FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KE6486, 584 aa 1>>>pF1KE6486 584 - 584 aa - 584 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9977+/-0.000989; mu= 20.4765+/- 0.059 mean_var=69.3356+/-14.448, 0's: 0 Z-trim(104.8): 34 B-trim: 0 in 0/49 Lambda= 0.154027 statistics sampled from 8052 (8071) to 8052 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.603), E-opt: 0.2 (0.248), width: 16 Scan time: 2.500 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS31909.1 SLC8B1 gene_id:80024|Hs108|chr12 ( 584) 3888 873.6 0 CCDS81744.1 SLC8B1 gene_id:80024|Hs108|chr12 ( 528) 2345 530.7 1.8e-150 CCDS13140.1 SLC24A3 gene_id:57419|Hs108|chr20 ( 644) 289 73.9 7.2e-13 CCDS45156.1 SLC24A4 gene_id:123041|Hs108|chr14 ( 558) 275 70.7 5.6e-12 CCDS45155.2 SLC24A4 gene_id:123041|Hs108|chr14 ( 603) 275 70.7 5.9e-12 CCDS9903.2 SLC24A4 gene_id:123041|Hs108|chr14 ( 622) 275 70.7 6e-12 >>CCDS31909.1 SLC8B1 gene_id:80024|Hs108|chr12 (584 aa) initn: 3888 init1: 3888 opt: 3888 Z-score: 4667.3 bits: 873.6 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 3888; 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CCDS13 VCGLFAGQVVALSSWCLLRDSIYYTLSVIALIVFIYDEKVSWWESLVLVLMYLIYIVIMK 200 210 220 230 240 250 250 260 270 280 290 pF1KE6 LCTWIYQ-RQRR----GSLFCPMPVTPEILSDSEEDRVSSNTNSYDYG--------DE-- . :.: .:: :.. . . :: ..:. : . .. .. :: CCDS13 YNACIHQCFERRTKGAGNMVNGLANNAEIDDSSNCDATVVLLKKANFHRKASVIMVDELL 260 270 280 290 300 310 300 310 320 330 pF1KE6 --YRPLFFYQETTAQILVRALNP----LDY-----MKWRRKSAYWKALK------VFKLP : . ..:. .:.. . : :.. .. :.. .: ..:.: CCDS13 SAYPHQLSFSEAGLRIMITSHFPPKTRLSMASRMLINERQRLINSRAYTNGESEVAIKIP 320 330 340 350 360 370 340 350 360 370 380 pF1KE6 VEFLLLL-TVPVVDPDK-------DD-----QNWKRPLNCLHLVISPLVVVLTLQSGTYG .. . : : ::. :: : . : . . : : CCDS13 IKHTVENGTGPSSAPDRGVNGTRRDDVVAEAGNETENENEDNENDEEEEEDEDDDEGPYT 380 390 400 410 420 430 390 400 410 420 430 pF1KE6 VYEI--GGLVPV-WVVVVIAGTALASVTFFATSDSQPPRLHWLFAFL-GFLTSALWINAA .. : : : :. . :. : .:.. . . :: : :. : .:.::: : CCDS13 PFDTPSGKLETVKWAFT----WPLSFVLYFTVPNCNKPR--WEKWFMVTFASSTLWIAAF 440 450 460 470 480 490 440 450 460 470 480 490 pF1KE6 ATEVVNILRSLGVVFRLSNTVLGLTLLAWGNSIGDAFSDFTLARQGYPRMAFSACFGGII . .: .. .: .. . ....:.:.:: :.:. : .... .::::. :: : .:. . CCDS13 SYMMVWMVTIIGYTLGIPDVIMGITFLAAGTSVPDCMASLIVARQGMGDMAVSNSIGSNV 500 510 520 530 540 550 500 510 520 530 540 550 pF1KE6 FNILVGVGLGCLLQ-ISRSH-TEVKLEPDGLLVWVLAGALGLSLVFSLVSVPLQCFQLSR :.::.:.:: :: .. .. . ..:. ::. : : : :. .. .: :. .::.. CCDS13 FDILIGLGLPWALQTLAVDYGSYIRLNSRGLIYSV--GLLLASVFVTVFGVHLNKWQLDK 560 570 580 590 600 560 570 580 pF1KE6 VYGFCLLLFYLNFLVVALLTEFGVIHLKSM : ::.: :: ...:::.: CCDS13 KLGCGCLLLYGVFLCFSIMTEFNVFTFVNLPMCGDH 610 620 630 640 >>CCDS45156.1 SLC24A4 gene_id:123041|Hs108|chr14 (558 aa) initn: 452 init1: 209 opt: 275 Z-score: 328.6 bits: 70.7 E(32554): 5.6e-12 Smith-Waterman score: 436; 24.9% identity (55.4% similar) in 522 aa overlap (99-578:35-545) 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 