKSNSSVVSEFVLLGLCSSQKLQLFYFCFFSVLYTVIVLGNLLIILTVTSDTSLHSPMY :. .:.: ::::.:::: . . : . : :: .: . :::::::::.:. :. ::.::: XP_011 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 FLLGNLSFVDICQASFATPKMIADFLSAHETISFSGCIAQIFFIHLFTGGEMVLLVSMAY :.:.:::::::: . ..:::.:. . .:::: ::..:..:. .:. . ::. ::: XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 DRYVAICKPLYYVVIMSRRTCTVLVMISWAVSLVHTLSQLSFTVNLPFCGPNVVDSFFCD :..::.:.::.:.. :... :..:: :.:. ...: . . . : ::. :.. :::: XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 LPRVTKLACLDSYIIEILIVVNSGILSLSTFSLLVSSYIIILVTVW-LKSSAAMAKAFST . . ::.: :... :..:. ..... .. : ...::. : :: . :. . ::::: XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 LASHIAVVILFFGPCIFIYVWPFTISPLDK--FLAIFYTVFTPVLNPIIYTLRNRDMKAA .::.:::.::.. : .: :.. .: . ...::: ::.:::.::.:::: .:.: XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA 250 260 270 280 290 300 300 310 320 pF1KE6 VRKIVNHYLRPRRISEMSLVVRTSFH ..:.: XP_011 LKKVVGRVVFSV 310 >>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa) initn: 834 init1: 647 opt: 847 Z-score: 822.2 bits: 160.3 E(85289): 4.7e-39 Smith-Waterman score: 847; 42.3% identity (74.4% similar) in 305 aa overlap (1-302:1-305) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MDKSNSSVVSEFVLLGLCSSQKLQLFYFCFFSVLYTVIVLGNLLIILTVTSDTSLHSPMY :. .:.: ::::.:::: . . : . : :: .: . :::::::::.:. :. ::.::: NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 FLLGNLSFVDICQASFATPKMIADFLSAHETISFSGCIAQIFFIHLFTGGEMVLLVSMAY :.:.:::::::: . ..:::.:. . .:::: ::..:..:. .:. . ::. ::: NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 DRYVAICKPLYYVVIMSRRTCTVLVMISWAVSLVHTLSQLSFTVNLPFCGPNVVDSFFCD :..::.:.::.:.. :... :..:: :.:. ...: . . . : ::. :.. :::: NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KE6 LPRVTKLACLDSYIIEILIVVNSGILSLSTFSLLVSSYIIILVTVW-LKSSAAMAKAFST . . ::.: :... :..:. ..... .. : ...::. : :: . :. . ::::: NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KE6 LASHIAVVILFFGPCIFIYVWPFTISPLDK--FLAIFYTVFTPVLNPIIYTLRNRDMKAA .::.:::.::.. : .: :.. .: . ...::: ::.:::.::.:::: .:.: NP_036 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA 250 260 270 280 290 300 300 310 320 pF1KE6 VRKIVNHYLRPRRISEMSLVVRTSFH ..:.: NP_036 LKKVVGRVVFSV 310 >>XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (322 aa) initn: 834 init1: 647 opt: 847 Z-score: 822.0 bits: 160.3 E(85289): 4.8e-39 Smith-Waterman score: 847; 42.3% identity (74.4% similar) in 305 aa overlap (1-302:11-315) 10 20 30 40 50 pF1KE6 MDKSNSSVVSEFVLLGLCSSQKLQLFYFCFFSVLYTVIVLGNLLIILTVT :. .:.: ::::.:::: . . : . : :: .: . :::::::::.:. XP_011 MGDRRADPRPMSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVS 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KE6 SDTSLHSPMYFLLGNLSFVDICQASFATPKMIADFLSAHETISFSGCIAQIFFIHLFTGG :. ::.::::.:.:::::::: . ..:::.:. . .:::: ::..:..:. .:. XP_011 IDSCLHTPMYFFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDM 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KE6 EMVLLVSMAYDRYVAICKPLYYVVIMSRRTCTVLVMISWAVSLVHTLSQLSFTVNLPFCG . ::. ::::..::.:.::.:.. :... :..:: :.:. ...: . . . : ::. 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XP_011 AWQKLLWKFSGLTSKLAT 300 310 >>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa) initn: 827 init1: 606 opt: 819 Z-score: 795.7 bits: 155.4 E(85289): 1.4e-37 Smith-Waterman score: 819; 40.0% identity (74.3% similar) in 300 aa overlap (5-301:2-301) 10 20 30 40 50 60 pF1KE6 MDKSNSSVVSEFVLLGLCSSQKLQLFYFCFFSVLYTVIVLGNLLIILTVTSDTSLHSPMY : :::.::..::: .. .:: . : :: ..: : :::.:::.. ...::.::: NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAKIYNNTLHTPMY 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 FLLGNLSFVDICQASFATPKMIADFLSAHETISFSGCIAQIFFIHLFTGGEMVLLVSMAY .: .:. ::: .. :::.. .:....:::..::..:.:.. :.::::...::: NP_001 VFLLTLAVVDIICTTSIIPKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLGAEMVLFTTMAY 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 DRYVAICKPLYYVVIMSRRTCTVLVMISWAVSLVHTLSQLSFTVNLPFCGPNVVDSFFCD ::::::: ::.: .::... :..:. . :...... . .. . : :::::..: :::. 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