RTNPDCHSDGGYLDYLEGIFCHFPPSLLPLAVTLYVSWLLYLFLILGVTAAKFFCPNLSA :: :.. ::.: :... :: :.: CCDS45 NGTQTAKNCTDPAIHEFPTDLFSNKERQHGAVLLHILGALYMFYALAIVCDDFFVPSLEK 10 20 30 40 50 60 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 ISTTLKLSHNVAGVTFLAFGNGAPDIFSALVAFSDPHTAGLALGALFGAGVLVTTVVAG- : :.::..:::.::.: :...:..:..... : . ...:.. :..:. . : CCDS45 ICERLHLSEDVAGATFMAAGSSTPELFASVIGVFITH-GDVGVGTIVGSAVFNILCIIGV 70 80 90 100 110 120 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 -GITILHPFMAASRPFFRDIVFYMVAVFLTFLMLFRGRVTLAWALGYLGLYVFYVV---- :. . . :: :.: ..:.. ..... ... .: . :::::.. CCDS45 CGLFAGQVVRLTWWAVCRDSVYYTISVIVLIVFIYDEQIVWWEGLVLIILYVFYILIMKY 130 140 150 160 170 180 250 260 270 280 pF1KE6 TVILCTWIYQRQRRGSLFCPMPVTPEI-----LSDSEEDRVS-----SNTNSYDYG---- .: . ... .:. :. ::. :. . :. : : . .. .:: CCDS45 NVKMQAFFTVKQK--SIANGNPVNSELEAGNDFYDGSYDDPSVPLLGQVKEKPQYGKNPV 190 200 210 220 230 240 290 300 310 320 330 pF1KE6 ---DEYR----PLFFYQETTAQILVRA-LNPLDYMKW-------RRKSAYWKALKVFKLP :: : : . :. .:.. ..: .. .:. .: : . : CCDS45 VMVDEIMSSSPPKFTFPEAGLRIMITNKFGPRTRLRMASRIIINERQRLINSANGVSSKP 250 260 270 280 290 300 340 350 360 370 380 pF1KE6 V-----EFLLLLTVPVVDPDKDDQNWKRPLNCLHLVISPLVVVLTLQSGTYGVYEIGGLV . : . .::: .:. .:: .. : : . : ..: : : CCDS45 LQNGRHENIENGNVPVENPEDPQQNQEQQPPPQPPPPEPEPVEADFLS-PFSVPEARGDK 310 320 330 340 350 360 390 400 410 420 430 440 pF1KE6 PVWVVVVIAGTALASVTFFATSDSQPPRLHWLFAFLGFLTSALWINAAATEVVNILRSLG :: . : . . . . :: . .: .. :.:..::: . . .: .. .: CCDS45 VKWVFT----WPLIFLLCVTIPNCSKPRWEKFF-MVTFITATLWIAVFSYIMVWLVTIIG 370 380 390 400 410 450 460 470 480 490 500 pF1KE6 VVFRLSNTVLGLTLLAWGNSIGDAFSDFTLARQGYPRMAFSACFGGIIFNILVGVGL--G .. . ....:.:.:: :.:. : .... .:::: :: : .:. .:.::::.:. : CCDS45 YTLGIPDVIMGITFLAAGTSVPDCMASLIVARQGLGDMAVSNTIGSNVFDILVGLGVPWG 420 430 440 450 460 470 510 520 530 540 550 560 pF1KE6 CLLQISRSHTEVKLEPDGLLVWVLAGALGLSLVFSLVSVPLQCFQLSRVYGFCLLLFYLN .. . ::.. :: :. .. :: :........ :. ..:.: : .:..: CCDS45 LQTMVVNYGSTVKINSRGL-VYSVVLLLG-SVALTVLGIHLNKWRLDRKLGVYVLVLYAI 480 490 500 510 520 530 570 580 pF1KE6 FLVVALLTEFGVIHLKSM :: ... ::.: CCDS45 FLCFSIMIEFNVFTFVNLPMCREDD 540 550 >>CCDS45155.2 SLC24A4 gene_id:123041|Hs108|chr14 (603 aa) initn: 452 init1: 209 opt: 275 Z-score: 328.1 bits: 70.7 E(32554): 5.9e-12 Smith-Waterman score: 465; 24.9% identity (57.1% similar) in 503 aa overlap (99-578:99-590) 70 80 90 100 110 120 pF1KE6 RTNPDCHSDGGYLDYLEGIFCHFPPSLLPLAVTLYVSWLLYLFLILGVTAAKFFCPNLSA :: :.. ::.: :... :: :.: CCDS45 NGTQTAKNCTDPAIHEFPTDLFSNKERQHGAVLLHILGALYMFYALAIVCDDFFVPSLEK 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KE6 ISTTLKLSHNVAGVTFLAFGNGAPDIFSALVAFSDPHTAGLALGALFGAGVLVTTVVAG- : :.::..:::.::.: :...:..:..... : . ...:.. :..:. . : CCDS45 ICERLHLSEDVAGATFMAAGSSTPELFASVIGVFITH-GDVGVGTIVGSAVFNILCIIGV 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KE6 -GITILHPFMAASRPFFRDIVFYMVAVFLTFLMLFRGRVTLAWALGYLGLYVFYVV---- :. . . :: :.: ..:.. ..... ... .: . :::::.. 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